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_entity_src_nat.pdbx_fragment _entity_src_nat.pdbx_variant _entity_src_nat.pdbx_cell_line _entity_src_nat.pdbx_atcc _entity_src_nat.pdbx_cellular_location _entity_src_nat.pdbx_organ _entity_src_nat.pdbx_organelle _entity_src_nat.pdbx_cell _entity_src_nat.pdbx_plasmid_name _entity_src_nat.pdbx_plasmid_details _entity_src_nat.details 1 1 sample 1 255 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 2 1 sample 1 225 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 3 1 sample 1 125 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 4 1 sample 1 1031 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 5 1 sample 1 793 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 6 1 sample 1 464 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 7 1 sample 1 501 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 8 1 sample 1 424 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 9 1 sample 1 240 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 10 1 sample 1 76 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 11 1 sample 1 119 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 12 1 sample 1 118 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 13 1 sample 1 126 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 14 1 sample 1 92 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 15 1 sample 1 86 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 16 1 sample 1 755 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 17 1 sample 1 895 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 18 1 sample 1 1304 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? 19 1 sample 1 188 Human 'Homo sapiens' 9606 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code 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LPPRPPLPESLPPPPPGGLPLPPMPPTGPAPSGPPGPPQLPPPAPGVHPPAPVVHPPASGVHPPAPGVHPPAPGVHPPAP GVHPPTSGVHPPAPGVHPPAPGVHPPAPGVHPPAPGVHPPAPGVHPPPSAGVHPQAPGVHPAAPAVHPQAPGVHPPAPGM HPQAPGVHPQPPGVHPSAPGVHPQPPGVHPSNPGVHPPTPMPPMLRPPLPSEGPGNIPPPPPTN ; 1 7 UNP SF3A3_HUMAN Q12874 ? 7 ;METILEQQRRYHEEKERLMDVMAKEMLTKKSTLRDQINSDHRTRAMQDRYMEVSGNLRDLYDDKDGLRKEELNAISGPNE FAEFYNRLKQIKEFHRKHPNEICVPMSVEFEELLKARENPSEEAQNLVEFTDEEGYGRYLDLHDCYLKYINLKASEKLDY ITYLSIFDQLFDIPKERKNAEYKRYLEMLLEYLQDYTDRVKPLQDQNELFGKIQAEFEKKWENGTFPGWPKETSSALTHA GAHLDLSAFSSWEELASLGLDRLKSALLALGLKCGGTLEERAQRLFSTKGKSLESLDTSLFAKNPKSKGTKRDTERNKDI AFLEAQIYEYVEILGEQRHLTHENVQRKQARTGEEREEEEEEQISESESEDEENEIIYNPKNLPLGWDGKPIPYWLYKLH GLNINYNCEICGNYTYRGPKAFQRHFAEWRHAHGMRCLGIPNTAHFANVTQIEDAVSLWAKLKLQKASERWQPDTEEEYE DSSGNVVNKKTYEDLKRQGLL ; 1 8 UNP SF3B4_HUMAN Q15427 ? 8 ;MAAGPISERNQDATVYVGGLDEKVSEPLLWELFLQAGPVVNTHMPKDRVTGQHQGYGFVEFLSEEDADYAIKIMNMIKLY GKPIRVNKASAHNKNLDVGANIFIGNLDPEIDEKLLYDTFSAFGVILQTPKIMRDPDTGNSKGYAFINFASFDASDAAIE AMNGQYLCNRPITVSYAFKKDSKGERHGSAAERLLAAQNPLSQADRPHQLFADAPPPPSAPNPVVSSLGSGLPPPGMPPP GSFPPPVPPPGALPPGIPPAMPPPPMPPGAAGHGPPSAGTPGAGHPGHGHSHPHPFPPGGMPHPGMSQMQLAHHGPHGLG HPHAGPPGSGGQPPPRPPPGMPHPGPPPMGMPPRGPPFGSPMGHPGPMPPHGMRGPPPLMPPHGYTGPPRPPPYGYQRGP LPPPRPTPRPPVPPRGPLRGPLPQ ; 1 9 UNP RSMB_HUMAN P14678 ? 