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NTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILVKTGIT ; C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;SIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNADSRILIEK ARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWSAQTIGRNS KTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEKQE ; ;SIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNADSRILIEK ARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWSAQTIGRNS KTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEKQE ; D ? 5 'polypeptide(L)' no no ;DRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSGLTADARSM IEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEPSGTFYRYN AKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELIKELKEKEA AE ; ;DRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSGLTADARSM IEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEPSGTFYRYN AKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELIKELKEKEA AE ; E ? 6 'polypeptide(L)' no no ;FRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPDA RVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTAI GARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI ; ;FRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPDA RVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTAI GARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI ; F ? 7 'polypeptide(L)' no no ;TGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSGLIPDG RHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGYKGAAT GKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAIDFAQK EIN ; ;TGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSGLIPDG RHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGYKGAAT GKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAIDFAQK EIN ; G ? 8 'polypeptide(L)' no no ;SVTMMTVEEKPDVTYSDVGGCKDQIEKLREVVELPLLSPERFATLGIDPPKGILLYGPPGTGKTLCARAVANRTDATFIR VIGSELVQKYVGEGARMVRELFEMARTKKACIIFFDEIDAVGGARFDDGAGGDNEVQRTMLELITQLDGFDPRGNIKVMF ATNRPNTLDPALLRPGRIDRKVEFSLPDLEGRANIFRIHSKSMSVERGIRWELISRLCPNSTGAELRSVCTEAGMFAIRA RRKVATEKDFLKAVDKVISGYK ; ;SVTMMTVEEKPDVTYSDVGGCKDQIEKLREVVELPLLSPERFATLGIDPPKGILLYGPPGTGKTLCARAVANRTDATFIR VIGSELVQKYVGEGARMVRELFEMARTKKACIIFFDEIDAVGGARFDDGAGGDNEVQRTMLELITQLDGFDPRGNIKVMF ATNRPNTLDPALLRPGRIDRKVEFSLPDLEGRANIFRIHSKSMSVERGIRWELISRLCPNSTGAELRSVCTEAGMFAIRA RRKVATEKDFLKAVDKVISGYK ; H ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MVSVMKMDKSPTESYSDIGGLESQIQEIKESVELPLTHPELYEEMGIKPPKGVILYGAPGTGKTLLAKAVANQTSATFLR 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ATNRLDILDPALLRPGRIDRKIEFPPPSVAARAEILRIHSRKMNLTRGINLRKVAEKMNGCSGADVKGVCTEAGMYALRE RRIHVTQEDFELAVGKVMNKNQETAISVAKLFK ; J ? 