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18 ;MSTFIRGPICGTDNCPSRLWRIIDGRRTCQYGHVMEGDVEFNDDEDDLNGLGAGVITRRLNLTTNATGSFQSSQLTNSQL LQQQQRQSHKKFKKLIGHEAKLLFLKSFQFILKRQIRWLITEMRFPKEFEHVAKIIWLKILKTINDQPQEELKLQLHMTS TISILYLASTHLSLPVYTCDYIKWICTAKMPYFQASEILPKSWRIQLPNYYVSILEGSISPFNGQLYNKIALTCGMIHFK EFFNSEISCQGLLLKLVMQCALPPEFYFYTKQVIEFEETDIRNLTLWERTDERHTGRVSNHAELRVLSYFMLTINWMLSF DRDRQYPLKWILSLTESLTQRTTTSESIGRNIVKVVYPDKPTSSDYFQWSEEETLEFLKWMEKQFLPTQTKSLHNENGSM EMTIDQKIARRKLYKIFPLDREANHDGEFNDSTHQLTFIEDLQERYAKQTPFFESNKIRDSLNYQEANPPARKEAIGRLL THIASQLLVDFAISKEQLKDCISRIKNACLHRMN ; 1 19 UNP RRN6_YEAST P32786 ? 19 ;MSEGQIPSSDVLGSQLGVGVQGASLYCPQENYTTKKQEKPQWLRPVDDTLAEDALDLHIVVKSLLCDTAIRYISDDKVLQ ESDADDDLITSDIDEDTDNQGDTSIVVNPVIPVVPKDVHFFKKVDVGNDSMFGVNCDTPVSFQDYIPSDLLRNLDDTLQE STNSSRPMQDAFFWDPTVANRLDSQYIQTASDLRNYRDGTEIIAYASGKTGSVLNIAVLTRQNTLHLNRHNNVTSIELHS PIKSIKIPGASESIGRRSNLVGIITENSFQIFRIESVHSRSCDVMVSSSEPLYFVEIDDLQVVDFAFNPWDLQQFAIIDI KGNWSIGRIPKNFNNNNKRKLQLIDNLHGTIFDPEELSSWKRIEWFSHFQKILVFDRSKMIEIDFMNNWQTEVVQAKAWS NIRDYKRIDDKNGILLTSREIIIVGASESNDPVRRISWKHDLDPDDTTLRITVQKVKKPDHILLVAFVYSMRHKRIYMHV FSHRKANLFQSLGCSTVLEIPGGTPTGIETILTLDHIDDESRREEDADENFELVVDFLVKLRNSSEVYYYALSNTQNSEP NKQETPIIVDHPEWASLFNNADEREKESIGALVSQIKLKERERISRVQNLIEHENSHDEDKYLQDLGYRLSIATNELLES WQKTKDESILSGSLSHSKLKNLLENSDSFASIPEFSSLLDQFFQYYQDQDVTFIGFEKLLHLFLHEDVPGLDIFYNKLLQ CWVLVSPQAELLTKEIVKDIIWSLARLEKPSLFEPIQNEISRSLSGPYQDIISSWDMDDINEEDESNEFNFDSQFSAPFN GRPPFNLNSQSQIPTIKSSQSSGLARRKRILKTQSQKATPLSQSTQNLSVLPDSMTPAFTLMQPPSSQISFVNDSQPRNS QKAKKKKKRIRGFG ; 1 20 UNP RRN11_YEAST Q04712 ? 20 ;MFEVPITLTNRKFAQRRKLKYQYINYISRRFDRISKKSTTTDSLPTPENSAAENNDEEEGQNSEAGTYRRSVLQQKKRRR ERHWRSVVGEIYSTTESETDSQEEETEEGGEHDTGIDKEDSDEERKFWKKYEKPEKSFEIWRTVSSQNKQPINKQKMTYH NFKKIEKIPLRKMEIPLLHCTKENKLYFQSISRGLEPLKTSTSEVRNYRTRHIVTLTDLLHLNVSRHNWSLAYKIFATLI RIPGVQIKSLWGIGVEILDNLSNSSSGLDFLQWMCQIYSSKSRFVQNINYRSIVPPFQTGSRTHTAKFAITYLWSSLINC QKSMEPSSNIIDKPFDTENDLLQELIDKISEWVLTPPFMEDAEVWFIYASCHLLKADTLSRQFVNDNKNNDLIGLDRDIK INQVIKHIHYVRTFLKICLDKGGFAVPSRLIENQLKSFESRLYGEAQDIQERDVANVYDSIDNSSVENSFGDVYETNAEF LDTQLMDLSPEDNGLDEMHYSDEDSSE ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6RUI T 1 ? 70 ? 6RUI 1 ? 70 ? 1 70 2 2 6RUI U 1 ? 70 ? 6RUI 1 ? 70 ? 1 70 3 3 6RUI I 1 ? 125 ? P32529 1 ? 125 ? 1 125 4 4 6RUI N 1 ? 233 ? P47006 1 ? 233 ? 1 233 5 5 6RUI M 1 ? 415 ? Q01080 1 ? 415 ? 1 415 6 6 6RUI A 1 ? 1664 ? P10964 1 ? 1664 ? 1 1664 7 7 6RUI B 1 ? 1203 ? P22138 1 ? 1203 ? 1 1203 8 8 6RUI C 1 ? 335 ? P07703 1 ? 335 ? 1 335 9 9 6RUI D 1 ? 137 ? P50106 1 ? 137 ? 1 137 10 10 6RUI E 1 ? 215 ? P20434 1 ? 215 ? 1 215 11 11 6RUI F 1 ? 155 ? P20435 1 ? 155 ? 1 155 12 12 6RUI G 1 ? 326 ? P46669 1 ? 326 ? 1 326 13 13 6RUI H 1 ? 146 ? P20436 1 ? 146 ? 1 146 14 14 6RUI J 1 ? 70 ? P22139 1 ? 70 ? 1 70 15 15 6RUI K 1 ? 142 ? P28000 1 ? 142 ? 1 142 16 16 6RUI L 1 ? 70 ? P40422 1 ? 70 ? 1 70 17 17 6RUI O 1 ? 627 ? P36070 1 ? 627 ? 1 627 18 18 6RUI Q 1 ? 514 ? P40992 1 ? 514 ? 1 514 19 19 6RUI S 1 ? 894 ? P32786 1 ? 894 ? 1 894 20 20 6RUI R 1 ? 507 ? Q04712 1 ? 507 ? 1 507 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details eicosameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 20 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 119780 ? 1 MORE -630 ? 1 'SSA (A^2)' 271970 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 SER C 58 ? LYS C 63 ? SER I 58 LYS I 63 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP D 63 ? LEU D 67 ? ASP N 63 LEU N 67 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP D 149 ? ARG D 154 ? ASP N 149 ARG N 154 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP E 67 ? ALA E 72 ? ASP M 67 ALA M 72 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 LYS F 22 ? SER F 28 ? LYS A 22 SER A 28 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 PHE F 90 ? ARG F 99 ? PHE A 90 ARG A 99 1 ? 10 HELX_P HELX_P7 AA7 VAL F 113 ? LEU F 125 ? VAL A 113 LEU A 125 1 ? 13 HELX_P HELX_P8 AA8 ILE F 130 ? LYS F 135 ? ILE A 130 LYS A 135 1 ? 6 HELX_P HELX_P9 AA9 SER F 174 ? ASP F 199 ? SER A 174 ASP A 199 1 ? 26 HELX_P HELX_P10 AB1 THR F 209 ? HIS F 224 ? THR A 209 HIS A 224 1 ? 16 HELX_P HELX_P11 AB2 ILE F 261 ? VAL F 266 ? ILE A 261 VAL A 266 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 THR F 318 ? GLU F 331 ? THR A 318 GLU A 331 1 ? 14 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU F 331 ? PHE F 339 ? GLU A 331 PHE A 339 1 ? 9 HELX_P HELX_P14 AB5 LYS F 351 ? SER F 354 ? LYS A 351 SER A 354 5 ? 4 HELX_P HELX_P15 AB6 THR F 365 ? LEU F 369 ? THR A 365 LEU A 369 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 ASN F 380 ? LEU F 406 ? ASN A 380 LEU A 406 1 ? 27 HELX_P HELX_P17 AB8 VAL F 418 ? ASP F 439 ? VAL A 418 ASP A 439 1 ? 22 HELX_P HELX_P18 AB9 PRO F 454 ? ALA F 459 ? PRO A 454 ALA A 459 1 ? 6 HELX_P HELX_P19 AC1 LEU F 466 ? MET F 471 ? LEU A 466 MET A 471 1 ? 6 HELX_P HELX_P20 AC2 PRO F 498 ? VAL F 503 ? PRO A 498 VAL A 503 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN F 515 ? GLY F 526 ? ASN A 515 GLY A 526 1 ? 12 HELX_P HELX_P22 AC4 SER F 550 ? ASN F 559 ? SER A 550 ASN A 559 1 ? 10 HELX_P HELX_P23 AC5 HIS F 596 ? ALA F 598 ? HIS A 596 ALA A 598 5 ? 3 HELX_P HELX_P24 AC6 HIS F 617 ? THR F 621 ? HIS A 617 THR A 621 5 ? 5 HELX_P HELX_P25 AC7 ASN F 640 ? LEU F 650 ? ASN A 640 LEU A 650 1 ? 11 HELX_P HELX_P26 AC8 HIS F 673 ? THR F 681 ? HIS A 673 THR A 681 1 ? 9 HELX_P HELX_P27 AC9 THR F 688 ? ILE F 700 ? THR A 688 ILE A 700 1 ? 13 HELX_P HELX_P28 AD1 GLY F 728 ? THR F 740 ? GLY A 728 THR A 740 1 ? 13 HELX_P HELX_P29 AD2 LYS F 756 ? GLY F 761 ? LYS A 756 GLY A 761 5 ? 6 HELX_P HELX_P30 AD3 ASP F 782 ? GLY F 787 ? ASP A 782 GLY A 787 1 ? 6 HELX_P HELX_P31 AD4 GLY F 792 ? TYR F 801 ? GLY A 792 TYR A 801 1 ? 10 HELX_P HELX_P32 AD5 GLY F 802 ? THR F 824 ? GLY A 802 THR A 824 1 ? 23 HELX_P HELX_P33 AD6 MET F 830 ? ARG F 834 ? MET A 830 ARG A 834 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 GLU F 838 ? LYS F 848 ? GLU A 838 LYS A 848 1 ? 11 HELX_P HELX_P35 AD8 THR F 849 ? VAL F 851 ? THR A 849 VAL A 851 5 ? 3 HELX_P HELX_P36 AD9 ASP F 852 ? THR F 862 ? ASP A 852 THR A 862 1 ? 11 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP F 872 ? ARG F 884 ? ASP A 872 ARG A 884 1 ? 13 HELX_P HELX_P38 AE2 ASP F 885 ? VAL F 912 ? ASP A 885 VAL A 912 1 ? 28 HELX_P HELX_P39 AE3 ASN F 923 ? GLY F 932 ? ASN A 923 GLY A 932 1 ? 10 HELX_P HELX_P40 AE4 SER F 936 ? CYS F 945 ? SER A 936 CYS A 945 1 ? 10 HELX_P HELX_P41 AE5 ALA F 976 ? GLY F 979 ? ALA A 976 GLY A 979 5 ? 4 HELX_P HELX_P42 AE6 LYS F 991 ? ALA F 1010 ? LYS A 991 ALA A 1010 1 ? 20 HELX_P HELX_P43 AE7 SER F 1016 ? LEU F 1027 ? 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R THR 12 OG1 ? ? ? 1_555 U ZN . ZN ? ? Q THR 12 Q ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.098 ? ? metalc2 metalc ? ? R CYS 29 SG ? ? ? 1_555 U ZN . ZN ? ? Q CYS 29 Q ZN 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.511 ? ? hydrog1 hydrog ? ? A DT 4 N3 ? ? ? 1_555 B DA 67 N1 ? ? T DT 4 U DA 67 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DC 6 N4 ? ? ? 1_555 B DT 64 O2 ? ? T DC 6 U DT 64 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DT MISPAIR' ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DA 7 N1 ? ? ? 1_555 B DT 63 N3 ? ? T DA 7 U DT 63 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DT PAIR' ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 11 O6 ? ? ? 1_555 B DG 59 N2 ? ? T DG 11 U DG 59 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DG MISPAIR' ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DC 12 N4 ? ? ? 1_555 B DA 57 N1 ? ? T DC 12 U DA 57 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DA MISPAIR' ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DC 30 O2 ? ? ? 1_555 B DG 41 N2 ? ? T DC 30 U DG 41 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DC 31 N3 ? ? ? 1_555 B DG 40 N2 ? ? T DC 31 U DG 40 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DC 32 O2 ? ? ? 1_555 B DG 39 N2 ? ? T DC 32 U DG 39 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DA 33 N1 ? ? ? 1_555 B DT 38 N3 ? ? T DA 33 U DT 38 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DA-DT PAIR' ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DA 34 N1 ? ? ? 1_555 B DG 36 N1 ? ? T DA 34 U DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DA 34 N6 ? ? ? 1_555 B DG 36 O6 ? ? T DA 34 U DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DC 35 N3 ? ? ? 1_555 B DG 36 N2 ? ? T DC 35 U DG 36 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DT 36 N3 ? ? ? 1_555 B DA 35 N1 ? ? T DT 36 U DA 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DT 36 O4 ? ? ? 1_555 B DA 35 N6 ? ? T DT 36 U DA 35 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DA 37 N1 ? ? ? 1_555 B DT 34 N3 ? ? T DA 37 U DT 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DA 37 N6 ? ? ? 1_555 B DT 34 O4 ? ? T DA 37 U DT 34 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DC 38 N3 ? ? ? 1_555 B DG 33 N1 ? ? T DC 38 U DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DC 38 N4 ? ? ? 1_555 B DG 33 O6 ? ? T DC 38 U DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DC 38 O2 ? ? ? 1_555 B DG 33 N2 ? ? T DC 38 U DG 33 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DT 39 N3 ? ? ? 1_555 B DA 32 N1 ? ? T DT 39 U DA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DT 39 O4 ? ? ? 1_555 B DA 32 N6 ? ? T DT 39 U DA 32 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DT 40 N3 ? ? ? 1_555 B DA 31 N1 ? ? T DT 40 U DA 31 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DT 41 N3 ? ? ? 1_555 B DA 30 N1 ? ? T DT 41 U DA 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DT 41 O4 ? ? ? 1_555 B DA 30 N6 ? ? T DT 41 U DA 30 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DT 42 N3 ? ? ? 1_555 B DA 29 N1 ? ? T DT 42 U DA 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DT 42 O4 ? ? ? 1_555 B DA 29 N6 ? ? T DT 42 U DA 29 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DC 43 N3 ? ? ? 1_555 B DG 28 N1 ? ? T DC 43 U DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DC 43 N4 ? ? ? 1_555 B DG 28 O6 ? ? T DC 43 U DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A DC 43 O2 ? ? ? 1_555 B DG 28 N2 ? ? T DC 43 U DG 28 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A DC 44 N3 ? ? ? 1_555 B DG 27 N1 ? ? T DC 44 U DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A DC 44 N4 ? ? ? 1_555 B DG 27 O6 ? ? T DC 44 U DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A DC 44 O2 ? ? ? 1_555 B DG 27 N2 ? ? T DC 44 U DG 27 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? A DT 45 N3 ? ? ? 1_555 B DA 26 N1 ? ? T DT 45 U DA 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? A DT 45 O4 ? ? ? 1_555 B DA 26 N6 ? ? T DT 45 U DA 26 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? A DC 46 N3 ? ? ? 1_555 B DG 25 N1 ? ? T DC 46 U DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? A DC 46 N4 ? ? ? 1_555 B DG 25 O6 ? ? T DC 46 U DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? A DC 46 O2 ? ? ? 1_555 B DG 25 N2 ? ? T DC 46 U DG 25 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A DC 48 O2 ? ? ? 1_555 B DG 23 N1 ? ? T DC 48 U DG 23 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A DC 50 O2 ? ? ? 1_555 B DG 21 N2 ? ? T DC 50 U DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A DT 51 O2 ? ? ? 1_555 B DA 20 N6 ? ? T DT 51 U DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? A DT 51 O2 ? ? ? 1_555 B DG 21 N2 ? ? T DT 51 U DG 21 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DG MISPAIR' ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? A DT 52 N3 ? ? ? 1_555 B DA 19 N1 ? ? T DT 52 U DA 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? A DT 52 O4 ? ? ? 1_555 B DA 19 N6 ? ? T DT 52 U DA 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? A DT 52 N3 ? ? ? 1_555 B DA 20 N1 ? ? T DT 52 U DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? A DT 52 O4 ? ? ? 1_555 B DA 20 N6 ? ? T DT 52 U DA 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? A DG 53 N1 ? ? ? 1_555 B DA 17 N1 ? ? T DG 53 U DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? A DG 53 O6 ? ? ? 1_555 B DA 17 N6 ? ? T DG 53 U DA 17 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_8_PAIR ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? A DC 56 N4 ? ? ? 1_555 B DA 14 N1 ? ? T DC 56 U DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DA MISPAIR' ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? A DC 56 N3 ? ? ? 1_555 B DG 15 N2 ? ? T DC 56 U DG 15 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? A DC 58 N3 ? ? ? 1_555 B DG 13 N1 ? ? T DC 58 U DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? A DC 58 N4 ? ? ? 1_555 B DG 13 O6 ? ? T DC 58 U DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? A DC 58 O2 ? ? ? 1_555 B DG 13 N2 ? ? T DC 58 U DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? A DC 59 O2 ? ? ? 1_555 B DG 13 N2 ? ? T DC 59 U DG 13 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # _pdbx_struct_conn_angle.id 1 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id OG1 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id R _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id THR _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id 12 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id Q _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id THR _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id 12 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry 1_555 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id ZN _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id U _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id ZN _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id . _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id Q _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id ZN _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id 601 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry 1_555 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id SG _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id R _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id CYS _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id 29 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id Q _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id CYS _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id 29 _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code ? _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry 1_555 _pdbx_struct_conn_angle.value 109.7 _pdbx_struct_conn_angle.value_esd ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 8 ? AA5 ? 7 ? AA6 ? 3 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 8 ? AB3 ? 4 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 7 ? AC2 ? 4 ? AC3 ? 4 ? AC4 ? 4 ? AC5 ? 2 ? AC6 ? 3 ? AC7 ? 4 ? AC8 ? 5 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 4 ? AD2 ? 5 ? AD3 ? 5 ? AD4 ? 7 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 8 ? AD7 ? 3 ? AD8 ? 2 ? AD9 ? 2 ? AE1 ? 2 ? AE2 ? 3 ? AE3 ? 4 ? AE4 ? 4 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 2 ? AE7 ? 2 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 4 ? AF1 ? 2 ? AF2 ? 4 ? AF3 ? 6 ? AF4 ? 2 ? AF5 ? 9 ? AF6 ? 4 ? AF7 ? 2 ? AF8 ? 2 ? AF9 ? 4 ? AG1 ? 2 ? AG2 ? 2 ? AG3 ? 2 ? AG4 ? 4 ? AG5 ? 4 ? AG6 ? 4 ? AG7 ? 5 ? AG8 ? 3 ? AG9 ? 4 ? AH1 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA4 3 4 ? anti-parallel AA4 4 5 ? anti-parallel AA4 5 6 ? parallel AA4 6 7 ? anti-parallel AA4 7 8 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA5 3 4 ? parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA5 5 6 ? anti-parallel AA5 6 7 ? parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? parallel AB2 6 7 ? anti-parallel AB2 7 8 ? parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC1 5 6 ? anti-parallel AC1 6 7 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC2 3 4 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC8 4 5 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD3 4 5 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 3 4 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD4 5 6 ? anti-parallel AD4 6 7 ? anti-parallel AD5 1 2 ? parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD6 4 5 ? parallel AD6 5 6 ? anti-parallel AD6 6 7 ? parallel AD6 7 8 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? parallel AE9 3 4 ? parallel AF1 1 2 ? parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF2 2 3 ? anti-parallel AF2 3 4 ? parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF3 3 4 ? parallel AF3 4 5 ? anti-parallel AF3 5 6 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF5 4 5 ? anti-parallel AF5 5 6 ? anti-parallel AF5 6 7 ? anti-parallel AF5 7 8 ? anti-parallel AF5 8 9 ? anti-parallel AF6 1 2 ? anti-parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AF9 3 4 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG4 3 4 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG5 2 3 ? anti-parallel AG5 3 4 ? anti-parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG6 2 3 ? anti-parallel AG6 3 4 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG7 2 3 ? anti-parallel AG7 3 4 ? anti-parallel AG7 4 5 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AG9 2 3 ? anti-parallel AG9 3 4 ? anti-parallel AH1 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 VAL C 3 ? VAL C 4 ? VAL I 3 VAL I 4 AA1 2 LEU C 7 ? ILE C 8 ? LEU I 7 ILE I 8 AA2 1 VAL C 47 ? THR C 50 ? VAL I 47 THR I 50 AA2 2 ILE F 1267 ? THR F 1275 ? ILE A 1267 THR A 1275 AA2 3 SER F 1289 ? PHE F 1296 ? SER A 1289 PHE A 1296 AA2 4 TRP F 1469 ? GLU F 1475 ? TRP A 1469 GLU A 1475 AA2 5 ASN F 1461 ? PHE F 1462 ? ASN A 1461 PHE A 1462 AA3 1 MET C 94 ? ASN C 95 ? MET I 94 ASN I 95 AA3 2 THR C 113 ? CYS C 114 ? THR I 113 CYS I 114 AA4 1 PHE D 29 ? LYS D 31 ? PHE N 29 LYS N 31 AA4 2 THR E 37 ? LYS E 43 ? THR M 37 LYS M 43 AA4 3 GLU E 50 ? GLU E 56 ? GLU M 50 GLU M 56 AA4 4 GLU E 61 ? TYR E 65 ? GLU M 61 TYR M 65 AA4 5 VAL E 95 ? SER E 98 ? VAL M 95 SER M 98 AA4 6 ALA E 22 ? SER E 25 ? ALA M 22 SER M 25 AA4 7 THR D 108 ? VAL D 111 ? THR N 108 VAL N 111 AA4 8 LYS D 120 ? ILE D 121 ? LYS N 120 ILE N 121 AA5 1 MET D 80 ? ILE D 82 ? MET N 80 ILE N 82 AA5 2 HIS D 85 ? ILE D 89 ? HIS N 85 ILE N 89 AA5 3 LYS D 135 ? THR D 142 ? LYS N 135 THR N 142 AA5 4 GLN D 52 ? PRO D 59 ? 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'Saccharomyces cerevisiae' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 1 2 ? 4932 'Saccharomyces cerevisiae' ? ? 2 3 ? 32630 'synthetic construct' ? ? 3 4 ? 562 'Escherichia coli' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 1.1075 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode SUPER-RESOLUTION _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? ? ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? SerialEM ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Gctf ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? ? ? 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6RUI 'double helix' 6RUI 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DT 4 1_555 B DA 67 1_555 -0.074 1.427 -0.649 4.905 26.608 65.738 1 T_DT4:DA67_U T 4 ? U 67 ? ? 1 1 A DC 6 1_555 B DT 64 1_555 -3.162 -1.446 0.234 -21.903 -12.128 37.447 2 T_DC6:DT64_U T 6 ? U 64 ? ? ? 1 A DA 7 1_555 B DT 63 1_555 -1.843 0.010 0.315 -11.492 -16.232 22.015 3 T_DA7:DT63_U T 7 ? U 63 ? ? 1 1 A DG 11 1_555 B DG 59 1_555 -3.219 1.702 0.802 -7.816 -5.296 12.049 4 T_DG11:DG59_U T 11 ? U 59 ? ? 1 1 A DC 12 1_555 B DA 57 1_555 -2.084 -0.151 -2.038 30.107 -22.440 5.471 5 T_DC12:DA57_U T 12 ? U 57 ? ? 1 1 A DC 30 1_555 B DG 41 1_555 -0.578 0.426 -0.575 7.291 -14.958 18.876 6 T_DC30:DG41_U T 30 ? U 41 ? ? 1 1 A DC 31 1_555 B DG 40 1_555 -2.988 2.296 1.372 18.705 -37.156 43.462 7 T_DC31:DG40_U T 31 ? U 40 ? ? ? 1 A DC 32 1_555 B DG 39 1_555 1.231 1.981 0.011 19.941 -53.474 42.012 8 T_DC32:DG39_U T 32 ? U 39 ? ? ? 1 A DA 33 1_555 B DT 38 1_555 1.220 0.337 1.813 -4.214 -32.573 20.731 9 T_DA33:DT38_U T 33 ? U 38 ? ? 1 1 A DC 35 1_555 B DG 36 1_555 -2.128 0.906 0.266 -8.014 -36.364 30.546 10 T_DC35:DG36_U T 35 ? 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