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EMDB EMD-4411 ? ? # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Cryo-EM structure of the human synaptic alpha1-beta3-gamma2 GABAA receptor in complex with Megabody38 in a lipid nanodisc' _pdbx_database_related.db_id EMD-4411 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6I53 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2018-11-12 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Laverty, D.' 1 ? 'Desai, R.' 2 ? 'Uchanski, T.' 3 ? 'Masiulis, S.' 4 ? 'Wojciech, J.S.' 5 ? 'Malinauskas, T.' 6 ? 'Zivanov, J.' 7 ? 'Pardon, E.' 8 ? 'Steyaert, J.' 9 ? 'Miller, K.W.' 10 ? 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;MSSPNIWSTGSSVYSTPVFSQKMTVWILLLLSLYPGFTSQKSDDDYEDYASNKTWVLTPKVPEGDVTVILNNLLEGYDNK LRPDIGVKPTLIHTDMYVNSIGPVNAINMEYTIDIFFAQTWYDRRLKFNSTIKVLRLNSNMVGKIWIPDTFFRNSKKADA HWITTPNRMLRIWNDGRVLYTLRLTIDAECQLQLHNFPMDEHSCPLEFSSYGYPREEIVYQWKRSSVEVGDTRSWRLYQF SFVGLRNTTEVVKTTSGDYVVMSVYFDLSRRMGYFTIQTYIPCTLIVVLSWVSFWINKDAVPARTSLGITTVLTMTTLST IARKSLPKVSYVTAMDLFVSVCFIFVFSALVEYGTLHYFVSNRKPSKDKDKKKKNPLLRMFSFKAPTIDIRPRSATIQMN NATHLQERDEEYGYECLDGKDCASFFCCFEDCRTGAWRHGRIHIRIAKMDSYARIFFPTAFCLFNLVYWVSYLYLGGSGG SGGSGKTETSQVAPA ; C ? 4 'polypeptide(L)' no no ;QVQLQESGGGLVQAGGSLRVSCAASGRTFTAYIMAWFRQAPGKEREFLAAMDQGRIQYYGDSVRGRFTISRDYAKNSVDL QLDGLRPEDTAVYYCAAGAGFWGLRTASSYHYWGQGTQVTVSS ; ;QVQLQESGGGLVQAGGSLRVSCAASGRTFTAYIMAWFRQAPGKEREFLAAMDQGRIQYYGDSVRGRFTISRDYAKNSVDL QLDGLRPEDTAVYYCAAGAGFWGLRTASSYHYWGQGTQVTVSS ; G ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 CYS n 1 3 SER n 1 4 GLY n 1 5 LEU n 1 6 LEU n 1 7 GLU n 1 8 LEU n 1 9 LEU n 1 10 LEU n 1 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THR G 106 TYR G 110 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 161 SG ? ? ? 1_555 A CYS 175 SG ? ? E CYS 136 E CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 174 SG ? ? ? 1_555 B CYS 188 SG ? ? A CYS 139 A CYS 153 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf3 disulf ? ? C CYS 161 SG ? ? ? 1_555 C CYS 175 SG ? ? B CYS 136 B CYS 150 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf4 disulf ? ? D CYS 190 SG ? ? ? 1_555 D CYS 204 SG ? ? C CYS 151 C CYS 165 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? E CYS 174 SG ? ? ? 1_555 E CYS 188 SG ? ? D CYS 139 D CYS 153 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf6 disulf ? ? F CYS 22 SG ? ? ? 1_555 F CYS 95 SG ? ? G CYS 22 G CYS 95 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? covale1 covale one ? A ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? E ASN 80 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 174 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? E ASN 149 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 146 ND2 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? A ASN 111 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? C ASN 105 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? B ASN 80 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? C ASN 174 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? B ASN 149 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? D ASN 247 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? C ASN 208 L NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? E ASN 146 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? D ASN 111 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale8 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale9 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G BMA . C1 ? ? F NAG 2 F BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale10 covale both ? G BMA . O3 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? F BMA 3 F MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale11 covale both ? G BMA . O6 ? ? ? 1_555 G MAN . C1 ? ? F BMA 3 F MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale12 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale13 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale14 covale both ? I NAG . O4 ? ? ? 