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'fall armyworm' 'Spodoptera frugiperda' 7108 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? baculovirus ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP NMDZ1_RAT P35439 P35439-2 1 ;MSTMHLLTFALLFSCSFARAACDPKIVNIGAVLSTRKHEQMFREAVNQANKRHGSWKIQLNATSVTHKPNAIQMALSVCE DLISSQVYAILVSHPPTPNDHFTPTPVSYTAGFYRIPVLGLTTRMSIYSDKSIHLSFLRTVPPYSHQSSVWFEMMRVYNW NHIILLVSDDHEGRAAQKRLETLLEERESKSKKRNYENLDQLSYDNKRGPKAEKVLQFDPGTKNVTALLMEARELEARVI ILSASEDDAATVYRAAAMLNMTGSGYVWLVGEREISGNALRYAPDGIIGLQLINGKNESAHISDAVGVVAQAVHELLEKE NITDPPRGCVGNTNIWKTGPLFKRVLMSSKYADGVTGRVEFNEDGDRKFANYSIMNLQNRKLVQVGIYNGTHVIPNDRKI IWPGGETEKPRGYQMSTRLKIVTIHQEPFVYVKPTMSDGTCKEEFTVNGDPVKKVICTGPNDTSPGSPRHTVPQCCYGFC IDLLIKLARTMNFTYEVHLVADGKFGTQERVNNSNKKEWNGMMGELLSGQADMIVAPLTINNERAQYIEFSKPFKYQGLT ILVKKEIPRSTLDSFMQPFQSTLWLLVGLSVHVVAVMLYLLDRFSPFGRFKVNSEEEEEDALTLSSAMWFSWGVLLNSGI GEGAPRSFSARILGMVWAGFAMIIVASYTANLAAFLVLDRPEERITGINDPRLRNPSDKFIYATVKQSSVDIYFRRQVEL STMYRHMEKHNYESAAEAIQAVRDNKLHAFIWDSAVLEFEASQKCDLVTTGELFFRSGFGIGMRKDSPWKQNVSLSILKS HENGFMEDLDKTWVRYQECDSRSNAPATLTFENMAGVFMLVAGGIVAGIFLIFIEIAYKRHKDARRKQMQLAFAAVNVWR KNLQDRKSGRAEPDPKKKATFRAITSTLASSFKRRRSSKDTSTGGGRGALQNQKDTVLPRRAIEREEGQLQLCSRHRES ; 1 2 UNP NMDE2_RAT Q00960 ? 2 ;RSQKSPPSIGIAVILVGTSDEVAIKDAHEKDDFHHLSVVPRVELVAMNETDPKSIITRICDLMSDRKIQGVVFADDTDQE AIAQILDFISAQTLTPILGIHGGSSMIMADKDESSMFFQFGPSIEQQASVMLNIMEEYDWYIFSIVTTYFPGYQDFVNKI RSTIENSFVGWELEEVLLLDMSLDDGDSKIQNQLKKLQSPIILLYCTKEEATYIFEVANSVGLTGYGYTWIVPSLVAGDT DTVPSEFPTGLISVSYDEWDYGLPARVRDGIAIITTAASDMLSEHSFIPEPKSSCYNTHEKRIYQSNMLNRYLINVTFEG RNLSFSEDGYQMHPKLVIILLNKERKWERVGKWKDKSLQMKYYVWPRMCPETEEQEDDHLSIVTLEEAPFVIVESVDPLS GTCMRNTVPCQKRIISENKTDEEPGYIKKCCKGFCIDILKKISKSVKFTYDLYLVTNGKHGKKINGTWNGMIGEVVMKRA YMAVGSLTINEERSEVVDFSVPFIETGISVMVSRSNGTVSPSAFLEPFSADVWVMMFVMLLIVSAVAVFVFEYFSPVGYN RCLADGREPGGPSFTIGKAIWLLWGLVFNNSVPVQNPKGTTSKIMVSVWAFFAVIFLASYTANLAAFMIQEEYVDQVSGL SDKKFQRPNDFSPPFRFGTVPNGSTERNIRNNYAEMHAYMGKFNQRGVDDALLSLKTGKLDAFIYDAAVLNYMAGRDEGC KLVTIGSGKVFASTGYGIAIQKDSGWKRQVDLAILQLFGDGEMEELEALWLTGICHNEKNEVMSSQLDIDNMAGVFYMLG AAMALSLITFICEHLFYWQFRHCFMG ; 27 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6WI0 A 1 ? 959 ? 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A CYS 79 SG ? ? ? 1_555 A CYS 329 SG ? ? A CYS 79 A CYS 329 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf2 disulf ? ? A CYS 441 SG ? ? ? 1_555 A CYS 475 SG ? ? A CYS 441 A CYS 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf3 disulf ? ? A CYS 457 SG ? ? ? 1_555 A CYS 476 SG ? ? A CYS 457 A CYS 476 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf4 disulf ? ? A CYS 765 SG ? ? ? 1_555 A CYS 819 SG ? ? A CYS 765 A CYS 819 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf5 disulf ? ? A CYS 831 SG ? ? ? 1_555 D CYS 588 SG ? ? A CYS 831 D CYS 557 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.055 ? ? disulf6 disulf ? ? B CYS 117 SG ? ? ? 1_555 B CYS 352 SG ? ? B CYS 86 B CYS 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.039 ? ? disulf7 disulf ? ? B CYS 460 SG ? ? ? 1_555 B CYS 487 SG ? ? B CYS 429 B CYS 456 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf8 disulf ? ? B CYS 467 SG ? ? ? 1_555 B CYS 488 SG ? ? B CYS 436 B CYS 457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf9 disulf ? ? B CYS 588 SG ? ? ? 1_555 C CYS 831 SG ? ? B CYS 557 C CYS 831 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.011 ? ? disulf10 disulf ? ? B CYS 777 SG ? ? ? 1_555 B CYS 832 SG ? ? B CYS 746 B CYS 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf11 disulf ? ? C CYS 79 SG ? ? ? 1_555 C CYS 329 SG ? ? C CYS 79 C CYS 329 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 441 SG ? ? ? 1_555 C CYS 475 SG ? ? C CYS 441 C CYS 475 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf13 disulf ? ? C CYS 457 SG ? ? ? 1_555 C CYS 476 SG ? ? C CYS 457 C CYS 476 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf14 disulf ? ? C CYS 765 SG ? ? ? 1_555 C CYS 819 SG ? ? C CYS 765 C CYS 819 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf15 disulf ? ? D CYS 117 SG ? ? ? 1_555 D CYS 352 SG ? ? D CYS 86 D CYS 321 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.038 ? ? disulf16 disulf ? ? D CYS 460 SG ? ? ? 1_555 D CYS 487 SG ? ? D CYS 429 D CYS 456 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf17 disulf ? ? D CYS 467 SG ? ? ? 1_555 D CYS 488 SG ? ? D CYS 436 D CYS 457 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.040 ? ? disulf18 disulf ? ? D CYS 777 SG ? ? ? 1_555 D CYS 832 SG ? ? D CYS 746 D CYS 801 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? covale1 covale none ? A PHE 505 CZ ? ? ? 1_555 G QGM . N ? ? A PHE 505 A QGM 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? ? covale2 covale one ? B ASN 573 ND2 ? ? ? 1_555 H NAG . C1 ? ? B ASN 542 B NAG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 719 ND2 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? B ASN 688 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale4 covale none ? C PHE 505 CZ ? ? ? 1_555 J QGM . N ? ? C PHE 505 C QGM 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? ? covale5 covale one ? D ASN 573 ND2 ? ? ? 1_555 K NAG . C1 ? ? D ASN 542 D NAG 901 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? N-Glycosylation covale6 covale one ? D ASN 719 ND2 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? D ASN 688 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? N-Glycosylation covale7 covale both ? E NAG . O4 ? ? ? 1_555 E NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.374 ? ? covale8 covale both ? F NAG . O4 ? ? ? 1_555 F NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.373 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_sheet.id _struct_sheet.type _struct_sheet.number_strands _struct_sheet.details AA1 ? 5 ? AA2 ? 3 ? AA3 ? 4 ? AA4 ? 5 ? AA5 ? 3 ? AA6 ? 2 ? AA7 ? 2 ? AA8 ? 3 ? AA9 ? 5 ? AB1 ? 8 ? AB2 ? 2 ? AB3 ? 3 ? AB4 ? 2 ? AB5 ? 2 ? AB6 ? 3 ? AB7 ? 5 ? AB8 ? 3 ? AB9 ? 4 ? AC1 ? 5 ? AC2 ? 3 ? AC3 ? 2 ? AC4 ? 2 ? AC5 ? 3 ? AC6 ? 5 ? AC7 ? 8 ? AC8 ? 2 ? AC9 ? 3 ? AD1 ? 2 ? AD2 ? 2 ? 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D LEU 240 524 1 Y 1 D ASP 210 ? D ASP 241 525 1 Y 1 D ASP 211 ? D ASP 242 526 1 Y 1 D GLY 212 ? D GLY 243 527 1 Y 1 D ARG 393 ? D ARG 424 528 1 Y 1 D MET 394 ? D MET 425 529 1 Y 1 D CYS 395 ? D CYS 426 530 1 Y 1 D PRO 396 ? D PRO 427 531 1 Y 1 D GLU 397 ? D GLU 428 532 1 Y 1 D THR 398 ? D THR 429 533 1 Y 1 D GLU 399 ? D GLU 430 534 1 Y 1 D GLU 400 ? D GLU 431 535 1 Y 1 D GLN 401 ? D GLN 432 536 1 Y 1 D GLU 402 ? D GLU 433 537 1 Y 1 D GLU 443 ? D GLU 474 538 1 Y 1 D ASN 444 ? D ASN 475 539 1 Y 1 D LYS 445 ? D LYS 476 540 1 Y 1 D THR 446 ? D THR 477 541 1 Y 1 D ASP 447 ? D ASP 478 542 1 Y 1 D GLU 448 ? D GLU 479 543 1 Y 1 D GLU 449 ? D GLU 480 544 1 Y 1 D PRO 450 ? D PRO 481 545 1 Y 1 D GLY 451 ? D GLY 482 546 1 Y 1 D PHE 580 ? D PHE 611 547 1 Y 1 D SER 581 ? D SER 612 548 1 Y 1 D PRO 582 ? D PRO 613 549 1 Y 1 D VAL 583 ? D VAL 614 550 1 Y 1 D GLY 584 ? D GLY 615 551 1 Y 1 D TYR 585 ? D TYR 616 552 1 Y 1 D ASN 586 ? D ASN 617 553 1 Y 1 D ARG 587 ? D ARG 618 554 1 Y 1 D SER 588 ? 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D GLY 883 # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 10116 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Rattus norvegicus' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_entity_assembly_recombinant.id 2 _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_recombinant.cell ? _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id 7108 _em_entity_assembly_recombinant.organism 'Spodoptera frugiperda' _em_entity_assembly_recombinant.plasmid ? _em_entity_assembly_recombinant.strain ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 64.5 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode ? _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'PARTICLE SELECTION' ? ? ? 1 ? ? 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? ? ? 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? ? ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? cisTEM 1.0.0 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _pdbx_audit_support.funding_organization _pdbx_audit_support.country _pdbx_audit_support.grant_number _pdbx_audit_support.ordinal 'National Institutes of Health/National Institute of Neurological Disorders and Stroke (NIH/NINDS)' 'United States' NS111745 1 'National Institutes of Health/National Institute of Mental Health (NIH/NIMH)' 'United States' MH085926 2 # loop_ _pdbx_branch_scheme.asym_id _pdbx_branch_scheme.entity_id _pdbx_branch_scheme.mon_id _pdbx_branch_scheme.num _pdbx_branch_scheme.pdb_asym_id _pdbx_branch_scheme.pdb_mon_id _pdbx_branch_scheme.pdb_seq_num _pdbx_branch_scheme.auth_asym_id _pdbx_branch_scheme.auth_mon_id _pdbx_branch_scheme.auth_seq_num _pdbx_branch_scheme.hetero E 3 NAG 1 E NAG 1 B NAG 905 n E 3 NAG 2 E NAG 2 B NAG 906 n F 3 NAG 1 F NAG 1 D NAG 905 n F 3 NAG 2 F NAG 2 D NAG 906 n # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier NAG 'CONDENSED IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 DGlcpNAcb NAG 'COMMON NAME' GMML 1.0 N-acetyl-b-D-glucopyranosamine NAG 'IUPAC CARBOHYDRATE SYMBOL' PDB-CARE 1.0 b-D-GlcpNAc NAG 'SNFG CARBOHYDRATE SYMBOL' GMML 1.0 GlcNAc # _pdbx_entity_branch.entity_id 3 _pdbx_entity_branch.type oligosaccharide # loop_ _pdbx_entity_branch_descriptor.ordinal _pdbx_entity_branch_descriptor.entity_id _pdbx_entity_branch_descriptor.descriptor _pdbx_entity_branch_descriptor.type _pdbx_entity_branch_descriptor.program _pdbx_entity_branch_descriptor.program_version 1 3 DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 2 3 'WURCS=2.0/1,2,1/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O]/1-1/a4-b1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 3 3 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{}}}' LINUCS PDB-CARE ? # _pdbx_entity_branch_link.link_id 1 _pdbx_entity_branch_link.entity_id 3 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 C1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 O1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 NAG _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 O4 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 HO4 _pdbx_entity_branch_link.value_order sing _pdbx_entity_branch_link.details ? # loop_ _pdbx_entity_branch_list.entity_id _pdbx_entity_branch_list.comp_id _pdbx_entity_branch_list.num _pdbx_entity_branch_list.hetero 3 NAG 1 n 3 NAG 2 n # loop_ _pdbx_entity_nonpoly.entity_id _pdbx_entity_nonpoly.name _pdbx_entity_nonpoly.comp_id 4 '(2R,4S)-5,7-dichloro-4-[(phenylcarbamoyl)amino]-1,2,3,4-tetrahydroquinoline-2-carboxylic acid' QGM 5 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose NAG # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? 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