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'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ;N-acetyl-beta-D-glucosamine; 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-D-glucose; 2-acetamido-2-deoxy-glucose; N-ACETYL-D-GLUCOSAMINE ; 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 QGM non-polymer . '(2R,4S)-5,7-dichloro-4-[(phenylcarbamoyl)amino]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-2-carboxylic acid' ? 'C17 H15 Cl2 N3 O3' 380.225 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6WHY _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6WHY _struct.title 'GluN1b-GluN2B NMDA receptor in complex with GluN1 antagonist L689,560, class 1' _struct.pdbx_descriptor 'Ionotropic glutamate receptor , NMDA receptor GluN1b, Ionotropic glutamate receptor , NMDA receptor GluN2B' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6WHY _struct_keywords.text 'NMDARs, Ligand-gated ion channels, METAL TRANSPORT, Ionotropic glutamate receptor, MEMBRANE PROTEIN, GluN1 antagonist' _struct_keywords.pdbx_keywords 'MEMBRANE PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? 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MET D 818 TRP D 844 1 ? 27 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 79 SG ? ? ? 1_555 A CYS 329 SG ? ? A CYS 79 A CYS 329 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 441 SG ? ? ? 1_555 A CYS 475 SG ? ? A CYS 441 A CYS 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 457 SG ? ? ? 1_555 A CYS 476 SG ? ? A CYS 457 A CYS 476 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 765 SG ? ? ? 1_555 A CYS 819 SG ? ? A CYS 765 A CYS 819 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf5 disulf ? ? A CYS 831 SG ? ? ? 1_555 D CYS 588 SG ? ? A CYS 831 D CYS 557 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf6 disulf ? ? B CYS 117 SG ? ? ? 1_555 B CYS 352 SG ? ? B CYS 86 B CYS 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.046 ? ? disulf7 disulf ? ? B CYS 460 SG ? ? ? 1_555 B CYS 487 SG ? ? B CYS 429 B CYS 456 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.035 ? ? disulf8 disulf ? ? B CYS 467 SG ? ? ? 1_555 B CYS 488 SG ? ? B CYS 436 B CYS 457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf9 disulf ? ? B CYS 588 SG ? ? ? 1_555 C CYS 831 SG ? ? B CYS 557 C CYS 831 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? ? disulf10 disulf ? ? B CYS 777 SG ? ? ? 1_555 B CYS 832 SG ? ? B CYS 746 B CYS 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf11 disulf ? ? C CYS 79 SG ? ? ? 1_555 C CYS 329 SG ? ? C CYS 79 C CYS 329 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 441 SG ? ? ? 1_555 C CYS 475 SG ? ? C CYS 441 C CYS 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf13 disulf ? ? C CYS 457 SG ? ? ? 1_555 C CYS 476 SG ? ? C CYS 457 C CYS 476 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf14 disulf ? ? C CYS 765 SG ? ? ? 1_555 C CYS 819 SG ? ? C CYS 765 C CYS 819 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf15 disulf ? ? D CYS 117 SG ? ? ? 1_555 D CYS 352 SG ? ? D CYS 86 D CYS 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.045 ? ? disulf16 disulf ? ? D CYS 460 SG ? ? ? 1_555 D CYS 487 SG ? ? D CYS 429 D CYS 456 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf17 disulf ? ? D CYS 467 SG ? ? ? 