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_audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Alcon, P.' 1 0000-0002-7435-3859 'Shakeel, S.' 2 0000-0003-3651-6087 'Passmore, L.A.' 3 0000-0003-1815-3710 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nat.Struct.Mol.Biol. _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1545-9985 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 27 _citation.language ? _citation.page_first 240 _citation.page_last 248 _citation.title 'FANCD2-FANCI is a clamp stabilized on DNA by monoubiquitination of FANCD2 during DNA repair.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41594-020-0380-1 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GCGCACCAAGAGATACGCGGTCGAATGCCGAGTAGCCATCAGCG X2: ACCATGCAGCTACTCGGCATTCGACCGCGTATCTGGCGACTACG X3: TATCTCTTGGTGCGC X4: CGCTGATGGCTACTC X5: CGTAGTCGCCAGATA X6: GAGTAGCTGCATGGT ; # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;MVSKRKLSKIDAAEESSKTDLQSRCPETKRSRISDKRAPSQGGLENEGVFEELLRTSGIILKVGEGQNEIAVDQTAFQKK LRVALEKHPSYPGVVNEFISGLESHIKDRSQFKNCLLPCTPARTEGSRTLVHSYCESLIKLLLGIKILQPAVVTLLLEKI PEFFFDVVGTFGTNFPRLIVNQFKWLDGLLDSQDLVKKLMQMLSVSPVPIQHDIITSLPEILEDSQQNEVARELSCLLKQ GRRLTVPILDALSRLDLDAELLAKVRQSAMTIVPSVKLEDLPVVIKFILHNVKAADAVEVISDLRKSLDLSSCVLPLQLL GSQRKLKSQAQASSSMSQVTTSQNCVKLLFDVIKLAVRFQKDVSEAWIKAIENSTSVSDHKVLDLIVLLLIHSTNSKNRK QTEKVLRSKIRLGCMPEQLMQNAFQNHSMVIKDFFPSILSLAQTFLHSAHPAVVSFGSCMYKQAFAVFDSYCQQEVVCAL 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;MAQRILQLAAEGSPERLQEALQGLTEGELGDMVTRQALRGRETAALLKGIFKGSPCSQQSGVLRRLQVYKHCVSLVESGD LHVGKVSEIIGLLMLEARQLPGHALAELATLFVEVIKRGSLSNGKSLELFSTVLTALSNSKESLAYGKGELNGEEFKKQL INTLCSSKWDPQCVIHLANMFRDIPLSGEELQFVVEKVLRMFSKLDLQEIPPLVYQLLLLSAKGSKKTVLEGIISFFNQL DKRQKEEQRVPQSADLEVATVPLDQLRHVEGTVILHIVSAINLDQDIGEELIKHLKTEQQKDPGKALCPFSVSLLLSTAV KHRLQEQIFDFLKTSITRSCKDLQILQASKFLQDLCPQQYDVTAVILEVVKNSAFGWDHVTQGLVDLGFSLMESYEPKKS FGGKAAETNLGLSKMPAQQACKLGASILLETFKVHEPIRSDILEQVLNRVLTKAASPVSHFIDLLSNIVVSAPLVLQNSS SRVTETFDNLSFLPIDTVQGLLRAVQPLLKVSMSVRDSLILVLQKAIFSRQLDARKAAVAGFLLLLRNFKILGSLTSSQC SQAIGATQVQADVHACYNSAANEAFCLEILGSLRRCLSQQADVRLMLYEGFYDVLRRNSQLASSIMETLLSQIKQYYLPQ QDLLPPLKLEGCIMAQGDQIFLQEPLAHLLCCIQHCLAWYKSTVHLCKGAEDEEEEEDVGFEQNFEEMLESVTRRMIKSE LEDFELDKSADFSPSSGVGVKNNIYAIQVMGICEVLIEYNFKIGNFSKNKFEDVLGLFTCYNKLSEILKEKAGKNKSTLG NRIARSFLSMGFVSTLLTALFRDNAQSHEESLAVLRSSTEFMRYAVSVALQKVQQLEEMGQTDGPDGQNPEKMFQNLCKI TRVLLWRYTSIPTAVEESGKKKGKSISLLCLEGLLRIFNTMQQLYAARIPQFLQALDITDGDAEEADINVTEKAAFQIRQ 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # _pdbx_entity_src_syn.entity_id 4 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag sample _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num 1 _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num 33 _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific 'synthetic construct' _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name ? _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id 32630 _pdbx_entity_src_syn.details ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP F1NP22_CHICK F1NP22 ? 1 ;MVSKRKLSKIDAAEESSKTDLQSRCPETKRSRISDKRAPSQGGLENEGVFEELLRTSGIILKVGEGQNEIAVDQTAFQKK LRVALEKHPSYPGVVNEFISGLESHIKDRSQFKNCLLPCTPARTEGSRTLVHSYCESLIKLLLGIKILQPAVVTLLLEKI PEFFFDVVGTFGTNFPRLIVNQFKWLDGLLDSQDLVKKLMQMLSVSPVPIQHDIITSLPEILEDSQQNEVARELSCLLKQ GRRLTVPILDALSRLDLDAELLAKVRQSAMTIVPSVKLEDLPVVIKFILHNVKAADAVEVISDLRKSLDLSSCVLPLQLL GSQRKLKSQAQASSSMSQVTTSQNCVKLLFDVIKLAVRFQKDVSEAWIKAIENSTSVSDHKVLDLIVLLLIHSTNSKNRK QTEKVLRSKIRLGCMPEQLMQNAFQNHSMVIKDFFPSILSLAQTFLHSAHPAVVSFGSCMYKQAFAVFDSYCQQEVVCAL VTHVCSGNETELDISLDVLTDLVILHPSLLLRYATFVKTILDSMQKLNPCQIRKLFYILSTLAFSQRQEGSYIQDDMHMV IRKWLSSSVPNHKQMGIIGAVTMMGSVALKRNEADGGLLERPELSIECDGQLSTLLDLVGFCCEQTPEVLALYYDELANL IEKQKGNLDLQLLDKFGKSLVEDFPNDFVVDLSPTVDGSFLFPVKSLYNLDEDETQGAIAINLLPLVSQSEPGRVADEMS NSRKRVVSPICLSPCFRLLRLYTGEQNNGSLEEIDALLGCPLYLTDLEVEGKLDSLSKQEREFLCSLLFYALNWFREVVN AFCQQQDAEMKGKVLTRLQNITELQNVLGKCLAATPGYVPPPATFDSEAPEGVPSINAGGPVRKKNGKKRKSDSSKACSA ERTQADESSDGNQPDTELSELEKSAAEKETGNPLAQLQSYRPYFRELDLEVFSVLHCGLLTKSILDTEMHTEASEVVQLG PAELCFLLDDMCWKLEHVLTPGSTRRVPFLKERGNKDVGFSHLCQRSPKEVAVCVVKLLKPLCNHMENMHNYFQTVIPNQ GVVDESGLNIQEYQLMSSCYHQLLLAFRLLFAWSGFSQHENSNLLRSALQVLADRLKPGETEFLPLEELISESFQYLLNF QASIPSFQCAFILTQVLMAISEKPMTGWKREKMASLAKQFLCQSWMKPGGDREKGSHFNSALHTLLCVYLEHTDNILKAI EEISSVGVPELINSAKDGCSSTYPTLSRQTFPVFFRVMMAQLESSVKSIPAGKPSDSGEVQLEKLLKWNIAVRNFHILIN LVKVFDSRPVLSICLKYGRLFVEAFLKLAMPLLDHSFKKHRDDVQSLLKTLQLSTRQLHHMCGHSKIHQDLGLTNHVPLL KKSLEQFVYRVKAMLAFNHCQEAFWVGVLKNRDLQGEEILSQASAAPEEDSAEGSEEDTEDSAAEEPDGTDSDSGGGG ; 1 2 UNP B0I564_CHICK B0I564 ? 2 ;MAQRILQLAAEGSPERLQEALQGLTEGELGDMVTRQALRGRETAALLKGIFKGSPCSQQSGVLRRLQVYKHCVSLVESGD LHVGKVSEIIGLLMLEARQLPGHALAELATLFVEVIKRGSLSNGKSLELFSTVLTALSNSKESLAYGKGELNGEEFKKQL INTLCSSKWDPQCVIHLANMFRDIPLSGEELQFVVEKVLRMFSKLDLQEIPPLVYQLLLLSAKGSKKTVLEGIISFFNQL DKRQKEEQRVPQSADLEVATVPLDQLRHVEGTVILHIVSAINLDQDIGEELIKHLKTEQQKDPGKALCPFSVSLLLSTAV KHRLQEQIFDFLKTSITRSCKDLQILQASKFLQDLCPQQYDVTAVILEVVKNSAFGWDHVTQGLVDLGFSLMESYEPKKS FGGKAAETNLGLSKMPAQQACKLGASILLETFKVHEPIRSDILEQVLNRVLTKAASPVSHFIDLLSNIVVSAPLVLQNSS SRVTETFDNLSFLPIDTVQGLLRAVQPLLKVSMSVRDSLILVLQKAIFSRQLDARKAAVAGFLLLLRNFKILGSLTSSQC SQAIGATQVQADVHACYNSAANEAFCLEILGSLRRCLSQQADVRLMLYEGFYDVLRRNSQLASSIMETLLSQIKQYYLPQ QDLLPPLKLEGCIMAQGDQIFLQEPLAHLLCCIQHCLAWYKSTVHLCKGAEDEEEEEDVGFEQNFEEMLESVTRRMIKSE LEDFELDKSADFSPSSGVGVKNNIYAIQVMGICEVLIEYNFKIGNFSKNKFEDVLGLFTCYNKLSEILKEKAGKNKSTLG NRIARSFLSMGFVSTLLTALFRDNAQSHEESLAVLRSSTEFMRYAVSVALQKVQQLEEMGQTDGPDGQNPEKMFQNLCKI TRVLLWRYTSIPTAVEESGKKKGKSISLLCLEGLLRIFNTMQQLYAARIPQFLQALDITDGDAEEADINVTEKAAFQIRQ FQRSLVNQLSSAEDDFNSKETQLLITILSTLSKLLDPGSQQFLQFLTWTVKICKENALEDLSCCKGLLTLLFSLHVLYKS PVSLLRELAQDIHACLGDIDQDVEIESRSHFAIVNVKTAAPTVCLLVLGQADKVLEEVDWLIKRLTILGSDTSEDSTQAS NQTQALEKGVILQLGTLLTVFHELVQTALPAGSCVDSLLRSLSKTYAILTSLIKHYIQACRSTSNTVPGRLEKLVKLSGS HLTPQCYSFITYVQNIHSESLSFAEEKKKKKKEDETAVVSTVMAKVLRDTKPIPNLIFAIEQYEKFLIHLSKKSKVNLMQ YMKLSTSRDFRINASMLDSVLQEQNTEDAENEPDNNQSGTAEQPDENQEPQKKRRRKK ; 1 3 UNP UBC_HUMAN P0CG48 ? 3 MQIFVKTLTGKTITLEVEPSDTIENVKAKIQDKEGIPPDQQRLIFAGKQLEDGRTLSDYNIQKESTLHLVLRLRGG 1 4 PDB 6TNF 6TNF ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6TNF A 1 ? 1438 ? 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'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 DN 'DNA linking' . ;UNKNOWN 2'-DEOXYNUCLEOTIDE ; ? 'C5 H11 O6 P' 198.111 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 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B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 4 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 VAL A 49 ? LEU A 54 ? VAL A 49 LEU A 54 1 ? 6 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 75 ? ALA A 84 ? THR A 75 ALA A 84 1 ? 10 HELX_P HELX_P3 AA3 PRO A 92 ? SER A 104 ? PRO A 92 SER A 104 1 ? 13 HELX_P HELX_P4 AA4 HIS A 105 ? ASP A 108 ? HIS A 105 ASP A 108 5 ? 4 HELX_P HELX_P5 AA5 ARG A 109 ? ASN A 114 ? ARG A 109 ASN A 114 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 ILE A 147 ? ILE A 160 ? ILE A 147 ILE A 160 1 ? 14 HELX_P HELX_P7 AA7 PHE A 175 ? GLN A 182 ? PHE A 175 GLN A 182 1 ? 8 HELX_P HELX_P8 AA8 ASP A 191 ? MET A 202 ? ASP A 191 MET A 202 1 ? 12 HELX_P HELX_P9 AA9 PRO A 207 ? LEU A 218 ? PRO A 207 LEU A 218 1 ? 12 HELX_P HELX_P10 AB1 GLN A 226 ? LEU A 238 ? GLN A 226 LEU A 238 1 ? 13 HELX_P HELX_P11 AB2 LEU A 244 ? LEU A 255 ? LEU A 244 LEU A 255 1 ? 12 HELX_P HELX_P12 AB3 GLU A 260 ? MET A 270 ? GLU A 260 MET A 270 1 ? 11 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU A 279 ? ASN A 291 ? GLU A 279 ASN A 291 1 ? 13 HELX_P HELX_P14 AB5 ASP A 296 ? LEU A 308 ? ASP A 296 LEU A 308 1 ? 13 HELX_P HELX_P15 AB6 SER A 342 ? ALA A 356 ? SER A 342 ALA A 356 1 ? 15 HELX_P HELX_P16 AB7 LYS A 361 ? GLU A 372 ? LYS A 361 GLU A 372 1 ? 12 HELX_P HELX_P17 AB8 LYS A 381 ? ILE A 391 ? LYS A 381 ILE A 391 1 ? 11 HELX_P HELX_P18 AB9 ARG A 399 ? ARG A 407 ? ARG A 399 ARG A 407 1 ? 9 HELX_P HELX_P19 AC1 ARG A 407 ? LEU A 412 ? ARG A 407 LEU A 412 1 ? 6 HELX_P HELX_P20 AC2 LEU A 419 ? HIS A 427 ? LEU A 419 HIS A 427 1 ? 9 HELX_P HELX_P21 AC3 SER A 428 ? ASP A 433 ? SER A 428 ASP A 433 1 ? 6 HELX_P HELX_P22 AC4 PHE A 434 ? LEU A 446 ? PHE A 434 LEU A 446 1 ? 13 HELX_P HELX_P23 AC5 HIS A 450 ? PHE A 468 ? HIS A 450 PHE A 468 1 ? 19 HELX_P HELX_P24 AC6 CYS A 472 ? VAL A 477 ? CYS A 472 VAL A 477 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 CYS A 478 ? HIS A 483 ? CYS A 478 HIS A 483 1 ? 6 HELX_P HELX_P26 AC8 ASN A 488 ? HIS A 506 ? ASN A 488 HIS A 506 1 ? 19 HELX_P HELX_P27 AC9 TYR A 513 ? ILE A 520 ? TYR A 513 ILE A 520 1 ? 8 HELX_P HELX_P28 AD1 GLN A 531 ? PHE A 544 ? GLN A 531 PHE A 544 1 ? 14 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY A 550 ? LEU A 565 ? GLY A 550 LEU A 565 1 ? 16 HELX_P HELX_P30 AD3 ASN A 571 ? ALA A 588 ? ASN A 571 ALA A 588 1 ? 18 HELX_P HELX_P31 AD4 GLU A 607 ? GLY A 620 ? GLU A 607 GLY A 620 1 ? 14 HELX_P HELX_P32 AD5 PHE A 621 ? THR A 626 ? PHE A 621 THR A 626 1 ? 6 HELX_P HELX_P33 AD6 THR A 626 ? LYS A 643 ? 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GLU C 24 GLU C 34 1 ? 11 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order covale1 covale both ? 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