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EMDB EMD-0758 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2019-09-18 2 'Structure model' 1 1 2019-10-09 3 'Structure model' 1 2 2019-11-06 4 'Structure model' 1 3 2024-03-27 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' 3 3 'Structure model' 'Data 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_citation.journal_id_ISSN 1091-6490 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 116 _citation.language ? _citation.page_first 19513 _citation.page_last 19522 _citation.title 'An ensemble of cryo-EM structures of TRiC reveal its conformational landscape and subunit specificity.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1073/pnas.1903976116 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31492816 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Jin, M.' 1 ? primary 'Han, W.' 2 ? primary 'Liu, C.' 3 ? primary 'Zang, Y.' 4 ? primary 'Li, J.' 5 ? primary 'Wang, F.' 6 ? primary 'Wang, Y.' 7 ? primary 'Cong, Y.' 8 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer 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KILVELAQQQDREIGDGTTSVVIIASELLKRANELVKNKIHPTTIITGFRVALREAIRFINEVLSTSVDTLGKETLINIA KTSMSSKIIGADSDFFSNMVVDALLAVKTQNSKGEIKYPVKAVNVLKAHGKSATESLLVPGYALNCTVASQAMPKRIAGG NVKIACLDLNLQKARMAMGVQINIDDPEQLEQIRKREAGIVLERVKKIIDAGAQVVLTTKGIDDLCLKEFVEAKIMGVRR CKKEDLRRIARATGATLVSSMSNLEGEETFESSYLGLCDEVVQAKFSDDECILIKGTSKHSSSSIILRGANDYSLDEMER SLHDSLSVVKRTLESGNVVPGGGCVEAALNIYLDNFATTVGSREQLAIAEFAAALLIIPKTLAVNAAKDSSELVAKLRSY HAASQMAKPEDVKRRSYRNYGLDLIRGKIVDEIHAGVLEPTISKVKSLKSALEACVAILRIDTMITVDPEPPKEDPHDH ; a,A ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MSVQIFGDQVTEERAENARLSAFVGAIAVGDLVKSTLGPKGMDKLLQSASSNTCMVTNDGATILKSIPLDNPAAKVLVNI SKVQDDEVGDGTTSVTVLSAELLREAEKLIDQSKIHPQTIIEGYRLASAAALDALTKAAVDNSHDKTMFREDLIHIAKTT LSSKILSQDKDHFAELATNAILRLKGSTNLEHIQIIKILGGKLSDSFLDEGFILAKKFGNNQPKRIENAKILIANTTLDT DKVKIFGTKFKVDSTAKLAQLEKAEREKMKNKIAKISKFGINTFINRQLIYDYPEQLFTDLGINSIEHADFEGVERLALV TGGEVVSTFDEPSKCKLGECDVIEEIMLGEQPFLKFSGCKAGEACTIVLRGATDQTLDEAERSLHDALSVLSQTTKETRT 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ITITNDGATILSQMELDNEIAKLLVQLSKSQDDEIGDGTTGVVVLASALLDQALELIQKGIHPIKIANGFDEAAKLAISK LEETCDDISASNDELFRDFLLRAAKTSLGSKIVSKDHDRFAEMAVEAVINVMDKDRKDVDFDLIKMQGRVGGSISDSKLI NGVILDKDFSHPQMPKCVLPKEGSDGVKLAILTCPFEPPKPKTKHKLDISSVEEYQKLQTYEQDKFKEMIDDVKKAGADV VICQWGFDDEANHLLLQNDLPAVRWVGGQELEHIAISTNGRIVPRFQDLSKDKLGTCSRIYEQEFGTTKDRMLIIEQSKE TKTVTCFVRGSNKMIVDEAERALHDSLCVVRNLVKDSRVVYGGGAAEVTMSLAVSEEADKQRGIDQYAFRGFAQALDTIP MTLAENSGLDPIGTLSTLKSKQLKEKISNIGVDCLGYGSNDMKELFVVDPFIGKKQQILLATQLCRMILKIDNVIISGKD EY ; ;MAARPQQPPMEMPDLSNAIVAQDEMGRPFIIVKDQGNKKRQHGLEAKKSHILAARSVASIIKTSLGPRGLDKILISPDGE ITITNDGATILSQMELDNEIAKLLVQLSKSQDDEIGDGTTGVVVLASALLDQALELIQKGIHPIKIANGFDEAAKLAISK LEETCDDISASNDELFRDFLLRAAKTSLGSKIVSKDHDRFAEMAVEAVINVMDKDRKDVDFDLIKMQGRVGGSISDSKLI NGVILDKDFSHPQMPKCVLPKEGSDGVKLAILTCPFEPPKPKTKHKLDISSVEEYQKLQTYEQDKFKEMIDDVKKAGADV VICQWGFDDEANHLLLQNDLPAVRWVGGQELEHIAISTNGRIVPRFQDLSKDKLGTCSRIYEQEFGTTKDRMLIIEQSKE TKTVTCFVRGSNKMIVDEAERALHDSLCVVRNLVKDSRVVYGGGAAEVTMSLAVSEEADKQRGIDQYAFRGFAQALDTIP 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PRVVLLDCPLEYKKGESQTNIEIEKEEDWNRILQIEEEQVQLMCEQILAVRPTLVITEKGVSDLAQHYLLKGGCSVLRRV KKSDNNRIARVTGATIVNRVEDLKESDVGTNCGLFKVEMIGDEYFSFLDNCKEPLEGSGSGWSHPQFEKGSGKRRWKKNF IAVSAANRFKKISSSGALGSGHHHHHHHHGSGLQKACTIMLRGGSKDILNEIDRNLQDAMAVARNVMLSPSLSPGGGATE MAVSVKLAEKAKQLEGIQQWPYQAVADAMECIPRTLIQNAGGDPIRLLSQLRAKHAQGNFTTGIDGDKGKIVDMVSYGIW EPEVIKQQSVKTAIESACLLLRVDDIVSGVRKQE ; g,G ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MNFGSQTPTIVVLKEGTDASQGKGQIISNINACVAVQEALKPTLGPLGSDILIVTSNQKTTISNDGATILKLLDVVHPAA KTLVDISRAQDAEVGDGTTSVTILAGELMKEAKPFLEEGISSHLIMKGYRKAVSLAVEKINELAVDITSEKSSGRELLER CARTAMSSKLIHNNADFFVKMCVDAVLSLDRNDLDDKLIGIKKIPGGAMEESLFINGVAFKKTFSYAGFEQQPKKFNNPK ILSLNVELELKAEKDNAEVRVEHVEDYQAIVDAEWQLIFEKLRQVEETGANIVLSKLPIGDLATQFFADRNIFCAGRVSA DDMNRVIQAVGGSIQSTTSDIKPEHLGTCALFEEMQIGSERYNLFQGCPQAKTCTLLLRGGAEQVIAEVERSLHDAIMIV KRALQNKLIVAGGGATEMEVSKCLRDYSKTIAGKQQMIINAFAKALEVIPRQLCENAGFDAIEILNKLRLAHSKGEKWYG VVFETENIGDNFAKFVWEPALVKINALNSATEATNLILSVDETITNKGSESANAGMMPPQGAGRGRGMPM ; ;MNFGSQTPTIVVLKEGTDASQGKGQIISNINACVAVQEALKPTLGPLGSDILIVTSNQKTTISNDGATILKLLDVVHPAA KTLVDISRAQDAEVGDGTTSVTILAGELMKEAKPFLEEGISSHLIMKGYRKAVSLAVEKINELAVDITSEKSSGRELLER CARTAMSSKLIHNNADFFVKMCVDAVLSLDRNDLDDKLIGIKKIPGGAMEESLFINGVAFKKTFSYAGFEQQPKKFNNPK ILSLNVELELKAEKDNAEVRVEHVEDYQAIVDAEWQLIFEKLRQVEETGANIVLSKLPIGDLATQFFADRNIFCAGRVSA DDMNRVIQAVGGSIQSTTSDIKPEHLGTCALFEEMQIGSERYNLFQGCPQAKTCTLLLRGGAEQVIAEVERSLHDAIMIV KRALQNKLIVAGGGATEMEVSKCLRDYSKTIAGKQQMIINAFAKALEVIPRQLCENAGFDAIEILNKLRLAHSKGEKWYG VVFETENIGDNFAKFVWEPALVKINALNSATEATNLILSVDETITNKGSESANAGMMPPQGAGRGRGMPM ; h,H ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSLRLPQNPNAGLFKQGYNSYSNADGQIIKSIAAIRELHQMCLTSMGPCGRNKIIVNHLGKIIITNDAATMLRELDIVHP AVKVLVMATEQQKIDMGDGTNLVMILAGELLNVSEKLISMGLSAVEIIQGYNMARKFTLKELDEMVVGEITDKNDKNELL KMIKPVISSKKYGSEDILSELVSEAVSHVLPVAQQAGEIPYFNVDSIRVVKIMGGSLSNSTVIKGMVFNREPEGHVKSLS EDKKHKVAVFTCPLDIANTETKGTVLLHNAQEMLDFSKGEEKQIDAMMKEIADMGVECIVAGAGVGELALHYLNRYGILV LKVPSKFELRRLCRVCGATPLPRLGAPTPEELGLVETVKTMEIGGDRVTVFKQEQGEISRTSTIILRGATQNNLDDIERA 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'see sequence details' 434 120 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexadecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 16 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB ; # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 22 ? 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AK4 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? parallel AA8 3 4 ? parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? parallel AC2 1 2 ? parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? parallel AC6 1 2 ? parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD4 1 2 ? parallel AD4 2 3 ? parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD5 1 2 ? parallel AD5 2 3 ? parallel AD5 3 4 ? parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD8 3 4 ? anti-parallel AD9 1 2 ? parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? parallel AE5 2 3 ? parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AF1 1 2 ? parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF3 1 2 ? parallel AF3 2 3 ? parallel AF4 1 2 ? parallel AF5 1 2 ? parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF7 1 2 ? parallel AF7 2 3 ? parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? parallel AF8 3 4 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AG1 1 2 ? parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG2 2 3 ? anti-parallel AG3 1 2 ? parallel AG3 2 3 ? parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG4 2 3 ? parallel AG4 3 4 ? anti-parallel AG5 1 2 ? parallel AG5 2 3 ? anti-parallel AG6 1 2 ? parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AH1 1 2 ? anti-parallel AH1 2 3 ? parallel AH1 3 4 ? anti-parallel AH2 1 2 ? parallel AH2 2 3 ? anti-parallel AH3 1 2 ? anti-parallel AH3 2 3 ? anti-parallel AH4 1 2 ? parallel AH4 2 3 ? parallel AH5 1 2 ? anti-parallel AH6 1 2 ? parallel AH7 1 2 ? anti-parallel AH7 2 3 ? anti-parallel AH8 1 2 ? parallel AH8 2 3 ? parallel AH8 3 4 ? parallel AH9 1 2 ? parallel AH9 2 3 ? parallel AH9 3 4 ? anti-parallel AI1 1 2 ? anti-parallel AI2 1 2 ? parallel AI2 2 3 ? anti-parallel AI3 1 2 ? anti-parallel AI3 2 3 ? parallel AI3 3 4 ? anti-parallel AI4 1 2 ? parallel AI4 2 3 ? anti-parallel AI5 1 2 ? anti-parallel AI5 2 3 ? anti-parallel AI6 1 2 ? parallel AI6 2 3 ? parallel AI6 3 4 ? anti-parallel AI7 1 2 ? anti-parallel AI8 1 2 ? anti-parallel AI8 2 3 ? parallel AI8 3 4 ? anti-parallel AI9 1 2 ? parallel AI9 2 3 ? anti-parallel AJ1 1 2 ? anti-parallel AJ1 2 3 ? anti-parallel AJ2 1 2 ? parallel AJ2 2 3 ? parallel AJ3 1 2 ? anti-parallel AJ4 1 2 ? anti-parallel AJ4 2 3 ? anti-parallel AJ5 1 2 ? parallel AJ5 2 3 ? anti-parallel AJ6 1 2 ? anti-parallel AJ6 2 3 ? anti-parallel AJ7 1 2 ? parallel AJ7 2 3 ? parallel AJ8 1 2 ? anti-parallel AJ9 1 2 ? anti-parallel AJ9 2 3 ? anti-parallel AK1 1 2 ? parallel AK1 2 3 ? anti-parallel AK2 1 2 ? anti-parallel AK2 2 3 ? anti-parallel AK3 1 2 ? parallel AK3 2 3 ? parallel AK3 3 4 ? parallel AK4 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 ASN A 6 ? 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