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EMD-20556 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6Q16 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-08-02 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Hu, J.' 1 0000-0003-3626-9602 'Worrall, L.J.' 2 0000-0003-4966-7175 'Strynadka, N.C.J.' 3 0000-0002-4058-9425 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat Microbiol' _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 2058-5276 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 4 _citation.language ? _citation.page_first 2010 _citation.page_last 2019 _citation.title 'T3S injectisome needle complex structures in four distinct states reveal the basis of membrane coupling and assembly.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41564-019-0545-z _citation.pdbx_database_id_PubMed 31427728 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Hu, J.' 1 ? primary 'Worrall, L.J.' 2 ? primary 'Vuckovic, M.' 3 ? primary 'Hong, C.' 4 ? primary 'Deng, W.' 5 ? primary 'Atkinson, C.E.' 6 ? primary 'Brett Finlay, B.' 7 ? primary 'Yu, Z.' 8 ? primary 'Strynadka, N.C.J.' 9 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? 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;MGNDISLIALLAFSTLLPFIIASGTCFVKFSIVFVMVRNALGLQQIPSNMTLNGVALLLSMFVMWPIMHDAYVYFEDEDV TFNDISSLSKHVDEGLDGYRDYLIKYSDRELVQFFENAQLKRQYGEETETVKRDKDEIEKPSIFALLPAYALSEIKSAFK IGFYLYLPFVVVDLVVSSVLLALGMMMMSPVTISTPIKLVLFVALDGWTLLSKGLILQYMDIAT ; 0,1,2,3,4 ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MFYALYFEIHHLVASAALGFARVAPIFFFLPFLNSGVLSGAPRNAIIILVALGVWPHALNEAPPFLSVAMIPLVLQEAAV GVMLGCLLSWPFWVMHALGCIIDNQRGATLSSSIDPANGIDTSEMANFLNMFAAVVYLQNGGLVTMVDVLNKSYQLCDPM NECTPSLPPLLTFINQVAQNALVLASPVVLVLLLSEVFLGLLSRFAPQMNAFAISLTVKSGIAVLIMLLYFSPVLPDNVL RLSFQATGLSSWFYERGATHVLE ; ;MFYALYFEIHHLVASAALGFARVAPIFFFLPFLNSGVLSGAPRNAIIILVALGVWPHALNEAPPFLSVAMIPLVLQEAAV GVMLGCLLSWPFWVMHALGCIIDNQRGATLSSSIDPANGIDTSEMANFLNMFAAVVYLQNGGLVTMVDVLNKSYQLCDPM NECTPSLPPLLTFINQVAQNALVLASPVVLVLLLSEVFLGLLSRFAPQMNAFAISLTVKSGIAVLIMLLYFSPVLPDNVL RLSFQATGLSSWFYERGATHVLE ; 5 ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MDDLVFAGNKALYLVLILSGWPTIVATIIGLLVGLFQTVTQLQEQTLPFGIKLLGVCLCLFLLSGWYGEVLLSYGRQVIF LALAKG ; ;MDDLVFAGNKALYLVLILSGWPTIVATIIGLLVGLFQTVTQLQEQTLPFGIKLLGVCLCLFLLSGWYGEVLLSYGRQVIF LALAKG ; 6,7,8,9 ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSIATIVPENAVIGQAVNIRSMETDIVSLDDRLLQAFSGSAIATAVDKQTITNRIEDPNLVTDPKELAISQEMISDYNLY VSMVSTLTRKGVGAVETLLRS ; ;MSIATIVPENAVIGQAVNIRSMETDIVSLDDRLLQAFSGSAIATAVDKQTITNRIEDPNLVTDPKELAISQEMISDYNLY VSMVSTLTRKGVGAVETLLRS ; AM,AN,AO,AP,AQ,AR ? 8 'polypeptide(L)' no no MATPWSGYLDDVSAKFDTGVDNLQTQVTEALDKLAAKPSDPALLAAYQSKLSEYNLYRNAQSNTVKVFKDIDAAIIQNFR MATPWSGYLDDVSAKFDTGVDNLQTQVTEALDKLAAKPSDPALLAAYQSKLSEYNLYRNAQSNTVKVFKDIDAAIIQNFR AS,AT,AU,AV,AW,AX,AY,AZ,BA,BB,BC,BD,BE ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ILE n 1 3 ARG n 1 4 ARG n 1 5 TYR n 1 6 LEU n 1 7 TYR n 1 8 THR n 1 9 PHE n 1 10 LEU n 1 11 LEU n 1 12 VAL n 1 13 MET n 1 14 THR n 1 15 LEU n 1 16 ALA n 1 17 GLY n 1 18 CYS n 1 19 LYS n 1 20 ASP n 1 21 LYS n 1 22 ASP n 1 23 LEU n 1 24 LEU n 1 25 LYS n 1 26 GLY n 1 27 LEU n 1 28 ASP n 1 29 GLN n 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'LT2 / SGSC1412 / ATCC 700720' ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP PRGK_SALTY P41786 ? 1 ;MIRRYLYTFLLVMTLAGCKDKDLLKGLDQEQANEVIAVLQMHNIEANKIDSGKLGYSITVAEPDFTAAVYWIKTYQLPPR PRVEIAQMFPADSLVSSPRAEKARLYSAIEQRLEQSLQTMEGVLSARVHISYDIDAGENGRPPKPVHLSALAVYERGSPL AHQISDIKRFLKNSFADVDYDNISVVLSERSDAQLQAPGTPVKRNSFATSWIVLIILLSVMSAGFGVWYYKNHYARNKKG ITADDKAKSSNE ; 1 2 UNP INVG_SALTY P35672 ? 2 ;MKTHILLARVLACAALVLVTPGYSSEKIPVTGSGFVAKDDSLRTFFDAMALQLKEPVIVSKMAARKKITGNFEFHDPNAL LEKLSLQLGLIWYFDGQAIYIYDASEMRNAVVSLRNVSLNEFNNFLKRSGLYNKNYPLRGDNRKGTFYVSGPPVYVDMVV NAATMMDKQNDGIELGRQKIGVMRLNNTFVGDRTYNLRDQKMVIPGIATAIERLLQGEEQPLGNIVSSEPPAMPAFSANG EKGKAANYAGGMSLQEALKQNAAAGNIKIVAYPDTNSLLVKGTAEQVHFIEMLVKALDVAKRHVELSLWIVDLNKSDLER LGTSWSGSITIGDKLGVSLNQSSISTLDGSRFIAAVNALEEKKQATVVSRPVLLTQENVPAIFDNNRTFYTKLIGERNVA LEHVTYGTMIRVLPRFSADGQIEMSLDIEDGNDKTPQSDTTTSVDALPEVGRTLISTIARVPHGKSLLVGGYTRDANTDT VQSIPFLGKLPLIGSLFRYSSKNKSNVVRVFMIEPKEIVDPLTPDASESVNNILKQSGAWSGDDKLQKWVRVYLDRGQEA IK ; 1 3 UNP PRGH_SALTY P41783 ? 3 ;METSKEKTITSPGPYIVRLLNSSLNGCEFPLLTGRTLFVVGQSDALTASGQLPDIPADSFFIPLDHGGVNFEIQVDTDAT EIILHELKEGNSESRSVQLNTPIQVGELLILIRPESEPWVPEQPEKLETSAKKNEPRFKNGIVAALAGFFILGIGTVGTL WILNSPQRQAAELDSLLGQEKERFQVLPGRDKMLYVAAQNERDTLWARQVLARGDYDKNARVINENEENKRISIWLDTYY PQLAYYRIHFDEPRKPVFWLSRQRNTMSKKELEVLSQKLRALMPYADSVNITLMDDVTAAGQAEAGLKQQALPYSRRNHK GGVTFVIQGALDDVEILRARQFVDSYYRTWGGRYVQFAIELKDDWLKGRSFQYGAEGYIKMSPGHWYFPSPL ; 1 4 UNP SPAP_SALTY P40700 ? 4 ;MGNDISLIALLAFSTLLPFIIASGTCFVKFSIVFVMVRNALGLQQIPSNMTLNGVALLLSMFVMWPIMHDAYVYFEDEDV TFNDISSLSKHVDEGLDGYRDYLIKYSDRELVQFFENAQLKRQYGEETETVKRDKDEIEKPSIFALLPAYALSEIKSAFK IGFYLYLPFVVVDLVVSSVLLALGMMMMSPVTISTPIKLVLFVALDGWTLLSKGLILQYMDIAT ; 1 5 UNP SPAR_SALTY P40701 ? 5 ;MFYALYFEIHHLVASAALGFARVAPIFFFLPFLNSGVLSGAPRNAIIILVALGVWPHALNEAPPFLSVAMIPLVLQEAAV GVMLGCLLSWPFWVMHALGCIIDNQRGATLSSSIDPANGIDTSEMANFLNMFAAVVYLQNGGLVTMVDVLNKSYQLCDPM NECTPSLPPLLTFINQVAQNALVLASPVVLVLLLSEVFLGLLSRFAPQMNAFAISLTVKSGIAVLIMLLYFSPVLPDNVL RLSFQATGLSSWFYERGATHVLE ; 1 6 UNP SPAQ_SALTY P0A1L7 ? 6 ;MDDLVFAGNKALYLVLILSGWPTIVATIIGLLVGLFQTVTQLQEQTLPFGIKLLGVCLCLFLLSGWYGEVLLSYGRQVIF LALAKG ; 1 7 UNP PRGJ_SALTY P41785 ? 7 ;MSIATIVPENAVIGQAVNIRSMETDIVSLDDRLLQAFSGSAIATAVDKQTITNRIEDPNLVTDPKELAISQEMISDYNLY VSMVSTLTRKGVGAVETLLRS ; 1 8 UNP PRGI_SALTY P41784 ? 8 ;MATPWSGYLDDVSAKFDTGVDNLQTQVTEALDKLAAKPSDPALLAAYQSKLSEYNLYRNAQSNTVKVFKDIDAAIIQNFR ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6Q16 AA 1 ? 252 ? 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'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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