11 'polypeptide(L)' no no ;DSDSSISVMGENEKPDVTYADVGGLDMQKQEIREAVELPLVQADLYEQIGIDPPRGVLLYGPPGTGKTMLVKAVANSTKA AFIRVNGSEFVHKYLGEGPRMVRDVFRLARENAPSIIFIDEVDSIATKRFDAQTGSDREVQRILIELLTQMDGFDQSTNV KVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPSLRDRRERRLIFGTIASKMSLAPEADLDSLIIRNDSLSGAVIAAIMQEAGL RAVRKNRYVILQSDLEEAYATQVKTDNTVDKFDFYK ; ;DSDSSISVMGENEKPDVTYADVGGLDMQKQEIREAVELPLVQADLYEQIGIDPPRGVLLYGPPGTGKTMLVKAVANSTKA AFIRVNGSEFVHKYLGEGPRMVRDVFRLARENAPSIIFIDEVDSIATKRFDAQTGSDREVQRILIELLTQMDGFDQSTNV KVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPSLRDRRERRLIFGTIASKMSLAPEADLDSLIIRNDSLSGAVIAAIMQEAGL RAVRKNRYVILQSDLEEAYATQVKTDNTVDKFDFYK ; K ? 12 'polypeptide(L)' no no ;LVYNMTSFEQGEITFDGIGGLTEQIRELREVIELPLKNPEIFQRVGIKPPKGVLLYGPPGTGKTLLAKAVAATIGANFIF SPASGIVDKYIGESARIIREMFAYAKEHEPCIIFMDEVDAIGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLTQMDGFDNLGQTKIIM ATNRPDTLDPALLRPGRLDRKVEIPLPNEAGRLEIFKIHTAKVKKTGEFDFEAAVKMSDGFNGADIRNCATEAGFFAIRD 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T N N 16 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP PSA1_YEAST P21243 ? 1 ;DRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIGMVVNGPIPDARN AALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPAGYYVGYKATATG PKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAENIEERLVAIAEQ ; 13 2 UNP PSA2_YEAST P23639 ? 2 ;MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGP DYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWK ATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTS QEINDRLEAL ; 1 3 UNP PSA3_YEAST P23638 ? 3 ;SRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGLTADAEIL INTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGWKAISVGA NTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILVKTGIT ; 8 4 UNP PSA4_YEAST P40303 ? 4 ;SIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNADSRILIEK ARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWSAQTIGRNS KTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEKQE ; 9 5 UNP PSA5_YEAST P32379 ? 5 ;DRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSGLTADARSM IEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEPSGTFYRYN AKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELIKELKEKEA AE ; 9 6 UNP PSA6_YEAST P40302 ? 6 ;FRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPDA RVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTAI GARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI ; 2 7 UNP PSA7_YEAST P21242 ? 7 ;TGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSGLIPDG RHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGYKGAAT GKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAIDFAQK EIN ; 6 8 UNP PRS7_YEAST P33299 ? 8 ;SVTMMTVEEKPDVTYSDVGGCKDQIEKLREVVELPLLSPERFATLGIDPPKGILLYGPPGTGKTLCARAVANRTDATFIR VIGSELVQKYVGEGARMVRELFEMARTKKACIIFFDEIDAVGGARFDDGAGGDNEVQRTMLELITQLDGFDPRGNIKVMF ATNRPNTLDPALLRPGRIDRKVEFSLPDLEGRANIFRIHSKSMSVERGIRWELISRLCPNSTGAELRSVCTEAGMFAIRA RRKVATEKDFLKAVDKVISGYK ; 194 9 UNP PRS4_YEAST P40327 ? 9 ;MVSVMKMDKSPTESYSDIGGLESQIQEIKESVELPLTHPELYEEMGIKPPKGVILYGAPGTGKTLLAKAVANQTSATFLR IVGSELIQKYLGDGPRLCRQIFKVAGENAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDDRGDVKVIM ATNKIETLDPALIRPGRIDRKILFENPDLSTKKKILGIHTSKMNLSEDVNLETLVTTKDDLSGADIQAMCTEAGLLALRE RRMQVTAEDFKQAKERVMKNKVEENLEGLYL ; 167 10 UNP PRS8_YEAST Q01939 ? 