data_6FFR # _entry.id 6FFR # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.308 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6FFR WWPDB D_1200008232 BMRB 34228 # _pdbx_database_related.db_name BMRB _pdbx_database_related.details 'DNA-RNA Hybrid Quadruplex with Flipped Tetrad' _pdbx_database_related.db_id 34228 _pdbx_database_related.content_type unspecified # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr REL _pdbx_database_status.entry_id 6FFR _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2018-01-09 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs REL _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Haase, L.' 1 ? 'Dickerhoff, J.' 2 ? 'Weisz, K.' 3 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country GE _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Chemistry _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1521-3765 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 24 _citation.language ? _citation.page_first 15365 _citation.page_last 15371 _citation.title 'DNA-RNA Hybrid Quadruplexes Reveal Interactions that Favor RNA Parallel Topologies.' _citation.year 2018 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1002/chem.201803367 _citation.pdbx_database_id_PubMed 30084512 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Haase, L.' 1 ? primary 'Dickerhoff, J.' 2 0000-0002-3197-9472 primary 'Weisz, K.' 3 0000-0002-2736-6606 # _entity.id 1 _entity.type polymer _entity.src_method syn _entity.pdbx_description ;DNA/RNA (5'-R(*G)-D(P*GP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*CP*AP*CP*AP*GP*GP*GP*GP*AP*C)-R(P*G)-D(P*GP*G)-3') ; _entity.formula_weight 7004.491 _entity.pdbx_number_of_molecules 1 _entity.pdbx_ec ? _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.details ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type 'polydeoxyribonucleotide/polyribonucleotide hybrid' _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code ;G(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)G(DG) (DG) ; _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can GGGATGGGACACAGGGGACGGG _entity_poly.pdbx_strand_id A _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 G n 1 2 DG n 1 3 DG n 1 4 DA n 1 5 DT n 1 6 DG n 1 7 DG n 1 8 DG n 1 9 DA n 1 10 DC n 1 11 DA n 1 12 DC n 1 13 DA n 1 14 DG n 1 15 DG n 1 16 DG n 1 17 DG n 1 18 DA n 1 19 DC n 1 20 G n 1 21 DG n 1 22 DG n # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 22 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'synthetic construct' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 32630 _pdbx_entity_src_syn.details ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 6FFR _struct_ref.pdbx_db_accession 6FFR _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # _struct_ref_seq.align_id 1 _struct_ref_seq.ref_id 1 _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code 6FFR _struct_ref_seq.pdbx_strand_id A _struct_ref_seq.seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.seq_align_end 22 _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_db_accession 6FFR _struct_ref_seq.db_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code ? _struct_ref_seq.db_align_end 22 _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code ? _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg 1 _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 22 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.spectrometer_id _pdbx_nmr_exptl.sample_state 1 1 1 '2D 1H-1H NOESY mixing time 500 ms' 1 isotropic 2 1 1 '2D 1H-1H NOESY mixing time 300 ms' 1 isotropic 3 1 1 '2D 1H-1H NOESY mixing time 150 ms' 1 isotropic 4 1 1 '2D 1H-1H NOESY mixing time 80 ms' 1 isotropic 5 1 1 '2D 1H-13C HSQC aromatic' 1 isotropic 6 1 2 '2D 1H-1H NOESY mixing time 300 ms' 1 isotropic 7 1 2 '2D 1H-13C HSQC aromatic' 1 isotropic 8 1 2 '2D DQF-COSY' 1 isotropic 9 1 2 '2D 1H-1H TOCSY' 1 isotropic # _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature 298 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units atm _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH 7 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength 10 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.details ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units mM _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label 1 _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_err ? _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units K # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system _pdbx_nmr_sample_details.label _pdbx_nmr_sample_details.type _pdbx_nmr_sample_details.details 1 ;10 mM potassium phosphate, 0.48 mM DNA/RNA (5'-R(*G)-D(P*GP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*CP*AP*CP*AP*GP*GP*GP*GP*AP*C)-R(P*G)-D(P*GP*G)-3'), 90% H2O/10% D2O ; '90% H2O/10% D2O' odn_r_1_20 solution ? 2 ;10 mM potassium phosphate, 0.48 mM DNA/RNA (5'-R(*G)-D(P*GP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*CP*AP*CP*AP*GP*GP*GP*GP*AP*C)-R(P*G)-D(P*GP*G)-3'), 100% D2O ; '100% D2O' odn_r_1_20_ex solution ? # _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id 1 _pdbx_nmr_spectrometer.model Avance _pdbx_nmr_spectrometer.type ? _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer Bruker _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength 600 _pdbx_nmr_spectrometer.details ? # loop_ _pdbx_nmr_refine.entry_id _pdbx_nmr_refine.method _pdbx_nmr_refine.details _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 6FFR 'DGSA-distance geometry simulated annealing' ? 4 6FFR 'simulated annealing' ? 5 # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 6FFR _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'all calculated structures submitted' _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 6FFR _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_software.ordinal _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.authors 1 processing TopSpin 3.5 'Bruker Biospin' 2 'chemical shift assignment' 'CcpNmr Analysis' 2.4 CCPN 3 'peak picking' 'CcpNmr Analysis' 2.4 CCPN 4 refinement Xplor-NIH 2.46 'Schwieters, Kuszewski, Tjandra and Clore' 5 'structure calculation' Amber ? 'Case, Darden, Cheatham III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6FFR _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6FFR _struct.title 'DNA-RNA Hybrid Quadruplex with Flipped Tetrad' _struct.pdbx_descriptor ;DNA/RNA (5'-R(*G)-D(P*GP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*CP*AP*CP*AP*GP*GP*GP*GP*AP*C)-R(P*G)-D(P*GP*G)-3') ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6FFR _struct_keywords.text 'quadruplex, DNA-RNA hybrid' _struct_keywords.pdbx_keywords 'DNA-RNA HYBRID' # _struct_asym.id A _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag N _struct_asym.pdbx_modified N _struct_asym.entity_id 1 _struct_asym.details ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order hydrog1 hydrog ? ? A G 1 N1 ? ? ? 1_555 A DG 6 O6 ? ? A G 1 A DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog2 hydrog ? ? A G 1 N2 ? ? ? 1_555 A DG 6 N7 ? ? A G 1 A DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog3 hydrog ? ? A G 1 N7 ? ? ? 1_555 A DG 16 N2 ? ? A G 1 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog4 hydrog ? ? A G 1 O6 ? ? ? 1_555 A DG 16 N1 ? ? A G 1 A DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog5 hydrog ? ? A G 1 O6 ? ? ? 1_555 A DC 19 N4 ? ? A G 1 A DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? 'G-DC PAIR' ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DG 2 N2 ? ? ? 1_555 A DT 5 O2 ? ? A DG 2 A DT 5 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DT MISPAIR' ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DG 2 N1 ? ? ? 1_555 A DG 7 O6 ? ? A DG 2 A DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DG 2 N2 ? ? ? 1_555 A DG 7 N7 ? ? A DG 2 A DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DG 2 N7 ? ? ? 1_555 A DG 15 N2 ? ? A DG 2 A DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DG 2 O6 ? ? ? 1_555 A DG 15 N1 ? ? A DG 2 A DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DG 3 N1 ? ? ? 1_555 A DG 8 O6 ? ? A DG 3 A DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DG 3 N2 ? ? ? 1_555 A DG 8 N7 ? ? A DG 3 A DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DG 3 N7 ? ? ? 1_555 A DG 14 N2 ? ? A DG 3 A DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DG 3 O6 ? ? ? 1_555 A DG 14 N1 ? ? A DG 3 A DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DG 6 N1 ? ? ? 1_555 A G 20 O6 ? ? A DG 6 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 6 N2 ? ? ? 1_555 A G 20 N7 ? ? A DG 6 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DG 7 N1 ? ? ? 1_555 A DG 21 O6 ? ? A DG 7 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DG 7 N2 ? ? ? 1_555 A DG 21 N7 ? ? A DG 7 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DG 8 N1 ? ? ? 1_555 A DG 22 O6 ? ? A DG 8 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DG 8 N2 ? ? ? 1_555 A DG 22 N7 ? ? A DG 8 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DA 9 N1 ? ? ? 1_555 A DA 13 N6 ? ? A DA 9 A DA 13 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DA MISPAIR' ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DC 10 O2 ? ? ? 1_555 A DC 12 N4 ? ? A DC 10 A DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DC MISPAIR' ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DG 14 N7 ? ? ? 1_555 A DG 22 N2 ? ? A DG 14 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DG 14 O6 ? ? ? 1_555 A DG 22 N1 ? ? A DG 14 A DG 22 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DG 15 N7 ? ? ? 1_555 A DG 21 N2 ? ? A DG 15 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DG 15 O6 ? ? ? 1_555 A DG 21 N1 ? ? A DG 15 A DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DG 16 N7 ? ? ? 1_555 A G 20 N2 ? ? A DG 16 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DG 16 O6 ? ? ? 1_555 A G 20 N1 ? ? A DG 16 A G 20 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _atom_sites.entry_id 6FFR _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 G 1 1 1 G G A . n A 1 2 DG 2 2 2 DG DG A . n A 1 3 DG 3 3 3 DG DG A . n A 1 4 DA 4 4 4 DA DA A . n A 1 5 DT 5 5 5 DT DT A . n A 1 6 DG 6 6 6 DG DG A . n A 1 7 DG 7 7 7 DG DG A . n A 1 8 DG 8 8 8 DG DG A . n A 1 9 DA 9 9 9 DA DA A . n A 1 10 DC 10 10 10 DC DC A . n A 1 11 DA 11 11 11 DA DA A . n A 1 12 DC 12 12 12 DC DC A . n A 1 13 DA 13 13 13 DA DA A . n A 1 14 DG 14 14 14 DG DG A . n A 1 15 DG 15 15 15 DG DG A . n A 1 16 DG 16 16 16 DG DG A . n A 1 17 DG 17 17 17 DG DG A . n A 1 18 DA 18 18 18 DA DA A . n A 1 19 DC 19 19 19 DC DC A . n A 1 20 G 20 20 20 G G A . n A 1 21 DG 21 21 21 DG DG A . n A 1 22 DG 22 22 22 DG DG A . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details monomeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 1 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 0 ? 1 MORE 0 ? 1 'SSA (A^2)' 3720 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2018-09-26 2 'Structure model' 1 1 2018-10-24 3 'Structure model' 1 2 2019-05-08 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' 3 3 'Structure model' 'Data collection' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 3 'Structure model' pdbx_nmr_software 3 3 'Structure model' pdbx_seq_map_depositor_info # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.journal_volume' 2 2 'Structure model' '_citation.page_first' 3 2 'Structure model' '_citation.page_last' 4 3 'Structure model' '_pdbx_nmr_software.name' 5 3 'Structure model' '_pdbx_seq_map_depositor_info.one_letter_code_mod' # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling 1 'potassium phosphate' 10 ? mM 'natural abundance' 1 ;DNA/RNA (5'-R(*G)-D(P*GP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*CP*AP*CP*AP*GP*GP*GP*GP*AP*C)-R(P*G)-D(P*GP*G)-3') ; 0.48 ? mM 'natural abundance' 2 'potassium phosphate' 10 ? mM 'natural abundance' 2 ;DNA/RNA (5'-R(*G)-D(P*GP*GP*AP*TP*GP*GP*GP*AP*CP*AP*CP*AP*GP*GP*GP*GP*AP*C)-R(P*G)-D(P*GP*G)-3') ; 0.48 ? mM 'natural abundance' # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 113.30 108.30 5.00 0.30 N 2 1 "O4'" A DA 4 ? ? "C1'" A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? 110.78 108.30 2.48 0.30 N 3 1 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.62 117.00 -3.38 0.50 N 4 1 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.43 117.70 3.73 0.50 N 5 1 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.01 118.60 -5.59 0.60 N 6 1 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 110.56 108.30 2.26 0.30 N 7 1 C6 A DT 5 ? ? C5 A DT 5 ? ? C7 A DT 5 ? ? 119.28 122.90 -3.62 0.60 N 8 1 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.27 108.30 3.97 0.30 N 9 1 N3 A DG 7 ? ? C2 A DG 7 ? ? N2 A DG 7 ? ? 115.65 119.90 -4.25 0.70 N 10 1 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 110.30 108.30 2.00 0.30 N 11 1 "O4'" A DA 9 ? ? "C1'" A DA 9 ? ? N9 A DA 9 ? ? 111.60 108.30 3.30 0.30 N 12 1 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.55 117.00 -3.45 0.50 N 13 1 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.46 117.70 3.76 0.50 N 14 1 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.25 118.60 -5.35 0.60 N 15 1 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 110.70 108.30 2.40 0.30 N 16 1 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.15 121.90 -4.75 0.70 N 17 1 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 18 1 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 19 1 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.72 118.60 -4.88 0.60 N 20 1 "O4'" A DC 12 ? ? "C1'" A DC 12 ? ? N1 A DC 12 ? ? 111.78 108.30 3.48 0.30 N 21 1 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 116.87 121.90 -5.03 0.70 N 22 1 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.91 117.00 -3.09 0.50 N 23 1 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.68 117.70 3.98 0.50 N 24 1 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.95 118.60 -4.65 0.60 N 25 1 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 114.30 108.30 6.00 0.30 N 26 1 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.25 108.30 4.95 0.30 N 27 1 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 115.14 108.30 6.84 0.30 N 28 1 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.16 108.30 4.86 0.30 N 29 1 "O4'" A DA 18 ? ? "C1'" A DA 18 ? ? N9 A DA 18 ? ? 112.14 108.30 3.84 0.30 N 30 1 C4 A DA 18 ? ? C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? 113.69 117.00 -3.31 0.50 N 31 1 C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N1 A DA 18 ? ? 121.48 117.70 3.78 0.50 N 32 1 N1 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N6 A DA 18 ? ? 113.25 118.60 -5.35 0.60 N 33 1 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.17 121.90 -4.73 0.70 N 34 1 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 113.82 108.30 5.52 0.30 N 35 1 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.57 108.30 3.27 0.30 N 36 2 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.87 108.30 4.57 0.30 N 37 2 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.26 108.30 1.96 0.30 N 38 2 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.58 117.00 -3.42 0.50 N 39 2 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.52 117.70 3.82 0.50 N 40 2 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 112.92 118.60 -5.68 0.60 N 41 2 C6 A DT 5 ? ? C5 A DT 5 ? ? C7 A DT 5 ? ? 118.89 122.90 -4.01 0.60 N 42 2 N3 A DG 7 ? ? C2 A DG 7 ? ? N2 A DG 7 ? ? 115.54 119.90 -4.36 0.70 N 43 2 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 112.16 108.30 3.86 0.30 N 44 2 "O4'" A DA 9 ? ? "C1'" A DA 9 ? ? N9 A DA 9 ? ? 110.49 108.30 2.19 0.30 N 45 2 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.87 117.00 -3.13 0.50 N 46 2 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.45 117.70 3.75 0.50 N 47 2 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.15 118.60 -5.45 0.60 N 48 2 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 111.13 108.30 2.83 0.30 N 49 2 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.17 121.90 -4.73 0.70 N 50 2 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 51 2 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.47 117.70 3.77 0.50 N 52 2 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.01 118.60 -5.59 0.60 N 53 2 N1 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 123.38 118.90 4.48 0.60 N 54 2 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 116.05 121.90 -5.85 0.70 N 55 2 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.87 117.00 -3.13 0.50 N 56 2 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.44 117.70 3.74 0.50 N 57 2 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.33 118.60 -5.27 0.60 N 58 2 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 113.70 108.30 5.40 0.30 N 59 2 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.64 108.30 5.34 0.30 N 60 2 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 114.34 108.30 6.04 0.30 N 61 2 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.53 108.30 5.23 0.30 N 62 2 "O4'" A DA 18 ? ? "C1'" A DA 18 ? ? N9 A DA 18 ? ? 112.51 108.30 4.21 0.30 N 63 2 C4 A DA 18 ? ? C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? 113.66 117.00 -3.34 0.50 N 64 2 C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N1 A DA 18 ? ? 121.47 117.70 3.77 0.50 N 65 2 N1 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N6 A DA 18 ? ? 112.88 118.60 -5.72 0.60 N 66 2 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.39 121.90 -4.51 0.70 N 67 2 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 112.10 108.30 3.80 0.30 N 68 2 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 112.13 108.30 3.83 0.30 N 69 3 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 113.29 108.30 4.99 0.30 N 70 3 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.63 108.30 2.33 0.30 N 71 3 N3 A DG 3 ? ? C2 A DG 3 ? ? N2 A DG 3 ? ? 115.67 119.90 -4.23 0.70 N 72 3 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.50 117.00 -3.50 0.50 N 73 3 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.56 117.70 3.86 0.50 N 74 3 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 112.92 118.60 -5.68 0.60 N 75 3 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 110.79 108.30 2.49 0.30 N 76 3 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.73 108.30 3.43 0.30 N 77 3 N3 A DG 7 ? ? C2 A DG 7 ? ? N2 A DG 7 ? ? 115.51 119.90 -4.39 0.70 N 78 3 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 113.80 108.30 5.50 0.30 N 79 3 "O4'" A DA 9 ? ? "C1'" A DA 9 ? ? N9 A DA 9 ? ? 111.87 108.30 3.57 0.30 N 80 3 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.52 117.00 -3.48 0.50 N 81 3 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.43 117.70 3.73 0.50 N 82 3 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.23 118.60 -5.37 0.60 N 83 3 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 113.76 108.30 5.46 0.30 N 84 3 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.90 117.00 -3.10 0.50 N 85 3 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.44 117.70 3.74 0.50 N 86 3 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.14 118.60 -5.46 0.60 N 87 3 N1 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 123.58 118.90 4.68 0.60 N 88 3 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 115.83 121.90 -6.07 0.70 N 89 3 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.28 117.70 3.58 0.50 N 90 3 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.43 118.60 -5.17 0.60 N 91 3 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.73 108.30 4.43 0.30 N 92 3 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.46 108.30 5.16 0.30 N 93 3 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 114.87 108.30 6.57 0.30 N 94 3 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.73 108.30 5.43 0.30 N 95 3 "O4'" A DA 18 ? ? "C1'" A DA 18 ? ? N9 A DA 18 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 96 3 C4 A DA 18 ? ? C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 97 3 C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N1 A DA 18 ? ? 121.35 117.70 3.65 0.50 N 98 3 N1 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N6 A DA 18 ? ? 113.21 118.60 -5.39 0.60 N 99 3 "O4'" A DC 19 ? ? "C4'" A DC 19 ? ? "C3'" A DC 19 ? ? 109.67 106.00 3.67 0.60 N 100 3 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.32 121.90 -4.58 0.70 N 101 3 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 111.57 108.30 3.27 0.30 N 102 3 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.33 108.30 2.03 0.30 N 103 4 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 113.13 108.30 4.83 0.30 N 104 4 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.14 108.30 1.84 0.30 N 105 4 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.61 117.00 -3.39 0.50 N 106 4 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.54 117.70 3.84 0.50 N 107 4 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 112.89 118.60 -5.71 0.60 N 108 4 C6 A DT 5 ? ? C5 A DT 5 ? ? C7 A DT 5 ? ? 119.11 122.90 -3.79 0.60 N 109 4 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.52 108.30 3.22 0.30 N 110 4 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 113.56 108.30 5.26 0.30 N 111 4 "O4'" A DA 9 ? ? "C1'" A DA 9 ? ? N9 A DA 9 ? ? 113.01 108.30 4.71 0.30 N 112 4 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.47 117.00 -3.53 0.50 N 113 4 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.53 117.70 3.83 0.50 N 114 4 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 112.99 118.60 -5.61 0.60 N 115 4 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 111.20 108.30 2.90 0.30 N 116 4 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.32 121.90 -4.58 0.70 N 117 4 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.82 117.00 -3.18 0.50 N 118 4 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.54 117.70 3.84 0.50 N 119 4 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 112.90 118.60 -5.70 0.60 N 120 4 "O4'" A DC 12 ? ? "C1'" A DC 12 ? ? N1 A DC 12 ? ? 110.26 108.30 1.96 0.30 N 121 4 N1 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 123.19 118.90 4.29 0.60 N 122 4 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 116.25 121.90 -5.65 0.70 N 123 4 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.85 117.00 -3.15 0.50 N 124 4 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.46 117.70 3.76 0.50 N 125 4 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.11 118.60 -5.49 0.60 N 126 4 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 113.37 108.30 5.07 0.30 N 127 4 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.52 108.30 5.22 0.30 N 128 4 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 112.95 108.30 4.65 0.30 N 129 4 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 130 4 C4 A DA 18 ? ? C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? 113.58 117.00 -3.42 0.50 N 131 4 C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N1 A DA 18 ? ? 121.40 117.70 3.70 0.50 N 132 4 N1 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N6 A DA 18 ? ? 113.09 118.60 -5.51 0.60 N 133 4 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.30 121.90 -4.60 0.70 N 134 4 "C3'" A DC 19 ? ? "O3'" A DC 19 ? ? P A G 20 ? ? 127.77 119.70 8.07 1.20 Y 135 4 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 111.24 108.30 2.94 0.30 N 136 5 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.74 108.30 2.44 0.30 N 137 5 "O4'" A DA 4 ? ? "C1'" A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? 111.07 108.30 2.77 0.30 N 138 5 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.62 117.00 -3.38 0.50 N 139 5 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.51 117.70 3.81 0.50 N 140 5 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 112.92 118.60 -5.68 0.60 N 141 5 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 110.11 108.30 1.81 0.30 N 142 5 N3 A DG 7 ? ? C2 A DG 7 ? ? N2 A DG 7 ? ? 115.66 119.90 -4.24 0.70 N 143 5 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.79 108.30 3.49 0.30 N 144 5 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.74 117.00 -3.26 0.50 N 145 5 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 146 5 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 112.83 118.60 -5.77 0.60 N 147 5 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.32 121.90 -4.58 0.70 N 148 5 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.73 117.00 -3.27 0.50 N 149 5 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.65 117.70 3.95 0.50 N 150 5 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.66 118.60 -4.94 0.60 N 151 5 "O4'" A DC 12 ? ? "C1'" A DC 12 ? ? N1 A DC 12 ? ? 111.11 108.30 2.81 0.30 N 152 5 N1 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 122.88 118.90 3.98 0.60 N 153 5 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 116.33 121.90 -5.57 0.70 N 154 5 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.35 117.70 3.65 0.50 N 155 5 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 112.56 118.60 -6.04 0.60 N 156 5 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 113.24 108.30 4.94 0.30 N 157 5 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.49 108.30 5.19 0.30 N 158 5 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 112.91 108.30 4.61 0.30 N 159 5 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 112.26 108.30 3.96 0.30 N 160 5 "O4'" A DA 18 ? ? "C1'" A DA 18 ? ? N9 A DA 18 ? ? 112.39 108.30 4.09 0.30 N 161 5 C4 A DA 18 ? ? C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 162 5 C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N1 A DA 18 ? ? 121.43 117.70 3.73 0.50 N 163 5 N1 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N6 A DA 18 ? ? 113.37 118.60 -5.23 0.60 N 164 5 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.53 121.90 -4.37 0.70 N 165 5 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 111.27 108.30 2.97 0.30 N 166 5 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.40 108.30 2.10 0.30 N 167 6 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 112.61 108.30 4.31 0.30 N 168 6 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 169 6 "O4'" A DA 4 ? ? "C1'" A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? 110.23 108.30 1.93 0.30 N 170 6 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.66 117.00 -3.34 0.50 N 171 6 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.42 117.70 3.72 0.50 N 172 6 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 112.99 118.60 -5.61 0.60 N 173 6 C6 A DT 5 ? ? C5 A DT 5 ? ? C7 A DT 5 ? ? 119.20 122.90 -3.70 0.60 N 174 6 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 110.30 108.30 2.00 0.30 N 175 6 N3 A DG 7 ? ? C2 A DG 7 ? ? N2 A DG 7 ? ? 115.55 119.90 -4.35 0.70 N 176 6 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 112.01 108.30 3.71 0.30 N 177 6 "C3'" A DG 8 ? ? "O3'" A DG 8 ? ? P A DA 9 ? ? 127.10 119.70 7.40 1.20 Y 178 6 "O4'" A DA 9 ? ? "C1'" A DA 9 ? ? N9 A DA 9 ? ? 110.86 108.30 2.56 0.30 N 179 6 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.86 117.00 -3.14 0.50 N 180 6 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.53 117.70 3.83 0.50 N 181 6 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 112.88 118.60 -5.72 0.60 N 182 6 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 183 6 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 116.78 121.90 -5.12 0.70 N 184 6 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.59 117.00 -3.41 0.50 N 185 6 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.61 117.70 3.91 0.50 N 186 6 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 112.98 118.60 -5.62 0.60 N 187 6 "O4'" A DC 12 ? ? "C1'" A DC 12 ? ? N1 A DC 12 ? ? 112.08 108.30 3.78 0.30 N 188 6 N1 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 123.05 118.90 4.15 0.60 N 189 6 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 116.60 121.90 -5.30 0.70 N 190 6 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 191 6 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.64 117.00 -3.36 0.50 N 192 6 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.40 117.70 3.70 0.50 N 193 6 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.35 118.60 -5.25 0.60 N 194 6 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.42 108.30 4.12 0.30 N 195 6 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.71 108.30 5.41 0.30 N 196 6 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 114.61 108.30 6.31 0.30 N 197 6 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.73 108.30 5.43 0.30 N 198 6 "O4'" A DA 18 ? ? "C1'" A DA 18 ? ? N9 A DA 18 ? ? 112.42 108.30 4.12 0.30 N 199 6 C4 A DA 18 ? ? C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? 113.58 117.00 -3.42 0.50 N 200 6 C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N1 A DA 18 ? ? 121.49 117.70 3.79 0.50 N 201 6 N1 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N6 A DA 18 ? ? 112.55 118.60 -6.05 0.60 N 202 6 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.29 121.90 -4.61 0.70 N 203 6 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 111.69 108.30 3.39 0.30 N 204 7 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 113.54 108.30 5.24 0.30 N 205 7 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 206 7 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.41 117.70 3.71 0.50 N 207 7 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.27 118.60 -5.33 0.60 N 208 7 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 110.94 108.30 2.64 0.30 N 209 7 C6 A DT 5 ? ? C5 A DT 5 ? ? C7 A DT 5 ? ? 119.27 122.90 -3.63 0.60 N 210 7 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.78 108.30 3.48 0.30 N 211 7 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.19 108.30 2.89 0.30 N 212 7 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 213 7 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.48 117.70 3.78 0.50 N 214 7 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.13 118.60 -5.47 0.60 N 215 7 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 110.31 108.30 2.01 0.30 N 216 7 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.06 121.90 -4.84 0.70 N 217 7 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.80 117.00 -3.20 0.50 N 218 7 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.53 117.70 3.83 0.50 N 219 7 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.31 118.60 -5.29 0.60 N 220 7 N1 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 123.56 118.90 4.66 0.60 N 221 7 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 115.74 121.90 -6.16 0.70 N 222 7 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.92 117.00 -3.08 0.50 N 223 7 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.37 117.70 3.67 0.50 N 224 7 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 112.80 118.60 -5.80 0.60 N 225 7 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 115.91 108.30 7.61 0.30 N 226 7 "C3'" A DG 14 ? ? "O3'" A DG 14 ? ? P A DG 15 ? ? 127.84 119.70 8.14 1.20 Y 227 7 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 110.17 108.30 1.87 0.30 N 228 7 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 115.12 108.30 6.82 0.30 N 229 7 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.48 108.30 5.18 0.30 N 230 7 "O4'" A DA 18 ? ? "C1'" A DA 18 ? ? N9 A DA 18 ? ? 111.88 108.30 3.58 0.30 N 231 7 C4 A DA 18 ? ? C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? 113.61 117.00 -3.39 0.50 N 232 7 C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N1 A DA 18 ? ? 121.47 117.70 3.77 0.50 N 233 7 N1 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N6 A DA 18 ? ? 112.96 118.60 -5.64 0.60 N 234 7 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.21 121.90 -4.69 0.70 N 235 7 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 111.80 108.30 3.50 0.30 N 236 7 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.29 108.30 2.99 0.30 N 237 7 N3 A DG 22 ? ? C2 A DG 22 ? ? N2 A DG 22 ? ? 115.69 119.90 -4.21 0.70 N 238 8 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 111.56 108.30 3.26 0.30 N 239 8 "O4'" A DA 4 ? ? "C1'" A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? 110.75 108.30 2.45 0.30 N 240 8 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.76 117.00 -3.24 0.50 N 241 8 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.35 117.70 3.65 0.50 N 242 8 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.21 118.60 -5.39 0.60 N 243 8 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 112.31 108.30 4.01 0.30 N 244 8 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.96 108.30 4.66 0.30 N 245 8 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 113.01 108.30 4.71 0.30 N 246 8 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 247 8 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.63 117.70 3.93 0.50 N 248 8 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 111.88 118.60 -6.72 0.60 N 249 8 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 250 8 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.03 121.90 -4.87 0.70 N 251 8 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.42 117.00 -3.58 0.50 N 252 8 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.60 117.70 3.90 0.50 N 253 8 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 112.60 118.60 -6.00 0.60 N 254 8 "O4'" A DC 12 ? ? "C1'" A DC 12 ? ? N1 A DC 12 ? ? 111.27 108.30 2.97 0.30 N 255 8 N1 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 123.04 118.90 4.14 0.60 N 256 8 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 116.35 121.90 -5.55 0.70 N 257 8 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.70 117.00 -3.30 0.50 N 258 8 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.37 117.70 3.67 0.50 N 259 8 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 113.35 118.60 -5.25 0.60 N 260 8 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 112.59 108.30 4.29 0.30 N 261 8 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.78 108.30 5.48 0.30 N 262 8 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 111.55 108.30 3.25 0.30 N 263 8 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 117.26 108.30 8.96 0.30 N 264 8 "O4'" A DA 18 ? ? "C1'" A DA 18 ? ? N9 A DA 18 ? ? 111.21 108.30 2.91 0.30 N 265 8 C4 A DA 18 ? ? C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? 113.77 117.00 -3.23 0.50 N 266 8 C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N1 A DA 18 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 267 8 N1 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N6 A DA 18 ? ? 113.27 118.60 -5.33 0.60 N 268 8 N1 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 123.48 118.90 4.58 0.60 N 269 8 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 115.51 121.90 -6.39 0.70 N 270 8 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 110.99 108.30 2.69 0.30 N 271 8 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.59 108.30 2.29 0.30 N 272 9 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 110.69 108.30 2.39 0.30 N 273 9 "O4'" A DA 4 ? ? "C1'" A DA 4 ? ? N9 A DA 4 ? ? 110.54 108.30 2.24 0.30 N 274 9 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.51 117.00 -3.49 0.50 N 275 9 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.52 117.70 3.82 0.50 N 276 9 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 112.85 118.60 -5.75 0.60 N 277 9 C6 A DT 5 ? ? C5 A DT 5 ? ? C7 A DT 5 ? ? 119.00 122.90 -3.90 0.60 N 278 9 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.47 108.30 3.17 0.30 N 279 9 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.51 117.00 -3.49 0.50 N 280 9 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.43 117.70 3.73 0.50 N 281 9 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.27 118.60 -5.33 0.60 N 282 9 "O4'" A DC 10 ? ? "C1'" A DC 10 ? ? N1 A DC 10 ? ? 112.92 108.30 4.62 0.30 N 283 9 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.60 121.90 -4.30 0.70 N 284 9 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.88 117.00 -3.12 0.50 N 285 9 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.44 117.70 3.74 0.50 N 286 9 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.82 118.60 -4.78 0.60 N 287 9 N1 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 123.87 118.90 4.97 0.60 N 288 9 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 115.58 121.90 -6.32 0.70 N 289 9 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 110.43 108.30 2.13 0.30 N 290 9 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.64 117.00 -3.36 0.50 N 291 9 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.26 117.70 3.56 0.50 N 292 9 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 112.69 118.60 -5.91 0.60 N 293 9 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 113.10 108.30 4.80 0.30 N 294 9 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 114.06 108.30 5.76 0.30 N 295 9 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 114.84 108.30 6.54 0.30 N 296 9 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 112.75 108.30 4.45 0.30 N 297 9 C4 A DA 18 ? ? C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? 113.90 117.00 -3.10 0.50 N 298 9 C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N1 A DA 18 ? ? 121.38 117.70 3.68 0.50 N 299 9 N1 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N6 A DA 18 ? ? 113.64 118.60 -4.96 0.60 N 300 9 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.27 121.90 -4.63 0.70 N 301 9 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 113.50 108.30 5.20 0.30 N 302 9 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 303 10 "O4'" A DG 2 ? ? "C1'" A DG 2 ? ? N9 A DG 2 ? ? 113.06 108.30 4.76 0.30 N 304 10 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 111.56 108.30 3.26 0.30 N 305 10 C4 A DA 4 ? ? C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? 113.72 117.00 -3.28 0.50 N 306 10 C5 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N1 A DA 4 ? ? 121.43 117.70 3.73 0.50 N 307 10 N1 A DA 4 ? ? C6 A DA 4 ? ? N6 A DA 4 ? ? 113.12 118.60 -5.48 0.60 N 308 10 "O4'" A DT 5 ? ? "C1'" A DT 5 ? ? N1 A DT 5 ? ? 110.11 108.30 1.81 0.30 N 309 10 C6 A DT 5 ? ? C5 A DT 5 ? ? C7 A DT 5 ? ? 118.21 122.90 -4.69 0.60 N 310 10 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 111.92 108.30 3.62 0.30 N 311 10 "O4'" A DA 9 ? ? "C1'" A DA 9 ? ? N9 A DA 9 ? ? 110.94 108.30 2.64 0.30 N 312 10 C4 A DA 9 ? ? C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? 113.72 117.00 -3.28 0.50 N 313 10 C5 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N1 A DA 9 ? ? 121.41 117.70 3.71 0.50 N 314 10 N1 A DA 9 ? ? C6 A DA 9 ? ? N6 A DA 9 ? ? 113.17 118.60 -5.43 0.60 N 315 10 N3 A DC 10 ? ? C2 A DC 10 ? ? O2 A DC 10 ? ? 117.45 121.90 -4.45 0.70 N 316 10 "O4'" A DA 11 ? ? "C1'" A DA 11 ? ? N9 A DA 11 ? ? 110.24 108.30 1.94 0.30 N 317 10 C4 A DA 11 ? ? C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? 113.92 117.00 -3.08 0.50 N 318 10 C5 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N1 A DA 11 ? ? 121.36 117.70 3.66 0.50 N 319 10 N1 A DA 11 ? ? C6 A DA 11 ? ? N6 A DA 11 ? ? 113.05 118.60 -5.55 0.60 N 320 10 "O4'" A DC 12 ? ? "C1'" A DC 12 ? ? N1 A DC 12 ? ? 111.57 108.30 3.27 0.30 N 321 10 N3 A DC 12 ? ? C2 A DC 12 ? ? O2 A DC 12 ? ? 116.97 121.90 -4.93 0.70 N 322 10 "O4'" A DA 13 ? ? "C1'" A DA 13 ? ? N9 A DA 13 ? ? 110.44 108.30 2.14 0.30 N 323 10 C4 A DA 13 ? ? C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? 113.67 117.00 -3.33 0.50 N 324 10 C5 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N1 A DA 13 ? ? 121.40 117.70 3.70 0.50 N 325 10 N1 A DA 13 ? ? C6 A DA 13 ? ? N6 A DA 13 ? ? 112.68 118.60 -5.92 0.60 N 326 10 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 113.89 108.30 5.59 0.30 N 327 10 "O4'" A DG 15 ? ? "C1'" A DG 15 ? ? N9 A DG 15 ? ? 113.63 108.30 5.33 0.30 N 328 10 "O4'" A DG 16 ? ? "C1'" A DG 16 ? ? N9 A DG 16 ? ? 114.98 108.30 6.68 0.30 N 329 10 "O4'" A DG 17 ? ? "C1'" A DG 17 ? ? N9 A DG 17 ? ? 113.29 108.30 4.99 0.30 N 330 10 "O4'" A DA 18 ? ? "C1'" A DA 18 ? ? N9 A DA 18 ? ? 111.50 108.30 3.20 0.30 N 331 10 C4 A DA 18 ? ? C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? 113.78 117.00 -3.22 0.50 N 332 10 C5 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N1 A DA 18 ? ? 121.50 117.70 3.80 0.50 N 333 10 N1 A DA 18 ? ? C6 A DA 18 ? ? N6 A DA 18 ? ? 113.47 118.60 -5.13 0.60 N 334 10 N3 A DC 19 ? ? C2 A DC 19 ? ? O2 A DC 19 ? ? 117.34 121.90 -4.56 0.70 N 335 10 "O4'" A DG 21 ? ? "C1'" A DG 21 ? ? N9 A DG 21 ? ? 112.39 108.30 4.09 0.30 N 336 10 "O4'" A DG 22 ? ? "C1'" A DG 22 ? ? N9 A DG 22 ? ? 111.00 108.30 2.70 0.30 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 G A 1 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 2 1 DG A 2 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 3 1 DG A 6 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 4 1 DA A 11 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 5 1 DG A 16 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 6 1 DG A 21 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 7 2 G A 1 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 8 2 DG A 2 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 9 2 DG A 6 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 10 2 DG A 16 ? ? 0.053 'SIDE CHAIN' 11 3 G A 1 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 12 3 DG A 2 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 13 3 DG A 8 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 14 3 DC A 10 ? ? 0.104 'SIDE CHAIN' 15 3 DG A 16 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 16 4 G A 1 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 17 4 DG A 2 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 18 4 DG A 6 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 19 4 DG A 8 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 20 4 DA A 11 ? ? 0.110 'SIDE CHAIN' 21 4 DG A 16 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 22 4 G A 20 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 23 5 G A 1 ? ? 0.083 'SIDE CHAIN' 24 5 DA A 11 ? ? 0.100 'SIDE CHAIN' 25 5 DC A 12 ? ? 0.087 'SIDE CHAIN' 26 5 DG A 16 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 27 5 DA A 18 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 28 6 G A 1 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 29 6 DC A 12 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 30 6 DG A 16 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 31 6 DG A 17 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 32 7 G A 1 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 33 7 DG A 2 ? ? 0.082 'SIDE CHAIN' 34 7 DG A 6 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 35 7 DG A 8 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 36 7 DG A 16 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' 37 7 DG A 22 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 38 8 DG A 2 ? ? 0.067 'SIDE CHAIN' 39 8 DA A 11 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 40 8 DA A 13 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 41 8 DG A 17 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 42 9 G A 1 ? ? 0.054 'SIDE CHAIN' 43 9 DG A 6 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 44 9 DG A 16 ? ? 0.100 'SIDE CHAIN' 45 9 DG A 21 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' 46 10 G A 1 ? ? 0.057 'SIDE CHAIN' 47 10 DG A 2 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 48 10 DG A 7 ? ? 0.053 'SIDE CHAIN' 49 10 DG A 16 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 50 10 DG A 21 ? ? 0.060 'SIDE CHAIN' # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6FFR 'double helix' 6FFR 'hairpin loop' 6FFR 'quadruple helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A G 1 1_555 A DG 16 1_555 -1.796 -3.358 -0.450 13.664 -2.369 89.041 1 A_G1:DG16_A A 1 ? A 16 ? 6 3 1 A DG 21 1_555 A DG 15 1_555 1.437 3.445 -0.351 0.126 9.397 -92.175 2 A_DG21:DG15_A A 21 ? A 15 ? 6 3 1 A DG 7 1_555 A DG 2 1_555 -1.634 -3.468 0.113 0.807 1.164 88.305 3 A_DG7:DG2_A A 7 ? A 2 ? 6 3 1 A G 20 1_555 A DG 6 1_555 -1.763 -3.309 0.426 -7.125 7.090 91.486 4 A_G20:DG6_A A 20 ? A 6 ? 6 3 1 A DG 3 1_555 A DG 14 1_555 -1.771 -3.287 -0.099 -3.350 12.971 91.656 5 A_DG3:DG14_A A 3 ? A 14 ? 6 3 1 A DA 9 1_555 A DA 13 1_555 2.802 0.825 0.126 9.438 -14.872 -125.621 6 A_DA9:DA13_A A 9 ? A 13 ? ? ? 1 A DC 10 1_555 A DC 12 1_555 0.982 -1.436 0.323 44.780 -22.100 -88.440 7 A_DC10:DC12_A A 10 ? A 12 ? ? ? # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A G 1 1_555 A DG 16 1_555 A DG 21 1_555 A DG 15 1_555 1.400 1.822 2.906 9.116 5.252 -72.525 -1.673 1.425 2.620 -4.417 7.666 -73.180 1 AA_G1DG21:DG15DG16_AA A 1 ? A 16 ? A 21 ? A 15 ? 1 A DG 21 1_555 A DG 15 1_555 A DG 7 1_555 A DG 2 1_555 1.355 3.573 -0.304 6.157 -14.184 -178.427 -1.787 0.678 -0.299 7.093 3.079 -178.441 2 AA_DG21DG7:DG2DG15_AA A 21 ? A 15 ? A 7 ? A 2 ? 1 A DG 7 1_555 A DG 2 1_555 A G 20 1_555 A DG 6 1_555 -0.606 -2.192 -2.929 -5.795 -2.188 71.374 -1.939 0.691 -2.820 -1.872 4.958 71.607 3 AA_DG7G20:DG6DG2_AA A 7 ? A 2 ? A 20 ? A 6 ? 1 A DG 3 1_555 A DG 14 1_555 A DA 9 1_555 A DA 13 1_555 0.724 -2.158 3.173 0.160 -2.613 -108.016 1.365 0.449 3.136 1.614 0.099 -108.038 4 AA_DG3DA9:DA13DG14_AA A 3 ? A 14 ? A 9 ? A 13 ? 1 A DA 9 1_555 A DA 13 1_555 A DC 10 1_555 A DC 12 1_555 -0.006 1.190 3.216 -3.897 3.624 9.785 0.407 -6.130 3.216 19.470 20.935 11.135 5 AA_DA9DC10:DC12DA13_AA A 9 ? A 13 ? A 10 ? A 12 ? # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #