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_entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 490 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E ASN 149 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? E ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? B ASN 80 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? E ASN 174 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? B ASN 149 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale7 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale8 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F BMA . C1 ? ? F NAG 2 F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale9 covale both ? F BMA . O3 ? ? ? 1_555 F MAN . C1 ? ? F BMA 3 F MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale10 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale11 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G BMA . C1 ? ? G NAG 2 G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale12 covale both ? G BMA . O3 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? G BMA 3 G MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale13 covale both ? G BMA . 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K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 6 ? AA2 ? 6 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 6 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 6 ? AB6 ? 5 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 6 ? AB9 ? 5 ? 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sing N N 277 MAN O6 HO6 sing N N 278 MET N CA sing N N 279 MET N H sing N N 280 MET N H2 sing N N 281 MET CA C sing N N 282 MET CA CB sing N N 283 MET CA HA sing N N 284 MET C O doub N N 285 MET C OXT sing N N 286 MET CB CG sing N N 287 MET CB HB2 sing N N 288 MET CB HB3 sing N N 289 MET CG SD sing N N 290 MET CG HG2 sing N N 291 MET CG HG3 sing N N 292 MET SD CE sing N N 293 MET CE HE1 sing N N 294 MET CE HE2 sing N N 295 MET CE HE3 sing N N 296 MET OXT HXT sing N N 297 NAG C1 C2 sing N N 298 NAG C1 O1 sing N N 299 NAG C1 O5 sing N N 300 NAG C1 H1 sing N N 301 NAG C2 C3 sing N N 302 NAG C2 N2 sing N N 303 NAG C2 H2 sing N N 304 NAG C3 C4 sing N N 305 NAG C3 O3 sing N N 306 NAG C3 H3 sing N N 307 NAG C4 C5 sing N N 308 NAG C4 O4 sing N N 309 NAG C4 H4 sing N N 310 NAG C5 C6 sing N N 311 NAG C5 O5 sing N N 312 NAG C5 H5 sing N N 313 NAG C6 O6 sing N N 314 NAG C6 H61 sing N N 315 NAG C6 H62 sing N N 316 NAG C7 C8 sing N N 317 NAG C7 N2 sing N N 318 NAG C7 O7 doub N N 319 NAG C8 H81 sing N N 320 NAG C8 H82 sing N N 321 NAG C8 H83 sing N N 322 NAG N2 HN2 sing N N 323 NAG O1 HO1 sing N N 324 NAG O3 HO3 sing N N 325 NAG O4 HO4 sing N N 326 NAG O6 HO6 sing N N 327 PHE N CA sing N N 328 PHE N H sing N N 329 PHE N H2 sing N N 330 PHE CA C sing N N 331 PHE CA CB sing N N 332 PHE CA HA sing N N 333 PHE C O doub N N 334 PHE C OXT sing N N 335 PHE CB CG sing N N 336 PHE CB HB2 sing N N 337 PHE CB HB3 sing N N 338 PHE CG CD1 doub Y N 339 PHE CG CD2 sing Y N 340 PHE CD1 CE1 sing Y N 341 PHE CD1 HD1 sing N N 342 PHE CD2 CE2 doub Y N 343 PHE CD2 HD2 sing N N 344 PHE CE1 CZ doub Y N 345 PHE CE1 HE1 sing N N 346 PHE CE2 CZ sing Y N 347 PHE CE2 HE2 sing N N 348 PHE CZ HZ sing N N 349 PHE OXT HXT sing N N 350 PRO N CA sing N N 351 PRO N CD sing N N 352 PRO N H sing N N 353 PRO CA C sing N N 354 PRO CA CB sing N N 355 PRO CA HA sing N N 356 PRO C O doub N N 357 PRO C OXT sing N N 358 PRO CB CG sing N N 359 PRO CB HB2 sing N N 360 PRO CB HB3 sing N N 361 PRO CG CD sing N N 362 PRO CG HG2 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_em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units KILODALTONS/NANOMETER _em_entity_assembly_molwt.value ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 10116 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Rattus norvegicus' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 1 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell TSA201 _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 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PHENIX 1.13 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.15 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'R01 GM100400' 1 'Howard Hughes Medical Institute (HHMI)' 'United States' ? 2 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero F 4 NAG 1 F NAG 1 C NAG 350 n F 4 NAG 2 F NAG 2 C NAG 351 n F 4 BMA 3 F BMA 3 C BMA 352 n F 4 MAN 4 F MAN 4 C MAN 353 n G 5 NAG 1 G NAG 1 A NAG 350 n G 5 NAG 2 G NAG 2 A NAG 351 n G 5 BMA 3 G BMA 3 A BMA 352 n G 5 MAN 4 G MAN 4 A MAN 353 n G 5 MAN 5 G MAN 5 A MAN 354 n G 5 MAN 6 G MAN 6 A MAN 355 n G 5 MAN 7 G MAN 7 A MAN 356 n H 6 NAG 1 H NAG 1 E NAG 348 n H 6 NAG 2 H NAG 2 E NAG 349 n H 6 BMA 3 H BMA 3 E BMA 350 n I 7 NAG 1 I NAG 1 E NAG 351 n I 7 NAG 2 I NAG 2 E NAG 352 n J 6 NAG 1 J NAG 1 B NAG 346 n J 6 NAG 2 J NAG 2 B NAG 347 n J 6 BMA 3 J BMA 3 B BMA 348 n K 7 NAG 1 K NAG 1 B NAG 349 n K 7 NAG 2 K NAG 2 B NAG 350 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 DManpa1-3DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/3,4,3/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 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