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10 ;MRSGDAEIKGIKPKVIEEYSLSQGSGPSNDSWKSLMSSAKDTPLQYDHMNRESLKKYFNPNAQLIEDPLDKPIQYRVCEK CGKPLALTAIVDHLENHCAGASGKSSTDPRDESTRETIRNGVESTGRNNNDDDNSNDNNNDDDDDDDNDDNEDDDDADDD DDNSNGANYKKNDSSFNPLKRSTSMESANTPNMDTKRSKTGTPQTFSSSIKKQKKVKQRNPTEKHLIDFNKQCGVELPEG GYCARSLTCKSHSMGAKRAVSGRSKPYDVLLADYHREHQTKIGAAAEKRAKQQELQKLQKQIQKEQKKHTQQQKQGQRSK QRNVNGGKSAKNGGKSTVHNGNNINEIGHVNLTPEEETTQVLNGVSRSFPLPLESTVLSSVRYRTKYFRMREMFASSFSV KPGYTSPGYGAIHSRVGCLDLDRTTDYKFRVRTPQPINHLTNQNLNPKQIQRLQQQRALQAQLLSQQQQQQQQQQQHHSP QAQAQASTQQPTQGMVPNHFPGGATNSSFNANVSSKQIQQQQQQQQHKSQDTGLTPLEIQSQQQKLRQQQLQQQKFEAAA SYLANATKLMQESNQDSHLSGTHNNNSSKNGNNNLMTMKASISSPNTSVNSIQSPPSVNSVNGSGQGVSTGINVSGNNGR IEVGIGNSVNPYNGRIN ; 1 11 UNP TRA1_YEAST P38811 ? 11 ;MSLTEQIEQFASRFRDDDATLQSRYSTLSELYDIMELLNSPEDYHFFLQAVIPLLLNQLKEVPISYDAHSPEQKLRNSML DIFNRCLMNQTFQPYAMEVLEFLLSVLPKENEENGILCMKVLTTLFKSFKSILQDKLDSFIRIIIQIYKNTPNLINQTFY EAGKAEQGDLDSPKEPQADELLDEFSKNDEEKDFPSKQSSTEPRFENSTSSNGLRSSMFSFKILSECPITMVTLYSSYKQ LTSTSLPEFTPLIMNLLNIQIKQQQEAREQAESRGEHFTSISTEIINRPAYCDFILAQIKATSFLAYVFIRGYAPEFLQD YVNFVPDLIIRLLQDCPSELSSARKELLHATRHILSTNYKKLFLPKLDYLFDERILIGNGFTMHETLRPLAYSTVADFIH NIRSELQLSEIEKTIKIYTGYLLDESLALTVQIMSAKLLLNLVERILKLGKENPQEAPRAKKLLMIIIDSYMNRFKTLNR QYDTIMKYYGRYETHKKEKAEKLKNSIQDNDKESEEFMRKVLEPSDDDHLMPQPKKEDINDSPDVEMTESDKVVKNDVEM FDIKNYAPILLLPTPTNDPIKDAFYLYRTLMSFLKTIIHDLKVFNPPPNEYTVANPKLWASVSRVFSYEEVIVFKDLFHE CIIGLKFFKDHNEKLSPETTKKHFDISMPSLPVSATKDARELMDYLAFMFMQMDNATFNEIIEQELPFVYERMLEDSGLL HVAQSFLTSEITSPNFAGILLRFLKGKLKDLGNVDFNTSNVLIRLFKLSFMSVNLFPNINEVVLLPHLNDLILNSLKYST TAEEPLVYFYLIRTLFRSIGGGRFENLYRSIKPILQVLLQSLNQMILTARLPHERELYVELCITVPVRLSVLAPYLPFLM KPLVFALQQYPDLVSQGLRTLELCIDNLTAEYFDPIIEPVIDDVSKALFNLLQPQPFNHAISHNVVRILGKLGGRNRQFL KPPTDLTEKTELDIDAIADFKINGMPEDVPLSVTPGIQSALNILQSYKSDIHYRKSAYKYLTCVLLLMTKSSAEFPTNYT ELLKTAVNSIKLERIGIEKNFDLEPTVNKRDYSNQENLFLRLLESVFYATSIKELKDDAMDLLNNLLDHFCLLQVNTTLL NKRNYNGTFNIDLKNPNFMLDSSLILDAIPFALSYYIPEVREVGVLAYKRIYEKSCLIYGEELALSHSFIPELAKQFIHL CYDETYYNKRGGVLGIKVLIDNVKSSSVFLKKYQYNLANGLLFVLKDTQSEAPSAITDSAEKLLIDLLSITFADVKEEDL GNKVLENTLTDIVCELSNANPKVRNACQKSLHTISNLTGIPIVKLMDHSKQFLLSPIFAKPLRALPFTMQIGNVDAITFC LSLPNTFLTFNEELFRLLQESIVLADAEDESLSTNIQKTTEYSTSEQLVQLRIACIKLLAIALKNEEFATAQQGNIRIRI LAVFFKTMLKTSPEIINTTYEALKGSLAENSKLPKELLQNGLKPLLMNLSDHQKLTVPGLDALSKLLELLIAYFKVEIGR KLLDHLTAWCRVEVLDTLFGQDLAEQMPTKIIVSIINIFHLLPPQADMFLNDLLLKVMLLERKLRLQLDSPFRTPLARYL NRFHNPVTEYFKKNMTLRQLVLFMCNIVQRPEAKELAEDFEKELDNFYDFYISNIPKNQVRVVSFFTNMVDLFNTMVITN GDEWLKKKGNMILKLKDMLNLTLKTIKENSFYIDHLQLNQSIAKFQALYLRFTELSERDQNPLLLDFIDFSFSNGIKASY SLKKFIFHNIIASSNKEKQNNFINDATLFVLSDKCLDARIFVLKNVINSTLIYEVATSGSLKSYLVEDKKPKWLELLHNK IWKNSNAILAYDVLDHHDLFRFELLQLSAIFIKADPEIIAEIKKDIIKFCWNFIKLEDTLIKQSAYLVTSYFISKFDFPI KVVTQVFVALLRSSHVEARYLVKQSLDVLTPVLHERMNAAGTPDTWINWVKRVMVENSSSQNNILYQFLISHPDLFFNSR DLFISNIIHHMNKITFMSNSNSDSHTLAIDLASLILYWENKTLEITNVNNTKTDSDGDVVMSDSKSDINPVEADTTAIIV DANNNSPISLHLREACTAFLIRYVCASNHRAIETELGLRAINILSELISDKHWTNVNVKLVYFEKFLIFQDLDSENILYY CMNALDVLYVFFKNKTKEWIMENLPTIQNLLEKCIKSDHHDVQEALQKVLQVIMKAIKAQGVSVIIEEESPGKTFIQMLT SVITQDLQETSSVTAGVTLAWVLFMNFPDNIVPLLTPLMKTFSKLCKDHLSISQPKDAMALEEARITTKLLEKVLYILSL KVSLLGDSRRPFLSTVALLIDHSMDQNFLRKIVNMSRSWIFNTEIFPTVKEKAAILTKMLAFEIRGEPSLSKLFYEIVLK LFDQEHFNNTEITVRMEQPFLVGTRVEDIGIRKRFMTILDNSLERDIKERLYYVIRDQNWEFIADYPWLNQALQLLYGSF NREKELSLKNIYCLSPPSILQEYLPENAEMVTEVNDLELSNFVKGHIASMQGLCRIISSDFIDSLIEIFYQDPKAIHRAW VTLFPQVYKSIPKNEKYGFVRSIITLLSKPYHTRQISSRTNVINMLLDSISKIESLELPPHLVKYLAISYNAWYQSINIL ESIQSNTSIDNTKIIEANEDALLELYVNLQEEDMFYGLWRRRAKYTETNIGLSYEQIGLWDKAQQLYEVAQVKARSGALP YSQSEYALWEDNWIQCAEKLQHWDVLTELAKHEGFTDLLLECGWRVADWNSDRDALEQSVKSVMDVPTPRRQMFKTFLAL QNFAESRKGDQEVRKLCDEGIQLSLIKWVSLPIRYTPAHKWLLHGFQQYMEFLEATQIYANLHTTTVQNLDSKAQEIKRI LQAWRDRLPNTWDDVNMWNDLVTWRQHAFQVINNAYLPLIPALQQSNSNSNINTHAYRGYHEIAWVINRFAHVARKHNMP DVCISQLARIYTLPNIEIQEAFLKLREQAKCHYQNMNELTTGLDVISNTNLVYFGTVQKAEFFTLKGMFLSKLRAYEEAN QAFATAVQIDLNLAKAWAQWGFFNDRRLSEEPNNISFASNAISCYLQAAGLYKNSKIRELLCRILWLISIDDASGMLTNA FDSFRGEIPVWYWITFIPQLLTSLSHKEANMVRHILIRIAKSYPQALHFQLRTTKEDFAVIQRQTMAVMGDKPDTNDRNG RRQPWEYLQELNNILKTAYPLLALSLESLVAQINDRFKSTTDEDLFRLINVLLIDGTLNYNRLPFPRKNPKLPENTEKNL VKFSTTLLAPYIRPKFNADFIDNKPDYETYIKRLRYWRRRLENKLDRASKKENLEVLCPHLSNFHHQKFEDIEIPGQYLL NKDNNVHFIKIARFLPTVDFVRGTHSSYRRLMIRGHDGSVHSFAVQYPAVRHSRREERMFQLYRLFNKSLSKNVETRRRS IQFNLPIAIPLSPQVRIMNDSVSFTTLHEIHNEFCKKKGFDPDDIQDFMADKLNAAHDDALPAPDMTILKVEIFNSIQTM FVPSNVLKDHFTSLFTQFEDFWLFRKQFASQYSSFVFMSYMMMINNRTPHKIHVDKTSGNVFTLEMLPSRFPYERVKPLL KNHDLSLPPDSPIFHNNEPVPFRLTPNIQSLIGDSALEGIFAVNLFTISRALIEPDNELNTYLALFIRDEIISWFSNLHR PIIENPQLREMVQTNVDLIIRKVAQLGHLNSTPTVTTQFILDCIGSAVSPRNLARTDVNFMPWF ; 1 12 PDB 6T9I 6T9I ? 12 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6T9I B 1 ? 604 ? 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'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6T9I _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6T9I _struct.title 'cryo-EM structure of transcription coactivator SAGA' _struct.pdbx_descriptor ;Transcription factor SPT20, Protein SPT3, Transcription initiation factor TFIID subunit 5, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, Transcription initiation factor TFIID subunit 10, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, Transcription initiation factor TFIID subunit 12, Transcriptional activator SPT7, SAGA-associated factor 73, Transcription-associated protein 1, unassigned sequence ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6T9I _struct_keywords.text 'Coactivator, Transcription, Histone acetyltransferase, Histone deubiquitinase, GENE REGULATION' _struct_keywords.pdbx_keywords 'GENE REGULATION' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 9 ? J N N 10 ? K N N 11 ? L N N 12 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ALA A 123 ? TYR A 130 ? ALA B 123 TYR B 130 1 ? 8 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 178 ? LEU A 183 ? THR B 178 LEU B 183 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 GLU A 184 ? VAL A 186 ? GLU B 184 VAL B 186 5 ? 3 HELX_P HELX_P4 AA4 ILE A 195 ? ASN A 203 ? 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