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_entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 327 ? ? 'csy2, PA14_33320' ? UCBPP-PA14 ? ? ? ? 'Pseudomonas aeruginosa (strain UCBPP-PA14)' 208963 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 342 ? ? 'csy3, csy1-3, PA14_33310' ? UCBPP-PA14 ? ? ? ? 'Pseudomonas aeruginosa (strain UCBPP-PA14)' 208963 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 'Biological sequence' 1 189 ? ? 'cas6f, csy4, PA14_33300' ? UCBPP-PA14 ? ? ? ? 'Pseudomonas aeruginosa (strain UCBPP-PA14)' 208963 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 'Biological sequence' 1 434 ? ? 'csy1, PA14_33330' ? UCBPP-PA14 ? ? ? ? 'Pseudomonas aeruginosa (strain UCBPP-PA14)' 208963 ? ? ? ? ? ? ? ? 'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 4 1 sample 1 60 'Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14' ? 208963 ? 5 1 sample 1 44 'Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14' ? 208963 ? 6 1 sample 1 34 'Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14' ? 208963 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP CSY2_PSEAB Q02MM0 ? 1 ;MSVTDPEALLLLPRLSIQNANAISSPLTWGFPSPGAFTGFVHALQRRVGISLDIELDGVGIVCHRFEAQISQPAGKRTKV FNLTRNPLNRDGSTAAIVEEGRAHLEVSLLLGVHGDGLDDHPAQEIARQVQEQAGAMRLAGGSILPWCNERFPAPNAELL MLGGSDEQRRKNQRRLTRRLLPGFALVSREALLQQHLETLRTTLPEATTLDALLDLCRINFEPPATSSEEEASPPDAAWQ VRDKPGWLVPIPAGYNALSPLYLPGEVRNARDRETPLRFVENLFGLGEWLSPHRVAALSDLLWYHHAEPDKGLYRWSTPR FVEHAIA ; 1 2 UNP CSY3_PSEAB Q02MM1 ? 2 ;MSKPILSTASVLAFERKLDPSDALMSAGAWAQRDASQEWPAVTVREKSVRGTISNRLKTKDRDPAKLDASIQSPNLQTVD VANLPSDADTLKVRFTLRVLGGAGTPSACNDAAYRDKLLQTVATYVNDQGFAELARRYAHNLANARFLWRNRVGAEAVEV RINHIRQGEVARAWRFDALAIGLRDFKADAELDALAELIASGLSGSGHVLLEVVAFARIGDGQEVFPSQELILDKGDKKG QKSKTLYSVRDAAAIHSQKIGNALRTIDTWYPDEDGLGPIAVEPYGSVTSQGKAYRQPKQKLDFYTLLDNWVLRDEAPAV EQQHYVIANLIRGGVFGEAEEK ; 1 3 UNP CAS6_PSEAB Q02MM2 ? 3 ;MDHYLDIRLRPDPEFPPAQLMSVLFGKLHQALVAQGGDRIGVSFPDLDESRSRLGERLRIHASADDLRALLARPWLEGLR DHLQFGEPAVVPHPTPYRQVSRVQAKSNPERLRRRLMRRHDLSEEEARKRIPDTVARALDLPFVTLRSQSTGQHFRLFIR HGPLQVTAEEGGFTCYGLSKGGFVPWF ; 1 4 PDB 6MPU 6MPU ? 4 ? 1 5 PDB 6MPU 6MPU ? 5 ? 1 6 PDB 6MPU 6MPU ? 6 ? 1 7 UNP CSY1_PSEAB Q02ML9 ? 7 ;MTSPLPTPTWQELRQFIESFIQERLQGKLDKLQPDEDDKRQTLLATHRREAWLADAARRVGQLQLVTHTLKPIHPDARGS NLHSLPQAPGQPGLAGSHELGDRLVSDVVGNAAALDVFKFLSLQYQGKNLLNWLTEDSAEALQALSDNAEQAREWRQAFI GITTVKGAPASHSLAKQLYFPLPGSGYHLLAPLFPTSLVHHVHALLREARFGDAAKAAREARSRQESWPHGFSEYPNLAI QKFGGTKPQNISQLNNERRGENWLLPSLPPNWQRQNVNAPMRHSSVFEHDFGRTPEVSRLTRTLQRFLAKTVHNNLAIRQ RRAQLVAQICDEALQYAARLRELEPGWSATPGCQLHDAEQLWLDPLRAQTDETFLQRRLRGDWPAEVGNRFANWLNRAVS SDSQILGSPEAAQWSQELSKELTMFKEILEDERD ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6MPU B 1 ? 327 ? 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'expression tag' -1 1 8 6MPU THR L 2 ? UNP Q02MM2 ? ? 'expression tag' 0 2 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6MPU _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6MPU _struct.title 'Structure of double-stranded target DNA engaged Csy complex from Pseudomonas aeruginosa (PA-14)' _struct.pdbx_descriptor ;CRISPR-associated protein Csy2, CRISPR-associated protein Csy3, CRISPR-associated endonuclease Cas6/Csy4, CRISPR-associated protein Csy1/RNA Complex ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6MPU _struct_keywords.text 'type I-F CRISPR RNA-guided surveillance complex, viral protein mimic, Csy-complex, IMMUNE SYSTEM-RNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'IMMUNE SYSTEM/RNA' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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WATSON-CRICK ? ? hydrog66 hydrog ? ? J DC 37 O2 ? ? ? 1_555 K DG 21 N2 ? ? N DC 37 O DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog67 hydrog ? ? J DA 38 N1 ? ? ? 1_555 K DC 20 N4 ? ? N DA 38 O DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DC MISPAIR' ? ? hydrog68 hydrog ? ? J DG 39 N1 ? ? ? 1_555 K DG 19 O6 ? ? N DG 39 O DG 19 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DG MISPAIR' ? ? hydrog69 hydrog ? ? J DC 40 N3 ? ? ? 1_555 K DG 18 N1 ? ? N DC 40 O DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog70 hydrog ? ? J DC 40 N4 ? ? ? 1_555 K DG 18 O6 ? ? N DC 40 O DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog71 hydrog ? ? J DC 40 O2 ? ? ? 1_555 K DG 18 N2 ? ? N DC 40 O DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog72 hydrog ? ? J DT 41 N3 ? ? ? 1_555 K DA 16 N1 ? ? N DT 41 O DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog73 hydrog ? ? J DT 41 O4 ? ? ? 1_555 K DA 16 N6 ? ? N DT 41 O DA 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog74 hydrog ? ? J DT 41 N3 ? ? ? 1_555 K DC 17 N3 ? ? N DT 41 O DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? hydrog75 hydrog ? ? J DT 41 O4 ? ? ? 1_555 K DC 17 N4 ? ? N DT 41 O DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_18_PAIR ? ? hydrog76 hydrog ? ? J DT 42 O2 ? ? ? 1_555 K DC 15 N4 ? ? N DT 42 O DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DC MISPAIR' ? ? hydrog77 hydrog ? ? J DC 43 N4 ? ? ? 1_555 K DC 15 O2 ? ? N DC 43 O DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DC MISPAIR' ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 5 ? AA9 ? 7 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 4 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 5 ? AB9 ? 5 ? AC1 ? 2 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 5 ? AC4 ? 6 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 2 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 5 ? AD1 ? 6 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 2 ? AD4 ? 2 ? AD5 ? 3 ? AD6 ? 5 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 3 ? AE2 ? 3 ? AE3 ? 2 ? 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ALA A 68 ? ARG B 65 ALA B 68 AA1 2 ALA A 103 ? VAL A 113 ? ALA B 103 VAL B 113 AA1 3 ALA A 8 ? ILE A 17 ? ALA B 8 ILE B 17 AA1 4 ILE A 144 ? LEU A 145 ? ILE B 144 LEU B 145 AA2 1 ARG A 65 ? ALA A 68 ? ARG B 65 ALA B 68 AA2 2 ALA A 103 ? VAL A 113 ? ALA B 103 VAL B 113 AA2 3 ALA A 8 ? ILE A 17 ? ALA B 8 ILE B 17 AA2 4 ALA A 157 ? LEU A 160 ? ALA B 157 LEU B 160 AA3 1 ILE A 70 ? SER A 71 ? ILE B 70 SER B 71 AA3 2 VAL A 80 ? PHE A 81 ? VAL B 80 PHE B 81 AA4 1 ALA A 185 ? LEU A 186 ? ALA B 185 LEU B 186 AA4 2 TRP