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'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6VWH _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _refine.pdbx_refine_id 'ELECTRON MICROSCOPY' _refine.entry_id 6VWH _refine.pdbx_diffrn_id ? _refine.pdbx_TLS_residual_ADP_flag ? _refine.ls_number_reflns_obs ? _refine.ls_number_reflns_all ? _refine.pdbx_ls_sigma_I ? _refine.pdbx_ls_sigma_F ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_low_absF ? _refine.pdbx_data_cutoff_high_rms_absF ? _refine.ls_d_res_low ? _refine.ls_d_res_high . _refine.ls_percent_reflns_obs ? _refine.ls_R_factor_obs ? _refine.ls_R_factor_all ? _refine.ls_R_factor_R_work ? _refine.ls_R_factor_R_free ? _refine.ls_R_factor_R_free_error ? _refine.ls_R_factor_R_free_error_details ? _refine.ls_percent_reflns_R_free ? _refine.ls_number_reflns_R_free ? _refine.ls_number_parameters ? _refine.ls_number_restraints ? _refine.occupancy_min ? _refine.occupancy_max ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc ? _refine.correlation_coeff_Fo_to_Fc_free ? _refine.B_iso_mean ? _refine.aniso_B[1][1] ? _refine.aniso_B[2][2] ? _refine.aniso_B[3][3] ? _refine.aniso_B[1][2] ? _refine.aniso_B[1][3] ? _refine.aniso_B[2][3] ? _refine.solvent_model_details ? _refine.solvent_model_param_ksol ? _refine.solvent_model_param_bsol ? _refine.pdbx_solvent_vdw_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_ion_probe_radii ? _refine.pdbx_solvent_shrinkage_radii ? _refine.pdbx_ls_cross_valid_method ? _refine.details ? _refine.pdbx_starting_model ? _refine.pdbx_method_to_determine_struct ? _refine.pdbx_isotropic_thermal_model ? _refine.pdbx_stereochemistry_target_values ? _refine.pdbx_stereochem_target_val_spec_case ? _refine.pdbx_R_Free_selection_details ? _refine.pdbx_overall_ESU_R ? _refine.pdbx_overall_ESU_R_Free ? _refine.overall_SU_ML ? _refine.pdbx_overall_phase_error ? _refine.overall_SU_B ? _refine.overall_SU_R_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Cruickshank_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_Blow_DPI ? _refine.pdbx_overall_SU_R_free_Blow_DPI ? # loop_ _refine_ls_restr.pdbx_refine_id _refine_ls_restr.criterion _refine_ls_restr.dev_ideal _refine_ls_restr.dev_ideal_target _refine_ls_restr.number _refine_ls_restr.rejects _refine_ls_restr.type _refine_ls_restr.weight _refine_ls_restr.pdbx_restraint_function 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.004 ? 8572 ? f_bond_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.871 ? 15423 ? f_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 13.707 ? 3539 ? f_dihedral_angle_d ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.058 ? 640 ? f_chiral_restr ? ? 'ELECTRON MICROSCOPY' ? 0.005 ? 1283 ? f_plane_restr ? ? # _struct.entry_id 6VWH _struct.title ;Leg region of the open conformation of the human type 1 insulin-like growth factor receptor ectodomain in complex with human insulin-like growth factor II. ; _struct.pdbx_descriptor 'Insulin-like growth factor 1 receptor (E.C.2.7.10.1)' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6VWH _struct_keywords.text 'Type 1 insulin-like growth factor receptor, Insulin-like growth factor II, ectodomain receptor, tyrosine kinase, SIGNALING PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'SIGNALING PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 1 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLU A 684 ? HIS A 697 ? GLU A 684 HIS A 697 1 ? 14 HELX_P HELX_P2 AA2 GLU A 779 ? GLY A 784 ? GLU A 779 GLY A 784 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 ASP B 12 ? LYS B 17 ? ASP B 12 LYS B 17 1 ? 6 HELX_P HELX_P4 AA4 ARG B 18 ? CYS B 22 ? ARG B 18 CYS B 22 5 ? 5 HELX_P HELX_P5 AA5 ASP B 126 ? LEU B 131 ? ASP B 126 LEU B 131 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 ALA B 133 ? ASN B 137 ? ALA B 133 ASN B 137 5 ? 5 HELX_P HELX_P7 AA7 PRO B 144 ? GLY B 149 ? PRO B 144 GLY B 149 1 ? 6 HELX_P HELX_P8 AA8 ARG B 249 ? ILE B 255 ? ARG B 249 ILE B 255 1 ? 7 HELX_P HELX_P9 AA9 GLU B 779 ? GLY B 784 ? GLU B 779 GLY B 784 1 ? 6 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order disulf1 disulf ? ? A CYS 776 SG ? ? ? 1_555 A CYS 785 SG ? ? A CYS 776 A CYS 785 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? disulf2 disulf ? ? B CYS 3 SG ? ? ? 1_555 B CYS 22 SG ? ? B CYS 3 B CYS 22 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? disulf3 disulf ? ? B CYS 120 SG ? ? ? 1_555 B CYS 148 SG ? ? B CYS 120 B CYS 148 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf4 disulf ? ? B CYS 152 SG ? ? ? 1_555 B CYS 175 SG ? ? B CYS 152 B CYS 175 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf5 disulf ? ? B CYS 162 SG ? ? ? 1_555 B CYS 181 SG ? ? B CYS 162 B CYS 181 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.025 ? disulf6 disulf ? ? B CYS 185 SG ? ? ? 1_555 B CYS 194 SG ? ? B CYS 185 B CYS 194 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? disulf7 disulf ? ? B CYS 189 SG ? ? ? 1_555 B CYS 200 SG ? ? B CYS 189 B CYS 200 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? disulf8 disulf ? ? B CYS 201 SG ? ? ? 1_555 B CYS 209 SG ? ? B CYS 201 B CYS 209 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? disulf9 disulf ? ? B CYS 205 SG ? ? ? 1_555 B CYS 218 SG ? ? B CYS 205 B CYS 218 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.021 ? disulf10 disulf ? ? B CYS 221 SG ? ? ? 1_555 B CYS 230 SG ? ? B CYS 221 B CYS 230 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? disulf11 disulf ? ? B CYS 234 SG ? ? ? 1_555 B CYS 246 SG ? ? B CYS 234 B CYS 246 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? disulf12 disulf ? ? B CYS 252 SG ? ? ? 1_555 B CYS 273 SG ? ? B CYS 252 B CYS 273 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? disulf13 disulf ? ? B CYS 277 SG ? ? ? 1_555 B CYS 291 SG ? ? B CYS 277 B CYS 291 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? disulf14 disulf ? ? B CYS 294 SG ? ? ? 1_555 B CYS 298 SG ? ? B CYS 294 B CYS 298 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? disulf15 disulf ? ? B CYS 776 SG ? ? ? 1_555 B CYS 785 SG ? ? B CYS 776 B CYS 785 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? # _struct_conn_type.id disulf _struct_conn_type.criteria ? _struct_conn_type.reference ? # _struct_mon_prot_cis.pdbx_id 1 _struct_mon_prot_cis.label_comp_id GLY _struct_mon_prot_cis.label_seq_id 4 _struct_mon_prot_cis.label_asym_id B _struct_mon_prot_cis.label_alt_id . _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code ? _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id GLY _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id 4 _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id B _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 5 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 B _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 ? _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 PRO _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 5 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 B _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num 1 _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle -4.60 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 3 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 5 ? AA4 ? 6 ? AA5 ? 2 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 2 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? anti-parallel AA1 2 3 ? anti-parallel AA2 1 2 ? anti-parallel AA2 2 3 ? anti-parallel AA2 3 4 ? anti-parallel AA3 1 2 ? parallel AA3 2 3 ? parallel AA3 3 4 ? parallel AA3 4 5 ? parallel AA4 1 2 ? parallel AA4 2 3 ? parallel AA4 3 4 ? parallel AA4 4 5 ? parallel AA4 5 6 ? parallel AA5 1 2 ? anti-parallel AA6 1 2 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AB1 1 2 ? anti-parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? anti-parallel AB2 1 2 ? anti-parallel AB3 1 2 ? anti-parallel AB3 2 3 ? anti-parallel AB4 1 2 ? anti-parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB4 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 585 ? 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CYS B 175 THR B 177 AA6 2 ARG B 180 ? CYS B 181 ? ARG B 180 CYS B 181 AA7 1 CYS B 194 ? THR B 195 ? CYS B 194 THR B 195 AA7 2 GLU B 199 ? CYS B 200 ? GLU B 199 CYS B 200 AA8 1 CYS B 205 ? CYS B 209 ? CYS B 205 CYS B 209 AA8 2 CYS B 218 ? CYS B 221 ? CYS B 218 CYS B 221 AA9 1 TYR B 224 ? TYR B 226 ? TYR B 224 TYR B 226 AA9 2 VAL B 229 ? VAL B 231 ? VAL B 229 VAL B 231 AB1 1 ARG B 245 ? ASP B 248 ? ARG B 245 ASP B 248 AB1 2 THR B 238 ? PHE B 241 ? THR B 238 PHE B 241 AB1 3 GLU B 272 ? MET B 274 ? GLU B 272 MET B 274 AB1 4 VAL B 267 ? HIS B 269 ? VAL B 267 HIS B 269 AB2 1 PHE B 281 ? ARG B 283 ? PHE B 281 ARG B 283 AB2 2 CYS B 291 ? PRO B 293 ? CYS B 291 PRO B 293 AB3 1 LEU B 585 ? ALA B 590 ? LEU B 585 ALA B 590 AB3 2 GLN B 596 ? ASN B 602 ? GLN B 596 ASN B 602 AB3 3 ARG B 757 ? SER B 761 ? ARG B 757 SER B 761 AB4 1 PHE B 747 ? ARG B 751 ? PHE B 747 ARG B 751 AB4 2 TYR B 613 ? ARG B 620 ? TYR B 613 ARG B 620 AB4 3 LEU B 768 ? CYS B 776 ? LEU B 768 CYS B 776 AB4 4 SER B 788 ? ARG B 794 ? SER B 788 ARG B 794 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N LEU A 588 ? 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