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EMDB EMD-0404 ? ? # loop_ _pdbx_audit_revision_history.ordinal _pdbx_audit_revision_history.data_content_type _pdbx_audit_revision_history.major_revision _pdbx_audit_revision_history.minor_revision _pdbx_audit_revision_history.revision_date 1 'Structure model' 1 0 2019-02-06 2 'Structure model' 1 1 2019-02-20 3 'Structure model' 1 2 2019-03-06 4 'Structure model' 1 3 2020-01-08 5 'Structure model' 2 0 2020-07-29 6 'Structure model' 2 1 2024-10-16 # loop_ _pdbx_audit_revision_details.ordinal _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_details.data_content_type _pdbx_audit_revision_details.provider _pdbx_audit_revision_details.type _pdbx_audit_revision_details.description _pdbx_audit_revision_details.details 1 1 'Structure model' repository 'Initial release' ? ? 2 5 'Structure model' repository Remediation 'Carbohydrate remediation' ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' 3 2 'Structure model' Other 4 3 'Structure model' 'Data collection' 5 3 'Structure model' 'Database references' 6 4 'Structure model' 'Author supporting evidence' 7 5 'Structure model' 'Atomic model' 8 5 'Structure model' 'Data collection' 9 5 'Structure model' 'Derived calculations' 10 5 'Structure model' 'Structure summary' 11 6 'Structure model' 'Data collection' 12 6 'Structure model' 'Database references' 13 6 'Structure model' 'Structure summary' # 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_pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6NB7 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2018-12-06 _pdbx_database_status.SG_entry Y _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type EMDB 'SARS-CoV complex with human neutralizing S230 antibody Fab fragment (state 2)' EMD-0404 'associated EM volume' PDB . 6NB3 unspecified PDB . 6NB4 unspecified PDB . 6NB5 unspecified PDB . 6NB6 unspecified PDB . 6NB8 unspecified EMDB . 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'Seattle Structural Genomics Center for Infectious Disease (SSGCID)' 15 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Cell _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1097-4172 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 176 _citation.language ? _citation.page_first 1026 _citation.page_last 1039.e15 _citation.title 'Unexpected Receptor Functional Mimicry Elucidates Activation of Coronavirus Fusion.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.cell.2018.12.028 _citation.pdbx_database_id_PubMed 30712865 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Walls, A.C.' 1 ? primary 'Xiong, X.' 2 ? primary 'Park, Y.J.' 3 ? primary 'Tortorici, M.A.' 4 ? primary 'Snijder, J.' 5 ? primary 'Quispe, J.' 6 ? primary 'Cameroni, E.' 7 ? primary 'Gopal, R.' 8 ? primary 'Dai, M.' 9 ? primary 'Lanzavecchia, A.' 10 ? primary 'Zambon, M.' 11 ? primary 'Rey, F.A.' 12 ? primary 'Corti, D.' 13 ? primary 'Veesler, D.' 14 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Spike glycoprotein' 139815.969 3 ? ? ? ? 2 polymer man 'S230 heavy chain' 14314.899 3 ? ? ? ? 3 polymer man 'S230 light chain' 12329.663 3 ? ? ? ? 4 branched man 'beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 586.542 21 ? ? ? ? 5 branched man 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;QAQLVESGGALVQPGRSLRLSCAASGFTFRNYAMHWVRQAPATGLQWLAVITSDGRNKFYADSVKGRFTISREDSKNTLY LQMDSLRGEDTAVYYCVTQRDNSRDYFPHYFHDMDVWGQGTTVAVSS ; D,G,H ? 3 'polypeptide(L)' no no ;DVVLTQSPLSLPVTLGQPASISCRSSQSLVYSDGDTYLNWFQQRPGQSPRRLIYQVSNRDSGVPDRFSGSGSGTDFTLKI SRVEAEDVGVYYCMQGSHWPPTFGQGTKVEIK ; ;DVVLTQSPLSLPVTLGQPASISCRSSQSLVYSDGDTYLNWFQQRPGQSPRRLIYQVSNRDSGVPDRFSGSGSGTDFTLKI SRVEAEDVGVYYCMQGSHWPPTFGQGTKVEIK ; E,I,L ? # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 9 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 GLY n 1 3 ILE n 1 4 LEU n 1 5 PRO n 1 6 SER n 1 7 PRO n 1 8 GLY n 1 9 MET n 1 10 PRO n 1 11 ALA n 1 12 LEU n 1 13 LEU n 1 14 SER n 1 15 LEU n 1 16 VAL n 1 17 SER n 1 18 LEU n 1 19 LEU n 1 20 SER n 1 21 VAL n 1 22 LEU n 1 23 LEU n 1 24 MET n 1 25 GLY n 1 26 CYS n 1 27 VAL n 1 28 ALA n 1 29 GLU n 1 30 THR n 1 31 GLY n 1 32 THR n 1 33 SER n 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GLU L 84 VAL L 88 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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A CYS 667 SG ? ? ? 1_555 A CYS 676 SG ? ? A CYS 648 A CYS 657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf11 disulf ? ? A CYS 739 SG ? ? ? 1_555 A CYS 761 SG ? ? A CYS 720 A CYS 742 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf12 disulf ? ? A CYS 744 SG ? ? ? 1_555 A CYS 750 SG ? ? A CYS 725 A CYS 731 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? ? disulf13 disulf ? ? A CYS 841 SG ? ? ? 1_555 A CYS 852 SG ? ? A CYS 822 A CYS 833 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? ? disulf14 disulf ? ? A CYS 1033 SG ? ? ? 1_555 A CYS 1044 SG ? ? A CYS 1014 A CYS 1025 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf15 disulf ? ? A CYS 1083 SG ? ? ? 1_555 A CYS 1127 SG ? ? A CYS 1064 A CYS 1108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf16 disulf ? ? B CYS 38 SG ? ? ? 1_555 B CYS 152 SG ? ? B CYS 19 B CYS 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf17 disulf ? ? B CYS 147 SG ? ? ? 1_555 B CYS 178 SG ? ? B CYS 128 B CYS 159 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf18 disulf ? ? B CYS 297 SG ? ? ? 1_555 B CYS 307 SG ? ? B CYS 278 B CYS 288 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf19 disulf ? ? B CYS 342 SG ? ? ? 1_555 B CYS 367 SG ? ? B CYS 323 B CYS 348 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf20 disulf ? ? B CYS 385 SG ? ? ? 1_555 B CYS 438 SG ? ? B CYS 366 B CYS 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf21 disulf ? ? B CYS 397 SG ? ? ? 1_555 B CYS 530 SG ? ? B CYS 378 B CYS 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.047 ? ? disulf22 disulf ? ? B CYS 486 SG ? ? ? 1_555 B CYS 493 SG ? ? B CYS 467 B CYS 474 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? ? disulf23 disulf ? ? B CYS 543 SG ? ? ? 1_555 B CYS 595 SG ? ? B CYS 524 B CYS 576 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf24 disulf ? ? B CYS 622 SG ? ? ? 1_555 B CYS 654 SG ? ? B CYS 603 B CYS 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.099 ? ? disulf25 disulf ? ? B CYS 667 SG ? ? ? 1_555 B CYS 676 SG ? ? B CYS 648 B CYS 657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf26 disulf ? ? B CYS 739 SG ? ? ? 1_555 B CYS 761 SG ? ? B CYS 720 B CYS 742 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.060 ? ? disulf27 disulf ? ? B CYS 744 SG ? ? ? 1_555 B CYS 750 SG ? ? B CYS 725 B CYS 731 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.056 ? ? disulf28 disulf ? ? B CYS 841 SG ? ? ? 1_555 B CYS 852 SG ? ? B CYS 822 B CYS 833 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? ? disulf29 disulf ? ? B CYS 1033 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1044 SG ? ? B CYS 1014 B CYS 1025 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf30 disulf ? ? B CYS 1083 SG ? ? ? 1_555 B CYS 1127 SG ? ? B CYS 1064 B CYS 1108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf31 disulf ? ? C CYS 38 SG ? ? ? 1_555 C CYS 152 SG ? ? C CYS 19 C CYS 133 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf32 disulf ? ? C CYS 147 SG ? ? ? 1_555 C CYS 178 SG ? ? C CYS 128 C CYS 159 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf33 disulf ? ? C CYS 297 SG ? ? ? 1_555 C CYS 307 SG ? ? C CYS 278 C CYS 288 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf34 disulf ? ? C CYS 342 SG ? ? ? 1_555 C CYS 367 SG ? ? C CYS 323 C CYS 348 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.019 ? ? disulf35 disulf ? ? C CYS 385 SG ? ? ? 1_555 C CYS 438 SG ? ? C CYS 366 C CYS 419 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf36 disulf ? ? C CYS 397 SG ? ? ? 1_555 C CYS 530 SG ? ? C CYS 378 C CYS 511 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf37 disulf ? ? C CYS 486 SG ? ? ? 1_555 C CYS 493 SG ? ? C CYS 467 C CYS 474 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.018 ? ? disulf38 disulf ? ? C CYS 543 SG ? ? ? 1_555 C CYS 595 SG ? ? C CYS 524 C CYS 576 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf39 disulf ? ? C CYS 622 SG ? ? ? 1_555 C CYS 654 SG ? ? C CYS 603 C CYS 635 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf40 disulf ? ? C CYS 667 SG ? ? ? 1_555 C CYS 676 SG ? ? C CYS 648 C CYS 657 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf41 disulf ? ? C CYS 739 SG ? ? ? 1_555 C CYS 761 SG ? ? C CYS 720 C CYS 742 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf42 disulf ? ? C CYS 744 SG ? ? ? 1_555 C CYS 750 SG ? ? C CYS 725 C CYS 731 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.061 ? ? disulf43 disulf ? ? C CYS 841 SG ? ? ? 1_555 C CYS 852 SG ? ? C CYS 822 C CYS 833 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.072 ? ? disulf44 disulf ? ? C CYS 1033 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1044 SG ? ? C CYS 1014 C CYS 1025 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf45 disulf ? ? C CYS 1083 SG ? ? ? 1_555 C CYS 1127 SG ? ? C CYS 1064 C CYS 1108 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf46 disulf ? ? D CYS 22 SG ? ? ? 1_555 D CYS 96 SG ? ? D CYS 22 D CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf47 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 93 SG ? ? E CYS 23 E CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.060 ? ? disulf48 disulf ? ? F CYS 22 SG ? ? ? 1_555 F CYS 96 SG ? ? G CYS 22 G CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf49 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf50 disulf ? ? H CYS 23 SG ? ? ? 1_555 H CYS 93 SG ? ? I CYS 23 I CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? ? disulf51 disulf ? ? I CYS 23 SG ? ? ? 1_555 I CYS 93 SG ? ? L CYS 23 L CYS 93 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? ? covale1 covale one ? A ASN 84 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? A ASN 65 A NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 92 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? A ASN 73 A NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 128 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? A ASN 109 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.410 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 138 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? A ASN 119 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 177 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? A ASN 158 A NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? A ASN 227 A NAG 1311 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 288 ND2 ? ? ? 1_555 L NAG . C1 ? ? A ASN 269 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 337 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 318 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 349 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? A ASN 330 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 376 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? A ASN 357 A NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 608 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? A ASN 589 A NAG 1321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 621 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? A ASN 602 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 710 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 691 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.397 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 718 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? A ASN 699 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? A ASN 802 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? A ASN 783 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? A ASN 1075 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? A ASN 1056 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? A ASN 1099 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? A ASN 1080 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? A ASN 1135 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 1116 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? B ASN 48 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? B ASN 29 B NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? B ASN 84 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? B ASN 65 B NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? B ASN 128 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? B ASN 109 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.410 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? B ASN 138 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? B ASN 119 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.397 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? B ASN 177 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? B ASN 158 B NAG 1309 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? B ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? B ASN 227 B NAG 1310 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? B ASN 288 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? B ASN 269 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? B ASN 337 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? B ASN 318 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.407 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? B ASN 349 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? B ASN 330 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? B ASN 376 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? B ASN 357 B NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? B ASN 608 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? B ASN 589 B NAG 1320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? B ASN 621 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? B ASN 602 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? B ASN 710 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? B ASN 691 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.405 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? B ASN 718 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? B ASN 699 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? B ASN 802 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? B ASN 783 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.406 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? B ASN 1075 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? B ASN 1056 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.400 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? B ASN 1099 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? B ASN 1080 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? B ASN 1135 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? B ASN 1116 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? C ASN 84 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? C ASN 65 C NAG 1302 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.388 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? C ASN 92 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? C ASN 73 C NAG 1303 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? C ASN 128 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? C ASN 109 h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.422 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? C ASN 138 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? C ASN 119 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.389 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? C ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? C ASN 227 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.410 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? C ASN 288 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? C ASN 269 k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.404 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? C ASN 337 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? C ASN 318 l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? C ASN 349 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? C ASN 330 m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.413 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? C ASN 376 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? C ASN 357 C NAG 1301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? C ASN 608 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? C ASN 589 C NAG 1320 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? C ASN 621 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? C ASN 602 n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? C ASN 710 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? C ASN 691 o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.403 ? N-Glycosylation covale49 covale one ? C ASN 718 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? C ASN 699 p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.412 ? N-Glycosylation covale50 covale one ? C ASN 802 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? C ASN 783 q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.399 ? N-Glycosylation covale51 covale one ? C ASN 1075 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? C ASN 1056 r NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.398 ? N-Glycosylation covale52 covale one ? C ASN 1099 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? C ASN 1080 s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.409 ? N-Glycosylation covale53 covale one ? C ASN 1135 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? C ASN 1116 t NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.411 ? N-Glycosylation covale54 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale55 covale both ? J NAG . O4 ? ? ? 1_555 J BMA . C1 ? ? 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NAG N 1 ? 1_555 ASN A 330 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 29 NAG NA . ? ASN C 621 ? NAG n 1 ? 1_555 ASN C 602 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 30 NAG O . ? ASN A 621 ? NAG O 1 ? 1_555 ASN A 602 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 31 NAG OA . ? ASN C 710 ? NAG o 1 ? 1_555 ASN C 691 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 32 NAG P . ? ASN A 710 ? NAG P 1 ? 1_555 ASN A 691 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 33 NAG PA . ? ASN C 718 ? NAG p 1 ? 1_555 ASN C 699 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 34 NAG Q . ? ASN A 718 ? NAG Q 1 ? 1_555 ASN A 699 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 35 NAG QA . ? ASN C 802 ? NAG q 1 ? 1_555 ASN C 783 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 36 NAG R . ? ASN A 802 ? NAG R 1 ? 1_555 ASN A 783 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 37 NAG RA . ? ASN C 1075 ? NAG r 1 ? 1_555 ASN C 1056 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 38 NAG S . ? ASN A 1075 ? NAG S 1 ? 1_555 ASN A 1056 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 39 NAG SA . ? ASN C 1099 ? NAG s 1 ? 1_555 ASN C 1080 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 40 NAG T . ? ASN A 1099 ? NAG T 1 ? 1_555 ASN A 1080 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 41 NAG TA . ? ASN C 1135 ? NAG t 1 ? 1_555 ASN C 1116 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 42 NAG U . ? ASN A 1135 ? NAG U 1 ? 1_555 ASN A 1116 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 43 NAG UA . ? ASN A 376 ? NAG A 1301 ? 1_555 ASN A 357 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 44 NAG V . ? ASN B 128 ? NAG V 1 ? 1_555 ASN B 109 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 45 NAG VA . ? ASN A 84 ? NAG A 1302 ? 1_555 ASN A 65 ? 1_555 C1 ND2 ASN 1 NAG N-Glycosylation Carbohydrate 46 NAG W . ? ASN B 138 ? 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CYS A 128 ? 1_555 CYS A 159 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 56 CYS A 297 ? CYS A 307 ? CYS A 278 ? 1_555 CYS A 288 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 57 CYS A 342 ? CYS A 367 ? CYS A 323 ? 1_555 CYS A 348 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 58 CYS A 385 ? CYS A 438 ? CYS A 366 ? 1_555 CYS A 419 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 59 CYS A 397 ? CYS A 530 ? CYS A 378 ? 1_555 CYS A 511 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 60 CYS A 486 ? CYS A 493 ? CYS A 467 ? 1_555 CYS A 474 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 61 CYS A 543 ? CYS A 595 ? CYS A 524 ? 1_555 CYS A 576 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 62 CYS A 622 ? CYS A 654 ? CYS A 603 ? 1_555 CYS A 635 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 63 CYS A 667 ? CYS A 676 ? CYS A 648 ? 1_555 CYS A 657 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 64 CYS A 739 ? CYS A 761 ? CYS A 720 ? 1_555 CYS A 742 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 65 CYS A 744 ? CYS A 750 ? 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CYS C 128 ? 1_555 CYS C 159 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 86 CYS C 297 ? CYS C 307 ? CYS C 278 ? 1_555 CYS C 288 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 87 CYS C 342 ? CYS C 367 ? CYS C 323 ? 1_555 CYS C 348 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 88 CYS C 385 ? CYS C 438 ? CYS C 366 ? 1_555 CYS C 419 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 89 CYS C 397 ? CYS C 530 ? CYS C 378 ? 1_555 CYS C 511 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 90 CYS C 486 ? CYS C 493 ? CYS C 467 ? 1_555 CYS C 474 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 91 CYS C 543 ? CYS C 595 ? CYS C 524 ? 1_555 CYS C 576 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 92 CYS C 622 ? CYS C 654 ? CYS C 603 ? 1_555 CYS C 635 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 93 CYS C 667 ? CYS C 676 ? CYS C 648 ? 1_555 CYS C 657 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 94 CYS C 739 ? CYS C 761 ? CYS C 720 ? 1_555 CYS C 742 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 95 CYS C 744 ? CYS C 750 ? CYS C 725 ? 1_555 CYS C 731 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 96 CYS C 841 ? CYS C 852 ? CYS C 822 ? 1_555 CYS C 833 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 97 CYS C 1033 ? CYS C 1044 ? CYS C 1014 ? 1_555 CYS C 1025 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 98 CYS C 1083 ? CYS C 1127 ? CYS C 1064 ? 1_555 CYS C 1108 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 99 CYS D 22 ? CYS D 96 ? CYS D 22 ? 1_555 CYS D 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 100 CYS E 23 ? CYS E 93 ? CYS E 23 ? 1_555 CYS E 93 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 101 CYS F 22 ? CYS F 96 ? CYS G 22 ? 1_555 CYS G 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 102 CYS G 22 ? CYS G 96 ? CYS H 22 ? 1_555 CYS H 96 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 103 CYS H 23 ? CYS H 93 ? CYS I 23 ? 1_555 CYS I 93 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' 104 CYS I 23 ? CYS I 93 ? CYS L 23 ? 1_555 CYS L 93 ? 1_555 SG SG . . . None 'Disulfide bridge' # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 PRO 488 A . ? PRO 469 A PRO 489 A ? PRO 470 A 1 -1.06 2 THR 635 A . ? THR 616 A PRO 636 A ? PRO 617 A 1 -4.94 3 PRO 488 B . ? PRO 469 B PRO 489 B ? PRO 470 B 1 -3.93 4 THR 635 B . ? THR 616 B PRO 636 B ? PRO 617 B 1 -3.08 5 PRO 488 C . ? PRO 469 C PRO 489 C ? 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