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'expression tag' 1093 8 1 6KKR GLU A 1094 ? UNP Q9UP95 ? ? 'expression tag' 1094 9 1 6KKR LYS A 1095 ? UNP Q9UP95 ? ? 'expression tag' 1095 10 2 6KKR LEU B 1086 ? UNP Q9UP95 ? ? 'expression tag' 1086 11 2 6KKR GLU B 1087 ? UNP Q9UP95 ? ? 'expression tag' 1087 12 2 6KKR TRP B 1088 ? UNP Q9UP95 ? ? 'expression tag' 1088 13 2 6KKR SER B 1089 ? UNP Q9UP95 ? ? 'expression tag' 1089 14 2 6KKR HIS B 1090 ? UNP Q9UP95 ? ? 'expression tag' 1090 15 2 6KKR PRO B 1091 ? UNP Q9UP95 ? ? 'expression tag' 1091 16 2 6KKR GLN B 1092 ? UNP Q9UP95 ? ? 'expression tag' 1092 17 2 6KKR PHE B 1093 ? UNP Q9UP95 ? ? 'expression tag' 1093 18 2 6KKR GLU B 1094 ? UNP Q9UP95 ? ? 'expression tag' 1094 19 2 6KKR LYS B 1095 ? UNP Q9UP95 ? ? 'expression tag' 1095 20 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BGC 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-glucopyranose 'beta-D-glucose; D-glucose; glucose' 'C6 H12 O6' 180.156 CL non-polymer . 'CHLORIDE ION' ? 'Cl -1' 35.453 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DU0 non-polymer . ;2-[2-[(1~{S},2~{S},4~{S},5'~{R},6~{R},7~{S},8~{R},9~{S},12~{S},13~{R},16~{S})-5',7,9,13-tetramethylspiro[5-oxapentacyclo[10.8.0.0^{2,9}.0^{4,8}.0^{13,18}]icos-18-ene-6,2'-oxane]-16-yl]oxyethyl]propane-1,3-diol ; ? 'C32 H52 O5' 516.752 GLC 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-glucopyranose 'alpha-D-glucose; D-glucose; glucose' 'C6 H12 O6' 180.156 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 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SER B 634 ILE B 652 1 ? 19 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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A DU0 2000 E BGC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.384 ? ? covale4 covale one ? N DU0 . O28 ? ? ? 1_555 I BGC . C1 ? ? A DU0 2000 I BGC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.376 ? ? covale5 covale one ? B ASN 312 ND2 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? B ASN 312 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? B ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? B ASN 361 H NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? R DU0 . O52 ? ? ? 1_555 F BGC . C1 ? ? B DU0 2000 F BGC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.376 ? ? covale8 covale one ? R DU0 . O28 ? ? ? 1_555 J BGC . C1 ? ? B DU0 2000 J BGC 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.384 ? ? covale9 covale both ? C NAG . O4 ? ? ? 1_555 C NAG . C1 ? ? C NAG 1 C NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale10 covale both ? D NAG . O4 ? ? ? 1_555 D NAG . C1 ? ? D NAG 1 D NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale11 covale both ? E BGC . O4 ? ? ? 1_555 E GLC . C1 ? ? E BGC 1 E GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.368 ? ? covale12 covale both ? F BGC . O4 ? ? ? 1_555 F GLC . C1 ? ? F BGC 1 F GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? ? covale13 covale both ? G NAG . O4 ? ? ? 1_555 G NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale14 covale both ? H NAG . O4 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? H NAG 1 H NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale15 covale both ? I BGC . O4 ? ? ? 1_555 I GLC . C1 ? ? I BGC 1 I GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? ? covale16 covale both ? J BGC . O4 ? ? ? 1_555 J GLC . C1 ? ? J BGC 1 J GLC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.368 ? ? metalc1 metalc ? ? A ASN 131 O ? ? ? 1_555 L K . K ? ? A ASN 131 A K 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.184 ? ? metalc2 metalc ? ? A ILE 132 O ? ? ? 1_555 L K . K ? ? A ILE 132 A K 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.965 ? ? metalc3 metalc ? ? A TYR 216 OH ? ? ? 1_555 L K . K ? ? A TYR 216 A K 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 3.275 ? ? metalc4 metalc ? ? A PRO 429 O ? ? ? 1_555 L K . K ? ? A PRO 429 A K 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.945 ? ? metalc5 metalc ? ? A THR 432 O ? ? ? 1_555 L K . K ? ? 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PRO A 306 LEU A 310 AA1 3 VAL A 362 ? PRO A 366 ? VAL A 362 PRO A 366 AA2 1 THR A 326 ? VAL A 329 ? THR A 326 VAL A 329 AA2 2 GLU A 332 ? ALA A 335 ? GLU A 332 ALA A 335 AA3 1 ARG B 313 ? THR B 314 ? ARG B 313 THR B 314 AA3 2 PRO B 306 ? LEU B 310 ? PRO B 306 LEU B 310 AA3 3 VAL B 362 ? PRO B 366 ? VAL B 362 PRO B 366 AA4 1 THR B 326 ? VAL B 329 ? THR B 326 VAL B 329 AA4 2 GLU B 332 ? ALA B 335 ? 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O ARG A 313 N LEU A 310 ? N LEU A 310 AA1 2 3 N VAL A 307 ? N VAL A 307 O ILE A 365 ? O ILE A 365 AA2 1 2 N ALA A 327 ? N ALA A 327 O VAL A 334 ? O VAL A 334 AA3 1 2 O ARG B 313 ? O ARG B 313 N LEU B 310 ? N LEU B 310 AA3 2 3 N VAL B 307 ? N VAL B 307 O ILE B 365 ? O ILE B 365 AA4 1 2 N ALA B 327 ? N ALA B 327 O VAL B 334 ? O VAL B 334 # _atom_sites.entry_id 6KKR _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C CL K N O S # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 MET 1 1 ? ? ? 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? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'Ministry of Science and Technology (China)' China 2018YFA0508100 1 'Ministry of Science and Technology (China)' China 2016YFA0500404 2 'National Natural Science Foundation of China' China 31870724 3 'National Natural Science Foundation of China' China 31525001 4 'National Natural Science Foundation of China' China 31430019 5 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero C 2 NAG 1 C NAG 1 A NAG 1102 n C 2 NAG 2 C NAG 2 A NAG 1101 n D 2 NAG 1 D NAG 1 A NAG 1104 n D 2 NAG 2 D NAG 2 A NAG 1103 n E 3 BGC 1 E BGC 1 A BGC 1109 n E 3 GLC 2 E GLC 2 A GLC 1110 n F 3 BGC 1 F BGC 1 A BGC 1111 n F 3 GLC 2 F GLC 2 A GLC 1112 n G 2 NAG 1 G NAG 1 B NAG 1102 n G 2 NAG 2 G NAG 2 B NAG 1101 n H 2 NAG 1 H NAG 1 B NAG 1104 n H 2 NAG 2 H NAG 2 B NAG 1103 n I 3 BGC 1 I BGC 1 B BGC 1108 n I 3 GLC 2 I GLC 2 B GLC 1109 n J 3 BGC 1 J BGC 1 B BGC 1111 n J 3 GLC 2 J GLC 2 B GLC 1112 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BGC 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpb BGC 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-glucopyranose BGC 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Glcp BGC 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Glc GLC 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpa GLC 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-glucopyranose GLC 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Glcp GLC 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Glc NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 2 oligosaccharide 3 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 2 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 2 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 2 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 3 DGlcpa1-4DGlcpb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 3 'WURCS=2.0/2,2,1/[a2122h-1b_1-5][a2122h-1a_1-5]/1-2/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 3 '[][D-1-deoxy-Glcp]{[(4+1)][a-D-Glcp]{}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 2 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 3 2 GLC C1 O1 1 BGC O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 2 NAG 1 n 2 NAG 2 n 3 BGC 1 n 3 GLC 2 n # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 4 'CHLORIDE ION' CL 5 'POTASSIUM ION' K 6 ;2-[2-[(1~{S},2~{S},4~{S},5'~{R},6~{R},7~{S},8~{R},9~{S},12~{S},13~{R},16~{S})-5',7,9,13-tetramethylspiro[5-oxapentacyclo[10.8.0.0^{2,9}.0^{4,8}.0^{13,18}]icos-18-ene-6,2'-oxane]-16-yl]oxyethyl]propane-1,3-diol ; DU0 # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? 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