data_6KAF # _entry.id 6KAF # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.318 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6KAF WWPDB D_1300012388 EMDB EMD-9957 # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'C2S2M2N2-type PSII-LHCII' _pdbx_database_related.db_id EMD-9957 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6KAF _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-06-22 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBJ _pdbx_database_status.process_site PDBJ _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Chang, S.H.' 1 0000-0002-0908-711X 'Shen, L.L.' 2 0000-0003-0868-3283 'Huang, Z.H.' 3 0000-0002-3367-9924 'Wang, W.D.' 4 0000-0002-1842-8633 'Han, G.Y.' 5 0000-0003-3373-2008 'Shen, J.R.' 6 0000-0003-4471-8797 'Zhang, X.' 7 0000-0002-6776-326X # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Proc.Natl.Acad.Sci.USA _citation.journal_id_ASTM PNASA6 _citation.journal_id_CSD 0040 _citation.journal_id_ISSN 1091-6490 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 116 _citation.language ? _citation.page_first 21246 _citation.page_last 21255 _citation.title 'Structure of a C2S2M2N2-type PSII-LHCII supercomplex from the green algaChlamydomonas reinhardtii.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1073/pnas.1912462116 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31570614 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Shen, L.' 1 ? primary 'Huang, Z.' 2 ? primary 'Chang, S.' 3 ? primary 'Wang, W.' 4 ? primary 'Wang, J.' 5 ? primary 'Kuang, T.' 6 ? primary 'Han, G.' 7 ? primary 'Shen, J.R.' 8 ? primary 'Zhang, X.' 9 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6KAF _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6KAF _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'Chlorophyll a-b binding protein CP29' 29970.846 2 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Photosystem II protein D1' 39066.340 2 1.10.3.9 ? ? ? 3 polymer nat 'Photosystem II D2 protein' 39474.031 2 1.10.3.9 ? ? ? 4 polymer nat 'Cytochrome b559 subunit beta' 4986.013 2 ? ? ? ? 5 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein H' 9445.063 2 ? ? ? ? 6 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein I' 4245.035 2 ? ? ? ? 7 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein J, PsbJ' 5725.746 2 ? ? ? ? 8 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein K' 5062.142 2 ? ? ? ? 9 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein L' 4431.229 2 ? ? ? ? 10 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein M' 3762.433 2 ? ? ? ? 11 polymer nat 'Oxygen-evolving enhancer protein 1 of photosystem II' 30614.748 2 ? ? ? ? 12 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein T' 3639.438 2 ? ? ? ? 13 polymer nat 'Photosystem II reaction center W protein, chloroplastic' 12155.054 2 ? ? ? ? 14 polymer nat '4.1 kDa photosystem II subunit' 9894.716 2 ? ? ? ? 15 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein Z' 6565.863 2 ? ? ? ? 16 polymer nat 'Photosystem II reaction center protein 30, Psb30' 3333.058 2 ? ? ? ? 17 polymer nat 'Cytochrome b559 subunit alpha' 9312.598 2 ? ? ? ? 18 polymer nat 'Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic' 27405.008 18 ? ? ? ? 19 polymer nat 'Chlorophyll a-b binding protein, chloroplastic' 30742.830 2 ? ? ? ? 20 polymer nat 'Photosystem II CP43 reaction center protein' 50680.738 2 ? ? ? ? 21 polymer nat 'Photosystem II CP47 reaction center protein' 56159.820 2 ? ? ? ? 22 non-polymer syn 'CHLOROPHYLL A' 893.489 252 ? ? ? ? 23 non-polymer syn "(3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL" 568.871 30 ? ? ? ? 24 non-polymer syn ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; 600.870 20 ? ? ? ? 25 non-polymer syn 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE 722.970 40 ? ? ? ? 26 non-polymer syn 'CHLOROPHYLL B' 907.472 122 ? ? ? ? 27 non-polymer syn ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; 600.870 16 ? ? ? ? 28 non-polymer syn 'FE (II) ION' 55.845 2 ? ? ? ? 29 non-polymer syn 'CHLORIDE ION' 35.453 4 ? ? ? ? 30 non-polymer syn 'PHEOPHYTIN A' 871.200 4 ? ? ? ? 31 non-polymer syn BETA-CAROTENE 536.873 22 ? ? ? ? 32 non-polymer syn '1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL' 795.116 8 ? ? ? ? 33 non-polymer syn ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; 749.201 4 ? ? ? ? 34 non-polymer syn 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE 787.158 14 ? ? ? ? 35 non-polymer syn 'BICARBONATE ION' 61.017 2 ? ? ? ? 36 non-polymer syn 'DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)' 949.299 10 ? ? ? ? 37 non-polymer syn 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' 616.487 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 Lhcbm4 2 'PSII D1 protein,32 kDa thylakoid membrane protein,Photosystem II Q(B) protein' 3 'PSII D2 protein,Photosystem Q(A) protein' 4 'PSII reaction center subunit VI' 5 'PSII-H,Photosystem II 8 kDa phosphoprotein' 6 'PSII-I,PSII 4.8 kDa protein' 8 PSII-K 9 PSII-L 10 PSII-M 12 PSII-T 13 'PSII 6.1 kDa protein' 15 PSII-Z 17 'PSII reaction center subunit V' 20 'PSII 43 kDa protein,Protein CP-43,Protein P6' 21 'PSII 47 kDa protein,Protein CP-47' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MVFKFPTPPGTQKKAGTTATKPAPKATTKKVATSTGTRSGGVGYRKYQGDALWLPNTTRPEWLDGSLPGDRGFDPLGLSK PSEFVVIGVDENDQNAAKNNKGSVEAIVQATPDEVSSENRLAPYSEVFGLARFRECELIHGRWAMLACLGALVAEATTGV SWVEAGKVELDGASYAGLSLPFSITQLIWIEVILVGGAEFYRNSETNPEKRCYPGGVFDPLKLASEDEERAFRLKTAEIK HARLAMVSFFGYGVQALSTGEGALGSLAKFADGLNNGKGL ; ;MVFKFPTPPGTQKKAGTTATKPAPKATTKKVATSTGTRSGGVGYRKYQGDALWLPNTTRPEWLDGSLPGDRGFDPLGLSK PSEFVVIGVDENDQNAAKNNKGSVEAIVQATPDEVSSENRLAPYSEVFGLARFRECELIHGRWAMLACLGALVAEATTGV SWVEAGKVELDGASYAGLSLPFSITQLIWIEVILVGGAEFYRNSETNPEKRCYPGGVFDPLKLASEDEERAFRLKTAEIK HARLAMVSFFGYGVQALSTGEGALGSLAKFADGLNNGKGL ; r,R ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MTAILERRENSSLWARFCEWITSTENRLYIGWFGVIMIPCLLTATSVFIIAFIAAPPVDIDGIREPVSGSLLYGNNIITG AVIPTSNAIGLHFYPIWEAASLDEWLYNGGPYQLIVCHFLLGVYCYMGREWELSFRLGMRPWIAVAYSAPVAAASAVFLV YPIGQGSFSDGMPLGISGTFNFMIVFQAEHNILMHPFHMLGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLIRETTENESANEGYRFG QEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRSLHFFLAAWPVIGIWFTALGLSTMAFNLNGFNFNQSVVDSQGRVLNTWADI INRANLGMEVMHERNAHNFPLDLASTNSSSNN ; ;MTAILERRENSSLWARFCEWITSTENRLYIGWFGVIMIPCLLTATSVFIIAFIAAPPVDIDGIREPVSGSLLYGNNIITG AVIPTSNAIGLHFYPIWEAASLDEWLYNGGPYQLIVCHFLLGVYCYMGREWELSFRLGMRPWIAVAYSAPVAAASAVFLV YPIGQGSFSDGMPLGISGTFNFMIVFQAEHNILMHPFHMLGVAGVFGGSLFSAMHGSLVTSSLIRETTENESANEGYRFG QEEETYNIVAAHGYFGRLIFQYASFNNSRSLHFFLAAWPVIGIWFTALGLSTMAFNLNGFNFNQSVVDSQGRVLNTWADI INRANLGMEVMHERNAHNFPLDLASTNSSSNN ; a,A ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MTIAIGTYQEKRTWFDDADDWLRQDRFVFVGWSGLLLFPCAYFALGGWLTGTTFVTSWYTHGLATSYLEGCNFLTAAVST PANSMAHSLLFVWGPEAQGDFTRWCQLGGLWAFVALHGAFGLIGFMLRQFEIARSVNLRPYNAIAFSAPIAVFVSVFLIY PLGQSGWFFAPSFGVAAIFRFILFFQGFHNWTLNPFHMMGVAGVLGAALLCAIHGATVENTLFEDGDGANTFRAFNPTQA EETYSMVTANRFWSQIFGVAFSNKRWLHFFMLLVPVTGLWMSAIGVVGLALNLRAYDFVSQEIRAAEDPEFETFYTKNIL LNEGIRAWMAAQDQPHERLVFPEEVLPRGNAL ; ;MTIAIGTYQEKRTWFDDADDWLRQDRFVFVGWSGLLLFPCAYFALGGWLTGTTFVTSWYTHGLATSYLEGCNFLTAAVST PANSMAHSLLFVWGPEAQGDFTRWCQLGGLWAFVALHGAFGLIGFMLRQFEIARSVNLRPYNAIAFSAPIAVFVSVFLIY PLGQSGWFFAPSFGVAAIFRFILFFQGFHNWTLNPFHMMGVAGVLGAALLCAIHGATVENTLFEDGDGANTFRAFNPTQA EETYSMVTANRFWSQIFGVAFSNKRWLHFFMLLVPVTGLWMSAIGVVGLALNLRAYDFVSQEIRAAEDPEFETFYTKNIL LNEGIRAWMAAQDQPHERLVFPEEVLPRGNAL ; d,D ? 4 'polypeptide(L)' no no MTTKKSAEVLVYPIFTVRWLAIHGIAVPTIFFLGAITAMQFIQR MTTKKSAEVLVYPIFTVRWLAIHGIAVPTIFFLGAITAMQFIQR f,F ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MATGTSKAKPSKVNSDFQEPGLVTPLGTLLRPLNSEAGKVLPGWGTTVLMAVFILLFAAFLLIILEIYNSSLILDDVSMS WETLAKVS ; ;MATGTSKAKPSKVNSDFQEPGLVTPLGTLLRPLNSEAGKVLPGWGTTVLMAVFILLFAAFLLIILEIYNSSLILDDVSMS WETLAKVS ; h,H ? 6 'polypeptide(L)' no no MLTLKIFVYTVVTFFVCLFIFGFLSNDPARNPGKNLD MLTLKIFVYTVVTFFVCLFIFGFLSNDPARNPGKNLD i,I ? 7 'polypeptide(L)' no no MSNTGTTGRIPLWLVGTEEGTLAIGAISCFFYGFLCWFRFFSIIKFKFFV MSNTGTTGRIPLWLVGTEEGTLAIGAISCFFYGFLCWFRFFSIIKFKFFV j,J ? 8 'polypeptide(L)' no no MTTLALVLAKLPEAYAPFAPIVDVLPVIPVFFILLAFVWQAAVSFR MTTLALVLAKLPEAYAPFAPIVDVLPVIPVFFILLAFVWQAAVSFR k,K ? 9 'polypeptide(L)' no no MARPNPNKQVVELNRTSLYWGLLLIFVLAVLFSSYIFN MARPNPNKQVVELNRTSLYWGLLLIFVLAVLFSSYIFN l,L ? 10 'polypeptide(L)' no no MEVNIYGLTATALFIIIPTSFLLILYVKTASTQD MEVNIYGLTATALFIIIPTSFLLILYVKTASTQD m,M ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MALRAAQSAKAGVRAARPNRATAVVCKAQKVGQAAAAAALATAMVAGSANALTFDEIQGLTYLQVKGSGIANTCPVLESG TTNLKELKAGSYKLENFCIEPTSFTVKEESQFKGGETEFVKTKLMTRLTYTLDAMSGSFKVGSDGSAELKEDDGIDYAAT TVQLPGGERVAFLFTIKQFDGKGTLDNIKGDFLVPSYRGSSFLDPKGRGGSTGYDNAVALPARADAEELLKENVKITKAL KGSAVFSVAKVDPVTGEIAGVFESIQPSDTDLGAKPPKDIKVTGLWYAQLK ; ;MALRAAQSAKAGVRAARPNRATAVVCKAQKVGQAAAAAALATAMVAGSANALTFDEIQGLTYLQVKGSGIANTCPVLESG TTNLKELKAGSYKLENFCIEPTSFTVKEESQFKGGETEFVKTKLMTRLTYTLDAMSGSFKVGSDGSAELKEDDGIDYAAT TVQLPGGERVAFLFTIKQFDGKGTLDNIKGDFLVPSYRGSSFLDPKGRGGSTGYDNAVALPARADAEELLKENVKITKAL KGSAVFSVAKVDPVTGEIAGVFESIQPSDTDLGAKPPKDIKVTGLWYAQLK ; o,O ? 12 'polypeptide(L)' no no MEALVYTFLLVGTLGIIFFSIFFRDPPRMIK MEALVYTFLLVGTLGIIFFSIFFRDPPRMIK t,T ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MQALSARAPRVAAKPVSRSGARSAVTVVCKATTVRSEVAKKVAMLSTLPATLAAHPAFALVDERMNGDGTGRPFGVNDPV LGWVLLGVFGTMWAIWFIGQKDLGDFEDADDGLKL ; ;MQALSARAPRVAAKPVSRSGARSAVTVVCKATTVRSEVAKKVAMLSTLPATLAAHPAFALVDERMNGDGTGRPFGVNDPV LGWVLLGVFGTMWAIWFIGQKDLGDFEDADDGLKL ; w,W ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MAAVCVSSKAVAVRPATRVASRPAARMVVRASAKPAQISEKAIAAGVSAAAAASLALAPIAEAAVTPSLKNFLGSLIAGA TVLGGIALAITAVSKFDKTIR ; ;MAAVCVSSKAVAVRPATRVASRPAARMVVRASAKPAQISEKAIAAGVSAAAAASLALAPIAEAAVTPSLKNFLGSLIAGA TVLGGIALAITAVSKFDKTIR ; x,X ? 15 'polypeptide(L)' no no MTSILQVALLALIFVSFALVVGVPVVFATPNGWTDNKGAVFSGLSLWLLLVFVVGILNSFVV MTSILQVALLALIFVSFALVVGVPVVFATPNGWTDNKGAVFSGLSLWLLLVFVVGILNSFVV z,Z ? 16 'polypeptide(L)' no no MNIELALTLVSLVLVVSAGPLVVVLLSARGGNL MNIELALTLVSLVLVVSAGPLVVVLLSARGGNL Y,y ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MAGKPVERPFSDILTSIRYWVIHSITVPALFIAGWLFVSTGLAYDVFGTPRPNEYFTEDRQEAPLITDRFNALEQVKKLS GN ; ;MAGKPVERPFSDILTSIRYWVIHSITVPALFIAGWLFVSTGLAYDVFGTPRPNEYFTEDRQEAPLITDRFNALEQVKKLS GN ; E,e ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MAFALSFSRKALQVSAKATGKKGTGKTAAKQAPASSGIEFYGPNRAKWLGPYSENATPAYLTGEFPGDYGWDTAGLSADP ETFKRYRELELIHARWAMLGALGCITPELLAKSGTQFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQNIVATLAVQVILM GLVEGYRVNGGPAGEGLDPLYPGESFDPLGLADDPDTFAELKVKEIKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIQNLDDHLSN PTVNNAFAFATKFTPSA ; ;MAFALSFSRKALQVSAKATGKKGTGKTAAKQAPASSGIEFYGPNRAKWLGPYSENATPAYLTGEFPGDYGWDTAGLSADP ETFKRYRELELIHARWAMLGALGCITPELLAKSGTQFGEAVWFKAGAQIFSEGGLDYLGNPSLVHAQNIVATLAVQVILM GLVEGYRVNGGPAGEGLDPLYPGESFDPLGLADDPDTFAELKVKEIKNGRLAMFSMFGFFVQAIVTGKGPIQNLDDHLSN PTVNNAFAFATKFTPSA ; 1,2,3,4,5,6,v,p,q,V,P,Q,U,N,G,u,n,g ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MQIQALFKKTGASAPAKKGTASTKVVKPSKAGGKATRGWLGGQGGAADLDKWYGPDRKLFLPSGLYDRSEIPEYLNGELA GDYGYDPLGLGKDPETVAKYRENELLHARWAMLAAAGILIPEGLQANGANIKGGTWFETGAEMLNGGTLNYFAVPWGIVS NPLPLFAVIAVEVGLMGAVEFYRRNGTGPAGYSPGIGKFDSSVFDGLDPLYPGGPFDPLGLADDPEVLQELKVKEIKNGR LAMVSVLGFAVQSYVTGEGPYANWTKHVADPFGYNLLTVLGAEERTPTL ; ;MQIQALFKKTGASAPAKKGTASTKVVKPSKAGGKATRGWLGGQGGAADLDKWYGPDRKLFLPSGLYDRSEIPEYLNGELA GDYGYDPLGLGKDPETVAKYRENELLHARWAMLAAAGILIPEGLQANGANIKGGTWFETGAEMLNGGTLNYFAVPWGIVS NPLPLFAVIAVEVGLMGAVEFYRRNGTGPAGYSPGIGKFDSSVFDGLDPLYPGGPFDPLGLADDPEVLQELKVKEIKNGR LAMVSVLGFAVQSYVTGEGPYANWTKHVADPFGYNLLTVLGAEERTPTL ; S,s ? 20 'polypeptide(L)' no no ;METLFNGTLTVGGRDQETTGFAWWSGNARLINLSGKLLGAHVAHAGLIVFWAGAMNLFEVSHFVPEKPMYEQGLILLPHI ATLGYGVGPGGEIIDTFPYFVSGVLHLISSAVLGFGGVYHSLIGPETLEESYPFFGYVWKDKNKMTNILGYHLIMLGLGA WLLVWKAMYFGGVYDTWAPGGGDVRVITNPTTNAAVIFGYLVKSPFGGDGWICSVDNMEDIIGGHIWIGTLEILGGIWHI YTTPWPWARRAFVWSGEAYLSYSLGAIGVMGFIACCMSWFNNTAYPSEFYGPTGPEASQSQAFTFLVRDQRLGANVASAQ GPTGLGKYLMRSPTGEIIFGGETMRFWDFRGPWLEPLRGPNGLDLNKLKNDIQPWQERRAAEYMTHAPLGSLNSVGGVAT EINAVNFVSPRSWLACSHFCLGFFFFIGHLWHAGRARAAAAGFEKGIDRFDEPVLSMRPLD ; ;METLFNGTLTVGGRDQETTGFAWWSGNARLINLSGKLLGAHVAHAGLIVFWAGAMNLFEVSHFVPEKPMYEQGLILLPHI ATLGYGVGPGGEIIDTFPYFVSGVLHLISSAVLGFGGVYHSLIGPETLEESYPFFGYVWKDKNKMTNILGYHLIMLGLGA WLLVWKAMYFGGVYDTWAPGGGDVRVITNPTTNAAVIFGYLVKSPFGGDGWICSVDNMEDIIGGHIWIGTLEILGGIWHI YTTPWPWARRAFVWSGEAYLSYSLGAIGVMGFIACCMSWFNNTAYPSEFYGPTGPEASQSQAFTFLVRDQRLGANVASAQ GPTGLGKYLMRSPTGEIIFGGETMRFWDFRGPWLEPLRGPNGLDLNKLKNDIQPWQERRAAEYMTHAPLGSLNSVGGVAT EINAVNFVSPRSWLACSHFCLGFFFFIGHLWHAGRARAAAAGFEKGIDRFDEPVLSMRPLD ; C,c ? 21 'polypeptide(L)' no no ;MGLPWYRVHTVVINDPGRLISVHLMHTALVSGWAGSMALFEISVFDPSDPVLNPMWRQGMFVLPFMTRLGITQSWGGWTI SGETATNPGIWSYEGVAAAHIILSGALFLASVWHWTYWDLELFRDPRTGKTALDLPKIFGIHLFLSGLLCFGFGAFHVTG VFGPGIWVSDPYGLTGRVQPVAPSWGADGFDPYNPGGIASHHIAAGILGVLAGLFHLCVRPSIRLYFGLSMGSIETVLSS 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20 ;METLFNGTLTVGGRDQETTGFAWWSGNARLINLSGKLLGAHVAHAGLIVFWAGAMNLFEVSHFVPEKPMYEQGLILLPHI ATLGYGVGPGGEIIDTFPYFVSGVLHLISSAVLGFGGVYHSLIGPETLEESYPFFGYVWKDKNKMTNILGYHLIMLGLGA WLLVWKAMYFGGVYDTWAPGGGDVRVITNPTTNAAVIFGYLVKSPFGGDGWICSVDNMEDIIGGHIWIGTLEILGGIWHI YTTPWPWARRAFVWSGEAYLSYSLGAIGVMGFIACCMSWFNNTAYPSEFYGPTGPEASQSQAFTFLVRDQRLGANVASAQ GPTGLGKYLMRSPTGEIIFGGETMRFWDFRGPWLEPLRGPNGLDLNKLKNDIQPWQERRAAEYMTHAPLGSLNSVGGVAT EINAVNFVSPRSWLACSHFCLGFFFFIGHLWHAGRARAAAAGFEKGIDRFDEPVLSMRPLD ; 1 21 UNP PSBB_CHLRE P37255 ? 21 ;MGLPWYRVHTVVINDPGRLISVHLMHTALVSGWAGSMALFEISVFDPSDPVLNPMWRQGMFVLPFMTRLGITQSWGGWTI SGETATNPGIWSYEGVAAAHIILSGALFLASVWHWTYWDLELFRDPRTGKTALDLPKIFGIHLFLSGLLCFGFGAFHVTG VFGPGIWVSDPYGLTGRVQPVAPSWGADGFDPYNPGGIASHHIAAGILGVLAGLFHLCVRPSIRLYFGLSMGSIETVLSS SIAAVFWAAFVVAGTMWYGSAATPIELFGPTRYQWDQGFFQQEIQKRVQASLAEGASLSDAWSRIPEKLAFYDYIGNNPA KGGLFRTGAMNSGDGIAVGWLGHASFKDQEGRELFVRRMPTFFETFPVLLLDKDGIVRADVPFRKAESKYSIEQVGVSVT FYGGELDGLTFTDPATVKKYARKAQLGEIFEFDRSTLQSDGVFRSSPRGWFTFGHVCFALLFFFGHIWHGARTIFRDVFA GIDDDINDQVEFGKYKKLGDTSSLREAF ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6KAF r 1 ? 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Q93WL4 1 ? 257 ? -7 249 46 18 6KAF n 1 ? 257 ? Q93WL4 1 ? 257 ? -7 249 47 18 6KAF g 1 ? 257 ? Q93WL4 1 ? 257 ? -7 249 48 1 6KAF R 1 ? 280 ? Q93WD2 1 ? 280 ? -38 241 49 19 6KAF S 1 ? 289 ? Q9FEK6 1 ? 289 ? 1 289 50 20 6KAF C 1 ? 461 ? P10898 1 ? 461 ? 1 461 51 21 6KAF B 1 ? 508 ? P37255 1 ? 508 ? 1 508 52 11 6KAF O 1 ? 291 ? A8J0E4 1 ? 291 ? 1 291 53 3 6KAF D 1 ? 352 ? P06007 1 ? 352 ? 1 352 54 14 6KAF X 1 ? 101 ? A8I846 1 ? 101 ? 1 101 55 21 6KAF b 1 ? 508 ? P37255 1 ? 508 ? 1 508 56 17 6KAF e 1 ? 82 ? P48268 1 ? 82 ? 1 82 57 20 6KAF c 1 ? 461 ? P10898 1 ? 461 ? 1 461 58 19 6KAF s 1 ? 289 ? Q9FEK6 1 ? 289 ? 1 289 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BCR non-polymer . BETA-CAROTENE ? 'C40 H56' 536.873 BCT non-polymer . 'BICARBONATE ION' ? 'C H O3 -1' 61.017 CHL non-polymer . 'CHLOROPHYLL B' ? 'C55 H70 Mg N4 O6 2' 907.472 CL non-polymer . 'CHLORIDE ION' ? 'Cl -1' 35.453 CLA non-polymer . 'CHLOROPHYLL A' ? 'C55 H72 Mg N4 O5 2' 893.489 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DGD saccharide . 'DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)' ? 'C51 H96 O15' 949.299 FE2 non-polymer . 'FE (II) ION' ? 'Fe 2' 55.845 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HEM non-polymer . 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' HEME 'C34 H32 Fe N4 O4' 616.487 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LHG non-polymer . 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE ? 'C38 H75 O10 P' 722.970 LMG non-polymer . 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE ? 'C45 H86 O10' 787.158 LUT non-polymer . "(3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL" ;(3R,3'R)-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL, LUTEIN ; 'C40 H56 O2' 568.871 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NEX non-polymer . ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; ;(3S,5R,6R,3'S,5'R,6'S)-5',6'-EPOXY-6,7-DIDEHYDRO- 5,6,5',6'-TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,5,3'-TRIOL, 9'-CIS-NEOXANTHIN ; 'C40 H56 O4' 600.870 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PHO non-polymer . 'PHEOPHYTIN A' ? 'C55 H74 N4 O5' 871.200 PL9 non-polymer . ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; 'PLASTOQUINONE 9' 'C53 H80 O2' 749.201 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SQD non-polymer . '1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL' SULFOQUINOVOSYLDIACYLGLYCEROL 'C41 H78 O12 S' 795.116 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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TI N N 26 ? UI N N 26 ? VI N N 27 ? WI N N 27 ? XI N N 22 ? YI N N 22 ? ZI N N 22 ? AJ N N 22 ? BJ N N 22 ? CJ N N 22 ? DJ N N 22 ? EJ N N 22 ? FJ N N 23 ? GJ N N 23 ? HJ N N 24 ? IJ N N 25 ? JJ N N 26 ? KJ N N 26 ? LJ N N 26 ? MJ N N 26 ? NJ N N 26 ? OJ N N 26 ? PJ N N 26 ? QJ N N 22 ? RJ N N 22 ? SJ N N 22 ? TJ N N 22 ? UJ N N 22 ? VJ N N 22 ? WJ N N 22 ? XJ N N 22 ? YJ N N 24 ? ZJ N N 25 ? AK N N 26 ? BK N N 26 ? CK N N 26 ? DK N N 26 ? EK N N 26 ? FK N N 22 ? GK N N 22 ? HK N N 22 ? IK N N 22 ? JK N N 22 ? KK N N 22 ? LK N N 22 ? MK N N 22 ? NK N N 23 ? OK N N 23 ? PK N N 24 ? QK N N 25 ? RK N N 26 ? SK N N 26 ? TK N N 26 ? UK N N 26 ? VK N N 26 ? WK N N 26 ? XK N N 27 ? YK N N 27 ? ZK N N 22 ? AL N N 22 ? BL N N 22 ? CL N N 22 ? DL N N 22 ? EL N N 22 ? FL N N 22 ? GL N N 22 ? HL N N 23 ? IL N N 23 ? JL N N 24 ? KL N N 25 ? LL N N 26 ? ML N N 26 ? NL N N 26 ? OL N N 26 ? PL N N 26 ? QL N N 26 ? RL N N 22 ? SL N N 22 ? TL N N 22 ? UL N N 22 ? VL N N 22 ? WL N N 22 ? XL N N 22 ? 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ALA b 329 GLY b 335 1 ? 7 HELX_P HELX_P312 BI6 SER CB 391 ? GLY CB 396 ? SER b 391 GLY b 396 1 ? 6 HELX_P HELX_P313 BI7 ASP CB 413 ? GLN CB 425 ? ASP b 413 GLN b 425 1 ? 13 HELX_P HELX_P314 BI8 SER CB 446 ? PHE CB 475 ? SER b 446 PHE b 475 1 ? 30 HELX_P HELX_P315 BI9 TRP DB 20 ? THR DB 40 ? TRP e 20 THR e 40 1 ? 21 HELX_P HELX_P316 BJ1 GLY DB 41 ? GLY DB 48 ? GLY e 41 GLY e 48 1 ? 8 HELX_P HELX_P317 BJ2 ASN DB 71 ? SER DB 80 ? ASN e 71 SER e 80 1 ? 10 HELX_P HELX_P318 BJ3 ALA EB 22 ? ILE EB 31 ? ALA c 22 ILE c 31 5 ? 10 HELX_P HELX_P319 BJ4 LEU EB 33 ? HIS EB 62 ? LEU c 33 HIS c 62 1 ? 30 HELX_P HELX_P320 BJ5 PRO EB 68 ? GLN EB 72 ? PRO c 68 GLN c 72 5 ? 5 HELX_P HELX_P321 BJ6 LEU EB 76 ? GLY EB 84 ? LEU c 76 GLY c 84 1 ? 9 HELX_P HELX_P322 BJ7 GLY EB 88 ? GLU EB 92 ? GLY c 88 GLU c 92 5 ? 5 HELX_P HELX_P323 BJ8 THR EB 96 ? ILE EB 123 ? THR c 96 ILE c 123 1 ? 28 HELX_P HELX_P324 BJ9 ASP EB 141 ? TYR EB 169 ? ASP c 141 TYR c 169 1 ? 29 HELX_P HELX_P325 BK1 ASN EB 193 ? LEU EB 201 ? ASN c 193 LEU c 201 1 ? 9 HELX_P HELX_P326 BK2 TRP EB 211 ? VAL EB 215 ? TRP c 211 VAL c 215 5 ? 5 HELX_P HELX_P327 BK3 ASN EB 217 ? THR EB 242 ? ASN c 217 THR c 242 1 ? 26 HELX_P HELX_P328 BK4 TRP EB 245 ? ARG EB 250 ? TRP c 245 ARG c 250 1 ? 6 HELX_P HELX_P329 BK5 SER EB 255 ? ASN EB 281 ? SER c 255 ASN c 281 1 ? 27 HELX_P HELX_P330 BK6 PRO EB 286 ? GLY EB 291 ? PRO c 286 GLY c 291 1 ? 6 HELX_P HELX_P331 BK7 THR EB 293 ? ARG EB 311 ? THR c 293 ARG c 311 1 ? 19 HELX_P HELX_P332 BK8 GLU EB 342 ? PHE EB 346 ? GLU c 342 PHE c 346 5 ? 5 HELX_P HELX_P333 BK9 LEU EB 354 ? ARG EB 358 ? LEU c 354 ARG c 358 5 ? 5 HELX_P HELX_P334 BL1 ASP EB 364 ? ASP EB 371 ? ASP c 364 ASP c 371 1 ? 8 HELX_P HELX_P335 BL2 GLN EB 373 ? MET EB 384 ? GLN c 373 MET c 384 1 ? 12 HELX_P HELX_P336 BL3 SER EB 409 ? GLY EB 442 ? SER c 409 GLY c 442 1 ? 34 HELX_P HELX_P337 BL4 ASP FB 93 ? ILE FB 118 ? ASP s 93 ILE s 118 1 ? 26 HELX_P HELX_P338 BL5 LEU FB 119 ? ALA FB 126 ? LEU s 119 ALA s 126 1 ? 8 HELX_P HELX_P339 BL6 THR FB 139 ? MET FB 143 ? THR s 139 MET s 143 5 ? 5 HELX_P HELX_P340 BL7 LEU FB 165 ? ASN FB 185 ? LEU s 165 ASN s 185 1 ? 21 HELX_P HELX_P341 BL8 ASP FB 224 ? THR FB 256 ? ASP s 224 THR s 256 1 ? 33 HELX_P HELX_P342 BL9 GLY FB 259 ? VAL FB 268 ? GLY s 259 VAL s 268 1 ? 10 HELX_P HELX_P343 BM1 ASN FB 275 ? LEU FB 280 ? ASN s 275 LEU s 280 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale1 covale none ? A TRP 53 CH2 ? ? ? 1_555 XB NEX . O4 ? ? r TRP 14 r NEX 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.377 ? covale2 covale none ? A LEU 180 CD2 ? ? ? 1_555 YB CHL . O1A ? ? r LEU 141 r CHL 619 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.376 ? covale3 covale none ? A HIS 241 CE1 ? ? ? 1_555 MB CLA . OBD ? ? r HIS 202 r CLA 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.378 ? covale4 covale none ? A SER 248 OG ? ? ? 1_555 QB LUT . C18 ? ? r SER 209 r LUT 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.377 ? metalc1 metalc ? ? B HIS 215 NE2 ? ? ? 1_555 ZB FE2 . FE ? ? a HIS 215 a FE2 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? metalc2 metalc ? ? B HIS 272 NE2 ? ? ? 1_555 ZB FE2 . FE ? ? a HIS 272 a FE2 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.799 ? covale5 covale none ? B PHE 273 CE1 ? ? ? 1_555 NC LHG . C7 ? ? a PHE 273 a LHG 415 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.505 ? covale6 covale none ? C LEU 49 CD1 ? ? ? 1_555 RC BCR . C16 ? ? d LEU 49 d BCR 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale7 covale none ? C ASN 72 ND2 ? ? ? 1_555 VC LMG . O3 ? ? d ASN 72 d LMG 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.298 ? covale8 covale none ? C PHE 73 CB ? ? ? 1_555 VC LMG . O9 ? ? d PHE 73 d LMG 407 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? covale9 covale none ? C GLN 186 OE1 ? ? ? 1_555 QC CLA . CBC ? ? d GLN 186 d CLA 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? covale10 covale none ? C PHE 261 CE1 ? ? ? 1_555 UC LHG . O9 ? ? d PHE 261 d LHG 406 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? covale11 covale none ? C PHE 269 CE2 ? ? ? 1_555 TC LHG . O1 ? ? d PHE 269 d LHG 405 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale12 covale none ? D ILE 22 CD1 ? ? ? 1_555 XU HEM . O1D ? ? f ILE 22 e HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? metalc3 metalc ? ? D HIS 23 NE2 ? ? ? 1_555 XU HEM . FE ? ? f HIS 23 e HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.178 ? covale13 covale none ? D HIS 23 NE2 ? ? ? 1_555 XU HEM . NA ? ? f HIS 23 e HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.356 ? covale14 covale none ? H ILE 33 CD1 ? ? ? 1_555 IV CLA . C20 ? ? k ILE 33 c CLA 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? covale15 covale none ? I LYS 8 NZ ? ? ? 1_555 YC SQD . O4 ? ? l LYS 8 l SQD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.298 ? covale16 covale none ? N ALA 80 CB ? ? ? 1_555 CD CLA . C15 ? ? x ALA 80 x CLA 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? metalc4 metalc ? ? Q HIS 215 NE2 ? ? ? 1_555 FD FE2 . FE ? ? A HIS 215 A FE2 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.744 ? covale17 covale none ? Q PHE 273 CE1 ? ? ? 1_555 RD LHG . C7 ? ? A PHE 273 A LHG 413 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.504 ? covale18 covale none ? R ARG 18 NH2 ? ? ? 1_555 TD HEM . O1A ? ? E ARG 18 E HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.297 ? covale19 covale none ? S ILE 22 CD1 ? ? ? 1_555 TD HEM . O1D ? ? F ILE 22 E HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? metalc5 metalc ? ? S HIS 23 NE2 ? ? ? 1_555 TD HEM . FE ? ? F HIS 23 E HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.177 ? covale20 covale none ? S HIS 23 NE2 ? ? ? 1_555 TD HEM . NA ? ? F HIS 23 E HEM 101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.356 ? covale21 covale none ? W ILE 33 CD1 ? ? ? 1_555 ES CLA . C20 ? ? K ILE 33 C CLA 512 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.492 ? covale22 covale none ? X LYS 8 NZ ? ? ? 1_555 XD SQD . O4 ? ? L LYS 8 L SQD 102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.298 ? covale23 covale none ? DA TRP 96 CE2 ? ? ? 1_555 RE CHL . CED ? ? 1 TRP 88 1 CHL 317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? metalc6 metalc ? ? EA TRP 48 O ? ? ? 1_555 FF CHL . MG ? ? 2 TRP 40 2 CHL 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.126 ? covale24 covale none ? EA TRP 48 O ? ? ? 1_555 FF CHL . NC ? ? 2 TRP 40 2 CHL 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.306 ? covale25 covale none ? EA LEU 49 O ? ? ? 1_555 FF CHL . CHC ? ? 2 LEU 41 2 CHL 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale26 covale none ? EA GLU 205 OE1 ? ? ? 1_555 WE CLA . CMA ? ? 2 GLU 197 2 CLA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.380 ? covale27 covale none ? EA LYS 207 CE ? ? ? 1_555 XE CLA . C3D ? ? 2 LYS 199 2 CLA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale28 covale none ? FA TYR 181 CB ? ? ? 1_555 PF CLA . O1D ? ? 3 TYR 173 3 CLA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale29 covale none ? FA PRO 182 CG ? ? ? 1_555 AG CHL . CBC ? ? 3 PRO 174 3 CHL 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale30 covale one ? FA GLY 183 N ? ? ? 1_555 PF CLA . OBD ? ? 3 GLY 175 3 CLA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.303 ? covale31 covale none ? GA TRP 96 CE2 ? ? ? 1_555 RG CHL . CED ? ? 4 TRP 88 4 CHL 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? metalc7 metalc ? ? HA TRP 48 O ? ? ? 1_555 FH CHL . MG ? ? 5 TRP 40 5 CHL 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.292 ? covale32 covale none ? HA TRP 48 O ? ? ? 1_555 FH CHL . NC ? ? 5 TRP 40 5 CHL 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.309 ? covale33 covale none ? HA LEU 49 O ? ? ? 1_555 FH CHL . CHC ? ? 5 LEU 41 5 CHL 313 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.372 ? covale34 covale none ? HA GLU 205 OE1 ? ? ? 1_555 WG CLA . CMA ? ? 5 GLU 197 5 CLA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.379 ? covale35 covale none ? HA LYS 207 CE ? ? ? 1_555 XG CLA . C3D ? ? 5 LYS 199 5 CLA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.510 ? covale36 covale none ? IA TYR 181 CB ? ? ? 1_555 QH CLA . O1D ? ? 6 TYR 173 6 CLA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.373 ? covale37 covale none ? IA PRO 182 CG ? ? ? 1_555 BI CHL . CBC ? ? 6 PRO 174 6 CHL 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale38 covale one ? IA GLY 183 N ? ? ? 1_555 QH CLA . OBD ? ? 6 GLY 175 6 CLA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.301 ? covale39 covale none ? JA TRP 96 CE2 ? ? ? 1_555 TI CHL . CED ? ? v TRP 88 v CHL 317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.496 ? metalc8 metalc ? ? KA TRP 48 O ? ? ? 1_555 JJ CHL . MG ? ? p TRP 40 p CHL 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.271 ? covale40 covale none ? KA TRP 48 O ? ? ? 1_555 JJ CHL . NC ? ? p TRP 40 p CHL 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.307 ? covale41 covale none ? KA LEU 49 O ? ? ? 1_555 JJ CHL . CHC ? ? p LEU 41 p CHL 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? covale42 covale none ? KA PRO 188 O ? ? ? 1_555 WI NEX . C2 ? ? p PRO 180 p NEX 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.377 ? covale43 covale none ? KA GLU 205 OE1 ? ? ? 1_555 AJ CLA . CMA ? ? p GLU 197 p CLA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.379 ? covale44 covale none ? KA LYS 207 CE ? ? ? 1_555 BJ CLA . C3D ? ? p LYS 199 p CLA 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.508 ? covale45 covale none ? LA TYR 181 CB ? ? ? 1_555 TJ CLA . O1D ? ? q TYR 173 q CLA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.376 ? covale46 covale none ? LA PRO 182 CG ? ? ? 1_555 DK CHL . CBC ? ? q PRO 174 q CHL 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? covale47 covale none ? LA GLY 183 CA ? ? ? 1_555 TJ CLA . OBD ? ? q GLY 175 q CLA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.377 ? covale48 covale none ? MA TRP 96 CE2 ? ? ? 1_555 VK CHL . CED ? ? V TRP 88 V CHL 317 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.494 ? metalc9 metalc ? ? NA TRP 48 O ? ? ? 1_555 LL CHL . MG ? ? P TRP 40 P CHL 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.308 ? covale49 covale none ? NA TRP 48 O ? ? ? 1_555 LL CHL . NC ? ? P TRP 40 P CHL 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.306 ? covale50 covale none ? NA LEU 49 O ? ? ? 1_555 LL CHL . CHC ? ? P LEU 41 P CHL 314 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.376 ? covale51 covale none ? NA PRO 188 O ? ? ? 1_555 YK NEX . C2 ? ? P PRO 180 P NEX 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? covale52 covale none ? NA GLU 205 OE1 ? ? ? 1_555 CL CLA . CMA ? ? P GLU 197 P CLA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.379 ? covale53 covale none ? NA LYS 207 CE ? ? ? 1_555 DL CLA . C3D ? ? P LYS 199 P CLA 306 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.507 ? covale54 covale none ? OA TYR 181 CB ? ? ? 1_555 UL CLA . O1D ? ? Q TYR 173 Q CLA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.376 ? covale55 covale none ? OA PRO 182 CG ? ? ? 1_555 FM CHL . CBC ? ? Q PRO 174 Q CHL 315 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.493 ? covale56 covale none ? OA GLY 183 CA ? ? ? 1_555 UL CLA . OBD ? ? Q GLY 175 Q CLA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.377 ? covale57 covale none ? PA TRP 96 CE2 ? ? ? 1_555 WM CHL . CED ? ? U TRP 88 U CHL 316 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.495 ? covale58 covale none ? QA GLU 205 OE1 ? ? ? 1_555 DN CLA . CMA ? ? N GLU 197 N CLA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.380 ? covale59 covale none ? QA LYS 207 CE ? ? ? 1_555 EN CLA . C3D ? ? N LYS 199 N CLA 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.509 ? covale60 covale none ? RA TYR 181 CB ? ? ? 1_555 VN CLA . O1D ? ? G TYR 173 G CLA 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? covale61 covale none ? RA PRO 182 CG ? ? ? 1_555 GO CHL . CBC ? ? 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WE 22 CLA 1 304 610 CLA CLA 2 . XE 22 CLA 1 305 611 CLA CLA 2 . YE 22 CLA 1 306 612 CLA CLA 2 . ZE 22 CLA 1 307 613 CLA CLA 2 . AF 22 CLA 1 308 614 CLA CLA 2 . BF 23 LUT 1 309 1620 LUT LUT 2 . CF 23 LUT 1 310 1621 LUT LUT 2 . DF 24 XAT 1 311 1622 XAT XAT 2 . EF 25 LHG 1 312 2630 LHG LHG 2 . FF 26 CHL 1 313 601 CHL CHL 2 . GF 26 CHL 1 314 605 CHL CHL 2 . HF 26 CHL 1 315 606 CHL CHL 2 . IF 26 CHL 1 316 607 CHL CHL 2 . JF 26 CHL 1 317 608 CHL CHL 2 . KF 26 CHL 1 318 609 CHL CHL 2 . LF 27 NEX 1 319 1623 NEX NEX 2 . MF 22 CLA 1 301 602 CLA CLA 3 . NF 22 CLA 1 302 603 CLA CLA 3 . OF 22 CLA 1 303 604 CLA CLA 3 . PF 22 CLA 1 304 610 CLA CLA 3 . QF 22 CLA 1 305 611 CLA CLA 3 . RF 22 CLA 1 306 612 CLA CLA 3 . SF 22 CLA 1 307 613 CLA CLA 3 . TF 22 CLA 1 308 614 CLA CLA 3 . UF 24 XAT 1 309 1622 XAT XAT 3 . VF 25 LHG 1 310 2630 LHG LHG 3 . WF 26 CHL 1 311 601 CHL CHL 3 . XF 26 CHL 1 312 605 CHL CHL 3 . YF 26 CHL 1 313 606 CHL CHL 3 . ZF 26 CHL 1 314 607 CHL CHL 3 . AG 26 CHL 1 315 608 CHL CHL 3 . 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? -84.45 41.49 85 1 GLN 4 139 ? ? -125.15 -163.96 86 1 ASN 4 140 ? ? 62.34 66.78 87 1 GLU 4 176 ? ? -128.94 -165.55 88 1 ASN 4 236 ? ? -99.59 57.92 89 1 ASN 4 237 ? ? -93.50 -76.16 90 1 ALA 4 238 ? ? -145.35 -25.49 91 1 PHE 4 241 ? ? -94.11 51.15 92 1 PHE 4 245 ? ? -93.55 53.56 93 1 GLU 5 46 ? ? 56.87 70.45 94 1 PRO 5 50 ? ? -68.37 82.56 95 1 SER 5 123 ? ? -65.52 -71.37 96 1 GLU 5 124 ? ? -120.47 -64.71 97 1 LEU 5 130 ? ? 67.76 -0.89 98 1 PRO 5 133 ? ? -84.50 45.16 99 1 LEU 5 135 ? ? -116.65 -169.21 100 1 GLN 5 139 ? ? -122.90 -164.73 101 1 ALA 5 184 ? ? -99.91 36.59 102 1 ALA 5 238 ? ? -140.06 -22.45 103 1 PHE 5 241 ? ? -94.95 53.49 104 1 LEU 6 41 ? ? 57.73 18.51 105 1 TYR 6 44 ? ? -117.69 52.50 106 1 SER 6 45 ? ? -83.12 30.33 107 1 GLU 6 124 ? ? -121.42 -58.00 108 1 PRO 6 133 ? ? -83.62 42.71 109 1 LEU 6 135 ? ? -117.35 -166.68 110 1 ASN 6 236 ? ? -93.13 54.12 111 1 ASN 6 237 ? ? -90.74 -74.48 112 1 ALA 6 238 ? ? -144.33 -24.19 113 1 PHE 6 241 ? ? -94.45 51.52 114 1 GLU v 56 ? ? 69.48 -5.07 115 1 GLU v 124 ? ? -130.03 -45.83 116 1 PRO v 133 ? ? -84.26 43.32 117 1 ASN v 140 ? ? 57.98 70.24 118 1 ASN v 236 ? ? -98.95 57.98 119 1 ASN v 237 ? ? -93.14 -73.93 120 1 ALA v 238 ? ? -143.09 -24.44 121 1 PHE v 241 ? ? -94.37 52.10 122 1 PHE v 245 ? ? -91.39 53.11 123 1 GLU p 46 ? ? 57.71 70.04 124 1 GLU p 56 ? ? 68.45 -5.84 125 1 GLU p 124 ? ? -121.85 -59.39 126 1 PRO p 133 ? ? -84.04 44.01 127 1 LEU p 135 ? ? -117.85 -163.16 128 1 VAL p 136 ? ? -28.14 -52.58 129 1 GLN p 139 ? ? -125.62 -166.60 130 1 LEU p 172 ? ? -93.57 -61.61 131 1 ASP p 179 ? ? -117.04 77.46 132 1 ALA p 238 ? ? -140.83 -25.38 133 1 PHE p 241 ? ? -94.26 52.94 134 1 LEU q 41 ? ? 59.14 9.10 135 1 TYR q 44 ? ? -98.07 41.29 136 1 SER q 45 ? ? -74.86 27.63 137 1 ALA q 48 ? ? -141.53 20.99 138 1 GLU q 56 ? ? 69.03 -5.71 139 1 TRP q 114 ? ? -65.40 2.20 140 1 SER q 123 ? ? -65.75 -70.64 141 1 GLU q 124 ? ? -122.82 -58.70 142 1 PRO q 133 ? ? -82.14 47.15 143 1 GLN q 139 ? ? -123.18 -168.16 144 1 ASN q 236 ? ? -93.34 54.06 145 1 ASN q 237 ? ? -81.19 -72.86 146 1 ALA q 238 ? ? -144.07 -15.86 147 1 PHE q 241 ? ? -95.07 53.48 148 1 PHE q 245 ? ? -92.78 58.79 149 1 GLU V 56 ? ? 69.49 -4.60 150 1 GLU V 124 ? ? -121.98 -57.96 151 1 PRO V 133 ? ? -83.96 44.26 152 1 ASN V 140 ? ? 57.99 70.69 153 1 GLU V 176 ? ? -129.63 -166.24 154 1 ASN V 236 ? ? -98.52 58.26 155 1 ASN V 237 ? ? -93.22 -73.62 156 1 ALA V 238 ? ? -143.33 -24.56 157 1 PHE V 241 ? ? -94.49 52.17 158 1 PHE V 245 ? ? -91.42 54.00 159 1 GLU P 46 ? ? 58.14 70.50 160 1 GLU P 56 ? ? 68.50 -6.00 161 1 PRO P 133 ? ? -84.27 44.17 162 1 LEU P 135 ? ? -117.63 -162.53 163 1 VAL P 136 ? ? -28.62 -51.62 164 1 GLN P 139 ? ? -125.00 -166.77 165 1 ASN P 140 ? ? 60.11 67.96 166 1 ASP P 179 ? ? -117.37 77.68 167 1 ALA P 184 ? ? -96.30 30.59 168 1 ALA P 238 ? ? -140.64 -24.24 169 1 PHE P 241 ? ? -94.63 53.05 170 1 TYR Q 44 ? ? -97.67 40.84 171 1 SER Q 45 ? ? -73.48 25.74 172 1 ALA Q 48 ? ? -143.85 27.99 173 1 GLU Q 56 ? ? 68.60 -5.76 174 1 TRP Q 63 ? ? -94.97 36.01 175 1 ASP Q 64 ? ? -91.76 49.85 176 1 TRP Q 114 ? ? -67.42 4.07 177 1 SER Q 123 ? ? -65.81 -70.15 178 1 GLU Q 124 ? ? -122.82 -57.87 179 1 PRO Q 133 ? ? -80.68 47.90 180 1 GLN Q 139 ? ? -115.88 -169.71 181 1 VAL Q 235 ? ? -123.91 -50.73 182 1 ASN Q 236 ? ? -94.54 53.41 183 1 ASN Q 237 ? ? -81.70 -73.06 184 1 ALA Q 238 ? ? -142.08 -22.51 185 1 PHE Q 241 ? ? -95.01 53.69 186 1 PHE Q 245 ? ? -92.43 58.80 187 1 ASN U 47 ? ? 58.76 16.98 188 1 ALA U 48 ? ? -173.86 149.01 189 1 GLU U 56 ? ? 65.73 -2.00 190 1 SER U 123 ? ? -64.61 -70.12 191 1 GLU U 124 ? ? -131.28 -42.05 192 1 PRO U 133 ? ? -81.12 45.19 193 1 LEU U 135 ? ? -102.02 -165.91 194 1 GLN U 139 ? ? -126.09 -164.87 195 1 ASN U 140 ? ? 61.61 67.76 196 1 ASN U 236 ? ? -94.28 49.38 197 1 ASN U 237 ? ? -85.43 -81.39 198 1 ALA U 238 ? ? -145.42 -24.06 199 1 PHE U 241 ? ? -94.23 49.93 200 1 PHE U 245 ? ? -90.70 50.57 201 1 SER N 123 ? ? -66.14 -71.87 202 1 GLU N 124 ? ? -124.14 -59.84 203 1 PRO N 133 ? ? -80.88 44.85 204 1 LEU N 135 ? ? -116.11 -167.17 205 1 GLN N 139 ? ? -123.43 -165.87 206 1 ASN N 140 ? ? 60.00 70.77 207 1 ALA N 184 ? ? -95.83 31.12 208 1 ALA N 238 ? ? -145.63 -24.94 209 1 PHE N 241 ? ? -93.52 51.76 210 1 PHE N 245 ? ? -90.85 51.34 211 1 GLU G 56 ? ? 67.11 -1.81 212 1 ASP G 64 ? ? -94.74 51.41 213 1 PRO G 133 ? ? -84.23 46.15 214 1 LEU G 135 ? ? -116.53 -165.69 215 1 TYR G 173 ? ? -156.70 87.49 216 1 ASN G 237 ? ? -93.19 -76.60 217 1 ALA G 238 ? ? -145.77 -24.11 218 1 PHE G 241 ? ? -93.97 50.92 219 1 PHE G 245 ? ? -94.34 51.76 220 1 SER u 45 ? ? -94.56 51.52 221 1 GLU u 46 ? ? 64.35 -2.59 222 1 ALA u 48 ? ? -172.27 141.50 223 1 GLU u 56 ? ? 65.68 -2.36 224 1 GLU u 124 ? ? -131.25 -42.21 225 1 PRO u 133 ? ? -81.19 45.45 226 1 GLN u 139 ? ? -127.02 -166.23 227 1 ASN u 140 ? ? 61.39 69.17 228 1 GLU u 176 ? ? -149.49 -157.04 229 1 ASN u 236 ? ? -94.63 48.91 230 1 ASN u 237 ? ? -84.93 -81.23 231 1 ALA u 238 ? ? -145.25 -24.08 232 1 PHE u 241 ? ? -94.41 49.92 233 1 PHE u 245 ? ? -90.67 52.12 234 1 GLU n 56 ? ? 68.78 -2.05 235 1 SER n 123 ? ? -65.67 -72.43 236 1 GLU n 124 ? ? -125.69 -61.02 237 1 PRO n 133 ? ? -77.79 47.80 238 1 GLN n 139 ? ? -125.33 -160.96 239 1 ASN n 140 ? ? 62.52 69.83 240 1 ALA n 238 ? ? -146.30 -25.08 241 1 PHE n 241 ? ? -94.06 51.82 242 1 ASN g 36 ? ? -97.55 34.25 243 1 TRP g 40 ? ? -79.52 -169.46 244 1 ASN g 47 ? ? -79.46 46.81 245 1 ALA g 48 ? ? -143.73 44.71 246 1 GLU g 56 ? ? 66.36 -0.64 247 1 ASP g 64 ? ? -95.00 49.80 248 1 PRO g 133 ? ? -84.50 41.16 249 1 GLN g 139 ? ? -121.18 -168.62 250 1 TYR g 173 ? ? -153.11 84.54 251 1 VAL g 235 ? ? -124.83 -50.50 252 1 ASN g 237 ? ? -93.88 -76.74 253 1 ALA g 238 ? ? -145.77 -23.95 254 1 PHE g 241 ? ? -93.97 50.97 255 1 PHE g 245 ? ? -94.38 49.29 256 1 ASN R 61 ? ? -126.27 -169.34 257 1 LYS R 62 ? ? -122.50 -167.29 258 1 ALA R 83 ? ? 52.68 74.61 259 1 SER R 140 ? ? 61.35 66.93 260 1 ALA R 224 ? ? 68.10 -7.66 261 1 ASP S 56 ? ? -95.27 34.14 262 1 ASN S 76 ? ? 36.20 40.80 263 1 GLU S 78 ? ? 59.51 17.85 264 1 ASP S 86 ? ? -158.65 85.48 265 1 ALA S 141 ? ? -87.27 48.47 266 1 GLU S 142 ? ? -131.76 -30.56 267 1 ASN S 145 ? 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'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 22 'CHLOROPHYLL A' CLA 23 "(3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL" LUT 24 ;(3S,5R,6S,3'S,5'R,6'S)-5,6,5',6'-DIEPOXY-5,6,5',6'- TETRAHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL ; XAT 25 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE LHG 26 'CHLOROPHYLL B' CHL 27 ;(1R,3R)-6-{(3E,5E,7E,9E,11E,13E,15E,17E)-18-[(1S,4R,6R)-4-HYDROXY-2,2,6-TRIMETHYL-7-OXABICYCLO[4.1.0]HEPT-1-YL]-3,7,12,16-TETRAMETHYLOCTADECA-1,3,5,7,9,11,13,15,17-NONAENYLIDENE}-1,5,5-TRIMETHYLCYCLOHEXANE-1,3-DIOL ; NEX 28 'FE (II) ION' FE2 29 'CHLORIDE ION' CL 30 'PHEOPHYTIN A' PHO 31 BETA-CAROTENE BCR 32 '1,2-DI-O-ACYL-3-O-[6-DEOXY-6-SULFO-ALPHA-D-GLUCOPYRANOSYL]-SN-GLYCEROL' SQD 33 ;2,3-DIMETHYL-5-(3,7,11,15,19,23,27,31,35-NONAMETHYL-2,6,10,14,18,22,26,30,34-HEXATRIACONTANONAENYL-2,5-CYCLOHEXADIENE-1,4-DIONE-2,3-DIMETHYL-5-SOLANESYL-1,4-BENZOQUINONE ; PL9 34 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE LMG 35 'BICARBONATE ION' BCT 36 'DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG)' DGD 37 'PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE' HEM # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _space_group.crystal_system triclinic _space_group.name_H-M_alt 'P 1' _space_group.IT_number 1 _space_group.name_Hall 'P 1' _space_group.id 1 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z #