data_6SYK # _entry.id 6SYK # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.331 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6SYK WWPDB D_1292104516 BMRB 34438 # _pdbx_database_related.db_name BMRB _pdbx_database_related.details ;Guanine-rich oligonucleotide with 5'- and 3'-GC ends form G-quadruplex with A(GGGG)A hexad, GCGC- and G-quartets and two symmetric GG and AA base pair ; _pdbx_database_related.db_id 34438 _pdbx_database_related.content_type unspecified # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr REL _pdbx_database_status.entry_id 6SYK _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-09-30 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site PDBE _pdbx_database_status.process_site PDBE _pdbx_database_status.status_code_cs REL _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Pavc, D.' 1 ? 'Wang, B.' 2 ? 'Spindler, L.' 3 ? 'Drevensek-Olenik, I.' 4 ? 'Plavec, J.' 5 ? 'Sket, P.' 6 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nucleic Acids Res.' _citation.journal_id_ASTM NARHAD _citation.journal_id_CSD 0389 _citation.journal_id_ISSN 1362-4962 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 48 _citation.language ? _citation.page_first 2749 _citation.page_last 2761 _citation.title 'GC ends control topology of DNA G-quadruplexes and their cation-dependent assembly.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1093/nar/gkaa058 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31996902 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Pavc, D.' 1 ? primary 'Wang, B.' 2 ? primary 'Spindler, L.' 3 ? primary 'Drevensek-Olenik, I.' 4 ? primary 'Plavec, J.' 5 ? primary 'Sket, P.' 6 ? # _entity.id 1 _entity.type polymer _entity.src_method syn _entity.pdbx_description GCnCG _entity.formula_weight 4451.877 _entity.pdbx_number_of_molecules 2 _entity.pdbx_ec ? _entity.pdbx_mutation ? _entity.pdbx_fragment ? _entity.details ? # _entity_poly.entity_id 1 _entity_poly.type polydeoxyribonucleotide _entity_poly.nstd_linkage no _entity_poly.nstd_monomer no _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code '(DG)(DC)(DG)(DG)(DA)(DG)(DG)(DG)(DG)(DA)(DG)(DG)(DC)(DG)' _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can GCGGAGGGGAGGCG _entity_poly.pdbx_strand_id A,B _entity_poly.pdbx_target_identifier ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 DG n 1 2 DC n 1 3 DG n 1 4 DG n 1 5 DA n 1 6 DG n 1 7 DG n 1 8 DG n 1 9 DG n 1 10 DA n 1 11 DG n 1 12 DG n 1 13 DC n 1 14 DG n # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 14 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'synthetic construct' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 32630 _pdbx_entity_src_syn.details ? # _struct_ref.id 1 _struct_ref.db_name PDB _struct_ref.db_code 6SYK _struct_ref.pdbx_db_accession 6SYK _struct_ref.pdbx_db_isoform ? _struct_ref.entity_id 1 _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code ? _struct_ref.pdbx_align_begin 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6SYK A 1 ? 14 ? 6SYK 1 ? 14 ? 1 14 2 1 6SYK B 1 ? 14 ? 6SYK 1 ? 14 ? 1 14 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight DA 'DNA linking' y "2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O6 P' 331.222 DC 'DNA linking' y "2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H14 N3 O7 P' 307.197 DG 'DNA linking' y "2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C10 H14 N5 O7 P' 347.221 # loop_ _pdbx_nmr_exptl.experiment_id _pdbx_nmr_exptl.conditions_id _pdbx_nmr_exptl.solution_id _pdbx_nmr_exptl.type _pdbx_nmr_exptl.spectrometer_id _pdbx_nmr_exptl.sample_state 1 2 2 '2D NOESY' 1 isotropic 2 2 2 '2D NOESY' 2 isotropic 3 3 3 '2D NOESY' 1 isotropic 4 3 3 '2D NOESY' 2 isotropic 5 3 3 '2D TOCSY' 2 isotropic 6 2 2 '2D DQF-COSY' 2 isotropic 7 3 3 '2D 1H-31P COSY' 2 isotropic 8 1 1 '2D 1H-13C HSQC aromatic' 2 isotropic # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.conditions_id _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_units _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.details _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_err _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.ionic_strength_units _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.label _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_err _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pH_units _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.pressure_err _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_err _pdbx_nmr_exptl_sample_conditions.temperature_units 1 298 atm 1 6.8 175 ? ? mM 13C15N_sample_conditions ? pH ? ? K 2 298 atm 1 6.8 175 ? ? mM unlabelled_sample_conditions ? pH ? ? K 3 298 atm 1 6.8 175 ? ? mM unlabelled_sample_D2O_conditions ? pH ? ? K # loop_ _pdbx_nmr_sample_details.solution_id _pdbx_nmr_sample_details.contents _pdbx_nmr_sample_details.solvent_system _pdbx_nmr_sample_details.label _pdbx_nmr_sample_details.type _pdbx_nmr_sample_details.details 1 '1 mM 8% 13C, 8% 15N GCnCG, 175 mM sodium chloride, 10 mM sodium phosphate buffer, 90% H2O/10% D2O' '90% H2O/10% D2O' 13C15N_sample solution 'Site-specific 13C,15N labelled samples used for unambiguous assignment' 2 '1 mM GCnCG, 175 mM sodium chloride, 10 mM sodium phosphate buffer, 90% H2O/10% D2O' '90% H2O/10% D2O' unlabelled_sample solution ? 3 '1 mM GCnCG, 175 mM sodium chloride, 10 mM sodium phosphate buffer, 100% D2O' '100% D2O' unlabelled_sample_D2O solution ? # loop_ _pdbx_nmr_spectrometer.spectrometer_id _pdbx_nmr_spectrometer.model _pdbx_nmr_spectrometer.type _pdbx_nmr_spectrometer.manufacturer _pdbx_nmr_spectrometer.field_strength _pdbx_nmr_spectrometer.details 1 'Agilent Technologies VNMRS 800 MHz NMR spectrometer' ? Agilent 800 ? 2 'Agilent Technologies DD2 600 MHz NMR spectrometer' ? Agilent 600 ? # _pdbx_nmr_refine.entry_id 6SYK _pdbx_nmr_refine.method 'simulated annealing' _pdbx_nmr_refine.details ? _pdbx_nmr_refine.software_ordinal 6 # _pdbx_nmr_ensemble.entry_id 6SYK _pdbx_nmr_ensemble.conformers_calculated_total_number 200 _pdbx_nmr_ensemble.conformers_submitted_total_number 10 _pdbx_nmr_ensemble.conformer_selection_criteria 'structures with the least restraint violations' _pdbx_nmr_ensemble.representative_conformer ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraints_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.average_constraint_violations_per_residue ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_upper_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_lower_distance_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.distance_constraint_violation_method ? _pdbx_nmr_ensemble.maximum_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.average_torsion_angle_constraint_violation ? _pdbx_nmr_ensemble.torsion_angle_constraint_violation_method ? # _pdbx_nmr_representative.entry_id 6SYK _pdbx_nmr_representative.conformer_id 1 _pdbx_nmr_representative.selection_criteria 'lowest energy' # loop_ _pdbx_nmr_software.ordinal _pdbx_nmr_software.classification _pdbx_nmr_software.name _pdbx_nmr_software.version _pdbx_nmr_software.authors 1 collection VNMR ? Varian 2 processing VNMR ? Varian 3 'chemical shift assignment' VNMR ? Varian 4 'peak picking' Sparky ? Goddard 5 'structure calculation' Amber 14 'Case, Darden, Cheatham III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' 6 refinement Amber 14 'Case, Darden, Cheatham III, Simmerling, Wang, Duke, Luo, ... and Kollman' # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6SYK _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'SOLUTION NMR' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6SYK _struct.title ;Guanine-rich oligonucleotide with 5'- and 3'-GC ends form G-quadruplex with A(GGGG)A hexad, GCGC- and G-quartets and two symmetric GG and AA base pair ; _struct.pdbx_descriptor GCnCG _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6SYK _struct_keywords.text ;DNA, G-quadruplex, A(GGGG)A hexad, GCGC-quartet, 5'- and 3'-GC ends ; _struct_keywords.pdbx_keywords DNA # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role hydrog1 hydrog ? ? A DG 1 N1 ? ? ? 