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'ELECTRON MICROSCOPY' 1 20 39 ? 0.01 0.05 ? ? E 51840 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 20 40 ? 0.01 0.05 ? ? K 51840 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 21 41 ? 0.00 0.05 ? ? E 51920 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 21 42 ? 0.00 0.05 ? ? L 51920 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 22 43 ? 0.00 0.05 ? ? F 51828 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 22 44 ? 0.00 0.05 ? ? G 51828 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 23 45 ? 0.00 0.05 ? ? F 51828 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 23 46 ? 0.00 0.05 ? ? H 51828 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 24 47 ? 0.00 0.05 ? ? F 51826 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 24 48 ? 0.00 0.05 ? ? I 51826 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 25 49 ? 0.00 0.05 ? ? G 51828 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 25 50 ? 0.00 0.05 ? ? H 51828 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 26 51 ? 0.00 0.05 ? ? G 51826 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 26 52 ? 0.00 0.05 ? ? I 51826 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 27 53 ? 0.00 0.05 ? ? H 51826 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 27 54 ? 0.00 0.05 ? ? I 51826 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 28 55 ? 0.00 0.05 ? ? J 51926 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 28 56 ? 0.00 0.05 ? ? K 51926 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 29 57 ? 0.01 0.05 ? ? J 51840 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 29 58 ? 0.01 0.05 ? ? L 51840 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 1 30 59 ? 0.01 0.05 ? ? K 51840 'interatomic distance' ? ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' 2 30 60 ? 0.01 0.05 ? ? L 51840 'interatomic distance' ? ? ? # _refine_ls_shell.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine_ls_shell.d_res_high 3.300 _refine_ls_shell.d_res_low 3.386 _refine_ls_shell.number_reflns_all ? _refine_ls_shell.number_reflns_obs ? _refine_ls_shell.number_reflns_R_free 0 _refine_ls_shell.number_reflns_R_work 13601 _refine_ls_shell.percent_reflns_obs 100.00 _refine_ls_shell.percent_reflns_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_all ? _refine_ls_shell.R_factor_obs ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free ? _refine_ls_shell.R_factor_R_free_error ? _refine_ls_shell.R_factor_R_work 0.749 _refine_ls_shell.redundancy_reflns_all ? _refine_ls_shell.redundancy_reflns_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_all ? _refine_ls_shell.wR_factor_obs ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_free ? _refine_ls_shell.wR_factor_R_work ? _refine_ls_shell.pdbx_total_number_of_bins_used 20 _refine_ls_shell.pdbx_phase_error ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_work ? _refine_ls_shell.pdbx_fsc_free ? # loop_ _struct_ncs_dom.id _struct_ncs_dom.details _struct_ncs_dom.pdbx_ens_id 1 A 1 2 C 1 1 A 2 2 E 2 1 A 3 2 J 3 1 A 4 2 K 4 1 A 5 2 L 5 1 B 6 2 D 6 1 B 7 2 F 7 1 B 8 2 G 8 1 B 9 2 H 9 1 B 10 2 I 10 1 C 11 2 E 11 1 C 12 2 J 12 1 C 13 2 K 13 1 C 14 2 L 14 1 D 15 2 F 15 1 D 16 2 G 16 1 D 17 2 H 17 1 D 18 2 I 18 1 E 19 2 J 19 1 E 20 2 K 20 1 E 21 2 L 21 1 F 22 2 G 22 1 F 23 2 H 23 1 F 24 2 I 24 1 G 25 2 H 25 1 G 26 2 I 26 1 H 27 2 I 27 1 J 28 2 K 28 1 J 29 2 L 29 1 K 30 2 L 30 # loop_ _struct_ncs_dom_lim.pdbx_ens_id _struct_ncs_dom_lim.dom_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_component_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.beg_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_label_alt_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.beg_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_asym_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_comp_id _struct_ncs_dom_lim.end_auth_seq_id _struct_ncs_dom_lim.pdbx_refine_code _struct_ncs_dom_lim.selection_details 1 1 0 A MET 1 . A VAL 437 . A MET 1 A VAL 437 0 ? 