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THR B 93 TRP B 108 1 ? 16 HELX_P HELX_P72 AH9 SER P 124 ? GLN P 135 ? SER B 123 GLN B 134 1 ? 12 HELX_P HELX_P73 AI1 VAL P 152 ? ILE P 166 ? VAL B 151 ILE B 165 1 ? 15 HELX_P HELX_P74 AI2 ARG P 167 ? ALA P 170 ? ARG B 166 ALA B 169 5 ? 4 HELX_P HELX_P75 AI3 LYS P 172 ? LYS P 187 ? LYS B 171 LYS B 186 1 ? 16 HELX_P HELX_P76 AI4 SER P 196 ? GLN P 222 ? SER B 195 GLN B 221 1 ? 27 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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A DLU 303 A MG 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? metalc11 metalc ? ? S DLU . OAE ? ? ? 1_555 T MG . MG ? ? A DLU 303 A MG 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.078 ? ? metalc12 metalc ? ? S DLU . OAD ? ? ? 1_555 U MG . MG ? ? A DLU 303 A MG 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? ? metalc13 metalc ? ? S DLU . OAE ? ? ? 1_555 U MG . MG ? ? A DLU 303 A MG 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.094 ? ? metalc14 metalc ? ? T MG . MG ? ? ? 1_555 GA HOH . O ? ? A MG 304 A HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? metalc15 metalc ? ? T MG . MG ? ? ? 1_555 GA HOH . O ? ? A MG 304 A HOH 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? metalc16 metalc ? ? U MG . MG ? ? ? 1_555 GA HOH . O ? ? A MG 305 A HOH 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? metalc17 metalc ? ? D HIS 13 NE2 ? ? ? 1_555 V ZN . ZN ? ? E HIS 12 E ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? ? metalc18 metalc ? ? D HIS 17 ND1 ? ? ? 1_555 V ZN . ZN ? ? E HIS 16 E ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.191 ? ? metalc19 metalc ? ? D CYS 41 SG ? ? ? 1_555 V ZN . ZN ? ? E CYS 40 E ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.379 ? ? metalc20 metalc ? ? D CYS 44 SG ? ? ? 1_555 V ZN . ZN ? ? E CYS 43 E ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.375 ? ? metalc21 metalc ? ? G HIS 13 NE2 ? ? ? 1_555 W ZN . ZN ? ? K HIS 12 K ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.189 ? ? metalc22 metalc ? ? G HIS 17 ND1 ? ? ? 1_555 W ZN . ZN ? ? K HIS 16 K ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? ? metalc23 metalc ? ? G CYS 41 SG ? ? ? 1_555 W ZN . ZN ? ? K CYS 40 K ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? ? metalc24 metalc ? ? G CYS 44 SG ? ? ? 1_555 W ZN . ZN ? ? K CYS 43 K ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? ? metalc25 metalc ? ? H HIS 13 NE2 ? ? ? 1_555 X ZN . ZN ? ? J HIS 12 J ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? ? metalc26 metalc ? ? H HIS 17 ND1 ? ? ? 1_555 X ZN . ZN ? ? J HIS 16 J ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? ? metalc27 metalc ? ? H CYS 41 SG ? ? ? 1_555 X ZN . ZN ? ? J CYS 40 J ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? ? metalc28 metalc ? ? H CYS 44 SG ? ? ? 1_555 X ZN . ZN ? ? J CYS 43 J ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.381 ? ? metalc29 metalc ? ? I HIS 13 NE2 ? ? ? 1_555 Y ZN . ZN ? ? I HIS 12 I ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.044 ? ? metalc30 metalc ? ? I HIS 17 ND1 ? ? ? 1_555 Y ZN . ZN ? ? I HIS 16 I ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.216 ? ? metalc31 metalc ? ? I CYS 41 SG ? ? ? 1_555 Y ZN . ZN ? ? I CYS 40 I ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? ? metalc32 metalc ? ? I CYS 44 SG ? ? ? 1_555 Y ZN . ZN ? ? I CYS 43 I ZN 301 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.406 ? ? metalc33 metalc ? ? I ASP 65 OD1 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? I ASP 64 I MG 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.095 ? ? metalc34 metalc ? ? I ASP 65 OD2 ? ? ? 1_555 CA MG . MG ? ? I ASP 64 I MG 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.053 ? ? metalc35 metalc ? ? I ASP 117 OD2 ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? I ASP 116 I MG 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.084 ? ? metalc36 metalc ? ? I GLU 153 OE1 ? ? ? 1_555 CA MG . MG ? ? I GLU 152 I MG 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? ? metalc37 metalc ? ? I GLU 153 OE2 ? ? ? 1_555 CA MG . MG ? ? I GLU 152 I MG 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? metalc38 metalc ? ? AA DLU . OAC ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? I DLU 303 I MG 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? metalc39 metalc ? ? AA DLU . OAE ? ? ? 1_555 BA MG . MG ? ? I DLU 303 I MG 304 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.077 ? ? metalc40 metalc ? ? AA DLU . OAD ? ? ? 1_555 CA MG . MG ? ? I DLU 303 I MG 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? metalc41 metalc ? ? AA DLU . OAE ? ? ? 1_555 CA MG . MG ? ? I DLU 303 I MG 305 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.086 ? ? metalc42 metalc ? ? BA MG . MG ? ? ? 1_555 HA HOH . O ? ? I MG 304 I HOH 401 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? metalc43 metalc ? ? BA MG . MG ? ? ? 1_555 HA HOH . O ? ? I MG 304 I HOH 403 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? metalc44 metalc ? ? CA MG . MG ? ? ? 1_555 HA HOH . O ? ? I MG 305 I HOH 402 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? ? metalc45 metalc ? ? L HIS 13 NE2 ? ? ? 1_555 DA ZN . ZN ? ? M HIS 12 M ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.197 ? ? metalc46 metalc ? ? L HIS 17 ND1 ? ? ? 1_555 DA ZN . ZN ? ? M HIS 16 M ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.192 ? ? metalc47 metalc ? ? L CYS 41 SG ? ? ? 1_555 DA ZN . ZN ? ? M CYS 40 M ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.378 ? ? metalc48 metalc ? ? L CYS 44 SG ? ? ? 1_555 DA ZN . ZN ? ? M CYS 43 M ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.376 ? ? metalc49 metalc ? ? O HIS 13 NE2 ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? C HIS 12 C ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.190 ? ? metalc50 metalc ? ? O HIS 17 ND1 ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? C HIS 16 C ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? ? metalc51 metalc ? ? O CYS 41 SG ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? C CYS 40 C ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.386 ? ? metalc52 metalc ? ? O CYS 44 SG ? ? ? 1_555 EA ZN . ZN ? ? C CYS 43 C ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.395 ? ? metalc53 metalc ? ? P HIS 13 NE2 ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? B HIS 12 B ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.196 ? ? metalc54 metalc ? ? P HIS 17 ND1 ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? B HIS 16 B ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.204 ? ? metalc55 metalc ? ? P CYS 41 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? B CYS 40 B ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.387 ? ? metalc56 metalc ? ? P CYS 44 SG ? ? ? 1_555 FA ZN . ZN ? ? B CYS 43 B ZN 500 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.380 ? ? hydrog1 hydrog ? ? B DG 5 N1 ? ? ? 1_555 C DC 29 N3 ? ? Q DG 5 W DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? B DG 5 N2 ? ? ? 1_555 C DC 29 O2 ? ? Q DG 5 W DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? B DG 5 O6 ? ? ? 1_555 C DC 29 N4 ? ? Q DG 5 W DC 20 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? B DG 6 N1 ? ? ? 1_555 C DC 28 N3 ? ? Q DG 6 W DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? B DG 6 N2 ? ? ? 1_555 C DC 28 O2 ? ? Q DG 6 W DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? B DG 6 O6 ? ? ? 1_555 C DC 28 N4 ? ? Q DG 6 W DC 19 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? B DT 7 N3 ? ? ? 1_555 C DA 27 N1 ? ? Q DT 7 W DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? B DT 7 O4 ? ? ? 1_555 C DA 27 N6 ? ? Q DT 7 W DA 18 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? B DA 8 N1 ? ? ? 1_555 C DT 26 N3 ? ? Q DA 8 W DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? B DA 8 N6 ? ? ? 1_555 C DT 26 O4 ? ? Q DA 8 W DT 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? B DG 9 N1 ? ? ? 1_555 C DC 25 N3 ? ? Q DG 9 W DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? B DG 9 N2 ? ? ? 1_555 C DC 25 O2 ? ? Q DG 9 W DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? B DG 9 O6 ? ? ? 1_555 C DC 25 N4 ? ? Q DG 9 W DC 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? B DA 10 N1 ? ? ? 1_555 C DT 24 N3 ? ? Q DA 10 W DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? B DA 10 N6 ? ? ? 1_555 C DT 24 O4 ? ? Q DA 10 W DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? B DG 11 N1 ? ? ? 1_555 C DC 23 N3 ? ? Q DG 11 W DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? B DG 11 N2 ? ? ? 1_555 C DC 23 O2 ? ? Q DG 11 W DC 14 1_555 ? ? ? ? ? ? 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ALA B 248 ASP B 253 AC2 3 ASP P 257 ? PRO P 262 ? 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O VAL B 260 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software A ZN 301 ? 4 'binding site for residue ZN A 301' AC2 Software A CL 302 ? 2 'binding site for residue CL A 302' AC3 Software A DLU 303 ? 14 'binding site for residue DLU A 303' AC4 Software A MG 304 ? 6 'binding site for residue MG A 304' AC5 Software A MG 305 ? 5 'binding site for residue MG A 305' AC6 Software E ZN 500 ? 4 'binding site for residue ZN E 500' AC7 Software K ZN 500 ? 4 'binding site for residue ZN K 500' AC8 Software J ZN 500 ? 4 'binding site for residue ZN J 500' AC9 Software I ZN 301 ? 4 'binding site for residue ZN I 301' AD1 Software I CL 302 ? 2 'binding site for residue CL I 302' AD2 Software I DLU 303 ? 14 'binding site for residue DLU I 303' AD3 Software I MG 304 ? 6 'binding site for residue MG I 304' AD4 Software I MG 305 ? 5 'binding site for residue MG I 305' AD5 Software M ZN 500 ? 4 'binding site for residue ZN M 500' AD6 Software C ZN 500 ? 4 'binding site for residue ZN C 500' AD7 Software B ZN 500 ? 4 'binding site for residue ZN B 500' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 4 HIS A 13 ? 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EPU ? ? ? 1 5 MASKING ? ? ? ? ? ? 6 'CTF CORRECTION' 'per-particle estimation' Gctf 1.06 1 ? ? 7 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 8 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 9 'MODEL FITTING' ? 'UCSF Chimera' ? ? 1 ? 10 OTHER ? ? ? ? ? ? 11 'MODEL REFINEMENT' ? Coot ? ? 1 ? 12 'MODEL REFINEMENT' phenix.real_space.refine PHENIX 1.15.2-3472 ? 1 ? 13 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC ? 1 ? ? 14 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC ? 1 ? ? 15 CLASSIFICATION ? 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W 20 ? 19 1 1 B DG 6 1_555 C DC 28 1_555 -0.159 -0.070 0.158 -10.628 -4.916 -1.103 2 Q_DG6:DC19_W Q 6 ? W 19 ? 19 1 1 B DT 7 1_555 C DA 27 1_555 -0.113 0.043 -0.109 -5.143 -5.393 -5.552 3 Q_DT7:DA18_W Q 7 ? W 18 ? 20 1 1 B DA 8 1_555 C DT 26 1_555 0.322 -0.026 -0.102 2.877 -7.718 -4.802 4 Q_DA8:DT17_W Q 8 ? W 17 ? 20 1 1 B DG 9 1_555 C DC 25 1_555 -0.207 -0.077 -0.025 2.122 -4.688 0.899 5 Q_DG9:DC16_W Q 9 ? W 16 ? 19 1 1 B DA 10 1_555 C DT 24 1_555 -0.093 0.127 0.104 4.261 -10.182 0.047 6 Q_DA10:DT15_W Q 10 ? W 15 ? 20 1 1 B DG 11 1_555 C DC 23 1_555 -0.175 -0.081 -0.103 7.365 -8.768 1.593 7 Q_DG11:DC14_W Q 11 ? W 14 ? 19 1 1 B DA 12 1_555 C DT 22 1_555 0.054 -0.112 -0.011 5.285 -17.322 2.506 8 Q_DA12:DT13_W Q 12 ? W 13 ? 20 1 1 B DT 13 1_555 C DA 21 1_555 0.354 0.362 -0.290 5.835 -21.151 8.879 9 Q_DT13:DA12_W Q 13 ? W 12 ? 20 1 1 B DT 14 1_555 C DA 20 1_555 0.019 0.648 -0.370 3.116 -24.623 8.932 10 Q_DT14:DA11_W Q 14 ? 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