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O TYR B 53 N GLY B 38 ? N GLY B 36 AA7 2 3 N VAL B 37 ? N VAL B 35 O LYS B 70 ? O LYS B 68 AA8 1 2 N GLU B 74 ? N GLU B 72 O ILE B 77 ? O ILE B 75 AA9 1 2 O MET B 178 ? O MET B 176 N ASN B 164 ? N ASN B 162 AA9 2 3 O VAL B 165 ? O VAL B 163 N VAL B 154 ? N VAL B 152 AA9 3 4 N ILE B 153 ? N ILE B 151 O VAL B 300 ? O VAL B 298 AB1 1 2 N TYR B 242 ? N TYR B 240 O ILE B 250 ? O ILE B 248 AB2 1 2 O ALA C 31 ? O ALA C 29 N ALA C 21 ? N ALA C 19 AB2 2 3 O LYS C 20 ? O LYS C 18 N ASP C 13 ? N ASP C 11 AB2 3 4 N CYS C 12 ? N CYS C 10 O LEU C 106 ? O LEU C 104 AB2 4 5 N LEU C 107 ? N LEU C 105 O TYR C 135 ? O TYR C 133 AB2 5 6 N MET C 134 ? N MET C 132 O ILE C 359 ? O ILE C 357 AB3 1 2 O TYR C 55 ? O TYR C 53 N GLY C 38 ? N GLY C 36 AB3 2 3 N VAL C 37 ? N VAL C 35 O LYS C 70 ? O LYS C 68 AB4 1 2 N GLU C 74 ? N GLU C 72 O ILE C 77 ? O ILE C 75 AB5 1 2 O TYR C 171 ? O TYR C 169 N TYR C 168 ? N TYR C 166 AB5 2 3 O VAL C 165 ? O VAL C 163 N VAL C 154 ? N VAL C 152 AB5 3 4 N ILE C 153 ? N ILE C 151 O VAL C 300 ? O VAL C 298 AB5 4 5 N ASN C 299 ? N ASN C 297 O ILE C 332 ? O ILE C 330 AB6 1 2 N TYR C 242 ? N TYR C 240 O ILE C 250 ? O ILE C 248 AB7 1 2 O ALA D 31 ? O ALA D 29 N ALA D 21 ? N ALA D 19 AB7 2 3 O LYS D 20 ? O LYS D 18 N ASP D 13 ? N ASP D 11 AB7 3 4 N CYS D 12 ? N CYS D 10 O LEU D 106 ? O LEU D 104 AB7 4 5 N LEU D 107 ? N LEU D 105 O TYR D 135 ? O TYR D 133 AB7 5 6 N MET D 134 ? N MET D 132 O ILE D 359 ? O ILE D 357 AB8 1 2 O TYR D 55 ? O TYR D 53 N GLY D 38 ? N GLY D 36 AB8 2 3 N VAL D 37 ? N VAL D 35 O LYS D 70 ? O LYS D 68 AB9 1 2 N GLU D 74 ? N GLU D 72 O ILE D 77 ? O ILE D 75 AC1 1 2 O TYR D 171 ? O TYR D 169 N TYR D 168 ? N TYR D 166 AC1 2 3 O ILE D 167 ? O ILE D 165 N GLY D 152 ? N GLY D 150 AC1 3 4 N ILE D 153 ? N ILE D 151 O VAL D 300 ? O VAL D 298 AC1 4 5 N ASN D 299 ? N ASN D 297 O ILE D 332 ? O ILE D 330 AC2 1 2 N TYR D 242 ? N TYR D 240 O ILE D 250 ? O ILE D 248 AC3 1 2 O ALA E 31 ? O ALA E 29 N ALA E 21 ? N ALA E 19 AC3 2 3 O LYS E 20 ? 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O MET H 176 AE5 1 2 O TYR H 171 ? O TYR H 169 N TYR H 168 ? N TYR H 166 AE5 2 3 O VAL H 165 ? O VAL H 163 N VAL H 154 ? N VAL H 152 AE5 3 4 N ILE H 153 ? N ILE H 151 O VAL H 300 ? O VAL H 298 AE5 4 5 N ASN H 299 ? N ASN H 297 O ILE H 332 ? O ILE H 330 AE6 1 2 N TYR H 242 ? N TYR H 240 O ILE H 250 ? O ILE H 248 # loop_ _struct_site.id _struct_site.pdbx_evidence_code _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id _struct_site.pdbx_auth_ins_code _struct_site.pdbx_num_residues _struct_site.details AC1 Software A MG 401 ? 4 'binding site for residue MG A 401' AC2 Software A ADP 402 ? 18 'binding site for residue ADP A 402' AC3 Software B MG 401 ? 3 'binding site for residue MG B 401' AC4 Software B ADP 402 ? 18 'binding site for residue ADP B 402' AC5 Software C MG 401 ? 3 'binding site for residue MG C 401' AC6 Software C ADP 402 ? 15 'binding site for residue ADP C 402' AC7 Software D MG 401 ? 2 'binding site for residue MG D 401' AC8 Software D ADP 402 ? 15 'binding site for residue ADP D 402' AC9 Software E MG 401 ? 4 'binding site for residue MG E 401' AD1 Software E ADP 402 ? 18 'binding site for residue ADP E 402' AD2 Software F MG 401 ? 4 'binding site for residue MG F 401' AD3 Software F ADP 402 ? 16 'binding site for residue ADP F 402' AD4 Software G MG 401 ? 4 'binding site for residue MG G 401' AD5 Software G ADP 402 ? 17 'binding site for residue ADP G 402' AD6 Software H MG 401 ? 4 'binding site for residue MG H 401' AD7 Software H ADP 402 ? 17 'binding site for residue ADP H 402' # loop_ _struct_site_gen.id _struct_site_gen.site_id _struct_site_gen.pdbx_num_res _struct_site_gen.label_comp_id _struct_site_gen.label_asym_id _struct_site_gen.label_seq_id _struct_site_gen.pdbx_auth_ins_code _struct_site_gen.auth_comp_id _struct_site_gen.auth_asym_id _struct_site_gen.auth_seq_id _struct_site_gen.label_atom_id _struct_site_gen.label_alt_id _struct_site_gen.symmetry _struct_site_gen.details 1 AC1 4 SER A 16 ? 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Resulting models were subjected to MDFF. ; _em_3d_fitting.overall_b_value 350 _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 6BNO _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages 1 _em_3d_reconstruction.num_particles 63139 _em_3d_reconstruction.resolution 5.5 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type HELICAL _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details 'Buffer was filtered through 0.44 um filter and degassed.' _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # _em_entity_assembly.id 1 _em_entity_assembly.parent_id 0 _em_entity_assembly.details 'Actin filament in the ADP state' _em_entity_assembly.name 'bare actin filament' _em_entity_assembly.source NATURAL _em_entity_assembly.type COMPLEX _em_entity_assembly.entity_id_list 1 _em_entity_assembly.synonym ? _em_entity_assembly.oligomeric_details ? # _em_image_scans.entry_id 6BNO _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height 3710 _em_image_scans.dimension_width 3838 _em_image_scans.frames_per_image 24 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size 5.0 _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image 1-24 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 6BNO _em_imaging.accelerating_voltage 200 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 100 _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TECNAI 20' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2 _em_imaging.nominal_defocus_max 3000 _em_imaging.nominal_defocus_min 1500 _em_imaging.nominal_magnification 29000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'GATAN 626 SINGLE TILT LIQUID NITROGEN CRYO TRANSFER HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 200 _em_sample_support.grid_type C-flat-1.2/1.3 _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 298 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;Sample was applied to a glow-discharged holey carbon grid, incubated for 60 seconds and blotted for 3 seconds from the backside with filter paper. ; _em_vitrification.humidity 95 _em_vitrification.instrument 'LEICA EM GP' _em_vitrification.entry_id 6BNO _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 6BNO _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state FILAMENT _em_experiment.reconstruction_method HELICAL _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 A MET -1 ? 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47 ALA OXT O N N 48 ALA H H N N 49 ALA H2 H N N 50 ALA HA H N N 51 ALA HB1 H N N 52 ALA HB2 H N N 53 ALA HB3 H N N 54 ALA HXT H N N 55 ARG N N N N 56 ARG CA C N S 57 ARG C C N N 58 ARG O O N N 59 ARG CB C N N 60 ARG CG C N N 61 ARG CD C N N 62 ARG NE N N N 63 ARG CZ C N N 64 ARG NH1 N N N 65 ARG NH2 N N N 66 ARG OXT O N N 67 ARG H H N N 68 ARG H2 H N N 69 ARG HA H N N 70 ARG HB2 H N N 71 ARG HB3 H N N 72 ARG HG2 H N N 73 ARG HG3 H N N 74 ARG HD2 H N N 75 ARG HD3 H N N 76 ARG HE H N N 77 ARG HH11 H N N 78 ARG HH12 H N N 79 ARG HH21 H N N 80 ARG HH22 H N N 81 ARG HXT H N N 82 ASN N N N N 83 ASN CA C N S 84 ASN C C N N 85 ASN O O N N 86 ASN CB C N N 87 ASN CG C N N 88 ASN OD1 O N N 89 ASN ND2 N N N 90 ASN OXT O N N 91 ASN H H N N 92 ASN H2 H N N 93 ASN HA H N N 94 ASN HB2 H N N 95 ASN HB3 H N N 96 ASN HD21 H N N 97 ASN HD22 H N N 98 ASN HXT H N N 99 ASP N N N N 100 ASP CA C N S 101 ASP C C N N 102 ASP O O N N 103 ASP CB C N N 104 ASP CG C N N 105 ASP OD1 O N N 106 ASP OD2 O N N 107 ASP 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