1 2 0 C MET 1 . C VAL 437 . C MET 1 C VAL 437 0 ? 2 1 0 A MET 1 . A VAL 437 . A MET 1 A VAL 437 0 ? 2 2 0 E MET 1 . E VAL 437 . E MET 1 E VAL 437 0 ? 3 1 0 A MET 1 . A VAL 437 . A MET 1 A VAL 437 0 ? 3 2 0 J MET 1 . J VAL 437 . J MET 1 J VAL 437 0 ? 4 1 0 A MET 1 . A VAL 437 . A MET 1 A VAL 437 0 ? 4 2 0 K MET 1 . K VAL 437 . K MET 1 K VAL 437 0 ? 5 1 0 A MET 1 . A VAL 437 . A MET 1 A VAL 437 0 ? 5 2 0 L MET 1 . L VAL 437 . L MET 1 L VAL 437 0 ? 6 1 0 B MET 1 . B ASN 416 . B MET 1 B ASN 426 0 ? 6 2 0 D MET 1 . D ASN 416 . D MET 1 D ASN 426 0 ? 7 1 0 B MET 1 . B ASN 416 . B MET 1 B ASN 426 0 ? 7 2 0 F MET 1 . F ASN 416 . F MET 1 F ASN 426 0 ? 8 1 0 B MET 1 . B ASN 416 . B MET 1 B ASN 426 0 ? 8 2 0 G MET 1 . G ASN 416 . G MET 1 G ASN 426 0 ? 9 1 0 B MET 1 . B ASN 416 . B MET 1 B ASN 426 0 ? 9 2 0 H MET 1 . H ASN 416 . H MET 1 H ASN 426 0 ? 10 1 0 B MET 1 . B ASN 416 . B MET 1 B ASN 426 0 ? 10 2 0 I MET 1 . I ASN 416 . I MET 1 I ASN 426 0 ? 11 1 0 C MET 1 . C VAL 437 . C MET 1 C VAL 437 0 ? 11 2 0 E MET 1 . E VAL 437 . E MET 1 E VAL 437 0 ? 12 1 0 C MET 1 . C VAL 437 . C MET 1 C VAL 437 0 ? 12 2 0 J MET 1 . J VAL 437 . J MET 1 J VAL 437 0 ? 13 1 0 C MET 1 . C VAL 437 . C MET 1 C VAL 437 0 ? 13 2 0 K MET 1 . K VAL 437 . K MET 1 K VAL 437 0 ? 14 1 0 C MET 1 . C VAL 437 . C MET 1 C VAL 437 0 ? 14 2 0 L MET 1 . L VAL 437 . L MET 1 L VAL 437 0 ? 15 1 0 D MET 1 . D ASN 416 . D MET 1 D ASN 426 0 ? 15 2 0 F MET 1 . F ASN 416 . F MET 1 F ASN 426 0 ? 16 1 0 D MET 1 . D ASN 416 . D MET 1 D ASN 426 0 ? 16 2 0 G MET 1 . G ASN 416 . G MET 1 G ASN 426 0 ? 17 1 0 D MET 1 . D ASN 416 . D MET 1 D ASN 426 0 ? 17 2 0 H MET 1 . H ASN 416 . H MET 1 H ASN 426 0 ? 18 1 0 D MET 1 . D ASN 416 . D MET 1 D ASN 426 0 ? 18 2 0 I MET 1 . I ASN 416 . I MET 1 I ASN 426 0 ? 19 1 0 E MET 1 . E VAL 437 . E MET 1 E VAL 437 0 ? 19 2 0 J MET 1 . J VAL 437 . J MET 1 J VAL 437 0 ? 20 1 0 E MET 1 . E VAL 437 . E MET 1 E VAL 437 0 ? 20 2 0 K MET 1 . K VAL 437 . K MET 1 K VAL 437 0 ? 21 1 0 E MET 1 . E VAL 437 . E MET 1 E VAL 437 0 ? 21 2 0 L MET 1 . L VAL 437 . L MET 1 L VAL 437 0 ? 22 1 0 F MET 1 . F ASN 416 . F MET 1 F ASN 426 0 ? 22 2 0 G MET 1 . G ASN 416 . G MET 1 G ASN 426 0 ? 23 1 0 F MET 1 . F ASN 416 . F MET 1 F ASN 426 0 ? 23 2 0 H MET 1 . H ASN 416 . H MET 1 H ASN 426 0 ? 24 1 0 F MET 1 . F ASN 416 . F MET 1 F ASN 426 0 ? 24 2 0 I MET 1 . I ASN 416 . I MET 1 I ASN 426 0 ? 25 1 0 G MET 1 . G ASN 416 . G MET 1 G ASN 426 0 ? 25 2 0 H MET 1 . H ASN 416 . H MET 1 H ASN 426 0 ? 26 1 0 G MET 1 . G ASN 416 . G MET 1 G ASN 426 0 ? 26 2 0 I MET 1 . I ASN 416 . I MET 1 I ASN 426 0 ? 27 1 0 H MET 1 . H ASN 416 . H MET 1 H ASN 426 0 ? 27 2 0 I MET 1 . I ASN 416 . I MET 1 I ASN 426 0 ? 28 1 0 J MET 1 . J VAL 437 . J MET 1 J VAL 437 0 ? 28 2 0 K MET 1 . K VAL 437 . K MET 1 K VAL 437 0 ? 29 1 0 J MET 1 . J VAL 437 . J MET 1 J VAL 437 0 ? 29 2 0 L MET 1 . L VAL 437 . L MET 1 L VAL 437 0 ? 30 1 0 K MET 1 . K VAL 437 . K MET 1 K VAL 437 0 ? 30 2 0 L MET 1 . L VAL 437 . L MET 1 L VAL 437 0 ? # loop_ _struct_ncs_ens.id _struct_ncs_ens.details 1 ? 2 ? 3 ? 4 ? 5 ? 6 ? 7 ? 8 ? 9 ? 10 ? 11 ? 12 ? 13 ? 14 ? 15 ? 16 ? 17 ? 18 ? 19 ? 20 ? 21 ? 22 ? 23 ? 24 ? 25 ? 26 ? 27 ? 28 ? 29 ? 