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3 ;MAAQPLYMEGMASTHQANCIFGEHAGSQCLSNCVMYLASSYYNSETPLVDRASLDDVLEQGMRLDLLLRKSGMLGFRQYA QLHHIPGFLRTDDWATKIFQSPEFYGLIGQDAAIREPFIESLRSVLSRNYAGTVQYLIIICQSKAGAIVVKDKTYYMFDP HCIPNIPNSPAHVIKTNDVGVLLPYIATHDTEYTGCFLYFIPHDYISPEHYIANHYRTIVFEELHGPRMDISRGVESCSI TEITSPSVSPAPSEAPLRRDSTQSQDETRPRRPRVVIPPYDPTDRPRPPHQDRPPEQAAGYGGNKGRGGNKGRGGKTGRG GNEGRGGHQPPDEHQPPHITAEHMDQSDGQGADGDMDSTPANGETSVTETPGPEPNPPARPDREPPPTPPATPGATALLS DLTATRGQKRKFSSLKESYPIDSPPSDDDDVSQPSQQTAPDTEDIWIDDPLTPLYPLTDTPSFDITADVTPDNTHPEKAA DGDFTNKTTSTDADRYASASQESLGTLVSPYDFTNLDTLLAELGRLGTAQPIPVIVDRLTSRPFREASALQAMDRILTHV VLEYGLVSGYSTAAPSKCTHVLQFFILWGEKLGIPTEDAKTLLESALEIPAMCEIVQQGRLKEPTFSRHIISKLNPCLES LHATSRQDFKSLIQAFNAEGIRIASRERETSMAELIETITARLKPNFNIVCARQDAQTIQDGVGLLRAEVNKRNAQIAQE AAYFENIITALSTFQPPPQSQQTFEVLPDLKLRTLVEHLTLVEAQVTTQTVESLQAYLQSAATAEHHLTNVPNVHSILSN ISNTLKVIDYVIPKFIINTDTLAPYKQQFSYLGGELASMFSLDWPHAPAEAVEPLPVLTSLRGKIAEALTRQENKNAVDQ ILTDAEGLLKNITDPNGAHFHAQAVSIPVLENYVHNAGVLLKGEKSERFSRLKTAIQNLVSSESFITVTLHSTNLGNLVT NVPKLGEAFTGGPHLLTSPSVRQSLSTLCTTLLRDALDALEKKDPALLGEGTTLALETLLGYGSVQDYKETVQIISSLVG IQKLVRDQGADKWATAVTRLTDLKSTLATTAIETATKRKLYRLIQRDLKEAQKHETNRAMEEWKQKVLALDNASPERVAT LLQQAPTAKAREFAEKHFKILLPVPADAPVQASPTPMEYSASPLPDPKDIDRATSIHGEQAWKKIQQAFKDFNFAVLRPA DWDALAAEYQRRGSPLPAAVGPALSGFLETILGTLNDIYMDKLRSFLPDAQPFQAPPFDWLTPYQDQVSFFLRTIGLPLV RALADKISVQALRLSHALQSGDLQQATVGTPLELPATEYARIASNMKSVFNDHGLQVRSEVADYVEAQRADAHTPHVPRP KIQAPKTLIPHPDAIVADGLPAFLKTSLLQQEAKLLALQRADFESLESDMRAAEAQRKASREETQRKMAHAITQLLQQAP SAISGRPLSLQDPVGFLEGIIYDKVLERESYETGLEGLSWLEQTIKSITVYAPVEEKQRMHVLLDEVKKQRANTETALEL EAAATHGDDARLLQRAVDELSPLRVKGGKAAVESWRQKIQTLKSLVQEAEQAGLLLATIDTVAGQAQETISPSTLQGLYQ QGQEAMAAIKRFRDSPQLAGLQEKLAELQQYVKYKKQYLEHFEATQSVVFTAFPLTQEVTIPALHYAGPFDNLERLSRYL HIGQTQPAPGQWLLTLPTFDPTRPACVPAGGHEPPLHRQVVFSSFLEAQIRLALSVAGPVPGRGLPGTPQIRRGVEAAAC FLHQWDEISRLLPEVLDTFFHNAPLPAESSSNAFLAMCVLTHLVYLAGRAVLGPREPEHAAPDAYPREVALAPRDLTYLL LAMWPSWISAILKQPSHAEAAHACLVTLPTMLKAVPYLTLEASAGPLPADMRHFATPEARLFFPARWHHVNVQEKLWLRN DFMSLCHRSPGRARIAVLVWAVTCLDPEVIRQLWSTLRPLTADESDTASGLLRVLVEMEFGPPPKTPRREAVAPGATLPP YPYGLATGERLVGQAQERSGGAGKMPVSGFEIVLGALLFRAPLRIFSTASTHRISDFEGGFQILTPLLDCCPDREPFASL AAAPRRTVPLGDPCANIHTPEEIQIFARQAAWLQYTFANYQIPSTDNPIPIVVLNANNNLENSYIPRDRKADPLRPFYVV PLKPQGRWPEIMTTATTPCRLPTSPEEAGSQFARLLQSQVSATWSDIFSRVPERLAPNAPQKSSQTMSEIHEVAATPPLT ITPNKPTGTPHVSPEADPITERKRGQQPKIVADNMPSRILPSLPTPKPREPRITLPHALPVISPPAHRPSPIPHLPAPQV TEPKGVLQSKRGTLVLRPAAVIDPRKPVSAPITRYERTALQPPRTEGEGRRPPDTQPVTLTFRLPPTAPTPATAALETKT TPPSTPPHAIDISPPQTPPMSTSPHARDTSPPAEKRAAPVIRVMAPTQPSGEARVKRVEIEQGLSTRNEAPPLERSNHAV PAVTPRRTVAREIRIPPEIKAGWDTAPDIPLPHSSPESSPPTSPQPIRVDDKSPLPNLVERYARGFLDTPSVEVMSLENQ DIAVDPGLLTRRIPSVVPMPHPIMWSPIVPISLQNTDIDTAKITLISFIRRIKQKVAALSASLAETVDRIKKWYL ; 1 4 UNP Q76RF6_HHV8 Q76RF6 ? 4 ;MKVQAENAARLGRQVLGLLPPPTHRVSLTRGPEFARGVRDLLSKYAASTRPTVGSLHEALRQAPFRQPTYGDFLVYSQTF SPQEPLGTFLFSFKQEDNGSSMDMLLTPTSLFMLSGMEAAKAPQTHKVAGVWYGSGSGLADFIPNLSELMDTGEFHTLLT PVGPMVQSVHSTFVTKVTSAMKGVGLARDEPRAHVGLTLPCDMLVDLDESCPMVQRREPAGLNVTIYASLVYLRVNQRPS MALTFFQSGKGFAEVVAMIKDHFTDVIRTKYIQLRHELYINRLVFGAVCTLGTVPFDSHPVHQSLNVKGTSLPVLVFANF EAACGPWTVFL ; 1 5 UNP C7E5A9_HHV8 C7E5A9 ? 5 ;MALDKSIVVNLTSRLFADELAALQSKIGSVLPLGDCHRLQNIQALGLGCVCSRETSPDYIQIMQYLSKCTLAVLEEVRPD SLRLTRMDPSDNLQIKNVYAPFFQWDSNTQLAVLPPLFSRKDSTIVLESNGFDIVFPMVVPQQLGHAILQQLLVYHIYSK ISAGAPGDVNMAELDLYTTNVSFMGRTYRLDVDNTDPRTALRVLDDLSMYLCILSALVPRGCLRLLTALVRHDRHPLTEV FEGVVPDEVTRIDLDQLSVPDDITRMRVMFSYLQSLSSIFNLGPRLHVYAYSAETLAASCWYSPR ; 1 6 UNP D0UZN7_HHV8 D0UZN7 ? 6 ;MEATLEQRPFPYLATEANLLTQIKESAADGLFKSFQLLLGKDAREGSVRFEALLGVYTNVVEFVKFLETALAAACVNTEF KDLRRMIDGKIQFKISMPTIAHGDGRRPNKQRQYIVMKACNKHHIGAEIELAAADIELLFAEKETPLDFTEYAGAIKTIT SALQFGMDALERGLVDTVLAVKLRHAPPVFILKTLGDPVYSERGLKKAVKSDMVSMFKAHLIEHSFFLDKAELMTRGKQY VLTMLSDMLAAVCEDTVFKGVSTYTTASGQQVAGVLETTDSVMRRLMNLLGQVESAMSGPAAYASYVVRGANLVTAVSYG RAMRNFEQFMARIVDHPNALPSVEGDKAALADGHDEIQRTRIAASLVKIGDKFVAIESLQRMYNETQFPCPLNRRIQYTY FFPVGLHLPVPRYSTSVSVRGVESPAIQSTETWVVNKNNVPLCFGYQNALKSICHPRMHNPTQSAQALNQAFPDPDGGHG YGLRYEQTPNMNLFRTFHQYYMGKNVAFVPDVAQKALVTTEDLLHPTSHRLLRLEVHPFFDFFVHPCPGARGSYRATHRT MVGNIPQPLAPREFQESRGAQFDAVTNMTHVIDQLTIDVIQETAFDPAYPLFCYVIEAMIHGQEEKFVMNMPLIALVIQT YWVNSGKLAFVNSYHMVRFICTHMGNGSIPKEAHGHYRKILGELIALEQALLKLAGHETVGRTPITHLVSALLDPHLLPP FAYHDVFTDLMQKSSRQPIIKIGDQNYDNPQNRATFINLRGRMEDLVNNLVNIYQTRVNEDHDERHVLDVAPLDENDYNP VLEKLFYYVLMPVCSNGHMCGMGVDYQNVALTLTYNGPVFADVVNAQDDILLHLENGTLKDILQAGDIRPTVDMIRVLCT SFLTCPFVTQAARVITKRDPAQSFATHEYGKDVAQTVLVNGFGAFAVADRSREAAETMFYPVPFNKLYADPLVAATLHPL LANYVTRLPNQRNAVVFNVPSNLMAEYEEWHKSPVAAYAASCQATPGAISAMVSMHQKLSAPSFICQAKHRMHPGFAMTV VRTDEVLAEHILYCSRASTSMFVGLPSVVRREVRSDAVTFEITHEIASLHTALGYSSVIAPAHVAAITTDMGVHCQDLFM IFPGDAYQDRQLHDYIKMKAGVQTGPPGNRMDHVGYAAGVPRCENLPGLSHGQLATCEIIPTPVTSDVAYFQTPSNPRGR AACVVSCDAYSNESAERLLYDHSIPDPAYECRSTNNPWASQRGSLGDVLYNITFRQTALPGMYSPCRQFFHKEDIMRYNR GLYTLVNEYSARLAGAPATSTTDLQYVVVNGTDVFLDQPCHMLQEAYPTLAASHRVMLDEYMSNKQTHAPVHMGQYLIEE VAPMKRLLKLGNKVVY ; 1 7 UNP Q76RF4_HHV8 Q76RF4 ? 7 ;MSNFKVRDPVIQERLDHDYAHHPLVARMNTLDQGNMSQAEYLVQKRHYLVFLIAHHYYEAYLRRMGGIQRRDHLQTLRDQ KPRERADRVSAASAYDAGTFTVPSRPGPASGTTPGGQDSLGVSGSSITTLSSGPHSLSPASDILTTLSSTTETAAPAVAD ARKPPSGKKK ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6PPH k 1 ? 454 ? Q76RH8 1 ? 454 ? 1 454 2 2 6PPH l 1 ? 549 ? Q76RI7 1 ? 549 ? 1 549 3 2 6PPH m 1 ? 549 ? Q76RI7 1 ? 549 ? 1 549 4 3 6PPH n 1 ? 2635 ? Q2HR64 1 ? 2635 ? 1 2635 5 3 6PPH o 1 ? 2635 ? Q2HR64 1 ? 2635 ? 1 2635 6 4 6PPH 5 1 ? 331 ? Q76RF6 1 ? 331 ? 1 331 7 5 6PPH 6 1 ? 305 ? C7E5A9 1 ? 305 ? 1 305 8 5 6PPH 7 1 ? 305 ? C7E5A9 1 ? 305 ? 1 305 9 4 6PPH b 1 ? 331 ? Q76RF6 1 ? 331 ? 1 331 10 5 6PPH c 1 ? 305 ? C7E5A9 1 ? 305 ? 1 305 11 5 6PPH d 1 ? 305 ? C7E5A9 1 ? 305 ? 1 305 12 6 6PPH 4 1 ? 1376 ? D0UZN7 1 ? 1376 ? 1 1376 13 7 6PPH A 1 ? 170 ? Q76RF4 1 ? 170 ? 1 170 14 7 6PPH 2 1 ? 170 ? Q76RF4 1 ? 170 ? 1 170 15 6 6PPH S 1 ? 1376 ? D0UZN7 1 ? 1376 ? 1 1376 16 7 6PPH 3 1 ? 170 ? Q76RF4 1 ? 170 ? 1 170 17 6 6PPH T 1 ? 1376 ? D0UZN7 1 ? 1376 ? 1 1376 18 7 6PPH 1 1 ? 170 ? Q76RF4 1 ? 170 ? 1 170 19 6 6PPH X 1 ? 1376 ? D0UZN7 1 ? 1376 ? 1 1376 20 7 6PPH 0 1 ? 170 ? Q76RF4 1 ? 170 ? 1 170 21 6 6PPH W 1 ? 1376 ? D0UZN7 1 ? 1376 ? 1 1376 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 6PPH PRO k 165 ? UNP Q76RH8 LEU 165 conflict 165 1 1 6PPH SER k 281 ? UNP Q76RH8 GLY 281 conflict 281 2 4 6PPH THR n 2220 ? UNP Q2HR64 PRO 2220 conflict 2220 3 5 6PPH THR o 2220 ? UNP Q2HR64 PRO 2220 conflict 2220 4 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6PPH _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean ? _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 6PPH _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values 'GeoStd + Monomer Library' _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0066 ? 75211 ? f_bond_d ? ? 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 7.1829 ? 45334 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 6PPH _struct.title ;Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV), C1 penton vertex register, CATC-binding structure ; _struct.pdbx_descriptor ;Capsid vertex component 1, Capsid vertex component 2, Large tegument protein deneddylase (E.C.3.4.19.12,3.4.22.-), Triplex capsid protein 1, Triplex capsid protein 2, Major capsid protein, Small capsomere-interacting protein ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6PPH _struct_keywords.text 'capsid, tegument, vertex, complex, VIRUS, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 2 ? D N N 3 ? E N N 3 ? F N N 4 ? G N N 5 ? H N N 5 ? I N N 4 ? 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AL7 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA7 4 5 ? anti-parallel AA7 5 6 ? parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? 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PHENIX 1.13 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _em_virus_natural_host.id 1 _em_virus_natural_host.entity_assembly_id 1 _em_virus_natural_host.ncbi_tax_id 9606 _em_virus_natural_host.organism 'Homo sapiens' _em_virus_natural_host.strain ? # _em_virus_shell.id 1 _em_virus_shell.entity_assembly_id 1 _em_virus_shell.diameter 1250.0 _em_virus_shell.name Capsid _em_virus_shell.triangulation 16 # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' GM071940 1 'National Institutes of Health/National Institute of Dental and Craniofacial Research (NIH/NIDCR)' 'United States' DE025567 2 'National Institutes of Health/National Institute of Dental and Craniofacial Research (NIH/NIDCR)' 'United States' DE028583 3 'National Institutes of Health/National Institute of Dental and Craniofacial Research (NIH/NIDCR)' 'United States' DE027901 4 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' AI094386 5 'National Institutes of Health/National Cancer Institute (NIH/NCI)' 'United States' CA177322 6 'National Institutes of Health/National Cancer Institute (NIH/NCI)' 'United States' CA091791 7 'National Institutes of Health/National Institute of Dental and Craniofacial Research (NIH/NIDCR)' 'United States' DE023591 8 'Other government' China 2017YFA0505300 9 'Other government' China 2016YFA0400900 10 'National Institutes of Health/National Center for Research Resources (NIH/NCRR)' 'United States' 1S10RR23057 11 'National Institutes of Health/National Institute of General Medical Sciences (NIH/NIGMS)' 'United States' 1U24GM116792 12 'National Science Foundation (NSF, United States)' 'United States' DBI-1338135 13 'National Science Foundation (NSF, United States)' 'United States' DMR-1548924 14 # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support microscopy _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details 'CATC-binding penton vertex registers can exist at all capsid vertices.' # _space_group.crystal_system triclinic _space_group.name_H-M_alt 'P 1' _space_group.IT_number 1 _space_group.name_Hall 'P 1' _space_group.id 1 # _space_group_symop.id 1 _space_group_symop.operation_xyz x,y,z #