data_6REY # _entry.id 6REY # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.333 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6REY WWPDB D_1292101657 EMDB EMD-4860 # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details 'Human 20S-PA200 Proteasome Complex' _pdbx_database_related.db_id EMD-4860 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6REY _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-04-12 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Toste Rego, A.' 1 0000-0002-8584-3386 'da Fonseca, P.C.A.' 2 0000-0001-8656-5747 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Mol.Cell _citation.journal_id_ASTM MOCEFL _citation.journal_id_CSD 2168 _citation.journal_id_ISSN 1097-2765 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 76 _citation.language ? _citation.page_first 138 _citation.page_last 147.e5 _citation.title 'Characterization of Fully Recombinant Human 20S and 20S-PA200 Proteasome Complexes.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1016/j.molcel.2019.07.014 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31473102 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Toste Rego, A.' 1 ? primary 'da Fonseca, P.C.A.' 2 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6REY _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6REY _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-6' 27432.459 2 3.4.25.1 ? ? ? 2 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-2' 25927.535 2 3.4.25.1 ? ? ? 3 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-4' 29525.842 2 3.4.25.1 ? ? ? 4 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-7' 27929.891 2 3.4.25.1 ? ? ? 5 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-5' 26435.977 2 3.4.25.1 ? ? ? 6 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-1' 29595.627 2 3.4.25.1 ? ? ? 7 polymer man 'Proteasome subunit alpha type-3' 28469.252 2 3.4.25.1 ? ? ? 8 polymer man 'Proteasome subunit beta type-6' 21921.836 2 3.4.25.1 ? ? ? 9 polymer man 'Proteasome subunit beta type-7' 25321.980 2 3.4.25.1 ? ? ? 10 polymer man 'Proteasome subunit beta type-3' 22972.896 2 3.4.25.1 ? ? ? 11 polymer man 'Proteasome subunit beta type-2' 22864.277 2 3.4.25.1 ? ? ? 12 polymer man 'Proteasome subunit beta type-5' 22484.369 2 3.4.25.1 ? ? ? 13 polymer man 'Proteasome subunit beta type-1' 23578.986 2 3.4.25.1 ? ? ? 14 polymer man 'Proteasome subunit beta type-4' 24414.740 2 3.4.25.1 ? ? ? 15 polymer man 'Proteasome activator complex subunit 4' 211593.344 2 ? ? ? 'I6P and K0W molecules bound to PA200' 16 non-polymer syn 'INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE' 660.035 2 ? ? ? ? 17 non-polymer syn ;[(1~{S},2~{R},3~{R},4~{S},5~{S},6~{R})-2-[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]oxy-3,4,5,6-tetraphosphonooxy-cyclohexyl] phosphono hydrogen phosphate ; 819.995 2 ? ? ? ? # loop_ _entity_name_com.entity_id _entity_name_com.name 1 '27 kDa prosomal protein,p27K,Macropain iota chain,Multicatalytic endopeptidase complex iota chain,Proteasome iota chain' 2 'Macropain subunit C3,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C3,Proteasome component C3' 3 'Macropain subunit C9,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C9,Proteasome