data_6U0N # _entry.id 6U0N # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.329 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6U0N WWPDB D_1000243685 EMDB EMD-20608 # loop_ _pdbx_database_related.db_name _pdbx_database_related.details _pdbx_database_related.db_id _pdbx_database_related.content_type PDB '6U0L is the same complex, but adopts a different conformation' 6U0L unspecified EMDB 'Asymmetrically open conformational state A of HIV-1 Env trimer BG505 SOSIP.664 in complex with sCD4 and E51 Fab' EMD-20608 'associated EM volume' EMDB . EMD-20605 'other EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6U0N _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2019-08-14 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible Y _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Yang, Z.' 1 0000-0001-8680-3784 'Bjorkman, P.J.' 2 0000-0002-2277-3990 # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country US _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev Nat.Struct.Mol.Biol. _citation.journal_id_ASTM ? _citation.journal_id_CSD ? _citation.journal_id_ISSN 1545-9985 _citation.journal_full ? _citation.journal_issue ? _citation.journal_volume 26 _citation.language ? _citation.page_first 1167 _citation.page_last 1175 _citation.title 'Asymmetric opening of HIV-1 Env bound to CD4 and a coreceptor-mimicking antibody.' _citation.year 2019 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s41594-019-0344-5 _citation.pdbx_database_id_PubMed 31792452 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Yang, Z.' 1 ? primary 'Wang, H.' 2 ? primary 'Liu, A.Z.' 3 0000-0002-9387-0878 primary 'Gristick, H.B.' 4 ? primary 'Bjorkman, P.J.' 5 0000-0002-2277-3990 # _cell.angle_alpha 90.00 _cell.angle_alpha_esd ? _cell.angle_beta 90.00 _cell.angle_beta_esd ? _cell.angle_gamma 90.00 _cell.angle_gamma_esd ? _cell.entry_id 6U0N _cell.details ? _cell.formula_units_Z ? _cell.length_a 1.00 _cell.length_a_esd ? _cell.length_b 1.00 _cell.length_b_esd ? _cell.length_c 1.00 _cell.length_c_esd ? _cell.volume ? _cell.volume_esd ? _cell.Z_PDB ? _cell.reciprocal_angle_alpha ? _cell.reciprocal_angle_beta ? _cell.reciprocal_angle_gamma ? _cell.reciprocal_angle_alpha_esd ? _cell.reciprocal_angle_beta_esd ? _cell.reciprocal_angle_gamma_esd ? _cell.reciprocal_length_a ? _cell.reciprocal_length_b ? _cell.reciprocal_length_c ? _cell.reciprocal_length_a_esd ? _cell.reciprocal_length_b_esd ? _cell.reciprocal_length_c_esd ? _cell.pdbx_unique_axis ? # _symmetry.entry_id 6U0N _symmetry.cell_setting ? _symmetry.Int_Tables_number 1 _symmetry.space_group_name_Hall ? _symmetry.space_group_name_H-M 'P 1' _symmetry.pdbx_full_space_group_name_H-M ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation 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'polypeptide(L)' no no ;NLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIISLW DQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKEYR LINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEVMI RSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQAFYATGDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRKHF GNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAM YAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRVVGRRRRRR ; ;NLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIISLW DQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKEYR LINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEVMI RSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQAFYATGDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRKHF GNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAM YAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRVVGRRRRRR ; A,B,C ? 2 'polypeptide(L)' no no ;KKVVLGKKGDTVELTCTASQKKSIQFHWKNSNQIKILGNQGSFLTKGPSKLNDRADSRRSLWDQGNFPLIIKNLKIEDSD TYICEVEDQKEEVQLLVFGLTANSDTHLLQGQSLTLTLESPPGSSPSVQCRSPRGKNIQGGKTLSVSQLELQDSGTWTCT VLQNQKKVEFKIDIVVLAFQKAIDGRHHHHHH ; ;KKVVLGKKGDTVELTCTASQKKSIQFHWKNSNQIKILGNQGSFLTKGPSKLNDRADSRRSLWDQGNFPLIIKNLKIEDSD TYICEVEDQKEEVQLLVFGLTANSDTHLLQGQSLTLTLESPPGSSPSVQCRSPRGKNIQGGKTLSVSQLELQDSGTWTCT VLQNQKKVEFKIDIVVLAFQKAIDGRHHHHHH ; D,E,F ? 