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EA 5 MG 1 502 4 MG MG D . # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6VFS _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6VFS _struct.title 'ClpXP from Neisseria meningitidis - Conformation A' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6VFS _struct_keywords.text 'Complex, AAA+, protease, ClpP, ClpX, HYDROLASE' _struct_keywords.pdbx_keywords HYDROLASE # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 1 ? E N N 1 ? F N N 1 ? G N N 2 ? H N N 3 ? I N N 3 ? J N N 3 ? K N N 3 ? L N N 3 ? M N N 3 ? N N N 3 ? O N N 3 ? P N N 3 ? Q N N 3 ? R N N 3 ? S N N 3 ? T N N 3 ? U N N 3 ? V N N 4 ? W N N 5 ? X N N 6 ? Y N N 6 ? Z N N 4 ? AA N N 5 ? BA N N 4 ? CA N N 5 ? DA N N 4 ? EA N N 5 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP A0A0Y4ZJG4_NEIME A0A0Y4ZJG4 ? 1 ;MSNENRTCSFCGKSKSHVKHLIEGENAFICDECVSNCIEILHEDGNDGTPSESAGGEPEESGKLPTPAEIVANLNDHVIG QEQAKKALAVSVYNHYKRLRHPKAGANVELSKSNILLIGPTGSGKTLLAQSLARKLDVPFVMADATTLTEAGYVGEDVEQ IITKLLGKCDFDVEKAQRGIVYIDEIDKISRKSDNPSITRDVSGEGVQQALLKLIEGTVASVPPQGGRKHPNQEFINVDT TNILFICGGAFAGLEKVIRQRTEKGGIGFGASVHSKDENADITKLFGIVEPEDLIKFGLIPELIGRLPVIATLEELDEDA LINILTEPKNALVKQYQALFGMENVELEFEEGALRSIARQAMERKTGARGLRSIVERCLLDTMYRLPDLKGLKKVVVGKA VIEEGREPELVFES ; 1 2 PDB 6VFS 6VFS ? 2 ? 1 3 UNP A0A0Y5K536_NEIME A0A0Y5K536 ? 3 ;MSFDNYLVPTVIEQSGRGERAFDIYSRLLKERIVFLVGPVTDESANLVVAQLLFLESENPDKDIFFYINSPGGSVTAGMS IYDTMNFIKPDVSTLCLGQAASMGAFLLSAGEKGKRFALPNSRIMIHQPLISGGLGGQASDIEIHARELLKIKEKLNRLM AKHCGRDLADLERDTDRDNFMSAEEAKEYGLIDQILENRASLRL ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6VFS E 1 ? 414 ? 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GLU E 350 ARG E 364 1 ? 15 HELX_P HELX_P16 AB7 LYS A 365 ? ALA A 368 ? LYS E 365 ALA E 368 5 ? 4 HELX_P HELX_P17 AB8 ARG A 369 ? LEU A 386 ? ARG E 369 LEU E 386 1 ? 18 HELX_P HELX_P18 AB9 GLY A 398 ? GLU A 404 ? GLY E 398 GLU E 404 1 ? 7 HELX_P HELX_P19 AC1 THR B 66 ? ASN B 75 ? THR A 66 ASN A 75 1 ? 10 HELX_P HELX_P20 AC2 GLN B 81 ? LEU B 99 ? GLN A 81 LEU A 99 1 ? 19 HELX_P HELX_P21 AC3 GLY B 124 ? LEU B 136 ? GLY A 124 LEU A 136 1 ? 13 HELX_P HELX_P22 AC4 THR B 146 ? LEU B 148 ? THR A 146 LEU A 148 5 ? 3 HELX_P HELX_P23 AC5 ASP B 157 ? VAL B 158 ? ASP A 157 VAL A 158 5 ? 2 HELX_P HELX_P24 AC6 GLU B 159 ? CYS B 169 ? GLU A 159 CYS A 169 1 ? 11 HELX_P HELX_P25 AC7 ASP B 172 ? GLN B 177 ? ASP A 172 GLN A 177 1 ? 6 HELX_P HELX_P26 AC8 GLN B 185 ? ILE B 189 ? GLN A 185 ILE A 189 5 ? 5 HELX_P HELX_P27 AC9 GLY B 206 ? GLU B 216 ? GLY A 206 GLU A 216 1 ? 11 HELX_P HELX_P28 AD1 THR B 241 ? ILE B 243 ? THR A 241 ILE A 243 5 ? 3 HELX_P HELX_P29 AD2 GLY B 253 ? GLN B 260 ? 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ALA N 183 GLY N 190 1 ? 8 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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O3G ? ? ? 1_555 CA MG . MG ? ? B ATP 501 B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.174 ? ? metalc11 metalc ? ? BA ATP . O1B ? ? ? 1_555 CA MG . MG ? ? B ATP 501 B MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.213 ? ? metalc12 metalc ? ? F THR 126 OG1 ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? D THR 126 D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.640 ? ? metalc13 metalc ? ? DA ATP . O1G ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? D ATP 501 D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.635 ? ? metalc14 metalc ? ? DA ATP . O3G ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? D ATP 501 D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.815 ? ? metalc15 metalc ? ? DA ATP . O1B ? ? ? 1_555 EA MG . MG ? ? D ATP 501 D MG 502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.145 ? ? # _struct_conn_type.id metalc _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG1 ? 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C ATP 501 ? 1_555 128.3 ? 10 OG1 ? D THR 126 ? C THR 126 ? 1_555 MG ? AA MG . ? C MG 502 ? 1_555 O1B ? Z ATP . ? C ATP 501 ? 1_555 118.7 ? 11 OD2 ? D ASP 184 ? C ASP 184 ? 1_555 MG ? AA MG . ? C MG 502 ? 1_555 O1B ? Z ATP . ? C ATP 501 ? 1_555 144.6 ? 12 O1G ? Z ATP . ? C ATP 501 ? 1_555 MG ? AA MG . ? C MG 502 ? 1_555 O1B ? Z ATP . ? C ATP 501 ? 1_555 80.1 ? 13 OG1 ? E THR 126 ? B THR 126 ? 1_555 MG ? CA MG . ? B MG 502 ? 1_555 O3G ? BA ATP . ? B ATP 501 ? 1_555 156.0 ? 14 OG1 ? E THR 126 ? B THR 126 ? 1_555 MG ? CA MG . ? B MG 502 ? 1_555 O1B ? BA ATP . ? B ATP 501 ? 1_555 84.3 ? 15 O3G ? BA ATP . ? B ATP 501 ? 1_555 MG ? CA MG . ? B MG 502 ? 1_555 O1B ? BA ATP . ? B ATP 501 ? 1_555 71.9 ? 16 OG1 ? F THR 126 ? D THR 126 ? 1_555 MG ? EA MG . ? D MG 502 ? 1_555 O1G ? DA ATP . ? D ATP 501 ? 1_555 111.6 ? 17 OG1 ? F THR 126 ? D THR 126 ? 1_555 MG ? EA MG . ? D MG 502 ? 1_555 O3G ? DA ATP . ? D ATP 501 ? 1_555 159.6 ? 18 O1G ? DA ATP . ? D ATP 501 ? 1_555 MG ? EA MG . ? 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