10 ;LVSLMMVEKVPDSTYDMVGGLTKQIKEIKEVIELPVKHPELFESLGIAQPKGVILYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCKFIR VSGAELVQKYIGEGSRMVRELFVMAREHAPSIIFMDEIDSIGSTRVEGSGGGDSEVQRTMLELLNQLDGFETSKNIKIIM ATNRLDILDPALLRPGRIDRKIEFPPPSVAARAEILRIHSRKMNLTRGINLRKVAEKMNGCSGADVKGVCTEAGMYALRE RRIHVTQEDFELAVGKVMNKNQETAISVAKLFK ; 133 11 UNP PRS6B_YEAST P33298 ? 11 ;DSDSSISVMGENEKPDVTYADVGGLDMQKQEIREAVELPLVQADLYEQIGIDPPRGVLLYGPPGTGKTMLVKAVANSTKA AFIRVNGSEFVHKYLGEGPRMVRDVFRLARENAPSIIFIDEVDSIATKRFDAQTGSDREVQRILIELLTQMDGFDQSTNV KVIMATNRADTLDPALLRPGRLDRKIEFPSLRDRRERRLIFGTIASKMSLAPEADLDSLIIRNDSLSGAVIAAIMQEAGL RAVRKNRYVILQSDLEEAYATQVKTDNTVDKFDFYK ; 153 12 UNP PRS10_YEAST P53549 ? 12 ;LVYNMTSFEQGEITFDGIGGLTEQIRELREVIELPLKNPEIFQRVGIKPPKGVLLYGPPGTGKTLLAKAVAATIGANFIF SPASGIVDKYIGESARIIREMFAYAKEHEPCIIFMDEVDAIGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLTQMDGFDNLGQTKIIM ATNRPDTLDPALLRPGRLDRKVEIPLPNEAGRLEIFKIHTAKVKKTGEFDFEAAVKMSDGFNGADIRNCATEAGFFAIRD DRDHINPDDLMKAVRKVAEVKKLEGTIEYQK ; 166 13 UNP PRS6A_YEAST P33297 ? 13 ;DEKPTETYSDVGGLDKQIEELVEAIVLPMKRADKFKDMGIRAPKGALMYGPPGTGKTLLARACAAQTNATFLKLAAPQLV QMYIGEGAKLVRDAFALAKEKAPTIIFIDELDAIGTKRFDSEKSGDREVQRTMLELLNQLDGFSSDDRVKVLAATNRVDV LDPALLRSGRLDRKIEFPLPSEDSRAQILQIHSRKMTTDDDINWQELARSTDEFNGAQLKAVTVEAGMIALRNGQSSVKH EDFVEGISEVQARKSKSVSFYA ; 173 14 PDB 6EF1 6EF1 ? 14 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6EF1 A 1 ? 239 ? 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GLY B 167 TRP B 179 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP B 187 ? SER B 199 ? ASP B 187 SER B 199 1 ? 13 HELX_P HELX_P17 AB8 ASN B 218 ? GLY B 223 ? ASN B 218 GLY B 223 1 ? 6 HELX_P HELX_P18 AB9 THR B 239 ? ALA B 249 ? THR B 239 ALA B 249 1 ? 11 HELX_P HELX_P19 AC1 GLN C 14 ? ILE C 22 ? GLN C 21 ILE C 29 1 ? 9 HELX_P HELX_P20 AC2 SER C 23 ? ALA C 25 ? SER C 30 ALA C 32 5 ? 3 HELX_P HELX_P21 AC3 ALA C 77 ? ASN C 96 ? ALA C 84 ASN C 103 1 ? 20 HELX_P HELX_P22 AC4 PRO C 100 ? VAL C 105 ? PRO C 107 VAL C 112 1 ? 6 HELX_P HELX_P23 AC5 SER C 109 ? GLN C 117 ? SER C 116 GLN C 124 1 ? 9 HELX_P HELX_P24 AC6 ASN C 161 ? TYR C 173 ? ASN C 168 TYR C 180 1 ? 13 HELX_P HELX_P25 AC7 LYS C 178 ? THR C 194 ? LYS C 185 THR C 201 1 ? 17 HELX_P HELX_P26 AC8 THR C 200 ? ASP C 202 ? THR C 207 ASP C 209 5 ? 3 HELX_P HELX_P27 AC9 LYS C 224 ? THR C 235 ? LYS C 231 THR C 242 1 ? 12 HELX_P HELX_P28 AD1 ILE D 9 ? LEU D 16 ? ILE D 17 LEU D 24 1 ? 8 HELX_P HELX_P29 AD2 ASN D 71 ? LEU D 92 ? 