1_555 D CYS 488 SG ? ? D CYS 436 D CYS 457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf18 disulf ? ? D CYS 777 SG ? ? ? 1_555 D CYS 832 SG ? ? D CYS 746 D CYS 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.029 ? ? covale1 covale none ? A VAL 705 CG1 ? ? ? 1_555 G QGM . CAF ? ? A VAL 705 A QGM 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.633 ? ? covale2 covale none ? A VAL 705 CG1 ? ? ? 1_555 G QGM . CAH ? ? A VAL 705 A QGM 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? ? covale3 covale one ? B ASN 573 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? B ASN 542 B NAG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale4 covale one ? B ASN 719 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? B ASN 688 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale5 covale none ? C VAL 705 CG1 ? ? ? 1_555 I QGM . CAF ? ? C VAL 705 C QGM 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.633 ? ? covale6 covale none ? C VAL 705 CG1 ? ? ? 1_555 I QGM . CAH ? ? C VAL 705 C QGM 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.491 ? ? covale7 covale one ? D ASN 573 ND2 ? ? ? 1_555 J NAG . C1 ? ? D ASN 542 D NAG 903 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? D ASN 719 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? D ASN 688 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale9 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? ? covale10 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.375 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 4 ? AA3 ? 3 ? AA4 ? 2 ? AA5 ? 5 ? AA6 ? 5 ? AA7 ? 3 ? AA8 ? 2 ? AA9 ? 3 ? AB1 ? 4 ? AB2 ? 8 ? AB3 ? 2 ? AB4 ? 3 ? AB5 ? 3 ? AB6 ? 2 ? AB7 ? 4 ? AB8 ? 4 ? AB9 ? 5 ? AC1 ? 4 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 5 ? AC5 ? 5 ? AC6 ? 3 ? AC7 ? 2 ? AC8 ? 3 ? AC9 ? 4 ? AD1 ? 8 ? AD2 ? 2 ? AD3 ? 3 ? AD4 ? 3 ? AD5 ? 2 ? AD6 ? 4 ? AD7 ? 4 ? # loop_ _struct_sheet_order.sheet_id _struct_sheet_order.range_id_1 _struct_sheet_order.range_id_2 _struct_sheet_order.offset _struct_sheet_order.sense AA1 1 2 ? parallel AA1 2 3 ? parallel AA1 3 4 ? parallel AA1 4 5 ? parallel AA2 1 2 ? parallel AA2 2 3 ? parallel AA2 3 4 ? parallel AA3 1 2 ? anti-parallel AA3 2 3 ? anti-parallel AA4 1 2 ? anti-parallel AA5 1 2 ? parallel AA5 2 3 ? parallel AA5 3 4 ? anti-parallel AA5 4 5 ? anti-parallel AA6 1 2 ? parallel AA6 2 3 ? parallel AA6 3 4 ? anti-parallel AA6 4 5 ? anti-parallel AA7 1 2 ? anti-parallel AA7 2 3 ? anti-parallel AA8 1 2 ? anti-parallel AA9 1 2 ? anti-parallel AA9 2 3 ? anti-parallel AB1 1 2 ? parallel AB1 2 3 ? parallel AB1 3 4 ? parallel AB2 1 2 ? parallel AB2 2 3 ? parallel AB2 3 4 ? parallel AB2 4 5 ? parallel AB2 5 6 ? anti-parallel AB2 6 7 ? anti-parallel AB2 7 8 ? anti-parallel AB3 1 2 ? parallel AB4 1 2 ? parallel AB4 2 3 ? anti-parallel AB5 1 2 ? anti-parallel AB5 2 3 ? anti-parallel AB6 1 2 ? anti-parallel AB7 1 2 ? parallel AB7 2 3 ? anti-parallel AB7 3 4 ? anti-parallel AB8 1 2 ? parallel AB8 2 3 ? anti-parallel AB8 3 4 ? anti-parallel AB9 1 2 ? parallel AB9 2 3 ? parallel AB9 3 4 ? parallel AB9 4 5 ? parallel AC1 1 2 ? parallel AC1 2 3 ? parallel AC1 3 4 ? parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC4 1 2 ? parallel AC4 2 3 ? parallel AC4 3 4 ? anti-parallel AC4 4 5 ? anti-parallel AC5 1 2 ? parallel AC5 2 3 ? parallel AC5 3 4 ? anti-parallel AC5 4 5 ? anti-parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC9 1 2 ? parallel AC9 2 3 ? parallel AC9 3 4 ? parallel AD1 1 2 ? parallel AD1 2 3 ? parallel AD1 3 4 ? parallel AD1 4 5 ? parallel AD1 5 6 ? anti-parallel AD1 6 7 ? anti-parallel AD1 7 8 ? anti-parallel AD2 1 2 ? parallel AD3 1 2 ? parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD4 2 3 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? parallel AD6 2 3 ? anti-parallel AD6 3 4 ? anti-parallel AD7 1 2 ? parallel AD7 2 3 ? anti-parallel AD7 3 4 ? anti-parallel # loop_ _struct_sheet_range.sheet_id _struct_sheet_range.id _struct_sheet_range.beg_label_comp_id _struct_sheet_range.beg_label_asym_id _struct_sheet_range.beg_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_sheet_range.end_label_comp_id _struct_sheet_range.end_label_asym_id _struct_sheet_range.end_label_seq_id _struct_sheet_range.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_sheet_range.beg_auth_comp_id _struct_sheet_range.beg_auth_asym_id _struct_sheet_range.beg_auth_seq_id _struct_sheet_range.end_auth_comp_id _struct_sheet_range.end_auth_asym_id _struct_sheet_range.end_auth_seq_id AA1 1 LEU A 60 ? 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GLU C 549 PHE C 550 AC5 1 VAL C 497 ? LEU C 499 ? VAL C 497 LEU C 499 AC5 2 ILE C 421 ? THR C 423 ? ILE C 421 THR C 423 AC5 3 MET C 533 ? LEU C 538 ? MET C 533 LEU C 538 AC5 4 SER C 777 ? MET C 783 ? SER C 777 MET C 783 AC5 5 LYS C 555 ? GLN C 557 ? LYS C 555 GLN C 557 AC6 1 TYR C 431 ? LYS C 433 ? TYR C 431 LYS C 433 AC6 2 VAL C 472 ? TYR C 477 ? VAL C 472 TYR C 477 AC6 3 VAL C 455 ? GLY C 459 ? VAL C 455 GLY C 459 AC7 1 GLN C 508 ? VAL C 511 ? GLN C 508 VAL C 511 AC7 2 LYS C 516 ? TRP C 519 ? LYS C 516 TRP C 519 AC8 1 PHE C 750 ? ASP C 753 ? PHE C 750 ASP C 753 AC8 2 LEU C 559 ? LYS C 564 ? LEU C 559 LYS C 564 AC8 3 LEU C 767 ? THR C 769 ? LEU C 767 THR C 769 AC9 1 ALA D 69 ? ILE D 71 ? ALA D 38 ILE D 40 AC9 2 VAL D 128 ? PHE D 130 ? VAL D 97 PHE D 99 AC9 3 ILE D 154 ? GLY D 156 ? ILE D 123 GLY D 125 AC9 4 PHE D 175 ? GLN D 176 ? PHE D 144 GLN D 145 AD1 1 GLU D 229 ? LEU D 235 ? GLU D 198 LEU D 204 AD1 2 ILE D 199 ? THR D 204 ? ILE D 168 THR D 173 AD1 3 ILE D 259 ? TYR D 262 ? 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# _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.entity_id 3 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.value_order sing _pdbx_entity_branch_link.details ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 3 NAG 1 n 3 NAG 2 n # _pdbx_entity_instance_feature.ordinal 1 _pdbx_entity_instance_feature.comp_id QGM _pdbx_entity_instance_feature.asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_comp_id QGM _pdbx_entity_instance_feature.auth_asym_id ? _pdbx_entity_instance_feature.auth_seq_num ? _pdbx_entity_instance_feature.feature_type 'SUBJECT OF INVESTIGATION' _pdbx_entity_instance_feature.details ? # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 4 '(2R,4S)-5,7-dichloro-4-[(phenylcarbamoyl)amino]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-2-carboxylic acid' QGM 5 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? #