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;NEPPLNPHGSARAEVHLRKSAFDMFNFLASKHRQPPEYNPNDEEEEEVQLKSARRATSMDLPMPMRFRHLKKTSKEAVGV YRSPIHGRGLFCKRNIDAGEMVIEYAGNVIRSIQTDKREKYYDSKGIGCYMFRIDDSEVVDATMHGNAARFINHSCEPNC YSRVINIDGQKHIVIFAMRKIYRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKKCRKFLN ; K ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MNLELLESFGQNYPEEADGTLDCISMALTCTFNRWGTLLAVGCNDGRIVIWDFLTRGIAKIISAHIHPVCSLCWSRDGHK LVSASTDNIVSQWDVLSGDCDQRFRFPSPILKVQYHPRDQNKVLVCPMKSAPVMLTLSDSKHVVLPVDDDSDLNVVASFD RRGEYIYTGNAKGKILVLKTDSQDLVASFRVTTGTSNTTAIKSIEFARKGSCFLINTADRIIRVYDGREILTCGRDGEPE PMQKLQDLVNRTPWKKCCFSGDGEYIVAGSARQHALYIWEKSIGNLVKILHGTRGELLLDVAWHPVRPIIASISSGVVSI WAQNQVENWSAFAPDFKELDENVEYEERESEFDIEDEDKSEPEQTGADAAEDEEVDVTSVDPIAAFCSSDEELEDSKALL YLPIAPEVEDPEENPYGPPPDAVQTSLMDEGASSEKKRQSSADGSQPPKKKPKTTNIELQGVPNDEVHPLLGVKGDGKSK KKQAGRPKGSKGKEKDSPFKPKLYKGDRGLPLEGSAKGKVQAELSQPLTAGGAISELL ; ;MNLELLESFGQNYPEEADGTLDCISMALTCTFNRWGTLLAVGCNDGRIVIWDFLTRGIAKIISAHIHPVCSLCWSRDGHK LVSASTDNIVSQWDVLSGDCDQRFRFPSPILKVQYHPRDQNKVLVCPMKSAPVMLTLSDSKHVVLPVDDDSDLNVVASFD 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.8837 ? 30585 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0526 ? 3438 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0067 ? 2870 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 18.9879 ? 12038 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 6KIV _struct.title 'Cryo-EM structure of human MLL1-ubNCP complex (4.0 angstrom)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6KIV _struct_keywords.text 'histone modification, nucleosome, MLL, TRANSCRIPTION, TRANSCRIPTION-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION/DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? M N N 9 ? N N N 10 ? O N N 11 ? P N N 12 ? Q N N 13 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A310TTQ1_XENLA A0A310TTQ1 ? 1 ;ARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKT DLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 2 2 UNP H4_XENLA P62799 ? 2 ;SGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKT VTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 2 3 UNP Q6AZJ8_XENLA Q6AZJ8 ? 3 ;SGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIP RHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; 2 4 UNP H2B11_XENLA P02281 ? 4 ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 5 5 PDB 6KIV 6KIV ? 5 ? 1 6 PDB 6KIV 6KIV ? 6 ? 1 7 UNP KMT2A_HUMAN Q03164 ? 7 ;NEPPLNPHGSARAEVHLRKSAFDMFNFLASKHRQPPEYNPNDEEEEEVQLKSARRATSMDLPMPMRFRHLKKTSKEAVGV YRSPIHGRGLFCKRNIDAGEMVIEYAGNVIRSIQTDKREKYYDSKGIGCYMFRIDDSEVVDATMHGNAARFINHSCEPNC YSRVINIDGQKHIVIFAMRKIYRGEELTYDYKFPIEDASNKLPCNCGAKKCRKFLN ; 3754 8 UNP RBBP5_HUMAN Q15291 ? 8 ;MNLELLESFGQNYPEEADGTLDCISMALTCTFNRWGTLLAVGCNDGRIVIWDFLTRGIAKIISAHIHPVCSLCWSRDGHK LVSASTDNIVSQWDVLSGDCDQRFRFPSPILKVQYHPRDQNKVLVCPMKSAPVMLTLSDSKHVVLPVDDDSDLNVVASFD RRGEYIYTGNAKGKILVLKTDSQDLVASFRVTTGTSNTTAIKSIEFARKGSCFLINTADRIIRVYDGREILTCGRDGEPE PMQKLQDLVNRTPWKKCCFSGDGEYIVAGSARQHALYIWEKSIGNLVKILHGTRGELLLDVAWHPVRPIIASISSGVVSI WAQNQVENWSAFAPDFKELDENVEYEERESEFDIEDEDKSEPEQTGADAAEDEEVDVTSVDPIAAFCSSDEELEDSKALL YLPIAPEVEDPEENPYGPPPDAVQTSLMDEGASSEKKRQSSADGSQPPKKKPKTTNIELQGVPNDEVHPLLGVKGDGKSK KKQAGRPKGSKGKEKDSPFKPKLYKGDRGLPLEGSAKGKVQAELSQPLTAGGAISELL ; 1 9 UNP RS27A_HUMAN P62979 ? 9 MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG 1 10 UNP ASH2L_HUMAN Q9UBL3 ? 10 ;MDTQAGSVDEENGRQLGEVELQCGICTKWFTADTFGIDTSSCLPFMTNYSFHCNVCHHSGNTYFLRKQANLKEMCLSALA NLTWQSRTQDEHPKTMFSKDKDIIPFIDKYWECMTTRQRPGKMTWPNNIVKTMSKERDVFLVKEHPDPGSKDPEEDYPKF GLLDQDLSNIGPAYDNQKQSSAVSTSGNLNGGIAAGSSGKGRGAKRKQQDGGTTGTTKKARSDPLFSAQRLPPHGYPLEH PFNKDGYRYILAEPDPHAPDPEKLELDCWAGKPIPGDLYRACLYERVLLALHDRAPQLKISDDRLTVVGEKGYSMVRASH GVRKGAWYFEITVDEMPPDTAARLGWSQPLGNLQAPLGYDKFSYSWRSKKGTKFHQSIGKHYSSGYGQGDVLGFYINLPE DTETAKSLPDTYKDKALIKFKSYLYFEEKDFVDKAEKSLKQTPHSEIIFYKNGVNQGVAYKDIFEGVYFPAISLYKSCTV SINFGPCFKYPPKDLTYRPMSDMGWGAVVEHTLADVLYHVETEVDGRRSPPWEP ; 95 11 UNP WDR5_HUMAN P61964 ? 11 ;MATEEKKPETEAARAQPTPSSSATQSKPTPVKPNYALKFTLAGHTKAVSSVKFSPNGEWLASSSADKLIKIWGAYDGKFE KTISGHKLGISDVAWSSDSNLLVSASDDKTLKIWDVSSGKCLKTLKGHSNYVFCCNFNPQSNLIVSGSFDESVRIWDVKT GKCLKTLPAHSDPVSAVHFNRDGSLIVSSSYDGLCRIWDTASGQCLKTLIDDDNPPVSFVKFSPNGKYILAATLDNTLKL WDYSKGKCLKTYTGHKNEKYCIFANFSVTGGKWIVSGSEDNLVYIWNLQTKEIVQKLQGHTDVVISTACHPTENIIASAA LENDKTIKLWKSDC ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6KIV A 1 ? 135 ? A0A310TTQ1 2 ? 136 ? 1 135 2 2 6KIV B 1 ? 102 ? P62799 2 ? 103 ? 1 102 3 3 6KIV C 1 ? 129 ? Q6AZJ8 2 ? 130 ? 1 129 4 4 6KIV D 1 ? 122 ? P02281 5 ? 126 ? 1 122 5 1 6KIV E 1 ? 135 ? A0A310TTQ1 2 ? 136 ? 1 135 6 2 6KIV F 1 ? 102 ? P62799 2 ? 103 ? 1 102 7 3 6KIV G 1 ? 129 ? Q6AZJ8 2 ? 130 ? 1 129 8 4 6KIV H 1 ? 122 ? P02281 5 ? 126 ? 1 122 9 5 6KIV I 1 ? 145 ? 6KIV 2 ? 146 ? 2 146 10 6 6KIV J 1 ? 145 ? 6KIV 2 ? 146 ? 2 146 11 7 6KIV K 1 ? 216 ? Q03164 3754 ? 3969 ? 3754 3969 12 8 6KIV N 1 ? 538 ? Q15291 1 ? 538 ? 1 538 13 9 6KIV O 1 ? 76 ? P62979 1 ? 76 ? 1 76 14 10 6KIV T 1 ? 534 ? Q9UBL3 95 ? 628 ? 1 534 15 11 6KIV R 1 ? 334 ? P61964 1 ? 334 ? 1 334 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 4 6KIV THR D 29 ? UNP P02281 SER 33 'engineered mutation' 29 1 4 6KIV CYS D 117 ? UNP P02281 LYS 121 'engineered mutation' 117 2 8 6KIV THR H 29 ? UNP P02281 SER 33 'engineered mutation' 29 3 8 6KIV CYS H 117 ? UNP P02281 LYS 121 'engineered mutation' 117 4 13 6KIV CYS O 76 ? UNP P62979 GLY 76 'engineered mutation' 76 5 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details pentadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 15 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support cross-linking _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 44 ? LYS A 56 ? GLY A 44 LYS A 56 1 ? 13 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 63 ? GLN A 76 ? ARG A 63 GLN A 76 1 ? 14 HELX_P HELX_P3 AA3 SER A 86 ? ALA A 114 ? SER A 86 ALA A 114 1 ? 29 HELX_P HELX_P4 AA4 MET A 120 ? GLY A 132 ? MET A 120 GLY A 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 PRO B 32 ? GLY B 42 ? PRO B 32 GLY B 42 1 ? 11 HELX_P HELX_P6 AA6 LEU B 49 ? ALA B 76 ? LEU B 49 ALA B 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P7 AA7 THR B 82 ? GLY B 94 ? THR B 82 GLY B 94 1 ? 13 HELX_P HELX_P8 AA8 THR C 16 ? GLY C 22 ? THR C 16 GLY C 22 1 ? 7 HELX_P HELX_P9 AA9 VAL C 27 ? LYS C 36 ? VAL C 27 LYS C 36 1 ? 10 HELX_P HELX_P10 AB1 GLY C 46 ? ASN C 73 ? GLY C 46 ASN C 73 1 ? 28 HELX_P HELX_P11 AB2 ILE C 79 ? ASP C 90 ? ILE C 79 ASP C 90 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 AB3 GLU C 91 ? LEU C 97 ? GLU C 91 LEU C 97 1 ? 7 HELX_P HELX_P13 AB4 TYR D 34 ? HIS D 46 ? TYR D 34 HIS D 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P14 AB5 SER D 53 ? ASN D 81 ? SER D 53 ASN D 81 1 ? 29 HELX_P HELX_P15 AB6 THR D 87 ? LEU D 99 ? THR D 87 LEU D 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P16 AB7 GLY D 101 ? SER D 120 ? GLY D 101 SER D 120 1 ? 20 HELX_P HELX_P17 AB8 GLY E 44 ? LYS E 56 ? GLY E 44 LYS E 56 1 ? 13 HELX_P HELX_P18 AB9 ARG E 63 ? GLN E 76 ? ARG E 63 GLN E 76 1 ? 14 HELX_P HELX_P19 AC1 SER E 86 ? ALA E 114 ? SER E 86 ALA E 114 1 ? 29 HELX_P HELX_P20 AC2 MET E 120 ? GLY E 132 ? MET E 120 GLY E 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P21 AC3 ASP F 24 ? ILE F 29 ? ASP F 24 ILE F 29 5 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 THR F 30 ? GLY F 42 ? THR F 30 GLY F 42 1 ? 13 HELX_P HELX_P23 AC5 LEU F 49 ? ALA F 76 ? LEU F 49 ALA F 76 1 ? 28 HELX_P HELX_P24 AC6 THR F 82 ? GLY F 94 ? THR F 82 GLY F 94 1 ? 13 HELX_P HELX_P25 AC7 THR G 16 ? GLY G 22 ? THR G 16 GLY G 22 1 ? 7 HELX_P HELX_P26 AC8 VAL G 27 ? GLY G 37 ? VAL G 27 GLY G 37 1 ? 11 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY G 46 ? ASN G 73 ? GLY G 46 ASN G 73 1 ? 28 HELX_P HELX_P28 AD1 ILE G 79 ? ASN G 89 ? ILE G 79 ASN G 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P29 AD2 GLU G 92 ? LEU G 97 ? GLU G 92 LEU G 97 1 ? 6 HELX_P HELX_P30 AD3 TYR H 34 ? HIS H 46 ? TYR H 34 HIS H 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P31 AD4 SER H 52 ? ASN H 81 ? SER H 52 ASN H 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P32 AD5 THR H 87 ? LEU H 99 ? THR H 87 LEU H 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P33 AD6 PRO H 100 ? ALA H 121 ? PRO H 100 ALA H 121 1 ? 22 HELX_P HELX_P34 AD7 PRO K 62 ? ALA K 77 ? PRO K 3815 ALA K 3830 1 ? 16 HELX_P HELX_P35 AD8 ILE K 113 ? LYS K 125 ? ILE K 3866 LYS K 3878 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 AD9 GLY L 227 ? GLY L 234 ? GLY N 227 GLY N 234 1 ? 8 HELX_P HELX_P37 AE1 THR M 22 ? GLU M 34 ? THR O 22 GLU O 34 1 ? 13 HELX_P HELX_P38 AE2 PRO M 37 ? GLN M 41 ? PRO O 37 GLN O 41 5 ? 5 HELX_P HELX_P39 AE3 THR M 55 ? TYR M 59 ? THR O 55 TYR O 59 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 SER N 501 ? MET N 503 ? SER T 501 MET T 503 5 ? 3 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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