30 ? # _struct.entry_id 6DPV _struct.title 'Undecorated GDP microtubule' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6DPV _struct_keywords.text 'microtubule, cytoskeleton, dynamic, seam, CELL CYCLE' _struct_keywords.pdbx_keywords 'CELL CYCLE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 2 ? H N N 2 ? I N N 2 ? J N N 1 ? K N N 1 ? L N N 1 ? M N N 3 ? N N N 4 ? O N N 5 ? P N N 3 ? Q N N 4 ? 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L GTP 501 L MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.007 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OD2 ? 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J ASP 98 ? 1_555 MG ? Z MG . ? J MG 502 ? 1_555 O1G ? Y GTP . ? J GTP 501 ? 1_555 62.4 ? 11 OD2 ? J ASP 98 ? J ASP 98 ? 1_555 MG ? Z MG . ? J MG 502 ? 1_555 O1B ? Y GTP . ? J GTP 501 ? 1_555 131.1 ? 12 O1G ? Y GTP . ? J GTP 501 ? 1_555 MG ? Z MG . ? J MG 502 ? 1_555 O1B ? Y GTP . ? J GTP 501 ? 1_555 74.7 ? 13 OD2 ? K ASP 98 ? K ASP 98 ? 1_555 MG ? BA MG . ? K MG 502 ? 1_555 O1G ? AA GTP . ? K GTP 501 ? 1_555 63.0 ? 14 OD2 ? K ASP 98 ? K ASP 98 ? 1_555 MG ? BA MG . ? K MG 502 ? 1_555 O1B ? AA GTP . ? K GTP 501 ? 1_555 132.5 ? 15 O1G ? AA GTP . ? K GTP 501 ? 1_555 MG ? BA MG . ? K MG 502 ? 1_555 O1B ? AA GTP . ? K GTP 501 ? 1_555 75.3 ? 16 OD2 ? L ASP 98 ? L ASP 98 ? 1_555 MG ? DA MG . ? L MG 502 ? 1_555 O1G ? CA GTP . ? L GTP 501 ? 1_555 63.7 ? 17 OD2 ? L ASP 98 ? L ASP 98 ? 1_555 MG ? DA MG . ? L MG 502 ? 1_555 O1B ? CA GTP . ? L GTP 501 ? 1_555 135.3 ? 18 O1G ? CA GTP . ? L GTP 501 ? 1_555 MG ? DA MG . ? L MG 502 ? 1_555 O1B ? CA GTP . ? 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AD3 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA1 5 6 ? parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA4 5 6 ? parallel AA4 6 7 ? parallel AA4 7 8 ? anti-parallel AA4 8 9 ? anti-parallel AA4 9 10 ? parallel AA4 10 11 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? parallel AA6 3 4 ? parallel AA6 4 5 ? parallel AA6 5 6 ? parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? parallel AA9 1 2 ? parallel AA9 2 3 ? parallel AA9 3 4 ? parallel AA9 4 5 ? parallel AA9 5 6 ? parallel AA9 6 7 ? parallel AA9 7 8 ? anti-parallel AA9 8 9 ? anti-parallel AA9 9 10 ? parallel AA9 10 11 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? parallel AB2 4 5 ? parallel AB2 5 6 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? parallel AB5 4 5 ? parallel AB5 5 6 ? parallel AB5 6 7 ? parallel AB5 7 8 ? anti-parallel AB5 8 9 ? anti-parallel AB5 9 10 ? parallel AB5 10 11 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? parallel AB7 3 4 ? parallel AB7 4 5 ? parallel AB7 5 6 ? parallel AB7 6 7 ? parallel AB7 7 8 ? anti-parallel AB7 8 9 ? anti-parallel AB7 9 10 ? parallel AB7 10 11 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? parallel AB9 4 5 ? parallel AB9 5 6 ? parallel AB9 6 7 ? parallel AB9 7 8 ? anti-parallel AB9 8 9 ? anti-parallel AB9 9 10 ? parallel AB9 10 11 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC2 1 2 ? parallel AC2 2 3 ? parallel AC2 3 4 ? parallel AC2 4 5 ? parallel AC2 5 6 ? parallel AC2 6 7 ? parallel AC2 7 8 ? anti-parallel AC2 8 9 ? anti-parallel AC2 9 10 ? parallel AC2 10 11 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? parallel AC4 4 5 ? parallel AC4 5 6 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? parallel AC7 4 5 ? parallel AC7 5 6 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? parallel AD1 3 4 ? parallel AD1 4 5 ? parallel AD1 5 6 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 92 ? 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