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'Escherichia coli B' 37762 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP PSB1_YEAST P38624 ? 1 ;MNGIQVDINRLKKGEVSLGTSIMAVTFKDGVILGADSRTTTGAYIANRVTDKLTRVHDKIWCCRSGSAADTQAIADIVQY HLELYTSQYGTPSTETAASVFKELCYENKDNLTAGIIVAGYDDKNKGEVYTIPLGGSVHKLPYAIAGSGSTFIYGYCDKN FRENMSKEETVDFIKHSLSQAIKWDGSSGGVIRMVVLTAAGVERLIFYPDEYEQL ; 1 2 UNP PSB2_YEAST P25043 ? 2 ;MAGLSFDNYQRNNFLAENSHTQPKATSTGTTIVGVKFNNGVVIAADTRSTQGPIVADKNCAKLHRISPKIWCAGAGTAAD TEAVTQLIGSNIELHSLYTSREPRVVSALQMLKQHLFKYQGHIGAYLIVAGVDPTGSHLFSIHAHGSTDVGYYLSLGSGS LAAMAVLESHWKQDLTKEEAIKLASDAIQAGIWNDLGSGSNVDVCVMEIGKDAEYLRNYLTPNVREEKQKSYKFPRGTTA VLKESIVNICDIQEEQVDITA ; 1 3 UNP PSB3_YEAST P25451 ? 3 ;MSDPSSINGGIVVAMTGKDCVAIACDLRLGSQSLGVSNKFEKIFHYGHVFLGITGLATDVTTLNEMFRYKTNLYKLKEER AIEPETFTQLVSSSLYERRFGPYFVGPVVAGINSKSGKPFIAGFDLIGCIDEAKDFIVSGTASDQLFGMCESLYEPNLEP EDLFETISQALLNAADRDALSGWGAVVYIIKKDEVVKRYLKMRQD ; 1 4 UNP PSB4_YEAST P22141 ? 4 ;MDIILGIRVQDSVILASSKAVTRGISVLKDSDDKTRQLSPHTLMSFAGEAGDTVQFAEYIQANIQLYSIREDYELSPQAV SSFVRQELAKSIRSRRPYQVNVLIGGYDKKKNKPELYQIDYLGTKVELPYGAHGYSGFYTFSLLDHHYRPDMTTEEGLDL LKLCVQELEKRMPMDFKGVIVKIVDKDGIRQVDDFQAQ ; 1 5 UNP PSB5_YEAST P30656 ? 5 ;MQAIADSFSVPNRLVKELQYDNEQNLESDFVTGASQFQRLAPSLTVPPIASPQQFLRAHTDDSRNPDCKIKIAHGTTTLA FRFQGGIIVAVDSRATAGNWVASQTVKKVIEINPFLLGTMAGGAADCQFWETWLGSQCRLHELREKERISVAAASKILSN LVYQYKGAGLSMGTMICGYTRKEGPTIYYVDSDGTRLKGDIFCVGSGQTFAYGVLDSNYKWDLSVEDALYLGKRSILAAA HRDAYSGGSVNLYHVTEDGWIYHGNHDVGELFWKVKEEEGSFNNVIG ; 1 6 UNP PSB6_YEAST P23724 ? 6 ;MATIASEYSSEASNTPIEHQFNPYGDNGGTILGIAGEDFAVLAGDTRNITDYSINSRYEPKVFDCGDNIVMSANGFAADG DALVKRFKNSVKWYHFDHNDKKLSINSAARNIQHLLYGKRFFPYYVHTIIAGLDEDGKGAVYSFDPVGSYEREQCRAGGA AASLIMPFLDNQVNFKNQYEPGTNGKVKKPLKYLSVEEVIKLVRDSFTSATERHIQVGDGLEILIVTKDGVRKEFYELKR D ; 1 7 UNP PSB7_YEAST P30657 ? 7 ;MNHDPFSWGRPADSTYGAYNTQIANAGASPMVNTQQPIVTGTSVISMKYDNGVIIAADNLGSYGSLLRFNGVERLIPVGD NTVVGISGDISDMQHIERLLKDLVTENAYDNPLADAEEALEPSYIFEYLATVMYQRRSKMNPLWNAIIVAGVQSNGDQFL RYVNLLGVTYSSPTLATGFGAHMANPLLRKVVDRESDIPKTTVQVAEEAIVNAMRVLYYRDARSSRNFSLAIIDKNTGLT FKKNLQVENMKWDFAKDIKGYGTQKI ; 1 8 UNP PSA1_YEAST P21243 ? 8 ;MSGAAAASAAGYDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKATNQTNINSLAVRGKDCTVVISQKKVPDKLLDPTTVSYIFCISRTIG MVVNGPIPDARNAALRAKAEAAEFRYKYGYDMPCDVLAKRMANLSQIYTQRAYMRPLGVILTFVSVDEELGPSIYKTDPA GYYVGYKATATGPKQQEITTNLENHFKKSKIDHINEESWEKVVEFAITHMIDALGTEFSKNDLEVGVATKDKFFTLSAEN IEERLVAIAEQD ; 1 9 UNP PSA2_YEAST P23639 ? 9 ;MTDRYSFSLTTFSPSGKLGQIDYALTAVKQGVTSLGIKATNGVVIATEKKSSSPLAMSETLSKVSLLTPDIGAVYSGMGP DYRVLVDKSRKVAHTSYKRIYGEYPPTKLLVSEVAKIMQEATQSGGVRPFGVSLLIAGHDEFNGFSLYQVDPSGSYFPWK ATAIGKGSVAAKTFLEKRWNDELELEDAIHIALLTLKESVEGEFNGDTIELAIIGDENPDLLGYTGIPTDKGPRFRKLTS QEINDRLEAL ; 1 10 UNP PSA3_YEAST P23638 ? 