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HIS N H2 sing N N 224 HIS CA C sing N N 225 HIS CA CB sing N N 226 HIS CA HA sing N N 227 HIS C O doub N N 228 HIS C OXT sing N N 229 HIS CB CG sing N N 230 HIS CB HB2 sing N N 231 HIS CB HB3 sing N N 232 HIS CG ND1 sing Y N 233 HIS CG CD2 doub Y N 234 HIS ND1 CE1 doub Y N 235 HIS ND1 HD1 sing N N 236 HIS CD2 NE2 sing Y N 237 HIS CD2 HD2 sing N N 238 HIS CE1 NE2 sing Y N 239 HIS CE1 HE1 sing N N 240 HIS NE2 HE2 sing N N 241 HIS OXT HXT sing N N 242 ILE N CA sing N N 243 ILE N H sing N N 244 ILE N H2 sing N N 245 ILE CA C sing N N 246 ILE CA CB sing N N 247 ILE CA HA sing N N 248 ILE C O doub N N 249 ILE C OXT sing N N 250 ILE CB CG1 sing N N 251 ILE CB CG2 sing N N 252 ILE CB HB sing N N 253 ILE CG1 CD1 sing N N 254 ILE CG1 HG12 sing N N 255 ILE CG1 HG13 sing N N 256 ILE CG2 HG21 sing N N 257 ILE CG2 HG22 sing N N 258 ILE CG2 HG23 sing N N 259 ILE CD1 HD11 sing N N 260 ILE CD1 HD12 sing N N 261 ILE CD1 HD13 sing N N 262 ILE OXT HXT sing N N 263 LEU N CA sing N N 264 LEU N H sing N N 265 LEU N H2 sing N N 266 LEU CA C sing N N 267 LEU CA CB sing N N 268 LEU CA HA sing N N 269 LEU C O doub N N 270 LEU C OXT sing N N 271 LEU CB CG sing N N 272 LEU CB HB2 sing N N 273 LEU CB HB3 sing N N 274 LEU CG CD1 sing N N 275 LEU CG CD2 sing N N 276 LEU CG HG sing N N 277 LEU CD1 HD11 sing N N 278 LEU CD1 HD12 sing N N 279 LEU CD1 HD13 sing N N 280 LEU CD2 HD21 sing N N 281 LEU CD2 HD22 sing N N 282 LEU CD2 HD23 sing N N 283 LEU OXT HXT sing N N 284 LYS N CA sing N N 285 LYS N H sing N N 286 LYS N H2 sing N N 287 LYS CA C sing N N 288 LYS CA CB sing N N 289 LYS CA HA sing N N 290 LYS C O doub N N 291 LYS C OXT sing N N 292 LYS CB CG sing N N 293 LYS CB HB2 sing N N 294 LYS CB HB3 sing N N 295 LYS CG CD sing N N 296 LYS CG HG2 sing N N 297 LYS CG HG3 sing N N 298 LYS CD CE sing N N 299 LYS CD HD2 sing N N 300 LYS CD HD3 sing N N 301 LYS CE NZ sing N N 302 LYS CE HE2 sing N N 303 LYS CE HE3 sing N N 304 LYS NZ HZ1 sing N N 305 LYS NZ HZ2 sing N N 306 LYS NZ HZ3 sing N N 307 LYS OXT HXT sing N N 308 MET N CA sing N N 309 MET N H sing N N 310 MET N H2 sing N N 311 MET CA C sing N N 312 MET CA CB sing N N 313 MET CA HA sing N N 314 MET C O doub N N 315 MET C OXT sing N N 316 MET CB CG sing N N 317 MET CB HB2 sing N N 318 MET CB HB3 sing N N 319 MET CG SD sing N N 320 MET CG HG2 sing N N 321 MET CG HG3 sing N N 322 MET SD CE sing N N 323 MET CE HE1 sing N N 324 MET CE HE2 sing N N 325 MET CE HE3 sing N N 326 MET OXT HXT sing N N 327 PHE N CA sing N N 328 PHE N H sing N N 329 PHE N H2 sing N N 330 PHE CA C sing N N 331 PHE CA CB sing N N 332 PHE CA HA sing N N 333 PHE C O doub N N 334 PHE C OXT sing N N 335 PHE CB CG sing N N 336 PHE CB HB2 sing N N 337 PHE CB HB3 sing N N 338 PHE CG CD1 doub Y N 339 PHE CG CD2 sing Y N 340 PHE CD1 CE1 sing Y N 341 PHE CD1 HD1 sing N N 342 PHE CD2 CE2 doub Y N 343 PHE CD2 HD2 sing N N 344 PHE CE1 CZ doub Y N 345 PHE CE1 HE1 sing N N 346 PHE CE2 CZ sing Y N 347 PHE CE2 HE2 sing N N 348 PHE CZ HZ sing N N 349 PHE OXT HXT sing N N 350 PRO N CA sing N N 351 PRO N CD sing N N 352 PRO N H sing N N 353 PRO CA C sing N N 354 PRO CA CB sing N N 355 PRO CA HA sing N N 356 PRO C O doub N N 357 PRO C OXT sing N N 358 PRO CB CG sing N N 359 PRO CB HB2 sing N N 360 PRO CB HB3 sing N N 361 PRO CG CD