1_555 I BMA . C1 ? ? I NAG 2 I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale15 covale both ? I BMA . O6 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? I BMA 3 I MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale16 covale both ? I BMA . O3 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? I BMA 3 I MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale17 covale both ? I MAN . O3 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? I MAN 4 I MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale18 covale both ? I MAN . O6 ? ? ? 1_555 I MAN . C1 ? ? I MAN 4 I MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale19 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale20 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J BMA . C1 ? ? J NAG 2 J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale21 covale both ? J BMA . O6 ? ? ? 1_555 J MAN . C1 ? ? J BMA 3 J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale22 covale both ? J BMA . O3 ? ? ? 1_555 J MAN . C1 ? ? J BMA 3 J MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale23 covale both ? J MAN . O3 ? ? ? 1_555 J MAN . C1 ? ? J MAN 4 J MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale24 covale both ? K NAG . O4 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale25 covale both ? L NAG . O4 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? L NAG 1 L NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale26 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale27 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M BMA . C1 ? ? M NAG 2 M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale28 covale both ? M BMA . O3 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? M BMA 3 M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale29 covale both ? M BMA . O6 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? M BMA 3 M MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 VAL 134 A . ? VAL 109 E THR 135 A ? THR 110 E 1 6.39 2 TYR 168 A . ? TYR 143 E PRO 169 A ? PRO 144 E 1 2.73 3 MET 147 B . ? MET 112 A THR 148 B ? 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X ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense A 1 2 ? parallel A 2 3 ? anti-parallel A 3 4 ? anti-parallel A 4 5 ? anti-parallel B 1 2 ? anti-parallel B 2 3 ? anti-parallel B 3 4 ? anti-parallel C 1 2 ? anti-parallel C 2 3 ? anti-parallel C 3 4 ? anti-parallel D 1 2 ? anti-parallel E 1 2 ? parallel E 2 3 ? anti-parallel E 3 4 ? anti-parallel E 4 5 ? anti-parallel E 5 6 ? anti-parallel F 1 2 ? parallel G 1 2 ? anti-parallel G 2 3 ? anti-parallel G 3 4 ? anti-parallel H 1 2 ? parallel H 2 3 ? anti-parallel H 3 4 ? anti-parallel H 4 5 ? anti-parallel H 5 6 ? anti-parallel I 1 2 ? anti-parallel J 1 2 ? anti-parallel J 2 3 ? anti-parallel J 3 4 ? anti-parallel K 1 2 ? anti-parallel L 1 2 ? anti-parallel M 1 2 ? parallel M 2 3 ? anti-parallel M 3 4 ? anti-parallel M 4 5 ? anti-parallel M 5 6 ? anti-parallel N 1 2 ? parallel O 1 2 ? anti-parallel O 2 3 ? anti-parallel O 3 4 ? anti-parallel P 1 2 ? anti-parallel Q 1 2 ? parallel Q 2 3 ? anti-parallel Q 3 4 ? anti-parallel R 1 2 ? anti-parallel S 1 2 ? anti-parallel S 2 3 ? anti-parallel T 1 2 ? anti-parallel U 1 2 ? anti-parallel V 1 2 ? anti-parallel V 2 3 ? anti-parallel V 3 4 ? anti-parallel W 1 2 ? parallel X 1 2 ? anti-parallel X 2 3 ? anti-parallel X 3 4 ? anti-parallel X 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id A 1 ILE A 189 ? 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'Embryonic kidney cells' 3 3 ? 562 'Escherichia coli' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 30.84 _em_image_recording.average_exposure_time 60 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON III (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 1 _em_image_recording.num_real_images 784 # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name ? _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width ? _em_imaging_optics.phase_plate 'VOLTA PHASE PLATE' _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'PARTICLE SELECTION' ? ? ? 1 ? ? 3 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 4 MASKING ? ? ? ? ? ? 5 'CTF CORRECTION' ? 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PHENIX ? ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.5 _em_specimen.details 'The purified receptor-nanodisc complex was mixed with Mb38 prior to grid preparation.' _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Medical Research Council (United Kingdom)' 'United Kingdom' MR/L009609/1 1 'Medical Research Council (United Kingdom)' 'United Kingdom' MC_UP_1201/15 2 'Medical Research Council (United Kingdom)' 'United Kingdom' MC_UP_A025_1013 3 'Human Frontier Science Program' 'United Kingdom' RGP0065/2014 4 'Cancer Research UK' 'United Kingdom' C20724/A14414 5 'Swiss National Science Foundation' Switzerland 168735 6 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 'GM 58448' 7 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero G 5 NAG 1 F NAG 1 V NAG 3000 n G 5 NAG 2 F NAG 2 V NAG 3001 n G 5 BMA 3 F BMA 3 V BMA 3002 n G 5 MAN 4 F MAN 4 V MAN 3008 n G 5 MAN 5 F MAN 5 V MAN 3003 n H 6 NAG 1 H NAG 1 P NAG 2000 n H 6 NAG 2 H NAG 2 P NAG 2001 n I 7 NAG 1 I NAG 1 R NAG 2997 n I 7 NAG 2 I NAG 2 R NAG 2998 n I 7 BMA 3 I BMA 3 R BMA 2999 n I 7 MAN 4 I MAN 4 R MAN 3000 n I 7 MAN 5 I MAN 5 R MAN 3003 n I 7 MAN 6 I MAN 6 R MAN 3001 n I 7 MAN 7 I MAN 7 R MAN 3005 n J 8 NAG 1 J NAG 1 S NAG 3000 n J 8 NAG 2 J NAG 2 S NAG 3001 n J 8 BMA 3 J BMA 3 S BMA 3002 n J 8 MAN 4 J MAN 4 S MAN 3003 n J 8 MAN 5 J MAN 5 S MAN 3006 n J 8 MAN 6 J MAN 6 S MAN 3008 n K 6 NAG 1 K NAG 1 O NAG 2000 n K 6 NAG 2 K NAG 2 O NAG 2001 n L 6 NAG 1 L NAG 1 T NAG 3000 n L 6 NAG 2 L NAG 2 T NAG 3001 n M 5 NAG 1 M NAG 1 U NAG 3000 n M 5 NAG 2 M NAG 2 U NAG 3001 n M 5 BMA 3 M BMA 3 U BMA 3002 n M 5 MAN 4 M MAN 4 U MAN 3008 n M 5 MAN 5 M MAN 5 U MAN 3003 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide 8 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 5 'DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 5 'WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 5 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 6 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 6 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 6 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 7 7 'DManpa1-3[DManpa1-6]DManpa1-6[DManpa1-3]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 8 7 'WURCS=2.0/3,7,6/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1_e3-f1_e6-g1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 9 7 ;[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}}} ; LINUCS PDB-CARE ? 10 8 'DManpa1-3DManpa1-6[DManpa1-3]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 11 8 'WURCS=2.0/3,6,5/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-e1_e3-f1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 12 8 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 5 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 3 5 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 4 5 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 5 6 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 6 7 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 7 7 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 8 7 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 9 7 5 MAN C1 O1 4 MAN O3 HO3 sing ? 10 7 6 MAN C1 O1 4 MAN O6 HO6 sing ? 11 7 7 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 12 8 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 13 8 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 14 8 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 15 8 5 MAN C1 O1 4 MAN O3 HO3 sing ? 16 8 6 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n 5 BMA 3 n 5 MAN 4 n 5 MAN 5 n 6 NAG 1 n 6 NAG 2 n 7 NAG 1 n 7 NAG 2 n 7 BMA 3 n 7 MAN 4 n 7 MAN 5 n 7 MAN 6 n 7 MAN 7 n 8 NAG 1 n 8 NAG 2 n 8 BMA 3 n 8 MAN 4 n 8 MAN 5 n 8 MAN 6 n # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 9 '(2S)-3-(hexadecanoyloxy)-2-[(9Z)-octadec-9-enoyloxy]propyl 2-(trimethylammonio)ethyl phosphate' POV 10 ;[(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate ; PIO # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #