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'Dienemann, C.' 3 ? 'Taipale, J.' 4 0000-0003-4204-0951 'Cramer, P.' 5 0000-0001-5454-7755 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country UK _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nature _citation.journal_id_ASTM NATUAS _citation.journal_id_CSD 0006 _citation.journal_id_ISSN 1476-4687 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 580 _citation.language ? _citation.page_first 669 _citation.page_last 672 _citation.title 'Nucleosome-bound SOX2 and SOX11 structures elucidate pioneer factor function.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41586-020-2195-y _citation.pdbx_database_id_PubMed 32350470 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Dodonova, S.O.' 1 ? primary 'Zhu, F.' 2 ? primary 'Dienemann, C.' 3 ? primary 'Taipale, J.' 4 ? primary 'Cramer, P.' 5 ? # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6T79 _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6T79 _symmetry.cell_setting ? 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;ATCTACACGACGCTCTTCCGATCTAATTTATGTTTGTTAGCGTTATACTATTCTAATTCTTTGTTTCGGTGGTATTGTTT ATTTTGTTCCTTTGTGCGTTCAGCTTAATGCCTAACGACACTCGGAGATCGGAAGAGCACACGTGAT ; I ? 6 polydeoxyribonucleotide no no ;(DA)(DT)(DC)(DA)(DC)(DG)(DT)(DG)(DT)(DG)(DC)(DT)(DC)(DT)(DT)(DC)(DC)(DG)(DA)(DT) (DC)(DT)(DC)(DC)(DG)(DA)(DG)(DT)(DG)(DT)(DC)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DG)(DC)(DA)(DT) (DT)(DA)(DA)(DG)(DC)(DT)(DG)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DA)(DC)(DA)(DA)(DA)(DG)(DG)(DA) (DA)(DC)(DA)(DA)(DA)(DA)(DT)(DA)(DA)(DA)(DC)(DA)(DA)(DT)(DA)(DC)(DC)(DA)(DC)(DC) (DG)(DA)(DA)(DA)(DC)(DA)(DA)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DT)(DA)(DG)(DA)(DA)(DT)(DA)(DG) (DT)(DA)(DT)(DA)(DA)(DC)(DG)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DA)(DA)(DA)(DC)(DA)(DT)(DA)(DA) (DA)(DT)(DT)(DA)(DG)(DA)(DT)(DC)(DG)(DG)(DA)(DA)(DG)(DA)(DG)(DC)(DG)(DT)(DC)(DG) (DT)(DG)(DT)(DA)(DG)(DA)(DT) ; ;ATCACGTGTGCTCTTCCGATCTCCGAGTGTCGTTAGGCATTAAGCTGAACGCACAAAGGAACAAAATAAACAATACCACC GAAACAAAGAATTAGAATAGTATAACGCTAACAAACATAAATTAGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGAT ; J ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num 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SER n 1 89 ALA n 1 90 VAL n 1 91 MET n 1 92 ALA n 1 93 LEU n 1 94 GLN n 1 95 GLU n 1 96 ALA n 1 97 SER n 1 98 GLU n 1 99 ALA n 1 100 TYR n 1 101 LEU n 1 102 VAL n 1 103 GLY n 1 104 LEU n 1 105 PHE n 1 106 GLU n 1 107 ASP n 1 108 THR n 1 109 ASN n 1 110 LEU n 1 111 ALA n 1 112 ALA n 1 113 ILE n 1 114 HIS n 1 115 ALA n 1 116 LYS n 1 117 ARG n 1 118 VAL n 1 119 THR n 1 120 ILE n 1 121 MET n 1 122 PRO n 1 123 LYS n 1 124 ASP n 1 125 ILE n 1 126 GLN n 1 127 LEU n 1 128 ALA n 1 129 ARG n 1 130 ARG n 1 131 ILE n 1 132 ARG n 1 133 GLY n 1 134 GLU n 1 135 ARG n 1 136 ALA n 2 1 MET n 2 2 SER n 2 3 GLY n 2 4 ARG n 2 5 GLY n 2 6 LYS n 2 7 GLY n 2 8 GLY n 2 9 LYS n 2 10 GLY n 2 11 LEU n 2 12 GLY n 2 13 LYS n 2 14 GLY n 2 15 GLY n 2 16 ALA n 2 17 LYS n 2 18 ARG n 2 19 HIS n 2 20 ARG n 2 21 LYS n 2 22 VAL n 2 23 LEU n 2 24 ARG n 2 25 ASP n 2 26 ASN n 2 27 ILE n 2 28 GLN n 2 29 GLY n 2 30 ILE n 2 31 THR n 2 32 LYS n 2 33 PRO n 2 34 ALA n 2 35 ILE n 2 36 ARG n 2 37 ARG n 2 38 LEU n 2 39 ALA n 2 40 ARG n 2 41 ARG n 2 42 GLY n 2 43 GLY n 2 44 VAL n 2 45 LYS n 2 46 ARG n 2 47 ILE n 2 48 SER n 2 49 GLY n 2 50 LEU n 2 51 ILE n 2 52 TYR n 2 53 GLU n 2 54 GLU n 2 55 THR n 2 56 ARG n 2 57 GLY n 2 58 VAL n 2 59 LEU n 2 60 LYS n 2 61 VAL n 2 62 PHE n 2 63 LEU n 2 64 GLU n 2 65 ASN n 2 66 VAL n 2 67 ILE n 2 68 ARG n 2 69 ASP n 2 70 ALA n 2 71 VAL n 2 72 THR n 2 73 TYR n 2 74 THR n 2 75 GLU n 2 76 HIS n 2 77 ALA n 2 78 LYS n 2 79 ARG n 2 80 LYS n 2 81 THR n 2 82 VAL n 2 83 THR n 2 84 ALA n 2 85 MET n 2 86 ASP n 2 87 VAL n 2 88 VAL n 2 89 TYR n 2 90 ALA n 2 91 LEU n 2 92 LYS n 2 93 ARG n 2 94 GLN n 2 95 GLY n 2 96 ARG n 2 97 THR n 2 98 LEU n 2 99 TYR n 2 100 GLY n 2 101 PHE n 2 102 GLY n 2 103 GLY n 3 1 MET n 3 2 GLY n 3 3 SER n 3 4 SER n 3 5 HIS n 3 6 HIS n 3 7 HIS n 3 8 HIS n 3 9 HIS n 3 10 HIS n 3 11 GLU n 3 12 ASN n 3 13 LEU n 3 14 TYR n 3 15 PHE n 3 16 GLN n 3 17 SER n 3 18 ASN n 3 19 ALA n 3 20 PRO n 3 21 TRP n 3 22 MET n 3 23 SER n 3 24 GLY n 3 25 ARG n 3 26 GLY n 3 27 LYS n 3 28 GLN n 3 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_em_buffer.id 1 _em_buffer.details ? _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.entity_id_list _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 0 Nucleosome Nucleosome 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX '1, 2, 3, 4, 5, 6' ? ? 2 1 Proteins Proteins RECOMBINANT COMPLEX 1,2,3,4 ? ? 3 1 DNA DNA RECOMBINANT COMPLEX 5,6 ? ? # _em_image_scans.entry_id 6T79 _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height ? _em_image_scans.dimension_width ? _em_image_scans.frames_per_image 40 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 6T79 _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 100 _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ;At least 50% of the data were collected at 25* stage tilt in order to partially compensate for preferred orientation of particles on the grid, and to improve angular distribution. ; _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max 3500 _em_imaging.nominal_defocus_min 1000 _em_imaging.nominal_magnification 130000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details '0.39 mB, 25 mA' _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 300 _em_sample_support.grid_type 'Quantifoil R2/1' _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 289 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;The sample was applied onto glow-discharged Quantifoil holey carbon grids. The grids were blotted from both sides for 5-10 seconds at 16*C in a chamber at 100% humidity and plunge-frozen into liquid ethane using a manual plunger. ; _em_vitrification.humidity 100 _em_vitrification.instrument 'FEI VITROBOT MARK IV' _em_vitrification.entry_id 6T79 _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 6T79 _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 6T79 _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry C1 # _pdbx_validate_close_contact.id 1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num 1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 OE1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 C _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 GLU _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 61 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 ? _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 CD2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 D _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 LEU _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 103 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 ? _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 ? _pdbx_validate_close_contact.dist 2.18 # loop_ _pdbx_validate_rmsd_angle.id _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_model_num _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_1 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_2 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_atom_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_asym_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_comp_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.auth_seq_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.PDB_ins_code_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.label_alt_id_3 _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_target_value _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.angle_standard_deviation _pdbx_validate_rmsd_angle.linker_flag 1 1 "O4'" I DT 54 ? ? 