component C9,Proteasome subunit L' 4 'Proteasome subunit RC6-1,Proteasome subunit XAPC7' 5 'Macropain zeta chain,Multicatalytic endopeptidase complex zeta chain,Proteasome zeta chain' 6 ;30 kDa prosomal protein,PROS-30,Macropain subunit C2,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C2,Proteasome component C2,Proteasome nu chain ; 7 'Macropain subunit C8,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C8,Proteasome component C8' 8 'Macropain delta chain,Multicatalytic endopeptidase complex delta chain,Proteasome delta chain,Proteasome subunit Y' 9 'Macropain chain Z,Multicatalytic endopeptidase complex chain Z,Proteasome subunit Z' 10 'Proteasome chain 13,Proteasome component C10-II,Proteasome theta chain' 11 'Macropain subunit C7-I,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C7-I,Proteasome component C7-I' 12 ;Macropain epsilon chain,Multicatalytic endopeptidase complex epsilon chain,Proteasome chain 6,Proteasome epsilon chain,Proteasome subunit MB1,Proteasome subunit X ; 13 'Macropain subunit C5,Multicatalytic endopeptidase complex subunit C5,Proteasome component C5,Proteasome gamma chain' 14 ;26 kDa prosomal protein,PROS-26,Macropain beta chain,Multicatalytic endopeptidase complex beta chain,Proteasome beta chain,Proteasome chain 3,HsN3 ; 15 'Proteasome activator PA200' # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVM TGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYY CGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLV ALAERD ; ;MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVM TGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYY CGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLV ALAERD ; A,O ? 2 'polypeptide(L)' no no ;MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMG PDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKA TAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; ;MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMG PDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKA TAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; B,P ? 3 'polypeptide(L)' no no ;MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGIT SDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWK ATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKH EEEEAKAEREKKEKEQKEKDK ; ;MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGIT SDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWK ATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKH EEEEAKAEREKKEKEQKEKDK ; C,Q ? 4 'polypeptide(L)' no no ;MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADA RIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANA IGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQSLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENE KKKQKKAS ; ;MSYDRAITVFSPDGHLFQVEYAQEAVKKGSTAVGVRGRDIVVLGVEKKSVAKLQDERTVRKICALDDNVCMAFAGLTADA RIVINRARVECQSHRLTVEDPVTVEYITRYIASLKQRYTQSNGRRPFGISALIVGFDFDGTPRLYQTDPSGTYHAWKANA IGRGAKSVREFLEKNYTDEAIETDDLTIKLVIKALLEVVQSGGKNIELAVMRRDQSLKILNPEEIEKYVAEIEKEKEENE KKKQKKAS ; D,R ? 5 'polypeptide(L)' no no ;MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSG LIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSG TFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKD I ; ;MFLTRSEYDRGVNTFSPEGRLFQVEYAIEAIKLGSTAIGIQTSEGVCLAVEKRITSPLMEPSSIEKIVEIDAHIGCAMSG LIADAKTLIDKARVETQNHWFTYNETMTVESVTQAVSNLALQFGEEDADPGAMSRPFGVALLFGGVDEKGPQLFHMDPSG TFVQCDARAIGSASEGAQSSLQEVYHKSMTLKEAIKSSLIILKQVMEEKLNATNIELATVQPGQNFHMFTKEELEEVIKD I ; E,S ? 6 'polypeptide(L)' no no ;MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTAD ARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMS IGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERP QRKAQPAQPADEPAEKADEPMEH ; ;MFRNQYDNDVTVWSPQGRIHQIEYAMEAVKQGSATVGLKSKTHAVLVALKRAQSELAAHQKKILHVDNHIGISIAGLTAD ARLLCNFMRQECLDSRFVFDRPLPVSRLVSLIGSKTQIPTQRYGRRPYGVGLLIAGYDDMGPHIFQTCPSANYFDCRAMS IGARSQSARTYLERHMSEFMECNLNELVKHGLRALRETLPAEQDLTTKNVSIGIVGKDLEFTIYDDDDVSPFLEGLEERP QRKAQPAQPADEPAEKADEPMEH ; F,T ? 7 'polypeptide(L)' no no ;MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAG LLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLKHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYG YWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDIVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTNGRHEIVPKDIREEAEKYA KESLKEEDESDDDNM ; ;MSSIGTGYDLSASTFSPDGRVFQVEYAMKAVENSSTAIGIRCKDGVVFGVEKLVLSKLYEEGSNKRLFNVDRHVGMAVAG LLADARSLADIAREEASNFRSNFGYNIPLKHLADRVAMYVHAYTLYSAVRPFGCSFMLGSYSVNDGAQLYMIDPSGVSYG YWGCAIGKARQAAKTEIEKLQMKEMTCRDIVKEVAKIIYIVHDEVKDKAFELELSWVGELTNGRHEIVPKDIREEAEKYA KESLKEEDESDDDNM ; G,U ? 8 'polypeptide(L)' no no ;TTIMAVQFDGGVVLGADSRTTTGSYIANRVTDKLTPIHDRIFCCRSGSAADTQAVADAVTYQLGFHSIELNEPPLVHTAA SLFKEMCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQVYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLQFTANAL ALAMERDGSSGGVIRLAAIAESGVERQVLLGDQIPKFAVATLPPA ; ;TTIMAVQFDGGVVLGADSRTTTGSYIANRVTDKLTPIHDRIFCCRSGSAADTQAVADAVTYQLGFHSIELNEPPLVHTAA SLFKEMCYRYREDLMAGIIIAGWDPQEGGQVYSVPMGGMMVRQSFAIGGSGSSYIYGYVDATYREGMTKEECLQFTANAL ALAMERDGSSGGVIRLAAIAESGVERQVLLGDQIPKFAVATLPPA ; H,V ? 9 'polypeptide(L)' no no ;TTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFISPNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTAN RMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGSTDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKNLVSEAIA AGIFNDLGSGSNIDLCVISKNKLDFLRPYTVPNKKGTRLGRYRCEKGTTAVLTEKITPLEIEVLEETVQTMDTS ; ;TTIAGVVYKDGIVLGADTRATEGMVVADKNCSKIHFISPNIYCCGAGTAADTDMTTQLISSNLELHSLSTGRLPRVVTAN RMLKQMLFRYQGYIGAALVLGGVDVTGPHLYSIYPHGSTDKLPYVTMGSGSLAAMAVFEDKFRPDMEEEEAKNLVSEAIA AGIFNDLGSGSNIDLCVISKNKLDFLRPYTVPNKKGTRLGRYRCEKGTTAVLTEKITPLEIEVLEETVQTMDTS ; I,W ? 10 'polypeptide(L)' no no ;MSIMSYNGGAVMAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGR QIKPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCAEQMYGMCESLWEPNMDP DHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD ; ;MSIMSYNGGAVMAMKGKNCVAIAADRRFGIQAQMVTTDFQKIFPMGDRLYIGLAGLATDVQTVAQRLKFRLNLYELKEGR QIKPYTLMSMVANLLYEKRFGPYYTEPVIAGLDPKTFKPFICSLDLIGCPMVTDDFVVSGTCAEQMYGMCESLWEPNMDP DHLFETISQAMLNAVDRDAVSGMGVIVHIIEKDKITTRTLKARMD ; J,X ? 11 'polypeptide(L)' no no ;MEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASNIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAA ANFTRRNLADCLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISRERAVELL RKCLEELQKRFILNLPTFSVRIIDKNGIHDLDNISFPKQGS ; ;MEYLIGIQGPDYVLVASDRVAASNIVQMKDDHDKMFKMSEKILLLCVGEAGDTVQFAEYIQKNVQLYKMRNGYELSPTAA ANFTRRNLADCLRSRTPYHVNLLLAGYDEHEGPALYYMDYLAALAKAPFAAHGYGAFLTLSILDRYYTPTISRERAVELL RKCLEELQKRFILNLPTFSVRIIDKNGIHDLDNISFPKQGS ; K,Y ? 12 'polypeptide(L)' no no ;TTTLAFKFRHGVIVAADSRATAGAYIASQTVKKVIEINPYLLGTMAGGAADCSFWERLLARQCRIYELRNKERISVAAAS KLLANMVYQYKGMGLSMGTMICGWDKRGPGLYYVDSEGNRISGATFSVGSGSVYAYGVMDRGYSYDLEVEQAYDLARRAI YQATYRDAYSGGAVNLYHVREDGWIRVSSDNVADLHEKYSGSTP ; ;TTTLAFKFRHGVIVAADSRATAGAYIASQTVKKVIEINPYLLGTMAGGAADCSFWERLLARQCRIYELRNKERISVAAAS KLLANMVYQYKGMGLSMGTMICGWDKRGPGLYYVDSEGNRISGATFSVGSGSVYAYGVMDRGYSYDLEVEQAYDLARRAI YQATYRDAYSGGAVNLYHVREDGWIRVSSDNVADLHEKYSGSTP ; L,Z ? 13 'polypeptide(L)' no no ;RFSPYVFNGGTILAIAGEDFAIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKIIEARLKMYKHSNN KAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQN VEHVPLSLDRAMRLVKDVFISAAERDVYTGDALRICIVTKEGIREETVSLRKD ; ;RFSPYVFNGGTILAIAGEDFAIVASDTRLSEGFSIHTRDSPKCYKLTDKTVIGCSGFHGDCLTLTKIIEARLKMYKHSNN KAMTTGAIAAMLSTILYSRRFFPYYVYNIIGGLDEEGKGAVYSFDPVGSYQRDSFKAGGSASAMLQPLLDNQVGFKNMQN VEHVPLSLDRAMRLVKDVFISAAERDVYTGDALRICIVTKEGIREETVSLRKD ; M,a ? 14 'polypeptide(L)' no no ;TQNPMVTGTSVLGVKFEGGVVIAADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLKQVLGQMVIDEELLGDG HSYSPRAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGYADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQPLLREVLEKQPVL SQTEARDLVERCMRVLYYRDARSYNRFQIATVTEKGVEIEGPLSTETNWDIAHMISGFE ; ;TQNPMVTGTSVLGVKFEGGVVIAADMLGSYGSLARFRNISRIMRVNNSTMLGASGDYADFQYLKQVLGQMVIDEELLGDG HSYSPRAIHSWLTRAMYSRRSKMNPLWNTMVIGGYADGESFLGYVDMLGVAYEAPSLATGYGAYLAQPLLREVLEKQPVL SQTEARDLVERCMRVLYYRDARSYNRFQIATVTEKGVEIEGPLSTETNWDIAHMISGFE ; N,b ? 15 'polypeptide(L)' no no ;MEPAERAGVGEPPEPGGRPEPGPRGFVPQKEIVYNKLLPYAERLDAESDLQLAQIKCNLGRAVQLQELWPGGLFWTRKLS TYIRLYGRKFSKEDHVLFIKLLYELVSIPKLEISMMQGFARLLINLLKKKELLSRADLELPWRPLYDMVERILYSKTEHL GLNWFPNSVENILKTLVKSCRPYFPADATAEMLEEWRPLMCPFDVTMQKAITYFEIFLPTSLPPELHHKGFKLWFDELIG LWVSVQNLPQWEGQLVNLFARLATDNIGYIDWDPYVPKIFTRILRSLNLPVGSSQVLVPRFLTNAYDIGHAVIWITAMMG GPSKLVQKHLAGLFNSITSFYHPSNNGRWLNKLMKLLQRLPNSVVRRLHRERYKKPSWLTPVPDSHKLTDQDVTDFVQCI IQPVLLAMFSKTGSLEAAQALQNLALMRPELVIPPVLERTYPALETLTEPHQLTATLSCVIGVARSLVSGGRWFPEGPTH MLPLLMRALPGVDPNDFSKCMITFQFIATFSTLVPLVDCSSVLQERNDLTEVERELCSATAEFEDFVLQFMDRCFGLIES STLEQTREETETEKMTHLESLVELGLSSTFSTILTQCSKEIFMVALQKVFNFSTSHIFETRVAGRMVADMCRAAVKCCPE ESLKLFVPHCCSVITQLTMNDDVLNDEELDKELLWNLQLLSEITRVDGRKLLLYREQLVKILQRTLHLTCKQGYTLSCNL LHHLLRSTTLIYPTEYCSVPGGFDKPPSEYFPIKDWGKPGDLWNLGIQWHVPSSEEVSFAFYLLDSFLQPELVKLQHCGD GKLEMSRDDILQSLTIVHNCLIGSGNLLPPLKGEPVTNLVPSMVSLEETKLYTGLEYDLSRENHREVIATVIRKLLNHIL DNSEDDTKSLFLIIKIIGDLLQFQGSHKHEFDSRWKSFNLVKKSMENRLHGKKQHIRALLIDRVMLQHELRTLTVEGCEY KKIHQDMIRDLLRLSTSSYSQVRNKAQQTFFAALGAYNFCCRDIIPLVLEFLRPDRQGVTQQQFKGALYCLLGNHSGVCL ANLHDWDCIVQTWPAIVSSGLSQAMSLEKPSIVRLFDDLAEKIHRQYETIGLDFTIPKSCVEIAELLQQSKNPSINQILL SPEKIKEGIKRQQEKNADALRNYENLVDTLLDGVEQRNLPWKFEHIGIGLLSLLLRDDRVLPLRAIRFFVENLNHDAIVV RKMAISAVAGILKQLKRTHKKLTINPCEISGCPKPTQIIAGDRPDNHWLHYDSKTIPRTKKEWESSCFVEKTHWGYYTWP KNMVVYAGVEEQPKLGRSREDMTEAEQIIFDHFSDPKFVEQLITFLSLEDRKGKDKFNPRRFCLFKGIFRNFDDAFLPVL KPHLEHLVADSHESTQRCVAEIIAGLIRGSKHWTFEKVEKLWELLCPLLRTALSNITVETYNDWGACIATSCESRDPRKL 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_entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 246 Human ? 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'Spodoptera frugiperda' 7108 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP PSA6_HUMAN P60900 ? 1 ;MSRGSSAGFDRHITIFSPEGRLYQVEYAFKAINQGGLTSVAVRGKDCAVIVTQKKVPDKLLDSSTVTHLFKITENIGCVM TGMTADSRSQVQRARYEAANWKYKYGYEIPVDMLCKRIADISQVYTQNAEMRPLGCCMILIGIDEEQGPQVYKCDPAGYY CGFKATAAGVKQTESTSFLEKKVKKKFDWTFEQTVETAITCLSTVLSIDFKPSEIEVGVVTVENPKFRILTEAEIDAHLV ALAERD ; 1 2 UNP PSA2_HUMAN P25787 ? 2 ;MAERGYSFSLTTFSPSGKLVQIEYALAAVAGGAPSVGIKAANGVVLATEKKQKSILYDERSVHKVEPITKHIGLVYSGMG PDYRVLVHRARKLAQQYYLVYQEPIPTAQLVQRVASVMQEYTQSGGVRPFGVSLLICGWNEGRPYLFQSDPSGAYFAWKA TAMGKNYVNGKTFLEKRYNEDLELEDAIHTAILTLKESFEGQMTEDNIEVGICNEAGFRRLTPTEVKDYLAAIA ; 1 3 UNP PSA4_HUMAN P25789 ? 3 ;MSRRYDSRTTIFSPEGRLYQVEYAMEAIGHAGTCLGILANDGVLLAAERRNIHKLLDEVFFSEKIYKLNEDMACSVAGIT SDANVLTNELRLIAQRYLLQYQEPIPCEQLVTALCDIKQAYTQFGGKRPFGVSLLYIGWDKHYGFQLYQSDPSGNYGGWK ATCIGNNSAAAVSMLKQDYKEGEMTLKSALALAIKVLNKTMDVSKLSAEKVEIATLTRENGKTVIRVLKQKEVEQLIKKH EEEEAKAEREKKEKEQKEKDK ; 1 4 UNP PSA7_HUMAN O14818 ? 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'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6REY _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6REY _struct.title 'Human 20S-PA200 Proteasome Complex' _struct.pdbx_descriptor ;Proteasome subunit alpha type-6 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit alpha type-2 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit alpha type-4 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit alpha type-7 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit alpha type-5 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit alpha type-1 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit alpha type-3 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-6 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-7 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-3 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-2 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-5 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-1 (E.C.3.4.25.1), Proteasome subunit beta type-4 (E.C.3.4.25.1), Proteasome activator complex subunit 4 ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6REY _struct_keywords.text 'proteasome, PA200, activator, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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_pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_audit_revision_group.ordinal _pdbx_audit_revision_group.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_group.data_content_type _pdbx_audit_revision_group.group 1 2 'Structure model' 'Data collection' 2 2 'Structure model' 'Database references' 3 3 'Structure model' 'Data collection' 4 3 'Structure model' 'Database references' 5 4 'Structure model' Advisory 6 4 'Structure model' 'Atomic model' 7 4 'Structure model' 'Data collection' 8 4 'Structure model' 'Derived calculations' 9 4 'Structure model' 'Non-polymer description' 10 4 'Structure model' 'Structure summary' # loop_ _pdbx_audit_revision_category.ordinal _pdbx_audit_revision_category.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_category.data_content_type _pdbx_audit_revision_category.category 1 2 'Structure model' citation 2 2 'Structure model' citation_author 3 3 'Structure model' citation 4 4 'Structure model' atom_site 5 4 'Structure model' chem_comp 6 4 'Structure model' database_PDB_caveat 7 4 'Structure model' entity 8 4 'Structure model' pdbx_entity_nonpoly 9 4 'Structure model' pdbx_nonpoly_scheme 10 4 'Structure model' pdbx_validate_chiral 11 4 'Structure model' pdbx_validate_close_contact 12 4 'Structure model' struct_site # loop_ _pdbx_audit_revision_item.ordinal _pdbx_audit_revision_item.revision_ordinal _pdbx_audit_revision_item.data_content_type _pdbx_audit_revision_item.item 1 2 'Structure model' '_citation.pdbx_database_id_PubMed' 2 2 'Structure model' '_citation.title' 3 2 'Structure model' '_citation_author.identifier_ORCID' 4 3 'Structure model' '_citation.journal_volume' 5 3 'Structure model' '_citation.page_first' 6 3 'Structure model' '_citation.page_last' 7 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_x' 8 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_y' 9 4 'Structure model' '_atom_site.Cartn_z' 10 4 'Structure model' '_atom_site.auth_atom_id' 11 4 'Structure model' '_atom_site.auth_comp_id' 12 4 'Structure model' '_atom_site.label_atom_id' 13 4 'Structure model' '_atom_site.label_comp_id' 14 4 'Structure model' '_atom_site.pdbx_formal_charge' 15 4 'Structure model' '_atom_site.type_symbol' 16 4 'Structure model' '_chem_comp.id' 17 4 'Structure model' '_chem_comp.name' 18 4 'Structure model' '_chem_comp.pdbx_synonyms' 19 4 'Structure model' '_entity.pdbx_description' 20 4 'Structure model' '_pdbx_entity_nonpoly.comp_id' 21 4 'Structure model' '_pdbx_entity_nonpoly.name' 22 4 'Structure model' '_pdbx_nonpoly_scheme.mon_id' 23 4 'Structure model' '_pdbx_nonpoly_scheme.pdb_mon_id' 24 4 'Structure model' '_pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2' 25 4 'Structure model' '_pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2' 26 4 'Structure model' '_struct_site.details' 27 4 'Structure model' '_struct_site.pdbx_auth_comp_id' # _pdbx_entry_details.entry_id 6REY _pdbx_entry_details.has_ligand_of_interest N _pdbx_entry_details.compound_details ? _pdbx_entry_details.source_details ? _pdbx_entry_details.nonpolymer_details ? _pdbx_entry_details.sequence_details ? # loop_ _em_3d_fitting.entry_id _em_3d_fitting.id _em_3d_fitting.details _em_3d_fitting.overall_b_value _em_3d_fitting.ref_protocol _em_3d_fitting.ref_space _em_3d_fitting.target_criteria _em_3d_fitting.method 6REY 1 'The model of the human recombinant 20S proteasome was built based on PDB: 5LE5 using real-space refinement in Coot and Phenix' ? 'FLEXIBLE FIT' REAL ? ? 6REY 2 ;the model for the human PA200 derived from Phyre2 and I-Tasser. These PA200 models were used as initial guides for the assignment of secondary structure using real-space refinement in Coot and Phenix, followed by correction of the sequence register using the amino acid side chain densities clearly resolved in our cryo-EM map. Connecting loops and all other regions were built ab initio from the cryo-EM density. ; ? 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