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_citation.page_first 482 _citation.page_last 482 _citation.title 'Structural basis of redox modulation on chloroplast ATP synthase.' _citation.year 2020 _citation.database_id_CSD ? _citation.pdbx_database_id_DOI 10.1038/s42003-020-01221-8 _citation.pdbx_database_id_PubMed 32879423 _citation.unpublished_flag ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Yang, J.H.' 1 ? primary 'Williams, D.' 2 ? primary 'Kandiah, E.' 3 ? primary 'Fromme, P.' 4 ? primary 'Chiu, P.L.' 5 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer nat 'ATP synthase subunit alpha, chloroplastic' 55505.199 3 7.1.2.2 ? ? ? 2 polymer nat 'ATP synthase subunit beta, chloroplastic' 53797.367 3 7.1.2.2 ? ? ? 3 polymer nat 'ATP synthase delta chain, chloroplastic' 27708.582 1 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;MANMLVASSSKTLPTTTTTTITPKPKFPLLKTPLLKLSPPQLPPLKHLNLSVLKSAAITATPLTLSFLLPYPSLAEEIEK ASLFDFNLTLPIIMAEFLFLMFALDKIYYTPLGDFMDKRDASIKEQLSGVKDTSSEVKQLEEQANAVMRAARAEISAALN KMKKETQLEVEAKLAEGRKKIEVELQEALGSLEQQKEDTIKSLDSQISALSDDIVKKVLPVS ; J ? 8 'polypeptide(L)' no no ;MNVLSYSINPLKGLYAISGVEVGQHFYWQIGGFQIHGQVLITSWVVIAILLGSAAIAVRSPQTIPTGGQNFFEYVLEFIR DVSKTQIGEEYRPWVPFIGTMFLFIFVSNWSGALLPWKIIQLPHGELAAPTNDINTTVALALLTSVAYFYAGLTKKGLGY FGKYIQPTPILLPINILEDFTKPLSLSFRLFGNILADELVVVVLVSLVPLVVPIPVMFLGLFTSGIQALIFATLAAAYIG ESLEGHH ; ;MNVLSYSINPLKGLYAISGVEVGQHFYWQIGGFQIHGQVLITSWVVIAILLGSAAIAVRSPQTIPTGGQNFFEYVLEFIR DVSKTQIGEEYRPWVPFIGTMFLFIFVSNWSGALLPWKIIQLPHGELAAPTNDINTTVALALLTSVAYFYAGLTKKGLGY FGKYIQPTPILLPINILEDFTKPLSLSFRLFGNILADELVVVVLVSLVPLVVPIPVMFLGLFTSGIQALIFATLAAAYIG ESLEGHH ; a ? 9 'polypeptide(L)' no no ;MNPLIAAASVIAAGLAVGLASIGPGVGQGTAAGQAVEGIARQPEAEGKIRGTLLLSLAFMEALTIYGLVVALALLFANPF V ; ;MNPLIAAASVIAAGLAVGLASIGPGVGQGTAAGQAVEGIARQPEAEGKIRGTLLLSLAFMEALTIYGLVVALALLFANPF V ; M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z ? # 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'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.8605 ? 53861 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0495 ? 6436 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.0061 ? 6946 ? f_plane_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 17.8442 ? 