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(N.Y.)' _citation.journal_id_ASTM NAMEFI _citation.journal_id_CSD 2148 _citation.journal_id_ISSN 1078-8956 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume ? _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'rVSV-ZEBOV induces a polyclonal and convergent B cell response with potent Ebola virus-neutralizing antibodies' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI ? _citation.pdbx_database_id_PubMed ? _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Diskin, R.' 1 0000-0002-2837-5897 primary 'Cohen-Dvashi, H.' 2 ? primary 'Ehrhardt, S.' 3 ? primary 'Zehner, M.' 4 ? primary 'Krahling, V.' 5 ? primary 'Kreer, C.' 6 ? primary 'Dahlke, C.' 7 ? primary 'Ercanoglu, M.S.' 8 ? primary 'Gruell, H.' 9 ? primary 'Addo, M.M.' 10 ? primary 'Becker, S.' 11 ? primary 'Klein, F.' 12 ? # _cell.angle_alpha 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;GSRSIPLGVIHNSALQVSDVDKLVCRDKLSSTNQLRSVGLNLEGNGVATDVPSATKRWGFRSGVPPKVVNYEAGEWAENC YNLEIKKPDGSECLPAAPDGIRGFPRCRYVHKVSGTGPCAGDFAFHKEGAFFLYDRLASTVIYRGTTFAEGVVAFLILPQ AKKDFFSSHPLREPVNATEDPSSGYYSTTIRYQATGFGTNETEYLFEVDNLTYVQLESRFTPQFLLQLNETIYTSGKRSN TTGKLIWKVNPEIDTTIGEWAFWETKKNLTRKIRSEELSFTVVXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX XX ; A,C,E ? 3 'polypeptide(L)' no no ;EAIVNAQPKCNPNLHYWTTQDEGAAIGLAWIPYFGPAAEGIYIEGLMHNQDGLICGLRQLANETTQALQLFLRATTELRT FSILNRKAIDFLLQRWGGTCHILGPDCCIEPHDWTKNITDKIDQIIHDFVDGSGYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFL GTHHHHHH ; ;EAIVNAQPKCNPNLHYWTTQDEGAAIGLAWIPYFGPAAEGIYIEGLMHNQDGLICGLRQLANETTQALQLFLRATTELRT FSILNRKAIDFLLQRWGGTCHILGPDCCIEPHDWTKNITDKIDQIIHDFVDGSGYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFL GTHHHHHH ; B,F,D ? 4 'polypeptide(L)' no no ;QVQLQESGPGLVKPSGTLSLTCAVSGGSISGTNWWTWVRQPPGRGLEWIGEIYYRGSPNYNPSLKSRVTISVDQSKSQFS LKLTSVTAADTAVYYCLRLSHYGGAWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSG ALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSC ; 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A CYS 23 SG ? ? ? 1_555 A CYS 88 SG ? ? Z CYS 23 Z CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 25 SG ? ? ? 1_555 D CYS 108 SG ? ? A CYS 53 B CYS 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.965 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 80 SG ? ? ? 1_555 B CYS 107 SG ? ? A CYS 108 A CYS 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 93 SG ? ? ? 1_555 B CYS 119 SG ? ? A CYS 121 A CYS 147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf5 disulf ? ? C CYS 23 SG ? ? ? 1_555 C CYS 88 SG ? ? Y CYS 23 Y CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf6 disulf ? ? D CYS 10 SG ? ? ? 1_555 D CYS 55 SG ? ? B CYS 511 B CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf7 disulf ? ? D CYS 100 SG ? ? ? 1_555 D CYS 107 SG ? ? B CYS 601 B CYS 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? disulf8 disulf ? ? E CYS 23 SG ? ? ? 1_555 E CYS 88 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf9 disulf ? ? F CYS 22 SG ? ? ? 1_555 F CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? disulf10 disulf ? ? G CYS 25 SG ? ? ? 1_555 J CYS 108 SG ? ? C CYS 53 D CYS 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.088 ? ? disulf11 disulf ? ? G CYS 80 SG ? ? ? 1_555 G CYS 107 SG ? ? C CYS 108 C CYS 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf12 disulf ? ? G CYS 93 SG ? ? ? 1_555 G CYS 119 SG ? ? C CYS 121 C CYS 147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf13 disulf ? ? H CYS 25 SG ? ? ? 1_555 I CYS 108 SG ? ? E CYS 53 F CYS 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.063 ? ? disulf14 disulf ? ? H CYS 80 SG ? ? ? 1_555 H CYS 107 SG ? ? E CYS 108 E CYS 135 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf15 disulf ? ? H CYS 93 SG ? ? ? 1_555 H CYS 119 SG ? ? E CYS 121 E CYS 147 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf16 disulf ? ? I CYS 10 SG ? ? ? 1_555 I CYS 55 SG ? ? F CYS 511 F CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf17 disulf ? ? I CYS 100 SG ? ? ? 1_555 I CYS 107 SG ? ? F CYS 601 F CYS 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? ? disulf18 disulf ? ? J CYS 10 SG ? ? ? 1_555 J CYS 55 SG ? ? D CYS 511 D CYS 556 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? disulf19 disulf ? ? J CYS 100 SG ? ? ? 1_555 J CYS 107 SG ? ? D CYS 601 D CYS 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.043 ? ? disulf20 disulf ? ? K CYS 22 SG ? ? ? 1_555 K CYS 96 SG ? ? W CYS 22 W CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.048 ? ? disulf21 disulf ? ? L CYS 22 SG ? ? ? 1_555 L CYS 96 SG ? ? Q CYS 22 Q CYS 96 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.049 ? ? covale1 covale one ? D ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? B ASN 563 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? D ASN 117 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? B ASN 618 B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? I ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? F ASN 563 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? I ASN 117 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? F ASN 618 F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? J ASN 62 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? D ASN 563 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? J ASN 117 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? D ASN 618 D NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? N-Glycosylation covale7 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale8 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M BMA . C1 ? ? G NAG 2 G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale9 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale10 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N BMA . C1 ? ? I NAG 2 I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale11 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale12 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O BMA . C1 ? ? J NAG 2 J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 7 A . ? SER 7 Z PRO 8 A ? PRO 8 Z 1 -13.38 2 THR 94 A . ? THR 94 Z PRO 95 A ? PRO 95 Z 1 -5.08 3 SER 7 C . ? SER 7 Y PRO 8 C ? PRO 8 Y 1 -13.45 4 THR 94 C . ? THR 94 Y PRO 95 C ? PRO 95 Y 1 -5.25 5 SER 7 E . ? SER 7 L PRO 8 E ? PRO 8 L 1 -13.37 6 THR 94 E . ? THR 94 L PRO 95 E ? PRO 95 L 1 -5.26 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 4 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 7 ? AA4 ? 7 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 8 ? AA7 ? 4 ? AA8 ? 4 ? AA9 ? 4 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 5 ? AB4 ? 5 ? AB5 ? 7 ? AB6 ? 7 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 8 ? AB9 ? 7 ? AC1 ? 7 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 8 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 5 ? AC9 ? 5 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? anti-parallel AA3 4 5 ? parallel AA3 5 6 ? anti-parallel AA3 6 7 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA4 6 7 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA6 5 6 ? parallel AA6 6 7 ? parallel AA6 7 8 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 3 4 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB3 4 5 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB4 4 5 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? parallel AB5 5 6 ? anti-parallel AB5 6 7 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB6 4 5 ? anti-parallel AB6 5 6 ? anti-parallel AB6 6 7 ? parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB8 5 6 ? parallel AB8 6 7 ? parallel AB8 7 8 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? anti-parallel AB9 4 5 ? parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AB9 6 7 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC1 5 6 ? anti-parallel AC1 6 7 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? parallel AC3 2 3 ? parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC3 5 6 ? parallel AC3 6 7 ? parallel AC3 7 8 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC8 4 5 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AC9 4 5 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 4 ? 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ARG B 580 THR B 581 AA5 1 TRP B 58 ? ARG B 61 ? TRP A 86 ARG A 89 AA5 2 PHE B 123 ? HIS B 126 ? PHE A 151 HIS A 154 AA6 1 ALA B 77 ? LYS B 86 ? ALA A 105 LYS A 114 AA6 2 CYS B 107 ? THR B 116 ? CYS A 135 THR A 144 AA6 3 THR B 188 ? THR B 195 ? THR A 216 THR A 223 AA6 4 GLU B 203 ? GLU B 207 ? GLU A 231 GLU A 235 AA6 5 THR B 212 ? GLN B 215 ? THR A 240 GLN A 243 AA6 6 LYS B 244 ? TRP B 247 ? LYS A 272 TRP A 275 AA6 7 UNK B 285 ? UNK B 291 ? UNK A 471 UNK A 477 AA6 8 SER B 279 ? VAL B 282 ? SER A 306 VAL A 309 AA7 1 LEU C 4 ? SER C 7 ? LEU Y 4 SER Y 7 AA7 2 ARG C 18 ? ALA C 25 ? ARG Y 18 ALA Y 25 AA7 3 ASP C 70 ? SER C 76 ? ASP Y 70 SER Y 76 AA7 4 PHE C 62 ? SER C 67 ? PHE Y 62 SER Y 67 AA8 1 ASN C 53 ? LEU C 54 ? ASN Y 53 LEU Y 54 AA8 2 LYS C 45 ? PHE C 49 ? LYS Y 45 PHE Y 49 AA8 3 ASN C 34 ? GLN C 38 ? ASN Y 34 GLN Y 38 AA8 4 THR C 85 ? GLN C 89 ? THR Y 85 GLN Y 89 AA9 1 LEU E 4 ? SER E 7 ? LEU L 4 SER L 7 AA9 2 ARG E 18 ? ALA E 25 ? ARG L 18 ALA L 25 AA9 3 ASP E 70 ? SER E 76 ? 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