data_6R10 # _entry.id 6R10 # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.333 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6R10 WWPDB D_1292100898 EMDB EMD-4703 # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB . 6QUM unspecified EMDB 'Thermus thermophilus V/A-type ATPase/synthase, rotational state 1R' EMD-4703 'associated EM volume' PDB . 6R0W unspecified PDB . 6R0Z unspecified PDB . 6R0Y unspecified EMDB . EMD-4640 'other EM volume' EMDB . EMD-4699 'other EM volume' EMDB . EMD-4700 'other EM volume' EMDB . EMD-4702 'other EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6R10 _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-03-13 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Zhou, L.' 1 ? 'Sazanov, L.' 2 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Science _citation.journal_id_ASTM SCIEAS _citation.journal_id_CSD 0038 _citation.journal_id_ISSN 1095-9203 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 365 _citation.language ? _citation.page_first ? _citation.page_last ? _citation.title 'Structure and conformational plasticity of the intact Thermus thermophilus V/A-type ATPase.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1126/science.aaw9144 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31439765 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Zhou, L.' 1 0000-0002-1864-8951 primary 'Sazanov, L.A.' 2 0000-0002-0977-7989 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6R10 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.0 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.0 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.0 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB 1 _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6R10 _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'V-type ATP synthase alpha chain' 63699.980 3 7.1.2.2 ? ? ? 2 polymer nat 'V-type ATP synthase beta chain' 53219.500 3 ? ? ? ? 3 polymer nat 'V-type ATP synthase subunit D' 24715.566 1 ? ? ? ? 4 polymer nat 'V-type ATP synthase subunit F' 11294.904 1 ? ? ? ? 5 polymer nat 'V-type ATP synthase, subunit (VAPC-THERM)' 13166.218 2 ? ? ? ? 6 polymer nat 'V-type ATP synthase subunit E' 20645.582 2 ? ? ? ? 7 polymer nat 'V-type ATP synthase subunit C' 35968.570 1 ? ? ? ? 8 polymer nat 'V-type ATP synthase subunit I' 72204.289 1 ? ? ? ? 