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'Escherichia coli BL21(DE3)' 469008 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 6 1 sample 1 25 'synthetic construct' ? 32630 ? 7 1 sample 1 38 'synthetic construct' ? 32630 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP DPOD1_HUMAN P28340 ? 1 ;MDGKRRPGPGPGVPPKRARGGLWDDDDAPRPSQFEEDLALMEEMEAEHRLQEQEEEELQSVLEGVADGQVPPSAIDPRWL RPTPPALDPQTEPLIFQQLEIDHYVGPAQPVPGGPPPSRGSVPVLRAFGVTDEGFSVCCHIHGFAPYFYTPAPPGFGPEH MGDLQRELNLAISRDSRGGRELTGPAVLAVELCSRESMFGYHGHGPSPFLRITVALPRLVAPARRLLEQGIRVAGLGTPS FAPYEANVDFEIRFMVDTDIVGCNWLELPAGKYALRLKEKATQCQLEADVLWSDVVSHPPEGPWQRIAPLRVLSFDIECA GRKGIFPEPERDPVIQICSLGLRWGEPEPFLRLALTLRPCAPILGAKVQSYEKEEDLLQAWSTFIRIMDPDVITGYNIQN FDLPYLISRAQTLKVQTFPFLGRVAGLCSNIRDSSFQSKQTGRRDTKVVSMVGRVQMDMLQVLLREYKLRSYTLNAVSFH FLGEQKEDVQHSIITDLQNGNDQTRRRLAVYCLKDAYLPLRLLERLMVLVNAVEMARVTGVPLSYLLSRGQQVKVVSQLL RQAMHEGLLMPVVKSEGGEDYTGATVIEPLKGYYDVPIATLDFSSLYPSIMMAHNLCYTTLLRPGTAQKLGLTEDQFIRT PTGDEFVKTSVRKGLLPQILENLLSARKRAKAELAKETDPLRRQVLDGRQLALKVSANSVYGFTGAQVGKLPCLEISQSV TGFGRQMIEKTKQLVESKYTVENGYSTSAKVVYGDTDSVMCRFGVSSVAEAMALGREAADWVSGHFPSPIRLEFEKVYFP YLLISKKRYAGLLFSSRPDAHDRMDCKGLEAVRRDNCPLVANLVTASLRRLLIDRDPEGAVAHAQDVISDLLCNRIDISQ LVITKELTRAASDYAGKQAHVELAERMRKRDPGSAPSLGDRVPYVIISAAKGVAAYMKSEDPLFVLEHSLPIDTQYYLEQ QLAKPLLRIFEPILGEGRAEAVLLRGDHTRCKTVLTGKVGGLLAFAKRRNCCIGCRTVLSHQGAVCEFCQPRESELYQKE VSHLNALEERFSRLWTQCQRCQGSLHEDVICTSRDCPIFYMRKKVRKDLEDQEQLLRRFGPPGPEAW ; 1 2 UNP DPOD2_HUMAN P49005 ? 2 ;MFSEQAAQRAHTLLSPPSANNATFARVPVATYTNSSQPFRLGERSFSRQYAHIYATRLIQMRPFLENRAQQHWGSGVGVK KLCELQPEEKCCVVGTLFKAMPLQPSILREVSEEHNLLPQPPRSKYIHPDDELVLEDELQRIKLKGTIDVSKLVTGTVLA VFGSVRDDGKFLVEDYCFADLAPQKPAPPLDTDRFVLLVSGLGLGGGGGESLLGTQLLVDVVTGQLGDEGEQCSAAHVSR VILAGNLLSHSTQSRDSINKAKYLTKKTQAASVEAVKMLDEILLQLSASVPVDVMPGEFDPTNYTLPQQPLHPCMFPLAT AYSTLQLVTNPYQATIDGVRFLGTSGQNVSDIFRYSSMEDHLEILEWTLRVRHISPTAPDTLGCYPFYKTDPFIFPECPH VYFCGNTPSFGSKIIRGPEDQTVLLVTVPDFSATQTACLVNLRSLACQPISFSGFGAEDDDLGGLGLGP ; 1 3 UNP DPOD3_HUMAN Q15054 ? 3 ;ADQLYLENIDEFVTDQNKIVTYKWLSYTLGVHVNQAKQMLYDYVERKRKENSGAQLHVTYLVSGSLIQNGHSCHKVAVVR EDKLEAVKSKLAVTASIHVYSIQKAMLKDSGPLFNTDYDILKSNLQNCSKFSAIQCAAAVPRAPAESSSSSKKFEQSHLH MSSETQANNELTTNGHGPPASKQVSQQPKGIMGMFASKAAAKTQETNKETKTEAKEVTNASAAGNKAPGKGNMMSNFFGK AAMNKFKVNLDSEQAVKEEKIVEQPTVSVTEPKLATPAGLKKSSKKAEPVKVLQKEKKRGKRVALSDDETKETENMRKKR RRIKLPESDSSEDEVFPDSPGAYEAESPSPPPPPSPPLEPVPKTEPEPPSVKSSSGENKRKRKRVLKSKTYLDGEGCIVT EKVYESESCTDSEEELNMKTSSVHRPPAMTVKKEPREERKGPKKGTAALGKANRQVSITGFFQRK ; 2 4 UNP DPOD4_HUMAN Q9HCU8 ? 4 ;GRKRLITDSYPVVKRREGPAGHSKGELAPELGEEPQPRDEEEAELELLRQFDLAWQYGPCTGITRLQRWCRAKQMGLEPP PEVWQVLKTHPGDPRFQCSLWHLYPL ; 2 5 UNP PCNA_HUMAN P12004 ? 5 ;MFEARLVQGSILKKVLEALKDLINEACWDISSSGVNLQSMDSSHVSLVQLTLRSEGFDTYRCDRNLAMGVNLTSMSKILK CAGNEDIITLRAEDNADTLALVFEAPNQEKVSDYEMKLMDLDVEQLGIPEQEYSCVVKMPSGEFARICRDLSHIGDAVVI SCAKDGVKFSASGELGNGNIKLSQTSNVDKEEEAVTIEMNEPVQLTFALRYLNFFTKATPLSSTVTLSMSADVPLVVEYK IADMGHLKYYLAPKIEDEEGS ; 1 6 PDB 6S1O 6S1O ? 6 ? 1 7 PDB 6S1O 6S1O ? 7 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6S1O A 1 ? 1107 ? 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UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -18 21 4 6S1O HIS D 13 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -17 22 4 6S1O PRO D 14 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -16 23 4 6S1O GLN D 15 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -15 24 4 6S1O PHE D 16 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -14 25 4 6S1O GLY D 17 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -13 26 4 6S1O GLY D 18 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -12 27 4 6S1O HIS D 19 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -11 28 4 6S1O HIS D 20 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -10 29 4 6S1O HIS D 21 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -9 30 4 6S1O HIS D 22 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -8 31 4 6S1O HIS D 23 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -7 32 4 6S1O HIS D 24 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -6 33 4 6S1O GLU D 25 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -5 34 4 6S1O ASN D 26 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -4 35 4 6S1O LEU D 27 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -3 36 4 6S1O TYR D 28 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -2 37 4 6S1O PHE D 29 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' -1 38 4 6S1O GLN D 30 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' 0 39 4 6S1O SER D 31 ? UNP Q9HCU8 ? ? 'expression tag' 1 40 5 6S1O GLY E 1 ? UNP P12004 ? ? 'expression tag' -2 41 5 6S1O PRO E 2 ? UNP P12004 ? ? 'expression tag' -1 42 5 6S1O HIS E 3 ? UNP P12004 ? ? 'expression tag' 0 43 6 6S1O GLY F 1 ? UNP P12004 ? ? 'expression tag' -2 44 6 6S1O PRO F 2 ? UNP P12004 ? ? 'expression tag' -1 45 6 6S1O HIS F 3 ? UNP P12004 ? ? 'expression tag' 0 46 7 6S1O GLY G 1 ? UNP P12004 ? ? 'expression tag' -2 47 7 6S1O PRO G 2 ? UNP P12004 ? ? 'expression tag' -1 48 7 6S1O HIS G 3 ? UNP P12004 ? ? 'expression tag' 0 49 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 DOC 'DNA linking' n "2',3'-DIDEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O6 P' 291.198 DT 'DNA linking' y "THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H15 N2 O8 P' 322.208 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 SF4 non-polymer . 'IRON/SULFUR CLUSTER' ? 'Fe4 S4' 351.640 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TTP non-polymer . "THYMIDINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 'C10 H17 N2 O14 P3' 482.168 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 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B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 5 ? G N N 5 ? H N N 6 ? I N N 7 ? J N N 8 ? K N N 9 ? L N N 10 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 HIS A 160 ? ASN A 169 ? HIS A 160 ASN A 169 1 ? 10 HELX_P HELX_P2 AA2 SER A 173 ? ARG A 177 ? SER A 173 ARG A 177 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 LEU A 216 ? ARG A 218 ? LEU A 216 ARG A 218 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 AA4 LEU A 219 ? GLU A 228 ? LEU A 219 GLU A 228 1 ? 10 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 249 ? ASP A 259 ? ASP A 249 ASP A 259 1 ? 11 HELX_P HELX_P6 AA6 GLU A 301 ? ARG A 306 ? GLU A 301 ARG A 306 5 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 LYS A 373 ? ASP A 389 ? LYS A 373 ASP A 389 1 ? 17 HELX_P HELX_P8 AA8 PHE A 401 ? LEU A 413 ? PHE A 401 LEU A 413 1 ? 13 HELX_P HELX_P9 AA9 MET A 459 ? TYR A 467 ? MET A 459 TYR A 467 1 ? 9 HELX_P HELX_P10 AB1 THR A 473 ? LEU A 482 ? THR A 473 LEU A 482 1 ? 10 HELX_P HELX_P11 AB2 ILE A 493 ? ASN A 499 ? ILE A 493 ASN A 499 1 ? 7 HELX_P HELX_P12 AB3 ASN A 501 ? LEU A 526 ? ASN A 501 LEU A 526 1 ? 26 HELX_P HELX_P13 AB4 MET A 527 ? GLY A 540 ? MET A 527 GLY A 540 1 ? 14 HELX_P HELX_P14 AB5 SER A 544 ? SER A 548 ? SER A 544 SER A 548 5 ? 5 HELX_P HELX_P15 AB6 GLN A 551 ? MET A 564 ? GLN A 551 MET A 564 1 ? 14 HELX_P HELX_P16 AB7 SER A 605 ? HIS A 614 ? SER A 605 HIS A 614 1 ? 10 HELX_P HELX_P17 AB8 CYS A 617 ? THR A 619 ? CYS A 617 THR A 619 5 ? 3 HELX_P HELX_P18 AB9 LEU A 655 ? ALA A 675 ? 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LEU A 1096 ? PRO A 1077 LEU A 1096 1 ? 20 HELX_P HELX_P33 AD6 GLU B 4 ? GLN B 8 ? GLU B 4 GLN B 8 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 SER B 36 ? ARG B 40 ? SER B 36 ARG B 40 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 TYR B 50 ? GLY B 74 ? TYR B 50 GLY B 74 1 ? 25 HELX_P HELX_P36 AD9 GLY B 209 ? THR B 223 ? GLY B 209 THR B 223 1 ? 15 HELX_P HELX_P37 AE1 ASP B 228 ? ALA B 236 ? ASP B 228 ALA B 236 1 ? 9 HELX_P HELX_P38 AE2 SER B 272 ? ALA B 288 ? SER B 272 ALA B 288 1 ? 17 HELX_P HELX_P39 AE3 HIS B 312 ? PHE B 316 ? HIS B 312 PHE B 316 5 ? 5 HELX_P HELX_P40 AE4 LEU B 318 ? TYR B 322 ? LEU B 318 TYR B 322 5 ? 5 HELX_P HELX_P41 AE5 GLN B 347 ? TYR B 355 ? GLN B 347 TYR B 355 1 ? 9 HELX_P HELX_P42 AE6 ASP B 360 ? VAL B 371 ? ASP B 360 VAL B 371 1 ? 12 HELX_P HELX_P43 AE7 ASP C 11 ? THR C 23 ? ASP C 3 THR C 15 1 ? 13 HELX_P HELX_P44 AE8 LYS C 32 ? LEU C 38 ? LYS C 24 LEU C 30 1 ? 7 HELX_P HELX_P45 AE9 HIS C 41 ? ASN C 60 ? HIS C 33 ASN C 52 1 ? 20 HELX_P HELX_P46 AF1 LYS C 92 ? LEU C 100 ? 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WATSON-CRICK ? ? hydrog20 hydrog ? ? H DC 10 O2 ? ? ? 1_555 I DG 29 N2 ? ? P DC 10 T DG 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog21 hydrog ? ? H DA 11 N1 ? ? ? 1_555 I DT 28 N3 ? ? P DA 11 T DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog22 hydrog ? ? H DA 11 N6 ? ? ? 1_555 I DT 28 O4 ? ? P DA 11 T DT 15 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog23 hydrog ? ? H DT 12 N3 ? ? ? 1_555 I DA 27 N1 ? ? P DT 12 T DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog24 hydrog ? ? H DT 12 O4 ? ? ? 1_555 I DA 27 N6 ? ? P DT 12 T DA 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog25 hydrog ? ? H DG 13 N1 ? ? ? 1_555 I DC 26 N3 ? ? P DG 13 T DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog26 hydrog ? ? H DG 13 N2 ? ? ? 1_555 I DC 26 O2 ? ? P DG 13 T DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog27 hydrog ? ? H DG 13 O6 ? ? ? 1_555 I DC 26 N4 ? ? P DG 13 T DC 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog28 hydrog ? ? H DA 14 N1 ? ? ? 1_555 I DT 25 N3 ? ? P DA 14 T DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog29 hydrog ? ? H DA 14 N6 ? ? ? 1_555 I DT 25 O4 ? ? P DA 14 T DT 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog30 hydrog ? ? H DT 15 N3 ? ? ? 1_555 I DA 24 N1 ? ? P DT 15 T DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog31 hydrog ? ? H DT 15 O4 ? ? ? 1_555 I DA 24 N6 ? ? P DT 15 T DA 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog32 hydrog ? ? H DT 16 N3 ? ? ? 1_555 I DA 23 N1 ? ? P DT 16 T DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog33 hydrog ? ? H DT 16 O4 ? ? ? 1_555 I DA 23 N6 ? ? P DT 16 T DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog34 hydrog ? ? H DA 17 N1 ? ? ? 1_555 I DT 22 N3 ? ? P DA 17 T DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog35 hydrog ? ? H DA 17 N6 ? ? ? 1_555 I DT 22 O4 ? ? P DA 17 T DT 9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog36 hydrog ? ? H DC 18 N3 ? ? ? 1_555 I DG 21 N1 ? ? P DC 18 T DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? hydrog37 hydrog ? ? H DC 18 N4 ? ? ? 1_555 I DG 21 O6 ? ? P DC 18 T DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? 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WATSON-CRICK ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? covale ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 240 A . ? SER 240 A PHE 241 A ? PHE 241 A 1 6.19 2 GLU 576 A . ? GLU 576 A GLY 577 A ? GLY 577 A 1 -3.32 3 GLN 628 A . ? GLN 628 A LYS 629 A ? LYS 629 A 1 3.93 4 SER 788 A . ? 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