24101 ? f_dihedral_angle_d ? ? # _struct.entry_id 6VON _struct.title 'Chloroplast ATP synthase (R1, CF1FO)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6VON _struct_keywords.text 'CF1FO, ATP synthase, PHOTOSYNTHESIS, TRANSLOCASE' _struct_keywords.pdbx_keywords 'TRANSLOCASE, PHOTOSYNTHESIS' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? C N N 1 ? D N N 2 ? E N N 2 ? F N N 2 ? G N N 3 ? H N N 4 ? I N N 5 ? J N N 6 ? K N N 7 ? L N N 8 ? M N N 9 ? N N N 9 ? O N N 9 ? P N N 9 ? Q N N 9 ? R N N 9 ? S N N 9 ? T N N 9 ? U N N 9 ? V N N 9 ? 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GA N N 12 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP ATPA_SPIOL P06450 ? 1 ;MATIRADEISKIIRERIEGYNREVKVVNTGTVLQVGDGIARIHGLDEVMAGELVEFEEGTIGIALNLESNNVGVVLMGDG LMIQEGSSVKATGRIAQIPVSEAYLGRVINALAKPIDGRGEITASESRLIESPAPGIMSRRSVYEPLQTGLIAIDAMIPV GRGQRELIIGDRQTGKTAVATDTILNQQGQNVICVYVAIGQKASSVAQVVTNFQERGAMEYTIVVAETADSPATLQYLAP YTGAALAEYFMYRERHTLIIYDDLSKQAQAYRQMSLLLRRPPGREAYPGDVFYLHSRLLERAAKLSSLLGEGSMTALPIV ETQAGDVSAYIPTNVISITDGQIFLSADLFNAGIRPAINVGISVSRVGSAAQIKAMKKVAGKLKLELAQFAELEAFAQFA SDLDKATQNQLARGQRLRELLKQPQSAPLTVEEQVMTIYTGTNGYLDSLELDQVRKYLVELRTYVKTNKPEFQEIISSTK TFTEEAEALLKEAIQEQMERFLLQEQA ; 1 2 UNP ATPB_SPIOL P00825 ? 2 ;MRINPTTSDPGVSTLEKKNLGRIAQIIGPVLDVAFPPGKMPNIYNALIVKGRDTAGQPMNVTCEVQQLLGNNRVRAVAMS ATDGLTRGMEVIDTGAPLSVPVGGATLGRIFNVLGEPVDNLGPVDTRTTSPIHRSAPAFTQLDTKLSIFETGIKVVDLLA PYRRGGKIGLFGGAGVGKTVLIMELINNIAKAHGGVSVFGGVGERTREGNDLYMEMKESGVINEQNIAESKVALVYGQMN EPPGARMRVGLTALTMAEYFRDVNEQDVLLFIDNIFRFVQAGSEVSALLGRMPSAVGYQPTLSTEMGSLQERITSTKEGS ITSIQAVYVPADDLTDPAPATTFAHLDATTVLSRGLAAKGIYPAVDPLDSTSTMLQPRIVGEEHYEIAQRVKETLQRYKE LQDIIAILGLDELSEEDRLTVARARKIERFLSQPFFVAEVFTGSPGKYVGLAETIRGFQLILSGELDSLPEQAFYLVGNI DEATAKAMNLEMESKLKK ; 1 3 UNP ATPD_SPIOL P11402 ? 3 ;MAALQNPVALQSRTTTAVAALSTSSTTSTPKPFSLSFSSSTATFNPLRLKILTASKLTAKPRGGALGTRMVDSTASRYAS ALADVADVTGTLEATNSDVEKLIRIFSEEPVYYFFANPVISIDNKRSVLDEIITTSGLQPHTANFINILIDSERINLVKE ILNEFEDVFNKITGTEVAVVTSVVKLENDHLAQIAKGVQKITGAKNVRIKTVIDPSLVAGFTIRYGNEGSKLVDMSVKKQ LEEIAAQLEMDDVTLAV ; 1 4 UNP ATPG_SPIOL P05435 ? 4 ;MACSLSFSSSVSTFHLPTTTQSTQAPPNNATTLPTTNPIQCANLRELRDRIGSVKNTQKITEAMKLVAAAKVRRAQEAVV NGRPFSETLVEVLYNMNEQLQTEDVDVPLTKIRTVKKVALMVVTGDRGLCGGFNNMLLKKAESRIAELKKLGVDYTIISI GKKGNTYFIRRPEIPVDRYFDGTNLPTAKEAQAIADDVFSLFVSEEVDKVEMLYTKFVSLVKSDPVIHTLLPLSPKGEIC DINGKCVDAAEDELFRLTTKEGKLTVERDMIKTETPAFSPILEFEQDPAQILDALLPLYLNSQILRALQESLASELAARM TAMSNATDNANELKKTLSINYNRARQAKITGEILEIVAGANACV ; 1 5 UNP ATPE_SPIOL P00833 ? 5 ;MTLNLCVLTPNRSIWNSEVKEIILSTNSGQIGVLPNHAPTATAVDIGILRIRLNDQWLTLALMGGFARIGNNEITILVND AERGSDIDPQEAQQTLEIAEANLRKAEGKRQKIEANLALRRARTRVEASNTISS ; 1 6 UNP ATPF_SPIOL P06453 ? 6 ;MKNVTDSFVFLGHWPSAGSFGFNTDILATNLINLSVVLGVLIFFGKGVLSDLLDNRKQRILNTIRNSEELRGKAIEQLEK ARARLKKVEMDADQFRVNGYSEIEREKMNLINSTYKTLEQFENYKNETIQFEQQKAINQVRQRVFQQALQGALGTLNSCL NNELHLRTINANIGMFGAMNEITD ; 1 7 UNP ATPX_SPIOL P31853 ? 7 ;MANMLVASSSKTLPTTTTTTITPKPKFPLLKTPLLKLSPPQLPPLKHLNLSVLKSAAITATPLTLSFLLPYPSLAEEIEK ASLFDFNLTLPIIMAEFLFLMFALDKIYYTPLGDFMDKRDASIKEQLSGVKDTSSEVKQLEEQANAVMRAARAEISAALN KMKKETQLEVEAKLAEGRKKIEVELQEALGSLEQQKEDTIKSLDSQISALSDDIVKKVLPVS ; 1 8 UNP ATPI_SPIOL P06451 ? 8 ;MNVLSYSINPLKGLYAISGVEVGQHFYWQIGGFQIHGQVLITSWVVIAILLGSAAIAVRSPQTIPTGGQNFFEYVLEFIR DVSKTQIGEEYRPWVPFIGTMFLFIFVSNWSGALLPWKIIQLPHGELAAPTNDINTTVALALLTSVAYFYAGLTKKGLGY FGKYIQPTPILLPINILEDFTKPLSLSFRLFGNILADELVVVVLVSLVPLVVPIPVMFLGLFTSGIQALIFATLAAAYIG ESLEGHH ; 1 9 UNP ATPH_SPIOL P69447 ? 9 ;MNPLIAAASVIAAGLAVGLASIGPGVGQGTAAGQAVEGIARQPEAEGKIRGTLLLSLAFMEALTIYGLVVALALLFANPF V ; 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6VON A 1 ? 507 ? 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P69447 1 ? 81 ? 1 81 25 9 6VON Y 1 ? 81 ? P69447 1 ? 81 ? 1 81 26 9 6VON Z 1 ? 81 ? 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ALA Z 45 PHE Z 76 1 ? 32 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ARG 355 A . ? ARG 355 A PRO 356 A ? PRO 356 A 1 1.62 2 ARG 355 C . ? ARG 355 C PRO 356 C ? PRO 356 C 1 0.63 3 TYR 362 D . ? TYR 362 D PRO 363 D ? PRO 363 D 1 1.25 4 TYR 362 E . ? TYR 362 E PRO 363 E ? 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ASP D 267 ASP D 273 AB5 5 SER D 320 ? TYR D 328 ? SER D 320 TYR D 328 AB5 6 ILE D 168 ? GLY D 172 ? ILE D 168 GLY D 172 AB6 1 ILE D 148 ? PHE D 149 ? ILE D 148 PHE D 149 AB6 2 TYR D 162 ? ARG D 163 ? TYR D 162 ARG D 163 AB7 1 SER E 99 ? PRO E 101 ? SER E 99 PRO E 101 AB7 2 THR E 129 ? PRO E 131 ? THR E 129 PRO E 131 AB8 1 ILE E 110 ? PHE E 111 ? ILE E 110 PHE E 111 AB8 2 VAL E 232 ? GLN E 238 ? VAL E 232 GLN E 238 AB8 3 SER E 197 ? GLU E 204 ? SER E 197 GLU E 204 AB8 4 ASP E 267 ? ILE E 272 ? ASP E 267 ILE E 272 AB8 5 SER E 320 ? ALA E 326 ? SER E 320 ALA E 326 AB8 6 LYS E 167 ? LEU E 170 ? LYS E 167 LEU E 170 AB8 7 LEU E 346 ? THR E 350 ? LEU E 346 THR E 350 AB8 8 THR E 371 ? SER E 372 ? THR E 371 SER E 372 AB9 1 ILE E 148 ? PHE E 149 ? ILE E 148 PHE E 149 AB9 2 TYR E 162 ? ARG E 163 ? TYR E 162 ARG E 163 AC1 1 SER F 99 ? PRO F 101 ? SER F 99 PRO F 101 AC1 2 THR F 129 ? PRO F 131 ? THR F 129 PRO F 131 AC2 1 VAL F 232 ? GLY F 237 ? VAL F 232 GLY F 237 AC2 2 SER F 197 ? VAL F 202 ? 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