1_555 A DG 7 O6 ? ? A DG 1 A DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? A DG 1 N2 ? ? ? 1_555 A DG 7 N7 ? ? A DG 1 A DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? A DG 1 N7 ? ? ? 1_555 B DG 7 N2 ? ? A DG 1 B DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? A DG 1 O6 ? ? ? 1_555 B DG 7 N1 ? ? A DG 1 B DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? A DC 2 N4 ? ? ? 1_555 A DG 6 N7 ? ? A DC 2 A DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? A DC 2 N3 ? ? ? 1_555 B DG 6 N1 ? ? A DC 2 B DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? A DC 2 N4 ? ? ? 1_555 B DG 6 O6 ? ? A DC 2 B DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? A DC 2 O2 ? ? ? 1_555 B DG 6 N2 ? ? A DC 2 B DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? A DG 3 O6 ? ? ? 1_555 A DA 5 N6 ? ? A DG 3 A DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DA MISPAIR' ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? A DG 4 N2 ? ? ? 1_555 B DG 3 O6 ? ? A DG 4 B DG 3 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DG MISPAIR' ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? A DG 4 N1 ? ? ? 1_555 B DG 4 O6 ? ? A DG 4 B DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_3_PAIR ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? A DG 4 O6 ? ? ? 1_555 B DG 4 N1 ? ? A DG 4 B DG 4 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_3_PAIR ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? A DA 5 N1 ? ? ? 1_555 B DA 5 N6 ? ? A DA 5 B DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_1_PAIR ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? A DA 5 N6 ? ? ? 1_555 B DA 5 N1 ? ? A DA 5 B DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_1_PAIR ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? A DG 6 N1 ? ? ? 1_555 B DC 2 N3 ? ? A DG 6 B DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? A DG 6 N2 ? ? ? 1_555 B DC 2 O2 ? ? A DG 6 B DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? A DG 6 O6 ? ? ? 1_555 B DC 2 N4 ? ? A DG 6 B DC 2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? A DG 7 N1 ? ? ? 1_555 B DG 1 O6 ? ? A DG 7 B DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? A DG 7 N2 ? ? ? 1_555 B DG 1 N7 ? ? A DG 7 B DG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? A DG 8 N2 ? ? ? 1_555 A DA 10 N7 ? ? A DG 8 A DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? A DG 8 N3 ? ? ? 1_555 A DA 10 N6 ? ? A DG 8 A DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? A DG 8 N1 ? ? ? 1_555 A DG 11 O6 ? ? A DG 8 A DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? A DG 8 N2 ? ? ? 1_555 A DG 11 N7 ? ? A DG 8 A DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? A DG 8 N7 ? ? ? 1_555 B DG 11 N2 ? ? A DG 8 B DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? A DG 8 O6 ? ? ? 1_555 B DG 11 N1 ? ? A DG 8 B DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? A DG 9 N1 ? ? ? 1_555 A DG 12 O6 ? ? A DG 9 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? A DG 9 N2 ? ? ? 1_555 A DG 12 N7 ? ? A DG 9 A DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? A DG 9 N7 ? ? ? 1_555 B DG 12 N2 ? ? A DG 9 B DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? A DG 9 O6 ? ? ? 1_555 B DG 12 N1 ? ? A DG 9 B DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? A DG 11 N1 ? ? ? 1_555 B DG 7 O6 ? ? A DG 11 B DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? A DG 11 N2 ? ? ? 1_555 B DG 7 N7 ? ? A DG 11 B DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? A DG 11 N1 ? ? ? 1_555 B DG 8 O6 ? ? A DG 11 B DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? A DG 11 N2 ? ? ? 1_555 B DG 8 N7 ? ? A DG 11 B DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? A DG 12 N1 ? ? ? 1_555 B DG 8 O6 ? ? A DG 12 B DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? A DG 12 N2 ? ? ? 1_555 B DG 8 N7 ? ? A DG 12 B DG 8 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? A DG 12 N1 ? ? ? 1_555 B DG 9 O6 ? ? A DG 12 B DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? A DG 12 N2 ? ? ? 1_555 B DG 9 N7 ? ? A DG 12 B DG 9 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? A DC 13 N3 ? ? ? 1_555 B DG 14 N1 ? ? A DC 13 B DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? A DC 13 N4 ? ? ? 1_555 B DG 14 O6 ? ? A DC 13 B DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? A DC 13 O2 ? ? ? 1_555 B DG 14 N2 ? ? A DC 13 B DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? B DG 1 N1 ? ? ? 1_555 B DG 7 O6 ? ? B DG 1 B DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? B DG 1 N2 ? ? ? 1_555 B DG 7 N7 ? ? B DG 1 B DG 7 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? B DC 2 N4 ? ? ? 1_555 B DG 6 N7 ? ? B DC 2 B DG 6 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? B DG 3 N7 ? ? ? 1_555 B DA 5 N6 ? ? B DG 3 B DA 5 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DA MISPAIR' ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? B DG 8 N2 ? ? ? 1_555 B DA 10 N7 ? ? B DG 8 B DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? B DG 8 N3 ? ? ? 1_555 B DA 10 N6 ? ? B DG 8 B DA 10 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_11_PAIR ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? B DG 8 N1 ? ? ? 1_555 B DG 11 O6 ? ? B DG 8 B DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? B DG 8 N2 ? ? ? 1_555 B DG 11 N7 ? ? B DG 8 B DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? B DG 9 N1 ? ? ? 1_555 B DG 12 O6 ? ? B DG 9 B DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? B DG 9 N2 ? ? ? 