3 'polypeptide(L)' no yes ;EVQLVQSGAEVNKPGSSVKVSCQASGATLNSHAFSWVRQAPGQGLEWMAGIIPIFGSSHYAQKFRGRVTISADESTRTVY LHLRGLRSDDTAVYYCASNSIAGVAAAGD(TYS)AD(TYS)DGGYYYDMDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKST SGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRV EPK ; ;EVQLVQSGAEVNKPGSSVKVSCQASGATLNSHAFSWVRQAPGQGLEWMAGIIPIFGSSHYAQKFRGRVTISADESTRTVY LHLRGLRSDDTAVYYCASNSIAGVAAAGDYADYDGGYYYDMDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALG CLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPK ; H,I,P ? 4 'polypeptide(L)' no no ;QSILTQPPSVSAAPGQKVTISCSGSSSNIGNNDVSWYQQFPGTVPKLVIYENNERPSGIPDRFSGSKSGTSATLGITGLQ TGDEADYYCGTWDSSLSAVVFGGGSKVTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVK AGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPT ; ;QSILTQPPSVSAAPGQKVTISCSGSSSNIGNNDVSWYQQFPGTVPKLVIYENNERPSGIPDRFSGSKSGTSATLGITGLQ TGDEADYYCGTWDSSLSAVVFGGGSKVTVLGQPKAAPSVTLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPVK AGVETTTPSKQSNNKYAASSYLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTVAPT ; J,L,Q ? 5 'polypeptide(L)' no no ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAPEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAPEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; X,Y,Z ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ASN n 1 2 LEU n 1 3 TRP n 1 4 VAL n 1 5 THR n 1 6 VAL n 1 7 TYR n 1 8 TYR n 1 9 GLY n 1 10 VAL n 1 11 PRO n 1 12 VAL n 1 13 TRP n 1 14 LYS n 1 15 ASP n 1 16 ALA n 1 17 GLU n 1 18 THR n 1 19 THR n 1 20 LEU n 1 21 PHE n 1 22 CYS n 1 23 ALA n 1 24 SER n 1 25 ASP n 1 26 ALA n 1 27 LYS n 1 28 ALA n 1 29 TYR n 1 30 GLU n 1 31 THR n 1 32 GLU n 1 33 LYS n 1 34 HIS n 1 35 ASN n 1 36 VAL n 1 37 TRP n 1 38 ALA n 1 39 THR n 1 40 HIS n 1 41 ALA n 1 42 CYS n 1 43 VAL n 1 44 PRO n 1 45 THR n 1 46 ASP n 1 47 PRO n 1 48 ASN n 1 49 PRO n 1 50 GLN n 1 51 GLU n 1 52 ILE n 1 53 HIS n 1 54 LEU n 1 55 GLU n 1 56 ASN n 1 57 VAL n 1 58 THR n 1 59 GLU n 1 60 GLU n 1 61 PHE n 1 62 ASN n 1 63 MET n 1 64 TRP n 1 65 LYS n 1 66 ASN n 1 67 ASN n 1 68 MET n 1 69 VAL n 1 70 GLU n 1 71 GLN n 1 72 MET n 1 73 HIS n 1 74 THR n 1 75 ASP n 1 76 ILE n 1 77 ILE n 1 78 SER n 1 79 LEU n 1 80 TRP n 1 81 ASP n 1 82 GLN n 1 83 SER n 1 84 LEU n 1 85 LYS n 1 86 PRO n 1 87 CYS n 1 88 VAL n 1 89 LYS n 1 90 LEU n 1 91 THR n 1 92 PRO n 1 93 LEU n 1 94 CYS n 1 95 VAL n 1 96 THR n 1 97 LEU n 1 98 GLN n 1 99 CYS n 1 100 THR n 1 101 ASN n 1 102 VAL n 1 103 THR n 1 104 ASN n 1 105 ASN n 1 106 ILE n 1 107 THR n 1 108 ASP n 1 109 ASP n 1 110 MET n 1 111 ARG n 1 112 GLY n 1 113 GLU n 1 114 LEU n 1 115 LYS n 1 116 ASN n 1 117 CYS n 1 118 SER n 1 119 PHE n 1 120 ASN n 1 121 MET n 1 122 THR n 1 123 THR n 1 124 GLU n 1 125 LEU n 1 126 ARG n 1 127 ASP n 1 128 LYS n 1 129 LYS n 1 130 GLN n 1 131 LYS n 1 132 VAL n 1 133 TYR n 1 134 SER n 1 135 LEU n 1 136 PHE n 1 137 TYR n 1 138 ARG n 1 139 LEU n 1 140 ASP n 1 141 VAL n 1 142 VAL n 1 143 GLN n 1 144 ILE n 1 145 ASN n 1 146 GLU n 1 147 ASN n 1 148 GLN n 1 149 GLY n 1 150 ASN n 1 151 ARG n 1 152 SER n 1 153 ASN n 1 154 ASN n 1 155 SER n 1 156 ASN n 1 157 LYS n 1 158 GLU n 1 159 TYR n 1 160 ARG n 1 161 LEU n 1 162 ILE n 1 163 ASN n 1 164 CYS n 1 165 ASN n 1 166 THR n 1 167 SER n 1 168 ALA n 1 169 ILE n 1 170 THR n 1 171 GLN n 1 172 ALA n 1 173 CYS n 1 174 PRO n 1 175 LYS n 1 176 VAL n 1 177 SER n 1 178 PHE n 1 179 GLU n 1 180 PRO n 1 181 ILE n 1 182 PRO n 1 183 ILE n 1 184 HIS n 1 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'Human immunodeficiency virus 1' 11676 ? ? ? ? ? ? ? human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 'Biological sequence' 1 192 Human ? CD4 ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 'Biological sequence' 1 235 Human ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 'Biological sequence' 1 213 Human ? ? ? ? ? ? ? ? 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 'Biological sequence' 1 153 HIV-1 ? env ? ? ? ? ? ? 'Human immunodeficiency virus 1' 11676 ? ? ? ? ? ? ? human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q2N0S6_9HIV1 Q2N0S6 ? 1 ;NLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIISLW DQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKEYR LINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEVMI RSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQAFYATGDIIGDIRQAHCTVSKATWNETLGKVVKQLRKHF GNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAM YAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRAKRRVVGR ; 32 2 UNP CD4_HUMAN P01730 ? 2 ;KKVVLGKKGDTVELTCTASQKKSIQFHWKNSNQIKILGNQGSFLTKGPSKLNDRADSRRSLWDQGNFPLIIKNLKIEDSD TYICEVEDQKEEVQLLVFGLTANSDTHLLQGQSLTLTLESPPGSSPSVQCRSPRGKNIQGGKTLSVSQLELQDSGTWTCT VLQNQKKVEFKIDIVVLAFQKA ; 26 3 PDB 6U0N 6U0N ? 3 ? 1 4 PDB 6U0N 6U0N ? 4 ? 1 5 UNP Q2N0S6_9HIV1 Q2N0S6 ? 5 ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAIEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICTTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; 509 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6U0N A 1 ? 474 ? 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'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 TYS 'L-peptide linking' n O-SULFO-L-TYROSINE ? 'C9 H11 N O6 S' 261.252 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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RA N N 8 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 MET A 72 ? ASP A 81 ? MET A 104 ASP A 113 1 ? 10 HELX_P HELX_P2 AA2 LYS A 302 ? LYS A 318 ? LYS A 335 LYS A 351 1 ? 17 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP A 335 ? THR A 340 ? ASP A 368 THR A 373 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 MET A 441 ? SER A 447 ? MET A 475 SER A 481 1 ? 7 HELX_P HELX_P5 AA5 LYS B 33 ? ALA B 38 ? LYS B 65 ALA B 70 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 GLN B 71 ? SER B 78 ? 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ALA H 105 A ALA I 98 ALA I 100 5 ? 4 HELX_P HELX_P21 AC3 ARG K 87 ? THR K 91 ? ARG P 83 THR P 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P22 AC4 SER K 100 ? VAL K 104 ? SER P 96 VAL P 100 5 ? 5 HELX_P HELX_P23 AC5 GLN L 80 ? GLU L 84 ? GLN Q 79 GLU Q 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 GLY M 5 ? LEU M 12 ? GLY X 516 LEU X 523 1 ? 8 HELX_P HELX_P25 AC7 THR M 18 ? MET M 24 ? THR X 529 MET X 535 1 ? 7 HELX_P HELX_P26 AC8 THR M 25 ? LEU M 34 ? THR X 536 LEU X 545 1 ? 10 HELX_P HELX_P27 AC9 THR M 58 ? LYS M 63 ? THR X 569 LYS X 574 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 AD1 ALA M 67 ? GLY M 83 ? ALA X 578 GLY X 594 1 ? 17 HELX_P HELX_P29 AD2 ASN M 107 ? ILE M 111 ? ASN X 618 ILE X 622 5 ? 5 HELX_P HELX_P30 AD3 TRP M 117 ? LYS M 122 ? TRP X 628 LYS X 633 1 ? 6 HELX_P HELX_P31 AD4 ILE M 130 ? SER M 138 ? ILE X 641 SER X 649 1 ? 9 HELX_P HELX_P32 AD5 THR N 18 ? LEU N 26 ? THR Y 529 LEU Y 537 1 ? 9 HELX_P HELX_P33 AD6 THR N 27 ? ASN N 32 ? THR Y 538 ASN Y 543 1 ? 6 HELX_P HELX_P34 AD7 THR N 58 ? LYS N 63 ? THR Y 569 LYS Y 574 1 ? 6 HELX_P HELX_P35 AD8 LEU N 65 ? ARG N 77 ? LEU Y 576 ARG Y 588 1 ? 13 HELX_P HELX_P36 AD9 ASP N 78 ? TRP N 85 ? ASP Y 589 TRP Y 596 1 ? 8 HELX_P HELX_P37 AE1 SER N 109 ? ASN N 114 ? SER Y 620 ASN Y 625 1 ? 6 HELX_P HELX_P38 AE2 THR N 116 ? ILE N 124 ? THR Y 627 ILE Y 635 1 ? 9 HELX_P HELX_P39 AE3 TYR N 127 ? GLN N 147 ? TYR Y 638 GLN Y 658 1 ? 21 HELX_P HELX_P40 AE4 THR O 18 ? SER O 23 ? THR Z 529 SER Z 534 1 ? 6 HELX_P HELX_P41 AE5 GLN O 52 ? GLN O 64 ? GLN Z 563 GLN Z 575 1 ? 13 HELX_P HELX_P42 AE6 LEU O 65 ? TRP O 85 ? LEU Z 576 TRP Z 596 1 ? 21 HELX_P HELX_P43 AE7 THR O 116 ? ILE O 124 ? THR Z 627 ILE Z 635 1 ? 9 HELX_P HELX_P44 AE8 TYR O 127 ? GLU O 143 ? TYR Z 638 GLU Z 654 1 ? 17 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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B CYS 87 SG ? ? ? 1_555 B CYS 173 SG ? ? B CYS 119 B CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf11 disulf ? ? B CYS 94 SG ? ? ? 1_555 B CYS 164 SG ? ? B CYS 126 B CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf12 disulf ? ? B CYS 186 SG ? ? ? 1_555 B CYS 215 SG ? ? B CYS 218 B CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf13 disulf ? ? B CYS 196 SG ? ? ? 1_555 B CYS 207 SG ? ? B CYS 228 B CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf14 disulf ? ? B CYS 264 SG ? ? ? 1_555 B CYS 298 SG ? ? B CYS 296 B CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf15 disulf ? ? B CYS 345 SG ? ? ? 1_555 B CYS 411 SG ? ? B CYS 378 B CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf16 disulf ? ? B CYS 352 SG ? ? ? 1_555 B CYS 384 SG ? ? B CYS 385 B CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf17 disulf ? ? B CYS 467 SG ? ? ? 1_555 N CYS 94 SG ? ? B CYS 501 Y CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf18 disulf ? ? C CYS 87 SG ? ? ? 1_555 C CYS 173 SG ? ? C CYS 119 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf19 disulf ? ? C CYS 94 SG ? ? ? 1_555 C CYS 164 SG ? ? C CYS 126 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf20 disulf ? ? C CYS 186 SG ? ? ? 1_555 C CYS 215 SG ? ? C CYS 218 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf21 disulf ? ? C CYS 196 SG ? ? ? 1_555 C CYS 207 SG ? ? C CYS 228 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf22 disulf ? ? C CYS 264 SG ? ? ? 1_555 C CYS 298 SG ? ? C CYS 296 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? ? disulf23 disulf ? ? C CYS 345 SG ? ? ? 1_555 C CYS 411 SG ? ? C CYS 378 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf24 disulf ? ? C CYS 352 SG ? ? ? 1_555 C CYS 384 SG ? ? C CYS 385 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf25 disulf ? ? C CYS 467 SG ? ? ? 1_555 O CYS 94 SG ? ? C CYS 501 Z CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf26 disulf ? ? D CYS 16 SG ? ? ? 1_555 D CYS 84 SG ? ? D CYS 16 D CYS 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf27 disulf ? ? E CYS 16 SG ? ? ? 1_555 E CYS 84 SG ? ? E CYS 16 E CYS 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf28 disulf ? ? F CYS 16 SG ? ? ? 1_555 F CYS 84 SG ? ? F CYS 16 F CYS 84 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf29 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf30 disulf ? ? H CYS 22 SG ? ? ? 1_555 H CYS 96 SG ? ? I CYS 22 I CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf31 disulf ? ? I CYS 22 SG ? ? ? 1_555 I CYS 89 SG ? ? J CYS 23 J CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf32 disulf ? ? J CYS 22 SG ? ? ? 1_555 J CYS 89 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf33 disulf ? ? K CYS 22 SG ? ? ? 1_555 K CYS 96 SG A ? P CYS 22 P CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf34 disulf ? ? K CYS 22 SG ? ? ? 1_555 K CYS 96 SG B ? P CYS 22 P CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf35 disulf ? ? L CYS 22 SG ? ? ? 1_555 L CYS 89 SG ? ? Q CYS 23 Q CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf36 disulf ? ? M CYS 87 SG ? ? ? 1_555 M CYS 93 SG ? ? X CYS 598 X CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf37 disulf ? ? N CYS 87 SG ? ? ? 1_555 N CYS 93 SG ? ? Y CYS 598 Y CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf38 disulf ? ? O CYS 87 SG ? ? ? 1_555 O CYS 93 SG ? ? Z CYS 598 Z CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.017 ? ? covale1 covale one ? A ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? A ASN 88 A NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 202 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? A ASN 234 A NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? A ASN 262 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 276 G NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? A ASN 339 A NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 355 A NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 330 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? A ASN 363 A NAG 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 353 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? A ASN 386 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? A ASN 448 A NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? B ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? B ASN 88 B NAG 603 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? B ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? B ASN 262 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? B ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? B ASN 276 B NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? B ASN 263 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? B ASN 295 B NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? B ASN 299 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? B ASN 332 B NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? B ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? B ASN 339 B NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? B ASN 330 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? B ASN 363 B NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? B ASN 353 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? B ASN 386 B NAG 602 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? B ASN 359 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? B ASN 392 B NAG 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? B ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? B ASN 448 B NAG 601 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? C ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? C ASN 88 C NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? C ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? C ASN 262 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? C ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? C ASN 276 C NAG 606 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? C ASN 263 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? C ASN 295 C NAG 607 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? C ASN 299 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? C ASN 332 C NAG 608 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? C ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? C ASN 339 C NAG 610 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? C ASN 330 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? C ASN 363 C NAG 609 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? C ASN 353 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? C ASN 386 C NAG 612 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? C ASN 359 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? C ASN 392 C NAG 614 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? C ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? C ASN 448 C NAG 611 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale30 covale both ? G ASP 109 C ? E ? 1_555 G TYS 110 N ? F H ASP 100 H TYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale31 covale both ? G TYS 110 C ? F ? 1_555 G ALA 111 N ? G H TYS 100 H ALA 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale32 covale both ? G ASP 112 C ? H ? 1_555 G TYS 113 N ? I H ASP 100 H TYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale33 covale both ? G TYS 113 C ? I ? 1_555 G ASP 114 N ? J H TYS 100 H ASP 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale34 covale both ? H ASP 109 C ? E ? 1_555 H TYS 110 N ? F I ASP 100 I TYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale35 covale both ? H TYS 110 C ? F ? 1_555 H ALA 111 N ? G I TYS 100 I ALA 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.328 ? ? covale36 covale both ? H ASP 112 C ? H ? 1_555 H TYS 113 N ? I I ASP 100 I TYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.324 ? ? covale37 covale both ? H TYS 113 C ? I ? 1_555 H ASP 114 N ? J I TYS 100 I ASP 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale38 covale both ? K ASP 109 C ? E ? 1_555 K TYS 110 N ? F P ASP 100 P TYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.329 ? ? covale39 covale both ? K TYS 110 C ? F ? 1_555 K ALA 111 N ? G P TYS 100 P ALA 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.327 ? ? covale40 covale both ? K ASP 112 C ? H ? 1_555 K TYS 113 N ? I P ASP 100 P TYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.326 ? ? covale41 covale both ? K TYS 113 C ? I ? 1_555 K ASP 114 N ? J P TYS 100 P ASP 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.325 ? ? covale42 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale43 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? covale44 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale45 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R BMA . C1 ? ? M NAG 2 M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale46 covale one ? R BMA . O3 ? ? ? 1_555 R MAN . C1 ? ? M BMA 3 M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale47 covale one ? R MAN . O2 ? ? ? 1_555 R MAN . C1 ? ? M MAN 4 M MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale48 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale49 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S BMA . C1 ? ? N NAG 2 N BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale50 covale one ? S BMA . O3 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? N BMA 3 N MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale51 covale one ? S MAN . O2 ? ? ? 1_555 S MAN . C1 ? ? N MAN 4 N MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale52 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale53 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T BMA . C1 ? ? O NAG 2 O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale54 covale one ? T BMA . O3 ? ? ? 1_555 T MAN . C1 ? ? O BMA 3 O MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale55 covale one ? T MAN . O2 ? ? ? 1_555 T MAN . C1 ? ? O MAN 4 O MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 3 ? AA5 ? 6 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 4 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 5 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 4 ? AB7 ? 2 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 2 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 4 ? AC6 ? 4 ? AC7 ? 3 ? AC8 ? 6 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 6 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 3 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 6 ? AD8 ? 3 ? AD9 ? 4 ? AE1 ? 6 ? AE2 ? 4 ? AE3 ? 2 ? AE4 ? 3 ? AE5 ? 4 ? AE6 ? 2 ? AE7 ? 3 ? AE8 ? 4 ? AE9 ? 4 ? AF1 ? 4 ? AF2 ? 4 ? AF3 ? 6 ? AF4 ? 3 ? AF5 ? 4 ? 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PHENIX 1.14 ? 1 ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration 1.2 _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'HIVRAD P01 P01AI10014 (P.J.B.)' 1 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' 'United States' 'P50 8 P50 AI150464-13 (P.J.B.)' 2 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero P 6 NAG 1 G NAG 1 A NAG 612 n P 6 NAG 2 G NAG 2 A NAG 613 n Q 6 NAG 1 K NAG 1 A NAG 602 n Q 6 NAG 2 K NAG 2 A NAG 603 n R 7 NAG 1 M NAG 1 A NAG 607 n R 7 NAG 2 M NAG 2 A NAG 608 n R 7 BMA 3 M BMA 3 A BMA 609 n R 7 MAN 4 M MAN 4 A MAN 610 n R 7 MAN 5 M MAN 5 A MAN 611 n S 7 NAG 1 N NAG 1 B NAG 605 n S 7 NAG 2 N NAG 2 B NAG 606 n S 7 BMA 3 N BMA 3 B BMA 607 n S 7 MAN 4 N MAN 4 B MAN 608 n S 7 MAN 5 N MAN 5 B MAN 609 n T 7 NAG 1 O NAG 1 C NAG 605 n T 7 NAG 2 O NAG 2 C NAG 606 n T 7 BMA 3 O BMA 3 C BMA 607 n T 7 MAN 4 O MAN 4 C MAN 608 n T 7 MAN 5 O MAN 5 C MAN 609 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 6 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 6 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 6 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 7 DManpa1-2DManpa1-3DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 7 'WURCS=2.0/3,5,4/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_d2-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 7 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 6 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 7 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 3 7 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 4 7 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 5 7 5 MAN C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 6 NAG 1 n 6 NAG 2 n 7 NAG 1 n 7 NAG 2 n 7 BMA 3 n 7 MAN 4 n 7 MAN 5 n # _pdbx_entity_nonpoly.entity_id 8 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #