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;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; B,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MDSPDLHHHHHHGTLVPRGSMQIFVKTLTGKTITLEVESSDTIDNVKSKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYN IQKESTLHLVLRLRGTSSGGSGGSGGSGRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGN AARDNKKTRIIPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; ;MDSPDLHHHHHHGTLVPRGSMQIFVKTLTGKTITLEVESSDTIDNVKSKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYN IQKESTLHLVLRLRGTSSGGSGGSGGSGRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGN AARDNKKTRIIPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; C,G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAH YNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; ;MAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAH YNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; D,H ? 5 polydeoxyribonucleotide no no ;(DC)(DT)(DG)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DC)(DC)(DC)(DG)(DG)(DT)(DG)(DC)(DC)(DG)(DA) 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 5 1 sample 1 149 'synthetic construct' ? 32630 ? 6 1 sample 1 149 'synthetic construct' ? 32630 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A310TTQ1_XENLA A0A310TTQ1 ? 1 ;MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFK TDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA ; 1 2 UNP H4_XENLA P62799 ? 2 ;MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRK TVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG ; 1 3 UNP RL40B_YEAST P0CH09 ? 3 MQIFVKTLTGKTITLEVESSDTIDNVKSKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRG 1 4 UNP Q6AZJ8_XENLA Q6AZJ8 ? 3 ;RSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAVRNDEELNKL LGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKKTESSKSAKSK ; 18 5 UNP H2B11_XENLA P02281 ? 4 ;AKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKSRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHY NKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK ; 5 6 PDB 6PX3 6PX3 ? 5 ? 1 7 PDB 6PX3 6PX3 ? 6 ? 1 8 UNP G0S676_CHATD G0S676 ? 7 ;MEASDRASGPTAGSKSEERTKQNGPRSKKEDASDSSTSTGSKSASRSSSATTMSPDDAKPADDSALAQENGVAPKPSRKS SKLPPRNPPQLFNHLPDATEEACRTFQVISDCLYGSRNMGSSDHDALDCDCAEDWRDGKNHACGEDSDCINRATKIECVI GDCNCGEGCQNQRFQRKQYAKVSVIKTEKKGYGLRADTDLQPNDFIYEYVGEVINEPTFRSRMLKYDKEGIKHFYFMSLT KNEFVDATKKGNLGRFCNHSCNPNCYVDKWVVGDKLRMGIFAARYIKAGEELVFNYNVDRYGADPQPCYCGEPNCVGFIG GKTQTERATKLPLATIEALGIEDGDSWDTTVAKKPRKKKASETDEEYVNSLQPKALDEDGVNKVMATLMQCKEKWIAVKL LSRLQATQDDHLRHRVVRMHGYQILKSTLNAFKHDNNVVLQVLDILYNLPRITKNKISDSNIEAVVQPLASSSDERVAFE AKRLLEEWDKLETAYRIPRKKDGRVVSAIANSFEEERRSNREEPTKPADPLANVVIPTGPRSNIPQRNANYYNGVRPRKP PTNLPEGWFVTVDKKTGKYYFYDVNGKVQWQRPTAPAITTPKPSVKAQQDQKALQDIIDSLTKEPTPRQSAGHTPQRSST PATEPKKEKWRSLPIEKQMKIYENTLFPHVKYVMDKFHGKLPREDLKKFARDVNKKLVASDYKHNRVQDPTVPLSSKQAK KVRKYVYDFFDRALQKYLEYQKRKAQYTSKEGMQSSQTEQNTATPTGTLGKDVDEVMSDVEAPNSSPQSTSSAGRKRKRD DDQDGDHDMRSPADEDAATSSDPPSVKRIKEDDGTGNDVIPSPPPPPPPPAEIPMTEEERSMREQEEALMRENEEAQRLE DEAKRKQLELQNGLAAAKNAGIELGSASFTVSGEPMDVDNDGPPPQEQAQQQKQAVMSH ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6PX3 A 1 ? 136 ? 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'Zn 2' 65.409 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6PX3 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.B_iso_max ? _refine.B_iso_mean ? _refine.B_iso_min ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.details ? _refine.diff_density_max ? _refine.diff_density_max_esd ? _refine.diff_density_min ? _refine.diff_density_min_esd ? _refine.diff_density_rms ? _refine.diff_density_rms_esd ? _refine.entry_id 6PX3 _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.ls_abs_structure_details ? _refine.ls_abs_structure_Flack ? _refine.ls_abs_structure_Flack_esd ? _refine.ls_abs_structure_Rogers ? _refine.ls_abs_structure_Rogers_esd ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_extinction_coef ? _refine.ls_extinction_coef_esd ? _refine.ls_extinction_expression ? _refine.ls_extinction_method ? _refine.ls_goodness_of_fit_all ? _refine.ls_goodness_of_fit_all_esd ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs ? _refine.ls_goodness_of_fit_obs_esd ? _refine.ls_hydrogen_treatment ? _refine.ls_matrix_type ? _refine.ls_number_constraints ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_work ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_Fsqd_factor_obs ? _refine.ls_R_I_factor_obs ? _refine.ls_redundancy_reflns_all ? _refine.ls_redundancy_reflns_obs ? _refine.ls_restrained_S_all ? _refine.ls_restrained_S_obs ? _refine.ls_shift_over_esd_max ? _refine.ls_shift_over_esd_mean ? _refine.ls_structure_factor_coef ? _refine.ls_weighting_details ? _refine.ls_weighting_scheme ? _refine.ls_wR_factor_all ? _refine.ls_wR_factor_obs ? _refine.ls_wR_factor_R_free ? _refine.ls_wR_factor_R_work ? _refine.occupancy_max ? _refine.occupancy_min ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.ls_R_factor_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_gt ? _refine.ls_goodness_of_fit_ref ? _refine.ls_shift_over_su_max ? _refine.ls_shift_over_su_max_lt ? _refine.ls_shift_over_su_mean ? _refine.ls_shift_over_su_mean_lt ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_ls_sigma_Fsqd ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_real_space_R ? _refine.pdbx_density_correlation ? _refine.pdbx_pd_number_of_powder_patterns ? _refine.pdbx_pd_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_meas_number_of_points ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_R_factor ? _refine.pdbx_pd_proc_ls_prof_wR_factor ? _refine.pdbx_pd_Marquardt_correlation_coeff ? _refine.pdbx_pd_Fsqrd_R_factor ? _refine.pdbx_pd_ls_matrix_band_width ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.overall_SU_R_free ? _refine.overall_FOM_free_R_set ? _refine.overall_FOM_work_R_set ? _refine.pdbx_average_fsc_overall ? _refine.pdbx_average_fsc_work ? _refine.pdbx_average_fsc_free ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.008 ? 15161 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.930 ? 21702 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 24.058 ? 8125 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.056 ? 2447 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.007 ? 1760 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6PX3 _struct.title 'Set2 bound to nucleosome' _struct.pdbx_descriptor ;Histone H3, Histone H4, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40,Histone H2A, Histone H2B 1.1, Histone-lysine N-methyltransferase/DNA Complex ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6PX3 _struct_keywords.text 'Set2, nucleosome, chromatin, KMT, GENE REGULATION' _struct_keywords.pdbx_keywords 'GENE REGULATION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? M N N 8 ? N N N 8 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 45 ? SER A 58 ? GLY A 44 SER A 57 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 AA2 ARG A 64 ? ASP A 78 ? ARG A 63 ASP A 77 1 ? 15 HELX_P HELX_P3 AA3 GLN A 86 ? ALA A 115 ? GLN A 85 ALA A 114 1 ? 30 HELX_P HELX_P4 AA4 MET A 121 ? GLY A 133 ? MET A 120 GLY A 132 1 ? 13 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP B 25 ? ILE B 30 ? 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ILE G 79 ASN G 89 1 ? 11 HELX_P HELX_P34 AD7 ASP G 182 ? LEU G 189 ? ASP G 90 LEU G 97 1 ? 8 HELX_P HELX_P35 AD8 GLN G 204 ? LEU G 208 ? GLN G 112 LEU G 116 5 ? 5 HELX_P HELX_P36 AD9 TYR H 35 ? HIS H 47 ? TYR H 34 HIS H 46 1 ? 13 HELX_P HELX_P37 AE1 SER H 53 ? ASN H 82 ? SER H 52 ASN H 81 1 ? 30 HELX_P HELX_P38 AE2 THR H 88 ? LEU H 100 ? THR H 87 LEU H 99 1 ? 13 HELX_P HELX_P39 AE3 PRO H 101 ? SER H 121 ? PRO H 100 SER H 120 1 ? 21 HELX_P HELX_P40 AE4 ASN K 151 ? LYS K 155 ? ASN S 151 LYS S 155 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 AE5 ASN K 215 ? GLY K 230 ? ASN S 215 GLY S 230 1 ? 16 HELX_P HELX_P42 AE6 ASN K 252 ? PHE K 256 ? ASN S 252 PHE S 256 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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ZN ? ? S CYS 163 S ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.462 ? metalc8 metalc ? ? K CYS 169 SG ? ? ? 1_555 L ZN . ZN ? ? S CYS 169 S ZN 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? metalc9 metalc ? ? K CYS 261 SG ? ? ? 1_555 N ZN . ZN ? ? S CYS 261 S ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.329 ? metalc10 metalc ? ? K CYS 308 SG ? ? ? 1_555 N ZN . ZN ? ? S CYS 308 S ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.284 ? metalc11 metalc ? ? K CYS 310 SG ? ? ? 1_555 N ZN . ZN ? ? S CYS 310 S ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.327 ? metalc12 metalc ? ? K CYS 315 SG ? ? ? 1_555 N ZN . ZN ? ? S CYS 315 S ZN 1003 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.309 ? hydrog1 hydrog ? ? I DT 2 N3 ? ? ? 1_555 J DA 148 N1 ? ? I DT 2 J DA 146 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog2 hydrog ? ? I DT 2 O4 ? ? ? 1_555 J DA 148 N6 ? ? I DT 2 J DA 146 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog3 hydrog ? ? I DG 3 N1 ? ? ? 1_555 J DC 147 N3 ? ? I DG 3 J DC 145 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog4 hydrog ? ? I DG 3 N2 ? ? ? 1_555 J DC 147 O2 ? ? 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K GLU 880 996 1 Y 1 S ASP 881 ? K ASP 881 997 1 Y 1 S GLU 882 ? K GLU 882 998 1 Y 1 S ALA 883 ? K ALA 883 999 1 Y 1 S LYS 884 ? K LYS 884 1000 1 Y 1 S ARG 885 ? K ARG 885 1001 1 Y 1 S LYS 886 ? K LYS 886 1002 1 Y 1 S GLN 887 ? K GLN 887 1003 1 Y 1 S LEU 888 ? K LEU 888 1004 1 Y 1 S GLU 889 ? K GLU 889 1005 1 Y 1 S LEU 890 ? K LEU 890 1006 1 Y 1 S GLN 891 ? K GLN 891 1007 1 Y 1 S ASN 892 ? K ASN 892 1008 1 Y 1 S GLY 893 ? K GLY 893 1009 1 Y 1 S LEU 894 ? K LEU 894 1010 1 Y 1 S ALA 895 ? K ALA 895 1011 1 Y 1 S ALA 896 ? K ALA 896 1012 1 Y 1 S ALA 897 ? K ALA 897 1013 1 Y 1 S LYS 898 ? K LYS 898 1014 1 Y 1 S ASN 899 ? K ASN 899 1015 1 Y 1 S ALA 900 ? K ALA 900 1016 1 Y 1 S GLY 901 ? K GLY 901 1017 1 Y 1 S ILE 902 ? K ILE 902 1018 1 Y 1 S GLU 903 ? K GLU 903 1019 1 Y 1 S LEU 904 ? K LEU 904 1020 1 Y 1 S GLY 905 ? K GLY 905 1021 1 Y 1 S SER 906 ? K SER 906 1022 1 Y 1 S ALA 907 ? K ALA 907 1023 1 Y 1 S SER 908 ? K SER 908 1024 1 Y 1 S PHE 909 ? K PHE 909 1025 1 Y 1 S THR 910 ? 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'synthetic construct' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 1 2 ? 562 'Escherichia coli' ? ? 3 4 ? 562 'Escherichia coli' ? ? 2 3 ? 32630 'synthetic construct' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # loop_ _em_image_recording.id _em_image_recording.imaging_id _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image _em_image_recording.average_exposure_time _em_image_recording.details _em_image_recording.detector_mode _em_image_recording.film_or_detector_model _em_image_recording.num_diffraction_images _em_image_recording.num_grids_imaged _em_image_recording.num_real_images 1 1 75 ? ? COUNTING 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' ? ? ? 2 1 75 ? ? ? 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'GATAN K2 BASE (4k x 4k)' ? ? ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6PX3 'double helix' 6PX3 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 I DT 2 1_555 J DA 148 1_555 -0.080 -0.254 -0.619 -13.752 -22.289 9.267 1 I_DT2:DA146_J I 2 ? 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