1_555 B DG 12 N7 ? ? B DG 9 B DG 12 1_555 ? ? ? ? ? ? TYPE_6_PAIR ? ? ? # _struct_conn_type.id hydrog _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _atom_sites.entry_id 6SYK _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[1][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[2][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][1] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][2] ? _atom_sites.Cartn_transf_matrix[3][3] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[1] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[2] ? _atom_sites.Cartn_transf_vector[3] ? _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[1][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[2][3] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][1] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][2] 0.000000 _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] 1.000000 _atom_sites.fract_transf_vector[1] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[2] 0.00000 _atom_sites.fract_transf_vector[3] 0.00000 _atom_sites.solution_primary ? _atom_sites.solution_secondary ? _atom_sites.solution_hydrogens ? _atom_sites.special_details ? # loop_ _atom_type.symbol C H N O P # loop_ _pdbx_poly_seq_scheme.asym_id _pdbx_poly_seq_scheme.entity_id _pdbx_poly_seq_scheme.seq_id _pdbx_poly_seq_scheme.mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.ndb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.auth_seq_num _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.auth_mon_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_strand_id _pdbx_poly_seq_scheme.pdb_ins_code _pdbx_poly_seq_scheme.hetero A 1 1 DG 1 1 1 DG DG A . n A 1 2 DC 2 2 2 DC DC A . n A 1 3 DG 3 3 3 DG DG A . n A 1 4 DG 4 4 4 DG DG A . n A 1 5 DA 5 5 5 DA DA A . n A 1 6 DG 6 6 6 DG DG A . n A 1 7 DG 7 7 7 DG DG A . n A 1 8 DG 8 8 8 DG DG A . n A 1 9 DG 9 9 9 DG DG A . n A 1 10 DA 10 10 10 DA DA A . n A 1 11 DG 11 11 11 DG DG A . n A 1 12 DG 12 12 12 DG DG A . n A 1 13 DC 13 13 13 DC DC A . n A 1 14 DG 14 14 14 DG DG A . n B 1 1 DG 1 1 1 DG DG B . n B 1 2 DC 2 2 2 DC DC B . n B 1 3 DG 3 3 3 DG DG B . n B 1 4 DG 4 4 4 DG DG B . n B 1 5 DA 5 5 5 DA DA B . n B 1 6 DG 6 6 6 DG DG B . n B 1 7 DG 7 7 7 DG DG B . n B 1 8 DG 8 8 8 DG DG B . n B 1 9 DG 9 9 9 DG DG B . n B 1 10 DA 10 10 10 DA DA B . n B 1 11 DG 11 11 11 DG DG B . n B 1 12 DG 12 12 12 DG DG B . n B 1 13 DC 13 13 13 DC DC B . n B 1 14 DG 14 14 14 DG DG B . n # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_and_software_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details PISA _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details dimeric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 2 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 1540 ? 1 MORE 2 ? 1 'SSA (A^2)' 4420 ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # _pdbx_audit_revision_history.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_history.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_history.major_revision 1 _pdbx_audit_revision_history.minor_revision 0 _pdbx_audit_revision_history.revision_date 2020-07-29 # _pdbx_audit_revision_details.ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.revision_ordinal 1 _pdbx_audit_revision_details.data_content_type 'Structure model' _pdbx_audit_revision_details.provider repository _pdbx_audit_revision_details.type 'Initial release' _pdbx_audit_revision_details.description ? _pdbx_audit_revision_details.details ? # loop_ _pdbx_nmr_exptl_sample.solution_id _pdbx_nmr_exptl_sample.component _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_range _pdbx_nmr_exptl_sample.concentration_units _pdbx_nmr_exptl_sample.isotopic_labeling 1 GCnCG 1 ? mM '8% 13C, 8% 15N' 1 'sodium chloride' 175 ? mM 'natural abundance' 1 'sodium phosphate buffer' 10 ? mM 'natural abundance' 2 GCnCG 1 ? mM 'natural abundance' 2 'sodium chloride' 175 ? mM 'natural abundance' 2 'sodium phosphate buffer' 10 ? mM 'natural abundance' 3 GCnCG 1 ? mM 'natural abundance' 3 'sodium chloride' 175 ? mM 'natural abundance' 3 'sodium phosphate buffer' 10 ? mM 'natural abundance' # loop_ _pdbx_validate_rmsd_bond.id _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_target_value _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.bond_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_bond.linker_flag 1 1 "C5'" B DG 7 ? ? "C4'" B DG 7 ? ? 1.557 1.512 0.045 0.007 N 2 7 "C5'" B DG 7 ? ? "C4'" B DG 7 ? ? 1.558 1.512 0.046 0.007 N # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "C1'" A DG 1 ? ? "O4'" A DG 1 ? ? "C4'" A DG 1 ? ? 102.50 110.10 -7.60 1.00 N 2 1 "O4'" A DG 1 ? ? "C1'" A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 116.05 108.30 7.75 0.30 N 3 1 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 112.63 108.30 4.33 0.30 N 4 1 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.73 121.90 -5.17 0.70 N 5 1 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.67 108.30 3.37 0.30 N 6 1 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 111.52 108.30 3.22 0.30 N 7 1 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.43 117.00 -3.57 0.50 N 8 1 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.86 117.70 4.16 0.50 N 9 1 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.32 118.60 -5.28 0.60 N 10 1 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 115.85 108.30 7.55 0.30 N 11 1 N1 A DG 6 ? ? C6 A DG 6 ? ? O6 A DG 6 ? ? 116.21 119.90 -3.69 0.60 N 12 1 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.84 108.30 4.54 0.30 N 13 1 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 113.71 108.30 5.41 0.30 N 14 1 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 15 1 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.09 117.70 3.39 0.50 N 16 1 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.57 118.60 -5.03 0.60 N 17 1 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.30 108.30 3.00 0.30 N 18 1 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 19 1 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 116.79 121.90 -5.11 0.70 N 20 1 "C1'" B DG 1 ? ? "O4'" B DG 1 ? ? "C4'" B DG 1 ? ? 103.52 110.10 -6.58 1.00 N 21 1 "O4'" B DG 1 ? ? "C1'" B DG 1 ? ? N9 B DG 1 ? ? 114.75 108.30 6.45 0.30 N 22 1 "O4'" B DC 2 ? ? "C1'" B DC 2 ? ? N1 B DC 2 ? ? 111.18 108.30 2.88 0.30 N 23 1 N3 B DC 2 ? ? C2 B DC 2 ? ? O2 B DC 2 ? ? 116.85 121.90 -5.05 0.70 N 24 1 "O4'" B DG 4 ? ? "C1'" B DG 4 ? ? N9 B DG 4 ? ? 110.57 108.30 2.27 0.30 N 25 1 C4 B DA 5 ? ? C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? 113.20 117.00 -3.80 0.50 N 26 1 C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N1 B DA 5 ? ? 121.16 117.70 3.46 0.50 N 27 1 N1 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N6 B DA 5 ? ? 112.08 118.60 -6.52 0.60 N 28 1 "O4'" B DG 6 ? ? "C1'" B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 114.12 108.30 5.82 0.30 N 29 1 N1 B DG 6 ? ? C6 B DG 6 ? ? O6 B DG 6 ? ? 116.27 119.90 -3.63 0.60 N 30 1 "O4'" B DG 8 ? ? "C1'" B DG 8 ? ? N9 B DG 8 ? ? 111.45 108.30 3.15 0.30 N 31 1 "O4'" B DG 9 ? ? "C1'" B DG 9 ? ? N9 B DG 9 ? ? 111.33 108.30 3.03 0.30 N 32 1 C4 B DA 10 ? ? C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? 113.96 117.00 -3.04 0.50 N 33 1 C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N1 B DA 10 ? ? 121.44 117.70 3.74 0.50 N 34 1 N1 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N6 B DA 10 ? ? 