sing N N 362 PRO CG HG2 sing N N 363 PRO CG HG3 sing N N 364 PRO CD HD2 sing N N 365 PRO CD HD3 sing N N 366 PRO OXT HXT sing N N 367 SER N CA sing N N 368 SER N H sing N N 369 SER N H2 sing N N 370 SER CA C sing N N 371 SER CA CB sing N N 372 SER CA HA sing N N 373 SER C O doub N N 374 SER C OXT sing N N 375 SER CB OG sing N N 376 SER CB HB2 sing N N 377 SER CB HB3 sing N N 378 SER OG HG sing N N 379 SER OXT HXT sing N N 380 THR N CA sing N N 381 THR N H sing N N 382 THR N H2 sing N N 383 THR CA C sing N N 384 THR CA CB sing N N 385 THR CA HA sing N N 386 THR C O doub N N 387 THR C OXT sing N N 388 THR CB OG1 sing N N 389 THR CB CG2 sing N N 390 THR CB HB sing N N 391 THR OG1 HG1 sing N N 392 THR CG2 HG21 sing N N 393 THR CG2 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HEPES 1 2 25 mM ? NaCl 1 3 25 mM ? KCl 1 4 10 mM ? MgCl2 1 5 1 mM ? TCEP 1 6 5 mM ? ATP 1 7 0.05 '% (w/v)' ? 'Nonidet P-40' 1 8 6 mM ? ortho-phenanthroline # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details 'CTF correction was performed by Relion during reconstruction' # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 1 3 ? ? 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? 2 2 ? ? 559292 ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 'ATCC 204508 / S288c' ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 1 3 ? 511693 'Escherichia coli BL21' ? 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Leginon 3.2 ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? MotionCorr2 2 1 ? ? 5 'CTF CORRECTION' ? RELION 2.1 1 ? ? 6 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 4 1 ? ? 7 'CTF CORRECTION' ? Gctf ? 1 ? ? 8 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 9 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 10 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' 1.12 ? 1 ? 11 'MODEL FITTING' ? PHENIX 1.11-2580 ? 1 ? 12 OTHER ? ? ? ? ? ? 13 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 2.1 1 ? ? 14 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 2.1 1 ? ? 15 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 16 RECONSTRUCTION ? RELION 2.1 1 ? ? 17 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.11-2580 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 25 _em_specimen.details ;26S proteasomes were diluted to a concentration of 20 micromolar in a buffer with an ATP regeneration system, and 6 mM ortho-phenanthroline. This solution was mixed with an equal volume of 50 micromolar ubiquitinated model substrate ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' R01-GM094497 1 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' DP2-EB020402 2 # _pdbx_initial_refinement_model.id 1 _pdbx_initial_refinement_model.type 'experimental model' _pdbx_initial_refinement_model.source_name PDB _pdbx_initial_refinement_model.accession_code 5MPC # _atom_sites.entry_id 6EF1 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C N O P S # loop_