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'expression tag' -15 5 1 6M17 ASP A 6 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -14 6 1 6M17 ASP A 7 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -13 7 1 6M17 ASP A 8 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -12 8 1 6M17 ASP A 9 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -11 9 1 6M17 LYS A 10 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -10 10 1 6M17 SER A 11 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -9 11 1 6M17 GLY A 12 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -8 12 1 6M17 PRO A 13 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -7 13 1 6M17 ASP A 14 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -6 14 1 6M17 GLU A 15 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -5 15 1 6M17 VAL A 16 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -4 16 1 6M17 ASP A 17 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -3 17 1 6M17 ALA A 18 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -2 18 1 6M17 SER A 19 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' -1 19 1 6M17 GLY A 20 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' 0 20 1 6M17 ARG A 21 ? UNP Q695T7 ? ? 'expression tag' 1 21 2 6M17 MET B 1 ? UNP Q9BYF1 ? ? 'initiating methionine' -8 22 2 6M17 ARG B 2 ? 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UNP Q9BYF1 ? ? insertion 14 59 5 6M17 PHE D 24 ? UNP Q9BYF1 ? ? insertion 15 60 5 6M17 GLU D 25 ? UNP Q9BYF1 ? ? insertion 16 61 5 6M17 LYS D 26 ? UNP Q9BYF1 ? ? insertion 17 62 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 HOH non-polymer . WATER ? 'H2 O' 18.015 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 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LA N N 9 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 40 ? GLU A 45 ? GLU A 20 GLU A 25 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 ASN A 57 ? CYS A 69 ? ASN A 37 CYS A 49 1 ? 13 HELX_P HELX_P3 AA3 ARG A 77 ? HIS A 85 ? ARG A 57 HIS A 65 1 ? 9 HELX_P HELX_P4 AA4 PHE A 90 ? GLU A 101 ? PHE A 70 GLU A 81 1 ? 12 HELX_P HELX_P5 AA5 GLU A 101 ? ARG A 117 ? GLU A 81 ARG A 97 1 ? 17 HELX_P HELX_P6 AA6 SER A 120 ? SER A 125 ? 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C ASN 368 C NAG 704 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? E ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? D ASN 53 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? E ASN 99 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? D ASN 90 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? E ASN 112 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? D ASN 103 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? E ASN 331 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? D ASN 322 D NAG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? E ASN 441 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? D ASN 432 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? E ASN 555 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? D ASN 546 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? E ASN 699 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? D ASN 690 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? F ASN 25 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? 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? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? cryoSPARC 2.13.2 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Natural Science Foundation of China (NSFC)' China 31971123 1 'National Natural Science Foundation of China (NSFC)' China 81920108015 2 'National Natural Science Foundation of China (NSFC)' China 31930059 3 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero G 4 NAG 1 G NAG 1 A NAG 703 n G 4 NAG 2 G NAG 2 A NAG 704 n H 4 NAG 1 H NAG 1 B NAG 901 n H 4 NAG 2 H NAG 2 B NAG 902 n I 4 NAG 1 I NAG 1 B NAG 903 n I 4 NAG 2 I NAG 2 B NAG 904 n J 4 NAG 1 J NAG 1 B NAG 905 n J 4 NAG 2 J NAG 2 B NAG 906 n K 4 NAG 1 K NAG 1 B NAG 908 n K 4 NAG 2 K NAG 2 B NAG 909 n L 4 NAG 1 L NAG 1 B NAG 910 n L 4 NAG 2 L NAG 2 B NAG 911 n M 4 NAG 1 M NAG 1 B NAG 912 n M 4 NAG 2 M NAG 2 B NAG 913 n N 5 NAG 1 N NAG 1 E NAG 1401 n N 5 NAG 2 N NAG 2 E NAG 1402 n N 5 NAG 3 N NAG 3 E NAG 1403 n O 4 NAG 1 O NAG 1 C NAG 703 n O 4 NAG 2 O NAG 2 C NAG 704 n P 4 NAG 1 P NAG 1 D NAG 901 n P 4 NAG 2 P NAG 2 D NAG 902 n Q 4 NAG 1 Q NAG 1 D NAG 903 n Q 4 NAG 2 Q NAG 2 D NAG 904 n R 4 NAG 1 R NAG 1 D NAG 905 n R 4 NAG 2 R NAG 2 D NAG 906 n S 4 NAG 1 S NAG 1 D NAG 908 n S 4 NAG 2 S NAG 2 D NAG 909 n T 4 NAG 1 T NAG 1 D NAG 910 n T 4 NAG 2 T NAG 2 D NAG 911 n U 4 NAG 1 U NAG 1 D NAG 912 n U 4 NAG 2 U NAG 2 D NAG 913 n V 5 NAG 1 V NAG 1 F NAG 1401 n V 5 NAG 2 V NAG 2 F NAG 1402 n V 5 NAG 3 V NAG 3 F NAG 1403 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 4 oligosaccharide 5 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 4 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 4 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 4 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 5 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-ROH 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 5 'WURCS=2.0/1,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1-1/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 5 '[][D-1-deoxy-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 4 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 5 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 5 3 NAG C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 4 NAG 1 n 4 NAG 2 n 5 NAG 1 n 5 NAG 2 n 5 NAG 3 n # loop_ _pdbx_entity_instance_feature.ordinal _pdbx_entity_instance_feature.comp_id _pdbx_entity_instance_feature.asym_id _pdbx_entity_instance_feature.seq_num _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num _pdbx_entity_instance_feature.feature_type _pdbx_entity_instance_feature.details 1 LEU ? ? LEU ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 2 NAG ? ? NAG ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? 3 ZN ? ? ZN ? ? 'SUBJECT OF INVESTIGATION' ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 6 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG 7 LEUCINE LEU 8 'ZINC ION' ZN 9 water HOH # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _space_group.crystal_system triclinic _space_group.name_H-M_alt 'P 1' _space_group.IT_number 1 _space_group.name_Hall 'P 1' _space_group.id 1 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z #