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'Cramer, P.' 5 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Cell _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1097-4172 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 171 _citation.language ? _citation.page_first 1072 _citation.page_last 1081.e10 _citation.title 'Structural Basis of Mitochondrial Transcription Initiation.' _citation.year 2017 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.cell.2017.10.036 _citation.pdbx_database_id_PubMed 29149603 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal primary 'Hillen, H.S.' 1 primary 'Morozov, Y.I.' 2 primary 'Sarfallah, A.' 3 primary 'Temiakov, D.' 4 primary 'Cramer, P.' 5 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 99.87 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6ERP _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 103.910 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 197.030 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 137.210 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB 4 _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6ERP _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 4 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1 21 1' 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TGTTAGTTGGGGGGTGACTGTTAAAAGTGCATACCTATCCCCGATAGGCC D,H ? 3 polydeoxyribonucleotide no no ;(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DA)(DT) (DG)(DC)(DA)(DC)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DA)(DG)(DT)(DC)(DA)(DC)(DC)(DC)(DC) (DC)(DC)(DA)(DA)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DA) ; GGCCTATCTTTTGGCGGTATGCACTTTTAACAGTCACCCCCCAACTAACA E,I ? 4 'polypeptide(L)' no no ;NARKVQMGAKDATPVPCGRWAKILEKDKRTQQMRMQRLKAKLQMPFQSGEFKALTRRLQVEPRLLSKQMAGCLEDCTRQA PESPWEEQLARLLQEAPGKLSLDVEQAPSGQHSQAQLSGQQQRLLAFFKCCLLTDQLPLAHHLLVVHHGQRQKRKLLTLD MYNAVMLGWARQGAFKELVYVLFMVKDAGLTPDLLSYAAALQCMGRQDQDAGTIERCLEQMSQEGLKLQALFTAVLLSEE DRATVLKAVHKVKPTFSLPPQLPPPVNTSKLLRDVYAKDGRVSYPKLHLPLKTLQCLFEKQLHMELASRVCVVSVEKPTL PSKEVKHARKTLKTLRDQWEKALCRALRETKNRLEREVYEGRFSLYPFLCLLDEREVVRMLLQVLQALPAQGESFTTLAR ELSARTFSRHVVQRQRVSGQVQALQNHYRKYLCLLASDAEVPEPCLPRQYWEALGAPEALREQPWPLPVQMELGKLLAEM LVQATQMPCSLDKPHRSSRLVPVLYHVYSFRNVQQIGILKPHPAYVQLLEKAAEPTLTFEAVDVPMLCPPLPWTSPHSGA 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AVPWTADIPLKVVGMFPSRGEKRALWKLAYDLYSCTSIYKFGRIEVNMFIGEKEFQKLMADPGNPDLYHVLSVIWQLACE IKVLHMEPWSSFDIYTRKGPLENPKRRELLDQLQQKLYLIQMIPRQNLFTKNLTPMNYNIFFHLLKHCFGRRSATVIDHL RSLTPLDARDILMQIGKQEDEKVVNMHPQDFKTLFETIERSKDCAYKWLYDETLEDR ; ;NARFCILGSEAATRKHLPARNHCGLSDSSPQLWPEPDFRNPPRKASKASLDFKRYVTDRRLAETLAQIYLGKPSRPPHLL LECNPGPGILTQALLEAGAKVVALESDKTFIPHLESLGKNLDGKLRVIHCDFFKLDPRSGGVIKPPAMSSRGLFKNLGIE AVPWTADIPLKVVGMFPSRGEKRALWKLAYDLYSCTSIYKFGRIEVNMFIGEKEFQKLMADPGNPDLYHVLSVIWQLACE IKVLHMEPWSSFDIYTRKGPLENPKRRELLDQLQQKLYLIQMIPRQNLFTKNLTPMNYNIFFHLLKHCFGRRSATVIDHL RSLTPLDARDILMQIGKQEDEKVVNMHPQDFKTLFETIERSKDCAYKWLYDETLEDR ; F,J ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ASN n 1 2 ALA n 1 3 SER n 1 4 SER n 1 5 VAL n 1 6 LEU n 1 7 ALA n 1 8 SER n 1 9 SER n 1 10 PRO n 1 11 LYS n 1 12 LYS n 1 13 PRO n 1 14 VAL n 1 15 SER n 1 16 SER n 1 17 TYR n 1 18 LEU n 1 19 ARG n 1 20 PHE n 1 21 SER n 1 22 LYS n 1 23 GLU n 1 24 GLN n 1 25 LEU n 1 26 PRO n 1 27 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WATSON-CRICK ? ? hydrog191 hydrog ? ? E DC 34 N4 ? ? ? 1_555 F DG 17 O6 ? ? H DC 34 I DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog192 hydrog ? ? E DC 34 O2 ? ? ? 1_555 F DG 17 N2 ? ? H DC 34 I DG 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog193 hydrog ? ? E DC 35 N3 ? ? ? 1_555 F DG 16 N1 ? ? H DC 35 I DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog194 hydrog ? ? E DC 35 N4 ? ? ? 1_555 F DG 16 O6 ? ? H DC 35 I DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog195 hydrog ? ? E DC 35 O2 ? ? ? 1_555 F DG 16 N2 ? ? H DC 35 I DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog196 hydrog ? ? E DG 43 N1 ? ? ? 1_555 F DC 8 N3 ? ? H DG 43 I DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog197 hydrog ? ? E DG 43 N2 ? ? ? 1_555 F DC 8 O2 ? ? H DG 43 I DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog198 hydrog ? ? E DG 43 O6 ? ? ? 1_555 F DC 8 N4 ? ? H DG 43 I DC 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog199 hydrog ? ? E DA 44 N1 ? ? ? 1_555 F DT 7 N3 ? ? H DA 44 I DT 7 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLN 261 G . ? GLN 363 A LEU 262 G ? LEU 364 A 1 2.84 2 GLY 455 G . ? GLY 557 A ALA 456 G ? ALA 558 A 1 -1.31 3 GLN 1094 G . ? GLN 1196 A LYS 1095 G ? LYS 1197 A 1 4.25 4 GLN 261 H . ? GLN 363 B LEU 262 H ? 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CYS J 258 GLU J 266 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N VAL G 312 ? 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PHENIX ? ? ? '(1.11.1_2575: ???)' 1 ? 'data reduction' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? XDS ? ? ? . 2 ? 'data scaling' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? XDS ? ? ? . 3 ? phasing ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? PHENIX ? ? ? . 4 ? 'model building' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? Coot ? ? ? . 5 # _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.entry_id 6ERP _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ;The region of mtRNAP corresponding to the specificity loop (residues 1086-1107) showed fragmented density and was modelled based on the structure of the T7 RNAP initiation complex (Cheetham et al., 1999). The density allowed for modelling the main chain trace of this element lacking only three residues (1094-1096) at the tip, yet the sequence register could not be assigned unambiguously and it was therefore modelled as poly-alanine. ; _pdbx_entry_details.source_details ? # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 OG1 J THR 309 ? ? OE2 J GLU 375 ? ? 2.07 2 1 O F LYS 236 ? ? OG F SER 251 ? ? 2.11 3 1 O C LEU 231 ? ? NH1 C ARG 233 ? ? 2.14 4 1 O J GLY 137 ? ? N J ASP 141 ? ? 2.14 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" D DA 23 ? ? 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