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;GGSMSLQPLTAVNCGSLVQPGFSLLDLEGDVYLFGQKGWPKRSCPTGIFGVRIKKGELKLRAISFSNNSSYLPPLRCPAI AHFEAQDGKPECYLIHGGRTPNNELSSSLYMLSVDSRGCNRKVTLRCEEKELVGDVPSARYGHTLSVINSRGKTACVLFG GRSYMPPTERTTQNWNSVVDCPPQVYLIDLEFGCCTAHTLPELTDGQSFHVALARQDCVYFLGGHILSSDCRPSRLIRLH VELLLGSPVLTCTILHEGLTITSAIASPIGYHEYIIFGGYQSETQKRMECTYVGLDDVGVHMESREPPQWTSEISHSRTW FGGSLGKGTALVAIPSEGNPTPPEAYHFYQVSFQKEQDGEATAQGGSQESTDFEDSAPLEDSEELYFGREPHELEYSSDV EGDTYNEEDEEDESQTGYWIKCCLSCQVDPNIWEPYYSTELTRPAMIFCSRGEGGHWVHAQCMELPESLLLQLSQDNSKY FCLDHGGLPKQEMTPPKQMLPVKRVPMKMTHRKAPVSLKMTPAKKTFLRRLFD ; B,D ? 3 polydeoxyribonucleotide no no ;(DG)(DA)(DT)(DC)(DT)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DT)(DA)(DC)(DA)(DC)(DA) (DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DA)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DA)(DC)(DA)(DA)(DA) (DA)(DA)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG) ; GATCTGGCCTGTCTTACACAGTGCTACAGACTGGAACAAAAACCCTGCAG E ? 4 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DT)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG) 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'expression tag' 0 74 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 25970 ? 1 MORE -166 ? 1 'SSA (A^2)' 98750 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation x,y,z _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 THR A 547 ? 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A ASP 748 ? A ASP 620 ? 1_555 CA ? I CA . ? A CA 1103 ? 1_555 OP2 ? E DC 17 ? E DC 17 ? 1_555 96.9 ? 11 "O3'" ? E DA 16 ? E DA 16 ? 1_555 CA ? I CA . ? A CA 1103 ? 1_555 OP2 ? E DC 17 ? E DC 17 ? 1_555 49.5 ? 12 OP1 ? E DC 17 ? E DC 17 ? 1_555 CA ? I CA . ? A CA 1103 ? 1_555 OP2 ? E DC 17 ? E DC 17 ? 1_555 52.1 ? 13 SG ? A CYS 877 ? A CYS 749 ? 1_555 ZN ? G ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 N ? A CYS 880 ? A CYS 752 ? 1_555 75.0 ? 14 SG ? A CYS 877 ? A CYS 749 ? 1_555 ZN ? G ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 SG ? A CYS 880 ? A CYS 752 ? 1_555 104.7 ? 15 N ? A CYS 880 ? A CYS 752 ? 1_555 ZN ? G ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 SG ? A CYS 880 ? A CYS 752 ? 1_555 85.1 ? 16 SG ? A CYS 877 ? A CYS 749 ? 1_555 ZN ? G ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? A HIS 1087 ? A HIS 959 ? 1_555 78.2 ? 17 N ? A CYS 880 ? A CYS 752 ? 1_555 ZN ? G ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? A HIS 1087 ? A HIS 959 ? 1_555 144.1 ? 18 SG ? A CYS 880 ? A CYS 752 ? 1_555 ZN ? G ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? A HIS 1087 ? A HIS 959 ? 1_555 79.0 ? 19 SG ? A CYS 877 ? A CYS 749 ? 1_555 ZN ? G ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? A HIS 1092 ? A HIS 964 ? 1_555 140.6 ? 20 N ? A CYS 880 ? A CYS 752 ? 1_555 ZN ? G ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? A HIS 1092 ? A HIS 964 ? 1_555 125.4 ? 21 SG ? A CYS 880 ? A CYS 752 ? 1_555 ZN ? G ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? A HIS 1092 ? A HIS 964 ? 1_555 110.0 ? 22 NE2 ? A HIS 1087 ? A HIS 959 ? 1_555 ZN ? G ZN . ? A ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? A HIS 1092 ? A HIS 964 ? 1_555 90.3 ? 23 SG ? C CYS 877 ? C CYS 749 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? C ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? C HIS 1087 ? C HIS 959 ? 1_555 92.7 ? 24 SG ? C CYS 877 ? C CYS 749 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? C ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? C HIS 1092 ? C HIS 964 ? 1_555 73.1 ? 25 NE2 ? C HIS 1087 ? C HIS 959 ? 1_555 ZN ? J ZN . ? C ZN 1101 ? 1_555 NE2 ? C HIS 1092 ? C HIS 964 ? 1_555 95.0 ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 640 A . ? GLY 512 A ARG 641 A ? ARG 513 A 1 1.78 2 GLN 667 A . ? GLN 539 A PRO 668 A ? PRO 540 A 1 -3.56 3 LEU 781 A . ? LEU 653 A GLU 782 A ? GLU 654 A 1 0.66 4 ALA 870 A . ? ALA 742 A SER 871 A ? SER 743 A 1 -6.99 5 ASP 87 B . ? ASP 84 B GLY 88 B ? GLY 85 B 1 3.74 6 PRO 90 B . ? 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AB9 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 6 7 ? anti-parallel AA1 7 8 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 5 6 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB2 6 7 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB3 5 6 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? parallel AB4 5 6 ? anti-parallel AB4 6 7 ? anti-parallel AB4 7 8 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? anti-parallel AB9 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 GLU A 665 ? 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? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.38 _em_specimen.details 'This sample was monodisperse.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6DBW 'double helix' 6DBW 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 E DG 1 1_555 F DC 50 1_555 -0.150 -0.441 -1.235 -1.025 -1.095 3.093 1 E_DG1:DC50_F E 1 ? F 50 ? 19 1 1 E DA 2 1_555 F DT 49 1_555 0.121 -0.807 -1.892 -12.568 -15.216 9.398 2 E_DA2:DT49_F E 2 ? F 49 ? 20 1 1 E DT 3 1_555 F DA 48 1_555 -0.171 -1.080 -1.881 -6.066 -7.532 3.152 3 E_DT3:DA48_F E 3 ? F 48 ? 20 1 1 E DC 4 1_555 F DG 47 1_555 0.222 -0.497 -1.209 -7.287 -5.912 6.002 4 E_DC4:DG47_F E 4 ? F 47 ? 19 1 1 E DT 5 1_555 F DA 46 1_555 -0.085 -0.550 -1.017 -7.076 -5.716 10.542 5 E_DT5:DA46_F E 5 ? F 46 ? 20 1 1 E DG 6 1_555 F DC 45 1_555 -0.290 -0.347 -1.174 -10.764 -6.948 5.360 6 E_DG6:DC45_F E 6 ? F 45 ? 19 1 1 E DG 7 1_555 F DC 44 1_555 -0.220 -0.411 -1.249 -9.846 -2.951 1.723 7 E_DG7:DC44_F E 7 ? F 44 ? 19 1 1 E DC 8 1_555 F DG 43 1_555 0.123 -0.490 -0.947 -2.421 2.142 -2.643 8 E_DC8:DG43_F E 8 ? F 43 ? 19 1 1 E DC 9 1_555 F DG 42 1_555 0.082 -0.984 -0.703 -2.439 5.257 -3.111 9 E_DC9:DG42_F E 9 ? F 42 ? 22 1 1 E DT 10 1_555 F DA 41 1_555 -0.112 -0.248 0.004 -3.967 2.881 -0.512 10 E_DT10:DA41_F E 10 ? 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F 20 ? 19 1 1 E DT 32 1_555 F DA 19 1_555 -0.007 -0.375 0.699 -0.346 6.976 5.307 29 E_DT32:DA19_F E 32 ? F 19 ? 20 1 1 E DG 33 1_555 F DC 18 1_555 -2.205 -0.450 -0.349 -21.694 12.926 17.364 30 E_DG33:DC18_F E 33 ? F 18 ? ? 1 1 E DG 34 1_555 F DT 16 1_555 -0.800 -0.970 -1.436 5.137 4.345 -1.392 31 E_DG34:DT16_F E 34 ? F 16 ? 28 1 1 E DC 37 1_555 F DG 14 1_555 1.503 1.220 -0.404 -14.505 1.167 44.228 32 E_DC37:DG14_F E 37 ? F 14 ? ? 1 1 E DA 38 1_555 F DT 13 1_555 0.044 -0.173 -0.443 -7.790 7.063 3.947 33 E_DA38:DT13_F E 38 ? F 13 ? 20 1 1 E DA 39 1_555 F DT 12 1_555 0.018 -0.235 -0.459 -1.973 0.009 3.565 34 E_DA39:DT12_F E 39 ? F 12 ? 20 1 1 E DA 40 1_555 F DT 11 1_555 0.026 -0.275 -0.492 -4.781 -2.122 4.588 35 E_DA40:DT11_F E 40 ? F 11 ? 20 1 1 E DA 41 1_555 F DT 10 1_555 0.190 -0.207 -0.455 -2.416 8.881 0.685 36 E_DA41:DT10_F E 41 ? F 10 ? 20 1 1 E DC 43 1_555 F DG 8 1_555 0.199 -0.156 -0.121 5.317 4.792 0.462 37 E_DC43:DG8_F E 43 ? 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F 1 ? 19 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 E DG 1 1_555 F DC 50 1_555 E DA 2 1_555 F DT 49 1_555 -1.226 2.120 4.196 0.359 -6.965 57.798 2.639 1.284 3.932 -7.177 -0.370 58.181 1 EE_DG1DA2:DT49DC50_FF E 1 ? F 50 ? E 2 ? F 49 ? 1 E DA 2 1_555 F DT 49 1_555 E DT 3 1_555 F DA 48 1_555 -0.670 1.241 2.806 -3.275 3.732 24.525 1.867 0.671 3.021 8.672 7.610 25.015 2 EE_DA2DT3:DA48DT49_FF E 2 ? F 49 ? E 3 ? F 48 ? 1 E DT 3 1_555 F DA 48 1_555 E DC 4 1_555 F DG 47 1_555 -0.054 1.813 3.269 -5.100 4.598 31.662 2.408 -0.839 3.458 8.305 9.213 32.380 3 EE_DT3DC4:DG47DA48_FF E 3 ? F 48 ? E 4 ? F 47 ? 1 E DC 4 1_555 F DG 47 1_555 E DT 5 1_555 F DA 46 1_555 0.324 1.754 3.016 -2.265 4.605 29.423 2.486 -1.080 3.214 8.981 4.418 29.857 4 EE_DC4DT5:DA46DG47_FF E 4 ? F 47 ? E 5 ? F 46 ? 1 E DT 5 1_555 F DA 46 1_555 E DG 6 1_555 F DC 45 1_555 -0.122 3.417 3.192 -4.768 10.763 47.005 3.258 -0.255 3.835 13.253 5.871 48.375 5 EE_DT5DG6:DC45DA46_FF E 5 ? F 46 ? E 6 ? F 45 ? 1 E DG 6 1_555 F DC 45 1_555 E DG 7 1_555 F DC 44 1_555 -0.088 0.293 3.125 -2.629 3.492 26.728 -0.226 -0.453 3.130 7.489 5.639 27.076 6 EE_DG6DG7:DC44DC45_FF E 6 ? F 45 ? E 7 ? 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