112.99 118.60 -5.61 0.60 N 35 1 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 110.59 108.30 2.29 0.30 N 36 1 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.16 121.90 -4.74 0.70 N 37 2 "O4'" A DG 1 ? ? "C1'" A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 114.15 108.30 5.85 0.30 N 38 2 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 110.42 108.30 2.12 0.30 N 39 2 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 117.02 121.90 -4.88 0.70 N 40 2 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 113.56 108.30 5.26 0.30 N 41 2 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 111.37 108.30 3.07 0.30 N 42 2 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.50 117.00 -3.50 0.50 N 43 2 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.54 117.70 3.84 0.50 N 44 2 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.12 118.60 -5.48 0.60 N 45 2 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 115.24 108.30 6.94 0.30 N 46 2 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.20 108.30 3.90 0.30 N 47 2 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.04 108.30 2.74 0.30 N 48 2 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 111.49 108.30 3.19 0.30 N 49 2 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 114.00 117.00 -3.00 0.50 N 50 2 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.39 117.70 3.69 0.50 N 51 2 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 112.90 118.60 -5.70 0.60 N 52 2 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 53 2 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 110.57 108.30 2.27 0.30 N 54 2 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 117.19 121.90 -4.71 0.70 N 55 2 "C1'" B DG 1 ? ? "O4'" B DG 1 ? ? "C4'" B DG 1 ? ? 102.82 110.10 -7.28 1.00 N 56 2 "O4'" B DG 1 ? ? "C1'" B DG 1 ? ? N9 B DG 1 ? ? 115.40 108.30 7.10 0.30 N 57 2 "O4'" B DC 2 ? ? "C1'" B DC 2 ? ? N1 B DC 2 ? ? 113.28 108.30 4.98 0.30 N 58 2 N3 B DC 2 ? ? C2 B DC 2 ? ? O2 B DC 2 ? ? 116.86 121.90 -5.04 0.70 N 59 2 C4 B DA 5 ? ? C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? 113.59 117.00 -3.41 0.50 N 60 2 C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N1 B DA 5 ? ? 121.12 117.70 3.42 0.50 N 61 2 N1 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N6 B DA 5 ? ? 113.04 118.60 -5.56 0.60 N 62 2 "O4'" B DG 6 ? ? "C1'" B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 114.92 108.30 6.62 0.30 N 63 2 "O4'" B DG 7 ? ? "C1'" B DG 7 ? ? N9 B DG 7 ? ? 112.62 108.30 4.32 0.30 N 64 2 "O4'" B DG 8 ? ? "C1'" B DG 8 ? ? N9 B DG 8 ? ? 113.40 108.30 5.10 0.30 N 65 2 "O4'" B DG 9 ? ? "C1'" B DG 9 ? ? N9 B DG 9 ? ? 110.66 108.30 2.36 0.30 N 66 2 C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N1 B DA 10 ? ? 121.06 117.70 3.36 0.50 N 67 2 N1 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N6 B DA 10 ? ? 113.64 118.60 -4.96 0.60 N 68 2 "O4'" B DG 12 ? ? "C1'" B DG 12 ? ? N9 B DG 12 ? ? 111.06 108.30 2.76 0.30 N 69 2 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 70 2 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.79 121.90 -5.11 0.70 N 71 3 "C1'" A DG 1 ? ? "O4'" A DG 1 ? ? "C4'" A DG 1 ? ? 103.69 110.10 -6.41 1.00 N 72 3 "O4'" A DG 1 ? ? "C1'" A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 114.31 108.30 6.01 0.30 N 73 3 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 110.43 108.30 2.13 0.30 N 74 3 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.86 121.90 -5.04 0.70 N 75 3 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 111.00 108.30 2.70 0.30 N 76 3 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.15 117.00 -3.85 0.50 N 77 3 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.36 117.70 3.66 0.50 N 78 3 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 112.47 118.60 -6.13 0.60 N 79 3 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 115.03 108.30 6.73 0.30 N 80 3 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.33 108.30 4.03 0.30 N 81 3 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.48 108.30 3.18 0.30 N 82 3 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 112.29 108.30 3.99 0.30 N 83 3 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.97 117.00 -3.03 0.50 N 84 3 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.41 117.70 3.71 0.50 N 85 3 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 112.70 118.60 -5.90 0.60 N 86 3 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.28 108.30 2.98 0.30 N 87 3 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 110.88 108.30 2.58 0.30 N 88 3 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 117.31 121.90 -4.59 0.70 N 89 3 "C1'" B DG 1 ? ? "O4'" B DG 1 ? ? "C4'" B DG 1 ? ? 103.49 110.10 -6.61 1.00 N 90 3 "O4'" B DG 1 ? ? "C1'" B DG 1 ? ? N9 B DG 1 ? ? 114.13 108.30 5.83 0.30 N 91 3 "O4'" B DC 2 ? ? "C1'" B DC 2 ? ? N1 B DC 2 ? ? 111.49 108.30 3.19 0.30 N 92 3 N3 B DC 2 ? ? C2 B DC 2 ? ? O2 B DC 2 ? ? 117.06 121.90 -4.84 0.70 N 93 3 "O4'" B DG 3 ? ? "C1'" B DG 3 ? ? N9 B DG 3 ? ? 111.96 108.30 3.66 0.30 N 94 3 "O4'" B DA 5 ? ? "C1'" B DA 5 ? ? N9 B DA 5 ? ? 111.38 108.30 3.08 0.30 N 95 3 C4 B DA 5 ? ? C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? 113.29 117.00 -3.71 0.50 N 96 3 C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N1 B DA 5 ? ? 121.42 117.70 3.72 0.50 N 97 3 N1 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N6 B DA 5 ? ? 113.70 118.60 -4.90 0.60 N 98 3 "O4'" B DG 6 ? ? "C1'" B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 116.50 108.30 8.20 0.30 N 99 3 "O4'" B DG 7 ? ? "C1'" B DG 7 ? ? N9 B DG 7 ? ? 112.74 108.30 4.44 0.30 N 100 3 "O4'" B DG 8 ? ? "C1'" B DG 8 ? ? N9 B DG 8 ? ? 113.74 108.30 5.44 0.30 N 101 3 "O4'" B DG 9 ? ? "C1'" B DG 9 ? ? N9 B DG 9 ? ? 111.08 108.30 2.78 0.30 N 102 3 C4 B DA 10 ? ? C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? 113.98 117.00 -3.02 0.50 N 103 3 C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N1 B DA 10 ? ? 121.17 117.70 3.47 0.50 N 104 3 N1 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N6 B DA 10 ? ? 113.55 118.60 -5.05 0.60 N 105 3 "O4'" B DG 12 ? ? "C1'" B DG 12 ? ? N9 B DG 12 ? ? 110.95 108.30 2.65 0.30 N 106 3 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 111.40 108.30 3.10 0.30 N 107 3 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.36 121.90 -4.54 0.70 N 108 3 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 109 4 "C1'" A DG 1 ? ? "O4'" A DG 1 ? ? "C4'" A DG 1 ? ? 102.63 110.10 -7.47 1.00 N 110 4 "O4'" A DG 1 ? ? "C1'" A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 116.41 108.30 8.11 0.30 N 111 4 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 112.11 108.30 3.81 0.30 N 112 4 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 117.00 121.90 -4.90 0.70 N 113 4 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 114 4 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.52 117.00 -3.48 0.50 N 115 4 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.35 117.70 3.65 0.50 N 116 4 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.15 118.60 -5.45 0.60 N 117 4 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 115.13 108.30 6.83 0.30 N 118 4 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.15 108.30 3.85 0.30 N 119 4 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 112.66 108.30 4.36 0.30 N 120 4 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 111.65 108.30 3.35 0.30 N 121 4 "O4'" A DA 10 ? ? "C1'" A DA 10 ? ? N9 A DA 10 ? ? 110.10 108.30 1.80 0.30 N 122 4 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.39 117.70 3.69 0.50 N 123 4 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.99 118.60 -4.61 0.60 N 124 4 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.45 108.30 3.15 0.30 N 125 4 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 110.26 108.30 1.96 0.30 N 126 4 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 116.78 121.90 -5.12 0.70 N 127 4 "C1'" B DG 1 ? ? "O4'" B DG 1 ? ? "C4'" B DG 1 ? ? 103.35 110.10 -6.75 1.00 N 128 4 "O4'" B DG 1 ? ? "C1'" B DG 1 ? ? N9 B DG 1 ? ? 115.45 108.30 7.15 0.30 N 129 4 "O4'" B DC 2 ? ? "C1'" B DC 2 ? ? N1 B DC 2 ? ? 110.92 108.30 2.62 0.30 N 130 4 N3 B DC 2 ? ? C2 B DC 2 ? ? O2 B DC 2 ? ? 116.96 121.90 -4.94 0.70 N 131 4 "O4'" B DG 3 ? ? "C1'" B DG 3 ? ? N9 B DG 3 ? ? 113.12 108.30 4.82 0.30 N 132 4 "O4'" B DA 5 ? ? "C1'" B DA 5 ? ? N9 B DA 5 ? ? 112.39 108.30 4.09 0.30 N 133 4 C4 B DA 5 ? ? C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? 113.47 117.00 -3.53 0.50 N 134 4 C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N1 B DA 5 ? ? 121.43 117.70 3.73 0.50 N 135 4 N1 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N6 B DA 5 ? ? 113.08 118.60 -5.52 0.60 N 136 4 "O4'" B DG 6 ? ? "C1'" B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 115.27 108.30 6.97 0.30 N 137 4 "O4'" B DG 7 ? ? "C1'" B DG 7 ? ? N9 B DG 7 ? ? 112.28 108.30 3.98 0.30 N 138 4 "O4'" B DG 8 ? ? "C1'" B DG 8 ? ? N9 B DG 8 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 139 4 "O4'" B DG 9 ? ? "C1'" B DG 9 ? ? N9 B DG 9 ? ? 112.46 108.30 4.16 0.30 N 140 4 C4 B DA 10 ? ? C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? 113.96 117.00 -3.04 0.50 N 141 4 C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N1 B DA 10 ? ? 121.50 117.70 3.80 0.50 N 142 4 N1 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N6 B DA 10 ? ? 113.13 118.60 -5.47 0.60 N 143 4 "O4'" B DG 12 ? ? "C1'" B DG 12 ? ? N9 B DG 12 ? ? 110.11 108.30 1.81 0.30 N 144 4 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 110.84 108.30 2.54 0.30 N 145 4 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.18 121.90 -4.72 0.70 N 146 5 "C1'" A DG 1 ? ? "O4'" A DG 1 ? ? "C4'" A DG 1 ? ? 103.75 110.10 -6.35 1.00 N 147 5 "O4'" A DG 1 ? ? "C1'" A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 114.12 108.30 5.82 0.30 N 148 5 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 117.10 121.90 -4.80 0.70 N 149 5 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 113.86 108.30 5.56 0.30 N 150 5 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.23 108.30 1.93 0.30 N 151 5 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 112.82 108.30 4.52 0.30 N 152 5 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.46 117.00 -3.54 0.50 N 153 5 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 154 5 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.00 118.60 -5.60 0.60 N 155 5 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 115.39 108.30 7.09 0.30 N 156 5 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.47 108.30 4.17 0.30 N 157 5 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 113.51 108.30 5.21 0.30 N 158 5 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 111.89 108.30 3.59 0.30 N 159 5 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.93 117.00 -3.07 0.50 N 160 5 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.40 117.70 3.70 0.50 N 161 5 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.82 118.60 -4.78 0.60 N 162 5 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.46 108.30 3.16 0.30 N 163 5 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 110.68 108.30 2.38 0.30 N 164 5 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 117.59 121.90 -4.31 0.70 N 165 5 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 110.76 108.30 2.46 0.30 N 166 5 "C1'" B DG 1 ? ? "O4'" B DG 1 ? ? "C4'" B DG 1 ? ? 103.20 110.10 -6.90 1.00 N 167 5 "O4'" B DG 1 ? ? "C1'" B DG 1 ? ? N9 B DG 1 ? ? 115.28 108.30 6.98 0.30 N 168 5 "O4'" B DC 2 ? ? "C1'" B DC 2 ? ? N1 B DC 2 ? ? 110.76 108.30 2.46 0.30 N 169 5 N3 B DC 2 ? ? C2 B DC 2 ? ? O2 B DC 2 ? ? 116.95 121.90 -4.95 0.70 N 170 5 "O4'" B DG 3 ? ? "C4'" B DG 3 ? ? "C3'" B DG 3 ? ? 101.50 104.50 -3.00 0.40 N 171 5 "O4'" B DG 3 ? ? "C1'" B DG 3 ? ? N9 B DG 3 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 172 5 "O4'" B DG 4 ? ? "C1'" B DG 4 ? ? N9 B DG 4 ? ? 110.97 108.30 2.67 0.30 N 173 5 "O4'" B DA 5 ? ? "C1'" B DA 5 ? ? N9 B DA 5 ? ? 110.82 108.30 2.52 0.30 N 174 5 C4 B DA 5 ? ? C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? 113.81 117.00 -3.19 0.50 N 175 5 C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N1 B DA 5 ? ? 121.41 117.70 3.71 0.50 N 176 5 N1 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N6 B DA 5 ? ? 113.45 118.60 -5.15 0.60 N 177 5 "O4'" B DG 6 ? ? "C1'" B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 115.22 108.30 6.92 0.30 N 178 5 "O4'" B DG 7 ? ? "C1'" B DG 7 ? ? N9 B DG 7 ? ? 112.41 108.30 4.11 0.30 N 179 5 "O4'" B DG 8 ? ? "C1'" B DG 8 ? ? N9 B DG 8 ? ? 111.50 108.30 3.20 0.30 N 180 5 "O4'" B DG 9 ? ? "C1'" B DG 9 ? ? N9 B DG 9 ? ? 112.31 108.30 4.01 0.30 N 181 5 C4 B DA 10 ? ? C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? 113.88 117.00 -3.12 0.50 N 182 5 C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N1 B DA 10 ? ? 121.45 117.70 3.75 0.50 N 183 5 N1 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N6 B DA 10 ? ? 112.53 118.60 -6.07 0.60 N 184 5 "O4'" B DG 12 ? ? "C1'" B DG 12 ? ? N9 B DG 12 ? ? 112.22 108.30 3.92 0.30 N 185 5 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 112.21 108.30 3.91 0.30 N 186 5 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.35 121.90 -4.55 0.70 N 187 5 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.77 108.30 2.47 0.30 N 188 6 "C1'" A DG 1 ? ? "O4'" A DG 1 ? ? "C4'" A DG 1 ? ? 102.63 110.10 -7.47 1.00 N 189 6 "O4'" A DG 1 ? ? "C1'" A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 116.38 108.30 8.08 0.30 N 190 6 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 110.96 108.30 2.66 0.30 N 191 6 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.83 121.90 -5.07 0.70 N 192 6 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.10 108.30 1.80 0.30 N 193 6 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 110.54 108.30 2.24 0.30 N 194 6 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 111.50 108.30 3.20 0.30 N 195 6 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.30 117.00 -3.70 0.50 N 196 6 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.39 117.70 3.69 0.50 N 197 6 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 112.75 118.60 -5.85 0.60 N 198 6 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 114.60 108.30 6.30 0.30 N 199 6 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.58 108.30 4.28 0.30 N 200 6 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 113.97 108.30 5.67 0.30 N 201 6 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 202 6 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.06 117.70 3.36 0.50 N 203 6 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.92 118.60 -4.68 0.60 N 204 6 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.07 108.30 2.77 0.30 N 205 6 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 110.48 108.30 2.18 0.30 N 206 6 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 116.63 121.90 -5.27 0.70 N 207 6 "C1'" B DG 1 ? ? "O4'" B DG 1 ? ? "C4'" B DG 1 ? ? 103.88 110.10 -6.22 1.00 N 208 6 "O4'" B DG 1 ? ? "C1'" B DG 1 ? ? N9 B DG 1 ? ? 