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VVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLIDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISS LLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKG ; ;MGISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIID VVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLIDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISS LLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKG ; J ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MPVARSWVCRKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRR LVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRVRKQVVNIPSFIVRLDSQKHIDFS LRSPYGGGRPGRVKRKNAKKGQGGAGAGDDEEED ; ;MPVARSWVCRKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRR LVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRVRKQVVNIPSFIVRLDSQKHIDFS LRSPYGGGRPGRVKRKNAKKGQGGAGAGDDEEED ; K ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLR DYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATE ; ;MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLR DYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATE ; L ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKM KMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF ; ;MADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKM KMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF ; M ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MAEEGIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVD DNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK ; ;MAEEGIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVD DNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK ; N ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MGRMHAPGKGLSQSALPYRRSVPTWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGL APDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYKTKRVLPPNWKYESSTASALVA ; ;MGRMHAPGKGLSQSALPYRRSVPTWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGL APDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYKTKRVLPPNWKYESSTASALVA ; O ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQD VAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL ; ;MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQD VAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL ; P ? 18 'polypeptide(L)' no no ;MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLSRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHL RDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK ; ;MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLSRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHL RDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK ; Q ? 19 'polypeptide(L)' no no ;SARVAPRFPFPVVAPRGEDRHSSAAAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEP VLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGG PGARARYQKSYR ; ;SARVAPRFPFPVVAPRGEDRHSSAAAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEP VLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGG PGARARYQKSYR ; R ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MGRVRTKTVKKAARVIIEKYYTRLGNDFHTNKRVCEEIAIIPSKKLRNKIAGYVTHLMKRIQRGPVRGISIKLQEEERER RDNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLKLLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFKTPRGAV ; ;MGRVRTKTVKKAARVIIEKYYTRLGNDFHTNKRVCEEIAIIPSKKLRNKIAGYVTHLMKRIQRGPVRGISIKLQEEERER RDNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLKLLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFKTPRGAV ; S ? 21 'polypeptide(L)' no no ;MSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRRKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIP DWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK ; ;MSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRRKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIP DWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK ; T ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYG GRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDWGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAAKKKH ; ;MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYG GRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDWGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAAKKKH ; U ? 23 'polypeptide(L)' no no ;MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRF QMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA ; ;MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRF QMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA ; V ? 24 'polypeptide(L)' no no ;MQSNAGEFVDLYVPRKCSASNRIIGAKDHASIPMNVAEVDKVTGRFNGQSKTYAICGAIRRMGESDDSILRLAKSHGIVS QNF ; ;MQSNAGEFVDLYVPRKCSASNRIIGAKDHASIPMNVAEVDKVTGRFNGQSKTYAICGAIRRMGESDDSILRLAKSHGIVS QNF ; W ? 25 'polypeptide(L)' no no ;MVRMNVLADALKSINNAEKRGKRQVLIRPCSKVIVRFLTVMMKHGYIGEFEIIDDHRAGKIVVNLTGRLNKCGVISPRFD VQLKDLEKWQNNLLPSRQFGFIVLTTSAGIMDHEEARRKHTGGKILGFFF ; ;MVRMNVLADALKSINNAEKRGKRQVLIRPCSKVIVRFLTVMMKHGYIGEFEIIDDHRAGKIVVNLTGRLNKCGVISPRFD VQLKDLEKWQNNLLPSRQFGFIVLTTSAGIMDHEEARRKHTGGKILGFFF ; X ? 26 'polypeptide(L)' no no ;AGKCRGLRTARKLRSHRRDQKWHDKQYKKAHLGTALKANPFGGASHAKGIVLEKVGVEAKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKK ITAFVPNDGCLNFIEENDEVLVAGFGRKGHAVGDIPGVRFKVVKVANVSLLALYKGKKERPRS ; ;AGKCRGLRTARKLRSHRRDQKWHDKQYKKAHLGTALKANPFGGASHAKGIVLEKVGVEAKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKK ITAFVPNDGCLNFIEENDEVLVAGFGRKGHAVGDIPGVRFKVVKVANVSLLALYKGKKERPRS ; Y ? 27 'polypeptide(L)' no no ;MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLD YAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKEPRG ; ;MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLD YAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKEPRG ; Z ? 28 'polypeptide(L)' no no ;MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIR GSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA ; ;MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIR GSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA ; a ? 29 'polypeptide(L)' no no ;MTKKRRNNGRAKKGRGHVQPIRCTNCACCVPKDKAIKKFVIRNIVEAAAVRDISEVSVFDAYVLPKLYVKLHYCVSCAIH SKVVRNRSREARKDRTPPPRFRPAGAAPPPPPKPM ; ;MTKKRRNNGRAKKGRGHVQPIRCTNCACCVPKDKAIKKFVIRNIVEAAAVRDISEVSVFDAYVLPKLYVKLHYCVSCAIH SKVVRNRSREARKDRTPPPRFRPAGAAPPPPPKPM ; b ? 30 'polypeptide(L)' no no ;MPLAKDLLHPSPEEEKRKHKKKRLVQSPNSYFMDVKCPGCYKITTVFSHAQTVVLCVGCSTVLCQPTGGKARLTEGCSFR RKQH ; ;MPLAKDLLHPSPEEEKRKHKKKRLVQSPNSYFMDVKCPGCYKITTVFSHAQTVVLCVGCSTVLCQPTGGKARLTEGCSFR RKQH ; c ? 31 'polypeptide(L)' no no MDTSRVQPIKLARVTKVLGRTGSQGQCTQVRVEFMDDTSRSIIRNVKGPVREGDVLTLLESEREARRLR MDTSRVQPIKLARVTKVLGRTGSQGQCTQVRVEFMDDTSRSIIRNVKGPVREGDVLTLLESEREARRLR d ? 32 'polypeptide(L)' no no MGHQQLYWSHPRKFGQGSRSCRVCSNRHGLIRKYGLNMCRQCFRQYAKDIGFIKLD MGHQQLYWSHPRKFGQGSRSCRVCSNRHGLIRKYGLNMCRQCFRQYAKDIGFIKLD e ? 33 'polypeptide(L)' no no ;MQLFVRAQELHTLEVTGRETVAQIKAHVASLEGIAPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALSTLEVAGRMLGGKVHGSL ARVGKVRGQTLKVAKQEKKKKRTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKKKGPNANS ; ;MQLFVRAQELHTLEVTGRETVAQIKAHVASLEGIAPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALSTLEVAGRMLGGKVHGSL ARVGKVRGQTLKVAKQEKKKKRTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKKKGPNANS ; f ? 34 'polypeptide(L)' no no ;MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKR KKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK ; ;MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKR KKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK ; g ? 35 'polypeptide(L)' no no ;MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALS GSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHTKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNS SNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALC FSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR ; ;MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALS GSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHTKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNS SNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALC FSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR ; h ? 36 'polypeptide(L)' no no MRAKWRKKRMRRLKRKRRKMRQRSK MRAKWRKKRMRRLKRKRRKMRQRSK n ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 U n 1 2 A n 1 3 C n 1 4 C n 1 5 U n 1 6 G n 1 7 G n 1 8 U n 1 9 U n 1 10 G n 1 11 A n 1 12 U n 1 13 C n 1 14 C n 1 15 U n 1 16 G n 1 17 C n 1 18 C n 1 19 A n 1 20 G n 1 21 U n 1 22 A n 1 23 G n 1 24 C n 1 25 A n 1 26 U n 1 27 A n 1 28 U n 1 29 G n 1 30 C n 1 31 U n 1 32 U n 1 33 G n 1 34 U n 1 35 C n 1 36 U n 1 37 C n 1 38 A n 1 39 A n 1 40 A n 1 41 G n 1 42 A n 1 43 U n 1 44 U n 1 45 A n 1 46 A n 1 47 G n 1 48 C n 1 49 C n 1 50 A n 1 51 U n 1 52 G n 1 53 C n 1 54 A n 1 55 U n 1 56 G n 1 57 U n 1 58 C n 1 59 U n 1 60 A n 1 61 A n 1 62 G n 1 63 U n 1 64 A n 1 65 C n 1 66 G n 1 67 C n 1 68 A n 1 69 C n 1 70 G n 1 71 G n 1 72 C n 1 73 C n 1 74 G n 1 75 G n 1 76 U n 1 77 A n 1 78 C n 1 79 A n 1 80 G n 1 81 U n 1 82 G n 1 83 A n 1 84 A n 1 85 A n 1 86 C n 1 87 U n 1 88 G n 1 89 C n 1 90 G n 1 91 A n 1 92 A n 1 93 U n 1 94 G n 1 95 G n 1 96 C n 1 97 U n 1 98 C n 1 99 A n 1 100 U n 1 101 U n 1 102 A n 1 103 A n 1 104 A n 1 105 U n 1 106 C n 1 107 A n 1 108 G n 1 109 U n 1 110 U n 1 111 A n 1 112 U n 1 113 G n 1 114 G n 1 115 U n 1 116 U n 1 117 C n 1 118 C n 1 119 U n 1 120 U n 1 121 U n 1 122 G n 1 123 G n 1 124 U n 1 125 C n 1 126 G n 1 127 C n 1 128 U n 1 129 C n 1 130 G n 1 131 C n 1 132 U n 1 133 C n 1 134 C n 1 135 U n 1 136 C n 1 137 U n 1 138 C n 1 139 C n 1 140 C n 1 141 A n 1 142 C n 1 143 U n 1 144 U n 1 145 G n 1 146 G n 1 147 A n 1 148 U n 1 149 A n 1 150 A n 1 151 C n 1 152 U n 1 153 G n 1 154 U n 1 155 G n 1 156 G n 1 157 U n 1 158 A n 1 159 A n 1 160 U n 1 161 U n 1 162 C n 1 163 U n 1 164 A n 1 165 G n 1 166 A n 1 167 G n 1 168 C n 1 169 U n 1 170 A n 1 171 A n 1 172 U n 1 173 A n 1 174 C n 1 175 A n 1 176 U n 1 177 G n 1 178 C n 1 179 C n 1 180 G n 1 181 A n 1 182 C n 1 183 G n 1 184 G n 1 185 G n 1 186 C n 1 187 G n 1 188 C n 1 189 U n 1 190 G n 1 191 A n 1 192 C n 1 193 C n 1 194 C n 1 195 C n 1 196 C n 1 197 U n 1 198 U n 1 199 C n 1 200 G n 1 201 C n 1 202 G n 1 203 G n 1 204 G n 1 205 G n 1 206 G n 1 207 G n 1 208 G n 1 209 A n 1 210 U n 1 211 G n 1 212 C n 1 213 G n 1 214 U n 1 215 G n 1 216 C n 1 217 A n 1 218 U n 1 219 U n 1 220 U n 1 221 A n 1 222 U n 1 223 C n 1 224 A n 1 225 G n 1 226 A n 1 227 U n 1 228 C n 1 229 A n 1 230 A n 1 231 A n 1 232 A n 1 233 C n 1 234 C n 1 235 A n 1 236 A n 1 237 C n 1 238 C n 1 239 C n 1 240 G n 1 241 G n 1 242 U n 1 243 C n 1 244 A n 1 245 G n 1 246 C n 1 247 C n 1 248 C n 1 249 C n 1 250 U n 1 251 C n 1 252 U n 1 253 C n 1 254 C n 1 255 G n 1 256 G n 1 257 C n 1 258 C n 1 259 C n 1 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sample 1 69 Rabbit 'Oryctolagus cuniculus' 9986 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 32 1 sample 1 56 Rabbit 'Oryctolagus cuniculus' 9986 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 33 1 sample 1 133 Rabbit 'Oryctolagus cuniculus' 9986 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 34 1 sample 1 156 Rabbit 'Oryctolagus cuniculus' 9986 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 35 1 sample 1 317 Rabbit 'Oryctolagus cuniculus' 9986 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 36 1 sample 1 25 Rabbit 'Oryctolagus cuniculus' 9986 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 PDB 6P4H 6P4H ? 1 ? 1 2 UNP G1TWL4_RABIT G1TWL4 ? 2 ;MSGALDVLQMKEEDVLKFLAAGTHLGGTNLDFQMEQYIYKRKSDGIYIINLKRTWEKLLLAARAIVAIENPADVSVISSR NTGQRAVLKFAAATGATPIAGRFTPGTFTNQIQAAFREPRLLVVTDPQADHQPLMEASYVNLPTIALCNTDSPLHYVDIA 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A G 1758 N2 ? ? ? 1_555 A C 1774 O2 ? ? 2 G 1758 2 C 1774 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog1695 hydrog ? ? A G 1758 O6 ? ? ? 1_555 A C 1774 N4 ? ? 2 G 1758 2 C 1774 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog1696 hydrog ? ? A G 1758 N1 ? ? ? 1_555 A U 1775 O2 ? ? 2 G 1758 2 U 1775 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog1697 hydrog ? ? A G 1758 O6 ? ? ? 1_555 A U 1775 N3 ? ? 2 G 1758 2 U 1775 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_28_PAIR ? ? hydrog1698 hydrog ? ? A G 1759 N1 ? ? ? 1_555 A C 1773 N3 ? ? 2 G 1759 2 C 1773 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog1699 hydrog ? ? A G 1759 N2 ? ? ? 1_555 A C 1773 O2 ? ? 2 G 1759 2 C 1773 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog1700 hydrog ? ? A G 1759 O6 ? ? ? 1_555 A C 1773 N4 ? ? 2 G 1759 2 C 1773 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog1701 hydrog ? ? A G 1759 N1 ? ? ? 1_555 A C 1774 N3 ? ? 2 G 1759 2 C 1774 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog1702 hydrog ? ? A G 1759 N2 ? ? ? 1_555 A C 1774 O2 ? ? 2 G 1759 2 C 1774 1_555 ? ? ? ? ? ? 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'_citation_author.identifier_ORCID' 13 2 'Structure model' '_citation_author.name' 14 3 'Structure model' '_citation.journal_volume' 15 4 'Structure model' '_pdbx_audit_support.funding_organization' # _em_3d_fitting.entry_id 6P4H _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 6P4H _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 96826 _em_3d_reconstruction.resolution 3.2 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? 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'Quantifoil R2/2' ? ? 2 2 ;Plasma cleaning for both holey carbon and holey gold grids was done on a Gatan Solarus with Hydrogen (6.4 sccm gas flow) and Oxygen (27.5 sccm gas flow) and 10 W cleaning power. ; GOLD ? 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CA MET 115 769 1 Y 1 c MET 1 ? DA MET 1 770 1 Y 1 d MET 1 ? EA MET 1 771 1 Y 1 d ASP 2 ? EA ASP 2 772 1 Y 1 d THR 3 ? EA THR 3 773 1 Y 1 d SER 4 ? EA SER 4 774 1 Y 1 d ARG 5 ? EA ARG 5 775 1 Y 1 d VAL 6 ? EA VAL 6 776 1 Y 1 d ARG 69 ? EA ARG 69 777 1 Y 1 e MET 1 ? FA MET 1 778 1 Y 1 f MET 0 ? GA MET 1 779 1 Y 1 f GLN 1 ? GA GLN 2 780 1 Y 1 f LEU 2 ? GA LEU 3 781 1 Y 1 f PHE 3 ? GA PHE 4 782 1 Y 1 f VAL 4 ? GA VAL 5 783 1 Y 1 f ARG 5 ? GA ARG 6 784 1 Y 1 f ALA 6 ? GA ALA 7 785 1 Y 1 f GLN 7 ? GA GLN 8 786 1 Y 1 f GLU 8 ? GA GLU 9 787 1 Y 1 f LEU 9 ? GA LEU 10 788 1 Y 1 f HIS 10 ? GA HIS 11 789 1 Y 1 f THR 11 ? GA THR 12 790 1 Y 1 f LEU 12 ? GA LEU 13 791 1 Y 1 f GLU 13 ? GA GLU 14 792 1 Y 1 f VAL 14 ? GA VAL 15 793 1 Y 1 f THR 15 ? GA THR 16 794 1 Y 1 f GLY 16 ? GA GLY 17 795 1 Y 1 f ARG 17 ? GA ARG 18 796 1 Y 1 f GLU 18 ? GA GLU 19 797 1 Y 1 f THR 19 ? GA THR 20 798 1 Y 1 f VAL 20 ? GA VAL 21 799 1 Y 1 f ALA 21 ? GA ALA 22 800 1 Y 1 f GLN 22 ? GA GLN 23 801 1 Y 1 f ILE 23 ? 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HA THR 12 866 1 Y 1 g ILE 13 ? HA ILE 13 867 1 Y 1 g THR 14 ? HA THR 14 868 1 Y 1 g LEU 15 ? HA LEU 15 869 1 Y 1 g GLU 16 ? HA GLU 16 870 1 Y 1 g VAL 17 ? HA VAL 17 871 1 Y 1 g GLU 18 ? HA GLU 18 872 1 Y 1 g PRO 19 ? HA PRO 19 873 1 Y 1 g SER 20 ? HA SER 20 874 1 Y 1 g ASP 21 ? HA ASP 21 875 1 Y 1 g THR 22 ? HA THR 22 876 1 Y 1 g ILE 23 ? HA ILE 23 877 1 Y 1 g GLU 24 ? HA GLU 24 878 1 Y 1 g ASN 25 ? HA ASN 25 879 1 Y 1 g VAL 26 ? HA VAL 26 880 1 Y 1 g LYS 27 ? HA LYS 27 881 1 Y 1 g ALA 28 ? HA ALA 28 882 1 Y 1 g LYS 29 ? HA LYS 29 883 1 Y 1 g ILE 30 ? HA ILE 30 884 1 Y 1 g GLN 31 ? HA GLN 31 885 1 Y 1 g ASP 32 ? HA ASP 32 886 1 Y 1 g LYS 33 ? HA LYS 33 887 1 Y 1 g GLU 34 ? HA GLU 34 888 1 Y 1 g GLY 35 ? HA GLY 35 889 1 Y 1 g ILE 36 ? HA ILE 36 890 1 Y 1 g PRO 37 ? HA PRO 37 891 1 Y 1 g PRO 38 ? HA PRO 38 892 1 Y 1 g ASP 39 ? HA ASP 39 893 1 Y 1 g GLN 40 ? HA GLN 40 894 1 Y 1 g GLN 41 ? HA GLN 41 895 1 Y 1 g ARG 42 ? HA ARG 42 896 1 Y 1 g LEU 43 ? HA LEU 43 897 1 Y 1 g ILE 44 ? 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IA ARG 317 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM Tris-HCl ? 1 2 100 mM KCL ? 1 3 8 mM MgCl2 ? 1 4 2 mM DTT ? 2 5 ? ? ? ? # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units ? _em_entity_assembly_molwt.value ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 9986 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Oryctolagus cuniculus' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 42.09 _em_image_recording.average_exposure_time 8 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images 11234 # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 1240275 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? Leginon ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Gctf ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? RELION ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? RELION ? 1 ? ? # loop_ _em_specimen.id _em_specimen.experiment_id _em_specimen.concentration _em_specimen.details _em_specimen.embedding_applied _em_specimen.shadowing_applied _em_specimen.staining_applied _em_specimen.vitrification_applied 1 1 ? ;Ribosomal complexes for the pre-translocated state were assembled at 240-390 nM concentration and applied to plasma treated holey carbon. ; NO NO NO YES 2 1 ? 'Same sample and buffer conditions used for the holey carbon grids was used for the holey gold grids.' NO NO NO YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6P4H 'double helix' 6P4H 'a-form double helix' 6P4H 'z-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A A 516 1_555 A U 31 1_555 -4.222 -2.083 -0.328 7.023 -2.045 -96.088 1 2_A516:U31_2 2 516 ? 2 31 ? 24 4 1 A G 644 1_555 A C 30 1_555 -0.275 -0.074 -0.112 -10.568 -10.350 2.303 2 2_G644:C30_2 2 644 ? 2 30 ? 19 1 1 A C 645 1_555 A G 29 1_555 1.001 -0.442 -0.235 4.406 -12.339 0.096 3 2_C645:G29_2 2 645 ? 2 29 ? 19 1 1 A G 646 1_555 A U 28 1_555 -2.605 -0.653 0.499 0.317 -10.193 -3.371 4 2_G646:U28_2 2 646 ? 2 28 ? 28 1 1 A U 647 1_555 A A 27 1_555 -0.099 -0.166 0.686 -5.256 -9.371 0.191 5 2_U647:A27_2 2 647 ? 2 27 ? 20 1 1 A A 648 1_555 A U 26 1_555 0.160 -0.092 -0.047 -1.755 -12.258 -0.804 6 2_A648:U26_2 2 648 ? 2 26 ? 20 1 1 A U 649 1_555 A A 25 1_555 0.214 0.038 -0.207 -4.884 -8.778 4.592 7 2_U649:A25_2 2 649 ? 2 25 ? 20 1 1 A A 650 1_555 A C 24 1_555 -2.514 -0.259 0.175 1.469 -19.579 4.828 8 2_A650:C24_2 2 650 ? 2 24 ? ? 1 1 A U 651 1_555 A G 23 1_555 3.216 -1.084 0.150 -6.868 -8.014 -9.089 9 2_U651:G23_2 2 651 ? 2 23 ? 28 1 1 A U 652 1_555 A A 22 1_555 -0.107 -0.151 0.119 -3.602 -5.343 2.288 10 2_U652:A22_2 2 652 ? 2 22 ? 20 1 1 A A 653 1_555 A U 21 1_555 -0.211 0.114 0.051 4.390 3.376 6.575 11 2_A653:U21_2 2 653 ? 2 21 ? 20 1 1 A C 4 1_555 A G 20 1_555 0.174 -0.183 -0.063 14.216 -19.449 0.559 12 2_C4:G20_2 2 4 ? 2 20 ? 19 1 1 A U 5 1_555 A A 19 1_555 0.329 -0.086 -0.312 8.721 -15.589 4.406 13 2_U5:A19_2 2 5 ? 2 19 ? 20 1 1 A G 6 1_555 A C 18 1_555 -0.150 -0.211 -0.235 -8.971 -16.152 -3.602 14 2_G6:C18_2 2 6 ? 2 18 ? 19 1 1 A G 7 1_555 A C 17 1_555 -0.047 -0.080 0.046 -7.914 -19.501 -0.146 15 2_G7:C17_2 2 7 ? 2 17 ? 19 1 1 A A 1195 1_555 A G 16 1_555 -6.827 -4.188 -0.066 2.040 -1.396 -0.508 16 2_A1195:G16_2 2 1195 ? 2 16 ? 11 9 1 A A 1196 1_555 A U 8 1_555 0.109 -3.250 -0.022 0.489 -4.696 64.542 17 2_A1196:U8_2 2 1196 ? 2 8 ? 23 3 1 A G 1197 1_555 A C 14 1_555 -0.251 -0.145 -0.052 -1.189 -19.350 3.898 18 2_G1197:C14_2 2 1197 ? 2 14 ? 19 1 1 A G 1198 1_555 A C 13 1_555 -0.120 -0.165 0.244 -7.190 -16.044 0.748 19 2_G1198:C13_2 2 1198 ? 2 13 ? 19 1 1 A A 1199 1_555 A U 12 1_555 -0.176 0.058 0.389 1.768 -13.229 3.984 20 2_A1199:U12_2 2 1199 ? 2 12 ? 20 1 1 A A 1200 1_555 A A 11 1_555 2.497 1.649 -0.251 -4.964 -16.630 14.936 21 2_A1200:A11_2 2 1200 ? 2 11 ? ? 1 1 A U 1201 1_555 A G 10 1_555 2.320 -0.551 -0.023 -5.189 -3.186 -10.513 22 2_U1201:G10_2 2 1201 ? 2 10 ? 28 1 1 A U 1202 1_555 A A 1697 1_555 0.097 0.042 -0.066 4.885 -18.813 4.214 23 2_U1202:A1697_2 2 1202 ? 2 1697 ? 20 1 1 A G 1203 1_555 A C 1696 1_555 -0.291 -0.034 0.196 -4.042 -24.852 6.110 24 2_G1203:C1696_2 2 1203 ? 2 1696 ? 19 1 1 A A 1204 1_555 A U 1694 1_555 -0.071 -0.128 0.765 0.718 -13.213 -10.499 25 2_A1204:U1694_2 2 1204 ? 2 1694 ? 20 1 1 A C 1205 1_555 A G 1693 1_555 0.171 -0.050 0.392 10.379 -17.067 1.537 26 2_C1205:G1693_2 2 1205 ? 2 1693 ? 19 1 1 A G 1206 1_555 A U 1692 1_555 -2.306 -0.417 0.301 6.268 -20.393 -2.358 27 2_G1206:U1692_2 2 1206 ? 2 1692 ? 28 1 1 A A 1208 1_555 A U 1691 1_555 0.188 -0.098 -0.227 -8.065 -12.112 1.720 28 2_A1208:U1691_2 2 1208 ? 2 1691 ? 20 1 1 A A 1209 1_555 A U 1690 1_555 -0.005 -0.102 0.188 -3.153 -4.255 2.830 29 2_A1209:U1690_2 2 1209 ? 2 1690 ? 20 1 1 A G 1210 1_555 A C 1689 1_555 -0.066 -0.284 -0.112 -1.903 -11.989 -2.479 30 2_G1210:C1689_2 2 1210 ? 2 1689 ? 19 1 1 A G 1211 1_555 A C 1688 1_555 -0.121 0.030 -0.207 -12.739 -8.117 1.882 31 2_G1211:C1688_2 2 1211 ? 2 1688 ? 19 1 1 A G 1212 1_555 A C 1687 1_555 -0.031 0.014 -0.069 -11.340 -11.306 1.046 32 2_G1212:C1687_2 2 1212 ? 2 1687 ? 19 1 1 A C 1213 1_555 A G 1686 1_555 0.261 -0.070 0.245 -3.514 -11.214 0.893 33 2_C1213:G1686_2 2 1213 ? 2 1686 ? 19 1 1 A A 1214 1_555 A U 1685 1_555 0.125 -0.085 0.535 14.869 -13.330 -2.632 34 2_A1214:U1685_2 2 1214 ? 2 1685 ? 20 1 1 A C 1682 1_555 A C 1684 1_555 4.446 0.612 2.142 -14.981 20.067 -48.327 35 2_C1682:C1684_2 2 1682 ? 2 1684 ? ? ? 1 A A 1217 1_555 A U 1681 1_555 0.190 -0.012 0.062 -1.789 -16.018 -2.538 36 2_A1217:U1681_2 2 1217 ? 2 1681 ? 20 1 1 A C 1218 1_555 A G 1680 1_555 0.258 -0.365 -0.150 10.151 -18.061 -1.422 37 2_C1218:G1680_2 2 1218 ? 2 1680 ? 19 1 1 A U 34 1_555 A A 521 1_555 -0.028 -0.064 -0.633 7.307 0.088 0.726 38 2_U34:A521_2 2 34 ? 2 521 ? 20 1 1 A C 35 1_555 A A 520 1_555 2.174 -0.113 -0.686 3.134 -0.220 14.042 39 2_C35:A520_2 2 35 ? 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