10 ;MGSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYALESISHAGTAIGIMASDGIVLAAERKVTSTLLEQDTSTEKLYKLNDKIAVAVAGL TADAEILINTARIHAQNYLKTYNEDIPVEILVRRLSDIKQGYTQHGGLRPFGVSFIYAGYDDRYGYQLYTSNPSGNYTGW KAISVGANTSAAQTLLQMDYKDDMKVDDAIELALKTLSKTTDSSALTYDRLEFATIRKGANDGEVYQKIFKPQEIKDILV KTGITKKDEDEEADEDMK ; 1 11 UNP PSA4_YEAST P40303 ? 11 ;MSGYDRALSIFSPDGHIFQVEYALEAVKRGTCAVGVKGKNCVVLGCERRSTLKLQDTRITPSKVSKIDSHVVLSFSGLNA DSRILIEKARVEAQSHRLTLEDPVTVEYLTRYVAGVQQRYTQSGGVRPFGVSTLIAGFDPRDDEPKLYQTEPSGIYSSWS AQTIGRNSKTVREFLEKNYDRKEPPATVEECVKLTVRSLLEVVQTGAKNIEITVVKPDSDIVALSSEEINQYVTQIEQEK QEQQEQDKKKKSNH ; 1 12 UNP PSA5_YEAST P32379 ? 12 ;MFLTRSEYDRGVSTFSPEGRLFQVEYSLEAIKLGSTAIGIATKEGVVLGVEKRATSPLLESDSIEKIVEIDRHIGCAMSG LTADARSMIEHARTAAVTHNLYYDEDINVESLTQSVCDLALRFGEGASGEERLMSRPFGVALLIAGHDADDGYQLFHAEP SGTFYRYNAKAIGSGSEGAQAELLNEWHSSLTLKEAELLVLKILKQVMEEKLDENNAQLSCITKQDGFKIYDNEKTAELI KELKEKEAAESPEEADVEMS ; 1 13 UNP PSA6_YEAST P40302 ? 13 ;MFRNNYDGDTVTFSPTGRLFQVEYALEAIKQGSVTVGLRSNTHAVLVALKRNADELSSYQKKIIKCDEHMGLSLAGLAPD ARVLSNYLRQQCNYSSLVFNRKLAVERAGHLLCDKAQKNTQSYGGRPYGVGLLIIGYDKSGAHLLEFQPSGNVTELYGTA IGARSQGAKTYLERTLDTFIKIDGNPDELIKAGVEAISQSLRDESLTVDNLSIAIVGKDTPFTIYDGEAVAKYI ; 1 14 UNP PSA7_YEAST P21242 ? 14 ;MTSIGTGYDLSNSVFSPDGRNFQVEYAVKAVENGTTSIGIKCNDGVVFAVEKLITSKLLVPQKNVKIQVVDRHIGCVYSG LIPDGRHLVNRGREEAASFKKLYKTPIPIPAFADRLGQYVQAHTLYNSVRPFGVSTIFGGVDKNGAHLYMLEPSGSYWGY KGAATGKGRQSAKAELEKLVDHHPEGLSAREAVKQAAKIIYLAHEDNKEKDFELEISWCSLSETNGLHKFVKGDLLQEAI DFAQKEINGDDDEDEDDSDNVMSSDDENAPVATNANATTDQEGDIHLE ; 1 15 UNP PRS7_YEAST P33299 ? 15 ;MPPKEDWEKYKAPLEDDDKKPDDDKIVPLTEGDIQVLKSYGAAPYAAKLKQTENDLKDIEARIKEKAGVKESDTGLAPSH LWDIMGDRQRLGEEHPLQVARCTKIIKGNGESDETTTDNNNSGNSNSNSNQQSTDADEDDEDAKYVINLKQIAKFVVGLG ERVSPTDIEEGMRVGVDRSKYNIELPLPPRIDPSVTMMTVEEKPDVTYSDVGGCKDQIEKLREVVELPLLSPERFATLGI DPPKGILLYGPPGTGKTLCARAVANRTDATFIRVIGSELVQKYVGEGARMVRELFEMARTKKACIIFFDEIDAVGGARFD DGAGGDNEVQRTMLELITQLDGFDPRGNIKVMFATNRPNTLDPALLRPGRIDRKVEFSLPDLEGRANIFRIHSKSMSVER GIRWELISRLCPNSTGAELRSVCTEAGMFAIRARRKVATEKDFLKAVDKVISGYKKFSSTSRYMQYN ; 1 16 UNP PRS4_YEAST P40327 ? 16 ;MGQGVSSGQDKKKKKGSNQKPKYEPPVQSKFGRKKRKGGPATAEKLPNIYPSTRCKLKLLRMERIKDHLLLEEEFVSNSE ILKPFEKKQEEEKKQLEEIRGNPLSIGTLEEIIDDDHAIVTSPTMPDYYVSILSFVDKELLEPGCSVLLHHKTMSIVGVL QDDADPMVSVMKMDKSPTESYSDIGGLESQIQEIKESVELPLTHPELYEEMGIKPPKGVILYGAPGTGKTLLAKAVANQT SATFLRIVGSELIQKYLGDGPRLCRQIFKVAGENAPSIVFIDEIDAIGTKRYDSNSGGEREIQRTMLELLNQLDGFDDRG DVKVIMATNKIETLDPALIRPGRIDRKILFENPDLSTKKKILGIHTSKMNLSEDVNLETLVTTKDDLSGADIQAMCTEAG LLALRERRMQVTAEDFKQAKERVMKNKVEENLEGLYL ; 1 17 UNP PRS8_YEAST Q01939 ? 17 ;MTAAVTSSNIVLETHESGIKPYFEQKIQETELKIRSKTENVRRLEAQRNALNDKVRFIKDELRLLQEPGSYVGEVIKIVS DKKVLVKVQPEGKYIVDVAKDINVKDLKASQRVCLRSDSYMLHKVLENKADPLVSLMMVEKVPDSTYDMVGGLTKQIKEI KEVIELPVKHPELFESLGIAQPKGVILYGPPGTGKTLLARAVAHHTDCKFIRVSGAELVQKYIGEGSRMVRELFVMAREH APSIIFMDEIDSIGSTRVEGSGGGDSEVQRTMLELLNQLDGFETSKNIKIIMATNRLDILDPALLRPGRIDRKIEFPPPS VAARAEILRIHSRKMNLTRGINLRKVAEKMNGCSGADVKGVCTEAGMYALRERRIHVTQEDFELAVGKVMNKNQETAISV AKLFK ; 1 18 UNP PRS6B_YEAST P33298 ? 18 ;MEELGIVTPVEKAVEEKPAVKSYASLLAQLNGTVNNNSALSNVNSDIYFKLKKLEKEYELLTLQEDYIKDEQRHLKRELK RAQEEVKRIQSVPLVIGQFLEPIDQNTGIVSSTTGMSYVVRILSTLDRELLKPSMSVALHRHSNALVDILPPDSDSSISV MGENEKPDVTYADVGGLDMQKQEIREAVELPLVQADLYEQIGIDPPRGVLLYGPPGTGKTMLVKAVANSTKAAFIRVNGS EFVHKYLGEGPRMVRDVFRLARENAPSIIFIDEVDSIATKRFDAQTGSDREVQRILIELLTQMDGFDQSTNVKVIMATNR ADTLDPALLRPGRLDRKIEFPSLRDRRERRLIFGTIASKMSLAPEADLDSLIIRNDSLSGAVIAAIMQEAGLRAVRKNRY VILQSDLEEAYATQVKTDNTVDKFDFYK ; 1 19 UNP PRS10_YEAST P53549 ? 19 ;MSEEQDPLLAGLGETSGDNHTQQSHEQQPEQPQETEEHHEEEPSRVDPEQEAHNKALNQFKRKLLEHRRYDDQLKQRRQN IRDLEKLYDKTENDIKALQSIGQLIGEVMKELSEEKYIVKASSGPRYIVGVRNSVDRSKLKKGVRVTLDITTLTIMRILP RETDPLVYNMTSFEQGEITFDGIGGLTEQIRELREVIELPLKNPEIFQRVGIKPPKGVLLYGPPGTGKTLLAKAVAATIG ANFIFSPASGIVDKYIGESARIIREMFAYAKEHEPCIIFMDEVDAIGGRRFSEGTSADREIQRTLMELLTQMDGFDNLGQ TKIIMATNRPDTLDPALLRPGRLDRKVEIPLPNEAGRLEIFKIHTAKVKKTGEFDFEAAVKMSDGFNGADIRNCATEAGF FAIRDDRDHINPDDLMKAVRKVAEVKKLEGTIEYQKL ; 1 20 UNP PRS6A_YEAST P33297 ? 20 ;MATLEELDAQTLPGDDELDQEILNLSTQELQTRAKLLDNEIRIFRSELQRLSHENNVMLEKIKDNKEKIKNNRQLPYLVA NVVEVMDMNEIEDKENSESTTQGGNVNLDNTAVGKAAVVKTSSRQTVFLPMVGLVDPDKLKPNDLVGVNKDSYLILDTLP SEFDSRVKAMEVDEKPTETYSDVGGLDKQIEELVEAIVLPMKRADKFKDMGIRAPKGALMYGPPGTGKTLLARACAAQTN ATFLKLAAPQLVQMYIGEGAKLVRDAFALAKEKAPTIIFIDELDAIGTKRFDSEKSGDREVQRTMLELLNQLDGFSSDDR VKVLAATNRVDVLDPALLRSGRLDRKIEFPLPSEDSRAQILQIHSRKMTTDDDINWQELARSTDEFNGAQLKAVTVEAGM IALRNGQSSVKHEDFVEGISEVQARKSKSVSFYA ; 1 21 PDB 6EF3 6EF3 ? 21 ? 1 22 UNP RPN11_YEAST P43588 ? 22 ;MERLQRLMMNSKVGSADTGRDDTKETVYISSIALLKMLKHGRAGVPMEVMGLMLGEFVDDYTVNVVDVFAMPQSGTGVSV EAVDDVFQAKMMDMLKQTGRDQMVVGWYHSHPGFGCWLSSVDVNTQKSFEQLNSRAVAVVVDPIQSVKGKVVIDAFRLID TGALINNLEPRQTTSNTGLLNKANIQALIHGLNRHYYSLNIDYHKTAKETKMLMNLHKEQWQSGLKMYDYEEKEESNLAA TKSMVKIAEQYSKRIEEEKELTEEELKTRYVGRQDPKKHLSETADETLENNIVSVLTAGVNSVAIK ; 1 23 PDB 6EF3 6EF3 ? 23 ? 1 24 UNP RL40A_YEAST P0CH08 ? 24 ;MQIFVKTLTGKTITLEVESSDTIDNVKSKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGIIEP SLKALASKYNCDKSVCRKCYARLPPRATNCRKRKCGHTNQLRPKKKLK ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6EF3 1 1 ? 215 ? P38624 1 ? 215 ? -18 196 2 2 6EF3 2 1 ? 261 ? P25043 1 ? 261 ? -28 232 3 3 6EF3 3 1 ? 205 ? P25451 1 ? 205 ? 1 205 4 4 6EF3 4 1 ? 198 ? P22141 1 ? 198 ? 1 198 5 5 6EF3 5 1 ? 287 ? P30656 1 ? 287 ? -74 212 6 6 6EF3 6 1 ? 241 ? P23724 1 ? 241 ? -18 222 7 7 6EF3 7 1 ? 266 ? P30657 1 ? 266 ? -32 233 8 8 6EF3 A 1 ? 252 ? P21243 1 ? 252 ? 1 252 9 9 6EF3 B 1 ? 250 ? P23639 1 ? 250 ? 1 250 10 10 6EF3 C 1 ? 258 ? P23638 1 ? 258 ? 1 258 11 11 6EF3 D 1 ? 254 ? P40303 1 ? 254 ? 1 254 12 12 6EF3 E 1 ? 260 ? P32379 1 ? 260 ? 1 260 13 13 6EF3 F 1 ? 234 ? P40302 1 ? 234 ? 1 234 14 14 6EF3 G 1 ? 288 ? P21242 1 ? 288 ? 1 288 15 15 6EF3 H 1 ? 467 ? P33299 1 ? 467 ? 1 467 16 16 6EF3 I 1 ? 437 ? P40327 1 ? 437 ? 1 437 17 17 6EF3 J 1 ? 405 ? Q01939 1 ? 405 ? 1 405 18 18 6EF3 K 1 ? 428 ? P33298 1 ? 428 ? 1 428 19 19 6EF3 L 1 ? 437 ? P53549 1 ? 437 ? 1 437 20 20 6EF3 M 1 ? 434 ? P33297 1 ? 434 ? 1 434 21 21 6EF3 n 1 ? 15 ? 6EF3 218 ? 232 ? 218 232 22 22 6EF3 r 1 ? 306 ? P43588 1 ? 306 ? 1 306 23 23 6EF3 s 1 ? 38 ? 6EF3 106 ? 143 ? 106 143 24 24 6EF3 u 1 ? 128 ? P0CH08 1 ? 128 ? 1 128 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ADP non-polymer n "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N5 O10 P2' 427.201 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 ATP non-polymer . "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H16 N5 O13 P3' 507.181 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6EF3 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6EF3 _struct.title 'Yeast 26S proteasome bound to ubiquitinated substrate (4D motor state)' _struct.pdbx_descriptor ;Proteasome subunit beta type-1 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-2 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-3 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-4 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-5 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-6 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-7 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit alpha type-1 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit alpha type-2 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit alpha type-3 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit alpha type-4 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit alpha type-5 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit alpha type-6 (E.C.3.4.25.1), Probable proteasome subunit alpha type-7 (E.C.3.4.25.1), 26S proteasome regulatory subunit 7 homolog, 26S proteasome regulatory subunit 4 homolog, 26S proteasome regulatory subunit 8 homolog, 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog, 26S proteasome subunit RPT4, 26S proteasome regulatory subunit 6A, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase RPN11 (E.C.3.4.19.12), Model substrate polypeptide, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40 ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6EF3 _struct_keywords.text '26S Proteasome, ATPase, AAA+, Protease, Motor protein, Ubiquitin' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MOTOR PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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ASP L 298 GLY L 314 1 ? 17 HELX_P HELX_P170 AS8 ARG S 329 ? LEU S 333 ? ARG L 329 LEU L 333 5 ? 5 HELX_P HELX_P171 AS9 ALA S 355 ? THR S 365 ? ALA L 355 THR L 365 1 ? 11 HELX_P HELX_P172 AT1 ALA S 366 ? VAL S 368 ? ALA L 366 VAL L 368 5 ? 3 HELX_P HELX_P173 AT2 PHE S 374 ? LYS S 381 ? PHE L 374 LYS L 381 1 ? 8 HELX_P HELX_P174 AT3 ASP S 390 ? ILE S 403 ? ASP L 390 ILE L 403 1 ? 14 HELX_P HELX_P175 AT4 ASN S 411 ? LYS S 417 ? ASN L 411 LYS L 417 1 ? 7 HELX_P HELX_P176 AT5 LYS S 417 ? LYS S 426 ? LYS L 417 LYS L 426 1 ? 10 HELX_P HELX_P177 AT6 ASP T 38 ? ARG T 45 ? ASP M 38 ARG M 45 1 ? 8 HELX_P HELX_P178 AT7 ARG T 45 ? ASN T 72 ? ARG M 45 ASN M 72 1 ? 28 HELX_P HELX_P179 AT8 ASP T 136 ? LEU T 140 ? ASP M 136 LEU M 140 5 ? 5 HELX_P HELX_P180 AT9 ASP T 164 ? ALA T 169 ? ASP M 164 ALA M 169 1 ? 6 HELX_P HELX_P181 AU1 LEU T 186 ? GLU T 195 ? LEU M 186 GLU M 195 1 ? 10 HELX_P HELX_P182 AU2 ILE T 197 ? ARG T 203 ? ILE M 197 ARG M 203 1 ? 7 HELX_P HELX_P183 AU3 ALA T 204 ? ASP T 209 ? ALA M 204 ASP M 209 1 ? 6 HELX_P HELX_P184 AU4 LYS T 228 ? THR T 239 ? LYS M 228 THR M 239 1 ? 12 HELX_P HELX_P185 AU5 GLY T 259 ? GLU T 272 ? GLY M 259 GLU M 272 1 ? 14 HELX_P HELX_P186 AU6 LYS T 295 ? ASP T 313 ? LYS M 295 ASP M 313 1 ? 19 HELX_P HELX_P187 AU7 ASP T 334 ? ARG T 339 ? ASP M 334 ARG M 339 5 ? 6 HELX_P HELX_P188 AU8 SER T 353 ? SER T 365 ? SER M 353 SER M 365 1 ? 13 HELX_P HELX_P189 AU9 ARG T 366 ? MET T 368 ? ARG M 366 MET M 368 5 ? 3 HELX_P HELX_P190 AV1 ASN T 375 ? SER T 382 ? ASN M 375 SER M 382 1 ? 8 HELX_P HELX_P191 AV2 ASN T 387 ? GLY T 406 ? ASN M 387 GLY M 406 1 ? 20 HELX_P HELX_P192 AV3 HIS T 412 ? GLN T 423 ? HIS M 412 GLN M 423 1 ? 12 HELX_P HELX_P193 AV4 SER V 30 ? GLY V 44 ? SER r 30 GLY r 44 1 ? 15 HELX_P HELX_P194 AV5 GLN V 88 ? LYS V 96 ? GLN r 88 LYS r 96 1 ? 9 HELX_P HELX_P195 AV6 SER V 119 ? ASN V 133 ? SER r 119 ASN r 133 1 ? 15 HELX_P HELX_P196 AV7 ASP V 160 ? ASN V 167 ? ASP r 160 ASN r 167 1 ? 8 HELX_P HELX_P197 AV8 ASN V 184 ? LEU V 188 ? ASN r 184 LEU r 188 5 ? 5 HELX_P HELX_P198 AV9 THR V 206 ? MET V 214 ? THR r 206 MET r 214 1 ? 9 HELX_P HELX_P199 AW1 ASN V 215 ? HIS V 217 ? ASN r 215 HIS r 217 5 ? 3 HELX_P HELX_P200 AW2 GLU V 232 ? SER V 252 ? GLU r 232 SER r 252 1 ? 21 HELX_P HELX_P201 AW3 LYS V 253 ? GLU V 256 ? LYS r 253 GLU r 256 5 ? 4 HELX_P HELX_P202 AW4 ASP V 275 ? VAL V 303 ? ASP r 275 VAL r 303 1 ? 29 HELX_P HELX_P203 AW5 THR X 22 ? GLU X 34 ? THR u 22 GLU u 34 1 ? 13 HELX_P HELX_P204 AW6 PRO X 37 ? ASP X 39 ? PRO u 37 ASP u 39 5 ? 3 HELX_P HELX_P205 AW7 THR X 55 ? TYR X 59 ? THR u 55 TYR u 59 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale1 covale one ? 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PRO 276 I 1 -10.82 2 ALA 241 Q . ? ALA 241 J PRO 242 Q ? PRO 242 J 1 -4.22 3 VAL 92 R . ? VAL 92 K PRO 93 R ? PRO 93 K 1 -11.67 4 ALA 265 R . ? ALA 265 K PRO 266 R ? PRO 266 K 1 -5.59 5 GLU 274 S . ? GLU 274 L PRO 275 S ? PRO 275 L 1 -9.55 6 ALA 274 T . ? ALA 274 M PRO 275 T ? PRO 275 M 1 -2.33 7 VAL 45 V . ? VAL 45 r PRO 46 V ? PRO 46 r 1 5.72 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 4 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 4 ? AA7 ? 5 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 5 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 5 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 5 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 5 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 5 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 4 ? AD6 ? 4 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 5 ? AD9 ? 4 ? AE1 ? 5 ? AE2 ? 5 ? AE3 ? 2 ? AE4 ? 4 ? AE5 ? 2 ? AE6 ? 2 ? AE7 ? 2 ? AE8 ? 3 ? AE9 ? 3 ? AF1 ? 3 ? AF2 ? 4 ? AF3 ? 2 ? AF4 ? 3 ? AF5 ? 3 ? AF6 ? 3 ? AF7 ? 2 ? AF8 ? 2 ? AF9 ? 7 ? AG1 ? 3 ? 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AG8 ? 3 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB1 4 5 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC2 4 5 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD8 4 5 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE1 4 5 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE2 4 5 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE6 1 2 ? parallel AE7 1 2 ? parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AF1 1 2 ? parallel AF1 2 3 ? parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? anti-parallel AF3 1 2 ? parallel AF4 1 2 ? parallel AF4 2 3 ? parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF7 1 2 ? parallel AF8 1 2 ? parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? parallel AF9 4 5 ? anti-parallel AF9 5 6 ? anti-parallel AF9 6 7 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? parallel AG2 1 2 ? parallel AG2 2 3 ? parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG4 1 2 ? parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG5 2 3 ? anti-parallel AG5 3 4 ? parallel AG5 4 5 ? anti-parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG6 2 3 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 TYR A 143 ? 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T GLY 114 662 1 Y 1 r MET 1 ? V MET 1 663 1 Y 1 r GLU 2 ? V GLU 2 664 1 Y 1 r ARG 3 ? V ARG 3 665 1 Y 1 r LEU 4 ? V LEU 4 666 1 Y 1 r GLN 5 ? V GLN 5 667 1 Y 1 r ARG 6 ? V ARG 6 668 1 Y 1 r LEU 7 ? V LEU 7 669 1 Y 1 r MET 8 ? V MET 8 670 1 Y 1 r MET 9 ? V MET 9 671 1 Y 1 r ASN 10 ? V ASN 10 672 1 Y 1 r SER 11 ? V SER 11 673 1 Y 1 r LYS 12 ? V LYS 12 674 1 Y 1 r VAL 13 ? V VAL 13 675 1 Y 1 r GLY 14 ? V GLY 14 676 1 Y 1 r SER 15 ? V SER 15 677 1 Y 1 r ALA 16 ? V ALA 16 678 1 Y 1 r ASP 17 ? V ASP 17 679 1 Y 1 r THR 18 ? V THR 18 680 1 Y 1 r GLY 19 ? V GLY 19 681 1 Y 1 r ARG 20 ? V ARG 20 682 1 Y 1 r ASP 21 ? V ASP 21 683 1 Y 1 r LEU 168 ? V LEU 168 684 1 Y 1 r GLU 169 ? V GLU 169 685 1 Y 1 r PRO 170 ? V PRO 170 686 1 Y 1 r ARG 171 ? V ARG 171 687 1 Y 1 r LYS 306 ? V LYS 306 688 1 Y 1 u MET 1 ? X MET 1 689 1 Y 1 u ILE 77 ? X ILE 77 690 1 Y 1 u ILE 78 ? X ILE 78 691 1 Y 1 u GLU 79 ? X GLU 79 692 1 Y 1 u PRO 80 ? X PRO 80 693 1 Y 1 u SER 81 ? X SER 81 694 1 Y 1 u LEU 82 ? X LEU 82 695 1 Y 1 u LYS 83 ? X LYS 83 696 1 Y 1 u ALA 84 ? X ALA 84 697 1 Y 1 u LEU 85 ? X LEU 85 698 1 Y 1 u ALA 86 ? X ALA 86 699 1 Y 1 u SER 87 ? X SER 87 700 1 Y 1 u LYS 88 ? X LYS 88 701 1 Y 1 u TYR 89 ? X TYR 89 702 1 Y 1 u ASN 90 ? X ASN 90 703 1 Y 1 u CYS 91 ? X CYS 91 704 1 Y 1 u ASP 92 ? X ASP 92 705 1 Y 1 u LYS 93 ? X LYS 93 706 1 Y 1 u SER 94 ? X SER 94 707 1 Y 1 u VAL 95 ? X VAL 95 708 1 Y 1 u CYS 96 ? X CYS 96 709 1 Y 1 u ARG 97 ? X ARG 97 710 1 Y 1 u LYS 98 ? X LYS 98 711 1 Y 1 u CYS 99 ? X CYS 99 712 1 Y 1 u TYR 100 ? X TYR 100 713 1 Y 1 u ALA 101 ? X ALA 101 714 1 Y 1 u ARG 102 ? X ARG 102 715 1 Y 1 u LEU 103 ? X LEU 103 716 1 Y 1 u PRO 104 ? X PRO 104 717 1 Y 1 u PRO 105 ? X PRO 105 718 1 Y 1 u ARG 106 ? X ARG 106 719 1 Y 1 u ALA 107 ? X ALA 107 720 1 Y 1 u THR 108 ? X THR 108 721 1 Y 1 u ASN 109 ? X ASN 109 722 1 Y 1 u CYS 110 ? X CYS 110 723 1 Y 1 u ARG 111 ? X ARG 111 724 1 Y 1 u LYS 112 ? X LYS 112 725 1 Y 1 u ARG 113 ? X ARG 113 726 1 Y 1 u LYS 114 ? X LYS 114 727 1 Y 1 u CYS 115 ? X CYS 115 728 1 Y 1 u GLY 116 ? X GLY 116 729 1 Y 1 u HIS 117 ? X HIS 117 730 1 Y 1 u THR 118 ? X THR 118 731 1 Y 1 u ASN 119 ? X ASN 119 732 1 Y 1 u GLN 120 ? X GLN 120 733 1 Y 1 u LEU 121 ? X LEU 121 734 1 Y 1 u ARG 122 ? X ARG 122 735 1 Y 1 u PRO 123 ? X PRO 123 736 1 Y 1 u LYS 124 ? X LYS 124 737 1 Y 1 u LYS 125 ? X LYS 125 738 1 Y 1 u LYS 126 ? X LYS 126 739 1 Y 1 u LEU 127 ? X LEU 127 740 1 Y 1 u LYS 128 ? X LYS 128 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM ? HEPES 1 2 25 mM ? NaCl 1 3 25 mM ? KCl 1 4 10 mM ? MgCl2 1 5 1 mM ? TCEP 1 6 5 mM ? ATP 1 7 0.05 '% (w/v)' ? 'Nonidet P-40' 1 8 6 mM ? ortho-phenanthroline # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details 'CTF correction was performed by Relion during reconstruction' # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 1 2 ? ? 559292 ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 'ATCC 204508 / S288c' ? 2 3 ? ? 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 9 2 ? 580240 'Saccharomyces cerevisiae W303' ? ? 10 3 ? 511693 'Escherichia coli BL21' ? BL21 # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details 'Camera was operated in counting mode' # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50 _em_image_recording.average_exposure_time 6.25 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 1 _em_image_recording.num_real_images 11656 # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name ? _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width ? _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details 'Particles were selected using the Relion template-based particle picker' _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 579361 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? Leginon 3.2 ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? MotionCorr2 2 1 ? ? 5 'CTF CORRECTION' ? RELION 2.1 1 ? ? 6 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 4 1 ? ? 7 'CTF CORRECTION' ? Gctf ? 1 ? ? 8 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 9 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 10 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' 1.12 ? 1 ? 11 'MODEL FITTING' ? PHENIX 1.11-2580 ? 1 ? 12 OTHER ? ? ? ? ? ? 13 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 2.1 1 ? ? 14 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 2.1 1 ? ? 15 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 16 RECONSTRUCTION ? RELION 2.1 1 ? ? 17 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.11-2580 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 25 _em_specimen.details ;26S proteasomes were diluted to a concentration of 20 micromolar in a buffer with an ATP regeneration system, and 6 mM ortho-phenanthroline. This solution was mixed with an equal volume of 50 micromolar ubiquitinated model substrate ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' R01-GM094497 1 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' DP2-EB020402 2 # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 25 "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ATP 26 "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" ADP # loop_ _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 1 1 'gel filtration' 'purification of holoenzyme' 2 1 microscopy 'EM density' #