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'Cryo-EM structures reveal specialization at the myosin VI-actin interface and a mechanism of force sensitivity.' 2017 ? 10.7554/eLife.31125 29199952 ? ? ? ? ? ? ? ? UK ? ? 1 'Nat Nanotechnol' ? ? 1748-3395 ? ? ? ? ? ? 'Controllable molecular motors engineered from myosin and RNA.' 2017 ? 10.1038/s41565-017-0005-y 29109539 ? # loop_ _citation_author.citation_id _citation_author.name _citation_author.ordinal _citation_author.identifier_ORCID primary 'Gurel, P.S.' 1 ? primary 'Kim, L.Y.' 2 ? primary 'Ruijgrok, P.V.' 3 ? primary 'Omabegho, T.' 4 ? primary 'Bryant, Z.' 5 ? primary 'Alushin, G.M.' 6 ? 1 'Omabegho, T.' 7 ? 1 'Gurel, P.S.' 8 ? 1 'Cheng, C.Y.' 9 ? 1 'Kim, L.Y.' 10 ? 1 'Ruijgrok, P.V.' 11 ? 1 'Das, R.' 12 ? 1 'Alushin, G.M.' 13 ? 1 'Bryant, Z.' 14 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Unconventional myosin-VI' 79837.367 6 ? ? ? ? 2 polymer nat 'Actin, alpha skeletal muscle' 41560.266 8 ? ? ? ? 3 non-polymer syn 'MAGNESIUM ION' 24.305 8 ? ? ? ? 4 non-polymer syn "ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE" 427.201 8 ? ? ? ? # 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P68135 1 ? 373 ? -1 371 # _pdbx_struct_assembly.id 1 _pdbx_struct_assembly.details author_defined_assembly _pdbx_struct_assembly.method_details ? _pdbx_struct_assembly.oligomeric_details tetradecameric _pdbx_struct_assembly.oligomeric_count 14 # loop_ _pdbx_struct_assembly_prop.biol_id _pdbx_struct_assembly_prop.type _pdbx_struct_assembly_prop.value _pdbx_struct_assembly_prop.details 1 'ABSA (A^2)' 45420 ? 1 MORE -279 ? 1 'SSA (A^2)' 305780 ? # _pdbx_struct_assembly_gen.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_gen.oper_expression 1 _pdbx_struct_assembly_gen.asym_id_list A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T,U,V,W,X,Y,Z,AA,BA,CA,DA # _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.assembly_id 1 _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.experimental_support none _pdbx_struct_assembly_auth_evidence.details ? # _pdbx_struct_oper_list.id 1 _pdbx_struct_oper_list.type 'identity operation' _pdbx_struct_oper_list.name 1_555 _pdbx_struct_oper_list.symmetry_operation ? _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][1] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[1][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][2] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[2][3] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][1] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][2] 0.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.matrix[3][3] 1.0000000000 _pdbx_struct_oper_list.vector[3] 0.0000000000 # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 LEU A 43 ? VAL A 47 ? LEU I 44 VAL I 48 5 ? 5 HELX_P HELX_P2 AA2 ASP A 60 ? LEU A 64 ? ASP I 61 LEU I 65 5 ? 5 HELX_P HELX_P3 AA3 ASN A 68 ? LYS A 82 ? ASN I 69 LYS I 83 1 ? 15 HELX_P HELX_P4 AA4 ILE A 102 ? SER A 107 ? ILE I 103 SER I 108 1 ? 6 HELX_P HELX_P5 AA5 SER A 107 ? GLN A 115 ? SER I 108 GLN I 116 1 ? 9 HELX_P HELX_P6 AA6 VAL A 126 ? ASP A 131 ? VAL I 127 ASP I 132 1 ? 6 HELX_P HELX_P7 AA7 ASP A 131 ? VAL A 139 ? ASP I 132 VAL I 140 1 ? 9 HELX_P HELX_P8 AA8 THR A 157 ? TYR A 171 ? THR I 158 TYR I 172 1 ? 15 HELX_P HELX_P9 AA9 ASP A 179 ? GLY A 192 ? ASP I 180 GLY I 193 1 ? 14 HELX_P HELX_P10 AB1 GLU A 230 ? ILE A 234 ? GLU I 231 ILE I 235 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 ILE A 246 ? CYS A 251 ? ILE I 247 CYS I 252 1 ? 6 HELX_P HELX_P12 AB3 SER A 255 ? GLU A 260 ? SER I 256 GLU I 261 1 ? 6 HELX_P HELX_P13 AB4 SER A 266 ? ASN A 274 ? SER I 267 ASN I 275 5 ? 9 HELX_P HELX_P14 AB5 ASN A 283 ? GLN A 289 ? ASN I 284 GLN I 290 1 ? 7 HELX_P HELX_P15 AB6 LEU A 291 ? LYS A 295 ? 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LEU I 565 ASN I 570 1 ? 6 HELX_P HELX_P30 AD3 GLN A 591 ? ASN A 597 ? GLN I 592 ASN I 598 1 ? 7 HELX_P HELX_P31 AD4 HIS A 601 ? CYS A 609 ? HIS I 602 CYS I 610 1 ? 9 HELX_P HELX_P32 AD5 ASP A 613 ? PHE A 620 ? ASP I 614 PHE I 621 1 ? 8 HELX_P HELX_P33 AD6 SER A 641 ? SER A 659 ? SER I 642 SER I 660 1 ? 19 HELX_P HELX_P34 AD7 ALA A 682 ? CYS A 690 ? ALA I 683 CYS I 691 1 ? 9 HELX_P HELX_P35 AD8 GLY A 692 ? MET A 700 ? GLY I 693 MET I 701 1 ? 9 HELX_P HELX_P36 AD9 LEU B 43 ? VAL B 47 ? LEU J 44 VAL J 48 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 AE1 ASN B 68 ? LYS B 82 ? ASN J 69 LYS J 83 1 ? 15 HELX_P HELX_P38 AE2 SER B 107 ? GLN B 115 ? SER J 108 GLN J 116 1 ? 9 HELX_P HELX_P39 AE3 VAL B 126 ? ASP B 136 ? VAL J 127 ASP J 137 1 ? 11 HELX_P HELX_P40 AE4 THR B 157 ? TYR B 171 ? THR J 158 TYR J 172 1 ? 15 HELX_P HELX_P41 AE5 ASP B 178 ? GLY B 192 ? ASP J 179 GLY J 193 1 ? 15 HELX_P HELX_P42 AE6 GLU B 230 ? ILE B 234 ? GLU J 231 ILE J 235 5 ? 5 HELX_P HELX_P43 AE7 ILE B 246 ? ALA B 252 ? ILE J 247 ALA J 253 1 ? 7 HELX_P HELX_P44 AE8 SER B 255 ? GLU B 260 ? SER J 256 GLU J 261 1 ? 6 HELX_P HELX_P45 AE9 SER B 266 ? ASN B 274 ? SER J 267 ASN J 275 5 ? 9 HELX_P HELX_P46 AF1 ASN B 283 ? LYS B 288 ? ASN J 284 LYS J 289 1 ? 6 HELX_P HELX_P47 AF2 GLN B 289 ? ILE B 290 ? GLN J 290 ILE J 291 5 ? 2 HELX_P HELX_P48 AF3 LEU B 291 ? LYS B 295 ? LEU J 292 LYS J 296 5 ? 5 HELX_P HELX_P49 AF4 SER B 296 ? GLY B 303 ? SER J 297 GLY J 304 1 ? 8 HELX_P HELX_P50 AF5 ASP B 311 ? ILE B 326 ? ASP J 312 ILE J 327 1 ? 16 HELX_P HELX_P51 AF6 ASP B 329 ? ASN B 348 ? ASP J 330 ASN J 349 1 ? 20 HELX_P HELX_P52 AF7 ASN B 365 ? SER B 367 ? ASN J 366 SER J 368 5 ? 3 HELX_P HELX_P53 AF8 THR B 368 ? GLY B 379 ? THR J 369 GLY J 380 1 ? 12 HELX_P HELX_P54 AF9 ASP B 381 ? VAL B 387 ? ASP J 382 VAL J 388 1 ? 7 HELX_P HELX_P55 AG1 LYS B 411 ? GLN B 440 ? LYS J 412 GLN J 441 1 ? 30 HELX_P HELX_P56 AG2 SER B 466 ? ILE B 487 ? SER J 467 ILE J 488 1 ? 22 HELX_P HELX_P57 AG3 LEU B 488 ? GLN B 496 ? LEU J 489 GLN J 497 1 ? 9 HELX_P HELX_P58 AG4 ASN B 510 ? GLU B 518 ? ASN J 511 GLU J 519 1 ? 9 HELX_P HELX_P59 AG5 ILE B 524 ? LEU B 534 ? ILE J 525 LEU J 535 1 ? 11 HELX_P HELX_P60 AG6 SER B 538 ? HIS B 550 ? SER J 539 HIS J 551 1 ? 13 HELX_P HELX_P61 AG7 ILE B 558 ? SER B 562 ? ILE J 559 SER J 563 5 ? 5 HELX_P HELX_P62 AG8 LEU B 564 ? ASN B 569 ? LEU J 565 ASN J 570 1 ? 6 HELX_P HELX_P63 AG9 GLN B 591 ? ASN B 596 ? GLN J 592 ASN J 597 1 ? 6 HELX_P HELX_P64 AH1 HIS B 601 ? CYS B 609 ? HIS J 602 CYS J 610 1 ? 9 HELX_P HELX_P65 AH2 ASP B 613 ? PHE B 620 ? ASP J 614 PHE J 621 1 ? 8 HELX_P HELX_P66 AH3 SER B 641 ? SER B 659 ? SER J 642 SER J 660 1 ? 19 HELX_P HELX_P67 AH4 ALA B 682 ? CYS B 690 ? ALA J 683 CYS J 691 1 ? 9 HELX_P HELX_P68 AH5 GLY B 692 ? MET B 700 ? GLY J 693 MET J 701 1 ? 9 HELX_P HELX_P69 AH6 LEU C 43 ? VAL C 47 ? LEU K 44 VAL K 48 5 ? 5 HELX_P HELX_P70 AH7 ASN C 68 ? LYS C 82 ? ASN K 69 LYS K 83 1 ? 15 HELX_P HELX_P71 AH8 SER C 107 ? GLN C 115 ? SER K 108 GLN K 116 1 ? 9 HELX_P HELX_P72 AH9 HIS C 125 ? ASP C 131 ? HIS K 126 ASP K 132 1 ? 7 HELX_P HELX_P73 AI1 ASP C 131 ? VAL C 139 ? ASP K 132 VAL K 140 1 ? 9 HELX_P HELX_P74 AI2 THR C 157 ? TYR C 171 ? THR K 158 TYR K 172 1 ? 15 HELX_P HELX_P75 AI3 ARG C 180 ? GLY C 192 ? ARG K 181 GLY K 193 1 ? 13 HELX_P HELX_P76 AI4 GLU C 230 ? ILE C 234 ? GLU K 231 ILE K 235 5 ? 5 HELX_P HELX_P77 AI5 ILE C 246 ? CYS C 251 ? ILE K 247 CYS K 252 1 ? 6 HELX_P HELX_P78 AI6 SER C 255 ? GLU C 260 ? SER K 256 GLU K 261 1 ? 6 HELX_P HELX_P79 AI7 SER C 266 ? ASN C 269 ? SER K 267 ASN K 270 5 ? 4 HELX_P HELX_P80 AI8 PHE C 270 ? ARG C 275 ? PHE K 271 ARG K 276 1 ? 6 HELX_P HELX_P81 AI9 ASN C 283 ? LYS C 288 ? ASN K 284 LYS K 289 1 ? 6 HELX_P HELX_P82 AJ1 LEU C 291 ? LYS C 295 ? LEU K 292 LYS K 296 5 ? 5 HELX_P HELX_P83 AJ2 SER C 296 ? GLY C 303 ? SER K 297 GLY K 304 1 ? 8 HELX_P HELX_P84 AJ3 ASP C 311 ? ILE C 326 ? ASP K 312 ILE K 327 1 ? 16 HELX_P HELX_P85 AJ4 ASP C 329 ? GLY C 347 ? 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LYS N 634 ? ? 76.73 # loop_ _pdbx_validate_planes.id _pdbx_validate_planes.PDB_model_num _pdbx_validate_planes.auth_comp_id _pdbx_validate_planes.auth_asym_id _pdbx_validate_planes.auth_seq_id _pdbx_validate_planes.PDB_ins_code _pdbx_validate_planes.label_alt_id _pdbx_validate_planes.rmsd _pdbx_validate_planes.type 1 1 ARG I 85 ? ? 0.200 'SIDE CHAIN' 2 1 TYR I 172 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 3 1 ARG I 205 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 4 1 ARG I 234 ? ? 0.093 'SIDE CHAIN' 5 1 ARG I 250 ? ? 0.158 'SIDE CHAIN' 6 1 ARG I 339 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 7 1 ARG I 438 ? ? 0.125 'SIDE CHAIN' 8 1 ARG I 561 ? ? 0.120 'SIDE CHAIN' 9 1 ARG I 667 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 10 1 TYR J 172 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 11 1 ARG J 199 ? ? 0.082 'SIDE CHAIN' 12 1 ARG J 205 ? ? 0.133 'SIDE CHAIN' 13 1 ARG J 262 ? ? 0.102 'SIDE CHAIN' 14 1 ARG J 556 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 15 1 ARG J 561 ? ? 0.104 'SIDE CHAIN' 16 1 ARG J 572 ? ? 0.147 'SIDE CHAIN' 17 1 ARG K 166 ? ? 0.113 'SIDE CHAIN' 18 1 TYR K 508 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 19 1 ARG K 521 ? ? 0.108 'SIDE CHAIN' 20 1 ARG K 659 ? ? 0.113 'SIDE CHAIN' 21 1 ARG K 667 ? ? 0.151 'SIDE CHAIN' 22 1 ARG L 85 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 23 1 ARG L 136 ? ? 0.115 'SIDE CHAIN' 24 1 ARG L 556 ? ? 0.138 'SIDE CHAIN' 25 1 ARG L 572 ? ? 0.107 'SIDE CHAIN' 26 1 ARG M 136 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 27 1 ARG M 205 ? ? 0.144 'SIDE CHAIN' 28 1 ARG M 438 ? ? 0.101 'SIDE CHAIN' 29 1 ARG M 561 ? ? 0.111 'SIDE CHAIN' 30 1 ARG M 580 ? ? 0.109 'SIDE CHAIN' 31 1 ARG N 80 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 32 1 TYR N 167 ? ? 0.117 'SIDE CHAIN' 33 1 ARG N 199 ? ? 0.175 'SIDE CHAIN' 34 1 ARG N 250 ? ? 0.096 'SIDE CHAIN' 35 1 ARG N 420 ? ? 0.086 'SIDE CHAIN' 36 1 ARG N 438 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 37 1 ARG N 561 ? ? 0.125 'SIDE CHAIN' 38 1 ARG N 569 ? ? 0.145 'SIDE CHAIN' 39 1 ARG N 572 ? ? 0.111 'SIDE CHAIN' 40 1 ARG N 618 ? ? 0.081 'SIDE CHAIN' 41 1 ARG A 62 ? ? 0.107 'SIDE CHAIN' 42 1 ARG A 206 ? ? 0.094 'SIDE CHAIN' 43 1 ARG A 290 ? ? 0.109 'SIDE CHAIN' 44 1 TYR A 362 ? ? 0.071 'SIDE CHAIN' 45 1 ARG B 290 ? ? 0.090 'SIDE CHAIN' 46 1 ARG C 196 ? ? 0.110 'SIDE CHAIN' 47 1 TYR C 218 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 48 1 ARG C 312 ? ? 0.108 'SIDE CHAIN' 49 1 ARG D 28 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 50 1 TYR D 133 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' 51 1 ARG D 290 ? ? 0.144 'SIDE CHAIN' 52 1 TYR D 362 ? ? 0.092 'SIDE CHAIN' 53 1 ARG E 28 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 54 1 TYR E 169 ? ? 0.070 'SIDE CHAIN' 55 1 ARG E 183 ? ? 0.103 'SIDE CHAIN' 56 1 ARG E 196 ? ? 0.125 'SIDE CHAIN' 57 1 ARG E 210 ? ? 0.112 'SIDE CHAIN' 58 1 ARG E 290 ? ? 0.089 'SIDE CHAIN' 59 1 TYR E 362 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 60 1 ARG F 147 ? ? 0.130 'SIDE CHAIN' 61 1 ARG F 206 ? ? 0.076 'SIDE CHAIN' 62 1 ARG F 210 ? ? 0.102 'SIDE CHAIN' 63 1 ARG F 254 ? ? 0.084 'SIDE CHAIN' 64 1 ARG F 290 ? ? 0.088 'SIDE CHAIN' 65 1 ARG F 312 ? ? 0.082 'SIDE CHAIN' 66 1 TYR F 362 ? ? 0.080 'SIDE CHAIN' 67 1 ARG G 28 ? ? 0.096 'SIDE CHAIN' 68 1 ARG G 183 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 69 1 ARG G 290 ? ? 0.130 'SIDE CHAIN' 70 1 TYR G 362 ? ? 0.072 'SIDE CHAIN' 71 1 ARG H 196 ? ? 0.085 'SIDE CHAIN' 72 1 ARG H 210 ? ? 0.119 'SIDE CHAIN' 73 1 ARG H 256 ? ? 0.132 'SIDE CHAIN' 74 1 ARG H 290 ? ? 0.127 'SIDE CHAIN' 75 1 ARG H 335 ? ? 0.079 'SIDE CHAIN' 76 1 TYR H 362 ? ? 0.077 'SIDE CHAIN' # _em_3d_fitting.entry_id 6BNQ _em_3d_fitting.id 1 _em_3d_fitting.details ;Initial models were assembled from 8 actins (3J8A) and 6 myosins (4PFO) through rigid body docking in Chimera, followed by flexible fitting with DireX. Resulting models were subjected to MDFF. ; _em_3d_fitting.overall_b_value 200 _em_3d_fitting.ref_protocol 'FLEXIBLE FIT' _em_3d_fitting.ref_space REAL _em_3d_fitting.target_criteria ? _em_3d_fitting.method ? # _em_3d_reconstruction.entry_id 6BNQ _em_3d_reconstruction.id 1 _em_3d_reconstruction.algorithm 'FOURIER SPACE' _em_3d_reconstruction.details ? _em_3d_reconstruction.refinement_type ? _em_3d_reconstruction.image_processing_id 1 _em_3d_reconstruction.num_class_averages 1 _em_3d_reconstruction.num_particles 36114 _em_3d_reconstruction.resolution 5.5 _em_3d_reconstruction.resolution_method 'FSC 0.143 CUT-OFF' _em_3d_reconstruction.symmetry_type HELICAL _em_3d_reconstruction.method ? _em_3d_reconstruction.nominal_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.actual_pixel_size ? _em_3d_reconstruction.magnification_calibration ? _em_3d_reconstruction.citation_id ? _em_3d_reconstruction.euler_angles_details ? # _em_buffer.id 1 _em_buffer.details 'Buffer was filtered through 0.44 um filter and degassed.' _em_buffer.pH 7.5 _em_buffer.specimen_id 1 _em_buffer.name ? # loop_ _em_entity_assembly.id _em_entity_assembly.parent_id _em_entity_assembly.details _em_entity_assembly.name _em_entity_assembly.source _em_entity_assembly.type _em_entity_assembly.entity_id_list _em_entity_assembly.synonym _em_entity_assembly.oligomeric_details 1 0 ? 'myosin VI-actin in the ADP state' 'MULTIPLE SOURCES' COMPLEX '1, 2' ? ? 2 1 ? 'myosin VI' RECOMBINANT COMPLEX 1 ? ? 3 1 ? actin NATURAL COMPLEX 2 ? ? # _em_image_scans.entry_id 6BNQ _em_image_scans.id 1 _em_image_scans.dimension_height 3710 _em_image_scans.dimension_width 3838 _em_image_scans.frames_per_image 24 _em_image_scans.image_recording_id 1 _em_image_scans.sampling_size 5.0 _em_image_scans.scanner_model ? _em_image_scans.used_frames_per_image 1-24 _em_image_scans.citation_id ? _em_image_scans.number_digital_images ? _em_image_scans.od_range ? _em_image_scans.quant_bit_size ? _em_image_scans.details ? # _em_imaging.id 1 _em_imaging.entry_id 6BNQ _em_imaging.accelerating_voltage 200 _em_imaging.alignment_procedure 'COMA FREE' _em_imaging.c2_aperture_diameter 100 _em_imaging.calibrated_defocus_max ? _em_imaging.calibrated_defocus_min ? _em_imaging.calibrated_magnification ? _em_imaging.cryogen NITROGEN _em_imaging.details ? _em_imaging.electron_source 'FIELD EMISSION GUN' _em_imaging.illumination_mode 'FLOOD BEAM' _em_imaging.microscope_model 'FEI TECNAI 20' _em_imaging.mode 'BRIGHT FIELD' _em_imaging.nominal_cs 2 _em_imaging.nominal_defocus_max 3000 _em_imaging.nominal_defocus_min 1500 _em_imaging.nominal_magnification 29000 _em_imaging.recording_temperature_maximum ? _em_imaging.recording_temperature_minimum ? _em_imaging.residual_tilt ? _em_imaging.specimen_holder_model 'GATAN 626 SINGLE TILT LIQUID NITROGEN CRYO TRANSFER HOLDER' _em_imaging.specimen_id 1 _em_imaging.citation_id ? _em_imaging.date ? _em_imaging.temperature ? _em_imaging.tilt_angle_min ? _em_imaging.tilt_angle_max ? _em_imaging.astigmatism ? _em_imaging.detector_distance ? _em_imaging.electron_beam_tilt_params ? _em_imaging.specimen_holder_type ? # _em_sample_support.id 1 _em_sample_support.specimen_id 1 _em_sample_support.details ? _em_sample_support.grid_material COPPER _em_sample_support.grid_mesh_size 200 _em_sample_support.grid_type C-flat-1.2/1.3 _em_sample_support.method ? _em_sample_support.film_material ? _em_sample_support.citation_id ? # _em_vitrification.id 1 _em_vitrification.specimen_id 1 _em_vitrification.chamber_temperature 298 _em_vitrification.cryogen_name ETHANE _em_vitrification.details ;Sample was applied to a glow-discharged holey carbon grid. 3 uL actin was incubated for 60 seconds. 3 uL of myosin VI was added and incubated for 60 seconds. 3 uL solution was removed. An additional 3 uL of myosin VI was applied. After 60 seconds, 3 uL solution was removed, and the grid was blotted for 3 seconds from the backside with filter paper. ; _em_vitrification.humidity 95 _em_vitrification.instrument 'LEICA EM GP' _em_vitrification.entry_id 6BNQ _em_vitrification.citation_id ? _em_vitrification.method ? _em_vitrification.temp ? _em_vitrification.time_resolved_state ? # _em_experiment.entry_id 6BNQ _em_experiment.id 1 _em_experiment.aggregation_state FILAMENT _em_experiment.reconstruction_method HELICAL _em_experiment.entity_assembly_id 1 # loop_ _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_model_num _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.polymer_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.occupancy_flag _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.auth_seq_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.PDB_ins_code _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_asym_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_comp_id _pdbx_unobs_or_zero_occ_residues.label_seq_id 1 1 Y 1 I GLU 2 ? 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J CYS 2 39 1 Y 1 D ASP 1 ? J ASP 3 40 1 Y 1 D GLU 2 ? J GLU 4 41 1 Y 1 D ASP 3 ? J ASP 5 42 1 Y 1 D GLU 4 ? J GLU 6 43 1 Y 1 E MET -1 ? K MET 1 44 1 Y 1 E CYS 0 ? K CYS 2 45 1 Y 1 E ASP 1 ? K ASP 3 46 1 Y 1 E GLU 2 ? K GLU 4 47 1 Y 1 E ASP 3 ? K ASP 5 48 1 Y 1 E GLU 4 ? K GLU 6 49 1 Y 1 F MET -1 ? L MET 1 50 1 Y 1 F CYS 0 ? L CYS 2 51 1 Y 1 F ASP 1 ? L ASP 3 52 1 Y 1 F GLU 2 ? L GLU 4 53 1 Y 1 F ASP 3 ? L ASP 5 54 1 Y 1 F GLU 4 ? L GLU 6 55 1 Y 1 G MET -1 ? M MET 1 56 1 Y 1 G CYS 0 ? M CYS 2 57 1 Y 1 G ASP 1 ? M ASP 3 58 1 Y 1 G GLU 2 ? M GLU 4 59 1 Y 1 G ASP 3 ? M ASP 5 60 1 Y 1 G GLU 4 ? M GLU 6 61 1 Y 1 H MET -1 ? N MET 1 62 1 Y 1 H CYS 0 ? N CYS 2 63 1 Y 1 H ASP 1 ? N ASP 3 64 1 Y 1 H GLU 2 ? N GLU 4 65 1 Y 1 H ASP 3 ? N ASP 5 66 1 Y 1 H GLU 4 ? N GLU 6 # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_ordinal ADP PB P N N 1 ADP O1B O N N 2 ADP O2B O N N 3 ADP O3B O N N 4 ADP PA P N S 5 ADP O1A O N N 6 ADP O2A O N N 7 ADP O3A O N N 8 ADP "O5'" O N N 9 ADP "C5'" C N N 10 ADP "C4'" C N R 11 ADP "O4'" O N N 12 ADP "C3'" C N S 13 ADP "O3'" O N N 14 ADP "C2'" C N R 15 ADP "O2'" O N N 16 ADP "C1'" C N R 17 ADP N9 N Y N 18 ADP C8 C Y N 19 ADP N7 N Y N 20 ADP C5 C Y N 21 ADP C6 C Y N 22 ADP N6 N N N 23 ADP N1 N Y N 24 ADP C2 C Y N 25 ADP N3 N Y N 26 ADP C4 C Y N 27 ADP HOB2 H N N 28 ADP HOB3 H N N 29 ADP HOA2 H N N 30 ADP "H5'1" H N N 31 ADP "H5'2" H N N 32 ADP "H4'" H N N 33 ADP "H3'" H N N 34 ADP "HO3'" H N N 35 ADP "H2'" H N N 36 ADP "HO2'" H N N 37 ADP "H1'" H N N 38 ADP H8 H N N 39 ADP HN61 H N N 40 ADP HN62 H N N 41 ADP H2 H N N 42 ALA N N N N 43 ALA CA C N S 44 ALA C C N N 45 ALA O O N N 46 ALA CB C N N 47 ALA OXT O N N 48 ALA H H N N 49 ALA H2 H N N 50 ALA HA H N N 51 ALA HB1 H N N 52 ALA HB2 H N N 53 ALA HB3 H N N 54 ALA HXT H N N 55 ARG N N N N 56 ARG CA C N S 57 ARG C C N N 58 ARG O O N N 59 ARG CB C N N 60 ARG CG C N N 61 ARG CD C N N 62 ARG NE N N N 63 ARG CZ C N N 64 ARG NH1 N N N 65 ARG NH2 N N N 66 ARG OXT O N N 67 ARG H H N N 68 ARG H2 H N N 69 ARG HA H N N 70 ARG HB2 H N N 71 ARG HB3 H N N 72 ARG HG2 H N N 73 ARG HG3 H N N 74 ARG HD2 H N N 75 ARG HD3 H N N 76 ARG HE H N N 77 ARG HH11 H N N 78 ARG HH12 H N N 79 ARG HH21 H N N 80 ARG HH22 H N N 81 ARG HXT H N N 82 ASN N N N N 83 ASN CA C N S 84 ASN C C N N 85 ASN O O N N 86 ASN CB C N N 87 ASN CG C N N 88 ASN OD1 O N N 89 ASN ND2 N N N 90 ASN OXT O N N 91 ASN H H N N 92 ASN H2 H N N 93 ASN HA H N N 94 ASN HB2 H N N 95 ASN HB3 H N N 96 ASN HD21 H N N 97 ASN HD22 H N N 98 ASN HXT H N N 99 ASP N N N N 100 ASP CA C N S 101 ASP C C N N 102 ASP O O N N 103 ASP CB C N N 104 ASP CG C N N 105 ASP OD1 O N N 106 ASP OD2 O N N 107 ASP 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N N 137 GLN CG CD sing N N 138 GLN CG HG2 sing N N 139 GLN CG HG3 sing N N 140 GLN CD OE1 doub N N 141 GLN CD NE2 sing N N 142 GLN NE2 HE21 sing N N 143 GLN NE2 HE22 sing N N 144 GLN OXT HXT sing N N 145 GLU N CA sing N N 146 GLU N H sing N N 147 GLU N H2 sing N N 148 GLU CA C sing N N 149 GLU CA CB sing N N 150 GLU CA HA sing N N 151 GLU C O doub N N 152 GLU C OXT sing N N 153 GLU CB CG sing N N 154 GLU CB HB2 sing N N 155 GLU CB HB3 sing N N 156 GLU CG CD sing N N 157 GLU CG HG2 sing N N 158 GLU CG HG3 sing N N 159 GLU CD OE1 doub N N 160 GLU CD OE2 sing N N 161 GLU OE2 HE2 sing N N 162 GLU OXT HXT sing N N 163 GLY N CA sing N N 164 GLY N H sing N N 165 GLY N H2 sing N N 166 GLY CA C sing N N 167 GLY CA HA2 sing N N 168 GLY CA HA3 sing N N 169 GLY C O doub N N 170 GLY C OXT sing N N 171 GLY OXT HXT sing N N 172 HIS N CA sing N N 173 HIS N H sing N N 174 HIS N H2 sing N N 175 HIS CA C sing N N 176 HIS CA CB sing N N 177 HIS CA HA sing N N 178 HIS C O doub N N 179 HIS C OXT sing N N 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