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1873 ? P21675 21 ? 1893 ? 21 1893 2 2 6MZD C 1 ? 929 ? Q5VWG9 1 ? 929 ? 28 956 3 3 6MZD D 1 ? 1085 ? O00268 1 ? 1085 ? 1 1085 4 4 6MZD F 1 ? 496 ? Q15542 1 ? 496 ? 1 496 5 5 6MZD F 497 ? 536 ? 6MZD 497 ? 536 ? 497 536 6 6 6MZD F 537 ? 800 ? Q15542 537 ? 800 ? 537 800 7 7 6MZD H 1 ? 677 ? P49848 1 ? 677 ? 1 677 8 8 6MZD L 1 ? 109 ? Q16594 1 ? 109 ? 1 109 9 9 6MZD L 110 ? 116 ? 6MZD 110 ? 116 ? 110 116 10 10 6MZD L 117 ? 264 ? Q16594 117 ? 264 ? 117 264 11 11 6MZD N 1 ? 218 ? Q12962 1 ? 218 ? 1 218 12 12 6MZD P 1 ? 211 ? Q15544 1 ? 211 ? 1 211 13 13 6MZD Q 1 ? 161 ? Q16514 1 ? 161 ? 1 161 14 14 6MZD S 1 ? 124 ? Q15543 1 ? 124 ? 1 124 15 15 6MZD T 1 ? 339 ? P20226 1 ? 339 ? 1 339 16 16 6MZD Y 1 ? 96 ? 6MZD 2 ? 328 ? 2 328 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 UNK 'L-peptide linking' . UNKNOWN ? 'C4 H9 N O2' 103.120 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6MZD _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 6MZD _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 11324 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.974 ? 15355 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 4.969 ? 6855 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.056 ? 1772 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.006 ? 1995 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6MZD _struct.title 'Human TFIID Lobe A canonical' _struct.pdbx_descriptor ;Transcription initiation factor TFIID subunit 1 (E.C.2.3.1.48,2.7.11.1), Transcription initiation factor TFIID subunit 3, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, Transcription initiation factor TFIID subunit 5, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, Transcription initiation factor TFIID subunit 9,TAF9,Transcription initiation factor TFIID subunit 9, Transcription initiation factor TFIID subunit 10, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, Transcription initiation factor TFIID subunit 12, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, TATA-box-binding protein, Unk ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6MZD _struct_keywords.text 'Transcription, DNA, Nuclear' _struct_keywords.pdbx_keywords TRANSCRIPTION # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 18 ? GLY A 24 ? LEU A 38 GLY A 44 1 ? 7 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 39 ? GLY A 50 ? ASP A 59 GLY A 70 1 ? 12 HELX_P HELX_P3 AA3 LEU A 54 ? THR A 62 ? LEU A 74 THR A 82 1 ? 9 HELX_P HELX_P4 AA4 GLU B 3 ? GLY B 22 ? 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ASN F 327 LEU F 337 1 ? 11 HELX_P HELX_P19 AC1 UNK D 510 ? UNK D 518 ? UNK F 510 UNK F 518 1 ? 9 HELX_P HELX_P20 AC2 PRO E 15 ? MET E 26 ? PRO H 15 MET H 26 1 ? 12 HELX_P HELX_P21 AC3 GLN E 32 ? HIS E 59 ? GLN H 32 HIS H 59 1 ? 28 HELX_P HELX_P22 AC4 THR E 67 ? LEU E 75 ? THR H 67 LEU H 75 1 ? 9 HELX_P HELX_P23 AC5 LYS F 14 ? GLY F 27 ? LYS L 14 GLY L 27 1 ? 14 HELX_P HELX_P24 AC6 GLU F 32 ? HIS F 60 ? GLU L 32 HIS L 60 1 ? 29 HELX_P HELX_P25 AC7 ASP F 67 ? PHE F 83 ? ASP L 67 PHE L 83 1 ? 17 HELX_P HELX_P26 AC8 PRO F 87 ? GLN F 101 ? PRO L 87 GLN L 101 1 ? 15 HELX_P HELX_P27 AC9 THR G 114 ? LEU G 123 ? THR N 114 LEU N 123 1 ? 10 HELX_P HELX_P28 AD1 PRO G 131 ? ALA G 142 ? PRO N 131 ALA N 142 1 ? 12 HELX_P HELX_P29 AD2 ASP G 148 ? HIS G 173 ? ASP N 148 HIS N 173 1 ? 26 HELX_P HELX_P30 AD3 THR G 196 ? LEU G 204 ? THR N 196 LEU N 204 1 ? 9 HELX_P HELX_P31 AD4 SER H 114 ? ARG H 126 ? SER P 114 ARG P 126 1 ? 13 HELX_P HELX_P32 AD5 PRO H 130 ? SER H 140 ? PRO P 130 SER P 140 1 ? 11 HELX_P HELX_P33 AD6 SER H 147 ? TRP H 176 ? SER P 147 TRP P 176 1 ? 30 HELX_P HELX_P34 AD7 GLN H 183 ? LYS H 197 ? GLN P 183 LYS P 197 1 ? 15 HELX_P HELX_P35 AD8 THR I 59 ? ASP I 71 ? THR Q 59 ASP Q 71 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 AD9 GLU I 78 ? ARG I 106 ? GLU Q 78 ARG Q 106 1 ? 29 HELX_P HELX_P37 AE1 GLU I 112 ? TRP I 124 ? GLU Q 112 TRP Q 124 1 ? 13 HELX_P HELX_P38 AE2 LEU J 36 ? TYR J 41 ? LEU S 36 TYR S 41 1 ? 6 HELX_P HELX_P39 AE3 GLY J 42 ? GLY J 44 ? GLY S 42 GLY S 44 5 ? 3 HELX_P HELX_P40 AE4 TYR J 50 ? SER J 74 ? TYR S 50 SER S 74 1 ? 25 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP K 179 ? ALA K 187 ? ASP T 179 ALA T 187 1 ? 9 HELX_P HELX_P42 AE6 SER K 226 ? LEU K 244 ? SER T 226 LEU T 244 1 ? 19 HELX_P HELX_P43 AE7 ARG K 269 ? HIS K 277 ? ARG T 269 HIS T 277 1 ? 9 HELX_P HELX_P44 AE8 VAL K 317 ? PHE K 335 ? VAL T 317 PHE T 335 1 ? 19 HELX_P HELX_P45 AE9 UNK L 3 ? UNK L 17 ? UNK Y 4 UNK Y 18 1 ? 15 HELX_P HELX_P46 AF1 UNK L 53 ? UNK L 59 ? UNK Y 120 UNK Y 126 1 ? 7 HELX_P HELX_P47 AF2 UNK L 68 ? UNK L 73 ? UNK Y 135 UNK Y 140 1 ? 6 HELX_P HELX_P48 AF3 UNK L 78 ? UNK L 87 ? 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