9 polymer nat 'V-type ATP synthase, subunit K' 9841.714 12 ? ? ? ? 10 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 1 ? ? ? ? 11 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 'V-ATPase subunit A' 2 'V-ATPase subunit B' 3 'V-ATPase subunit D' 4 'V-ATPase subunit F' 6 'V-ATPase subunit E' 7 'V-ATPase subunit C' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MIQGVIQKIAGPAVIAKGMLGARMYDICKVGEEGLVGEIIRLDGDTAFVQVYEDTSGLKVGEPVVSTGLPLAVELGPGML NGIYDGIQRPLERIREKTGIYITRGVVVHALDREKKWAWTPMVKPGDEVRGGMVLGTVPEFGFTHKILVPPDVRGRVKEV KPAGEYTVEEPVVVLEDGTELKMYHTWPVRRARPVQRKLDPNTPFLTGMRILDVLFPVAMGGTAAIPGPFGSGKTVTQQS LAKWSNADVVVYVGCGERGNEMTDVLVEFPELTDPKTGGPLMHRTVLIANTSNMPVAAREASIYVGVTIAEYFRDQGFSV ALMADSTSRWAEALREISSRLEEMPAEEGYPPYLAARLAAFYERAGKVITLGGEEGAVTIVGAVSPPGGDMSEPVTQSTL RIVGAFWRLDASLAFRRHFPAINWNGSYSLFTSALDPWYRENVAEDYPELRDAISELLQREAGLQEIVQLVGPDALQDAE RLVIEVGRIIREDFLQQNAYHEVDAYCSMKKAYGIMKMILAFYKEAEAAIKRGVSIDEILQLPVLERIGRARYVSEEEFP AYFEEAMKEIQGAFKALA ; ;MIQGVIQKIAGPAVIAKGMLGARMYDICKVGEEGLVGEIIRLDGDTAFVQVYEDTSGLKVGEPVVSTGLPLAVELGPGML NGIYDGIQRPLERIREKTGIYITRGVVVHALDREKKWAWTPMVKPGDEVRGGMVLGTVPEFGFTHKILVPPDVRGRVKEV KPAGEYTVEEPVVVLEDGTELKMYHTWPVRRARPVQRKLDPNTPFLTGMRILDVLFPVAMGGTAAIPGPFGSGKTVTQQS LAKWSNADVVVYVGCGERGNEMTDVLVEFPELTDPKTGGPLMHRTVLIANTSNMPVAAREASIYVGVTIAEYFRDQGFSV ALMADSTSRWAEALREISSRLEEMPAEEGYPPYLAARLAAFYERAGKVITLGGEEGAVTIVGAVSPPGGDMSEPVTQSTL RIVGAFWRLDASLAFRRHFPAINWNGSYSLFTSALDPWYRENVAEDYPELRDAISELLQREAGLQEIVQLVGPDALQDAE RLVIEVGRIIREDFLQQNAYHEVDAYCSMKKAYGIMKMILAFYKEAEAAIKRGVSIDEILQLPVLERIGRARYVSEEEFP AYFEEAMKEIQGAFKALA ; A,B,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MDLLKKEYTGITYISGPLLFVENAKDLAYGAIVDIKDGTGRVRGGQVIEVSEEYAVIQVFEETTGLDLATTSVSLVEDVA RLGVSKEMLGRRFNGIGKPIDGLPPITPEKRLPITGLPLNPVARRKPEQFIQTGISTIDVMNTLVRGQKLPIFSGSGLPA NEIAAQIARQATVRPDLSGEGEKEEPFAVVFAAMGITQRELSYFIQEFERTGALSRSVLFLNKADDPTIERILTPRMALT VAEYLAFEHDYHVLVILTDMTNYCEALREIGAAREEIPGRRGYPGYMYTDLATIYERAGVVEGKKGSVTQIPILSMPDDD RTHPIPDLTGYITEGQIQLSRELHRKGIYPPIDPLPSLSRLMNNGVGKGKTREDHKQVSDQLYSAYANGVDIRKLVAIIG EDALTENDRRYLQFADAFERFFINQGQQNRSIEESLQIAWALLSMLPQGELKRISKDHIGKYYGQKLEEIWGAPQALD ; ;MDLLKKEYTGITYISGPLLFVENAKDLAYGAIVDIKDGTGRVRGGQVIEVSEEYAVIQVFEETTGLDLATTSVSLVEDVA RLGVSKEMLGRRFNGIGKPIDGLPPITPEKRLPITGLPLNPVARRKPEQFIQTGISTIDVMNTLVRGQKLPIFSGSGLPA NEIAAQIARQATVRPDLSGEGEKEEPFAVVFAAMGITQRELSYFIQEFERTGALSRSVLFLNKADDPTIERILTPRMALT VAEYLAFEHDYHVLVILTDMTNYCEALREIGAAREEIPGRRGYPGYMYTDLATIYERAGVVEGKKGSVTQIPILSMPDDD RTHPIPDLTGYITEGQIQLSRELHRKGIYPPIDPLPSLSRLMNNGVGKGKTREDHKQVSDQLYSAYANGVDIRKLVAIIG EDALTENDRRYLQFADAFERFFINQGQQNRSIEESLQIAWALLSMLPQGELKRISKDHIGKYYGQKLEEIWGAPQALD ; D,E,F ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSQVSPTRMNLLQRRGQLRLAQKGVDLLKKKRDALVAEFFGLVREAMEARKALDQAAKEAYAALLLAQAFDGPEVVAGAA LGVPPLEGVEAEVENVWGSKVPRLKATFPDGALLSPVGTPAYTLEASRAFRRYAEALIRVANTETRLKKIGEEIKKTTRR VNALEQVVIPGIRAQIRFIQQVLEQREREDTFRLKRIKGKIEAREAEEEGGRPNPQVEIGAGL ; ;MSQVSPTRMNLLQRRGQLRLAQKGVDLLKKKRDALVAEFFGLVREAMEARKALDQAAKEAYAALLLAQAFDGPEVVAGAA LGVPPLEGVEAEVENVWGSKVPRLKATFPDGALLSPVGTPAYTLEASRAFRRYAEALIRVANTETRLKKIGEEIKKTTRR VNALEQVVIPGIRAQIRFIQQVLEQREREDTFRLKRIKGKIEAREAEEEGGRPNPQVEIGAGL ; G ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MAVIADPETAQGFRLAGLEGYGASSAEEAQSLLETLVERGGYALVAVDEALLPDPERAVERLMRGRDLPVLLPIAGLKEA FQGHDVEGYMRELVRKTIGFDIKL ; ;MAVIADPETAQGFRLAGLEGYGASSAEEAQSLLETLVERGGYALVAVDEALLPDPERAVERLMRGRDLPVLLPIAGLKEA FQGHDVEGYMRELVRKTIGFDIKL ; H ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MTGGLVLNAISRAGGAMGGLGLIKSLAEKEKQLLERLEAAKKEAEERVKRAEAEAKALLEEAEAKAKALEAQYRERERAE TEALLARYRERAEAEAKAVREKAMARLDEAVALVLKEVLP ; ;MTGGLVLNAISRAGGAMGGLGLIKSLAEKEKQLLERLEAAKKEAEERVKRAEAEAKALLEEAEAKAKALEAQYRERERAE TEALLARYRERAEAEAKAVREKAMARLDEAVALVLKEVLP ; I,K ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MSKLEAILSQEVEAEIQALLQEAEAKAEAVKREAEEKAKALLQARERALEAQYRAALRRAESAGELLVATARTQARGEVL EEVRRRVREALEALPQKPEWPEVVRKLALEALEALPGAKALVANPEDLPHLEALARERGVELQAEPALRLGVRAVGAEGK TQVENSLLARLDRAWDALSSKVAQALWG ; ;MSKLEAILSQEVEAEIQALLQEAEAKAEAVKREAEEKAKALLQARERALEAQYRAALRRAESAGELLVATARTQARGEVL EEVRRRVREALEALPQKPEWPEVVRKLALEALEALPGAKALVANPEDLPHLEALARERGVELQAEPALRLGVRAVGAEGK TQVENSLLARLDRAWDALSSKVAQALWG ; J,L ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MADDFAYLNARVRVRRGTLLKESFFQEALDLSFADFLRLLSETVYGGELAGQGLPDVDRAVLRTQAKLVGDLPRLVTGEA REAVRLLLLRNDLHNLQALLRAKATGRPFEEVLLLPGTLREEVWRQAYEAQDPAGMAQVLAVPGHPLARALRAVLRETQD LARVEALLAKRFFEDVAKAAKGLDQPALRDYLALEVDAENLRTAFKLQGSGLAPDAFFLKGGRFVDRVRFARLMEGDYAV LDELSGTPFSGLSGVRDLKALERGLRCVLLKEAKKGVQDPLGVGLVLAYVKEREWEAVRLRLLARRAYFGLPRAQVEEEV VCP ; ;MADDFAYLNARVRVRRGTLLKESFFQEALDLSFADFLRLLSETVYGGELAGQGLPDVDRAVLRTQAKLVGDLPRLVTGEA REAVRLLLLRNDLHNLQALLRAKATGRPFEEVLLLPGTLREEVWRQAYEAQDPAGMAQVLAVPGHPLARALRAVLRETQD LARVEALLAKRFFEDVAKAAKGLDQPALRDYLALEVDAENLRTAFKLQGSGLAPDAFFLKGGRFVDRVRFARLMEGDYAV LDELSGTPFSGLSGVRDLKALERGLRCVLLKEAKKGVQDPLGVGLVLAYVKEREWEAVRLRLLARRAYFGLPRAQVEEEV VCP ; M ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MIAPMEKLVLAGPKGRAKELLQSLQQAGVVHLETLRPEALSAYQLSPEERAELRRWEAVSAGAEHTLSLLGLEAEPARPF PEGLEAAEKALSPIQAHAEGLTRQKQELEEELALAQAYLEPLERLAALAHGLDKSPFLRVIPFLLTEKELPLVEEALRKA LEDRYLLAHEAYAGGVAALVVVHRKEVDQAKAALSRAGVAELRLPGALGELPLSEAARRLKERAEAAPRELSEVRQHLAK LARESASTLQSLWTRAQDEVARLKALEELASGRFGFALLGYVPVKAKPKVEEALARHKESVVYAFEPVDEHHEADRIPVV LDNPPWAKPFELLVSFLNTPKYGTFDPTPVVPVFFPFWFGMIVGDIGYALLFYLVGRWLSGYVKRNEPLVIDLFALKLKP QVIGKLVHILNWMVFWTVVWGVIYGEFFGTFLEHLGVFGTPEHPGLIPILIHRIDTAKTANLLILLSVAFGVVLVFFGLA LRAYLGLKHRHMAHFWEGVGYLGGLVGVLALAASYLGNLQAGWLQGLMYLGFGVFLLAVLMSRIWLMIPEIFTQAGHILS HIRIYAVGAAGGILAGLLTDVGFALAERLGLLGVLLGLLVAGVLHLLILLLTTLGHMLQPIRLLWVEFFTKFGFYEENGR PYRPFKSVREAQ ; ;MIAPMEKLVLAGPKGRAKELLQSLQQAGVVHLETLRPEALSAYQLSPEERAELRRWEAVSAGAEHTLSLLGLEAEPARPF PEGLEAAEKALSPIQAHAEGLTRQKQELEEELALAQAYLEPLERLAALAHGLDKSPFLRVIPFLLTEKELPLVEEALRKA LEDRYLLAHEAYAGGVAALVVVHRKEVDQAKAALSRAGVAELRLPGALGELPLSEAARRLKERAEAAPRELSEVRQHLAK LARESASTLQSLWTRAQDEVARLKALEELASGRFGFALLGYVPVKAKPKVEEALARHKESVVYAFEPVDEHHEADRIPVV LDNPPWAKPFELLVSFLNTPKYGTFDPTPVVPVFFPFWFGMIVGDIGYALLFYLVGRWLSGYVKRNEPLVIDLFALKLKP QVIGKLVHILNWMVFWTVVWGVIYGEFFGTFLEHLGVFGTPEHPGLIPILIHRIDTAKTANLLILLSVAFGVVLVFFGLA LRAYLGLKHRHMAHFWEGVGYLGGLVGVLALAASYLGNLQAGWLQGLMYLGFGVFLLAVLMSRIWLMIPEIFTQAGHILS HIRIYAVGAAGGILAGLLTDVGFALAERLGLLGVLLGLLVAGVLHLLILLLTTLGHMLQPIRLLWVEFFTKFGFYEENGR PYRPFKSVREAQ ; N ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MKKLLVTVLLAVFGALAFAAEEAAASGGLDRGLIAVGMGLAVGLAALGTGVAQARIGAAGVGAIAEDRSNFGTALIFLLL PETLVIFGLLIAFILNGRL ; ;MKKLLVTVLLAVFGALAFAAEEAAASGGLDRGLIAVGMGLAVGLAALGTGVAQARIGAAGVGAIAEDRSNFGTALIFLLL PETLVIFGLLIAFILNGRL ; O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 ILE n 1 3 GLN n 1 4 GLY n 1 5 VAL n 1 6 ILE n 1 7 GLN n 1 8 LYS n 1 9 ILE n 1 10 ALA n 1 11 GLY n 1 12 PRO n 1 13 ALA n 1 14 VAL n 1 15 ILE n 1 16 ALA n 1 17 LYS n 1 18 GLY n 1 19 MET n 1 20 LEU n 1 21 GLY n 1 22 ALA n 1 23 ARG n 1 24 MET n 1 25 TYR n 1 26 ASP n 1 27 ILE n 1 28 CYS n 1 29 LYS n 1 30 VAL n 1 31 GLY n 1 32 GLU n 1 33 GLU n 1 34 GLY n 1 35 LEU n 1 36 VAL n 1 37 GLY n 1 38 GLU n 1 39 ILE n 1 40 ILE n 1 41 ARG n 1 42 LEU n 1 43 ASP n 1 44 GLY n 1 45 ASP n 1 46 THR n 1 47 ALA n 1 48 PHE n 1 49 VAL n 1 50 GLN n 1 51 VAL n 1 52 TYR n 1 53 GLU n 1 54 ASP n 1 55 THR n 1 56 SER n 1 57 GLY n 1 58 LEU n 1 59 LYS n 1 60 VAL n 1 61 GLY n 1 62 GLU n 1 63 PRO n 1 64 VAL n 1 65 VAL n 1 66 SER n 1 67 THR n 1 68 GLY n 1 69 LEU n 1 70 PRO n 1 71 LEU n 1 72 ALA n 1 73 VAL n 1 74 GLU n 1 75 LEU n 1 76 GLY n 1 77 PRO n 1 78 GLY n 1 79 MET n 1 80 LEU n 1 81 ASN n 1 82 GLY n 1 83 ILE n 1 84 TYR n 1 85 ASP n 1 86 GLY n 1 87 ILE n 1 88 GLN n 1 89 ARG n 1 90 PRO n 1 91 LEU n 1 92 GLU n 1 93 ARG n 1 94 ILE n 1 95 ARG n 1 96 GLU n 1 97 LYS n 1 98 THR n 1 99 GLY n 1 100 ILE n 1 101 TYR n 1 102 ILE n 1 103 THR n 1 104 ARG n 1 105 GLY n 1 106 VAL n 1 107 VAL n 1 108 VAL n 1 109 HIS n 1 110 ALA n 1 111 LEU n 1 112 ASP n 1 113 ARG n 1 114 GLU n 1 115 LYS n 1 116 LYS n 1 117 TRP n 1 118 ALA n 1 119 TRP n 1 120 THR n 1 121 PRO n 1 122 MET n 1 123 VAL n 1 124 LYS n 1 125 PRO n 1 126 GLY n 1 127 ASP n 1 128 GLU n 1 129 VAL n 1 130 ARG n 1 131 GLY n 1 132 GLY n 1 133 MET n 1 134 VAL n 1 135 LEU n 1 136 GLY n 1 137 THR n 1 138 VAL n 1 139 PRO n 1 140 GLU n 1 141 PHE n 1 142 GLY n 1 143 PHE n 1 144 THR n 1 145 HIS n 1 146 LYS n 1 147 ILE n 1 148 LEU n 1 149 VAL n 1 150 PRO n 1 151 PRO n 1 152 ASP n 1 153 VAL n 1 154 ARG n 1 155 GLY n 1 156 ARG n 1 157 VAL n 1 158 LYS n 1 159 GLU n 1 160 VAL n 1 161 LYS n 1 162 PRO n 1 163 ALA n 1 164 GLY n 1 165 GLU n 1 166 TYR n 1 167 THR n 1 168 VAL n 1 169 GLU n 1 170 GLU n 1 171 PRO n 1 172 VAL n 1 173 VAL n 1 174 VAL n 1 175 LEU n 1 176 GLU n 1 177 ASP n 1 178 GLY n 1 179 THR n 1 180 GLU n 1 181 LEU n 1 182 LYS n 1 183 MET n 1 184 TYR n 1 185 HIS n 1 186 THR n 1 187 TRP n 1 188 PRO n 1 189 VAL n 1 190 ARG n 1 191 ARG n 1 192 ALA n 1 193 ARG n 1 194 PRO n 1 195 VAL n 1 196 GLN n 1 197 ARG n 1 198 LYS n 1 199 LEU n 1 200 ASP n 1 201 PRO n 1 202 ASN n 1 203 THR n 1 204 PRO n 1 205 PHE n 1 206 LEU n 1 207 THR 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'Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 27634 ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 478 ? 'Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 27634 ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 223 ? 'Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 27634 ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 1 104 ? 'Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 27634 ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 1 120 ? 'Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 27634 ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 1 188 ? 'Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 27634 ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 1 323 ? 'Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 27634 ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 1 652 ? 'Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 27634 ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample 1 99 ? 'Thermus thermophilus (strain HB8 / ATCC 27634 / DSM 579)' 300852 ? ? ? ? ? ? ? ? ? 27634 ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP VATA_THET8 Q56403 ? 1 ;MIQGVIQKIAGPAVIAKGMLGARMYDICKVGEEGLVGEIIRLDGDTAFVQVYEDTSGLKVGEPVVSTGLPLAVELGPGML NGIYDGIQRPLERIREKTGIYITRGVVVHALDREKKWAWTPMVKPGDEVRGGMVLGTVPEFGFTHKILVPPDVRGRVKEV KPAGEYTVEEPVVVLEDGTELKMYHTWPVRRARPVQRKLDPNTPFLTGMRILDVLFPVAMGGTAAIPGPFGSGKTVTQQS LAKWSNADVVVYVGCGERGNEMTDVLVEFPELTDPKTGGPLMHRTVLIANTSNMPVAAREASIYVGVTIAEYFRDQGFSV ALMADSTSRWAEALREISSRLEEMPAEEGYPPYLAARLAAFYERAGKVITLGGEEGAVTIVGAVSPPGGDMSEPVTQSTL RIVGAFWRLDASLAFRRHFPAINWNGSYSLFTSALDPWYRENVAEDYPELRDAISELLQREAGLQEIVQLVGPDALQDAE RLVIEVGRIIREDFLQQNAYHEVDAYCSMKKAYGIMKMILAFYKEAEAAIKRGVSIDEILQLPVLERIGRARYVSEEEFP AYFEEAMKEIQGAFKALA ; 1 2 UNP VATB_THET8 Q56404 ? 2 ;MDLLKKEYTGITYISGPLLFVENAKDLAYGAIVDIKDGTGRVRGGQVIEVSEEYAVIQVFEETTGLDLATTSVSLVEDVA RLGVSKEMLGRRFNGIGKPIDGLPPITPEKRLPITGLPLNPVARRKPEQFIQTGISTIDVMNTLVRGQKLPIFSGSGLPA NEIAAQIARQATVRPDLSGEGEKEEPFAVVFAAMGITQRELSYFIQEFERTGALSRSVLFLNKADDPTIERILTPRMALT VAEYLAFEHDYHVLVILTDMTNYCEALREIGAAREEIPGRRGYPGYMYTDLATIYERAGVVEGKKGSVTQIPILSMPDDD RTHPIPDLTGYITEGQIQLSRELHRKGIYPPIDPLPSLSRLMNNGVGKGKTREDHKQVSDQLYSAYANGVDIRKLVAIIG EDALTENDRRYLQFADAFERFFINQGQQNRSIEESLQIAWALLSMLPQGELKRISKDHIGKYYGQKLEEIWGAPQALD ; 1 3 UNP VATD_THET8 O87880 ? 3 ;MSQVSPTRMNLLQRRGQLRLAQKGVDLLKKKRDALVAEFFGLVREAMEARKALDQAAKEAYAALLLAQAFDGPEVVAGAA LGVPPLEGVEAEVENVWGSKVPRLKATFPDGALLSPVGTPAYTLEASRAFRRYAEALIRVANTETRLKKIGEEIKKTTRR VNALEQVVIPGIRAQIRFIQQVLEQREREDTFRLKRIKGKIEAREAEEEGGRPNPQVEIGAGL ; 1 4 UNP VATF_THET8 P74903 ? 4 ;MAVIADPETAQGFRLAGLEGYGASSAEEAQSLLETLVERGGYALVAVDEALLPDPERAVERLMRGRDLPVLLPIAGLKEA FQGHDVEGYMRELVRKTIGFDIKL ; 1 5 UNP Q5SIT5_THET8 Q5SIT5 ? 5 ;MTGGLVLNAISRAGGAMGGLGLIKSLAEKEKQLLERLEAAKKEAEERVKRAEAEAKALLEEAEAKAKALEAQYRERERAE TEALLARYRERAEAEAKAVREKAMARLDEAVALVLKEVLP ; 1 6 UNP VATE_THET8 P74901 ? 6 ;MSKLEAILSQEVEAEIQALLQEAEAKAEAVKREAEEKAKALLQARERALEAQYRAALRRAESAGELLVATARTQARGEVL EEVRRRVREALEALPQKPEWPEVVRKLALEALEALPGAKALVANPEDLPHLEALARERGVELQAEPALRLGVRAVGAEGK TQVENSLLARLDRAWDALSSKVAQALWG ; 1 7 UNP VATC_THET8 P74902 ? 7 ;MADDFAYLNARVRVRRGTLLKESFFQEALDLSFADFLRLLSETVYGGELAGQGLPDVDRAVLRTQAKLVGDLPRLVTGEA REAVRLLLLRNDLHNLQALLRAKATGRPFEEVLLLPGTLREEVWRQAYEAQDPAGMAQVLAVPGHPLARALRAVLRETQD LARVEALLAKRFFEDVAKAAKGLDQPALRDYLALEVDAENLRTAFKLQGSGLAPDAFFLKGGRFVDRVRFARLMEGDYAV LDELSGTPFSGLSGVRDLKALERGLRCVLLKEAKKGVQDPLGVGLVLAYVKEREWEAVRLRLLARRAYFGLPRAQVEEEV VCP ; 1 8 UNP Q5SIT6_THET8 Q5SIT6 ? 8 ;MIAPMEKLVLAGPKGRAKELLQSLQQAGVVHLETLRPEALSAYQLSPEERAELRRWEAVSAGAEHTLSLLGLEAEPARPF PEGLEAAEKALSPIQAHAEGLTRQKQELEEELALAQAYLEPLERLAALAHGLDKSPFLRVIPFLLTEKELPLVEEALRKA LEDRYLLAHEAYAGGVAALVVVHRKEVDQAKAALSRAGVAELRLPGALGELPLSEAARRLKERAEAAPRELSEVRQHLAK LARESASTLQSLWTRAQDEVARLKALEELASGRFGFALLGYVPVKAKPKVEEALARHKESVVYAFEPVDEHHEADRIPVV LDNPPWAKPFELLVSFLNTPKYGTFDPTPVVPVFFPFWFGMIVGDIGYALLFYLVGRWLSGYVKRNEPLVIDLFALKLKP QVIGKLVHILNWMVFWTVVWGVIYGEFFGTFLEHLGVFGTPEHPGLIPILIHRIDTAKTANLLILLSVAFGVVLVFFGLA LRAYLGLKHRHMAHFWEGVGYLGGLVGVLALAASYLGNLQAGWLQGLMYLGFGVFLLAVLMSRIWLMIPEIFTQAGHILS HIRIYAVGAAGGILAGLLTDVGFALAERLGLLGVLLGLLVAGVLHLLILLLTTLGHMLQPIRLLWVEFFTKFGFYEENGR PYRPFKSVREAQ ; 1 9 UNP Q5SIT7_THET8 Q5SIT7 ? 9 ;MKKLLVTVLLAVFGALAFAAEEAAASGGLDRGLIAVGMGLAVGLAALGTGVAQARIGAAGVGAIAEDRSNFGTALIFLLL PETLVIFGLLIAFILNGRL ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6R10 A 1 ? 578 ? 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'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 MG non-polymer . 'MAGNESIUM ION' ? 'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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LEU R 10 ASP R 48 1 ? 39 HELX_P HELX_P171 AS9 ASN R 70 ? LEU R 80 ? ASN R 51 LEU R 61 1 ? 11 HELX_P HELX_P172 AT1 GLU R 82 ? LEU R 99 ? GLU R 63 LEU R 80 1 ? 18 HELX_P HELX_P173 AT2 ASP S 30 ? ASP S 67 ? ASP S 11 ASP S 48 1 ? 38 HELX_P HELX_P174 AT3 ASN S 70 ? LEU S 80 ? ASN S 51 LEU S 61 1 ? 11 HELX_P HELX_P175 AT4 GLU S 82 ? LEU S 99 ? GLU S 63 LEU S 80 1 ? 18 HELX_P HELX_P176 AT5 LEU T 29 ? ASP T 67 ? LEU T 10 ASP T 48 1 ? 39 HELX_P HELX_P177 AT6 ASN T 70 ? LEU T 80 ? ASN T 51 LEU T 61 1 ? 11 HELX_P HELX_P178 AT7 GLU T 82 ? LEU T 99 ? GLU T 63 LEU T 80 1 ? 18 HELX_P HELX_P179 AT8 LEU U 29 ? ASP U 67 ? LEU U 10 ASP U 48 1 ? 39 HELX_P HELX_P180 AT9 ASN U 70 ? LEU U 80 ? ASN U 51 LEU U 61 1 ? 11 HELX_P HELX_P181 AU1 GLU U 82 ? LEU U 99 ? GLU U 63 LEU U 80 1 ? 18 HELX_P HELX_P182 AU2 LEU V 29 ? ASP V 67 ? LEU V 10 ASP V 48 1 ? 39 HELX_P HELX_P183 AU3 ASN V 70 ? LEU V 80 ? ASN V 51 LEU V 61 1 ? 11 HELX_P HELX_P184 AU4 PRO V 81 ? LEU V 99 ? 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AE5 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA1 3 4 ? anti-parallel AA1 4 5 ? anti-parallel AA1 5 6 ? anti-parallel AA1 7 8 ? anti-parallel AA1 8 9 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA2 6 7 ? anti-parallel AA2 7 8 ? anti-parallel AA2 8 9 ? anti-parallel AA2 9 10 ? anti-parallel AA2 10 11 ? anti-parallel AA2 12 13 ? anti-parallel AA2 13 14 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA4 5 6 ? anti-parallel AA4 6 7 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? parallel AA5 3 4 ? parallel AA5 4 5 ? parallel AA5 5 6 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 3 4 ? anti-parallel AA8 4 5 ? anti-parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA8 6 7 ? anti-parallel AA8 7 8 ? anti-parallel AA8 8 9 ? anti-parallel AA8 9 10 ? anti-parallel AA8 10 11 ? anti-parallel AA8 11 12 ? anti-parallel AA8 12 13 ? anti-parallel AA8 13 14 ? anti-parallel AA8 14 15 ? anti-parallel AA8 15 16 ? anti-parallel AA8 16 17 ? anti-parallel AA8 17 18 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB7 4 5 ? anti-parallel AB7 5 6 ? anti-parallel AB7 6 7 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? parallel AB9 4 5 ? parallel AB9 5 6 ? anti-parallel AB9 6 7 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? parallel AC1 5 6 ? parallel AC1 6 7 ? parallel AC1 7 8 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC5 5 6 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? parallel AC7 4 5 ? parallel AC7 5 6 ? anti-parallel AC8 1 2 ? parallel AC8 2 3 ? parallel AC8 3 4 ? parallel AC8 4 5 ? parallel AC8 5 6 ? parallel AC8 6 7 ? parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? parallel AD3 3 4 ? parallel AD3 4 5 ? parallel AD3 5 6 ? parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD6 2 3 ? parallel AD6 3 4 ? parallel AD6 4 5 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? parallel AD8 2 3 ? parallel AD9 1 2 ? parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? parallel AE5 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU C 42 ? 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