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A GLY 13 14 1 Y 1 A GLY 13 ? A GLY 14 15 1 Y 1 A LYS 14 ? A LYS 15 16 1 Y 1 A ALA 15 ? A ALA 16 17 1 Y 1 A PRO 16 ? A PRO 17 18 1 Y 1 A ARG 17 ? A ARG 18 19 1 Y 1 A LYS 18 ? A LYS 19 20 1 Y 1 A GLN 19 ? A GLN 20 21 1 Y 1 A LEU 20 ? A LEU 21 22 1 Y 1 A ALA 21 ? A ALA 22 23 1 Y 1 A THR 22 ? A THR 23 24 1 Y 1 A LYS 23 ? A LYS 24 25 1 Y 1 A ALA 24 ? A ALA 25 26 1 Y 1 A ALA 25 ? A ALA 26 27 1 Y 1 A ARG 26 ? A ARG 27 28 1 Y 1 A LYS 27 ? A LYS 28 29 1 Y 1 A SER 28 ? A SER 29 30 1 Y 1 A ALA 29 ? A ALA 30 31 1 Y 1 A PRO 30 ? A PRO 31 32 1 Y 1 A ALA 31 ? A ALA 32 33 1 Y 1 A THR 32 ? A THR 33 34 1 Y 1 A GLY 33 ? A GLY 34 35 1 Y 1 A GLY 34 ? A GLY 35 36 1 Y 1 A VAL 35 ? A VAL 36 37 1 Y 1 A LYS 36 ? A LYS 37 38 1 Y 1 A ALA 135 ? A ALA 136 39 1 Y 1 B MET 0 ? B MET 1 40 1 Y 1 B SER 1 ? B SER 2 41 1 Y 1 B GLY 2 ? B GLY 3 42 1 Y 1 B ARG 3 ? B ARG 4 43 1 Y 1 B GLY 4 ? B GLY 5 44 1 Y 1 B LYS 5 ? B LYS 6 45 1 Y 1 B GLY 6 ? B GLY 7 46 1 Y 1 B GLY 7 ? B GLY 8 47 1 Y 1 B LYS 8 ? B LYS 9 48 1 Y 1 B GLY 9 ? 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F LYS 13 182 1 Y 1 F GLY 13 ? F GLY 14 183 1 Y 1 F GLY 14 ? F GLY 15 184 1 Y 1 F ALA 15 ? F ALA 16 185 1 Y 1 G MET -21 ? G MET 1 186 1 Y 1 G GLY -20 ? G GLY 2 187 1 Y 1 G SER -19 ? G SER 3 188 1 Y 1 G SER -18 ? G SER 4 189 1 Y 1 G HIS -17 ? G HIS 5 190 1 Y 1 G HIS -16 ? G HIS 6 191 1 Y 1 G HIS -15 ? G HIS 7 192 1 Y 1 G HIS -14 ? G HIS 8 193 1 Y 1 G HIS -13 ? G HIS 9 194 1 Y 1 G HIS -12 ? G HIS 10 195 1 Y 1 G GLU -11 ? G GLU 11 196 1 Y 1 G ASN -10 ? G ASN 12 197 1 Y 1 G LEU -9 ? G LEU 13 198 1 Y 1 G TYR -8 ? G TYR 14 199 1 Y 1 G PHE -7 ? G PHE 15 200 1 Y 1 G GLN -6 ? G GLN 16 201 1 Y 1 G SER -5 ? G SER 17 202 1 Y 1 G ASN -4 ? G ASN 18 203 1 Y 1 G ALA -3 ? G ALA 19 204 1 Y 1 G PRO -2 ? G PRO 20 205 1 Y 1 G TRP -1 ? G TRP 21 206 1 Y 1 G MET 0 ? G MET 22 207 1 Y 1 G SER 1 ? G SER 23 208 1 Y 1 G GLY 2 ? G GLY 24 209 1 Y 1 G ARG 3 ? G ARG 25 210 1 Y 1 G GLY 4 ? G GLY 26 211 1 Y 1 G LYS 5 ? G LYS 27 212 1 Y 1 G GLN 6 ? G GLN 28 213 1 Y 1 G GLY 7 ? G GLY 29 214 1 Y 1 G GLY 8 ? 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DTT # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_molwt.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_molwt.id 1 _em_entity_assembly_molwt.experimental_flag NO _em_entity_assembly_molwt.units MEGADALTONS _em_entity_assembly_molwt.value 0.205 # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 2 2 ? ? 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? 3 3 ? ? 32630 ? ? 'synthetic construct' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 2 2 ? 469008 'Escherichia coli BL21(DE3)' ? ? 3 3 ? 32630 'synthetic construct' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 1.125 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged 1 _em_image_recording.num_real_images ? # _em_imaging_optics.id 1 _em_imaging_optics.imaging_id 1 _em_imaging_optics.chr_aberration_corrector ? _em_imaging_optics.energyfilter_lower ? _em_imaging_optics.energyfilter_name 'GIF Bioquantum' _em_imaging_optics.energyfilter_upper ? _em_imaging_optics.energyfilter_slit_width 30 _em_imaging_optics.phase_plate ? _em_imaging_optics.sph_aberration_corrector ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? Gautomatch ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? EPU ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? Gctf ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 10 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? RELION ? 1 ? ? 11 CLASSIFICATION ? RELION ? 1 ? ? 12 RECONSTRUCTION ? RELION ? 1 ? ? 13 'MODEL REFINEMENT' ? PHENIX ? ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 0.15 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _em_volume_selection.id 1 _em_volume_selection.details '1733 vesicles and near-complete buds were picked from 61 tomograms. Subtomograms were extracted from the surface of the vesicles.' _em_volume_selection.image_processing_id 1 _em_volume_selection.method ? _em_volume_selection.num_tomograms 54 _em_volume_selection.num_volumes_extracted 2547 _em_volume_selection.reference_model ? # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6T79 'double helix' 6T79 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 I DA 1 1_555 J DT 147 1_555 0.050 -0.183 -0.519 -3.204 0.874 2.401 1 I_DA1:DT145_J I 1 ? 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