A 289 ? LEU A 290 ? TRP B 289 LEU B 290 AA5 1 PRO A 252 ? ALA A 257 ? PRO B 252 ALA B 257 AA5 2 PHE A 279 ? PHE A 284 ? PHE B 279 PHE B 284 AA5 3 ALA L 191 ? PRO L 192 ? ALA A 191 PRO A 192 AA6 1 TYR A 304 ? HIS A 306 ? TYR B 304 HIS B 306 AA6 2 ARG A 315 ? SER A 317 ? ARG B 315 SER B 317 AA7 1 VAL B 11 ? PHE B 14 ? VAL C 30 PHE C 33 AA7 2 GLY B 334 ? GLY B 337 ? GLY C 353 GLY C 356 AA8 1 VAL B 170 ? ALA B 173 ? VAL C 189 ALA C 192 AA8 2 ASN B 163 ? ILE B 165 ? ASN C 182 ILE C 184 AA8 3 VAL B 209 ? ARG B 218 ? VAL C 228 ARG C 237 AA8 4 ALA B 157 ? VAL B 160 ? ALA C 176 VAL C 179 AA8 5 PHE B 176 ? ASP B 177 ? PHE C 195 ASP C 196 AA9 1 VAL B 170 ? ALA B 173 ? VAL C 189 ALA C 192 AA9 2 ASN B 163 ? ILE B 165 ? ASN C 182 ILE C 184 AA9 3 VAL B 209 ? ARG B 218 ? VAL C 228 ARG C 237 AA9 4 THR B 90 ? VAL B 99 ? THR C 109 VAL C 118 AA9 5 ALA B 23 ? GLY B 28 ? ALA C 42 GLY C 47 AA9 6 ALA B 252 ? ILE B 255 ? ALA C 271 ILE C 274 AA9 7 SER B 248 ? VAL B 249 ? SER C 267 VAL C 268 AB1 1 ARG B 45 ? LYS B 47 ? ARG C 64 LYS C 66 AB1 2 VAL B 79 ? VAL B 81 ? VAL C 98 VAL C 100 AB2 1 THR B 266 ? ASP B 268 ? THR C 285 ASP C 287 AB2 2 ILE B 280 ? ALA B 281 ? ILE C 299 ALA C 300 AB3 1 ASP C 19 ? PRO C 20 ? ASP D 38 PRO D 39 AB3 2 LEU C 91 ? ARG C 98 ? LEU D 110 ARG D 117 AB3 3 LEU C 210 ? ALA C 217 ? LEU D 229 ALA D 236 AB3 4 VAL C 158 ? ILE C 165 ? VAL D 177 ILE D 184 AB3 5 VAL C 170 ? ALA C 173 ? VAL D 189 ALA D 192 AB4 1 ASP C 19 ? PRO C 20 ? ASP D 38 PRO D 39 AB4 2 LEU C 91 ? ARG C 98 ? LEU D 110 ARG D 117 AB4 3 ALA C 23 ? ALA C 27 ? ALA D 42 ALA D 46 AB4 4 ALA C 254 ? ILE C 255 ? ALA D 273 ILE D 274 AB5 1 ARG C 45 ? ARG C 50 ? ARG D 64 ARG D 69 AB5 2 LEU C 76 ? VAL C 81 ? LEU D 95 VAL D 100 AB6 1 SER C 287 ? VAL C 288 ? SER D 306 VAL D 307 AB6 2 LYS C 293 ? ALA C 294 ? LYS D 312 ALA D 313 AB7 1 LEU D 12 ? PHE D 14 ? LEU E 31 PHE E 33 AB7 2 GLY D 334 ? PHE D 336 ? GLY E 353 PHE E 355 AB8 1 ASP D 19 ? PRO D 20 ? ASP E 38 PRO E 39 AB8 2 THR D 90 ? ARG D 98 ? THR E 109 ARG E 117 AB8 3 LEU D 210 ? ALA D 217 ? LEU E 229 ALA E 236 AB8 4 VAL D 158 ? ILE D 165 ? VAL E 177 ILE E 184 AB8 5 VAL D 170 ? ASP D 177 ? VAL E 189 ASP E 196 AB9 1 ASP D 19 ? PRO D 20 ? ASP E 38 PRO E 39 AB9 2 THR D 90 ? ARG D 98 ? THR E 109 ARG E 117 AB9 3 ALA D 23 ? GLY D 28 ? ALA E 42 GLY E 47 AB9 4 ALA D 252 ? ILE D 255 ? ALA E 271 ILE E 274 AB9 5 SER D 248 ? VAL D 249 ? SER E 267 VAL E 268 AC1 1 VAL D 44 ? ARG D 50 ? VAL E 63 ARG E 69 AC1 2 LEU D 76 ? ALA D 82 ? LEU E 95 ALA E 101 AC2 1 ALA E 108 ? CYS E 109 ? ALA F 127 CYS F 128 AC2 2 LEU E 12 ? PHE E 14 ? LEU F 31 PHE F 33 AC2 3 GLY E 334 ? PHE E 336 ? GLY F 353 PHE F 355 AC3 1 ASP E 19 ? PRO E 20 ? ASP F 38 PRO F 39 AC3 2 THR E 90 ? VAL E 99 ? THR F 109 VAL F 118 AC3 3 VAL E 209 ? ALA E 217 ? VAL F 228 ALA F 236 AC3 4 VAL E 158 ? VAL E 160 ? VAL F 177 VAL F 179 AC3 5 PHE E 176 ? ASP E 177 ? PHE F 195 ASP F 196 AC4 1 VAL E 170 ? ALA E 173 ? VAL F 189 ALA F 192 AC4 2 ASN E 163 ? ILE E 165 ? ASN F 182 ILE F 184 AC4 3 VAL E 209 ? ALA E 217 ? VAL F 228 ALA F 236 AC4 4 THR E 90 ? VAL E 99 ? THR F 109 VAL F 118 AC4 5 ALA E 23 ? GLY E 28 ? ALA F 42 GLY F 47 AC4 6 ALA E 254 ? ILE E 255 ? ALA F 273 ILE F 274 AC5 1 ARG E 45 ? THR E 52 ? ARG F 64 THR F 71 AC5 2 PRO E 74 ? ASN E 83 ? PRO F 93 ASN F 102 AC5 3 GLU E 224 ? VAL E 225 ? GLU F 243 VAL F 244 AC6 1 THR E 266 ? ASP E 268 ? THR F 285 ASP F 287 AC6 2 ILE E 280 ? ALA E 281 ? ILE F 299 ALA F 300 AC7 1 SER E 287 ? VAL E 288 ? 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THR A . n L 7 374 PHE 374 374 374 PHE PHE A . n L 7 375 LEU 375 375 375 LEU LEU A . n L 7 376 GLN 376 376 376 GLN GLN A . n L 7 377 ARG 377 377 377 ARG ARG A . n L 7 378 ARG 378 378 378 ARG ARG A . n L 7 379 LEU 379 379 379 LEU LEU A . n L 7 380 ARG 380 380 380 ARG ARG A . n L 7 381 GLY 381 381 381 GLY GLY A . n L 7 382 ASP 382 382 382 ASP ASP A . n L 7 383 TRP 383 383 383 TRP TRP A . n L 7 384 PRO 384 384 384 PRO PRO A . n L 7 385 ALA 385 385 385 ALA ALA A . n L 7 386 GLU 386 386 386 GLU GLU A . n L 7 387 VAL 387 387 387 VAL VAL A . n L 7 388 GLY 388 388 388 GLY GLY A . n L 7 389 ASN 389 389 389 ASN ASN A . n L 7 390 ARG 390 390 390 ARG ARG A . n L 7 391 PHE 391 391 391 PHE PHE A . n L 7 392 ALA 392 392 392 ALA ALA A . n L 7 393 ASN 393 393 393 ASN ASN A . n L 7 394 TRP 394 394 394 TRP TRP A . n L 7 395 LEU 395 395 395 LEU LEU A . n L 7 396 ASN 396 396 396 ASN ASN A . n L 7 397 ARG 397 397 397 ARG ARG A . n L 7 398 ALA 398 398 398 ALA ALA A . n L 7 399 VAL 399 399 399 VAL VAL A . n L 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A . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dodecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 12 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 69010 ? 1 MORE -201 ? 1 'SSA (A^2)' 118820 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2018-10-24 2 'Structure model' 1 1 2018-12-26 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? 2 2 'Structure model' repository Obsolete ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' Advisory 2 2 'Structure model' 'Data collection' 3 2 'Structure model' Other # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' pdbx_database_PDB_obs_spr 2 2 'Structure model' pdbx_database_status # _pdbx_audit_revision_item.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal 2 _pdbx_audit_revision_item.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_item.item '_pdbx_database_status.status_code' # _em_3d_fitting.entry_id 6MPU _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ;The atomic models for Cas5f, Cas8f, Cas6f, and Cas7f from the Csy Acr complex (PDB ID 5UZ9) were used as initial template models for model building. These were individually rigid body-fitted into the reconstructed maps using the fit map function in UCSF Chimera, and residue registers and backbone geometries were fixed in Coot. Models for the crRNA and DNA strands were also manually built into the map using Coot. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol 'AB INITIO MODEL' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 5UZ9 # _em_3d_reconstruction.entry_id 6MPU _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.details ;The final map was reconstructed using several focused maps from different subregions of the complex. These were initially aligned to each other and then stitched using the vop maximum function in UCSF Chimera. The resolution of the final composite map is 3.2 Angstrom. ; _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 291227 _em_3d_reconstruction.resolution 3.4 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.name 'Double-stranded target DNA engaged Csy Complex from Pseudomonas aeruginosa (PA-14)' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list '1, 2, 3, 4, 5, 6, 7' _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 6MPU _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height 7420 _em_image_scans.dimension_width 7676 _em_image_scans.frames_per_image 56 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size 2.5 _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image 1-56 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 6MPU _em_imaging.accelerating_voltage 200 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 70 _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details 'Objective astigmatism was corrected at 36000x magnification using Thon rings visualized with a K2 camera.' _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TALOS ARCTICA' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 1500 _em_imaging.nominal_defocus_min 600 _em_imaging.nominal_magnification 36000 _em_imaging.recording_temperature_maximum 79 _em_imaging.recording_temperature_minimum 77 _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil, UltrAuFoil, R1.2/1.3' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;Freezing was carried out in a cold room at 4 degrees C and relative humidity of 98%. 5 uL sample was applied to plasma cleaned grid and manually blotted with Whatman 1 filter paper for 5-7 sec before plunge freezing. ; _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.instrument 'HOMEMADE PLUNGER' _em_vitrification.entry_id 6MPU _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 6MPU _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 6MPU _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 O H GLU 302 ? ? 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L GLU 432 168 1 Y 1 A ARG 433 ? L ARG 433 169 1 Y 1 A ASP 434 ? L ASP 434 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM C8H18N2O4S HEPES 1 2 100 mM KCl 'potassium chloride' 1 3 1 mM C9H15O6P TCEP 1 4 2 '% (v/v)' C3H8O3 glycerol 1 5 0.05 '% (v/v)' C47H88O22 'lauryl maltose neopentyl glycol' # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 0.36 # _em_entity_assembly_naturalsource.id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 208963 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Pseudomonas aeruginosa (strain UCBPP-PA14)' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 1 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 469008 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Escherichia coli BL21(DE3)' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ;Super-resolution movie frames were Fourier-binned 2 x 2 times to a pixel size of 1.15 Angstrom/pixel prior to dose-weighted frame alignment using MotionCorr2. ; # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 58 _em_image_recording.average_exposure_time 14 _em_image_recording.details 'Data were acquired using Leginon and collected on K2 summit operating in super-resolution mode.' _em_image_recording.detector_mode SUPER-RESOLUTION _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 4 _em_image_recording.num_real_images 3208 # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name ? _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width ? _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ;Particles were initially extracted binned by 2 with a box size of 144 pixels (2.3 Angstrom/pixel). The final processing was carried out with an unbinned particle stack with a box size of 288 pixels (1.15 Angstrom/pixel). ; _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 1543677 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' 'Automated data acquisition software' Leginon 3.0 ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 4 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' 1.12 ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 2.0 1 ? ? 10 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION 2.1 1 ? ? 11 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 12 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? 13 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX 1.14 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 2 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6MPU 'double helix' 6MPU 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 I U 9 1_555 J DA 32 1_555 0.061 -0.041 -0.049 -10.856 17.241 -1.266 1 M_U9:DA32_N M 9 ? N 32 ? 20 1 1 I U 10 1_555 J DA 31 1_555 -0.137 -0.171 0.134 0.428 28.889 -3.625 2 M_U10:DA31_N M 10 ? N 31 ? 20 1 1 I C 11 1_555 J DG 30 1_555 0.186 -0.200 -0.090 -0.648 1.122 2.299 3 M_C11:DG30_N M 11 ? N 30 ? 19 1 1 I A 12 1_555 J DT 29 1_555 0.865 5.266 -0.081 -5.626 22.951 -96.468 4 M_A12:DT29_N M 12 ? N 29 ? ? ? 1 I C 13 1_555 J DG 28 1_555 0.331 -0.362 0.717 0.312 14.173 16.925 5 M_C13:DG28_N M 13 ? N 28 ? 22 1 1 I G 15 1_555 J DC 26 1_555 -0.097 -0.120 -0.443 -14.865 13.698 3.141 6 M_G15:DC26_N M 15 ? N 26 ? 19 1 1 I C 16 1_555 J DG 25 1_555 0.160 -0.122 -0.115 -0.779 14.415 1.212 7 M_C16:DG25_N M 16 ? N 25 ? 19 1 1 I G 17 1_555 J DC 24 1_555 -0.139 -0.124 0.570 12.951 8.389 2.114 8 M_G17:DC24_N M 17 ? N 24 ? 19 1 1 I G 18 1_555 J DC 23 1_555 -0.163 -0.175 0.429 -1.456 10.278 2.463 9 M_G18:DC23_N M 18 ? N 23 ? 19 1 1 I G 19 1_555 J DC 22 1_555 -0.199 -0.262 0.714 7.758 11.028 3.567 10 M_G19:DC22_N M 19 ? N 22 ? 19 1 1 I U 21 1_555 J DA 20 1_555 -1.211 -4.931 0.971 -2.616 17.755 70.158 11 M_U21:DA20_N M 21 ? N 20 ? ? 3 1 I U 22 1_555 J DA 19 1_555 0.066 -0.166 -0.206 -1.418 8.569 7.568 12 M_U22:DA19_N M 22 ? N 19 ? 20 1 1 I G 23 1_555 J DC 18 1_555 -0.106 -0.161 0.627 10.635 3.671 0.798 13 M_G23:DC18_N M 23 ? N 18 ? 19 1 1 I U 25 1_555 J DA 16 1_555 0.092 -0.341 0.868 4.595 10.703 8.126 14 M_U25:DA16_N M 25 ? N 16 ? 20 1 1 I U 27 1_555 J DA 14 1_555 -0.138 -0.175 -0.262 -13.017 11.974 -2.014 15 M_U27:DA14_N M 27 ? N 14 ? 