114.76 108.30 6.46 0.30 N 209 6 "O4'" B DC 2 ? ? "C1'" B DC 2 ? ? N1 B DC 2 ? ? 111.52 108.30 3.22 0.30 N 210 6 N3 B DC 2 ? ? C2 B DC 2 ? ? O2 B DC 2 ? ? 116.98 121.90 -4.92 0.70 N 211 6 "C1'" B DG 3 ? ? "O4'" B DG 3 ? ? "C4'" B DG 3 ? ? 103.79 110.10 -6.31 1.00 N 212 6 "O4'" B DG 3 ? ? "C1'" B DG 3 ? ? N9 B DG 3 ? ? 112.78 108.30 4.48 0.30 N 213 6 "O4'" B DA 5 ? ? "C1'" B DA 5 ? ? N9 B DA 5 ? ? 112.54 108.30 4.24 0.30 N 214 6 C4 B DA 5 ? ? C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? 113.30 117.00 -3.70 0.50 N 215 6 C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N1 B DA 5 ? ? 121.46 117.70 3.76 0.50 N 216 6 N1 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N6 B DA 5 ? ? 112.77 118.60 -5.83 0.60 N 217 6 "O4'" B DG 6 ? ? "C1'" B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 115.36 108.30 7.06 0.30 N 218 6 "O4'" B DG 7 ? ? "C1'" B DG 7 ? ? N9 B DG 7 ? ? 112.66 108.30 4.36 0.30 N 219 6 "O4'" B DG 8 ? ? "C1'" B DG 8 ? ? N9 B DG 8 ? ? 111.47 108.30 3.17 0.30 N 220 6 "O4'" B DG 9 ? ? "C1'" B DG 9 ? ? N9 B DG 9 ? ? 111.96 108.30 3.66 0.30 N 221 6 C4 B DA 10 ? ? C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? 113.78 117.00 -3.22 0.50 N 222 6 C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N1 B DA 10 ? ? 121.45 117.70 3.75 0.50 N 223 6 N1 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N6 B DA 10 ? ? 112.46 118.60 -6.14 0.60 N 224 6 "O4'" B DG 12 ? ? "C1'" B DG 12 ? ? N9 B DG 12 ? ? 110.40 108.30 2.10 0.30 N 225 6 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 110.47 108.30 2.17 0.30 N 226 6 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.18 121.90 -4.72 0.70 N 227 7 "C1'" A DG 1 ? ? "O4'" A DG 1 ? ? "C4'" A DG 1 ? ? 102.82 110.10 -7.28 1.00 N 228 7 "O4'" A DG 1 ? ? "C1'" A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 115.54 108.30 7.24 0.30 N 229 7 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 111.46 108.30 3.16 0.30 N 230 7 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.82 121.90 -5.08 0.70 N 231 7 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.29 117.00 -3.71 0.50 N 232 7 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.22 117.70 3.52 0.50 N 233 7 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 112.69 118.60 -5.91 0.60 N 234 7 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 115.25 108.30 6.95 0.30 N 235 7 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.27 108.30 3.97 0.30 N 236 7 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 110.91 108.30 2.61 0.30 N 237 7 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 110.93 108.30 2.63 0.30 N 238 7 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.93 117.00 -3.07 0.50 N 239 7 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.60 117.70 3.90 0.50 N 240 7 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.33 118.60 -5.27 0.60 N 241 7 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.64 108.30 2.34 0.30 N 242 7 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 111.50 108.30 3.20 0.30 N 243 7 N1 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 122.57 118.90 3.67 0.60 N 244 7 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 116.43 121.90 -5.47 0.70 N 245 7 "O4'" A DG 14 ? ? "C1'" A DG 14 ? ? N9 A DG 14 ? ? 111.05 108.30 2.75 0.30 N 246 7 "C1'" B DG 1 ? ? "O4'" B DG 1 ? ? "C4'" B DG 1 ? ? 103.49 110.10 -6.61 1.00 N 247 7 "O4'" B DG 1 ? ? "C1'" B DG 1 ? ? N9 B DG 1 ? ? 114.76 108.30 6.46 0.30 N 248 7 "O4'" B DC 2 ? ? "C1'" B DC 2 ? ? N1 B DC 2 ? ? 110.55 108.30 2.25 0.30 N 249 7 N3 B DC 2 ? ? C2 B DC 2 ? ? O2 B DC 2 ? ? 116.93 121.90 -4.97 0.70 N 250 7 "O4'" B DG 3 ? ? "C1'" B DG 3 ? ? N9 B DG 3 ? ? 113.28 108.30 4.98 0.30 N 251 7 "O4'" B DA 5 ? ? "C1'" B DA 5 ? ? N9 B DA 5 ? ? 111.93 108.30 3.63 0.30 N 252 7 C4 B DA 5 ? ? C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? 113.35 117.00 -3.65 0.50 N 253 7 C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N1 B DA 5 ? ? 121.63 117.70 3.93 0.50 N 254 7 N1 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N6 B DA 5 ? ? 113.25 118.60 -5.35 0.60 N 255 7 "O4'" B DG 6 ? ? "C1'" B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 114.78 108.30 6.48 0.30 N 256 7 "O4'" B DG 7 ? ? "C1'" B DG 7 ? ? N9 B DG 7 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 257 7 "O4'" B DG 8 ? ? "C1'" B DG 8 ? ? N9 B DG 8 ? ? 110.60 108.30 2.30 0.30 N 258 7 "O4'" B DG 9 ? ? "C1'" B DG 9 ? ? N9 B DG 9 ? ? 112.77 108.30 4.47 0.30 N 259 7 C4 B DA 10 ? ? C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? 113.75 117.00 -3.25 0.50 N 260 7 C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N1 B DA 10 ? ? 121.75 117.70 4.05 0.50 N 261 7 N1 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N6 B DA 10 ? ? 112.68 118.60 -5.92 0.60 N 262 7 "O4'" B DG 12 ? ? "C1'" B DG 12 ? ? N9 B DG 12 ? ? 110.61 108.30 2.31 0.30 N 263 7 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 110.38 108.30 2.08 0.30 N 264 7 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.24 121.90 -4.66 0.70 N 265 8 "C1'" A DG 1 ? ? "O4'" A DG 1 ? ? "C4'" A DG 1 ? ? 102.74 110.10 -7.36 1.00 N 266 8 "O4'" A DG 1 ? ? "C1'" A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 115.89 108.30 7.59 0.30 N 267 8 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 111.79 108.30 3.49 0.30 N 268 8 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.72 121.90 -5.18 0.70 N 269 8 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.42 117.00 -3.58 0.50 N 270 8 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.15 117.70 3.45 0.50 N 271 8 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 112.76 118.60 -5.84 0.60 N 272 8 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 114.59 108.30 6.29 0.30 N 273 8 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.29 108.30 3.99 0.30 N 274 8 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 112.94 108.30 4.64 0.30 N 275 8 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 112.13 108.30 3.83 0.30 N 276 8 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.33 117.70 3.63 0.50 N 277 8 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.85 118.60 -4.75 0.60 N 278 8 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.40 108.30 3.10 0.30 N 279 8 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 112.59 108.30 4.29 0.30 N 280 8 "C1'" B DG 1 ? ? "O4'" B DG 1 ? ? "C4'" B DG 1 ? ? 103.61 110.10 -6.49 1.00 N 281 8 "O4'" B DG 1 ? ? "C1'" B DG 1 ? ? N9 B DG 1 ? ? 114.54 108.30 6.24 0.30 N 282 8 N3 B DC 2 ? ? C2 B DC 2 ? ? O2 B DC 2 ? ? 116.90 121.90 -5.00 0.70 N 283 8 "O4'" B DG 3 ? ? "C1'" B DG 3 ? ? N9 B DG 3 ? ? 113.90 108.30 5.60 0.30 N 284 8 "O4'" B DA 5 ? ? "C1'" B DA 5 ? ? N9 B DA 5 ? ? 111.49 108.30 3.19 0.30 N 285 8 C4 B DA 5 ? ? C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? 113.35 117.00 -3.65 0.50 N 286 8 C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N1 B DA 5 ? ? 121.71 117.70 4.01 0.50 N 287 8 N1 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N6 B DA 5 ? ? 113.37 118.60 -5.23 0.60 N 288 8 "O4'" B DG 6 ? ? "C1'" B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 115.97 108.30 7.67 0.30 N 289 8 "O4'" B DG 7 ? ? "C1'" B DG 7 ? ? N9 B DG 7 ? ? 112.25 108.30 3.95 0.30 N 290 8 "O4'" B DG 8 ? ? "C1'" B DG 8 ? ? N9 B DG 8 ? ? 