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'Spodoptera frugiperda' 7108 ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? ? # loop_ _pdbx_entity_src_syn.entity_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_src_id _pdbx_entity_src_syn.pdbx_alt_source_flag _pdbx_entity_src_syn.pdbx_beg_seq_num _pdbx_entity_src_syn.pdbx_end_seq_num _pdbx_entity_src_syn.organism_scientific _pdbx_entity_src_syn.organism_common_name _pdbx_entity_src_syn.ncbi_taxonomy_id _pdbx_entity_src_syn.details 5 1 sample 1 34 'synthetic construct' ? 32630 ? 6 1 sample 1 34 'synthetic construct' ? 32630 ? # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 ATP non-polymer . "ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE" ? 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'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 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D ILE 661 CG2 275 1 Y 1 D ILE 661 ? CD1 ? D ILE 661 CD1 276 1 Y 1 D LYS 662 ? CG ? D LYS 662 CG 277 1 Y 1 D LYS 662 ? CD ? D LYS 662 CD 278 1 Y 1 D LYS 662 ? CE ? D LYS 662 CE 279 1 Y 1 D LYS 662 ? NZ ? D LYS 662 NZ 280 1 Y 1 D ASP 846 ? CG ? D ASP 846 CG 281 1 Y 1 D ASP 846 ? OD1 ? D ASP 846 OD1 282 1 Y 1 D ASP 846 ? OD2 ? D ASP 846 OD2 283 1 Y 1 D GLN 847 ? CG ? D GLN 847 CG 284 1 Y 1 D GLN 847 ? CD ? D GLN 847 CD 285 1 Y 1 D GLN 847 ? OE1 ? D GLN 847 OE1 286 1 Y 1 D GLN 847 ? NE2 ? D GLN 847 NE2 287 1 Y 1 D SER 1183 ? OG ? D SER 1183 OG 288 1 Y 1 D LEU 1413 ? CG ? D LEU 1413 CG 289 1 Y 1 D LEU 1413 ? CD1 ? D LEU 1413 CD1 290 1 Y 1 D LEU 1413 ? CD2 ? D LEU 1413 CD2 291 1 Y 1 D GLU 1448 ? CG ? D GLU 1448 CG 292 1 Y 1 D GLU 1448 ? CD ? D GLU 1448 CD 293 1 Y 1 D GLU 1448 ? OE1 ? D GLU 1448 OE1 294 1 Y 1 D GLU 1448 ? OE2 ? D GLU 1448 OE2 295 1 Y 1 D SER 1449 ? OG ? D SER 1449 OG 296 1 Y 1 D GLU 1450 ? CG ? D GLU 1450 CG 297 1 Y 1 D GLU 1450 ? CD ? D GLU 1450 CD 298 1 Y 1 D GLU 1450 ? OE1 ? D GLU 1450 OE1 299 1 Y 1 D GLU 1450 ? OE2 ? D GLU 1450 OE2 300 1 Y 1 D LEU 1451 ? CG ? D LEU 1451 CG 301 1 Y 1 D LEU 1451 ? CD1 ? D LEU 1451 CD1 302 1 Y 1 D LEU 1451 ? CD2 ? D LEU 1451 CD2 303 1 Y 1 D LYS 1452 ? CG ? D LYS 1452 CG 304 1 Y 1 D LYS 1452 ? CD ? D LYS 1452 CD 305 1 Y 1 D LYS 1452 ? CE ? D LYS 1452 CE 306 1 Y 1 D LYS 1452 ? NZ ? D LYS 1452 NZ 307 1 Y 1 D ASN 1453 ? CG ? D ASN 1453 CG 308 1 Y 1 D ASN 1453 ? OD1 ? D ASN 1453 OD1 309 1 Y 1 D ASN 1453 ? ND2 ? D ASN 1453 ND2 310 1 Y 1 D LYS 1454 ? CG ? D LYS 1454 CG 311 1 Y 1 D LYS 1454 ? CD ? D LYS 1454 CD 312 1 Y 1 D LYS 1454 ? CE ? D LYS 1454 CE 313 1 Y 1 D LYS 1454 ? NZ ? D LYS 1454 NZ 314 1 Y 1 D GLN 1455 ? CG ? D GLN 1455 CG 315 1 Y 1 D GLN 1455 ? CD ? D GLN 1455 CD 316 1 Y 1 D GLN 1455 ? OE1 ? D GLN 1455 OE1 317 1 Y 1 D GLN 1455 ? NE2 ? D GLN 1455 NE2 318 1 Y 1 D PHE 1466 ? CG ? D PHE 1466 CG 319 1 Y 1 D PHE 1466 ? CD1 ? D PHE 1466 CD1 320 1 Y 1 D PHE 1466 ? CD2 ? D PHE 1466 CD2 321 1 Y 1 D PHE 1466 ? CE1 ? 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D GLU 1474 OE1 345 1 Y 1 D GLU 1474 ? OE2 ? D GLU 1474 OE2 346 1 Y 1 D GLN 1475 ? CG ? D GLN 1475 CG 347 1 Y 1 D GLN 1475 ? CD ? D GLN 1475 CD 348 1 Y 1 D GLN 1475 ? OE1 ? D GLN 1475 OE1 349 1 Y 1 D GLN 1475 ? NE2 ? D GLN 1475 NE2 350 1 Y 1 G DT 32 ? C7 ? F DT 32 C7 351 1 Y 1 G DT 33 ? C7 ? F DT 33 C7 352 1 Y 1 G DT 34 ? C7 ? F DT 34 C7 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6ZZ6 _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6ZZ6 _struct.title 'Cryo-EM structure of S.cerevisiae cohesin-Scc2-DNA complex' _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6ZZ6 _struct_keywords.text 'SMC, cohesin, DNA, CELL CYCLE' _struct_keywords.pdbx_keywords 'CELL CYCLE' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 7 ? J N N 8 ? # loop_ _struct_ref.id _struct_ref.db_name _struct_ref.db_code _struct_ref.pdbx_db_accession _struct_ref.pdbx_db_isoform _struct_ref.entity_id _struct_ref.pdbx_seq_one_letter_code _struct_ref.pdbx_align_begin 1 UNP SMC1_YEAST P32908 ? 1 GRLVGLELSNFKSYRGVTKVGFGESNFTSIIGPNGSGKSNMMDAISFVLGVRSNHLRSNILKDLIYRGVL 2 2 UNP SMC1_YEAST P32908 ? 1 ;SNPQSAYVKAFYQKGNKLVELMRIISRNGDTSYKIDGKTVSYKDYSIFLENENILIKAKNFLVFQGDVEQIAAQSPVELS RMFEEVSGSIQYKKEYEELKEKIEKLSKS ; 87 3 UNP SMC1_YEAST P32908 ? 1 ;AEEKKILNQFLKIKKKRKELFEKTFDYVSDHLDAIYRELTKNPNSNVELAGGNASLTIEDEDEPFNAGIKYHATPPLKRF KDMEYLSGGEKTVAALALLFAINSYQPSPFFVLDEVDAALDITNVQRIAAYIRRHRNPDLQFIVISLKNTMFEKSDALVG VYRQQQENSSKIITLDLSNYA ; 1044 4 UNP SMC3_YEAST P47037 ? 2 ;YIKRVIIKGFKTYRNETIIDNFSPHQNVIIGSNGSGKSNFFAAIRFVLSDDYSNLKREERQGLIHQGSGGSVMSASVEIV FHDPDHSMILPSGVLSRGDDEVTIRRTVGLKKDDYQLNDRNVTKGDIVRMLETAGFSMNNPYNIVPQGKIVALTNAKDKE RLQLLEDVVGAKSFEVKLKASLKKMEETEQKKIQINKEMGELNSKLSEMEQERKELEKYNELERNRK ; 2 5 UNP SMC3_YEAST P47037 ? 2 RAFENFKKFNERRKDLAERASELDESKDSIQDLIVKLKQQKVNAVDSTFQKVSENFEAVFERLVPRGTAKLIIHR 997 6 UNP SMC3_YEAST P47037 ? 2 ;YTGVSISVSFNSKQNEQLHVEQLSGGQKTVCAIALILAIQMVDPASFYLFDEIDAALDKQYRTAVATLLKELSKNAQFIC TTFRTDMLQVADKFFRVKYENKISTVIEVNREEAIGFIR ; 1104 7 UNP SCC1_YEAST Q12158 ? 3 TLRTSGELLQGIVRVYSKQATFLLTDIKDTLTKISML 67 8 UNP SCC1_YEAST Q12158 ? 3 VIFTDVLKS 502 9 UNP SCC1_YEAST Q12158 ? 3 ITKREASRGFFDILSLATEGCIGLSQTEAFGNIKIDA 519 10 UNP SCC2_YEAST Q04002 ? 4 ;MSYPGKDKNIPGRIIEALEDLPLSYLVPKDGLAALVNAPMRVSLPFDKTIFTSADDGRDVNINVLGTANSTTSSIKNEAE KERLVFKRPSNFTSSANSVDYVPTNFLEGLSPLAQSVLSTHKGLNDSINIEKKSEIVSRPEAKHKLESVTSNAGNLSFND NSSNKKTKTSTGVTMTQANLAEQYLNDLKNILDIVGFDQNSAEIGNIEYWLQLPNKKFVLTTNCLTKLQMTIKNITDNPQ LSNSIEITWLLRLLDVMVCNIKFSKSSLKMGLDDSMLRYIALLSTIVLFNIFLLGKNDSNLHRESYIMEPVNFLSDLIES LKILTIEYGSLKIEFDTFQEALELLPKYIRNGPFLDDNVTAKLVYIFSDLLMNNDIEATTNIQFQSFWDNVKRISSDILV SLFGSFDQQRGFIIEELLSHIEKLPTKRIQKKLRKVGNQNIYITDFTFTLMSMLENINCYSFCNQMKDIAPENIDLLKNE YKKQEEFLFNIVEHINDTILERFFKNPSALRYVIDNFVQDLLLLISSPQWPVTEKILSSLLKRLLSVYSPSMQVSANIET ICLQLIGNIGSTIFDIKCSTRDHEDNNLIKMINYPETLPHFFKSFEECIAYNETIKCRRSATRFLWNLRLGTILILEEYT KDAKEQIITVDNELKKILEQIKDGGLGPELENREADFSTIKLDYFSILHAFELLNLYDPYLKLILSLLAKDKIKLRSTAI KCLSMLASKDKVILSNPMVKETIHRRLNDSSASVKDAILDLVSINSSYFEFYQQINNNYNDDSIMVRKHVLRINEKMYDE TNDIVTKVYVIARILMKIEDEEDNIIDMARLILLNRWILKVHEVLDQPEKLKEISSSVLLVMSRVAIMNEKCSQLFDLFL NFYLLNKEAHSKEAYDKITHVLTILTDFLVQKIVELNSDDTNEKNSIVDKQNFLNLLAKFADSTVSFLTKDHITALYPYM VSDEKSDFHYYILQVFRCTFEKLANFKQKFLYDLETTLLSRLPKMNVREIDEAMPLIWSVATHRHDTARVAKACSSCLSH LHPYINKANNEEAAIVVDGKLQRLIYLSTGFARFCFPKPSNDKIAFLQEGETLYEHITKCLLVLSKDKITHVIRRVAVKN LTKLCGNHPKLFNSRHVLHLLDKEFQSDQLDIKLVILESLYDLFLLEERKSVRNTGVNSTLSSNSILKKKLLKTNRVEFA NDGVCSALATRFLDNILQLCLLRDLKNSLVAIRLLKLILKFGYTNPSHSIPTVIALFASTSQYIRHVAYELLEDLFEKYE TLVFSSLSRGVTKAIHYSIHTDEKYYYKHDHFLSLLEKLCGTGKKNGPKFFKVLKRIMQSYLDDITDLTSTNSSVQKSIF VLCTNISNITFVSQYDLVSLLKTIDLTTDRLKEVIMDEIGDNVSSLSVSEEKLSGIILIQLSLQDLGTYLLHLYGLRDDV LLLDIVEESELKNKQLPAKKPDISKFSAQLENIEQYSSNGKLLTYFRKHVKDT ; 1 11 PDB 6ZZ6 6ZZ6 ? 5 ? 1 12 PDB 6ZZ6 6ZZ6 ? 6 ? 1 # loop_ _struct_ref_seq.align_id _struct_ref_seq.ref_id _struct_ref_seq.pdbx_PDB_id_code _struct_ref_seq.pdbx_strand_id _struct_ref_seq.seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.seq_align_end _struct_ref_seq.pdbx_seq_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_db_accession _struct_ref_seq.db_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_db_align_beg_ins_code _struct_ref_seq.db_align_end _struct_ref_seq.pdbx_db_align_end_ins_code _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_beg _struct_ref_seq.pdbx_auth_seq_align_end 1 1 6ZZ6 A 1 ? 70 ? 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Q04002 1 ? 1493 ? 1 1493 11 11 6ZZ6 F 1 ? 34 ? 6ZZ6 1 ? 34 ? 1 34 12 12 6ZZ6 G 1 ? 34 ? 6ZZ6 1 ? 34 ? 1 34 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 3 6ZZ6 GLN A 294 ? UNP P32908 GLU 1158 conflict 1158 1 4 6ZZ6 GLY B 1 ? UNP P47037 ? ? 'expression tag' 0 2 4 6ZZ6 PRO B 2 ? UNP P47037 ? ? 'expression tag' 1 3 6 6ZZ6 GLN B 356 ? UNP P47037 GLU 1155 conflict 1155 4 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details hexameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 6 # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support 'gel filtration' _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 37 ? 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SER D 1467 ILE D 1473 1 ? 7 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role metalc1 metalc ? ? 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WATSON-CRICK ? ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference metalc ? ? hydrog ? ? # loop_ _pdbx_struct_conn_angle.id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr1_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr2_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_alt_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_label_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_atom_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_asym_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_comp_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_auth_seq_id _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_PDB_ins_code _pdbx_struct_conn_angle.ptnr3_symmetry _pdbx_struct_conn_angle.value _pdbx_struct_conn_angle.value_esd 1 OG ? 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