20 1 1 I C 28 1_555 J DG 13 1_555 0.114 -0.207 -0.088 -1.107 20.380 -1.424 16 M_C28:DG13_N M 28 ? N 13 ? 19 1 1 I C 29 1_555 J DG 12 1_555 0.165 -0.181 0.560 4.978 -3.153 0.490 17 M_C29:DG12_N M 29 ? N 12 ? 19 1 1 I G 30 1_555 J DC 11 1_555 -0.107 -0.116 -0.234 -9.923 7.761 0.151 18 M_G30:DC11_N M 30 ? N 11 ? 19 1 1 I C 31 1_555 J DG 10 1_555 0.184 -0.260 0.657 1.045 3.173 2.434 19 M_C31:DG10_N M 31 ? N 10 ? 19 1 1 I C 34 1_555 J DG 7 1_555 0.110 -0.211 -0.809 -4.683 1.762 -0.278 20 M_C34:DG7_N M 34 ? N 7 ? 19 1 1 I U 35 1_555 J DA 6 1_555 1.308 0.008 -0.156 12.269 -8.933 14.195 21 M_U35:DA6_N M 35 ? N 6 ? 20 1 1 I A 36 1_555 J DT 5 1_555 -0.706 0.645 0.407 -28.840 9.604 -5.169 22 M_A36:DT5_N M 36 ? N 5 ? ? ? 1 I U 39 1_555 J DA 2 1_555 -0.348 0.969 -0.720 -55.768 10.074 -126.998 23 M_U39:DA2_N M 39 ? N 2 ? 20 1 1 I G 48 1_555 I C 50 1_555 1.951 -7.853 -1.112 -10.965 -41.501 87.672 24 M_G48:C50_M M 48 ? M 50 ? ? 7 1 J DG 33 1_555 K DT 25 1_555 2.857 -4.508 -0.603 -11.508 -19.748 96.074 25 N_DG33:DT25_O N 33 ? O 25 ? ? ? 1 J DG 34 1_555 K DC 24 1_555 -0.087 -0.356 1.266 14.464 2.170 -3.117 26 N_DG34:DC24_O N 34 ? O 24 ? 19 1 1 J DT 35 1_555 K DG 23 1_555 -1.391 0.384 0.358 15.170 -10.042 -13.406 27 N_DT35:DG23_O N 35 ? O 23 ? ? 1 1 J DC 37 1_555 K DG 21 1_555 0.243 -0.170 -0.224 2.561 -14.982 0.559 28 N_DC37:DG21_O N 37 ? O 21 ? 19 1 1 J DA 38 1_555 K DC 20 1_555 2.243 0.059 -0.382 -0.858 -22.889 12.262 29 N_DA38:DC20_O N 38 ? O 20 ? ? 1 1 J DG 39 1_555 K DG 19 1_555 0.975 1.389 -1.584 -7.765 -19.400 14.002 30 N_DG39:DG19_O N 39 ? O 19 ? ? ? 1 J DC 40 1_555 K DG 18 1_555 0.167 -0.270 -0.841 -6.066 -2.834 3.280 31 N_DC40:DG18_O N 40 ? O 18 ? 19 1 1 J DT 41 1_555 K DA 16 1_555 -0.573 -1.052 -1.971 -12.351 1.289 -29.568 32 N_DT41:DA16_O N 41 ? O 16 ? 20 1 1 J DC 43 1_555 K DC 15 1_555 -4.255 -4.607 -1.712 7.752 25.105 -92.591 33 N_DC43:DC15_O N 43 ? O 15 ? ? 4 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 I U 9 1_555 J DA 32 1_555 I U 10 1_555 J DA 31 1_555 -0.250 1.551 3.657 -2.433 15.173 3.205 -11.779 -1.884 2.287 77.304 12.396 15.696 1 MM_U9U10:DA31DA32_NN M 9 ? N 32 ? M 10 ? N 31 ? 1 I U 10 1_555 J DA 31 1_555 I C 11 1_555 J DG 30 1_555 1.055 1.304 3.727 -0.122 27.883 4.738 -7.059 -2.202 1.912 80.545 0.352 28.275 2 MM_U10C11:DG30DA31_NN M 10 ? N 31 ? M 11 ? N 30 ? 1 I C 11 1_555 J DG 30 1_555 I A 12 1_555 J DT 29 1_555 1.165 -0.163 3.664 25.291 49.023 58.085 -1.842 -0.038 3.064 41.856 -21.593 78.407 3 MM_C11A12:DT29DG30_NN M 11 ? N 30 ? M 12 ? N 29 ? 1 I A 12 1_555 J DT 29 1_555 I C 13 1_555 J DG 28 1_555 0.395 4.170 3.456 -0.723 12.245 -39.656 -7.039 0.491 2.137 -17.548 -1.035 -41.436 4 MM_A12C13:DG28DT29_NN M 12 ? N 29 ? M 13 ? N 28 ? 1 I G 15 1_555 J DC 26 1_555 I C 16 1_555 J DG 25 1_555 -0.677 0.953 3.478 -2.100 11.761 10.947 -6.750 0.593 3.134 46.907 8.377 16.191 5 MM_G15C16:DG25DC26_NN M 15 ? N 26 ? M 16 ? N 25 ? 1 I C 16 1_555 J DG 25 1_555 I G 17 1_555 J DC 24 1_555 1.111 1.640 3.573 -2.580 13.439 6.005 -9.204 -7.251 2.722 65.226 12.521 14.938 6 MM_C16G17:DC24DG25_NN M 16 ? N 25 ? M 17 ? 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