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'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.959 ? 60168 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 11.807 ? 13956 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.060 ? 2796 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 4992 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6MHY _struct.title 'Structure of connexin-50 intercellular gap junction channel at 3.4 angstrom resolution by cryoEM' _struct.pdbx_descriptor 'Gap junction alpha-8 protein' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6MHY _struct_keywords.text 'ion channel, gap junction, cell communication, connexin, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? 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PHE E 32 ALA E 40 1 ? 9 HELX_P HELX_P36 AD9 ALA E 40 ? GLY E 46 ? ALA E 40 GLY E 46 1 ? 7 HELX_P HELX_P37 AE1 GLY E 60 ? PHE E 70 ? GLY E 60 PHE E 70 1 ? 11 HELX_P HELX_P38 AE2 SER E 73 ? VAL E 97 ? SER E 73 VAL E 97 1 ? 25 HELX_P HELX_P39 AE3 LEU E 155 ? TYR E 180 ? LEU E 155 TYR E 180 1 ? 26 HELX_P HELX_P40 AE4 ARG E 205 ? LEU E 234 ? ARG E 205 LEU E 234 1 ? 30 HELX_P HELX_P41 AE5 TRP F 4 ? GLU F 16 ? TRP F 4 GLU F 16 1 ? 13 HELX_P HELX_P42 AE6 VAL F 20 ? PHE F 32 ? VAL F 20 PHE F 32 1 ? 13 HELX_P HELX_P43 AE7 PHE F 32 ? ALA F 40 ? PHE F 32 ALA F 40 1 ? 9 HELX_P HELX_P44 AE8 ALA F 40 ? GLY F 46 ? ALA F 40 GLY F 46 1 ? 7 HELX_P HELX_P45 AE9 GLY F 60 ? PHE F 70 ? GLY F 60 PHE F 70 1 ? 11 HELX_P HELX_P46 AF1 SER F 73 ? VAL F 97 ? SER F 73 VAL F 97 1 ? 25 HELX_P HELX_P47 AF2 LEU F 155 ? TYR F 180 ? LEU F 155 TYR F 180 1 ? 26 HELX_P HELX_P48 AF3 ARG F 205 ? LEU F 234 ? ARG F 205 LEU F 234 1 ? 30 HELX_P HELX_P49 AF4 TRP G 4 ? GLU G 16 ? 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ARG L 205 LEU L 234 1 ? 30 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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D CYS 54 SG ? ? ? 1_555 D CYS 201 SG ? ? D CYS 54 D CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf11 disulf ? ? D CYS 61 SG ? ? ? 1_555 D CYS 195 SG ? ? D CYS 61 D CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf12 disulf ? ? D CYS 65 SG ? ? ? 1_555 D CYS 190 SG ? ? D CYS 65 D CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf13 disulf ? ? E CYS 54 SG ? ? ? 1_555 E CYS 201 SG ? ? E CYS 54 E CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf14 disulf ? ? E CYS 61 SG ? ? ? 1_555 E CYS 195 SG ? ? E CYS 61 E CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf15 disulf ? ? E CYS 65 SG ? ? ? 1_555 E CYS 190 SG ? ? E CYS 65 E CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf16 disulf ? ? F CYS 54 SG ? ? ? 1_555 F CYS 201 SG ? ? F CYS 54 F CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf17 disulf ? ? F CYS 61 SG ? ? ? 1_555 F CYS 195 SG ? ? F CYS 61 F CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf18 disulf ? ? F CYS 65 SG ? ? ? 1_555 F CYS 190 SG ? ? F CYS 65 F CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf19 disulf ? ? G CYS 54 SG ? ? ? 1_555 G CYS 201 SG ? ? G CYS 54 G CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf20 disulf ? ? G CYS 61 SG ? ? ? 1_555 G CYS 195 SG ? ? G CYS 61 G CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf21 disulf ? ? G CYS 65 SG ? ? ? 1_555 G CYS 190 SG ? ? G CYS 65 G CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf22 disulf ? ? H CYS 54 SG ? ? ? 1_555 H CYS 201 SG ? ? H CYS 54 H CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf23 disulf ? ? H CYS 61 SG ? ? ? 1_555 H CYS 195 SG ? ? H CYS 61 H CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf24 disulf ? ? H CYS 65 SG ? ? ? 1_555 H CYS 190 SG ? ? H CYS 65 H CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf25 disulf ? ? I CYS 54 SG ? ? ? 1_555 I CYS 201 SG ? ? I CYS 54 I CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf26 disulf ? ? I CYS 61 SG ? ? ? 1_555 I CYS 195 SG ? ? I CYS 61 I CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf27 disulf ? ? I CYS 65 SG ? ? ? 1_555 I CYS 190 SG ? ? I CYS 65 I CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf28 disulf ? ? J CYS 54 SG ? ? ? 1_555 J CYS 201 SG ? ? J CYS 54 J CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf29 disulf ? ? J CYS 61 SG ? ? ? 1_555 J CYS 195 SG ? ? J CYS 61 J CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf30 disulf ? ? J CYS 65 SG ? ? ? 1_555 J CYS 190 SG ? ? J CYS 65 J CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf31 disulf ? ? K CYS 54 SG ? ? ? 1_555 K CYS 201 SG ? ? K CYS 54 K CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf32 disulf ? ? K CYS 61 SG ? ? ? 1_555 K CYS 195 SG ? ? K CYS 61 K CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf33 disulf ? ? K CYS 65 SG ? ? ? 1_555 K CYS 190 SG ? ? K CYS 65 K CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf34 disulf ? ? L CYS 54 SG ? ? ? 1_555 L CYS 201 SG ? ? L CYS 54 L CYS 201 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf35 disulf ? ? L CYS 61 SG ? ? ? 1_555 L CYS 195 SG ? ? L CYS 61 L CYS 195 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf36 disulf ? ? L CYS 65 SG ? ? ? 1_555 L CYS 190 SG ? ? L CYS 65 L CYS 190 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 187 ? ARG A 189 ? LEU A 187 ARG A 189 AA1 2 ASP A 200 ? PHE A 202 ? ASP A 200 PHE A 202 AA2 1 LEU B 187 ? ARG B 189 ? LEU B 187 ARG B 189 AA2 2 ASP B 200 ? PHE B 202 ? ASP B 200 PHE B 202 AA3 1 LEU C 187 ? ARG C 189 ? LEU C 187 ARG C 189 AA3 2 ASP C 200 ? PHE C 202 ? ASP C 200 PHE C 202 AA4 1 LEU D 187 ? ARG D 189 ? LEU D 187 ARG D 189 AA4 2 ASP D 200 ? PHE D 202 ? ASP D 200 PHE D 202 AA5 1 LEU E 187 ? ARG E 189 ? LEU E 187 ARG E 189 AA5 2 ASP E 200 ? PHE E 202 ? ASP E 200 PHE E 202 AA6 1 LEU F 187 ? ARG F 189 ? LEU F 187 ARG F 189 AA6 2 ASP F 200 ? PHE F 202 ? ASP F 200 PHE F 202 AA7 1 LEU G 187 ? ARG G 189 ? LEU G 187 ARG G 189 AA7 2 ASP G 200 ? PHE G 202 ? ASP G 200 PHE G 202 AA8 1 LEU H 187 ? ARG H 189 ? LEU H 187 ARG H 189 AA8 2 ASP H 200 ? PHE H 202 ? ASP H 200 PHE H 202 AA9 1 LEU I 187 ? ARG I 189 ? LEU I 187 ARG I 189 AA9 2 ASP I 200 ? PHE I 202 ? ASP I 200 PHE I 202 AB1 1 LEU J 187 ? ARG J 189 ? LEU J 187 ARG J 189 AB1 2 ASP J 200 ? PHE J 202 ? ASP J 200 PHE J 202 AB2 1 LEU K 187 ? ARG K 189 ? LEU K 187 ARG K 189 AB2 2 ASP K 200 ? PHE K 202 ? ASP K 200 PHE K 202 AB3 1 LEU L 187 ? ARG L 189 ? LEU L 187 ARG L 189 AB3 2 ASP L 200 ? PHE L 202 ? ASP L 200 PHE L 202 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N TYR A 188 ? N TYR A 188 O CYS A 201 ? O CYS A 201 AA2 1 2 N TYR B 188 ? N TYR B 188 O CYS B 201 ? O CYS B 201 AA3 1 2 N TYR C 188 ? N TYR C 188 O CYS C 201 ? O CYS C 201 AA4 1 2 N TYR D 188 ? N TYR D 188 O CYS D 201 ? O CYS D 201 AA5 1 2 N TYR E 188 ? N TYR E 188 O CYS E 201 ? O CYS E 201 AA6 1 2 N TYR F 188 ? N TYR F 188 O CYS F 201 ? O CYS F 201 AA7 1 2 N TYR G 188 ? N TYR G 188 O CYS G 201 ? O CYS G 201 AA8 1 2 N TYR H 188 ? N TYR H 188 O CYS H 201 ? O CYS H 201 AA9 1 2 N TYR I 188 ? N TYR I 188 O CYS I 201 ? O CYS I 201 AB1 1 2 N TYR J 188 ? N TYR J 188 O CYS J 201 ? O CYS J 201 AB2 1 2 N TYR K 188 ? N TYR K 188 O CYS K 201 ? O CYS K 201 AB3 1 2 N TYR L 188 ? N TYR L 188 O CYS L 201 ? 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