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;MVYSYTEKKRIRKDFGKRPQVLDVPYLLSIQLDSFQKFIEQDPEGQYGLEAAFRSVFPIQSYSGNSELQYVSYRLGEPVF DVQECQIRGVTYSAPLRVKLRLVIYEREAPEGTVKDIKEQEVYMGEIPLMTDNGTFVINGTERVIVSQLHRSPGVFFDSD KGKTHSSGKVLYNARIIPYRGSWLDFEFDPKDNLFVRIDRRRKLPATIILRALNYTTEQILDLFFEKVIFEIRDNKLQME LVPERLRGETASFDIEANGKVYVEKGRRITARHIRQLEKDDVKLIEVPVEYIAGKVVAKDYIDESTGELICAANMELSLD LLAKLSQSGHKRIETLFTNDLDHGPYISETLRVDPTNDRLSALVEIYRMMRPGEPPTREAAESLFENLFFSEDRYDLSAV GRMKFNRSLLREEIEGSGILSKDDIIDVMKKLIDIRNGKGEVDDIDHLGNRRIRSVGEMAENQFRVGLVRVERAVKERLS LGDLDTLMPQDMINAKPISAAVKEFFGSSQLSQFMDQNNPLSEITHKRRISALGPGGLTRERAGFEVRDVHPTHYGRVCP IETPEGPNIGLINSLSVYAQTNEYGFLETPYRKVTDGVVTDEIHYLSAIEEGNYVIAQANSNLDEEGHFVEDLVTCRSKG ESSLFSRDQVDYMDVSTQQVVSVGASLIPFLEHDDANRALMGANMQRQAVPTLRADKPLVGTGMERAVAVDSGVTAVAKR GGVVQYVDASRIVIKVNEDEMYPGEAGIDIYNLTKYTRSNQNTCINQMPCVSLGEPVERGDVLADGPSTDLGELALGQNM RVAFMPWNGYNFEDSILVSERVVQEDRFTTIHIQELACVSRDTKLGPEEITADIPNVGEAALSKLDESGIVYIGAEVTGG DILVGKVTPKGETQLTPEEKLLRAIFGEKASDVKDSSLRVPNGVSGTVIDVQVFTRDGVEKDKRALEIEEMQLKQAKKDL 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(DA)(DG)(DC)(DG)(DG)(DA)(DT)(DA)(DA)(DC) ; GGGCTGCGAATAACGGCCGAGCAGCGTAGCATTACTTGTGAGCGGATAAC K ? 9 polydeoxyribonucleotide no no ;(DG)(DT)(DT)(DA)(DT)(DC)(DC)(DG)(DC)(DT)(DC)(DA)(DC)(DA)(DA)(DT)(DG)(DC)(DC)(DA) (DC)(DA)(DC)(DG)(DC)(DG)(DC)(DT)(DG)(DC)(DT)(DC)(DG)(DG)(DC)(DC)(DG)(DT)(DT)(DA) (DT)(DT)(DC)(DG)(DC)(DA)(DG)(DC)(DC)(DC) ; GTTATCCGCTCACAATGCCACACGCGCTGCTCGGCCGTTATTCGCAGCCC L ? 10 polyribonucleotide no no ;GGGAUAACCCCGCUCUUACACAUUCCAGCCCUGAAAAAGGGCAUCAAAUUAAACCACACCUAUGGUGUAUGUCAAAUUAA ACCACACCUGGCGUGUGGC ; ;GGGAUAACCCCGCUCUUACACAUUCCAGCCCUGAAAAAGGGCAUCAAAUUAAACCACACCUAUGGUGUAUGUCAAAUUAA ACCACACCUGGCGUGUGGC ; R ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 MET n 1 2 SER n 1 3 GLU n 1 4 ALA n 1 5 PRO n 1 6 LYS n 1 7 LYS n 1 8 ARG n 1 9 TRP n 1 10 TYR n 1 11 VAL n 1 12 VAL n 1 13 GLN n 1 14 ALA n 1 15 PHE n 1 16 SER n 1 17 GLY n 1 18 PHE n 1 19 GLU n 1 20 GLY n 1 21 ARG n 1 22 VAL n 1 23 ALA n 1 24 THR n 1 25 SER n 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'Escherichia coli' 562 ? ? ? ? ? ? ? ? ;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ; 866768 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 8 1 sample 1 50 'synthetic construct' ? 32630 ? 9 1 sample 1 50 'synthetic construct' ? 32630 ? 10 1 sample 1 99 'synthetic construct' ? 32630 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP C3SID2_ECOLX C3SID2 ? 1 ;MSEAPKKRWYVVQAFSGFEGRVATSLREHIKLHNMEDLFGEVMVPTEEVVEIRGGQRRKSERKFFPGYVLVQMVMNDASW HLVRSVPRVMGFIGGTSDRPAPISDKEVDAIMNRLQQVGDKPRPKTLFEPGEMVRVNDGPFADFNGVVEEVDYEKSRLKV SVSIFGRATPVELDFSQVEKA ; 1 2 UNP A0A0A0GPI6_ECOLX A0A0A0GPI6 ? 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'Mg 2' 24.305 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 U 'RNA linking' y "URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE" ? 'C9 H13 N2 O9 P' 324.181 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 ZN non-polymer . 'ZINC ION' ? 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MG ? ? ? 1_555 KA HOH . O ? ? b MG 1001 b HOH 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.141 ? ? metalc9 metalc ? ? U MG . MG ? ? ? 1_555 KA HOH . O ? ? b MG 1001 b HOH 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.108 ? ? metalc10 metalc ? ? U MG . MG ? ? ? 1_555 KA HOH . O ? ? b MG 1001 b HOH 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.042 ? ? metalc11 metalc ? ? E THR 185 OG1 ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? c THR 185 c MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.290 ? ? metalc12 metalc ? ? W ADP . O3B ? ? ? 1_555 X MG . MG ? ? c ADP 1000 c MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.661 ? ? metalc13 metalc ? ? X MG . MG ? ? ? 1_555 LA HOH . O ? ? c MG 1001 c HOH 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.188 ? ? metalc14 metalc ? ? X MG . MG ? ? ? 1_555 LA HOH . O ? ? c MG 1001 c HOH 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.069 ? ? metalc15 metalc ? ? X MG . MG ? ? ? 1_555 LA HOH . O ? ? c MG 1001 c HOH 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.162 ? ? metalc16 metalc ? ? F THR 185 OG1 ? ? ? 1_555 AA MG . MG ? ? d THR 185 d MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.972 ? ? metalc17 metalc ? ? Z ADP . O1B ? ? ? 1_555 AA MG . MG ? ? d ADP 1000 d MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.083 ? ? metalc18 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 MA HOH . O ? ? d MG 1001 d HOH 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.993 ? ? metalc19 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 MA HOH . O ? ? d MG 1001 d HOH 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.081 ? ? metalc20 metalc ? ? AA MG . MG ? ? ? 1_555 MA HOH . O ? ? d MG 1001 d HOH 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.187 ? ? metalc21 metalc ? ? G THR 185 OG1 ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? e THR 185 e MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.338 ? ? metalc22 metalc ? ? CA ADP . O1B ? ? ? 1_555 DA MG . MG ? ? e ADP 1000 e MG 1001 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.994 ? ? metalc23 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 NA HOH . O ? ? e MG 1001 e HOH 1101 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.212 ? ? metalc24 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 NA HOH . O ? ? e MG 1001 e HOH 1102 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.093 ? ? metalc25 metalc ? ? DA MG . MG ? ? ? 1_555 NA HOH . O ? ? e MG 1001 e HOH 1103 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.268 ? ? metalc26 metalc ? ? M CYS 70 SG ? ? ? 1_555 GA ZN . ZN ? ? Y CYS 70 Y ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.719 ? ? metalc27 metalc ? ? M CYS 72 SG ? ? ? 1_555 GA ZN . ZN ? ? Y CYS 72 Y ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.455 ? ? metalc28 metalc ? ? M CYS 85 SG ? ? ? 1_555 GA ZN . ZN ? ? Y CYS 85 Y ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.532 ? ? metalc29 metalc ? ? M CYS 88 SG ? ? ? 1_555 GA ZN . ZN ? ? Y CYS 88 Y ZN 1502 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.652 ? ? metalc30 metalc ? ? M ASP 460 OD1 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? Y ASP 460 Y MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.198 ? ? metalc31 metalc ? ? M ASP 460 OD2 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? Y ASP 460 Y MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.943 ? ? metalc32 metalc ? ? M ASP 462 OD1 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? Y ASP 462 Y MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.567 ? ? metalc33 metalc ? ? M ASP 464 OD1 ? ? ? 1_555 FA MG . MG ? ? Y ASP 464 Y MG 1501 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.489 ? ? metalc34 metalc ? ? M CYS 814 SG ? ? ? 1_555 HA ZN . ZN ? ? Y CYS 814 Y ZN 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.769 ? ? metalc35 metalc ? ? M CYS 895 SG ? ? ? 1_555 HA ZN . ZN ? ? Y CYS 895 Y ZN 1503 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.444 ? ? metalc36 metalc ? ? FA MG . MG ? ? ? 1_555 P C 99 "O3'" ? ? Y MG 1501 R C 99 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.062 ? ? hydrog1 hydrog ? ? N DC 18 O2 ? ? ? 1_555 O DG 33 N2 ? ? K DC -18 L DG 18 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DC-DG PAIR' ? ? ? hydrog2 hydrog ? ? N DG 19 N1 ? ? ? 1_555 O DC 32 N3 ? ? K DG -17 L DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog3 hydrog ? ? N DG 19 N2 ? ? ? 1_555 O DC 32 O2 ? ? K DG -17 L DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog4 hydrog ? ? N DG 19 O6 ? ? ? 1_555 O DC 32 N4 ? ? K DG -17 L DC 17 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog5 hydrog ? ? N DA 20 N1 ? ? ? 1_555 O DT 31 N3 ? ? K DA -16 L DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog6 hydrog ? ? N DA 20 N6 ? ? ? 1_555 O DT 31 O4 ? ? K DA -16 L DT 16 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog7 hydrog ? ? N DG 21 N2 ? ? ? 1_555 O DC 30 O2 ? ? K DG -15 L DC 15 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DG-DC PAIR' ? ? ? hydrog8 hydrog ? ? N DC 22 N3 ? ? ? 1_555 O DG 29 N2 ? ? K DC -14 L DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog9 hydrog ? ? N DC 22 O2 ? ? ? 1_555 O DG 29 N1 ? ? K DC -14 L DG 14 1_555 ? ? ? ? ? ? 'REVERSED WATSON-CRICK' ? ? ? hydrog10 hydrog ? ? N DA 23 N1 ? ? ? 1_555 O DT 28 N3 ? ? K DA -13 L DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog11 hydrog ? ? N DA 23 N6 ? ? ? 1_555 O DT 28 O4 ? ? K DA -13 L DT 13 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog12 hydrog ? ? N DG 24 N1 ? ? ? 1_555 O DC 27 N3 ? ? K DG -12 L DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog13 hydrog ? ? N DG 24 N2 ? ? ? 1_555 O DC 27 O2 ? ? K DG -12 L DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog14 hydrog ? ? N DG 24 O6 ? ? ? 1_555 O DC 27 N4 ? ? K DG -12 L DC 12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog15 hydrog ? ? N DC 25 N3 ? ? ? 1_555 O DG 26 N1 ? ? K DC -11 L DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog16 hydrog ? ? N DC 25 N4 ? ? ? 1_555 O DG 26 O6 ? ? K DC -11 L DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog17 hydrog ? ? N DC 25 O2 ? ? ? 1_555 O DG 26 N2 ? ? K DC -11 L DG 11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog18 hydrog ? ? N DT 36 N3 ? ? ? 1_555 O DA 15 N3 ? ? K DT 0 L DA 0 1_555 ? ? ? ? ? ? 'DT-DA PAIR' ? ? ? hydrog19 hydrog ? ? N DT 37 N3 ? ? ? 1_555 O DA 14 N1 ? ? K DT 1 L DA -1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog20 hydrog ? ? N DT 37 O4 ? ? ? 1_555 O DA 14 N6 ? ? K DT 1 L DA -1 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog21 hydrog ? ? N DG 38 N1 ? ? ? 1_555 O DC 13 N3 ? ? K DG 2 L DC -2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog22 hydrog ? ? N DG 38 N2 ? ? ? 1_555 O DC 13 O2 ? ? K DG 2 L DC -2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog23 hydrog ? ? N DG 38 O6 ? ? ? 1_555 O DC 13 N4 ? ? K DG 2 L DC -2 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog24 hydrog ? ? N DT 39 N3 ? ? ? 1_555 O DA 12 N1 ? ? K DT 3 L DA -3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog25 hydrog ? ? N DT 39 O4 ? ? ? 1_555 O DA 12 N6 ? ? K DT 3 L DA -3 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog26 hydrog ? ? N DG 40 N1 ? ? ? 1_555 O DC 11 N3 ? ? K DG 4 L DC -4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog27 hydrog ? ? N DG 40 N2 ? ? ? 1_555 O DC 11 O2 ? ? K DG 4 L DC -4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog28 hydrog ? ? N DG 40 O6 ? ? ? 1_555 O DC 11 N4 ? ? K DG 4 L DC -4 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog29 hydrog ? ? N DA 41 N1 ? ? ? 1_555 O DT 10 N3 ? ? K DA 5 L DT -5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog30 hydrog ? ? N DA 41 N6 ? ? ? 1_555 O DT 10 O4 ? ? K DA 5 L DT -5 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog31 hydrog ? ? N DG 42 N1 ? ? ? 1_555 O DC 9 N3 ? ? K DG 6 L DC -6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog32 hydrog ? ? N DG 42 N2 ? ? ? 1_555 O DC 9 O2 ? ? K DG 6 L DC -6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog33 hydrog ? ? N DG 42 O6 ? ? ? 1_555 O DC 9 N4 ? ? K DG 6 L DC -6 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog34 hydrog ? ? N DC 43 N3 ? ? ? 1_555 O DG 8 N1 ? ? K DC 7 L DG -7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog35 hydrog ? ? N DC 43 N4 ? ? ? 1_555 O DG 8 O6 ? ? K DC 7 L DG -7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog36 hydrog ? ? N DC 43 O2 ? ? ? 1_555 O DG 8 N2 ? ? K DC 7 L DG -7 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog37 hydrog ? ? N DG 44 N1 ? ? ? 1_555 O DC 7 N3 ? ? K DG 8 L DC -8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog38 hydrog ? ? N DG 44 N2 ? ? ? 1_555 O DC 7 O2 ? ? K DG 8 L DC -8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog39 hydrog ? ? N DG 44 O6 ? ? ? 1_555 O DC 7 N4 ? ? K DG 8 L DC -8 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog40 hydrog ? ? N DG 45 N1 ? ? ? 1_555 O DC 6 N3 ? ? K DG 9 L DC -9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog41 hydrog ? ? N DG 45 N2 ? ? ? 1_555 O DC 6 O2 ? ? K DG 9 L DC -9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog42 hydrog ? ? N DG 45 O6 ? ? ? 1_555 O DC 6 N4 ? ? K DG 9 L DC -9 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog43 hydrog ? ? N DA 46 N1 ? ? ? 1_555 O DT 5 N3 ? ? K DA 10 L DT -10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog44 hydrog ? ? N DA 46 N6 ? ? ? 1_555 O DT 5 O4 ? ? K DA 10 L DT -10 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog45 hydrog ? ? N DT 47 N3 ? ? ? 1_555 O DA 4 N1 ? ? K DT 11 L DA -11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog46 hydrog ? ? N DT 47 O4 ? ? ? 1_555 O DA 4 N6 ? ? K DT 11 L DA -11 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog47 hydrog ? ? N DA 48 N1 ? ? ? 1_555 O DT 3 N3 ? ? K DA 12 L DT -12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog48 hydrog ? ? N DA 48 N6 ? ? ? 1_555 O DT 3 O4 ? ? K DA 12 L DT -12 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog49 hydrog ? ? O DG 17 N1 ? ? ? 1_555 P C 99 N3 ? ? L DG 2 R C 99 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog50 hydrog ? ? O DG 17 N2 ? ? ? 1_555 P C 99 O2 ? ? L DG 2 R C 99 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog51 hydrog ? ? O DG 17 O6 ? ? ? 1_555 P C 99 N4 ? ? L DG 2 R C 99 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog52 hydrog ? ? O DC 18 N3 ? ? ? 1_555 P G 98 N1 ? ? L DC 3 R G 98 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog53 hydrog ? ? O DC 18 N4 ? ? ? 1_555 P G 98 O6 ? ? L DC 3 R G 98 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog54 hydrog ? ? O DC 18 O2 ? ? ? 1_555 P G 98 N2 ? ? L DC 3 R G 98 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog55 hydrog ? ? O DC 19 N3 ? ? ? 1_555 P G 97 N1 ? ? L DC 4 R G 97 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog56 hydrog ? ? O DC 19 N4 ? ? ? 1_555 P G 97 O6 ? ? L DC 4 R G 97 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog57 hydrog ? ? O DC 19 O2 ? ? ? 1_555 P G 97 N2 ? ? L DC 4 R G 97 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog58 hydrog ? ? O DA 20 N1 ? ? ? 1_555 P U 96 N3 ? ? L DA 5 R U 96 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog59 hydrog ? ? O DA 20 N6 ? ? ? 1_555 P U 96 O4 ? ? L DA 5 R U 96 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog60 hydrog ? ? O DC 21 N3 ? ? ? 1_555 P G 95 N1 ? ? L DC 6 R G 95 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog61 hydrog ? ? O DC 21 N4 ? ? ? 1_555 P G 95 O6 ? ? L DC 6 R G 95 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog62 hydrog ? ? O DC 21 O2 ? ? ? 1_555 P G 95 N2 ? ? L DC 6 R G 95 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog63 hydrog ? ? O DA 22 N1 ? ? ? 1_555 P U 94 N3 ? ? L DA 7 R U 94 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog64 hydrog ? ? O DA 22 N6 ? ? ? 1_555 P U 94 O4 ? ? L DA 7 R U 94 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog65 hydrog ? ? O DC 23 N3 ? ? ? 1_555 P G 93 N1 ? ? L DC 8 R G 93 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog66 hydrog ? ? O DC 23 N4 ? ? ? 1_555 P G 93 O6 ? ? L DC 8 R G 93 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog67 hydrog ? ? O DC 23 O2 ? ? ? 1_555 P G 93 N2 ? ? L DC 8 R G 93 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog68 hydrog ? ? O DG 24 N1 ? ? ? 1_555 P C 92 N3 ? ? L DG 9 R C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog69 hydrog ? ? O DG 24 N2 ? ? ? 1_555 P C 92 O2 ? ? L DG 9 R C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog70 hydrog ? ? O DG 24 O6 ? ? ? 1_555 P C 92 N4 ? ? L DG 9 R C 92 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog71 hydrog ? ? O DC 25 N3 ? ? ? 1_555 P G 91 N1 ? ? L DC 10 R G 91 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog72 hydrog ? ? O DC 25 N4 ? ? ? 1_555 P G 91 O6 ? ? L DC 10 R G 91 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? hydrog73 hydrog ? ? O DC 25 O2 ? ? ? 1_555 P G 91 N2 ? ? L DC 10 R G 91 1_555 ? ? ? ? ? ? WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference covale ? ? metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 ASP 265 B . ? ASP 265 f SER 266 B ? SER 266 f 1 -2.18 2 PHE 355 B . ? PHE 355 f PRO 356 B ? PRO 356 f 1 0.73 3 ASP 265 C . ? ASP 265 a SER 266 C ? SER 266 a 1 -2.26 4 PHE 355 C . ? 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parallel AB9 5 6 ? parallel AC1 1 2 ? anti-parallel AC1 2 3 ? anti-parallel AC1 3 4 ? parallel AC1 4 5 ? parallel AC1 5 6 ? anti-parallel AC2 1 2 ? anti-parallel AC2 2 3 ? anti-parallel AC3 1 2 ? anti-parallel AC3 2 3 ? anti-parallel AC4 1 2 ? anti-parallel AC4 2 3 ? parallel AC5 1 2 ? anti-parallel AC5 2 3 ? parallel AC6 1 2 ? anti-parallel AC6 2 3 ? anti-parallel AC6 3 4 ? anti-parallel AC7 1 2 ? anti-parallel AC8 1 2 ? anti-parallel AC8 2 3 ? anti-parallel AC8 3 4 ? anti-parallel AC8 4 5 ? anti-parallel AC9 1 2 ? anti-parallel AD1 1 2 ? anti-parallel AD2 1 2 ? anti-parallel AD2 2 3 ? anti-parallel AD2 3 4 ? anti-parallel AD3 1 2 ? anti-parallel AD3 2 3 ? anti-parallel AD3 3 4 ? anti-parallel AD4 1 2 ? anti-parallel AD5 1 2 ? anti-parallel AD6 1 2 ? anti-parallel AD7 1 2 ? anti-parallel AD8 1 2 ? parallel AD9 1 2 ? anti-parallel AD9 2 3 ? anti-parallel AD9 3 4 ? anti-parallel AE1 1 2 ? anti-parallel AE1 2 3 ? anti-parallel AE2 1 2 ? anti-parallel AE2 2 3 ? parallel AE2 3 4 ? anti-parallel AE3 1 2 ? anti-parallel AE3 2 3 ? anti-parallel AE3 3 4 ? anti-parallel AE3 4 5 ? anti-parallel AE4 1 2 ? anti-parallel AE5 1 2 ? anti-parallel AE6 1 2 ? anti-parallel AE7 1 2 ? anti-parallel AE8 1 2 ? anti-parallel AE8 2 3 ? anti-parallel AE9 1 2 ? anti-parallel AE9 2 3 ? anti-parallel AF1 1 2 ? anti-parallel AF1 2 3 ? anti-parallel AF2 1 2 ? anti-parallel AF3 1 2 ? anti-parallel AF3 2 3 ? anti-parallel AF4 1 2 ? anti-parallel AF4 2 3 ? anti-parallel AF5 1 2 ? anti-parallel AF6 1 2 ? parallel AF6 2 3 ? anti-parallel AF6 3 4 ? parallel AF6 4 5 ? anti-parallel AF6 5 6 ? anti-parallel AF6 6 7 ? anti-parallel AF7 1 2 ? anti-parallel AF7 2 3 ? anti-parallel AF7 3 4 ? anti-parallel AF8 1 2 ? anti-parallel AF9 1 2 ? anti-parallel AF9 2 3 ? anti-parallel AG1 1 2 ? anti-parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel AG1 4 5 ? anti-parallel AG1 5 6 ? parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG2 2 3 ? parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG4 1 2 ? anti-parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG5 1 2 ? parallel AG5 2 3 ? 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'synthetic construct' ? ? # loop_ _em_entity_assembly_recombinant.id _em_entity_assembly_recombinant.entity_assembly_id _em_entity_assembly_recombinant.cell _em_entity_assembly_recombinant.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_recombinant.organism _em_entity_assembly_recombinant.plasmid _em_entity_assembly_recombinant.strain 2 2 ? 866768 ;Escherichia coli 'BL21-Gold(DE3)pLysS AG' ; ? ? 3 3 ? 32630 'synthetic construct' ? ? # _em_image_processing.id 1 _em_image_processing.image_recording_id 1 _em_image_processing.details ? # _em_image_recording.id 1 _em_image_recording.imaging_id 1 _em_image_recording.avg_electron_dose_per_image 50 _em_image_recording.average_exposure_time ? _em_image_recording.details ? _em_image_recording.detector_mode SUPER-RESOLUTION _em_image_recording.film_or_detector_model 'GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k)' _em_image_recording.num_diffraction_images ? _em_image_recording.num_grids_imaged ? _em_image_recording.num_real_images ? # loop_ _em_software.id _em_software.category _em_software.details _em_software.name _em_software.version _em_software.image_processing_id _em_software.fitting_id _em_software.imaging_id 1 'SYMMETRY DETERMINATION' ? ? ? 1 1 1 2 'IMAGE ACQUISITION' ? Leginon 3.3 ? ? 1 3 MASKING ? ? ? ? ? ? 4 'CTF CORRECTION' ? CTFFIND 4 1 ? ? 5 'LAYERLINE INDEXING' ? ? ? ? ? ? 6 'DIFFRACTION INDEXING' ? ? ? ? ? ? 7 'MODEL FITTING' ? ? ? ? ? ? 8 'MODEL REFINEMENT' ? ? ? ? ? ? 9 OTHER ? ? ? ? ? ? 10 'INITIAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC 2.12 1 ? ? 11 'FINAL EULER ASSIGNMENT' ? cryoSPARC 2.14 1 ? ? 12 CLASSIFICATION ? cisTEM ? 1 ? ? 13 RECONSTRUCTION ? cryoSPARC 2.14 1 ? ? # _em_specimen.id 1 _em_specimen.experiment_id 1 _em_specimen.concentration ? _em_specimen.details ? _em_specimen.embedding_applied NO _em_specimen.shadowing_applied NO _em_specimen.staining_applied NO _em_specimen.vitrification_applied YES # loop_ _ndb_struct_conf_na.entry_id _ndb_struct_conf_na.feature 6Z9R 'double helix' 6Z9R 'a-form double helix' 6Z9R 'b-form double helix' # loop_ _ndb_struct_na_base_pair.model_number _ndb_struct_na_base_pair.i_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.i_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.j_label_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_comp_id _ndb_struct_na_base_pair.j_label_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_symmetry _ndb_struct_na_base_pair.shear _ndb_struct_na_base_pair.stretch _ndb_struct_na_base_pair.stagger _ndb_struct_na_base_pair.buckle _ndb_struct_na_base_pair.propeller _ndb_struct_na_base_pair.opening _ndb_struct_na_base_pair.pair_number _ndb_struct_na_base_pair.pair_name _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.i_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.i_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_asym_id _ndb_struct_na_base_pair.j_auth_seq_id _ndb_struct_na_base_pair.j_PDB_ins_code _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_28 _ndb_struct_na_base_pair.hbond_type_12 1 N DC 18 1_555 O DG 33 1_555 0.407 0.409 -0.393 0.829 -1.806 14.235 1 K_DC-18:DG18_L K -18 ? 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L 18 ? K -17 ? L 17 ? 1 N DG 19 1_555 O DC 32 1_555 N DA 20 1_555 O DT 31 1_555 -0.017 0.260 3.221 1.331 1.938 40.194 0.161 0.174 3.227 2.817 -1.935 40.260 2 KK_DG-17DA-16:DT16DC17_LL K -17 ? L 17 ? K -16 ? L 16 ? 1 N DA 20 1_555 O DT 31 1_555 N DG 21 1_555 O DC 30 1_555 0.056 0.176 3.671 -0.607 -0.570 31.264 0.447 -0.232 3.666 -1.057 1.125 31.274 3 KK_DA-16DG-15:DC15DT16_LL K -16 ? L 16 ? K -15 ? L 15 ? 1 N DG 21 1_555 O DC 30 1_555 N DC 22 1_555 O DG 29 1_555 0.046 -0.140 3.376 -2.253 0.660 37.585 -0.305 -0.372 3.365 1.023 3.493 37.655 4 KK_DG-15DC-14:DG14DC15_LL K -15 ? L 15 ? K -14 ? L 14 ? 1 N DC 22 1_555 O DG 29 1_555 N DA 23 1_555 O DT 28 1_555 -1.955 -0.443 2.933 -0.366 2.052 35.736 -0.986 3.134 2.923 3.341 0.596 35.795 5 KK_DC-14DA-13:DT13DG14_LL K -14 ? L 14 ? K -13 ? L 13 ? 1 N DA 23 1_555 O DT 28 1_555 N DG 24 1_555 O DC 27 1_555 -0.707 0.666 3.470 -1.861 0.237 36.131 1.036 0.859 3.505 0.383 2.998 36.178 6 KK_DA-13DG-12:DC12DT13_LL K -13 ? L 13 ? K -12 ? 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