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'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6UVR _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6UVR _struct.title 'Human Connexin-26 (Neutral pH open conformation)' _struct.pdbx_descriptor 'Gap junction beta-2 protein' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6UVR _struct_keywords.text 'gap junction channel, MEMBRANE PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 1 ? H N N 1 ? I N N 1 ? J N N 1 ? 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SER C 72 MET C 93 1 ? 22 HELX_P HELX_P35 AD8 THR F 135 ? TYR F 158 ? THR C 135 TYR C 158 1 ? 24 HELX_P HELX_P36 AD9 ARG F 184 ? SER F 211 ? ARG C 184 SER C 211 1 ? 28 HELX_P HELX_P37 AE1 SER G 19 ? LYS G 41 ? SER I 19 LYS I 41 1 ? 23 HELX_P HELX_P38 AE2 VAL G 43 ? GLU G 47 ? VAL I 43 GLU I 47 5 ? 5 HELX_P HELX_P39 AE3 GLY G 59 ? PHE G 69 ? GLY I 59 PHE I 69 1 ? 11 HELX_P HELX_P40 AE4 SER G 72 ? MET G 93 ? SER I 72 MET I 93 1 ? 22 HELX_P HELX_P41 AE5 THR G 135 ? TYR G 158 ? THR I 135 TYR I 158 1 ? 24 HELX_P HELX_P42 AE6 ARG G 184 ? SER G 211 ? ARG I 184 SER I 211 1 ? 28 HELX_P HELX_P43 AE7 SER H 19 ? LYS H 41 ? SER D 19 LYS D 41 1 ? 23 HELX_P HELX_P44 AE8 VAL H 43 ? GLU H 47 ? VAL D 43 GLU D 47 5 ? 5 HELX_P HELX_P45 AE9 GLY H 59 ? PHE H 69 ? GLY D 59 PHE D 69 1 ? 11 HELX_P HELX_P46 AF1 SER H 72 ? MET H 93 ? SER D 72 MET D 93 1 ? 22 HELX_P HELX_P47 AF2 THR H 135 ? TYR H 158 ? THR D 135 TYR D 158 1 ? 24 HELX_P HELX_P48 AF3 ARG H 184 ? SER H 211 ? ARG D 184 SER D 211 1 ? 28 HELX_P HELX_P49 AF4 SER I 19 ? LYS I 41 ? SER J 19 LYS J 41 1 ? 23 HELX_P HELX_P50 AF5 VAL I 43 ? GLU I 47 ? VAL J 43 GLU J 47 5 ? 5 HELX_P HELX_P51 AF6 GLY I 59 ? PHE I 69 ? GLY J 59 PHE J 69 1 ? 11 HELX_P HELX_P52 AF7 SER I 72 ? MET I 93 ? SER J 72 MET J 93 1 ? 22 HELX_P HELX_P53 AF8 THR I 135 ? TYR I 158 ? THR J 135 TYR J 158 1 ? 24 HELX_P HELX_P54 AF9 ARG I 184 ? SER I 211 ? ARG J 184 SER J 211 1 ? 28 HELX_P HELX_P55 AG1 SER J 19 ? LYS J 41 ? SER E 19 LYS E 41 1 ? 23 HELX_P HELX_P56 AG2 GLY J 59 ? PHE J 69 ? GLY E 59 PHE E 69 1 ? 11 HELX_P HELX_P57 AG3 SER J 72 ? MET J 93 ? SER E 72 MET E 93 1 ? 22 HELX_P HELX_P58 AG4 THR J 135 ? TYR J 158 ? THR E 135 TYR E 158 1 ? 24 HELX_P HELX_P59 AG5 ARG J 184 ? SER J 211 ? ARG E 184 SER E 211 1 ? 28 HELX_P HELX_P60 AG6 SER K 19 ? LYS K 41 ? SER F 19 LYS F 41 1 ? 23 HELX_P HELX_P61 AG7 VAL K 43 ? GLU K 47 ? VAL F 43 GLU F 47 5 ? 5 HELX_P HELX_P62 AG8 GLY K 59 ? PHE K 69 ? 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ARG G 184 SER G 211 1 ? 28 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? 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J CYS 53 SG ? ? ? 1_555 J CYS 180 SG ? ? E CYS 53 E CYS 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf29 disulf ? ? J CYS 60 SG ? ? ? 1_555 J CYS 174 SG ? ? E CYS 60 E CYS 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? disulf30 disulf ? ? J CYS 64 SG ? ? ? 1_555 J CYS 169 SG ? ? E CYS 64 E CYS 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf31 disulf ? ? K CYS 53 SG ? ? ? 1_555 K CYS 180 SG ? ? F CYS 53 F CYS 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf32 disulf ? ? K CYS 60 SG ? ? ? 1_555 K CYS 174 SG ? ? F CYS 60 F CYS 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf33 disulf ? ? K CYS 64 SG ? ? ? 1_555 K CYS 169 SG ? ? F CYS 64 F CYS 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf34 disulf ? ? L CYS 53 SG ? ? ? 1_555 L CYS 180 SG ? ? G CYS 53 G CYS 180 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? disulf35 disulf ? ? L CYS 60 SG ? ? ? 1_555 L CYS 174 SG ? ? G CYS 60 G CYS 174 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf36 disulf ? ? L CYS 64 SG ? ? ? 1_555 L CYS 169 SG ? ? G CYS 64 G CYS 169 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? 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Multiple rounds of automated (Phenix) and manual (Coot) model building were performed. The model was validated in Molprobity(part of Phenix package). Model-map cross correlation score as well as EMRinger score were obtained in Phenix. RMSD values for C-alphas were calculated in UCSF Chimera. ; _em_3d_fitting.overall_b_value ? _em_3d_fitting.ref_protocol OTHER _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria 'Model-map cross correlation' _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 6UVR _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm ? _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages ? _em_3d_reconstruction.num_particles 10345 _em_3d_reconstruction.resolution 4.0 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type POINT _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details 'NaCl was diluted from 1 M to 200 mM immediately before freezing.' _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details ? _em_entity_assembly.name 'Connexin-26 Gap Junction Channel' _em_entity_assembly.source RECOMBINANT _em_entity_assembly.type 'ORGANELLE OR CELLULAR COMPONENT' _em_entity_assembly.entity_id_list 1 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 6UVR _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height ? _em_image_scans.dimension_width ? _em_image_scans.frames_per_image 20 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size ? _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image ? _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 6UVR _em_imaging.accelerating_voltage 300 _em_imaging.alignment_procedure ? _em_imaging.c2_aperture_diameter ? _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen ? _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'SPOT SCAN' _em_imaging.microscope_model 'FEI TITAN KRIOS' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2.7 _em_imaging.nominal_defocus_max ? _em_imaging.nominal_defocus_min ? _em_imaging.nominal_magnification 130000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model ? _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material ? _em_sample_support.grid_mesh_size ? _em_sample_support.grid_type C-flat-2/2 _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature ? _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details 'After application of sample to the C-flat holey carbon grid, sample was manually blotted with Whatman no. 1 filter paper for 3-5 s.' _em_vitrification.humidity ? _em_vitrification.instrument 'HOMEMADE PLUNGER' _em_vitrification.entry_id 6UVR _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 6UVR _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state PARTICLE _em_experiment.reconstruction_method 'SINGLE PARTICLE' _em_experiment.entity_assembly_id 1 # _em_single_particle_entity.entry_id 6UVR _em_single_particle_entity.id 1 _em_single_particle_entity.image_processing_id 1 _em_single_particle_entity.point_symmetry D6 # loop_ _pdbx_validate_close_contact.id _pdbx_validate_close_contact.PDB_model_num _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_1 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_1 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_1 _pdbx_validate_close_contact.auth_atom_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_asym_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_comp_id_2 _pdbx_validate_close_contact.auth_seq_id_2 _pdbx_validate_close_contact.PDB_ins_code_2 _pdbx_validate_close_contact.label_alt_id_2 _pdbx_validate_close_contact.dist 1 1 HD22 A LEU 166 ? ? 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O I LYS 168 ? ? 1.60 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 VAL A 43 ? ? -121.74 -61.54 2 1 GLU A 47 ? ? -89.13 49.24 3 1 GLN A 48 ? ? -135.15 -37.44 4 1 PHE A 161 ? ? -118.04 52.44 5 1 ARG A 184 ? ? 34.53 56.69 6 1 VAL K 43 ? ? -121.79 -61.48 7 1 GLU K 47 ? ? -89.08 49.21 8 1 GLN K 48 ? ? -135.11 -37.47 9 1 PHE K 161 ? ? -118.11 52.44 10 1 ARG K 184 ? ? 34.51 56.69 11 1 VAL L 43 ? ? -121.76 -61.58 12 1 GLU L 47 ? ? -89.15 49.23 13 1 GLN L 48 ? ? -135.10 -37.41 14 1 PHE L 161 ? ? -118.04 52.40 15 1 ARG L 184 ? ? 34.55 56.71 16 1 VAL B 43 ? ? -121.78 -61.54 17 1 GLU B 47 ? ? -89.09 49.22 18 1 GLN B 48 ? ? -135.13 -37.44 19 1 PHE B 161 ? ? -118.07 52.45 20 1 ARG B 184 ? ? 34.60 56.70 21 1 VAL H 43 ? ? -121.71 -61.59 22 1 GLU H 47 ? ? -89.16 49.26 23 1 GLN H 48 ? ? -135.14 -37.44 24 1 PHE H 161 ? ? -118.06 52.47 25 1 ARG H 184 ? ? 34.42 56.75 26 1 VAL C 43 ? ? -121.79 -61.53 27 1 GLU C 47 ? ? -89.11 49.26 28 1 GLN C 48 ? ? -135.18 -37.41 29 1 PHE C 161 ? ? -118.04 52.49 30 1 ARG C 184 ? ? 34.57 56.63 31 1 VAL I 43 ? ? -121.73 -61.52 32 1 GLU I 47 ? ? -89.08 49.18 33 1 GLN I 48 ? ? -135.11 -37.46 34 1 PHE I 161 ? ? -118.05 52.45 35 1 ARG I 184 ? ? 34.56 56.66 36 1 VAL D 43 ? ? -121.74 -61.52 37 1 GLU D 47 ? ? -89.11 49.22 38 1 GLN D 48 ? ? -135.13 -37.43 39 1 PHE D 161 ? ? -118.02 52.41 40 1 ARG D 184 ? ? 34.46 56.67 41 1 VAL J 43 ? ? -121.73 -61.61 42 1 GLU J 47 ? ? -89.11 49.26 43 1 GLN J 48 ? ? -135.19 -37.36 44 1 PHE J 161 ? ? -118.06 52.47 45 1 ARG J 184 ? ? 34.53 56.72 46 1 VAL E 43 ? ? -121.71 -61.57 47 1 GLU E 47 ? ? -89.12 49.20 48 1 GLN E 48 ? ? -135.09 -37.44 49 1 PHE E 161 ? ? -118.06 52.46 50 1 ARG E 184 ? ? 34.59 56.69 51 1 VAL F 43 ? ? -121.72 -61.52 52 1 GLU F 47 ? ? -89.18 49.24 53 1 GLN F 48 ? ? -135.17 -37.45 54 1 PHE F 161 ? ? -118.03 52.36 55 1 ARG F 184 ? ? 34.53 56.67 56 1 VAL G 43 ? ? -121.72 -61.57 57 1 GLU G 47 ? ? -89.14 49.28 58 1 GLN G 48 ? ? -135.17 -37.43 59 1 PHE G 161 ? ? -118.03 52.48 60 1 ARG G 184 ? ? 34.52 56.73 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.auth_atom_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_alt_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_atoms.label_atom_id 1 1 Y 1 A SER 17 ? 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CG ? A GLN 80 CG 54 1 Y 1 A GLN 80 ? CD ? A GLN 80 CD 55 1 Y 1 A GLN 80 ? OE1 ? A GLN 80 OE1 56 1 Y 1 A GLN 80 ? NE2 ? A GLN 80 NE2 57 1 Y 1 A LEU 81 ? CG ? A LEU 81 CG 58 1 Y 1 A LEU 81 ? CD1 ? A LEU 81 CD1 59 1 Y 1 A LEU 81 ? CD2 ? A LEU 81 CD2 60 1 Y 1 A VAL 84 ? CG1 ? A VAL 84 CG1 61 1 Y 1 A VAL 84 ? CG2 ? A VAL 84 CG2 62 1 Y 1 A THR 86 ? OG1 ? A THR 86 OG1 63 1 Y 1 A THR 86 ? CG2 ? A THR 86 CG2 64 1 Y 1 A LEU 89 ? CG ? A LEU 89 CG 65 1 Y 1 A LEU 89 ? CD1 ? A LEU 89 CD1 66 1 Y 1 A LEU 89 ? CD2 ? A LEU 89 CD2 67 1 Y 1 A LEU 90 ? CG ? A LEU 90 CG 68 1 Y 1 A LEU 90 ? CD1 ? A LEU 90 CD1 69 1 Y 1 A LEU 90 ? CD2 ? A LEU 90 CD2 70 1 Y 1 A VAL 91 ? CG1 ? A VAL 91 CG1 71 1 Y 1 A VAL 91 ? CG2 ? A VAL 91 CG2 72 1 Y 1 A MET 93 ? CG ? A MET 93 CG 73 1 Y 1 A MET 93 ? SD ? A MET 93 SD 74 1 Y 1 A MET 93 ? CE ? A MET 93 CE 75 1 Y 1 A HIS 94 ? CG ? A HIS 94 CG 76 1 Y 1 A HIS 94 ? ND1 ? A HIS 94 ND1 77 1 Y 1 A HIS 94 ? CD2 ? A HIS 94 CD2 78 1 Y 1 A HIS 94 ? CE1 ? A HIS 94 CE1 79 1 Y 1 A HIS 94 ? 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