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4 61 ARG n 4 62 PHE n 4 63 SER n 4 64 GLY n 4 65 SER n 4 66 GLY n 4 67 ALA n 4 68 GLY n 4 69 THR n 4 70 ASP n 4 71 PHE n 4 72 THR n 4 73 LEU n 4 74 THR n 4 75 ILE n 4 76 SER n 4 77 SER n 4 78 LEU n 4 79 GLN n 4 80 PRO n 4 81 GLU n 4 82 ASP n 4 83 PHE n 4 84 ALA n 4 85 LEU n 4 86 TYR n 4 87 TYR n 4 88 CYS n 4 89 GLN n 4 90 GLN n 4 91 HIS n 4 92 ASN n 4 93 ASN n 4 94 TYR n 4 95 PRO n 4 96 LEU n 4 97 THR n 4 98 PHE n 4 99 GLY n 4 100 PRO n 4 101 GLY n 4 102 THR n 4 103 LYS n 4 104 VAL n 4 105 ASP n 4 106 ILE n 4 107 LYS n # loop_ _entity_src_gen.entity_id _entity_src_gen.pdbx_src_id _entity_src_gen.pdbx_alt_source_flag _entity_src_gen.pdbx_seq_type _entity_src_gen.pdbx_beg_seq_num _entity_src_gen.pdbx_end_seq_num _entity_src_gen.gene_src_common_name _entity_src_gen.gene_src_genus _entity_src_gen.pdbx_gene_src_gene _entity_src_gen.gene_src_species _entity_src_gen.gene_src_strain _entity_src_gen.gene_src_tissue _entity_src_gen.gene_src_tissue_fraction _entity_src_gen.gene_src_details _entity_src_gen.pdbx_gene_src_fragment _entity_src_gen.pdbx_gene_src_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_gene_src_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.pdbx_gene_src_variant _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell_line _entity_src_gen.pdbx_gene_src_atcc _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organ _entity_src_gen.pdbx_gene_src_organelle _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cell _entity_src_gen.pdbx_gene_src_cellular_location _entity_src_gen.host_org_common_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_scientific_name _entity_src_gen.pdbx_host_org_ncbi_taxonomy_id _entity_src_gen.host_org_genus _entity_src_gen.pdbx_host_org_gene _entity_src_gen.pdbx_host_org_organ _entity_src_gen.host_org_species _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue _entity_src_gen.pdbx_host_org_tissue_fraction _entity_src_gen.pdbx_host_org_strain _entity_src_gen.pdbx_host_org_variant _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell_line _entity_src_gen.pdbx_host_org_atcc _entity_src_gen.pdbx_host_org_culture_collection _entity_src_gen.pdbx_host_org_cell _entity_src_gen.pdbx_host_org_organelle _entity_src_gen.pdbx_host_org_cellular_location _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector_type _entity_src_gen.pdbx_host_org_vector _entity_src_gen.host_org_details _entity_src_gen.expression_system_id _entity_src_gen.plasmid_name _entity_src_gen.plasmid_details _entity_src_gen.pdbx_description 1 1 sample 'Biological sequence' 1 475 HIV-1 ? env ? ? ? ? ? ? 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HEK293F ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP Q2N0S6_9HIV1 Q2N0S6 ? 1 ;AENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIIS LWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKE YRLINCNTSAITQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEV MIRSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQAFYATGDIIGDIRQAHCTVSKATWNETLGKVVKQLRK HFGNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQ AMYAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRAKRRVVG ; 30 2 UNP Q2N0S6_9HIV1 Q2N0S6 ? 2 ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAIEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICTTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; 509 3 PDB 6VO1 6VO1 ? 3 ? 1 4 PDB 6VO1 6VO1 ? 4 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6VO1 A 1 ? 475 ? 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UNP Q2N0S6 THR 330 conflict 332 20 9 6VO1 CYS D 469 ? UNP Q2N0S6 ALA 498 conflict 501 21 10 6VO1 PRO F 48 ? UNP Q2N0S6 ILE 556 conflict 559 22 10 6VO1 CYS F 50 ? UNP Q2N0S6 ALA 558 conflict 561 23 10 6VO1 CYS F 94 ? UNP Q2N0S6 THR 602 conflict 605 24 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose 'beta-D-mannose; D-mannose; mannose' 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 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'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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A ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 N NAG . C1 ? ? A ASN 156 N NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.454 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? A ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 O NAG . C1 ? ? A ASN 160 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? N-Glycosylation covale5 covale one ? A ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? A ASN 197 A NAG 629 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.456 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? A ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 P NAG . C1 ? ? A ASN 234 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? N-Glycosylation covale7 covale one ? A ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 Q NAG . C1 ? ? A ASN 262 Q NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.463 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? A ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 R NAG . C1 ? ? A ASN 276 R NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.470 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? A ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? A ASN 295 A NAG 618 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? A ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 S NAG . C1 ? ? A ASN 332 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? A ASN 308 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? A ASN 339 A NAG 627 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? A ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? A ASN 355 A NAG 626 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.472 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? A ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? A ASN 386 A NAG 621 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.473 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? A ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 T NAG . C1 ? ? A ASN 392 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.464 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? A ASN 416 ND2 ? ? ? 1_555 U NAG . C1 ? ? A ASN 448 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.470 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? E ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 V NAG . C1 ? ? C ASN 88 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? E ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? C ASN 133 C NAG 628 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.470 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? E ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 W NAG . C1 ? ? C ASN 156 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? 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C1 ? ? l NAG 1 l NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.416 ? ? covale87 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? m NAG 1 m NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.414 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 SER 7 D . ? SER 7 L PRO 8 D ? 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AE9 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA2 4 5 ? anti-parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA4 2 3 ? anti-parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA6 2 3 ? anti-parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA6 5 6 ? anti-parallel AA6 6 7 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA7 3 4 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? anti-parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? anti-parallel AB2 3 4 ? anti-parallel AB2 4 5 ? anti-parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB3 3 4 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel AB5 1 2 ? parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB5 3 4 ? anti-parallel AB5 4 5 ? anti-parallel AB5 5 6 ? anti-parallel AB6 1 2 ? parallel AB6 2 3 ? anti-parallel AB6 3 4 ? anti-parallel AB7 1 2 ? anti-parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB8 1 2 ? anti-parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB8 4 5 ? anti-parallel AB9 1 2 ? anti-parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC3 3 4 ? anti-parallel AC3 4 5 ? anti-parallel AC3 5 6 ? anti-parallel AC3 6 7 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? anti-parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC7 2 3 ? anti-parallel AC7 3 4 ? anti-parallel AC8 1 2 ? parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC8 4 5 ? anti-parallel AC8 5 6 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? anti-parallel AC9 3 4 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD1 2 3 ? anti-parallel AD1 3 4 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD2 4 5 ? anti-parallel AD2 5 6 ? anti-parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD5 2 3 ? anti-parallel AD5 3 4 ? anti-parallel AD5 4 5 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD8 1 2 ? anti-parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AD9 4 5 ? anti-parallel AD9 5 6 ? anti-parallel AD9 6 7 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE1 3 4 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE4 2 3 ? anti-parallel AE4 3 4 ? anti-parallel AE5 1 2 ? parallel AE5 2 3 ? anti-parallel AE5 3 4 ? anti-parallel AE5 4 5 ? anti-parallel AE5 5 6 ? anti-parallel AE6 1 2 ? parallel AE6 2 3 ? anti-parallel AE6 3 4 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE7 2 3 ? anti-parallel AE7 3 4 ? anti-parallel AE8 1 2 ? parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE8 3 4 ? anti-parallel AE8 4 5 ? anti-parallel AE8 5 6 ? anti-parallel AE9 1 2 ? parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AE9 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 462 ? 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VAL C 116 ? VAL H 107 VAL H 111 AB3 3 ALA C 93 ? SER C 101 ? ALA H 88 SER H 96 AB3 4 ASP C 104 ? TRP C 108 ? ASP H 99 TRP H 103 AB4 1 MET D 4 ? SER D 7 ? MET L 4 SER L 7 AB4 2 VAL D 19 ? ALA D 25 ? VAL L 19 ALA L 25 AB4 3 ASP D 70 ? ILE D 75 ? ASP L 70 ILE L 75 AB4 4 PHE D 62 ? ALA D 67 ? PHE L 62 ALA L 67 AB5 1 SER D 10 ? ALA D 13 ? SER L 10 ALA L 13 AB5 2 THR D 102 ? ILE D 106 ? THR L 102 ILE L 106 AB5 3 LEU D 85 ? GLN D 90 ? LEU L 85 GLN L 90 AB5 4 LEU D 33 ? GLN D 38 ? LEU L 33 GLN L 38 AB5 5 LYS D 45 ? TYR D 49 ? LYS L 45 TYR L 49 AB5 6 ASN D 53 ? LEU D 54 ? ASN L 53 LEU L 54 AB6 1 SER D 10 ? ALA D 13 ? SER L 10 ALA L 13 AB6 2 THR D 102 ? ILE D 106 ? THR L 102 ILE L 106 AB6 3 LEU D 85 ? GLN D 90 ? LEU L 85 GLN L 90 AB6 4 THR D 97 ? PHE D 98 ? THR L 97 PHE L 98 AB7 1 LEU E 462 ? THR E 467 ? LEU C 494 THR C 499 AB7 2 TRP E 5 ? TYR E 10 ? TRP C 35 TYR C 40 AB7 3 ILE F 92 ? PRO F 98 ? ILE E 603 PRO E 609 AB8 1 TRP E 15 ? ASP E 17 ? TRP C 45 ASP C 47 AB8 2 TYR E 454 ? ILE E 459 ? 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'Macaca mulatta' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain ? 2 1 9606 'Homo sapiens' ? ? ? 3 2 9606 'Homo sapiens' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode COUNTING _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? 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_pdbx_entity_nonpoly.entity_id 8 _pdbx_entity_nonpoly.name 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose _pdbx_entity_nonpoly.comp_id NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #