data_6GEJ # _entry.id 6GEJ # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.318 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6GEJ WWPDB D_1200009835 EMDB EMD-4395 # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Chromatin remodeller-nucleosome complex at 3.6 A resolution.' _pdbx_database_related.db_id EMD-4395 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6GEJ _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2018-04-26 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Willhoft, O.' 1 0000-0003-2422-1839 'Chua, E.Y.D.' 2 0000-0003-1224-2157 'Wilkinson, M.' 3 ? 'Wigley, D.B.' 4 0000-0002-0786-6726 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Science _citation.journal_id_ASTM SCIEAS _citation.journal_id_CSD 0038 _citation.journal_id_ISSN 1095-9203 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 362 _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structure and dynamics of the yeast SWR1-nucleosome complex.' _citation.year 2018 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/science.aat7716 _citation.pdbx_database_id_PubMed 30309918 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Willhoft, O.' 1 ? primary 'Ghoneim, M.' 2 0000-0003-2889-1039 primary 'Lin, C.L.' 3 0000-0002-7158-6091 primary 'Chua, E.Y.D.' 4 0000-0003-1224-2157 primary 'Wilkinson, M.' 5 0000-0001-5490-613X primary 'Chaban, Y.' 6 ? primary 'Ayala, R.' 7 ? primary 'McCormack, E.A.' 8 ? primary 'Ocloo, L.' 9 ? primary 'Rueda, D.S.' 10 0000-0003-4657-6323 primary 'Wigley, D.B.' 11 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6GEJ _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.0 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.0 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.0 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB 1 _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6GEJ _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Vacuolar protein sorting-associated protein 72' 11166.757 1 ? ? ? ? 2 polymer man 'Histone H3' 15405.032 2 ? ? ? ? 3 polymer man 'Histone H4' 11395.390 2 ? ? ? ? 4 polymer man 'Histone H2A.1' 14013.177 2 ? ? ? ? 5 polymer man 'Histone H2B.1' 14280.362 2 ? ? ? ? 6 polymer man 'DNA (154-MER)' 47274.102 1 ? ? ? ? 7 polymer man 'DNA (154-MER)' 47803.430 1 ? ? ? ? 8 polymer man 'Helicase SWR1' 174792.969 1 3.6.4.12 ? ? ? 9 polymer man 'Actin-like protein ARP6' 50100.582 1 ? ? ? ? 10 polymer man 'Vacuolar protein sorting-associated protein 71' 32073.479 1 ? ? ? ? 11 polymer man 'RuvB-like protein 1' 50516.941 3 3.6.4.12 ? ? ? 12 polymer man 'RuvB-like protein 2' 51673.488 3 3.6.4.12 ? ? ? 13 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 8 ? ? ? ? 14 non-polymer syn 'BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION' 66.007 2 ? ? ? ? 15 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 8 ? ? ? ? 16 non-polymer syn 'ZINC ION' 65.409 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 5 'Suppressor of Ty protein 12' 8 'Swi2/Snf2-related 1' 10 'SWR complex protein 6' 11 'RUVBL1,TIP49-homology protein 1,TIP49a homolog' 12 'RUVBL2,TIP49-homology protein 2,TIP49b homolog' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK)(UNK) (UNK)(UNK)(UNK) ; ;XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX ; Z ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLASKAARKSAPSTGGVKKPHRYKPGTVALREIRRFQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAIGALQESVEAYLVSLFEDTNLAAIHAKRVTIQKKEIKLARRLRGERS ; ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLASKAARKSAPSTGGVKKPHRYKPGTVALREIRRFQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAIGALQESVEAYLVSLFEDTNLAAIHAKRVTIQKKEIKLARRLRGERS ; A,B ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKILRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEEVRAVLKSFLESVIRDSVTYTEHAKRK TVTSLDVVYALKRQGRTLYGFGG ; ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKILRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEEVRAVLKSFLESVIRDSVTYTEHAKRK TVTSLDVVYALKRQGRTLYGFGG ; C,D ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSGGKGGKAGSAAKASQSRSAKAGLTFPVGRVHRLLRRGNYAQRIGSGAPVYLTAVLEYLAAEILELAGNAARDNKKTRI IPRHLQLAIRNDDELNKLLGNVTIAQGGVLPNIHQNLLPKKSAKATKASQEL ; ;MSGGKGGKAGSAAKASQSRSAKAGLTFPVGRVHRLLRRGNYAQRIGSGAPVYLTAVLEYLAAEILELAGNAARDNKKTRI IPRHLQLAIRNDDELNKLLGNVTIAQGGVLPNIHQNLLPKKSAKATKASQEL ; E,F ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MSAKAEKKPASKAPAEKKPAAKKTSTSTDGKKRSKARKETYSSYIYKVLKQTHPDTGISQKSMSILNSFVNDIFERIATE ASKLAAYNKKSTISAREIQTAVRLILPGELAKHAVSEGTRAVTKYSSSTQA ; ;MSAKAEKKPASKAPAEKKPAAKKTSTSTDGKKRSKARKETYSSYIYKVLKQTHPDTGISQKSMSILNSFVNDIFERIATE ASKLAAYNKKSTISAREIQTAVRLILPGELAKHAVSEGTRAVTKYSSSTQA ; G,H ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DG)(DC)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG) (DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DA)(DT)(DT)(DG)(DG)(DT)(DC) (DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC) (DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG) (DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DC)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DC)(DC)(DG)(DC)(DC) (DA)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DT)(DT)(DA)(DC)(DT)(DC)(DC)(DC)(DT)(DA)(DG)(DT)(DC) (DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DA)(DG)(DA)(DT)(DA)(DT) (DA)(DT)(DA)(DC)(DA)(DT)(DC)(DC)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DA) ; ;CGCCCTGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCTCAATTGGTCGTAGACAGCTCTAGCACCGCTTAAACGCACGTACGCGCTG TCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACTCCCTAGTCTCCAGGCACGTGTCAGATATATACATCCTGTGCA ; I ? 7 polydeoxyribonucleotide no no ;(DT)(DG)(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DG)(DA)(DT)(DG)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DA)(DT)(DC)(DT) (DG)(DA)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DC)(DT)(DA)(DG) (DG)(DG)(DA)(DG)(DT)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DC)(DT)(DT)(DG)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT) (DT)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DC)(DA)(DG)(DC)(DG)(DC) (DG)(DT)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DC)(DG)(DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG) (DC)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DT)(DC)(DT)(DA)(DC)(DG)(DA)(DC)(DC)(DA)(DA) (DT)(DT)(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DA)(DC)(DC)(DG)(DG) (DG)(DA)(DT)(DT)(DC)(DT)(DC)(DC)(DA)(DG)(DG)(DG)(DC)(DG) ; ;TGCACAGGATGTATATATCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAATCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGC GTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGTCTACGACCAATTGAGCGGCCTCGGCACCGGGATTCTCCAGGGCG ; J ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MTTSRKSHAKDKKAGGEQDLADLKFRYDLLTNELFHLREFVSLVDYDPTHFNDSESFQKFLRETHLSLEERGEKFTDDVA KKGTNGDLTRRRRNLRTSTVVSSETTNEKKGDIELKLESIAPLVRNKCEELKYKLSDHSNRKSIVPQKRPIQHLKKREAA KSLKFKSERKENPLPLHEHIAEERYDHIAKVEEPSEAFTIKCPSDDSSFENTSEHYSDNFYFTTSSEEEDIKKKRGRKKK 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FNPSEFDGFDLKEGKGHHLVASESCMTLPELSKHADQVIFEEYEFDSLFKSPVAVFVPFTKSYKGEMRTISGKDEDIDIV RGNSDSTNSTSSESKNAQDSGSDYHDFQLVIDSGFNCTWIIPVLKGIPYYKAVKKLDIGGRFLTGLLKETLSFRHYNMMD ETILVNNIKEQCLFVSPVSYFDSFKTKDKHALEYVLPDFQTSFLGYVRNPRKENVPLPEDAQIITLTDELFTIPETFFHP EISQITKPGIVEAILESLSMLPEIVRPLMVGNIVCTGGNFNLPNFAQRLAAELQRQLPTDWTCHVSVPEGDCALFGWEVM SQFAKTDSYRKARVTREEYYEHGPDWCTKHRFGYQNWI ; ;METPPIVIDNGSYEIKFGPSTNKKPFRALNALAKDKFGTSYLSNHIKNIKDISSITFRRPHELGQLTLWELESCIWDYCL FNPSEFDGFDLKEGKGHHLVASESCMTLPELSKHADQVIFEEYEFDSLFKSPVAVFVPFTKSYKGEMRTISGKDEDIDIV RGNSDSTNSTSSESKNAQDSGSDYHDFQLVIDSGFNCTWIIPVLKGIPYYKAVKKLDIGGRFLTGLLKETLSFRHYNMMD ETILVNNIKEQCLFVSPVSYFDSFKTKDKHALEYVLPDFQTSFLGYVRNPRKENVPLPEDAQIITLTDELFTIPETFFHP EISQITKPGIVEAILESLSMLPEIVRPLMVGNIVCTGGNFNLPNFAQRLAAELQRQLPTDWTCHVSVPEGDCALFGWEVM SQFAKTDSYRKARVTREEYYEHGPDWCTKHRFGYQNWI ; R ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MKALVEEIDKKTYNPDIYFTSLDPQARRYTSKKINKQGTISTSRPVKRINYSLADLEARLYTSRSEGDGNSISRQDDRNS KNSHSFEERYTQQEILQSDRRFMELNTENFSDLPNVPTLLSDLTGVPRDRIESTTKPISQTSDGLSALMGGSSFVKEHSK YGHGWVLKPETLREIQLSYKSTKLPKPKRKNTNRIVALKKVLSSKRNLHSFLDSALLNLMDKNVIYHNVYNKRYFKVLPL ITTCSICGGYDSISSCVNCGNKICSVSCFKLHNETRCRNR ; ;MKALVEEIDKKTYNPDIYFTSLDPQARRYTSKKINKQGTISTSRPVKRINYSLADLEARLYTSRSEGDGNSISRQDDRNS KNSHSFEERYTQQEILQSDRRFMELNTENFSDLPNVPTLLSDLTGVPRDRIESTTKPISQTSDGLSALMGGSSFVKEHSK YGHGWVLKPETLREIQLSYKSTKLPKPKRKNTNRIVALKKVLSSKRNLHSFLDSALLNLMDKNVIYHNVYNKRYFKVLPL ITTCSICGGYDSISSCVNCGNKICSVSCFKLHNETRCRNR ; S ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MVAISEVKENPGVNSSNSGAVTRTAAHTHIKGLGLDESGVAKRVEGGFVGQIEAREACGVIVDLIKAKKMSGRAILLAGG PSTGKTALALAISQELGPKVPFCPLVGSELYSVEVKKTETLMENFRRAIGLRIKETKEVYEGEVTELTPEDAENPLGGYG KTISHVIVGLKSAKGTKTLRLDPTIYESIQREKVSIGDVIYIEANTGAVKRVGRSDAYATEFDLETEEYVPLPKGEVHKK KEIVQDVTLHDLDVANARPQGGQDVISMMGQLLKPKKTEITEKLRQEVNKVVAKYIDQGVAELIPGVLFIDEVNMLDIEI FTYLNKALESNIAPVVVLASNRGMTTVRGTEDVISPHGVPPDLIDRLLIVRTLPYDKDEIRTIIERRATVERLQVESSAL DLLATMGTETSLRYALQLLAPCGILAQTSNRKEIVVNDVNEAKLLFLDAKRSTKILETSANYL ; 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'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 136 ;Baker's yeast ; ? 'HHT1, YBR010W, YBR0201, HHT2, SIN2, YNL031C, N2749' ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 'Biological sequence' 1 103 ;Baker's yeast ; ? 'HHF1, YBR009C, YBR0122, HHF2, YNL030W, N2752' ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 'Biological sequence' 1 132 ;Baker's yeast ; ? 'HTA1, H2A1, SPT11, YDR225W, YD9934.10' ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 'Biological sequence' 1 131 ;Baker's yeast ; ? 'HTB1, H2B1, SPT12, YDR224C, YD9934.09C' ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 'Biological sequence' 1 154 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 'synthetic construct' 32630 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 'Biological sequence' 1 154 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 'synthetic construct' 32630 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 'Biological sequence' 1 1514 ;Baker's yeast ; ? 'SWR1, YDR334W, D9651.6' ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample 'Biological sequence' 1 438 ;Baker's yeast ; ? 'ARP6, YLR085C, L2393, L9449.13' ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 1 sample 'Biological sequence' 1 280 ;Baker's yeast ; ? 'VPS71, SWC6, YML041C, YM8054.02C' ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 1 sample 'Biological sequence' 1 463 ;Baker's yeast ; ? 'RVB1, TIH1, TIP49A, YDR190C' ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 1 sample 'Biological sequence' 1 471 ;Baker's yeast ; ? 'RVB2, TIH2, TIP49B, YPL235W, P1060' ? ? ? ? ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' 559292 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Trichoplusia ni' 7111 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 6GEJ 6GEJ ? 1 ? 1 2 UNP H3_YEAST P61830 ? 2 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLASKAARKSAPSTGGVKKPHRYKPGTVALREIRRFQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAIGALQESVEAYLVSLFEDTNLAAIHAKRVTIQKKDIKLARRLRGERS ; 1 3 UNP H4_YEAST P02309 ? 3 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKILRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEEVRAVLKSFLESVIRDSVTYTEHAKRK TVTSLDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 4 UNP H2A1_YEAST P04911 ? 4 ;MSGGKGGKAGSAAKASQSRSAKAGLTFPVGRVHRLLRRGNYAQRIGSGAPVYLTAVLEYLAAEILELAGNAARDNKKTRI IPRHLQLAIRNDDELNKLLGNVTIAQGGVLPNIHQNLLPKKSAKATKASQEL ; 1 5 UNP H2B1_YEAST P02293 ? 5 ;MSAKAEKKPASKAPAEKKPAAKKTSTSTDGKKRSKARKETYSSYIYKVLKQTHPDTGISQKSMSILNSFVNDIFERIATE ASKLAAYNKKSTISAREIQTAVRLILPGELAKHAVSEGTRAVTKYSSSTQA ; 1 6 PDB 6GEJ 6GEJ ? 6 ? 1 7 PDB 6GEJ 6GEJ ? 7 ? 1 8 UNP SWR1_YEAST Q05471 ? 8 ;MTTSRKSHAKDKKAGGEQDLADLKFRYDLLTNELFHLREFVSLVDYDPTHFNDSESFQKFLRETHLSLEERGEKFTDDVA KKGTNGDLTRRRRNLRTSTVVSSETTNEKKGDIELKLESIAPLVRNKCEELKYKLSDHSNRKSIVPQKRPIQHLKKREAA KSLKFKSERKENPLPLHEHIAEERYDHIAKVEEPSEAFTIKCPSDDSSFENTSEHYSDNFYFTTSSEEEDIKKKRGRKKK KPRIKLVVHPPKQTITNPLHVVKPGYESLHEYIASFKSLEDDLTLEEYNKYIDEQRRLLSRLKKGIENGALKYDKETDSL QPITSKEIKTIITYKPDPISYFYKQQDLQIHTDHLINQGIHMSKLFRSSTKARIARAKKVSQMIEQHFKHVAGAEERKAK EEERHKKSLARFAVQAVKKRWNMAEKAYRILRKDEEEQLKRIEGKQHLSKMLEKSTQLLEAQLNQVNDDGRSSTPSSDSN DVLSESDDDMDDELSTSSDEDEEVDADVGLENSPASTEATPTDESLNLIQLKEKYGHFNGSSTVYDSRNKDEKFPTLDKH ESSSSESSVMTGEESSIYSSSENESQNENDRESDDKTPSVGLSALFGKGEESDGDLDLDDSEDFTVNSSSVEGEELEKDQ VDNSAATFERAGDFVHTQNENRDDIKDVEEDAETKVQEEQLSVVDVPVPSLLRGNLRTYQKQGLNWLASLYNNHTNGILA DEMGLGKTIQTISLLAYLACEKENWGPHLIVVPTSVLLNWEMEFKRFAPGFKVLTYYGSPQQRKEKRKGWNKPDAFHVCI VSYQLVVQDQHSFKRKRWQYMVLDEAHNIKNFRSTRWQALLNFNTQRRLLLTGTPLQNNLAELWSLLYFLMPQTVIDGKK VSGFADLDAFQQWFGRPVDKIIETGQNFGQDKETKKTVAKLHQVLRPYLLRRLKADVEKQMPAKYEHIVYCKLSKRQRFL YDDFMSRAQTKATLASGNFMSIVNCLMQLRKVCNHPNLFEVRPILTSFVLEHCVASDYKDVERTLLKLFKKNNQVNRVDL DFLNLVFTLNDKDLTSYHAEEISKLTCVKNFVEEVNKLRETNKQLQEEFGEASFLNFQDANQYFKYSNKQKLEGTVDMLN FLKMVNKLRCDRRPIFGKNLIDLLTKDRRVKYDKSSIIDNELIKPLQTRVLDNRKIIDTFAVLTPSAVSLDMRKLALGLN DDSSVGENTRLKVMQNCFEVSNPLHQLQTKLTIAFPDKSLLQYDCGKLQKLAILLQQLKDNGHRALIFTQMTKVLDVLEQ FLNYHGYLYMRLDGATKIEDRQILTERFNTDSRITVFILSSRSGGLGINLTGADTVIFYDSDWNPAMDKQCQDRCHRIGQ TRDVHIYRFVSEHTIESNILKKANQKRQLDNVVIQEGDFTTDYFSKLSVRDLLGSELPENASGGDKPLIADADVAAKDPR QLERLLAQAEDEDDVKAANLAMREVEIDNDDFDESTEKKAANEEEENHAELDEYEGTAHVDEYMIRFIANGYYY ; 1 9 UNP ARP6_YEAST Q12509 ? 9 ;METPPIVIDNGSYEIKFGPSTNKKPFRALNALAKDKFGTSYLSNHIKNIKDISSITFRRPHELGQLTLWELESCIWDYCL FNPSEFDGFDLKEGKGHHLVASESCMTLPELSKHADQVIFEEYEFDSLFKSPVAVFVPFTKSYKGEMRTISGKDEDIDIV RGNSDSTNSTSSESKNAQDSGSDYHDFQLVIDSGFNCTWIIPVLKGIPYYKAVKKLDIGGRFLTGLLKETLSFRHYNMMD ETILVNNIKEQCLFVSPVSYFDSFKTKDKHALEYVLPDFQTSFLGYVRNPRKENVPLPEDAQIITLTDELFTIPETFFHP EISQITKPGIVEAILESLSMLPEIVRPLMVGNIVCTGGNFNLPNFAQRLAAELQRQLPTDWTCHVSVPEGDCALFGWEVM SQFAKTDSYRKARVTREEYYEHGPDWCTKHRFGYQNWI ; 1 10 UNP VPS71_YEAST Q03433 ? 10 ;MKALVEEIDKKTYNPDIYFTSLDPQARRYTSKKINKQGTISTSRPVKRINYSLADLEARLYTSRSEGDGNSISRQDDRNS KNSHSFEERYTQQEILQSDRRFMELNTENFSDLPNVPTLLSDLTGVPRDRIESTTKPISQTSDGLSALMGGSSFVKEHSK YGHGWVLKPETLREIQLSYKSTKLPKPKRKNTNRIVALKKVLSSKRNLHSFLDSALLNLMDKNVIYHNVYNKRYFKVLPL ITTCSICGGYDSISSCVNCGNKICSVSCFKLHNETRCRNR ; 1 11 UNP RUVB1_YEAST Q03940 ? 11 ;MVAISEVKENPGVNSSNSGAVTRTAAHTHIKGLGLDESGVAKRVEGGFVGQIEAREACGVIVDLIKAKKMSGRAILLAGG PSTGKTALALAISQELGPKVPFCPLVGSELYSVEVKKTETLMENFRRAIGLRIKETKEVYEGEVTELTPEDAENPLGGYG KTISHVIVGLKSAKGTKTLRLDPTIYESIQREKVSIGDVIYIEANTGAVKRVGRSDAYATEFDLETEEYVPLPKGEVHKK KEIVQDVTLHDLDVANARPQGGQDVISMMGQLLKPKKTEITEKLRQEVNKVVAKYIDQGVAELIPGVLFIDEVNMLDIEI FTYLNKALESNIAPVVVLASNRGMTTVRGTEDVISPHGVPPDLIDRLLIVRTLPYDKDEIRTIIERRATVERLQVESSAL DLLATMGTETSLRYALQLLAPCGILAQTSNRKEIVVNDVNEAKLLFLDAKRSTKILETSANYL ; 1 12 UNP RUVB2_YEAST Q12464 ? 12 ;MSIQTSDPNETSDLKSLSLIAAHSHITGLGLDENLQPRPTSEGMVGQLQARRAAGVILKMVQNGTIAGRAVLVAGPPSTG KTALAMGVSQSLGKDVPFTAIAGSEIFSLELSKTEALTQAFRKSIGIKIKEETELIEGEVVEIQIDRSITGGHKQGKLTI KTTDMETIYELGNKMIDGLTKEKVLAGDVISIDKASGKITKLGRSFARSRDYDAMGADTRFVQCPEGELQKRKTVVHTVS LHEIDVINSRTQGFLALFTGDTGEIRSEVRDQINTKVAEWKEEGKAEIVPGVLFIDEVHMLDIECFSFINRALEDEFAPI VMMATNRGVSKTRGTNYKSPHGLPLDLLDRSIIITTKSYNEQEIKTILSIRAQEEEVELSSDALDLLTKTGVETSLRYSS NLISVAQQIAMKRKNNTVEVEDVKRAYLLFLDSARSVKYVQENESQYIDDQGNVQISIAKSADPDAMDTTE ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6GEJ Z 1 ? 131 ? 6GEJ 81 ? 211 ? 81 211 2 2 6GEJ A 1 ? 136 ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.003 ? 6834 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6GEJ _struct.title 'Chromatin remodeller-nucleosome complex at 3.6 A resolution.' _struct.pdbx_descriptor ;Vacuolar protein sorting-associated protein 72, Histone H3, Histone H4, Histone H2A.1, Histone H2B.1, Helicase SWR1, Actin-like protein ARP6, Vacuolar protein sorting-associated protein 71, RuvB-like protein 1, RuvB-like protein 2/DNA Complex ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6GEJ _struct_keywords.text 'Chromatin, Remodeller, ATPase, Histone, NUCLEAR PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'NUCLEAR PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 5 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? 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WATSON-CRICK ? ? hydrog253 hydrog ? ? J DG 98 N1 ? ? ? 1_555 K DC 57 N3 ? ? I DG 20 J DC -20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog254 hydrog ? ? J DG 98 N2 ? ? ? 1_555 K DC 57 O2 ? ? I DG 20 J DC -20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog255 hydrog ? ? J DG 98 O6 ? ? ? 1_555 K DC 57 N4 ? ? I DG 20 J DC -20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog256 hydrog ? ? J DC 99 N3 ? ? ? 1_555 K DG 56 N1 ? ? I DC 21 J DG -21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog257 hydrog ? ? J DC 99 N4 ? ? ? 1_555 K DG 56 O6 ? ? I DC 21 J DG -21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog258 hydrog ? ? J DC 99 O2 ? ? ? 1_555 K DG 56 N2 ? ? I DC 21 J DG -21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog259 hydrog ? ? J DC 100 N4 ? ? ? 1_555 K DG 55 O6 ? ? I DC 22 J DG -22 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? hydrog260 hydrog ? ? J DC 100 N4 ? ? ? 1_555 K DG 56 O6 ? ? I DC 22 J DG -21 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? hydrog261 hydrog ? ? J DA 102 N1 ? ? ? 1_555 K DT 53 N3 ? ? 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S GLU 9 1320 1 Y 1 X ASN 10 ? S ASN 10 1321 1 Y 1 X PRO 11 ? S PRO 11 1322 1 Y 1 X GLY 12 ? S GLY 12 1323 1 Y 1 X VAL 13 ? S VAL 13 1324 1 Y 1 X ASN 14 ? S ASN 14 1325 1 Y 1 X SER 15 ? S SER 15 1326 1 Y 1 X SER 16 ? S SER 16 1327 1 Y 1 X ASN 17 ? S ASN 17 1328 1 Y 1 X SER 18 ? S SER 18 1329 1 Y 1 X GLY 19 ? S GLY 19 1330 1 Y 1 X ALA 20 ? S ALA 20 1331 1 Y 1 X VAL 21 ? S VAL 21 1332 1 Y 1 Y MET 1 ? T MET 1 1333 1 Y 1 Y SER 2 ? T SER 2 1334 1 Y 1 Y ILE 3 ? T ILE 3 1335 1 Y 1 Y GLN 4 ? T GLN 4 1336 1 Y 1 Y THR 5 ? T THR 5 1337 1 Y 1 Y SER 6 ? T SER 6 1338 1 Y 1 Y ASP 7 ? T ASP 7 1339 1 Y 1 Y PRO 8 ? T PRO 8 1340 1 Y 1 Y ASN 9 ? T ASN 9 1341 1 Y 1 Y GLU 10 ? T GLU 10 1342 1 Y 1 Y THR 11 ? T THR 11 1343 1 Y 1 Y SER 12 ? T SER 12 1344 1 Y 1 Y ASP 13 ? T ASP 13 1345 1 Y 1 Y SER 461 ? T SER 461 1346 1 Y 1 Y ALA 462 ? T ALA 462 1347 1 Y 1 Y ASP 463 ? T ASP 463 1348 1 Y 1 Y PRO 464 ? T PRO 464 1349 1 Y 1 Y ASP 465 ? T ASP 465 1350 1 Y 1 Y ALA 466 ? T ALA 466 1351 1 Y 1 Y MET 467 ? 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'Sodium fluoride' # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 1.3 # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? 2 1 559292 ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' ? ? ? ? 3 2 32630 ? ? 'synthetic construct' ? ? ? ? 4 3 559292 ? ? 'Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)' ? ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain _em_entity_assembly_recombinant.cell 2 1 562 'Escherichia coli' ? ? ? 3 2 562 'Escherichia coli' ? ? ? 4 3 7111 'Trichoplusia ni' ? ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 1.71794871794872 _em_image_recording.average_exposure_time 1 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode INTEGRATING _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON III (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 1 _em_image_recording.num_real_images 5517 # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 ? 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? 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J 46 ? 1 J DC 32 1_555 K DG 123 1_555 J DA 33 1_555 K DT 122 1_555 -0.538 3.242 3.806 2.070 -6.051 41.695 5.187 0.981 3.296 -8.442 -2.888 42.161 32 II_DC-46DA-45:DT45DG46_JJ I -46 ? J 46 ? I -45 ? J 45 ? 1 J DA 33 1_555 K DT 122 1_555 J DA 34 1_555 K DT 121 1_555 -1.576 1.178 3.704 -6.278 1.197 37.706 1.622 1.477 3.940 1.836 9.629 38.224 33 II_DA-45DA-44:DT44DT45_JJ I -45 ? J 45 ? I -44 ? J 44 ? 1 J DA 34 1_555 K DT 121 1_555 J DT 35 1_555 K DA 120 1_555 0.112 0.140 3.563 -5.341 3.105 31.869 -0.343 -1.222 3.497 5.588 9.614 32.447 34 II_DA-44DT-43:DA43DT44_JJ I -44 ? J 44 ? I -43 ? J 43 ? 1 J DT 35 1_555 K DA 120 1_555 J DT 36 1_555 K DA 119 1_555 0.699 -0.169 3.559 -4.228 6.383 34.655 -1.280 -1.812 3.370 10.557 6.992 35.466 35 II_DT-43DT-42:DA42DA43_JJ I -43 ? J 43 ? I -42 ? J 42 ? 1 J DT 36 1_555 K DA 119 1_555 J DG 37 1_555 K DC 118 1_555 1.903 -0.096 2.864 -2.490 11.348 35.529 -1.431 -3.255 2.580 18.013 3.952 37.322 36 II_DT-42DG-41:DC41DA42_JJ I -42 ? J 42 ? I -41 ? J 41 ? 1 J DG 37 1_555 K DC 118 1_555 J DG 38 1_555 K DC 117 1_555 0.024 -0.921 3.138 2.100 6.855 31.954 -2.737 0.295 2.879 12.260 -3.756 32.728 37 II_DG-41DG-40:DC40DC41_JJ I -41 ? J 41 ? I -40 ? J 40 ? 1 J DG 38 1_555 K DC 117 1_555 J DT 39 1_555 K DA 116 1_555 0.420 -0.977 3.146 2.806 3.368 34.797 -2.104 -0.297 3.065 5.605 -4.669 35.064 38 II_DG-40DT-39:DA39DC40_JJ I -40 ? J 40 ? I -39 ? J 39 ? 1 J DT 39 1_555 K DA 116 1_555 J DC 40 1_555 K DG 115 1_555 0.919 0.093 3.325 13.301 7.256 42.387 -0.578 0.079 3.422 9.672 -17.732 44.896 39 II_DT-39DC-38:DG38DA39_JJ I -39 ? J 39 ? I -38 ? J 38 ? 1 J DC 40 1_555 K DG 115 1_555 J DG 41 1_555 K DC 114 1_555 0.412 1.529 3.692 1.602 -0.703 31.695 2.942 -0.423 3.674 -1.285 -2.931 31.742 40 II_DC-38DG-37:DC37DG38_JJ I -38 ? J 38 ? I -37 ? J 37 ? 1 J DG 41 1_555 K DC 114 1_555 J DT 42 1_555 K DA 113 1_555 -1.022 -0.111 3.170 -3.761 1.176 30.666 -0.433 1.199 3.262 2.212 7.074 30.913 41 II_DG-37DT-36:DA36DC37_JJ I -37 ? J 37 ? I -36 ? 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