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ALA B 78 HIS B 84 1 ? 7 HELX_P HELX_P16 AB7 ARG B 100 ? GLY B 106 ? ARG B 100 GLY B 106 1 ? 7 HELX_P HELX_P17 AB8 THR B 110 ? GLY B 116 ? THR B 110 GLY B 116 1 ? 7 HELX_P HELX_P18 AB9 PRO B 125 ? TYR B 145 ? PRO B 125 TYR B 145 1 ? 21 HELX_P HELX_P19 AC1 PRO B 160 ? GLU B 175 ? PRO B 160 GLU B 175 1 ? 16 HELX_P HELX_P20 AC2 SER B 178 ? THR B 186 ? SER B 178 THR B 186 1 ? 9 HELX_P HELX_P21 AC3 ASN B 195 ? GLY B 206 ? ASN B 195 GLY B 206 1 ? 12 HELX_P HELX_P22 AC4 THR B 210 ? CYS B 218 ? THR B 210 CYS B 218 1 ? 9 HELX_P HELX_P23 AC5 SER C 16 ? GLU C 28 ? SER C 16 GLU C 28 1 ? 13 HELX_P HELX_P24 AC6 VAL C 36 ? SER C 41 ? VAL C 36 SER C 41 1 ? 6 HELX_P HELX_P25 AC7 THR C 48 ? ASN C 57 ? THR C 48 ASN C 57 1 ? 10 HELX_P HELX_P26 AC8 HIS C 62 ? HIS C 84 ? HIS C 62 HIS C 84 1 ? 23 HELX_P HELX_P27 AC9 ARG C 100 ? GLY C 106 ? ARG C 100 GLY C 106 1 ? 7 HELX_P HELX_P28 AD1 THR C 110 ? GLY C 116 ? THR C 110 GLY C 116 1 ? 7 HELX_P HELX_P29 AD2 PRO C 125 ? SER C 146 ? 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THR N 210 CYS N 218 1 ? 9 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASN 121 A . ? ASN 121 A PRO 122 A ? PRO 122 A 1 0.36 2 ASN 121 B . ? ASN 121 B PRO 122 B ? PRO 122 B 1 5.77 3 ASN 121 C . ? ASN 121 C PRO 122 C ? PRO 122 C 1 3.47 4 ASN 121 D . ? ASN 121 D PRO 122 D ? PRO 122 D 1 4.47 5 ASN 121 E . ? ASN 121 M PRO 122 E ? PRO 122 M 1 3.31 6 ASN 121 F . ? ASN 121 N PRO 122 F ? PRO 122 N 1 4.44 # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 2 ? AA2 ? 2 ? AA3 ? 2 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 2 ? 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MET N 10 HIS N 12 # loop_ _pdbx_struct_sheet_hbond.sheet_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_1 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_id_2 _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_1_auth_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_label_seq_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_PDB_ins_code _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_atom_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_comp_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_asym_id _pdbx_struct_sheet_hbond.range_2_auth_seq_id AA1 1 2 N VAL A 3 ? 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O VAL N 11 # loop_ _pdbx_validate_torsion.id _pdbx_validate_torsion.PDB_model_num _pdbx_validate_torsion.auth_comp_id _pdbx_validate_torsion.auth_asym_id _pdbx_validate_torsion.auth_seq_id _pdbx_validate_torsion.PDB_ins_code _pdbx_validate_torsion.label_alt_id _pdbx_validate_torsion.phi _pdbx_validate_torsion.psi 1 1 ASN A 5 ? ? -96.45 -159.77 2 1 GLU A 29 ? ? -146.10 -47.89 3 1 ALA A 31 ? ? 49.83 -99.62 4 1 GLU A 35 ? ? -99.64 32.56 5 1 ARG A 100 ? ? -115.29 -147.91 6 1 THR A 119 ? ? -117.20 76.33 7 1 PRO A 125 ? ? -66.01 82.74 8 1 LYS A 158 ? ? -145.03 53.16 9 1 GLU A 175 ? ? -63.36 88.63 10 1 ALA A 177 ? ? -163.55 -80.67 11 1 THR A 188 ? ? -146.97 11.14 12 1 LEU A 189 ? ? -148.22 -35.47 13 1 ASN A 193 ? ? -116.57 64.00 14 1 ALA A 194 ? ? -116.05 -163.36 15 1 ASN B 5 ? ? -97.04 -159.29 16 1 GLU B 29 ? ? -134.85 -50.01 17 1 ALA B 31 ? ? 49.89 -95.99 18 1 SER B 33 ? ? -106.95 -169.77 19 1 VAL B 59 ? ? -56.97 101.02 20 1 ARG B 100 ? ? -129.07 -156.03 21 1 THR B 119 ? ? -116.95 59.62 22 1 PRO B 125 ? ? -69.31 82.40 23 1 LYS B 158 ? ? -145.27 55.08 24 1 ALA B 177 ? ? -162.38 -169.29 25 1 THR B 188 ? ? -145.15 10.93 26 1 LEU B 189 ? ? -147.52 -39.73 27 1 ASN B 193 ? ? -114.80 62.36 28 1 ALA B 194 ? ? -115.55 -162.77 29 1 ASN C 5 ? ? -96.89 -158.90 30 1 GLU C 29 ? ? -136.02 -53.20 31 1 ALA C 31 ? ? 49.85 -92.42 32 1 ALA C 65 ? ? -142.75 -27.60 33 1 ARG C 100 ? ? -128.02 -155.85 34 1 THR C 119 ? ? -118.72 65.68 35 1 HIS C 120 ? ? -124.97 -168.30 36 1 PRO C 125 ? ? -69.81 80.54 37 1 PRO C 147 ? ? -92.39 36.78 38 1 ALA C 177 ? ? -162.15 -163.15 39 1 THR C 188 ? ? -115.00 70.01 40 1 LEU C 189 ? ? -165.20 -73.32 41 1 ALA C 194 ? ? -104.73 -161.08 42 1 ASN D 5 ? ? -96.33 -159.60 43 1 GLU D 29 ? ? -138.34 -50.88 44 1 ALA D 31 ? ? 49.85 -92.29 45 1 ARG D 100 ? ? -119.28 -154.22 46 1 THR D 119 ? ? -117.58 67.99 47 1 HIS D 120 ? ? -127.92 -169.66 48 1 PRO D 125 ? ? -65.91 82.31 49 1 GLU D 175 ? ? -63.04 88.45 50 1 ALA D 177 ? ? -163.62 -90.16 51 1 THR D 188 ? ? -146.82 10.27 52 1 LEU D 189 ? ? -147.77 -40.00 53 1 ASN D 193 ? ? -117.49 59.52 54 1 ALA D 194 ? ? -111.63 -155.03 55 1 ASN M 5 ? ? -96.59 -159.19 56 1 GLU M 29 ? ? -138.58 -50.06 57 1 ALA M 31 ? ? 49.87 -92.35 58 1 PHE M 32 ? ? -151.33 88.74 59 1 SER M 33 ? ? -117.66 -161.63 60 1 THR M 58 ? ? -141.14 27.10 61 1 ARG M 100 ? ? -128.38 -156.66 62 1 THR M 119 ? ? -117.64 63.75 63 1 HIS M 120 ? ? -123.37 -169.11 64 1 PRO M 125 ? ? -69.20 80.96 65 1 GLU M 175 ? ? -67.62 85.97 66 1 ALA M 177 ? ? -162.09 -168.14 67 1 THR M 188 ? ? -146.70 11.72 68 1 LEU M 189 ? ? -147.76 -39.24 69 1 ALA M 194 ? ? -100.99 -160.68 70 1 ASN N 5 ? ? -97.20 -159.47 71 1 GLU N 29 ? ? -136.42 -51.58 72 1 ALA N 31 ? ? 49.93 -92.30 73 1 SER N 33 ? ? -110.12 -169.54 74 1 VAL N 59 ? ? -58.29 95.54 75 1 ARG N 100 ? ? -128.90 -155.72 76 1 THR N 119 ? ? -117.43 61.33 77 1 PRO N 125 ? ? -68.84 82.31 78 1 LYS N 158 ? ? -143.67 57.06 79 1 THR N 188 ? ? -145.45 11.13 80 1 LEU N 189 ? ? -147.58 -39.74 81 1 ASN N 193 ? ? -116.61 60.30 82 1 ALA N 194 ? ? -113.27 -159.29 # _em_3d_fitting.entry_id 6VWS _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ? _em_3d_fitting.overall_b_value 204.64 _em_3d_fitting.ref_protocol 'RIGID BODY FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_fitting_list.3d_fitting_id 1 _em_3d_fitting_list.id 1 _em_3d_fitting_list.details ? _em_3d_fitting_list.pdb_chain_id A _em_3d_fitting_list.pdb_chain_residue_range 1-220 _em_3d_fitting_list.pdb_entry_id 6VKV _em_3d_fitting_list.initial_refinement_model_id 1 _em_3d_fitting_list.chain_id ? _em_3d_fitting_list.chain_residue_range ? _em_3d_fitting_list.source_name PDB _em_3d_fitting_list.type 'experimental model' _em_3d_fitting_list.accession_code 6VKV # _em_3d_reconstruction.entry_id 6VWS _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm 'BACK PROJECTION' _em_3d_reconstruction.details ;A non-helical approach (RASTR) to calculate a volume from the same subset of data used for helical analysis. The position and rotation to the center of a single hexamer in the final helical volume was determined and used along the final refined helical rise and twist to extract a total of 245050 unique particles from which surrounding tube density was subtracted by reprojection using Relion. The resulting stack of 245050 particles, each extracted into a 192 multiple 192 pixel box centered around the chosen asymmetric unit for each subtracted volume, was imported into Cryosparc. 2D clustering and ab-initio heterogeneous reconstruction with 4 volumes were then used to select a subset of 96392 particle images. 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