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Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q2N0S6_9HIV1 Q2N0S6 ? 1 ;NLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIISLW DQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKEYR LINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEVMI RSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQAFYATGDIIGDIRQAHCTVSKATWNETLGKVVKQLRKHF GNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQAM YAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRAKRRV ; 32 2 UNP Q2N0S9_9HIV1 Q2N0S9 ? 2 ;LGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAIEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQLLGIWGCS GKLICTTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; 519 3 PDB 6V8X 6V8X ? 3 ? 1 4 UNP Q6N095_HUMAN Q6N095 ? 3 ;STKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTY ICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC ; 147 5 PDB 6V8X 6V8X ? 4 ? 1 6 UNP Q6PIL8_HUMAN Q6PIL8 ? 4 ;DIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKA DYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC ; 127 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6V8X A 1 ? 471 ? 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Q6PIL8 127 ? 236 ? 107 216 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 6V8X ILE A 36 ? UNP Q2N0S6 VAL 67 conflict 68 1 1 6V8X ALA A 105 ? UNP Q2N0S6 ASN 136 conflict 148 2 1 6V8X VAL A 172 ? UNP Q2N0S6 ALA 203 conflict 204 3 1 6V8X LEU A 176 ? UNP Q2N0S6 VAL 207 conflict 208 4 1 6V8X LEU A 223 ? UNP Q2N0S6 VAL 254 conflict 255 5 1 6V8X ASN A 299 ? UNP Q2N0S6 THR 330 conflict 332 6 1 6V8X CYS A 467 ? UNP Q2N0S6 ALA 498 conflict 501 7 2 6V8X CYS B 86 ? UNP Q2N0S9 THR 604 conflict 605 8 4 6V8X ALA C 219 ? UNP Q6N095 VAL 243 conflict 211 9 6 6V8X ARG D 196 ? UNP Q6PIL8 SER 224 conflict 204 10 7 6V8X ILE E 36 ? UNP Q2N0S6 VAL 67 conflict 68 11 7 6V8X ALA E 105 ? UNP Q2N0S6 ASN 136 conflict 148 12 7 6V8X VAL E 172 ? UNP Q2N0S6 ALA 203 conflict 204 13 7 6V8X LEU E 176 ? UNP Q2N0S6 VAL 207 conflict 208 14 7 6V8X LEU E 223 ? UNP Q2N0S6 VAL 254 conflict 255 15 7 6V8X ASN E 299 ? UNP Q2N0S6 THR 330 conflict 332 16 7 6V8X CYS E 467 ? UNP Q2N0S6 ALA 498 conflict 501 17 8 6V8X CYS F 86 ? UNP Q2N0S9 THR 604 conflict 605 18 10 6V8X ALA G 219 ? UNP Q6N095 VAL 243 conflict 211 19 12 6V8X ARG H 196 ? UNP Q6PIL8 SER 224 conflict 204 20 13 6V8X ILE I 36 ? UNP Q2N0S6 VAL 67 conflict 68 21 13 6V8X ALA I 105 ? UNP Q2N0S6 ASN 136 conflict 148 22 13 6V8X VAL I 172 ? UNP Q2N0S6 ALA 203 conflict 204 23 13 6V8X LEU I 176 ? UNP Q2N0S6 VAL 207 conflict 208 24 13 6V8X LEU I 223 ? UNP Q2N0S6 VAL 254 conflict 255 25 13 6V8X ASN I 299 ? UNP Q2N0S6 THR 330 conflict 332 26 13 6V8X CYS I 467 ? UNP Q2N0S6 ALA 498 conflict 501 27 14 6V8X CYS J 86 ? UNP Q2N0S9 THR 604 conflict 605 28 16 6V8X ALA K 219 ? UNP Q6N095 VAL 243 conflict 211 29 18 6V8X ARG L 196 ? UNP Q6PIL8 SER 224 conflict 204 30 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose ? 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose ? 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ? 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6V8X _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6V8X _struct.title 'VRC01 Bound BG505 F14 HIV-1 SOSIP Envelope Trimer Structure' _struct.pdbx_descriptor 'envelope glycoprotein gp120, envelope glycoprotein gp41, VRC01 VH, VRC01 VL' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6V8X _struct_keywords.text 'Trimer, Complex, Immunogen, HIV-1, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 1 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 1 ? J N N 2 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 5 ? N N N 6 ? O N N 7 ? P N N 7 ? Q N N 7 ? R N N 6 ? S N N 6 ? T N N 7 ? U N N 6 ? V N N 6 ? W N N 6 ? X N N 6 ? Y N N 5 ? Z N N 6 ? AA N N 7 ? BA N N 7 ? CA N N 7 ? DA N N 6 ? EA N N 6 ? FA N N 7 ? GA N N 6 ? HA N N 6 ? IA N N 6 ? JA N N 6 ? KA N N 5 ? LA N N 6 ? MA N N 7 ? NA N N 7 ? OA N N 7 ? PA N N 6 ? QA N N 6 ? RA N N 7 ? SA N N 6 ? TA N N 6 ? UA N N 6 ? VA N N 6 ? WA N N 8 ? XA N N 8 ? YA N N 8 ? ZA N N 8 ? AB N N 8 ? BB N N 8 ? CB N N 8 ? DB N N 8 ? EB N N 8 ? FB N N 8 ? GB N N 8 ? HB N N 8 ? IB N N 8 ? JB N N 8 ? KB N N 8 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 ASN A 67 ? SER A 83 ? ASN A 99 SER A 115 1 ? 17 HELX_P HELX_P2 AA2 LEU A 90 ? CYS A 94 ? LEU A 122 CYS A 126 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 THR A 308 ? GLY A 321 ? THR A 341 GLY A 354 1 ? 14 HELX_P HELX_P4 AA4 ASP A 335 ? THR A 340 ? ASP A 368 THR A 373 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP A 440 ? ASN A 444 ? ASP A 474 ASN A 478 5 ? 5 HELX_P HELX_P6 AA6 THR B 17 ? ARG B 23 ? THR B 536 ARG B 542 1 ? 7 HELX_P HELX_P7 AA7 LEU B 47 ? TRP B 77 ? LEU B 566 TRP B 596 1 ? 31 HELX_P HELX_P8 AA8 ASN B 92 ? SER B 96 ? ASN B 611 SER B 615 5 ? 5 HELX_P HELX_P9 AA9 LEU B 100 ? ASP B 105 ? LEU B 619 ASP B 624 1 ? 6 HELX_P HELX_P10 AB1 THR B 108 ? ILE B 116 ? THR B 627 ILE B 635 1 ? 9 HELX_P HELX_P11 AB2 TYR B 119 ? LEU B 127 ? TYR B 638 LEU B 646 1 ? 9 HELX_P HELX_P12 AB3 LEU B 127 ? ASP B 145 ? LEU B 646 ASP B 664 1 ? 19 HELX_P HELX_P13 AB4 GLU C 28 ? CYS C 32 ? GLU C 28 CYS C 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P14 AB5 ARG C 62 ? GLN C 65 ? ARG C 61 GLN C 64 5 ? 4 HELX_P HELX_P15 AB6 THR C 87 ? THR C 91 ? THR C 83 THR C 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 LYS C 209 ? ASN C 212 ? LYS C 201 ASN C 204 5 ? 4 HELX_P HELX_P17 AB8 GLU D 75 ? PHE D 79 ? GLU D 79 PHE D 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P18 AB9 ASP D 179 ? LYS D 184 ? ASP D 187 LYS D 192 5 ? 6 HELX_P HELX_P19 AC1 ASN E 67 ? SER E 83 ? ASN E 99 SER E 115 1 ? 17 HELX_P HELX_P20 AC2 LEU E 90 ? CYS E 94 ? LEU E 122 CYS E 126 5 ? 5 HELX_P HELX_P21 AC3 THR E 308 ? GLY E 321 ? THR E 341 GLY E 354 1 ? 14 HELX_P HELX_P22 AC4 ASP E 335 ? THR E 340 ? ASP E 368 THR E 373 1 ? 6 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP E 440 ? ASN E 444 ? ASP E 474 ASN E 478 5 ? 5 HELX_P HELX_P24 AC6 THR F 17 ? ARG F 23 ? THR F 536 ARG F 542 1 ? 7 HELX_P HELX_P25 AC7 LEU F 47 ? TRP F 77 ? LEU F 566 TRP F 596 1 ? 31 HELX_P HELX_P26 AC8 ASN F 92 ? SER F 96 ? ASN F 611 SER F 615 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 LEU F 100 ? ASP F 105 ? LEU F 619 ASP F 624 1 ? 6 HELX_P HELX_P28 AD1 THR F 108 ? ILE F 116 ? THR F 627 ILE F 635 1 ? 9 HELX_P HELX_P29 AD2 TYR F 119 ? LEU F 127 ? TYR F 638 LEU F 646 1 ? 9 HELX_P HELX_P30 AD3 LEU F 127 ? ASP F 145 ? LEU F 646 ASP F 664 1 ? 19 HELX_P HELX_P31 AD4 GLU G 28 ? CYS G 32 ? GLU G 28 CYS G 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P32 AD5 ARG G 62 ? GLN G 65 ? ARG G 61 GLN G 64 5 ? 4 HELX_P HELX_P33 AD6 THR G 87 ? THR G 91 ? THR G 83 THR G 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 LYS G 209 ? ASN G 212 ? 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LEU J 646 ASP J 664 1 ? 19 HELX_P HELX_P49 AF4 GLU K 28 ? CYS K 32 ? GLU K 28 CYS K 32 5 ? 5 HELX_P HELX_P50 AF5 ARG K 62 ? GLN K 65 ? ARG K 61 GLN K 64 5 ? 4 HELX_P HELX_P51 AF6 THR K 87 ? THR K 91 ? THR K 83 THR K 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P52 AF7 LYS K 209 ? ASN K 212 ? LYS K 201 ASN K 204 5 ? 4 HELX_P HELX_P53 AF8 GLU L 75 ? PHE L 79 ? GLU L 79 PHE L 83 5 ? 5 HELX_P HELX_P54 AF9 ASP L 179 ? LYS L 184 ? ASP L 187 LYS L 192 5 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? 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A CYS 467 SG ? ? ? 1_555 B CYS 86 SG ? ? A CYS 501 B CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? ? disulf11 disulf ? ? B CYS 79 SG ? ? ? 1_555 B CYS 85 SG ? ? B CYS 598 B CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 22 SG ? ? ? 1_555 C CYS 96 SG ? ? C CYS 22 C CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.915 ? ? disulf13 disulf ? ? C CYS 32 SG ? ? ? 1_555 C CYS 102 SG ? ? C CYS 32 C CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.985 ? ? disulf14 disulf ? ? C CYS 148 SG ? ? ? 1_555 C CYS 204 SG ? ? C CYS 140 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf15 disulf ? ? C CYS 224 SG ? ? ? 1_555 D CYS 208 SG ? ? C CYS 216 D CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? ? disulf16 disulf ? ? D CYS 21 SG ? ? ? 1_555 D CYS 84 SG ? ? D CYS 23 D CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.194 ? ? disulf17 disulf ? ? D CYS 128 SG ? ? ? 1_555 D CYS 188 SG ? ? D CYS 136 D CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf18 disulf ? ? E CYS 22 SG ? ? ? 1_555 E CYS 42 SG ? ? E CYS 54 E CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? ? disulf19 disulf ? ? E CYS 87 SG ? ? ? 1_555 E CYS 173 SG ? ? E CYS 119 E CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.012 ? ? disulf20 disulf ? ? E CYS 94 SG ? ? ? 1_555 E CYS 164 SG ? ? E CYS 126 E CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? ? disulf21 disulf ? ? E CYS 99 SG ? ? ? 1_555 E CYS 117 SG ? ? E CYS 131 E CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.118 ? ? disulf22 disulf ? ? E CYS 186 SG ? ? ? 1_555 E CYS 215 SG ? ? E CYS 218 E CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf23 disulf ? ? E CYS 196 SG ? ? ? 1_555 E CYS 207 SG ? ? E CYS 228 E CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf24 disulf ? ? E CYS 264 SG ? ? ? 1_555 E CYS 298 SG ? ? E CYS 296 E CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? ? disulf25 disulf ? ? E CYS 345 SG ? ? ? 1_555 E CYS 411 SG ? ? E CYS 378 E CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.090 ? ? disulf26 disulf ? ? E CYS 352 SG ? ? ? 1_555 E CYS 384 SG ? ? E CYS 385 E CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? ? disulf27 disulf ? ? E CYS 467 SG ? ? ? 1_555 F CYS 86 SG ? ? E CYS 501 F CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? ? disulf28 disulf ? ? F CYS 79 SG ? ? ? 1_555 F CYS 85 SG ? ? F CYS 598 F CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? ? disulf29 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 96 SG ? ? G CYS 22 G CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.914 ? ? disulf30 disulf ? ? G CYS 32 SG ? ? ? 1_555 G CYS 102 SG ? ? G CYS 32 G CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.985 ? ? disulf31 disulf ? ? G CYS 148 SG ? ? ? 1_555 G CYS 204 SG ? ? G CYS 140 G CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf32 disulf ? ? G CYS 224 SG ? ? ? 1_555 H CYS 208 SG ? ? G CYS 216 H CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? ? disulf33 disulf ? ? H CYS 21 SG ? ? ? 1_555 H CYS 84 SG ? ? H CYS 23 H CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? ? disulf34 disulf ? ? H CYS 128 SG ? ? ? 1_555 H CYS 188 SG ? ? H CYS 136 H CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.041 ? ? disulf35 disulf ? ? I CYS 22 SG ? ? ? 1_555 I CYS 42 SG ? ? I CYS 54 I CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.073 ? ? disulf36 disulf ? ? I CYS 87 SG ? ? ? 1_555 I CYS 173 SG ? ? I CYS 119 I CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? ? disulf37 disulf ? ? I CYS 94 SG ? ? ? 1_555 I CYS 164 SG ? ? I CYS 126 I CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.065 ? ? disulf38 disulf ? ? I CYS 99 SG ? ? ? 1_555 I CYS 117 SG ? ? I CYS 131 I CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.117 ? ? disulf39 disulf ? ? I CYS 186 SG ? ? ? 1_555 I CYS 215 SG ? ? I CYS 218 I CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf40 disulf ? ? I CYS 196 SG ? ? ? 1_555 I CYS 207 SG ? ? I CYS 228 I CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? disulf41 disulf ? ? I CYS 264 SG ? ? ? 1_555 I CYS 298 SG ? ? I CYS 296 I CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.105 ? ? disulf42 disulf ? ? I CYS 345 SG ? ? ? 1_555 I CYS 411 SG ? ? I CYS 378 I CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.090 ? ? disulf43 disulf ? ? I CYS 352 SG ? ? ? 1_555 I CYS 384 SG ? ? I CYS 385 I CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.237 ? ? disulf44 disulf ? ? I CYS 467 SG ? ? ? 1_555 J CYS 86 SG ? ? I CYS 501 J CYS 605 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.311 ? ? disulf45 disulf ? ? J CYS 79 SG ? ? ? 1_555 J CYS 85 SG ? ? J CYS 598 J CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.002 ? ? disulf46 disulf ? ? K CYS 22 SG ? ? ? 1_555 K CYS 96 SG ? ? K CYS 22 K CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.914 ? ? disulf47 disulf ? ? K CYS 32 SG ? ? ? 1_555 K CYS 102 SG ? ? K CYS 32 K CYS 98 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.985 ? ? disulf48 disulf ? ? K CYS 148 SG ? ? ? 1_555 K CYS 204 SG ? ? K CYS 140 K CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf49 disulf ? ? K CYS 224 SG ? ? ? 1_555 L CYS 208 SG ? ? K CYS 216 L CYS 216 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.998 ? ? disulf50 disulf ? ? L CYS 21 SG ? ? ? 1_555 L CYS 84 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.193 ? ? disulf51 disulf ? ? L CYS 128 SG ? ? ? 1_555 L CYS 188 SG ? ? L CYS 136 L CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? covale1 covale one ? A ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? A ASN 88 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 101 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? A ASN 133 A NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? A ASN 116 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? A ASN 156 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 120 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? A ASN 160 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 197 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 262 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? A ASN 276 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 263 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? A ASN 295 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 269 ND2 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? A ASN 301 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 299 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? A ASN 332 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? A ASN 339 A NAG 632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? A ASN 355 A NAG 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 330 ND2 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? A ASN 363 M NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 353 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? A ASN 386 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? A ASN 359 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? A ASN 392 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? A ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? A ASN 448 A NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? B ASN 92 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? B ASN 611 B NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? E ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? E ASN 88 h NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? E ASN 101 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? E ASN 133 E NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale20 covale one ? E ASN 116 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? E ASN 156 f NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? N-Glycosylation covale21 covale one ? E ASN 120 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? E ASN 160 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? E ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? E ASN 197 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? E ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? E ASN 262 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.424 ? N-Glycosylation covale24 covale one ? E ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? E ASN 276 c NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale25 covale one ? E ASN 263 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? E ASN 295 d NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? N-Glycosylation covale26 covale one ? E ASN 269 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? E ASN 301 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale27 covale one ? E ASN 299 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? E ASN 332 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? E ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? E ASN 339 E NAG 632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? E ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? E ASN 355 E NAG 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? E ASN 330 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? E ASN 363 Y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? E ASN 353 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? E ASN 386 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? E ASN 359 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? E ASN 392 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? E ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? E ASN 448 E NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? F ASN 92 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? F ASN 611 F NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? I ASN 56 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? I ASN 88 t NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? I ASN 101 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? I ASN 133 I NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? I ASN 116 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? I ASN 156 r NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? I ASN 120 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? I ASN 160 q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.419 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? I ASN 165 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? I ASN 197 s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? N-Glycosylation covale40 covale one ? I ASN 230 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? I ASN 262 n NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? N-Glycosylation covale41 covale one ? I ASN 244 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? I ASN 276 o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? I ASN 263 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? I ASN 295 p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? I ASN 269 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? I ASN 301 v NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale44 covale one ? I ASN 299 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? I ASN 332 u NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.415 ? N-Glycosylation covale45 covale one ? I ASN 306 ND2 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? I ASN 339 I NAG 632 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale46 covale one ? I ASN 322 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? I ASN 355 I NAG 617 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? N-Glycosylation covale47 covale one ? I ASN 330 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? I ASN 363 k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.425 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? I ASN 353 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? I ASN 386 m NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale49 covale one ? I ASN 359 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? I ASN 392 l NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale50 covale one ? I ASN 414 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? I ASN 448 I NAG 613 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale51 covale one ? J ASN 92 ND2 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? J ASN 611 J NAG 701 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.426 ? N-Glycosylation covale52 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M NAG . C1 ? ? M NAG 1 M NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale53 covale both ? M NAG . O4 ? ? ? 1_555 M BMA . C1 ? ? M NAG 2 M BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.429 ? ? covale54 covale both ? M BMA . O3 ? ? ? 1_555 M MAN . C1 ? ? M BMA 3 M MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale55 covale both ? N NAG . O4 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? N NAG 1 N NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale56 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale57 covale both ? O NAG . O4 ? ? ? 1_555 O BMA . C1 ? ? O NAG 2 O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale58 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? ? covale59 covale both ? P NAG . O4 ? ? ? 1_555 P BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale60 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? Q NAG 1 Q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale61 covale both ? Q NAG . O4 ? ? ? 1_555 Q BMA . C1 ? ? Q NAG 2 Q BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale62 covale both ? R NAG . O4 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? R NAG 1 R NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale63 covale both ? S NAG . O4 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale64 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale65 covale both ? T NAG . O4 ? ? ? 1_555 T BMA . C1 ? ? T NAG 2 T BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale66 covale both ? U NAG . O4 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale67 covale both ? V NAG . O4 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale68 covale both ? W NAG . O4 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? ? covale69 covale both ? X NAG . O4 ? ? ? 1_555 X NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale70 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale71 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y BMA . C1 ? ? Y NAG 2 Y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? ? covale72 covale both ? Y BMA . O3 ? ? ? 1_555 Y MAN . C1 ? ? Y BMA 3 Y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale73 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? covale74 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale75 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA BMA . C1 ? ? a NAG 2 a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale76 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? ? covale77 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA BMA . C1 ? ? b NAG 2 b BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale78 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? c NAG 1 c NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale79 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA BMA . C1 ? ? c NAG 2 c BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale80 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d NAG 1 d NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale81 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale82 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale83 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA BMA . C1 ? ? f NAG 2 f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale84 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale85 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? h NAG 1 h NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale86 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? i NAG 1 i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.471 ? ? covale87 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? j NAG 1 j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale88 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? k NAG 1 k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale89 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA BMA . C1 ? ? k NAG 2 k BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? ? covale90 covale both ? KA BMA . O3 ? ? ? 1_555 KA MAN . C1 ? ? k BMA 3 k MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale91 covale both ? LA NAG . O4 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? l NAG 1 l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.455 ? ? covale92 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? m NAG 1 m NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale93 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA BMA . C1 ? ? m NAG 2 m BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale94 covale both ? NA NAG . O4 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? n NAG 1 n NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? ? covale95 covale both ? NA NAG . O4 ? ? ? 1_555 NA BMA . C1 ? ? n NAG 2 n BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale96 covale both ? OA NAG . O4 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? o NAG 1 o NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale97 covale both ? OA NAG . O4 ? ? ? 1_555 OA BMA . C1 ? ? o NAG 2 o BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale98 covale both ? PA NAG . O4 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? p NAG 1 p NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale99 covale both ? QA NAG . O4 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? q NAG 1 q NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.439 ? ? covale100 covale both ? RA NAG . O4 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? r NAG 1 r NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? ? covale101 covale both ? RA NAG . O4 ? ? ? 1_555 RA BMA . C1 ? ? r NAG 2 r BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale102 covale both ? SA NAG . O4 ? ? ? 1_555 SA NAG . 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C1 ? ? v NAG 1 v NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 GLY 9 C . ? GLY 9 C GLN 10 C ? GLN 10 C 1 -3.53 2 PHE 154 C . ? PHE 146 C PRO 155 C ? PRO 147 C 1 -8.63 3 GLU 156 C . ? GLU 148 C PRO 157 C ? PRO 149 C 1 -8.07 4 SER 5 D . ? SER 7 D PRO 6 D ? PRO 8 D 1 -10.99 5 SER 61 D . ? SER 65 D ARG 62 D ? ARG 66 D 1 11.03 6 TYR 134 D . ? TYR 142 D PRO 135 D ? PRO 143 D 1 1.64 7 GLY 9 G . ? GLY 9 G GLN 10 G ? GLN 10 G 1 -3.55 8 PHE 154 G . ? PHE 146 G PRO 155 G ? PRO 147 G 1 -8.67 9 GLU 156 G . ? GLU 148 G PRO 157 G ? PRO 149 G 1 -8.02 10 SER 5 H . ? SER 7 H PRO 6 H ? PRO 8 H 1 -10.99 11 SER 61 H . ? SER 65 H ARG 62 H ? ARG 66 H 1 11.13 12 TYR 134 H . ? TYR 142 H PRO 135 H ? PRO 143 H 1 1.68 13 GLY 9 K . ? GLY 9 K GLN 10 K ? GLN 10 K 1 -3.53 14 PHE 154 K . ? PHE 146 K PRO 155 K ? PRO 147 K 1 -8.66 15 GLU 156 K . ? GLU 148 K PRO 157 K ? PRO 149 K 1 -8.16 16 SER 5 L . ? SER 7 L PRO 6 L ? PRO 8 L 1 -11.01 17 SER 61 L . ? SER 65 L ARG 62 L ? ARG 66 L 1 10.99 18 TYR 134 L . ? TYR 142 L PRO 135 L ? PRO 143 L 1 1.62 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 5 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 6 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 2 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 4 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 3 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 2 ? AC1 ? 6 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 3 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 5 ? AD2 ? 3 ? AD3 ? 6 ? AD4 ? 5 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 2 ? AD7 ? 2 ? AD8 ? 3 ? AD9 ? 4 ? AE1 ? 2 ? AE2 ? 3 ? AE3 ? 3 ? AE4 ? 2 ? AE5 ? 6 ? AE6 ? 3 ? AE7 ? 3 ? AE8 ? 2 ? AE9 ? 3 ? AF1 ? 5 ? AF2 ? 2 ? AF3 ? 2 ? AF4 ? 3 ? AF5 ? 5 ? AF6 ? 3 ? AF7 ? 6 ? AF8 ? 5 ? AF9 ? 2 ? AG1 ? 2 ? AG2 ? 2 ? AG3 ? 3 ? AG4 ? 4 ? AG5 ? 2 ? AG6 ? 3 ? AG7 ? 3 ? AG8 ? 2 ? AG9 ? 6 ? AH1 ? 3 ? AH2 ? 3 ? AH3 ? 2 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA5 2 3 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA8 2 3 ? anti-parallel AA8 4 5 ? parallel AA8 5 6 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AA9 4 5 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? anti-parallel AC1 4 5 ? anti-parallel AC1 5 6 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC6 4 5 ? anti-parallel AC7 1 2 ? parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD1 4 5 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 4 5 ? parallel AD3 5 6 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD4 4 5 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD8 2 3 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE5 4 5 ? anti-parallel AE5 5 6 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF1 3 4 ? anti-parallel AF1 4 5 ? anti-parallel AF2 1 2 ? parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF5 2 3 ? anti-parallel AF5 3 4 ? anti-parallel AF5 4 5 ? anti-parallel AF6 1 2 ? parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF7 4 5 ? parallel AF7 5 6 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF8 2 3 ? anti-parallel AF8 4 5 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG2 1 2 ? parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG4 3 4 ? anti-parallel AG5 1 2 ? anti-parallel AG6 1 2 ? anti-parallel AG6 2 3 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG7 2 3 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG9 1 2 ? parallel AG9 2 3 ? anti-parallel AG9 3 4 ? anti-parallel AG9 4 5 ? anti-parallel AG9 5 6 ? anti-parallel AH1 1 2 ? anti-parallel AH1 2 3 ? anti-parallel AH2 1 2 ? anti-parallel AH2 2 3 ? anti-parallel AH3 1 2 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 460 ? 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_em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # _pdbx_audit_support.funding_organization 'National Institutes of Health/National Institute Of Allergy and Infectious Diseases (NIH/NIAID)' _pdbx_audit_support.country 'United States' _pdbx_audit_support.grant_number 1R01AI145687-01 _pdbx_audit_support.ordinal 1 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero M 5 NAG 1 M NAG 1 A NAG 900 n M 5 NAG 2 M NAG 2 A NAG 901 n M 5 BMA 3 M BMA 3 A BMA 902 n M 5 MAN 4 M MAN 4 A MAN 903 n N 6 NAG 1 N NAG 1 A NAG 904 n N 6 NAG 2 N NAG 2 A NAG 905 n O 7 NAG 1 O NAG 1 A NAG 906 n O 7 NAG 2 O NAG 2 A NAG 907 n O 7 BMA 3 O BMA 3 A BMA 908 n P 7 NAG 1 P NAG 1 A NAG 909 n P 7 NAG 2 P NAG 2 A NAG 910 n P 7 BMA 3 P BMA 3 A BMA 911 n Q 7 NAG 1 Q NAG 1 A NAG 913 n Q 7 NAG 2 Q NAG 2 A NAG 914 n Q 7 BMA 3 Q BMA 3 A BMA 915 n R 6 NAG 1 R NAG 1 A NAG 917 n R 6 NAG 2 R NAG 2 A NAG 918 n S 6 NAG 1 S NAG 1 A NAG 919 n S 6 NAG 2 S NAG 2 A NAG 920 n T 7 NAG 1 T NAG 1 A NAG 921 n T 7 NAG 2 T NAG 2 A NAG 922 n T 7 BMA 3 T BMA 3 A BMA 923 n U 6 NAG 1 U NAG 1 A NAG 924 n U 6 NAG 2 U NAG 2 A NAG 925 n V 6 NAG 1 V NAG 1 A NAG 927 n V 6 NAG 2 V NAG 2 A NAG 928 n W 6 NAG 1 W NAG 1 A NAG 929 n W 6 NAG 2 W NAG 2 A NAG 930 n X 6 NAG 1 X NAG 1 A NAG 933 n X 6 NAG 2 X NAG 2 A NAG 934 n Y 5 NAG 1 Y NAG 1 E NAG 900 n Y 5 NAG 2 Y NAG 2 E NAG 901 n Y 5 BMA 3 Y BMA 3 E BMA 902 n Y 5 MAN 4 Y MAN 4 E MAN 903 n Z 6 NAG 1 Z NAG 1 E NAG 904 n Z 6 NAG 2 Z NAG 2 E NAG 905 n AA 7 NAG 1 a NAG 1 E NAG 906 n AA 7 NAG 2 a NAG 2 E NAG 907 n AA 7 BMA 3 a BMA 3 E BMA 908 n BA 7 NAG 1 b NAG 1 E NAG 909 n BA 7 NAG 2 b NAG 2 E NAG 910 n BA 7 BMA 3 b BMA 3 E BMA 911 n CA 7 NAG 1 c NAG 1 E NAG 913 n CA 7 NAG 2 c NAG 2 E NAG 914 n CA 7 BMA 3 c BMA 3 E BMA 915 n DA 6 NAG 1 d NAG 1 E NAG 917 n DA 6 NAG 2 d NAG 2 E NAG 918 n EA 6 NAG 1 e NAG 1 E NAG 919 n EA 6 NAG 2 e NAG 2 E NAG 920 n FA 7 NAG 1 f NAG 1 E NAG 921 n FA 7 NAG 2 f NAG 2 E NAG 922 n FA 7 BMA 3 f BMA 3 E BMA 923 n GA 6 NAG 1 g NAG 1 E NAG 924 n GA 6 NAG 2 g NAG 2 E NAG 925 n HA 6 NAG 1 h NAG 1 E NAG 927 n HA 6 NAG 2 h NAG 2 E NAG 928 n IA 6 NAG 1 i NAG 1 E NAG 929 n IA 6 NAG 2 i NAG 2 E NAG 930 n JA 6 NAG 1 j NAG 1 E NAG 933 n JA 6 NAG 2 j NAG 2 E NAG 934 n KA 5 NAG 1 k NAG 1 I NAG 900 n KA 5 NAG 2 k NAG 2 I NAG 901 n KA 5 BMA 3 k BMA 3 I BMA 902 n KA 5 MAN 4 k MAN 4 I MAN 903 n LA 6 NAG 1 l NAG 1 I NAG 904 n LA 6 NAG 2 l NAG 2 I NAG 905 n MA 7 NAG 1 m NAG 1 I NAG 906 n MA 7 NAG 2 m NAG 2 I NAG 907 n MA 7 BMA 3 m BMA 3 I BMA 908 n NA 7 NAG 1 n NAG 1 I NAG 909 n NA 7 NAG 2 n NAG 2 I NAG 910 n NA 7 BMA 3 n BMA 3 I BMA 911 n OA 7 NAG 1 o NAG 1 I NAG 913 n OA 7 NAG 2 o NAG 2 I NAG 914 n OA 7 BMA 3 o BMA 3 I BMA 915 n PA 6 NAG 1 p NAG 1 I NAG 917 n PA 6 NAG 2 p NAG 2 I NAG 918 n QA 6 NAG 1 q NAG 1 I NAG 919 n QA 6 NAG 2 q NAG 2 I NAG 920 n RA 7 NAG 1 r NAG 1 I NAG 921 n RA 7 NAG 2 r NAG 2 I NAG 922 n RA 7 BMA 3 r BMA 3 I BMA 923 n SA 6 NAG 1 s NAG 1 I NAG 924 n SA 6 NAG 2 s NAG 2 I NAG 925 n TA 6 NAG 1 t NAG 1 I NAG 927 n TA 6 NAG 2 t NAG 2 I NAG 928 n UA 6 NAG 1 u NAG 1 I NAG 929 n UA 6 NAG 2 u NAG 2 I NAG 930 n VA 6 NAG 1 v NAG 1 I NAG 933 n VA 6 NAG 2 v NAG 2 I NAG 934 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier BMA 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpb BMA 'COMMON NAME' GMML 1.0 b-D-mannopyranose BMA 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-Manp BMA 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man MAN 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DManpa MAN 'COMMON NAME' GMML 1.0 a-D-mannopyranose MAN 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 a-D-Manp MAN 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 Man NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # loop_ _pdbx_entity_branch.entity_id _pdbx_entity_branch.type 5 oligosaccharide 6 oligosaccharide 7 oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 5 DManpa1-3DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 5 'WURCS=2.0/3,4,3/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 5 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 4 6 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 5 6 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 6 6 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? 7 7 DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 8 7 'WURCS=2.0/2,3,2/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5]/1-1-2/a4-b1_b4-c1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 9 7 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{}}}}' LINUCS PDB-CARE ? # 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_pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #