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_citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Embo J.' _citation.journal_id_ASTM EMJODG _citation.journal_id_CSD 0897 _citation.journal_id_ISSN 1460-2075 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 38 _citation.language ? _citation.page_first e102226 _citation.page_last e102226 _citation.title 'The Israeli acute paralysis virus IRES captures host ribosomes by mimicking a ribosomal state with hybrid tRNAs.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.15252/embj.2019102226 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31609474 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Acosta-Reyes, F.' 1 ? primary 'Neupane, R.' 2 ? primary 'Frank, J.' 3 0000-0001-5449-6943 primary 'Fernandez, I.S.' 4 0000-0001-7218-1603 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 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ACGGGUGACGGGGAAUCAGGGUUCGAUUCCGGAGAGGGAGCCUGAGAAACGGCUACCACAUCCAAGGAAGGCAGCAGGCG CGCAAAUUACCCACUCCCGACCCGGGGAGGUAGUGACGAAAAAUAACAAUACAGGACUCUUUCGAGGCCCUGUAAUUGGA AUGAGUCCACUUUAAAUCCUUUAACGAGGAUCCAUUGGAGGGCAAGUCUGGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUUCCAGCUCCA AUAGCGUAUAUUAAAGUUGCUGCAGUUAAAAAGCUCGUAGUUGGAUCUUGGGAGCGGGCGGGCGGUCCGCCGCGAGGCGA GCCACCGCCCGUCCCCGCCCCUUGCCUCUCGGCGCCCCCUCGAUGCUCUUAGCUGAGUGUCCCGCGGGGCCCGAAGCGUU UACUUUGAAAAAAUUAGAGUGUUCAAAGCAGGCCCGAGCCGCCUGGAUACCGCAGCUAGGAAUAAUGGAAUAGGACCGCG GUUCUAUUUUGUUGGUUUUCGGAACUGAGGCCAUGAUUAAGAGGGACGGCCGGGGGCAUUCGUAUUGCGCCGCUAGAGGU GAAAUUCUUGGACCGGCGCAAGACGGACCAGAGCGAAAGCAUUUGCCAAGAAUGUUUUCAUUAAUCAAGAACGAAAGUCG GAGGUUCGAAGACGAUCAGAUACCGUCGUAGUUCCGACCAUAAACGAUGCCGACCGGCGAUGCGGCGGCGUUAUUCCCAU GACCCGCCGGGCAGCUUCCGGGAAACCAAAGUCUUUGGGUUCCGGGGGGAGUAUGGUUGCAAAGCUGAAACUUAAAGGAA UUGACGGAAGGGCACCACCAGGAGUGGAGCCUGCGGCUUAAUUUGACUCAACACGGGAAACCUCACCCGGCCCGGACACG GACAGGAUUGACAGAUUGAUAGCUCUUUCUCGAUUCCGUGGGUGGUGGUGCAUGGCCGUUCUUAGUUGGUGGAGCGAUUU 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'polypeptide(L)' no no ;MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADALGEEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKG HSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRK PLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRAS TSKSESSQK ; ;MKLNISFPATGCQKLIEVDDERKLRTFYEKRMATEVAADALGEEWKGYVVRISGGNDKQGFPMKQGVLTHGRVRLLLSKG HSCYRPRRTGERKRKSVRGCIVDANLSVLNLVIVKKGEKDIPGLTDTTVPRRLGPKRASRIRKLFNLSKEDDVRQYVVRK PLNKEGKKPRTKAPKIQRLVTPRVLQHKRRRIALKKQRTKKNKEEAAEYAKLLAKRMKEAKEKRQEQIAKRRRLSSLRAS TSKSESSQK ; H ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MFSSSAKIVKPNGEKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPVPQLKSFQKIQVRLV RELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSRTLTAVHDAILEDLVFPSEIVGKRIRVKLDGSRLIKVHLDK AQQNNVEHKVETFSGVYKKLTGKDVNFEFPEFQL ; ;MFSSSAKIVKPNGEKPDEFESGISQALLELEMNSDLKAQLRELNITAAKEIEVGGGRKAIIIFVPVPQLKSFQKIQVRLV RELEKKFSGKHVVFIAQRRILPKPTRKSRTKNKQKRPRSRTLTAVHDAILEDLVFPSEIVGKRIRVKLDGSRLIKVHLDK AQQNNVEHKVETFSGVYKKLTGKDVNFEFPEFQL ; I ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MGISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIID VVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLIDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISS LLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKG ; ;MGISRDNWHKRRKTGGKRKPYHKKRKYELGRPAANTKIGPRRIHTVRVRGGNKKYRALRLDVGNFSWGSECCTRKTRIID VVYNASNNELVRTKTLVKNCIVLIDSTPYRQWYESHYALPLGRKKGAKLTPEEEEILNKKRSKKIQKKYDERKKNAKISS LLEEQFQQGKLLACIASRPGQCGRADGYVLEGKELEFYLRKIKARKG ; J ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MPVARSWVCRKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRR LVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRVRKQVVNIPSFIVRLDSQKHIDFS LRSPYGGGRPGRVKRKNAKKGQGGAGAGDDEEED ; ;MPVARSWVCRKTYVTPRRPFEKSRLDQELKLIGEYGLRNKREVWRVKFTLAKIRKAARELLTLDEKDPRRLFEGNALLRR LVRIGVLDEGKMKLDYILGLKIEDFLERRLQTQVFKLGLAKSIHHARVLIRQRHIRVRKQVVNIPSFIVRLDSQKHIDFS LRSPYGGGRPGRVKRKNAKKGQGGAGAGDDEEED ; K ? 12 'polypeptide(L)' no no ;MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLR DYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATE ; ;MLMPKKNRIAIYELLFKEGVMVAKKDVHMPKHPELADKNVPNLHVMKAMQSLKSRGYVKEQFAWRHFYWYLTNEGIQYLR DYLHLPPEIVPATLRRSRPETGRPRPKGLEGERPARLTRGEADRDTYRRSAVPPGADKKAEAGAGSATE ; L ? 13 'polypeptide(L)' no no ;MADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKM KMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF ; ;MADIQTERAYQKQPTIFQNKKRVLLGETGKEKLPRYYKNIGLGFKTPKEAIEGTYIDKKCPFTGNVSIRGRILSGVVTKM KMQRTIVIRRDYLHYIRKYNRFEKRHKNMSVHLSPCFRDVQIGDIVTVGECRPLSKTVRFNVLKVTKAAGTKKQFQKF ; M ? 14 'polypeptide(L)' no no ;MAEEGIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVD DNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK ; ;MAEEGIAAGGVMDVNTALQEVLKTALIHDGLARGIREAAKALDKRQAHLCVLASNCDEPMYVKLVEALCAEHQINLIKVD DNKKLGEWVGLCKIDREGKPRKVVGCSCVVVKDYGKESQAKDVIEEYFKCKK ; N ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MGRMHAPGKGLSQSALPYRRSVPTWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGL APDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYKTKRVLPPNWKYESSTASALVA ; ;MGRMHAPGKGLSQSALPYRRSVPTWLKLTSDDVKEQIYKLAKKGLTPSQIGVILRDSHGVAQVRFVTGNKILRILKSKGL APDLPEDLYHLIKKAVAVRKHLERNRKDKDAKFRLILIESRIHRLARYYKTKRVLPPNWKYESSTASALVA ; O ? 16 'polypeptide(L)' no no ;MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQD VAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL ; ;MAPRKGKEKKEEQVISLGPQVAEGENVFGVCHIFASFNDTFVHVTDLSGKETICRVTGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQD VAQRCKELGITALHIKLRATGGNRTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPSDSTRRKGGRRGRRL ; P ? 17 'polypeptide(L)' no no ;MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLSRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHL RDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK ; ;MAEVEQKKKRTFRKFTYRGVDLDQLLDMSYEQLMQLYSARQRRRLSRGLRRKQHSLLKRLRKAKKEAPPMEKPEVVKTHL RDMIILPEMVGSMVGVYNGKTFNQVEIKPEMIGHYLGEFSITYKPVKHGRPGIGATHSSRFIPLK ; Q ? 18 'polypeptide(L)' no no ;SARVAPRFPFPVVAPRGEDRHSSAAAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEP VLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGG PGARARYQKSYR ; ;SARVAPRFPFPVVAPRGEDRHSSAAAMPSKGPLQSVQVFGRKKTATAVAHCKRGNGLIKVNGRPLEMIEPRTLQYKLLEP VLLLGKERFAGVDIRVRVKGGGHVAQIYAIRQSISKALVAYYQKYVDEASKKEIKDILIQYDRTLLVADPRRCESKKFGG PGARARYQKSYR ; R ? 19 'polypeptide(L)' no no ;MGRVRTKTVKKAARVIIEKYYTRLGNDFHTNKRVCEEIAIIPSKKLRNKIAGYVTHLMKRIQRGPVRGISIKLQEEERER RDNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLKLLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFKTPRGAV ; ;MGRVRTKTVKKAARVIIEKYYTRLGNDFHTNKRVCEEIAIIPSKKLRNKIAGYVTHLMKRIQRGPVRGISIKLQEEERER RDNYVPEVSALDQEIIEVDPDTKEMLKLLDFGSLSNLQVTQPTVGMNFKTPRGAV ; S ? 20 'polypeptide(L)' no no ;MSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRRKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIP DWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK ; ;MSLVIPEKFQHILRVLNTNIDGRRKIAFAITAIKGVGRRYAHVVLRKADIDLTKRAGELTEDEVERVITIMQNPRQYKIP DWFLNRQKDVKDGKYSQVLANGLDNKLREDLERLKKIRAHRGLRHFWGLRVRGQHTKTTGRRGRTVGVSKKK ; T ? 21 'polypeptide(L)' no no ;MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYG GRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDWGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAAKKKH ; ;MPGVTVKDVNQQEFVRALAAFLKKSGKLKVPEWVDTVKLAKHKELAPYDENWFYTRAASTARHLYLRGGAGVGSMTKIYG GRQRNGVMPSHFSRGSKSVARRVLQALEGLKMVEKDQDWGRKLTPQGQRDLDRIAGQVAAAKKKH ; U ? 22 'polypeptide(L)' no no ;MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRF QMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA ; ;MAFKDTGKTPVEPEVAIHRIRITLTSRNVKSLEKVCADLIRGAKEKNLKVKGPVRMPTKTLRITTRKTPCGEGSKTWDRF QMRIHKRLIDLHSPSEIVKQITSISIEPGVEVEVTIADA ; V ? 23 'polypeptide(L)' no no ;MQSNAGEFVDLYVPRKCSASNRIIGAKDHASIPMNVAEVDKVTGRFNGQSKTYAICGAIRRMGESDDSILRLAKSHGIVS QNF ; ;MQSNAGEFVDLYVPRKCSASNRIIGAKDHASIPMNVAEVDKVTGRFNGQSKTYAICGAIRRMGESDDSILRLAKSHGIVS QNF ; W ? 24 'polypeptide(L)' no no ;MVRMNVLADALKSINNAEKRGKRQVLIRPCSKVIVRFLTVMMKHGYIGEFEIIDDHRAGKIVVNLTGRLNKCGVISPRFD VQLKDLEKWQNNLLPSRQFGFIVLTTSAGIMDHEEARRKHTGGKILGFFF ; ;MVRMNVLADALKSINNAEKRGKRQVLIRPCSKVIVRFLTVMMKHGYIGEFEIIDDHRAGKIVVNLTGRLNKCGVISPRFD VQLKDLEKWQNNLLPSRQFGFIVLTTSAGIMDHEEARRKHTGGKILGFFF ; X ? 25 'polypeptide(L)' no no ;AGKCRGLRTARKLRSHRRDQKWHDKQYKKAHLGTALKANPFGGASHAKGIVLEKVGVEAKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKK ITAFVPNDGCLNFIEENDEVLVAGFGRKGHAVGDIPGVRFKVVKVANVSLLALYKGKKERPRS ; ;AGKCRGLRTARKLRSHRRDQKWHDKQYKKAHLGTALKANPFGGASHAKGIVLEKVGVEAKQPNSAIRKCVRVQLIKNGKK ITAFVPNDGCLNFIEENDEVLVAGFGRKGHAVGDIPGVRFKVVKVANVSLLALYKGKKERPRS ; Y ? 26 'polypeptide(L)' no no ;MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLD YAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKEPRG ; ;MNDTVTIRTRKFMTNRLLQRKQMVIDVLHPGKATVPKTEIREKLAKMYKTTPDVIFVFGFRTHFGGGKTTGFGMIYDSLD YAKKNEPKHRLARHGLYEKKKTSRKQRKERKNRMKKVRGTAKANVGAGKKEPRG ; Z ? 27 'polypeptide(L)' no no ;MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIR GSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA ; ;MPPKDDKKKKDAGKSAKKDKDPVNKSGGKAKKKKWSKGKVRDKLNNLVLFDKATYDKLCKEVPNYKLITPAVVSERLKIR GSLARAALQELLSKGLIKLVSKHRAQVIYTRNTKGGDAPAAGEDA ; a ? 28 'polypeptide(L)' no no ;MTKKRRNNGRAKKGRGHVQPIRCTNCACCVPKDKAIKKFVIRNIVEAAAVRDISEVSVFDAYVLPKLYVKLHYCVSCAIH SKVVRNRSREARKDRTPPPRFRPAGAAPPPPPKPM ; ;MTKKRRNNGRAKKGRGHVQPIRCTNCACCVPKDKAIKKFVIRNIVEAAAVRDISEVSVFDAYVLPKLYVKLHYCVSCAIH SKVVRNRSREARKDRTPPPRFRPAGAAPPPPPKPM ; b ? 29 'polypeptide(L)' no no ;MPLAKDLLHPSPEEEKRKHKKKRLVQSPNSYFMDVKCPGCYKITTVFSHAQTVVLCVGCSTVLCQPTGGKARLTEGCSFR RKQH ; ;MPLAKDLLHPSPEEEKRKHKKKRLVQSPNSYFMDVKCPGCYKITTVFSHAQTVVLCVGCSTVLCQPTGGKARLTEGCSFR RKQH ; c ? 30 'polypeptide(L)' no no MDTSRVQPIKLARVTKVLGRTGSQGQCTQVRVEFMDDTSRSIIRNVKGPVREGDVLTLLESEREARRLR MDTSRVQPIKLARVTKVLGRTGSQGQCTQVRVEFMDDTSRSIIRNVKGPVREGDVLTLLESEREARRLR d ? 31 'polypeptide(L)' no no MGHQQLYWSHPRKFGQGSRSCRVCSNRHGLIRKYGLNMCRQCFRQYAKDIGFIKLD MGHQQLYWSHPRKFGQGSRSCRVCSNRHGLIRKYGLNMCRQCFRQYAKDIGFIKLD e ? 32 'polypeptide(L)' no no ;MQLFVRAQELHTLEVTGRETVAQIKAHVASLEGIAPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALSTLEVAGRMLGGKVHGSL ARVGKVRGQTLKVAKQEKKKKRTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKKKGPNANS ; ;MQLFVRAQELHTLEVTGRETVAQIKAHVASLEGIAPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALSTLEVAGRMLGGKVHGSL ARVGKVRGQTLKVAKQEKKKKRTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKKKGPNANS ; f ? 33 'polypeptide(L)' no no ;MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKR KKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK ; ;MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKR KKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK ; g ? 34 'polypeptide(L)' no no ;MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALS GSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHTKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNS SNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALC FSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR ; ;MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALS GSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHTKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNS SNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALC FSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR ; h ? 35 polyribonucleotide no no ;GAGCGGUUUCUGGAAUACUAUAUGUAAGUAUAGUGUUCUGGAGGCAUCAUUCUAUGGUUACCCAUCAUUAGAGGAAAUUU CCAAUAAACUCUGGUGUAAGGCUUAGAGUGAUGGUCGAGGUGCCCUAUUUAGGGUGAGGAGCCUCGGUGGCAGCCCCACC AAAUCCUCUAUUGGAUAGGAACAGCUGUACUGGGCAGUUACAGCAGUCGUAUGGUAACACAUGCGGCGUUCCGAAAUACC AUGCCUGGCGAUG ; ;GAGCGGUUUCUGGAAUACUAUAUGUAAGUAUAGUGUUCUGGAGGCAUCAUUCUAUGGUUACCCAUCAUUAGAGGAAAUUU CCAAUAAACUCUGGUGUAAGGCUUAGAGUGAUGGUCGAGGUGCCCUAUUUAGGGUGAGGAGCCUCGGUGGCAGCCCCACC AAAUCCUCUAUUGGAUAGGAACAGCUGUACUGGGCAGUUACAGCAGUCGUAUGGUAACACAUGCGGCGUUCCGAAAUACC AUGCCUGGCGAUG ; 1 ? 36 polyribonucleotide no no ;CGCGACCUCAGAUCAGACGUGGCGACCCGCUGAAUUUAAGCAUAUUAGUCAGCGGAGGAAAAGAAACUAACCAGGAUUCC CUCAGUAACGGCGAGUGAACAGGGAAGAGCCCAGCGCCGAAUCCCCGCCCCGCGGCGGGGCGCGGGAAAUGUGGCGUACG GAAGACCCACUCCCCGGCGCCGGGGGGCCCAAGUCCUUCUGAUCGAGGCCCAGCCCGUGGACGGUGUGAGGCCGGUAGCG GCCCCCGGCGCGCCGGGCCCGGGUCUUCCCGGAGUCGGGUUGCUUGGGAAUGCAGCCCAAAGCGGGUGGUAAACUCCAUC UAAGGCUAAAUACCGGCACGAGACCGAUAGUCAACAAGUACCGUAAGGGAAAGUUGAAAAGAACUUUGAAGAGAGAGUUC AAGAGGGCGUGAAACCGUUAAGAGGUAAACGGGUGGGGUCCGCGCAGUCCGCCCGGAGGAUUCAACCCGGCGGCGGGUCC GGCCGUGCCGGCGGGGCGGAUCUCCCGCUCCCGUCGGCGGGGGACCGCCCCCCGGCCGGCGACCGGCCGCCGCCGGGCGC AUUUCCACCGCGGCGGUGCGCCGCGACCGGCUCCGGGACGGCUGGGAAGGCCCGGCGGGGAAGGUGGCCCGGGGGCCCCG GGUGUUACAGCCCACCCGGCAGCAGCAGCUCGCCGAAUCCCGGGGCCGAGGGAGCGAGACCUGUGUCGCCGCGCUCUCCC CCCUGGGGGGGCCGGGCCACCCCUCCCACGGCGCGACCGCUGGGGCGGACUGUCCAGUGCGCCCCGGGCGGGUCGCGCCG UCGGGCCCGGGGGGCCACGCGUCCCCCGCGAGCGCACGGGGUCGGCGGCGAUGUCGGCUACCCACCCGACCCGUCUUGAA ACACGGACCAAGGAGUCUAACACGUGCGCGAGUCGGGGGCUACGAAAGCCGCCGUGGCGCAAUGAAGGUGAAGGCCGGCG CCGCCGGCCGAGGUGGGAUCCCGAGGCCUUCCAGUCCGCCGAGGGCGCACCACCGGCCCGUCUCGCCCGCCGCGCCGGGG 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AKKATAAGKKAAQPPKAQKGQKPPAQKAPAPKASGKKA ; AM ? 51 'polypeptide(L)' no no ;MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRIRVRRGGRKRPVPKGAT YGKPVHHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHRE MRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR ; ;MGAYKYIQELWRKKQSDVMRFLLRVRCWQYRQLSALHRAPRPTRPDKARRLGYKAKQGYVIYRIRVRRGGRKRPVPKGAT YGKPVHHGVNQLKFARSLQSVAEERAGRHCGALRVLNSYWVGEDSTYKFFEVILIDPFHKAIRRNPDTQWITKPVHKHRE MRGLTSAGRKSRGLGKGHKFHHTIGGSRRAAWRRRNTLQLHRYR ; AN ? 52 'polypeptide(L)' no no ;MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIF WRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKR KEKAKIHYRKKKQIMRLRKQAEKNVEKKISKFTEVLKTHGLLV ; ;MAEGQVLVLDGRGHLLGRLAAIVAKQVLLGRKVVVVRCEGINISGNFYRNKLKYLAFLRKRMNTNPSRGPYHFRAPSRIF WRTVRGMLPHKTKRGQAALDRLKVFDGIPPPYDKKKRMVVPAALKVVRLKPTRKFAYLGRLAHEVGWKYQAVTATLEEKR KEKAKIHYRKKKQIMRLRKQAEKNVEKKISKFTEVLKTHGLLV ; AO ? 53 'polypeptide(L)' no no 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;QPSRLRKTRKLRGHVSHGHGRIGKHRKHPGGRGNAGGMHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWT LVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSGYYKVLGKGKLPKQPVIVKAKFFSRRAEEKIKGVGGACVLVA ; ;QPSRLRKTRKLRGHVSHGHGRIGKHRKHPGGRGNAGGMHHHRINFDKYHPGYFGKVGMRHYHLKRNQSFCPTVNLDKLWT LVSEQTRVNAAKNKTGAAPIIDVVRSGYYKVLGKGKLPKQPVIVKAKFFSRRAEEKIKGVGGACVLVA ; Aa ? 65 'polypeptide(L)' no no ;MAKSKNHTTHNQSRKWHRNGIKKPRSQRYESLKGVDPKFLRNMRFAKKHNKKGLKKMQANNAKAMAARAEAIKALVKPKE VKPTIPKGVSRKLHRLAYIAHPKLGRRARARIARGLRLSRPQTKAKAKTEPQIKGKVKAQIKAQAQAQIKSKGKGKAQAE TKPKAQAETKPKAQAQAKPKAQAQGKPKAQAQGKPKAQAQAKPKAQAQAKPKAQAQTKPKAQATPA ; ;MAKSKNHTTHNQSRKWHRNGIKKPRSQRYESLKGVDPKFLRNMRFAKKHNKKGLKKMQANNAKAMAARAEAIKALVKPKE VKPTIPKGVSRKLHRLAYIAHPKLGRRARARIARGLRLSRPQTKAKAKTEPQIKGKVKAQIKAQAQAQIKSKGKGKAQAE TKPKAQAETKPKAQAQAKPKAQAQGKPKAQAQGKPKAQAQAKPKAQAQAKPKAQAQTKPKAQATPA ; Ab ? 66 'polypeptide(L)' no no ;MVAAKKTKKSLESINSRLQLVMKSGKYVLGYKQSLKMIRQGKAKLVILANNCPALRKSEIEYYAMLAKTGVHHYSGNNIE LGTACGKYYRVCTLSIIDPGDSDIIRSMPEQTGEK ; ;MVAAKKTKKSLESINSRLQLVMKSGKYVLGYKQSLKMIRQGKAKLVILANNCPALRKSEIEYYAMLAKTGVHHYSGNNIE LGTACGKYYRVCTLSIIDPGDSDIIRSMPEQTGEK ; Ac ? 67 'polypeptide(L)' no no ;MAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRNV PYRIRVRLSRKRNEDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKNLQTVNVDEN ; ;MAPAKKGGEKKKGRSAINEVVTREYTINIHKRIHGVGFKKRAPRALKEIRKFAMKEMGTPDVRIDTRLNKAVWAKGIRNV PYRIRVRLSRKRNEDEDSPNKLYTLVTYVPVTTFKNLQTVNVDEN ; Ad ? 68 'polypeptide(L)' no no ;MAALRPLVKPKIVKKRTKKFIRHQSDRYVKIKRNWRKPRGIDNRVRRRFKGQILMPNIGYGSNKKTKHMLPSGFRKFLVH NVKELEVLLMCNKSYCAEIAHNVSSKNRKAIVERAAQLAIRVTNPNARLRSEENE ; ;MAALRPLVKPKIVKKRTKKFIRHQSDRYVKIKRNWRKPRGIDNRVRRRFKGQILMPNIGYGSNKKTKHMLPSGFRKFLVH NVKELEVLLMCNKSYCAEIAHNVSSKNRKAIVERAAQLAIRVTNPNARLRSEENE ; Ae ? 69 'polypeptide(L)' no no ;MSGRLWCKAIFAGYKRGLRNQREHTALLKIEGVYARDETEFYLGKRCAYVYKAKNNTVTPGGKPNKTRVIWGKVTRAHGN SGMVRAKFRSNLPAKAIGHRIRVMLYPSRI ; ;MSGRLWCKAIFAGYKRGLRNQREHTALLKIEGVYARDETEFYLGKRCAYVYKAKNNTVTPGGKPNKTRVIWGKVTRAHGN SGMVRAKFRSNLPAKAIGHRIRVMLYPSRI ; Af ? 70 'polypeptide(L)' no no ;LPGRCLEAATMVQRLTYRRRLSYNTASNKTRLSRTPGNRIVYLYTKKVGKAPKSACGVCPGRLRGVRAVRPKVLMRLSKT KKHVSRAYGGSMCAKCVRDRIKRAFLIEEQKIVVKVLKAQAQSQKA ; ;LPGRCLEAATMVQRLTYRRRLSYNTASNKTRLSRTPGNRIVYLYTKKVGKAPKSACGVCPGRLRGVRAVRPKVLMRLSKT KKHVSRAYGGSMCAKCVRDRIKRAFLIEEQKIVVKVLKAQAQSQKA ; Ag ? 71 'polypeptide(L)' no no ;MAKIKARDLRGKKKEELLKQLDDLKVELSQLRVAKVTGGAASKLSKIRVVRKSIARVLTVINQTQKENLRKFYKGKKYKP LDLRPKKTRAMRRRLNKHEESLKTKKQQRKERLYPLRKYAVKA ; ;MAKIKARDLRGKKKEELLKQLDDLKVELSQLRVAKVTGGAASKLSKIRVVRKSIARVLTVINQTQKENLRKFYKGKKYKP LDLRPKKTRAMRRRLNKHEESLKTKKQQRKERLYPLRKYAVKA ; Ah ? 72 'polypeptide(L)' no no ;MALRYPMAVGLNKGHKVTKNVSKPRHSRRRGRLTKHTKFVRDMIREVCGFAPYERRAMELLKVSKDKRALKFIKKRVGTH IRAKRKREELSSVLAAMRKAAAKKD ; ;MALRYPMAVGLNKGHKVTKNVSKPRHSRRRGRLTKHTKFVRDMIREVCGFAPYERRAMELLKVSKDKRALKFIKKRVGTH IRAKRKREELSSVLAAMRKAAAKKD ; Ai ? 73 'polypeptide(L)' no no ;MTKGTSSFGKRRNKTHTLCRRCGSKAYHLQKSTCGKCGYPAKRKRKYNWSAKAKRRNTTGTGRMRHLKIVYRRFRHGFRE GTTPKPKRAAVAASSSS ; ;MTKGTSSFGKRRNKTHTLCRRCGSKAYHLQKSTCGKCGYPAKRKRKYNWSAKAKRRNTTGTGRMRHLKIVYRRFRHGFRE GTTPKPKRAAVAASSSS ; Aj ? 74 'polypeptide(L)' no no PQKIEEIKDFLLTARRKDAKSVKIKKNKDNVKFKVRCSRYLYTLVIMDKEKAEKLKQSLPPGLAMKELK PQKIEEIKDFLLTARRKDAKSVKIKKNKDNVKFKVRCSRYLYTLVIMDKEKAEKLKQSLPPGLAMKELK Ak ? 75 'polypeptide(L)' no no MSSHKTFRIKRFLAKKQKQNRPIPQWIWMKTGNKIRYNSKRRHWRRTKLGL MSSHKTFRIKRFLAKKQKQNRPIPQWIWMKTGNKIRYNSKRRHWRRTKLGL Al ? 76 'polypeptide(L)' no no IIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK IIEPSLRQLAQKYNCDKMICRKCYARLHPRAVNCRKKKCGHTNNLRPKKKVK Am ? 77 'polypeptide(L)' no no MRAKWRKKRMRRLKRKRRKMRQRSK MRAKWRKKRMRRLKRKRRKMRQRSK An ? 78 'polypeptide(L)' no no ;MVNVPKTRRTFCKKCGKHQPHKVTQYKKGKDSLYAQGKRRYDRKQSGYGGQTKPIFRKKAKTTKKIVLRLECVEPNCRSK RMLAIKRCKHFELGGDKKRKGQVIQF ; ;MVNVPKTRRTFCKKCGKHQPHKVTQYKKGKDSLYAQGKRRYDRKQSGYGGQTKPIFRKKAKTTKKIVLRLECVEPNCRSK RMLAIKRCKHFELGGDKKRKGQVIQF ; Ao ? 79 'polypeptide(L)' no no ;MAKRTKKVGIVGKYGTRYGASLRKMVKKIEISQHAKYTCSFCGKTKMKRRAVGIWHCGSCMKTVAGGAWTYNTTSAVTVK SAIRRLKELKDQ ; ;MAKRTKKVGIVGKYGTRYGASLRKMVKKIEISQHAKYTCSFCGKTKMKRRAVGIWHCGSCMKTVAGGAWTYNTTSAVTVK SAIRRLKELKDQ ; Ap ? 80 'polypeptide(L)' no no ;MSAHLQWMVVRNCSSFLIKRNKQTYSTEPNNLKARNSFRYNGLIHRKTVGVEPAADGKGVVVVMKRRSGQRKPATSYVRT TINKNARATLSSIRHMIRKNKYHPDLRMAAIRRASAILRSQKPVMVKRKRTRPTKSS ; ;MSAHLQWMVVRNCSSFLIKRNKQTYSTEPNNLKARNSFRYNGLIHRKTVGVEPAADGKGVVVVMKRRSGQRKPATSYVRT TINKNARATLSSIRHMIRKNKYHPDLRMAAIRRASAILRSQKPVMVKRKRTRPTKSS ; Ar ? 81 'polypeptide(L)' no no ;MSSKVSRDTLYEAVREVLHGNQRKRRKFLETVELQISLKNYDPQKDKRFSGTVRLKSTPRPKFSVCVLGDQQHCDEAKAV DIPHMDIEALKKLNKNKKLVKKLAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMK KVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY ; ;MSSKVSRDTLYEAVREVLHGNQRKRRKFLETVELQISLKNYDPQKDKRFSGTVRLKSTPRPKFSVCVLGDQQHCDEAKAV DIPHMDIEALKKLNKNKKLVKKLAKKYDAFLASESLIKQIPRILGPGLNKAGKFPSLLTHNENMVAKVDEVKSTIKFQMK KVLCLAVAVGHVKMTDDELVYNIHLAVNFLVSLLKKNWQNVRALYIKSTMGKPQRLY ; AK ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 U n 1 2 A n 1 3 C n 1 4 C n 1 5 U n 1 6 G n 1 7 G n 1 8 U n 1 9 U n 1 10 G n 1 11 A n 1 12 U n 1 13 C n 1 14 C n 1 15 U n 1 16 G n 1 17 C n 1 18 C n 1 19 A n 1 20 G n 1 21 U n 1 22 A n 1 23 G n 1 24 C n 1 25 A n 1 26 U n 1 27 A n 1 28 U n 1 29 G n 1 30 C n 1 31 U n 1 32 U n 1 33 G n 1 34 U n 1 35 C n 1 36 U n 1 37 C n 1 38 A n 1 39 A n 1 40 A n 1 41 G n 1 42 A n 1 43 U n 1 44 U n 1 45 A n 1 46 A n 1 47 G n 1 48 C n 1 49 C n 1 50 A n 1 51 U n 1 52 G n 1 53 C n 1 54 A n 1 55 U n 1 56 G n 1 57 U n 1 58 C n 1 59 U n 1 60 A n 1 61 A n 1 62 G n 1 63 U n 1 64 A n 1 65 C n 1 66 G n 1 67 C n 1 68 A n 1 69 C n 1 70 G n 1 71 G n 1 72 C n 1 73 C n 1 74 G n 1 75 G n 1 76 U n 1 77 A n 1 78 C n 1 79 A n 1 80 G n 1 81 U n 1 82 G n 1 83 A n 1 84 A n 1 85 A n 1 86 C n 1 87 U n 1 88 G n 1 89 C n 1 90 G n 1 91 A n 1 92 A n 1 93 U n 1 94 G n 1 95 G n 1 96 C n 1 97 U n 1 98 C n 1 99 A n 1 100 U n 1 101 U n 1 102 A n 1 103 A n 1 104 A n 1 105 U n 1 106 C n 1 107 A n 1 108 G n 1 109 U n 1 110 U n 1 111 A n 1 112 U n 1 113 G n 1 114 G n 1 115 U n 1 116 U n 1 117 C n 1 118 C n 1 119 U n 1 120 U n 1 121 U n 1 122 G n 1 123 G n 1 124 U n 1 125 C n 1 126 G n 1 127 C n 1 128 U n 1 129 C n 1 130 G n 1 131 C n 1 132 U n 1 133 C n 1 134 C n 1 135 U n 1 136 C n 1 137 U n 1 138 C n 1 139 C n 1 140 C n 1 141 A n 1 142 C n 1 143 U n 1 144 U n 1 145 G n 1 146 G n 1 147 A n 1 148 U n 1 149 A n 1 150 A n 1 151 C n 1 152 U n 1 153 G n 1 154 U n 1 155 G n 1 156 G n 1 157 U n 1 158 A n 1 159 A n 1 160 U n 1 161 U n 1 162 C n 1 163 U n 1 164 A n 1 165 G n 1 166 A n 1 167 G n 1 168 C n 1 169 U n 1 170 A n 1 171 A n 1 172 U n 1 173 A n 1 174 C n 1 175 A n 1 176 U n 1 177 G n 1 178 C n 1 179 C n 1 180 G n 1 181 A n 1 182 C n 1 183 G n 1 184 G n 1 185 G n 1 186 C n 1 187 G n 1 188 C n 1 189 U n 1 190 G n 1 191 A n 1 192 C n 1 193 C n 1 194 C n 1 195 C n 1 196 C n 1 197 U n 1 198 U n 1 199 C n 1 200 G n 1 201 C n 1 202 G n 1 203 G n 1 204 G n 1 205 G n 1 206 G n 1 207 G n 1 208 G n 1 209 A n 1 210 U n 1 211 G n 1 212 C n 1 213 G n 1 214 U n 1 215 G n 1 216 C n 1 217 A n 1 218 U n 1 219 U n 1 220 U n 1 221 A n 1 222 U n 1 223 C n 1 224 A n 1 225 G n 1 226 A n 1 227 U n 1 228 C n 1 229 A n 1 230 A n 1 231 A n 1 232 A n 1 233 C n 1 234 C n 1 235 A n 1 236 A n 1 237 C n 1 238 C n 1 239 C n 1 240 G n 1 241 G n 1 242 U n 1 243 C n 1 244 A n 1 245 G n 1 246 C n 1 247 C n 1 248 C n 1 249 C n 1 250 U n 1 251 C n 1 252 U n 1 253 C n 1 254 C n 1 255 G n 1 256 G n 1 257 C n 1 258 C n 1 259 C n 1 260 C n 1 261 G n 1 262 G n 1 263 C n 1 264 C n 1 265 G n 1 266 G n 1 267 G n 1 268 G n 1 269 G n 1 270 G n 1 271 C n 1 272 G n 1 273 G n 1 274 G n 1 275 C n 1 276 G n 1 277 C n 1 278 C n 1 279 G n 1 280 G n 1 281 C n 1 282 G n 1 283 G n 1 284 C n 1 285 U n 1 286 U n 1 287 U n 1 288 G n 1 289 G n 1 290 U n 1 291 G n 1 292 A n 1 293 C n 1 294 U n 1 295 C n 1 296 U n 1 297 A n 1 298 G n 1 299 A n 1 300 U n 1 301 A n 1 302 A n 1 303 C n 1 304 C n 1 305 U n 1 306 C n 1 307 G n 1 308 G n 1 309 G n 1 310 C n 1 311 C n 1 312 G n 1 313 A n 1 314 U n 1 315 C n 1 316 G n 1 317 C n 1 318 A n 1 319 C n 1 320 G n 1 321 C n 1 322 C n 1 323 C n 1 324 C n 1 325 C n 1 326 C n 1 327 G n 1 328 U n 1 329 G n 1 330 G n 1 331 C n 1 332 G n 1 333 G n 1 334 C n 1 335 G n 1 336 A n 1 337 C n 1 338 G n 1 339 A n 1 340 C n 1 341 C n 1 342 C n 1 343 A n 1 344 U n 1 345 U n 1 346 C n 1 347 G n 1 348 A n 1 349 A n 1 350 C n 1 351 G n 1 352 U n 1 353 C n 1 354 U n 1 355 G n 1 356 C n 1 357 C n 1 358 C n 1 359 U n 1 360 A n 1 361 U n 1 362 C n 1 363 A n 1 364 A n 1 365 C n 1 366 U n 1 367 U n 1 368 U n 1 369 C n 1 370 G n 1 371 A n 1 372 U n 1 373 G n 1 374 G n 1 375 U n 1 376 A n 1 377 G n 1 378 U n 1 379 C n 1 380 G n 1 381 C n 1 382 C n 1 383 G n 1 384 U n 1 385 G n 1 386 C n 1 387 C n 1 388 U n 1 389 A n 1 390 C n 1 391 C n 1 392 A n 1 393 U n 1 394 G n 1 395 G n 1 396 U n 1 397 G n 1 398 A n 1 399 C n 1 400 C n 1 401 A n 1 402 C n 1 403 G n 1 404 G n 1 405 G n 1 406 U n 1 407 G n 1 408 A n 1 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31 MGHQQLYWSHPRKFGQGSRSCRVCSNRHGLIRKYGLNMCRQCFRQYAKDIGFIKLD 1 32 UNP G1T8A2_RABIT G1T8A2 ? 32 ;MQLFVRAQELHTLEVTGRETVAQIKAHVASLEGIAPEDQVVLLAGTPLEDEATLGQCGVEALSTLEVAGRMLGGKVHGSL ARVGKVRGQTLKVAKQEKKKKRTGRAKRRMQYNRRFVNVVPTFGKKKGPNANS ; 1 33 UNP G1SK22_RABIT G1SK22 ? 33 ;MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGGAKKR KKKSYTTPKKNKHKRKKVKLAVLKYYKVDENGKISRLRRECPSDECGAGVFMASHFDRHYCGKCCLTYCFNKPEDK ; 1 34 UNP G1SJB4_RABIT G1SJB4 ? 34 ;MTEQMTLRGTLKGHNGWVTQIATTPQFPDMILSASRDKTIIMWKLTRDETNYGIPQRALRGHSHFVSDVVISSDGQFALS GSWDGTLRLWDLTTGTTTRRFVGHTKDVLSVAFSSDNRQIVSGSRDKTIKLWNTLGVCKYTVQDESHSEWVSCVRFSPNS SNPIIVSCGWDKLVKVWNLANCKLKTNHIGHTGYLNTVTVSPDGSLCASGGKDGQAMLWDLNEGKHLYTLDGGDIINALC FSPNRYWLCAATGPSIKIWDLEGKIIVDELKQEVISTSSKAEPPQCTSLAWSADGQTLFAGYTDNLVRVWQVTIGTR ; 1 35 PDB 6P5I 6P5I ? 35 ? 1 36 PDB 6P5I 6P5I ? 36 ? 1 37 PDB 6P5I 6P5I ? 37 ? 1 38 PDB 6P5I 6P5I ? 38 ? 1 39 UNP G1TT27_RABIT G1TT27 ? 39 ;MGRVIRGQRKGAGSVFRAHVKHRKGAARLRAVDFAERHGYIKGIVKDIIHDPGRGAPLAKVVFRDPYRFKKRTELFIAAE GIHTGQFVYCGKKAQLNIGNVLPVGTMPEGTIVCCLEEKPGDRGKLARASGNYATVISHNPETKKTRVKLPSGSKKVISS ANRAVVGVVAGGGRIDKPILKAGRAYHKYKAKRNCWPRVRGVAMNPVEHPFGGGNHQHIGKPSTIRRDAPAGRKVGLIAA RRTGRLRGTKTVQEKEN ; 1 40 UNP G1TL06_RABIT G1TL06 ? 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53 ;MVRYSLDPENPTKSCKSRGSNLRVHFKNTRETAQAIKGMHIRKATKYLKDVTLKKQCVPFRRYNGGVGRCAQAKQWGWTQ GRWPKKSAEFLLHMLKNAESNAELKGLDVDSLVIEHIQVNKAPKMRRRTYRAHGRINPYMSSPCHIEMILTEKEQIVPKP EEEVAQKKKISQKKLKKQKLMARE ; 4 54 PDB 6P5I 6P5I ? 54 ? 1 55 UNP G1TJR3_RABIT G1TJR3 ? 55 ;MSMLRLQKRLASSVLRCGKKKVWLDPNETNEIANANSCQQIRKLIKDGLIIRKPVTVHSRARCQKNTLARRKGRHMGIGK RKGTANARMPEKVKWMRRMRILRRLLRRYRESKKIDRHMYHSLYLKVKGNVFKNKRILMEHIHKLKADKARKKLLADQAE ARRSKTKEARKRREERLQAKKEEIIKTLSKEEETKK ; 1 56 PDB 6P5I 6P5I ? 56 ? 1 57 UNP G1SHQ2_RABIT G1SHQ2 ? 57 ;MTNTKGKRRGTRYMFSRPFRKHGVVPLATYMRIYKKGDIVDIKGMGTVQKGMPHKCYHGKTGRVYNVTQHAVGIVVNKQV KGKILAKRINVRIEHIKHSKSRDSFLKRVKENDQKKKEAKEKGTWVQLKRQPAPPREAHFVRTNGKEPELLEPIPYEFMA ; 1 58 UNP G1TSG1_RABIT G1TSG1 ? 58 ;MAPVKKLVAKGGKKKKQVLKFTLDCTHPVEDRIMDEANSEQFLQERIKVNGKARNLGGGAVTIERSKSKITVTSEVPFSK RYLKYLTKKYLKKNNLHDWLRVVANSKESYELRYFQINQDEEEEEDED ; 1 59 UNP G1T6D1_RABIT G1T6D1 ? 59 ;MSKRGRGGSSGAKFRISLGLPVGAVINCADNTGAKNLYIISVKGIKGRLNRLPAAGVGDMVMATVKKGKPELRKKVHPAV VIRQRKSYRRKDGVFLYFEDNAGVIVNNKGEMKGSAITGPVAKECADLWPRIASNAGSIA ; 1 60 UNP G1SE28_RABIT G1SE28 ? 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G1TX33 1 ? 192 ? 1 192 47 47 6P5I AI 1 ? 214 ? B7NZQ2 1 ? 214 ? 1 214 48 48 6P5I AJ 1 ? 178 ? G1TUB8 1 ? 178 ? 1 178 49 49 6P5I AL 1 ? 211 ? 6P5I 1 ? 211 ? 1 211 50 50 6P5I AM 1 ? 198 ? U3KNW6 1 ? 198 ? 1 198 51 51 6P5I AN 1 ? 204 ? G1T0C1 1 ? 204 ? 1 204 52 52 6P5I AO 1 ? 203 ? 6P5I 1 ? 203 ? 1 203 53 53 6P5I AP 1 ? 184 ? G1TVT6 4 ? 187 ? 1 184 54 54 6P5I AQ 1 ? 188 ? 6P5I 1 ? 188 ? 1 188 55 55 6P5I AR 1 ? 196 ? G1TJR3 1 ? 196 ? 1 196 56 56 6P5I AS 1 ? 176 ? 6P5I 1 ? 176 ? 1 176 57 57 6P5I AT 1 ? 160 ? G1SHQ2 1 ? 160 ? 1 160 58 58 6P5I AU 1 ? 128 ? G1TSG1 1 ? 128 ? 1 128 59 59 6P5I AV 1 ? 140 ? G1T6D1 1 ? 140 ? 1 140 60 60 6P5I AW 1 ? 157 ? G1SE28 1 ? 157 ? 1 157 61 61 6P5I AX 1 ? 156 ? G1SE76 1 ? 156 ? 1 156 62 62 6P5I AY 1 ? 145 ? G1SQH0 1 ? 145 ? 1 145 63 63 6P5I AZ 1 ? 136 ? G1TXF6 1 ? 136 ? 1 136 64 64 6P5I Aa 1 ? 148 ? G1SNY0 1 ? 148 ? 1 148 65 65 6P5I Ab 1 ? 226 ? G1SGR6 1 ? 226 ? 1 226 66 66 6P5I Ac 1 ? 115 ? G1TDL2 1 ? 115 ? 1 115 67 67 6P5I Ad 1 ? 125 ? G1SHG0 1 ? 125 ? 1 125 68 68 6P5I Ae 1 ? 135 ? G1U437 1 ? 135 ? 1 135 69 69 6P5I Af 1 ? 110 ? G1SF08 1 ? 110 ? 1 110 70 70 6P5I Ag 1 ? 126 ? G1U945 1 ? 126 ? -9 116 71 71 6P5I Ah 1 ? 123 ? G1SIT5 1 ? 123 ? 1 123 72 72 6P5I Ai 1 ? 105 ? G1TTQ5 1 ? 105 ? 1 105 73 73 6P5I Aj 1 ? 97 ? U3KPD5 1 ? 97 ? 1 97 74 74 6P5I Ak 1 ? 69 ? 6P5I 2 ? 70 ? 2 70 75 75 6P5I Al 1 ? 51 ? G1TTN1 1 ? 51 ? 1 51 76 76 6P5I Am 1 ? 52 ? 6P5I 51 ? 102 ? 51 102 77 77 6P5I An 1 ? 25 ? A0A087WNH4 1 ? 25 ? 1 25 78 78 6P5I Ao 1 ? 106 ? G1U344 1 ? 106 ? 1 106 79 79 6P5I Ap 1 ? 92 ? G1SY53 1 ? 92 ? 1 92 80 80 6P5I Ar 1 ? 137 ? G1U7L1 1 ? 137 ? 1 137 81 81 6P5I AK 1 ? 217 ? G1SKZ8 1 ? 217 ? 1 217 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight A 'RNA linking' y "ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 C 'RNA linking' y "CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O8 P' 323.197 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 G 'RNA linking' y "GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O8 P' 363.221 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6P5I _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6P5I _struct.title 'Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1)' _struct.pdbx_descriptor Ribosome _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6P5I _struct_keywords.text ;Israeli Acute Paralysis Virus, Internal Ribosome Entry Site, IRES, Small Ribosomal Subunit, 40S, Large Ribosomal Subunit, 60S, 80S, RIBOSOME ; _struct_keywords.pdbx_keywords RIBOSOME # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? M N N 13 ? N N N 14 ? O N N 15 ? P N N 16 ? Q N N 17 ? R N N 18 ? S N N 19 ? T N N 20 ? U N N 21 ? V N N 22 ? W N N 23 ? X N N 24 ? Y N N 25 ? Z N N 26 ? AA N N 27 ? BA N N 28 ? CA N N 29 ? DA N N 30 ? EA N N 31 ? FA N N 32 ? GA N N 33 ? HA N N 34 ? IA N N 35 ? JA N N 36 ? KA N N 37 ? LA N N 38 ? MA N N 39 ? NA N N 40 ? OA N N 41 ? PA N N 42 ? QA N N 43 ? RA N N 44 ? SA N N 45 ? TA N N 46 ? UA N N 47 ? VA N N 48 ? WA N N 49 ? XA N N 50 ? YA N N 51 ? ZA N N 52 ? AB N N 53 ? BB N N 54 ? CB N N 55 ? DB N N 56 ? EB N N 57 ? FB N N 58 ? GB N N 59 ? HB N N 60 ? IB N N 61 ? JB N N 62 ? KB N N 63 ? LB N N 64 ? MB N N 65 ? NB N N 66 ? OB N N 67 ? PB N N 68 ? QB N N 69 ? RB N N 70 ? SB N N 71 ? TB N N 72 ? UB N N 73 ? VB N N 74 ? WB N N 75 ? XB N N 76 ? YB N N 77 ? ZB N N 78 ? AC N N 79 ? BC N N 80 ? CC N N 81 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LYS B 11 ? GLY B 22 ? LYS B 11 GLY B 22 1 ? 12 HELX_P HELX_P2 AA2 MET B 34 ? GLN B 36 ? MET B 34 GLN B 36 5 ? 3 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN B 50 ? ALA B 67 ? ASN B 50 ALA B 67 1 ? 18 HELX_P HELX_P4 AA4 ASN B 70 ? ASP B 73 ? ASN B 70 ASP B 73 5 ? 4 HELX_P HELX_P5 AA5 GLY B 83 ? GLY B 95 ? GLY B 83 GLY B 95 1 ? 13 HELX_P HELX_P6 AA6 HIS B 131 ? ALA B 137 ? HIS B 131 ALA B 137 1 ? 7 HELX_P HELX_P7 AA7 GLY B 167 ? GLY B 187 ? GLY B 167 GLY B 187 1 ? 21 HELX_P HELX_P8 AA8 MET B 198 ? PHE B 203 ? MET B 198 PHE B 203 5 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP B 206 ? ALA B 217 ? ASP B 206 ALA B 217 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 PRO C 24 ? SER C 26 ? PRO C 24 SER C 26 5 ? 3 HELX_P HELX_P11 AB2 SER C 59 ? LYS C 63 ? SER C 59 LYS C 63 5 ? 5 HELX_P HELX_P12 AB3 ALA C 72 ? LEU C 74 ? ALA C 72 LEU C 74 5 ? 3 HELX_P HELX_P13 AB4 THR C 106 ? VAL C 114 ? THR C 106 VAL C 114 1 ? 9 HELX_P HELX_P14 AB5 GLN C 157 ? THR C 178 ? GLN C 157 THR C 178 1 ? 22 HELX_P HELX_P15 AB6 ASP C 180 ? ILE C 189 ? ASP C 180 ILE C 189 1 ? 10 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP C 191 ? CYS C 201 ? ASP C 191 CYS C 201 1 ? 11 HELX_P HELX_P17 AB8 GLN C 202 ? ILE C 204 ? GLN C 202 ILE C 204 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 AB9 GLU C 224 ? HIS C 232 ? GLU C 224 HIS C 232 1 ? 9 HELX_P HELX_P19 AC1 THR D 26 ? ASP D 34 ? THR D 64 ASP D 72 1 ? 9 HELX_P HELX_P20 AC2 LEU D 40 ? PHE D 46 ? LEU D 78 PHE D 84 1 ? 7 HELX_P HELX_P21 AC3 ILE D 55 ? LEU D 60 ? ILE D 93 LEU D 98 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 GLY D 61 ? LEU D 64 ? GLY D 99 LEU D 102 5 ? 4 HELX_P HELX_P23 AC5 GLU D 108 ? SER D 123 ? GLU D 146 SER D 161 1 ? 16 HELX_P HELX_P24 AC6 ALA D 169 ? GLY D 180 ? ALA D 207 GLY D 218 1 ? 12 HELX_P HELX_P25 AC7 THR D 194 ? ILE D 206 ? THR D 232 ILE D 244 1 ? 13 HELX_P HELX_P26 AC8 THR D 214 ? LYS D 219 ? THR D 252 LYS D 257 5 ? 6 HELX_P HELX_P27 AC9 SER D 226 ? PHE D 231 ? SER D 264 PHE D 269 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 AD1 SER E 44 ? LEU E 67 ? SER E 6 LEU E 29 1 ? 24 HELX_P HELX_P29 AD2 ALA E 68 ? ASP E 70 ? ALA E 30 ASP E 32 5 ? 3 HELX_P HELX_P30 AD3 ARG E 92 ? GLY E 98 ? ARG E 54 GLY E 60 1 ? 7 HELX_P HELX_P31 AD4 GLY E 101 ? PHE E 115 ? GLY E 63 PHE E 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P32 AD5 CYS E 135 ? GLY E 150 ? CYS E 97 GLY E 112 1 ? 16 HELX_P HELX_P33 AD6 ALA E 152 ? GLU E 166 ? ALA E 114 GLU E 128 1 ? 15 HELX_P HELX_P34 AD7 PRO E 201 ? TYR E 205 ? 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CC 81 186 ALA 186 186 186 ALA ALA AK . n CC 81 187 VAL 187 187 187 VAL VAL AK . n CC 81 188 ASN 188 188 188 ASN ASN AK . n CC 81 189 PHE 189 189 189 PHE PHE AK . n CC 81 190 LEU 190 190 190 LEU LEU AK . n CC 81 191 VAL 191 191 191 VAL VAL AK . n CC 81 192 SER 192 192 192 SER SER AK . n CC 81 193 LEU 193 193 193 LEU LEU AK . n CC 81 194 LEU 194 194 194 LEU LEU AK . n CC 81 195 LYS 195 195 195 LYS LYS AK . n CC 81 196 LYS 196 196 196 LYS LYS AK . n CC 81 197 ASN 197 197 197 ASN ASN AK . n CC 81 198 TRP 198 198 198 TRP TRP AK . n CC 81 199 GLN 199 199 199 GLN GLN AK . n CC 81 200 ASN 200 200 200 ASN ASN AK . n CC 81 201 VAL 201 201 201 VAL VAL AK . n CC 81 202 ARG 202 202 202 ARG ARG AK . n CC 81 203 ALA 203 203 203 ALA ALA AK . n CC 81 204 LEU 204 204 204 LEU LEU AK . n CC 81 205 TYR 205 205 205 TYR TYR AK . n CC 81 206 ILE 206 206 206 ILE ILE AK . n CC 81 207 LYS 207 207 207 LYS LYS AK . n CC 81 208 SER 208 208 208 SER SER AK . n CC 81 209 THR 209 209 209 THR THR AK . n CC 81 210 MET 210 210 210 MET MET AK . n CC 81 211 GLY 211 211 211 GLY GLY AK . n CC 81 212 LYS 212 212 212 LYS LYS AK . n CC 81 213 PRO 213 213 213 PRO PRO AK . n CC 81 214 GLN 214 214 214 GLN GLN AK . n CC 81 215 ARG 215 215 215 ARG ARG AK . n CC 81 216 LEU 216 216 216 LEU LEU AK . n CC 81 217 TYR 217 217 217 TYR TYR AK . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details 81-meric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 81 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list ;A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA,EA,FA,GA,HA,IA,JA,KA,LA,MA,NA,OA,PA,QA,RA,SA,TA,UA,VA,WA,XA,YA,ZA,AB,BB,CB,DB,EB,FB,GB,HB,IB,JB,KB,LB,MB,NB,OB,PB,QB,RB,SB,TB,UB,VB,WB,XB,YB,ZB,AC,BC,CC ; # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 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citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 3 'Structure model' citation 4 4 'Structure model' pdbx_audit_support 5 5 'Structure model' entity_src_gen 6 5 'Structure model' entity_src_nat 7 5 'Structure model' struct_ref 8 5 'Structure model' struct_ref_seq # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.country' 2 2 'Structure model' '_citation.journal_abbrev' 3 2 'Structure model' '_citation.journal_id_ASTM' 4 2 'Structure model' '_citation.journal_id_CSD' 5 2 'Structure model' '_citation.journal_id_ISSN' 6 2 'Structure model' '_citation.page_first' 7 2 'Structure model' '_citation.page_last' 8 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_DOI' 9 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 10 2 'Structure model' '_citation.title' 11 2 'Structure model' '_citation.year' 12 2 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 13 2 'Structure model' '_citation_author.name' 14 3 'Structure model' '_citation.journal_volume' 15 4 'Structure model' '_pdbx_audit_support.funding_organization' 16 5 'Structure model' '_entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num' 17 5 'Structure model' '_entity_src_gen.pdbx_end_seq_num' 18 5 'Structure model' '_entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name' 19 5 'Structure model' '_entity_src_gen.pdbx_seq_type' 20 5 'Structure model' '_entity_src_nat.common_name' 21 5 'Structure model' '_entity_src_nat.pdbx_ncbi_taxonomy_id' 22 5 'Structure model' '_entity_src_nat.pdbx_organism_scientific' 23 5 'Structure model' '_struct_ref.db_code' 24 5 'Structure model' '_struct_ref.db_name' 25 5 'Structure model' '_struct_ref.pdbx_align_begin' 26 5 'Structure model' '_struct_ref.pdbx_db_accession' 27 5 'Structure model' '_struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code' 28 5 'Structure model' '_struct_ref_seq.db_align_beg' 29 5 'Structure model' '_struct_ref_seq.db_align_end' 30 5 'Structure model' '_struct_ref_seq.pdbx_db_accession' # _em_3d_fitting.entry_id 6P5I _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol ? _em_3d_fitting.ref_space ? _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 6P5I _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 120176 _em_3d_reconstruction.resolution 3.1 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.name 'Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1)' _em_entity_assembly.source 'MULTIPLE SOURCES' _em_entity_assembly.type RIBOSOME _em_entity_assembly.entity_id_list ;1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45, 46, 47, 48, 49, 50, 51, 52, 53, 54, 55, 56, 57, 58, 59, 60, 61, 62, 63, 64, 65, 66, 67, 68, 69, 70, 71, 72, 73, 74, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81 ; _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 6P5I _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height 3838 _em_image_scans.dimension_width 3710 _em_image_scans.frames_per_image 40 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image 1-40 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 6P5I _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode OTHER _em_imaging.microscope_model 'FEI TECNAI F30' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.26 _em_imaging.nominal_defocus_max 2500 _em_imaging.nominal_defocus_min 800 _em_imaging.nominal_magnification 31000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ;Plasma cleaning for both holey carbon and holey gold grids was done on a Gatan Solarus with Hydrogen (6.4 sccm gas flow) and Oxygen (27.5 sccm gas flow) and 10 W cleaning power. ; _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R2/2' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 277.15 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;Blot force = 3s Wait 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MB GLN 184 1517 1 Y 1 Ab GLY 185 ? MB GLY 185 1518 1 Y 1 Ab LYS 186 ? MB LYS 186 1519 1 Y 1 Ab PRO 187 ? MB PRO 187 1520 1 Y 1 Ab LYS 188 ? MB LYS 188 1521 1 Y 1 Ab ALA 189 ? MB ALA 189 1522 1 Y 1 Ab GLN 190 ? MB GLN 190 1523 1 Y 1 Ab ALA 191 ? MB ALA 191 1524 1 Y 1 Ab GLN 192 ? MB GLN 192 1525 1 Y 1 Ab GLY 193 ? MB GLY 193 1526 1 Y 1 Ab LYS 194 ? MB LYS 194 1527 1 Y 1 Ab PRO 195 ? MB PRO 195 1528 1 Y 1 Ab LYS 196 ? MB LYS 196 1529 1 Y 1 Ab ALA 197 ? MB ALA 197 1530 1 Y 1 Ab GLN 198 ? MB GLN 198 1531 1 Y 1 Ab ALA 199 ? MB ALA 199 1532 1 Y 1 Ab GLN 200 ? MB GLN 200 1533 1 Y 1 Ab ALA 201 ? MB ALA 201 1534 1 Y 1 Ab LYS 202 ? MB LYS 202 1535 1 Y 1 Ab PRO 203 ? MB PRO 203 1536 1 Y 1 Ab LYS 204 ? MB LYS 204 1537 1 Y 1 Ab ALA 205 ? MB ALA 205 1538 1 Y 1 Ab GLN 206 ? MB GLN 206 1539 1 Y 1 Ab ALA 207 ? MB ALA 207 1540 1 Y 1 Ab GLN 208 ? MB GLN 208 1541 1 Y 1 Ab ALA 209 ? MB ALA 209 1542 1 Y 1 Ab LYS 210 ? MB LYS 210 1543 1 Y 1 Ab PRO 211 ? MB PRO 211 1544 1 Y 1 Ab LYS 212 ? MB LYS 212 1545 1 Y 1 Ab ALA 213 ? MB ALA 213 1546 1 Y 1 Ab GLN 214 ? MB GLN 214 1547 1 Y 1 Ab ALA 215 ? MB ALA 215 1548 1 Y 1 Ab GLN 216 ? MB GLN 216 1549 1 Y 1 Ab THR 217 ? MB THR 217 1550 1 Y 1 Ab LYS 218 ? MB LYS 218 1551 1 Y 1 Ab PRO 219 ? MB PRO 219 1552 1 Y 1 Ab LYS 220 ? MB LYS 220 1553 1 Y 1 Ab ALA 221 ? MB ALA 221 1554 1 Y 1 Ab GLN 222 ? MB GLN 222 1555 1 Y 1 Ab ALA 223 ? MB ALA 223 1556 1 Y 1 Ab THR 224 ? MB THR 224 1557 1 Y 1 Ab PRO 225 ? MB PRO 225 1558 1 Y 1 Ab ALA 226 ? MB ALA 226 1559 1 Y 1 Ac MET 1 ? NB MET 1 1560 1 Y 1 Ac VAL 2 ? NB VAL 2 1561 1 Y 1 Ac ALA 3 ? NB ALA 3 1562 1 Y 1 Ac ALA 4 ? NB ALA 4 1563 1 Y 1 Ac LYS 5 ? NB LYS 5 1564 1 Y 1 Ac LYS 6 ? NB LYS 6 1565 1 Y 1 Ac THR 7 ? NB THR 7 1566 1 Y 1 Ac LYS 8 ? NB LYS 8 1567 1 Y 1 Ac LYS 9 ? NB LYS 9 1568 1 Y 1 Ac MET 108 ? NB MET 108 1569 1 Y 1 Ac PRO 109 ? NB PRO 109 1570 1 Y 1 Ac GLU 110 ? NB GLU 110 1571 1 Y 1 Ac GLN 111 ? NB GLN 111 1572 1 Y 1 Ac THR 112 ? NB THR 112 1573 1 Y 1 Ac GLY 113 ? NB GLY 113 1574 1 Y 1 Ac GLU 114 ? NB GLU 114 1575 1 Y 1 Ac LYS 115 ? NB LYS 115 1576 1 Y 1 Ad MET 1 ? OB MET 1 1577 1 Y 1 Ad ALA 2 ? OB ALA 2 1578 1 Y 1 Ad PRO 3 ? OB PRO 3 1579 1 Y 1 Ad ALA 4 ? OB ALA 4 1580 1 Y 1 Ad LYS 5 ? OB LYS 5 1581 1 Y 1 Ad LYS 6 ? OB LYS 6 1582 1 Y 1 Ad GLY 7 ? OB GLY 7 1583 1 Y 1 Ad GLY 8 ? OB GLY 8 1584 1 Y 1 Ad GLU 9 ? OB GLU 9 1585 1 Y 1 Ad LYS 10 ? OB LYS 10 1586 1 Y 1 Ad LYS 11 ? OB LYS 11 1587 1 Y 1 Ad LYS 12 ? OB LYS 12 1588 1 Y 1 Ad GLY 13 ? OB GLY 13 1589 1 Y 1 Ad ARG 14 ? OB ARG 14 1590 1 Y 1 Ad SER 15 ? OB SER 15 1591 1 Y 1 Ad ALA 16 ? OB ALA 16 1592 1 Y 1 Ad ILE 17 ? OB ILE 17 1593 1 Y 1 Ad ASN 125 ? OB ASN 125 1594 1 Y 1 Ae MET 1 ? PB MET 1 1595 1 Y 1 Ae ARG 130 ? PB ARG 130 1596 1 Y 1 Ae SER 131 ? PB SER 131 1597 1 Y 1 Ae GLU 132 ? PB GLU 132 1598 1 Y 1 Ae GLU 133 ? PB GLU 133 1599 1 Y 1 Ae ASN 134 ? PB ASN 134 1600 1 Y 1 Ae GLU 135 ? PB GLU 135 1601 1 Y 1 Af MET 1 ? QB MET 1 1602 1 Y 1 Ag LEU -9 ? RB LEU 1 1603 1 Y 1 Ag PRO -8 ? RB PRO 2 1604 1 Y 1 Ag GLY -7 ? RB GLY 3 1605 1 Y 1 Ag ARG -6 ? RB ARG 4 1606 1 Y 1 Ag CYS -5 ? RB CYS 5 1607 1 Y 1 Ag LEU -4 ? RB LEU 6 1608 1 Y 1 Ag GLU -3 ? RB GLU 7 1609 1 Y 1 Ag ALA -2 ? RB ALA 8 1610 1 Y 1 Ag ALA -1 ? RB ALA 9 1611 1 Y 1 Ag THR 0 ? RB THR 10 1612 1 Y 1 Ag MET 1 ? RB MET 11 1613 1 Y 1 Ag ALA 116 ? RB ALA 126 1614 1 Y 1 Ah MET 1 ? SB MET 1 1615 1 Y 1 Ai MET 1 ? TB MET 1 1616 1 Y 1 Ai LYS 104 ? TB LYS 104 1617 1 Y 1 Ai ASP 105 ? TB ASP 105 1618 1 Y 1 Aj MET 1 ? UB MET 1 1619 1 Y 1 Aj ARG 88 ? UB ARG 88 1620 1 Y 1 Aj ALA 89 ? UB ALA 89 1621 1 Y 1 Aj ALA 90 ? UB ALA 90 1622 1 Y 1 Aj VAL 91 ? UB VAL 91 1623 1 Y 1 Aj ALA 92 ? UB ALA 92 1624 1 Y 1 Aj ALA 93 ? UB ALA 93 1625 1 Y 1 Aj SER 94 ? UB SER 94 1626 1 Y 1 Aj SER 95 ? UB SER 95 1627 1 Y 1 Aj SER 96 ? UB SER 96 1628 1 Y 1 Aj SER 97 ? UB SER 97 1629 1 Y 1 Al MET 1 ? WB MET 1 1630 1 Y 1 Ao MET 1 ? ZB MET 1 1631 1 Y 1 Ao PHE 106 ? ZB PHE 106 1632 1 Y 1 Ap MET 1 ? AC MET 1 1633 1 Y 1 Ar MET 1 ? BC MET 1 1634 1 Y 1 Ar VAL 126 ? BC VAL 126 1635 1 Y 1 Ar LYS 127 ? BC LYS 127 1636 1 Y 1 Ar ARG 128 ? BC ARG 128 1637 1 Y 1 Ar LYS 129 ? BC LYS 129 1638 1 Y 1 Ar ARG 130 ? BC ARG 130 1639 1 Y 1 Ar THR 131 ? BC THR 131 1640 1 Y 1 Ar ARG 132 ? BC ARG 132 1641 1 Y 1 Ar PRO 133 ? BC PRO 133 1642 1 Y 1 Ar THR 134 ? BC THR 134 1643 1 Y 1 Ar LYS 135 ? BC LYS 135 1644 1 Y 1 Ar SER 136 ? BC SER 136 1645 1 Y 1 Ar SER 137 ? BC SER 137 1646 1 Y 1 AK MET 1 ? CC MET 1 1647 1 Y 1 AK SER 2 ? CC SER 2 1648 1 Y 1 AK SER 3 ? CC SER 3 1649 1 Y 1 AK LYS 4 ? CC LYS 4 1650 1 Y 1 AK VAL 5 ? CC VAL 5 # loop_ _em_buffer_component.buffer_id _em_buffer_component.id _em_buffer_component.concentration _em_buffer_component.concentration_units _em_buffer_component.formula _em_buffer_component.name 1 1 20 mM Tris-HCl ? 1 2 100 mM KCl ? 1 3 8 mM MgCl2 ? 1 4 2 mM DTT ? # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units ? _em_entity_assembly_molwt.value ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 9986 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Oryctolagus cuniculus' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 42.09 _em_image_recording.average_exposure_time 8 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images 11234 # _em_particle_selection.id 1 _em_particle_selection.image_processing_id 1 _em_particle_selection.details ? _em_particle_selection.method ? _em_particle_selection.num_particles_selected 1240275 _em_particle_selection.reference_model ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? Leginon ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Gctf ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? RELION ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? RELION ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ;Ribosomal complexes for the pre-translocated state were assembled at 240-390 nM concentration and applied to plasma treated holey carbon. ; _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6P5I 'double helix' 6P5I 'a-form double helix' 6P5I 'z-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A A 516 1_555 A U 31 1_555 -4.724 -2.747 -0.322 13.295 -0.427 -94.870 1 2_A516:U31_2 2 516 ? 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