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;(DC)(DA)(DC)(DA)(DG)(DT)(DG)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA)(DA)(DA)(DT)(DC)(DA)(DA)(DG)(DT) (DG)(DT)(DG)(DA)(DA)(DG)(DC)(DC)(DA)(DG)(DA)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA)(DA)(DC)(DC)(DC) (DG) ; CACAGTGATGCAAATCAAGTGTGAAGCCAGACAAAAACCCG M ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 8 'CALCIUM ION' CA 9 'ZINC ION' ZN # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ALA n 1 3 ALA n 1 4 SER n 1 5 LEU n 1 6 PRO n 1 7 SER n 1 8 THR n 1 9 LEU n 1 10 SER n 1 11 PHE n 1 12 SER n 1 13 SER n 1 14 ALA n 1 15 PRO n 1 16 ASP n 1 17 GLU n 1 18 ILE n 1 19 GLN n 1 20 HIS n 1 21 PRO n 1 22 GLN n 1 23 ILE n 1 24 LYS n 1 25 PHE n 1 26 SER n 1 27 GLU n 1 28 TRP n 1 29 LYS n 1 30 PHE n 1 31 LYS n 1 32 LEU n 1 33 PHE n 1 34 ARG n 1 35 VAL n 1 36 ARG n 1 37 SER n 1 38 PHE n 1 39 GLU n 1 40 LYS n 1 41 ALA n 1 42 PRO n 1 43 GLU n 1 44 GLU n 1 45 ALA n 1 46 GLN n 1 47 LYS n 1 48 GLU n 1 49 LYS n 1 50 ASP n 1 51 SER n 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.902 ? 28559 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 16.602 ? 13594 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.056 ? 3129 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.017 ? 3054 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6OET _struct.title 'Cryo-EM structure of mouse RAG1/2 STC complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6OET _struct_keywords.text 'V(D)J recombination, DNA Transposition, RAG, SCID, RECOMBINATION, RECOMBINATION-DNA complex' _struct_keywords.pdbx_keywords RECOMBINATION/DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 4 ? H N N 5 ? I N N 6 ? J N N 7 ? K N N 8 ? L N N 9 ? M N N 8 ? 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P15919 1 ? 1040 ? 1 1040 2 2 6OET B 1 ? 527 ? P21784 1 ? 527 ? 1 527 3 1 6OET C 1 ? 1040 ? P15919 1 ? 1040 ? 1 1040 4 2 6OET D 1 ? 527 ? P21784 1 ? 527 ? 1 527 5 3 6OET F 1 ? 50 ? 6OET 1 ? 50 ? 1 50 6 4 6OET I 1 ? 15 ? 6OET 2 ? 16 ? 2 16 7 4 6OET J 1 ? 15 ? 6OET 2 ? 16 ? 2 16 8 5 6OET G 1 ? 61 ? 6OET 1 ? 61 ? 1 61 9 6 6OET L 1 ? 30 ? 6OET 17 ? 46 ? 17 46 10 7 6OET M 1 ? 41 ? 6OET 17 ? 57 ? 17 57 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 6OET GLN A 962 ? UNP P15919 GLU 962 'engineered mutation' 962 1 3 6OET GLN C 962 ? UNP P15919 GLU 962 'engineered mutation' 962 2 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details decameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 10 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLN A 404 ? 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SER C 996 LYS C 1001 1 ? 6 HELX_P HELX_P58 AG4 PHE C 1002 ? ASN C 1004 ? PHE C 1002 ASN C 1004 5 ? 3 HELX_P HELX_P59 AG5 ASN D 11 ? ALA D 13 ? ASN D 11 ALA D 13 5 ? 3 HELX_P HELX_P60 AG6 THR D 168 ? TRP D 172 ? THR D 168 TRP D 172 5 ? 5 HELX_P HELX_P61 AG7 THR D 308 ? HIS D 313 ? 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