9 ;MTVGKSSKMLQHIDYRMRCILQDGRIFIGTFKAFDKHMNLILCDCDEFRKIKPKNSKQAEREEKRVLGLVLLRGENLVSM TVEGPPPKDTGIARVPLAGAAGGPGIGRAAGRGIPAGVPMPQAPAGLAGPVRGVGGPSQQVMTPQGRGTVAAAAAAATAS IAGAPTQYPPGRGGPPPPMGRGAPPPGMMGPPPGMRPPMGPPMGIPPGRGTPMGMPPPGMRPPPPGMRGPPPPGMRPPRP ; 1 10 UNP RUXG_HUMAN P62308 ? 10 MSKAHPPELKKFMDKKLSLKLNGGRHVQGILRGFDPFMNLVIDECVEMATSGQQNNIGMVVIRGNSIIMLEALERV 1 11 UNP SMD1_HUMAN P62314 ? 11 ;MKLVRFLMKLSHETVTIELKNGTQVHGTITGVDVSMNTHLKAVKMTLKNREPVQLETLSIRGNNIRYFILPDSLPLDTLL VDVEPKVKSKKREAVAGRGRGRGRGRGRGRGRGRGGPRR ; 1 12 UNP SMD2_HUMAN P62316 ? 12 ;MSLLNKPKSEMTPEELQKREEEEFNTGPLSVLTQSVKNNTQVLINCRNNKKLLGRVKAFDRHCNMVLENVKEMWTEVPKS GKGKKKSKPVNKDRYISKMFLRGDSVIVVLRNPLIAGK ; 1 13 UNP SMD3_HUMAN P62318 ? 13 ;MSIGVPIKVLHEAEGHIVTCETNTGEVYRGKLIEAEDNMNCQMSNITVTYRDGRVAQLEQVYIRGSKIRFLILPDMLKNA PMLKSMKNKNQGSGAGRGKAAILKAQVAARGRGRGMGRGNIFQKRR ; 1 14 UNP RUXE_HUMAN P62304 ? 14 ;MAYRGQGQKVQKVMVQPINLIFRYLQNRSRIQVWLYEQVNMRIEGCIIGFDEYMNLVLDDAEEIHSKTKSRKQLGRIMLK GDNITLLQSVSN ; 1 15 UNP RUXF_HUMAN P62306 ? 15 ;MSLPLNPKPFLNGLTGKPVMVKLKWGMEYKGYLVSVDGYMNMQLANTEEYIDGALSGHLGEVLIRCNNVLYIRGVEEEEE DGEMRE ; 1 16 UNP HTSF1_HUMAN O43719 ? 16 ;MSGTNLDGNDEFDEQLRMQELYGDGKDGDTQTDAGGEPDSLGQQPTDTPYEWDLDKKAWFPKITEDFIATYQANYGFSND GASSSTANVEDVHARTAEEPPQEKAPEPTDARKKGEKRKAESGWFHVEEDRNTNVYVSGLPPDITVDEFIQLMSKFGIIM RDPQTEEFKVKLYKDNQGNLKGDGLCCYLKRESVELALKLLDEDEIRGYKLHVEVAKFQLKGEYDASKKKKKCKDYKKKL SMQQKQLDWRPERRAGPSRMRHERVVIIKNMFHPMDFEDDPLVLNEIREDLRVECSKFGQIRKLLLFDRHPDGVASVSFR DPEEADYCIQTLDGRWFGGRQITAQAWDGTTDYQVEETSREREERLRGWEAFLNAPEANRGLRRSDSVSASERAGPSRAR HFSEHPSTSKMNAQETATGMAFEEPIDEKKFEKTEDGGEFEEGASENNAKESSPEKEAEEGCPEKESEEGCPKRGFEGSC SQKESEEGNPVRGSEEDSPKKESKKKTLKNDCEENGLAKESEDDLNKESEEEVGPTKESEEDDSEKESDEDCSEKQSEDG SEREFEENGLEKDLDEEGSEKELHENVLDKELEENDSENSEFEDDGSEKVLDEEGSEREFDEDSDEKEEEEDTYEKVFDD ESDEKEDEEYADEKGLEAADKKAEEGDADEKLFEESDDKEDEDADGKEVEDADEKLFEDDDSNEKLFDEEEDSSEKLFDD SDERGTLGGFGSVEEGPLSTGSSFILSSDDDDDDI ; 1 17 UNP SF3B2_HUMAN Q13435 ? 17 ;MATEHPEPPKAELQLPPPPPPGHYGAWAAQELQAKLAEIGAPIQGNREELVERLQSYTRQTGIVLNRPVLRGEDGDKAAP PPMSAQLPGIPMPPPPLGLPPLQPPPPPPPPPPGLGLGFPMAHPPNLGPPPPLRVGEPVALSEEERLKLAQQQAALLMQQ EERAKQQGDHSLKEHELLEQQKRAAVLLEQERQQEIAKMGTPVPRPPQDMGQIGVRTPLGPRVAAPVGPVGPTPTVLPMG APVPRPRGPPPPPGDENREMDDPSVGPKIPQALEKILQLKESRQEEMNSQQEEEEMETDARSSLGQSASETEEDTVSVSK KEKNRKRRNRKKKKKPQRVRGVSSESSGDREKDSTRSRGSDSPAADVEIEYVTEEPEIYEPNFIFFKRIFEAFKLTDDVK KEKEKEPEKLDKLENSAAPKKKGFEEEHKDSDDDSSDDEQEKKPEAPKLSKKKLRRMNRFTVAELKQLVARPDVVEMHDV TAQDPKLLVHLKATRNSVPVPRHWCFKRKYLQGKRGIEKPPFELPDFIKRTGIQEMREALQEKEEQKTMKSKMREKVRPK MGKIDIDYQKLHDAFFKWQTKPKLTIHGDLYYEGKEFETRLKEKKPGDLSDELRISLGMPVGPNAHKVPPPWLIAMQRYG PPPSYPNLKIPGLNSPIPESCSFGYHAGGWGKPPVDETGKPLYGDVFGTNAAEFQTKTEEEEIDRTPWGELEPSDEESSE EEEEEESDEDKPDETGFITPADSGLITPGGFSSVPAGMETPELIELRKKKIEEAMDGSETPQLFTVLPEKRTATVGGAMM GSTHIYDMSTVMSRKGPAPELQGVEVALAPEELELDPMAMTQKYEEHVREQQAQVEKEDFSDMVAEHAAKQKQKKRKAQP QDSRGGSKKYKEFKF ; 1 18 UNP SF3B1_HUMAN O75533 ? 18 ;MAKIAKTHEDIEAQIREIQGKKAALDEAQGVGLDSTGYYDQEIYGGSDSRFAGYVTSIAATELEDDDDDYSSSTSLLGQK KPGYHAPVALLNDIPQSTEQYDPFAEHRPPKIADREDEYKKHRRTMIISPERLDPFADGGKTPDPKMNARTYMDVMREQH LTKEEREIRQQLAEKAKAGELKVVNGAAASQPPSKRKRRWDQTADQTPGATPKKLSSWDQAETPGHTPSLRWDETPGRAK GSETPGATPGSKIWDPTPSHTPAGAATPGRGDTPGHATPGHGGATSSARKNRWDETPKTERDTPGHGSGWAETPRTDRGG DSIGETPTPGASKRKSRWDETPASQMGGSTPVLTPGKTPIGTPAMNMATPTPGHIMSMTPEQLQAWRWEREIDERNRPLS DEELDAMFPEGYKVLPPPAGYVPIRTPARKLTATPTPLGGMTGFHMQTEDRTMKSVNDQPSGNLPFLKPDDIQYFDKLLV DVDESTLSPEEQKERKIMKLLLKIKNGTPPMRKAALRQITDKAREFGAGPLFNQILPLLMSPTLEDQERHLLVKVIDRIL YKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDEDYYARVEGREIISNLAKAAGLATMISTMRPDIDNMDEYVRNTTARAFAVVASALG IPSLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGIKIVQQIAILMGCAILPHLRSLVEIIEHGLVDEQQKVRTISALAIAALAEAATPYG 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_struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6Y53 a 1 ? 255 ? 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S A 59 5463 1 Y 1 2 U 60 ? S U 60 5464 1 Y 1 2 C 61 ? S C 61 5465 1 Y 1 2 U 62 ? S U 62 5466 1 Y 1 2 G 63 ? S G 63 5467 1 Y 1 2 A 64 ? S A 64 5468 1 Y 1 2 U 65 ? S U 65 5469 1 Y 1 2 A 66 ? S A 66 5470 1 Y 1 2 C 67 ? S C 67 5471 1 Y 1 2 G 68 ? S G 68 5472 1 Y 1 2 U 76 ? S U 74 5473 1 Y 1 2 A 77 ? S A 75 5474 1 Y 1 2 U 78 ? S U 76 5475 1 Y 1 2 C 79 ? S C 77 5476 1 Y 1 2 C 80 ? S C 78 5477 1 Y 1 2 C 85 A S C 84 5478 1 Y 1 2 A 85 B S A 85 5479 1 Y 1 2 A 85 C S A 86 5480 1 Y 1 2 U 85 D S U 87 5481 1 Y 1 2 A 85 E S A 88 5482 1 Y 1 2 U 85 F S U 89 5483 1 Y 1 2 A 85 G S A 90 5484 1 Y 1 2 U 85 H S U 91 5485 1 Y 1 2 U 85 I S U 92 5486 1 Y 1 2 A 85 J S A 93 5487 1 Y 1 2 A 85 K S A 94 5488 1 Y 1 2 A 85 L S A 95 5489 1 Y 1 2 U 85 M S U 96 5490 1 Y 1 2 A 185 ? S A 185 5491 1 Y 1 2 C 186 ? S C 186 5492 1 Y 1 2 C 187 ? S C 187 5493 1 Y 1 2 C 188 ? S C 188 # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # _em_entity_assembly_naturalsource.id 2 _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id 1 _em_entity_assembly_naturalsource.cell ? _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location ? _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id 9606 _em_entity_assembly_naturalsource.organ ? _em_entity_assembly_naturalsource.organelle ? _em_entity_assembly_naturalsource.organism 'Homo sapiens' _em_entity_assembly_naturalsource.strain ? _em_entity_assembly_naturalsource.tissue ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 72 _em_image_recording.average_exposure_time 1 _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode INTEGRATING _em_image_recording.film_or_detector_model 'FEI FALCON III (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'CRYSTALLOGRAPHY MERGING' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? ? ? ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? ? ? 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? 1 ? 8 OTHER ? ? ? ? ? ? 9 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? 1 ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? 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RELION 3.0 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6Y53 'double helix' 6Y53 'a-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 S U 69 1_555 S A 83 1_555 -0.050 -0.144 -0.538 -1.769 2.172 2.368 1 2_U69:A85_2 2 69 ? 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