110.77 108.30 2.47 0.30 N 291 8 "O4'" B DG 9 ? ? "C1'" B DG 9 ? ? N9 B DG 9 ? ? 112.43 108.30 4.13 0.30 N 292 8 C4 B DA 10 ? ? C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? 113.98 117.00 -3.02 0.50 N 293 8 C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N1 B DA 10 ? ? 121.55 117.70 3.85 0.50 N 294 8 N1 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N6 B DA 10 ? ? 113.32 118.60 -5.28 0.60 N 295 8 "O4'" B DG 12 ? ? "C1'" B DG 12 ? ? N9 B DG 12 ? ? 111.82 108.30 3.52 0.30 N 296 8 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 114.37 108.30 6.07 0.30 N 297 8 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.56 121.90 -4.34 0.70 N 298 9 "C1'" A DG 1 ? ? "O4'" A DG 1 ? ? "C4'" A DG 1 ? ? 103.30 110.10 -6.80 1.00 N 299 9 "O4'" A DG 1 ? ? "C1'" A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 114.96 108.30 6.66 0.30 N 300 9 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 112.28 108.30 3.98 0.30 N 301 9 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.72 121.90 -5.18 0.70 N 302 9 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.16 108.30 1.86 0.30 N 303 9 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.77 108.30 3.47 0.30 N 304 9 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 110.45 108.30 2.15 0.30 N 305 9 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.43 117.00 -3.57 0.50 N 306 9 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.65 117.70 3.95 0.50 N 307 9 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 113.25 118.60 -5.35 0.60 N 308 9 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 115.64 108.30 7.34 0.30 N 309 9 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.37 108.30 4.07 0.30 N 310 9 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 311 9 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 112.25 108.30 3.95 0.30 N 312 9 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.83 117.00 -3.17 0.50 N 313 9 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.50 117.70 3.80 0.50 N 314 9 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 113.06 118.60 -5.54 0.60 N 315 9 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 110.20 108.30 1.90 0.30 N 316 9 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 110.62 108.30 2.32 0.30 N 317 9 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 117.30 121.90 -4.60 0.70 N 318 9 "C1'" B DG 1 ? ? "O4'" B DG 1 ? ? "C4'" B DG 1 ? ? 102.64 110.10 -7.46 1.00 N 319 9 "O4'" B DG 1 ? ? "C1'" B DG 1 ? ? N9 B DG 1 ? ? 116.09 108.30 7.79 0.30 N 320 9 "O4'" B DC 2 ? ? "C1'" B DC 2 ? ? N1 B DC 2 ? ? 110.57 108.30 2.27 0.30 N 321 9 N3 B DC 2 ? ? C2 B DC 2 ? ? O2 B DC 2 ? ? 116.90 121.90 -5.00 0.70 N 322 9 "O4'" B DG 3 ? ? "C1'" B DG 3 ? ? N9 B DG 3 ? ? 111.64 108.30 3.34 0.30 N 323 9 "O4'" B DG 4 ? ? "C1'" B DG 4 ? ? N9 B DG 4 ? ? 111.13 108.30 2.83 0.30 N 324 9 "O4'" B DA 5 ? ? "C1'" B DA 5 ? ? N9 B DA 5 ? ? 112.43 108.30 4.13 0.30 N 325 9 C4 B DA 5 ? ? C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? 113.36 117.00 -3.64 0.50 N 326 9 C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N1 B DA 5 ? ? 121.06 117.70 3.36 0.50 N 327 9 N1 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N6 B DA 5 ? ? 112.03 118.60 -6.57 0.60 N 328 9 "O4'" B DG 6 ? ? "C1'" B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 114.85 108.30 6.55 0.30 N 329 9 "O4'" B DG 7 ? ? "C1'" B DG 7 ? ? N9 B DG 7 ? ? 112.77 108.30 4.47 0.30 N 330 9 "O4'" B DG 8 ? ? "C1'" B DG 8 ? ? N9 B DG 8 ? ? 113.40 108.30 5.10 0.30 N 331 9 "O4'" B DG 9 ? ? "C1'" B DG 9 ? ? N9 B DG 9 ? ? 111.01 108.30 2.71 0.30 N 332 9 "O4'" B DA 10 ? ? "C1'" B DA 10 ? ? N9 B DA 10 ? ? 110.67 108.30 2.37 0.30 N 333 9 C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N1 B DA 10 ? ? 120.97 117.70 3.27 0.50 N 334 9 N1 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N6 B DA 10 ? ? 113.54 118.60 -5.06 0.60 N 335 9 "O4'" B DG 12 ? ? "C1'" B DG 12 ? ? N9 B DG 12 ? ? 111.02 108.30 2.72 0.30 N 336 9 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 111.09 108.30 2.79 0.30 N 337 9 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 116.73 121.90 -5.17 0.70 N 338 10 "C1'" A DG 1 ? ? "O4'" A DG 1 ? ? "C4'" A DG 1 ? ? 103.86 110.10 -6.24 1.00 N 339 10 "O4'" A DG 1 ? ? "C1'" A DG 1 ? ? N9 A DG 1 ? ? 114.35 108.30 6.05 0.30 N 340 10 "O4'" A DC 2 ? ? "C1'" A DC 2 ? ? N1 A DC 2 ? ? 110.32 108.30 2.02 0.30 N 341 10 N3 A DC 2 ? ? C2 A DC 2 ? ? O2 A DC 2 ? ? 116.86 121.90 -5.04 0.70 N 342 10 "O4'" A DG 3 ? ? "C1'" A DG 3 ? ? N9 A DG 3 ? ? 110.25 108.30 1.95 0.30 N 343 10 "O4'" A DG 4 ? ? "C1'" A DG 4 ? ? N9 A DG 4 ? ? 111.29 108.30 2.99 0.30 N 344 10 "O4'" A DA 5 ? ? "C1'" A DA 5 ? ? N9 A DA 5 ? ? 112.15 108.30 3.85 0.30 N 345 10 C4 A DA 5 ? ? C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? 113.28 117.00 -3.72 0.50 N 346 10 C5 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N1 A DA 5 ? ? 121.30 117.70 3.60 0.50 N 347 10 N1 A DA 5 ? ? C6 A DA 5 ? ? N6 A DA 5 ? ? 112.30 118.60 -6.30 0.60 N 348 10 "O4'" A DG 6 ? ? "C1'" A DG 6 ? ? N9 A DG 6 ? ? 114.72 108.30 6.42 0.30 N 349 10 "O4'" A DG 7 ? ? "C1'" A DG 7 ? ? N9 A DG 7 ? ? 112.21 108.30 3.91 0.30 N 350 10 "O4'" A DG 8 ? ? "C1'" A DG 8 ? ? N9 A DG 8 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 351 10 "O4'" A DG 9 ? ? "C1'" A DG 9 ? ? N9 A DG 9 ? ? 112.75 108.30 4.45 0.30 N 352 10 C4 A DA 10 ? ? C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? 113.79 117.00 -3.21 0.50 N 353 10 C5 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N1 A DA 10 ? ? 121.52 117.70 3.82 0.50 N 354 10 N1 A DA 10 ? ? C6 A DA 10 ? ? N6 A DA 10 ? ? 112.70 118.60 -5.90 0.60 N 355 10 "O4'" A DG 12 ? ? "C1'" A DG 12 ? ? N9 A DG 12 ? ? 111.00 108.30 2.70 0.30 N 356 10 "O4'" A DC 13 ? ? "C1'" A DC 13 ? ? N1 A DC 13 ? ? 110.68 108.30 2.38 0.30 N 357 10 N3 A DC 13 ? ? C2 A DC 13 ? ? O2 A DC 13 ? ? 117.36 121.90 -4.54 0.70 N 358 10 "C1'" B DG 1 ? ? "O4'" B DG 1 ? ? "C4'" B DG 1 ? ? 103.27 110.10 -6.83 1.00 N 359 10 "O4'" B DG 1 ? ? "C1'" B DG 1 ? ? N9 B DG 1 ? ? 114.77 108.30 6.47 0.30 N 360 10 "O4'" B DC 2 ? ? "C1'" B DC 2 ? ? N1 B DC 2 ? ? 111.15 108.30 2.85 0.30 N 361 10 N3 B DC 2 ? ? C2 B DC 2 ? ? O2 B DC 2 ? ? 117.06 121.90 -4.84 0.70 N 362 10 "O4'" B DG 3 ? ? "C1'" B DG 3 ? ? N9 B DG 3 ? ? 111.02 108.30 2.72 0.30 N 363 10 "O4'" B DA 5 ? ? "C1'" B DA 5 ? ? N9 B DA 5 ? ? 110.85 108.30 2.55 0.30 N 364 10 C4 B DA 5 ? ? C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? 113.52 117.00 -3.48 0.50 N 365 10 C5 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N1 B DA 5 ? ? 121.35 117.70 3.65 0.50 N 366 10 N1 B DA 5 ? ? C6 B DA 5 ? ? N6 B DA 5 ? ? 113.93 118.60 -4.67 0.60 N 367 10 "O4'" B DG 6 ? ? "C1'" B DG 6 ? ? N9 B DG 6 ? ? 116.16 108.30 7.86 0.30 N 368 10 "O4'" B DG 7 ? ? "C1'" B DG 7 ? ? N9 B DG 7 ? ? 112.79 108.30 4.49 0.30 N 369 10 "O4'" B DG 8 ? ? "C1'" B DG 8 ? ? N9 B DG 8 ? ? 113.82 108.30 5.52 0.30 N 370 10 "O4'" B DG 9 ? ? "C1'" B DG 9 ? ? N9 B DG 9 ? ? 111.19 108.30 2.89 0.30 N 371 10 C5 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N1 B DA 10 ? ? 121.09 117.70 3.39 0.50 N 372 10 N1 B DA 10 ? ? C6 B DA 10 ? ? N6 B DA 10 ? ? 113.54 118.60 -5.06 0.60 N 373 10 "O4'" B DG 12 ? ? "C1'" B DG 12 ? ? N9 B DG 12 ? ? 110.89 108.30 2.59 0.30 N 374 10 "O4'" B DC 13 ? ? "C1'" B DC 13 ? ? N1 B DC 13 ? ? 111.22 108.30 2.92 0.30 N 375 10 N3 B DC 13 ? ? C2 B DC 13 ? ? O2 B DC 13 ? ? 117.33 121.90 -4.57 0.70 N 376 10 "O4'" B DG 14 ? ? "C1'" B DG 14 ? ? N9 B DG 14 ? ? 110.46 108.30 2.16 0.30 N # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 DG A 6 ? ? 0.130 'SIDE CHAIN' 2 1 DG A 7 ? ? 0.066 'SIDE CHAIN' 3 1 DG A 9 ? ? 0.094 'SIDE CHAIN' 4 1 DC A 13 ? ? 0.061 'SIDE CHAIN' 5 1 DA B 5 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 6 1 DG B 6 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 7 1 DG B 7 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 8 2 DG A 4 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 9 2 DG A 6 ? ? 0.108 'SIDE CHAIN' 10 2 DG A 7 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 11 2 DG B 4 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 12 2 DG B 6 ? ? 0.116 'SIDE CHAIN' 13 2 DG B 7 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 14 2 DG B 9 ? ? 0.102 'SIDE CHAIN' 15 2 DG B 14 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' 16 3 DG A 6 ? ? 0.100 'SIDE CHAIN' 17 3 DG A 7 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 18 3 DG B 4 ? ? 0.125 'SIDE CHAIN' 19 3 DG B 6 ? ? 0.141 'SIDE CHAIN' 20 3 DG B 9 ? ? 0.099 'SIDE CHAIN' 21 4 DG A 6 ? ? 0.132 'SIDE CHAIN' 22 4 DG A 7 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 23 4 DG A 14 ? ? 0.101 'SIDE CHAIN' 24 4 DC B 2 ? ? 0.062 'SIDE CHAIN' 25 4 DG B 4 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 26 4 DG B 6 ? ? 0.113 'SIDE CHAIN' 27 4 DG B 7 ? ? 0.073 'SIDE CHAIN' 28 4 DG B 11 ? ? 0.059 'SIDE CHAIN' 29 5 DG A 6 ? ? 0.094 'SIDE CHAIN' 30 5 DG A 7 ? ? 0.052 'SIDE CHAIN' 31 5 DG B 6 ? ? 0.123 'SIDE CHAIN' 32 5 DG B 7 ? ? 0.091 'SIDE CHAIN' 33 6 DG A 6 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 34 6 DG A 7 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 35 6 DG A 9 ? ? 0.093 'SIDE CHAIN' 36 6 DG A 14 ? ? 0.114 'SIDE CHAIN' 37 6 DG B 4 ? ? 0.094 'SIDE CHAIN' 38 6 DG B 6 ? ? 0.107 'SIDE CHAIN' 39 6 DG B 7 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 40 6 DG B 11 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 41 7 DG A 6 ? ? 0.115 'SIDE CHAIN' 42 7 DG A 7 ? ? 0.074 'SIDE CHAIN' 43 7 DG A 11 ? ? 0.058 'SIDE CHAIN' 44 7 DC A 13 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 45 7 DG A 14 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 46 7 DG B 4 ? ? 0.069 'SIDE CHAIN' 47 7 DG B 6 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 48 7 DG B 7 ? ? 0.050 'SIDE CHAIN' 49 7 DG B 11 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 50 8 DG A 6 ? ? 0.108 'SIDE CHAIN' 51 8 DG A 7 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 52 8 DC A 13 ? ? 0.136 'SIDE CHAIN' 53 8 DG A 14 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 54 8 DG B 4 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 55 8 DG B 6 ? ? 0.117 'SIDE CHAIN' 56 8 DG B 7 ? ? 0.065 'SIDE CHAIN' 57 8 DG B 9 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 58 8 DC B 13 ? ? 0.092 'SIDE CHAIN' 59 9 DG A 4 ? ? 0.064 'SIDE CHAIN' 60 9 DG A 6 ? ? 0.142 'SIDE CHAIN' 61 9 DG A 7 ? ? 0.063 'SIDE CHAIN' 62 9 DG B 4 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 63 9 DG B 6 ? ? 0.078 'SIDE CHAIN' 64 9 DG B 7 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 65 9 DG B 9 ? ? 0.103 'SIDE CHAIN' 66 9 DG B 14 ? ? 0.068 'SIDE CHAIN' 67 10 DG A 6 ? ? 0.075 'SIDE CHAIN' 68 10 DG A 7 ? ? 0.082 'SIDE CHAIN' 69 10 DC B 2 ? ? 0.056 'SIDE CHAIN' 70 10 DG B 4 ? ? 0.126 'SIDE CHAIN' 71 10 DG B 6 ? ? 0.143 'SIDE CHAIN' 72 10 DG B 9 ? ? 0.103 'SIDE CHAIN' # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6SYK 'double helix' 6SYK 'parallel strands' 6SYK 'hairpin loop' 6SYK 'mismatched base pair' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 A DG 4 1_555 B DG 4 1_555 -1.287 -0.929 0.726 -5.522 -30.385 177.176 1 A_DG4:DG4_B A 4 ? B 4 ? 3 2 1 A DA 5 1_555 B DA 5 1_555 -1.700 -1.013 0.153 -2.186 -20.136 169.779 2 A_DA5:DA5_B A 5 ? B 5 ? 1 2 1 A DG 6 1_555 B DC 2 1_555 -0.426 -0.065 -0.368 -5.452 1.521 -0.523 3 A_DG6:DC2_B A 6 ? B 2 ? 19 1 1 A DG 1 1_555 B DG 7 1_555 -2.612 -2.706 -0.203 5.629 10.071 84.759 4 A_DG1:DG7_B A 1 ? B 7 ? 6 3 1 A DG 7 1_555 B DG 1 1_555 2.653 2.623 0.045 -4.327 -6.848 -84.473 5 A_DG7:DG1_B A 7 ? B 1 ? 6 3 1 A DG 8 1_555 B DG 11 1_555 -1.773 -3.233 0.273 -8.090 1.308 91.058 6 A_DG8:DG11_B A 8 ? B 11 ? 6 3 1 B DG 9 1_555 B DG 12 1_555 1.521 3.374 0.715 -5.489 -2.519 -93.090 7 B_DG9:DG12_B B 9 ? B 12 ? 6 3 1 A DC 13 1_555 B DG 14 1_555 -0.002 -0.109 0.944 -21.955 49.686 1.981 8 A_DC13:DG14_B A 13 ? B 14 ? 19 1 # loop_ _ndb_struct_na_base_pair_step.model_number _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_comp_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_label_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_symmetry_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.shift _ndb_struct_na_base_pair_step.slide _ndb_struct_na_base_pair_step.rise _ndb_struct_na_base_pair_step.tilt _ndb_struct_na_base_pair_step.roll _ndb_struct_na_base_pair_step.twist _ndb_struct_na_base_pair_step.x_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.y_displacement _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_rise _ndb_struct_na_base_pair_step.inclination _ndb_struct_na_base_pair_step.tip _ndb_struct_na_base_pair_step.helical_twist _ndb_struct_na_base_pair_step.step_number _ndb_struct_na_base_pair_step.step_name _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_1 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.i_PDB_ins_code_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_asym_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_auth_seq_id_2 _ndb_struct_na_base_pair_step.j_PDB_ins_code_2 1 A DG 4 1_555 B DG 4 1_555 A DA 5 1_555 B DA 5 1_555 -0.796 -0.543 3.509 -3.586 0.021 34.603 -0.912 0.739 3.571 0.035 6.008 34.782 1 AA_DG4DA5:DA5DG4_BB A 4 ? B 4 ? A 5 ? B 5 ? 1 A DA 5 1_555 B DA 5 1_555 A DG 6 1_555 B DC 2 1_555 -0.121 -0.765 3.178 0.295 7.429 96.592 -0.633 0.086 3.128 4.969 -0.198 96.807 2 AA_DA5DG6:DC2DA5_BB A 5 ? B 5 ? A 6 ? B 2 ? 1 A DG 6 1_555 B DC 2 1_555 A DG 1 1_555 B DG 7 1_555 1.046 4.144 3.646 -13.509 3.768 -95.298 -2.859 0.443 3.612 -2.539 -9.102 -96.077 3 AA_DG6DG1:DG7DC2_BB A 6 ? B 2 ? A 1 ? B 7 ? 1 A DG 7 1_555 B DG 1 1_555 A DG 8 1_555 B DG 11 1_555 1.397 1.372 2.968 4.086 1.969 -60.495 -1.443 1.559 2.836 -1.952 4.049 -60.649 4 AA_DG7DG8:DG11DG1_BB A 7 ? B 1 ? A 8 ? B 11 ? 1 A DG 8 1_555 B DG 11 1_555 B DG 9 1_555 B DG 12 1_555 0.458 1.932 3.049 4.952 12.640 -66.470 -2.161 0.578 2.651 -11.409 4.470 -67.687 5 AB_DG8DG9:DG12DG11_BB A 8 ? B 11 ? B 9 ? B 12 ? 1 B DG 9 1_555 B DG 12 1_555 A DC 13 1_555 B DG 14 1_555 -2.371 2.448 2.804 73.957 37.167 -105.321 -1.721 -0.643 2.963 -21.527 42.836 -125.861 6 BA_DG9DC13:DG14DG12_BB B 9 ? B 12 ? A 13 ? B 14 ? # _pdbx_audit_support.funding_organization 'Slovenian Research Agency' _pdbx_audit_support.country Slovenia _pdbx_audit_support.grant_number ? _pdbx_audit_support.ordinal 1 # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'native gel electrophoresis' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #