data_6CDI # _entry.id 6CDI # _audit_conform.dict_name mmcif_pdbx.dic _audit_conform.dict_version 5.329 _audit_conform.dict_location http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic # loop_ _database_2.database_id _database_2.database_code PDB 6CDI WWPDB D_1000232577 EMDB EMD-7460 # _pdbx_database_related.db_name EMDB _pdbx_database_related.details ;Cryo-EM structure at 3.6 A resolution of vaccine-elicited antibody vFP16.02 in complex with HIV-1 Env BG505 DS-SOSIP, and antibodies VRC03 and PGT122 ; _pdbx_database_related.db_id EMD-7460 _pdbx_database_related.content_type 'associated EM volume' # _pdbx_database_status.status_code REL _pdbx_database_status.status_code_sf ? _pdbx_database_status.status_code_mr ? _pdbx_database_status.entry_id 6CDI _pdbx_database_status.recvd_initial_deposition_date 2018-02-08 _pdbx_database_status.SG_entry N _pdbx_database_status.deposit_site RCSB _pdbx_database_status.process_site RCSB _pdbx_database_status.status_code_cs ? _pdbx_database_status.methods_development_category ? _pdbx_database_status.pdb_format_compatible N _pdbx_database_status.status_code_nmr_data ? # loop_ _audit_author.name _audit_author.pdbx_ordinal _audit_author.identifier_ORCID 'Acharya, P.' 1 ? 'Xu, K.' 2 ? 'Liu, K.' 3 ? 'Carragher, B.' 4 ? 'Potter, C.S.' 5 ? 'Kwong, P.D.' 6 ? # _citation.abstract ? _citation.abstract_id_CAS ? _citation.book_id_ISBN ? _citation.book_publisher ? _citation.book_publisher_city ? _citation.book_title ? _citation.coordinate_linkage ? _citation.country ? _citation.database_id_Medline ? _citation.details ? _citation.id primary _citation.journal_abbrev 'Nat. 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'Asokan, M.' 14 ? primary 'Bailer, R.T.' 15 ? primary 'Chambers, M.' 16 ? primary 'Chen, X.' 17 ? primary 'Choi, C.W.' 18 ? primary 'Dandey, V.P.' 19 ? primary 'Doria-Rose, N.A.' 20 ? primary 'Druz, A.' 21 ? primary 'Eng, E.T.' 22 ? primary 'Farney, S.K.' 23 ? primary 'Foulds, K.E.' 24 ? primary 'Geng, H.' 25 ? primary 'Georgiev, I.S.' 26 ? primary 'Gorman, J.' 27 ? primary 'Hill, K.R.' 28 ? primary 'Jafari, A.J.' 29 ? primary 'Kwon, Y.D.' 30 ? primary 'Lai, Y.T.' 31 ? primary 'Lemmin, T.' 32 ? primary 'McKee, K.' 33 ? primary 'Ohr, T.Y.' 34 ? primary 'Ou, L.' 35 ? primary 'Peng, D.' 36 ? primary 'Rowshan, A.P.' 37 ? primary 'Sheng, Z.' 38 ? primary 'Todd, J.P.' 39 ? primary 'Tsybovsky, Y.' 40 ? primary 'Viox, E.G.' 41 ? primary 'Wang, Y.' 42 ? primary 'Wei, H.' 43 ? primary 'Yang, Y.' 44 ? primary 'Zhou, A.F.' 45 ? primary 'Chen, R.' 46 ? primary 'Yang, L.' 47 ? primary 'Scorpio, D.G.' 48 ? primary 'McDermott, A.B.' 49 ? primary 'Shapiro, L.' 50 ? primary 'Carragher, B.' 51 ? primary 'Potter, C.S.' 52 ? primary 'Mascola, J.R.' 53 ? primary 'Kwong, P.D.' 54 ? # loop_ _entity.id _entity.type _entity.src_method _entity.pdbx_description _entity.formula_weight _entity.pdbx_number_of_molecules _entity.pdbx_ec _entity.pdbx_mutation _entity.pdbx_fragment _entity.details 1 polymer man 'Glycoprotein gp41' 17162.525 3 ? ? ? ? 2 polymer man 'Glycoprotein 120' 52986.969 3 ? ? ? ? 3 polymer man 'PGT122 Light Chain' 11591.728 3 ? ? ? ? 4 polymer man 'PGT122 Heavy Chain' 14838.731 3 ? ? ? ? 5 polymer man 'VRC03 light chain' 11386.774 3 ? ? ? ? 6 polymer man 'VRC03 Heavy Chain' 24653.771 3 ? ? ? ? 7 polymer man 'vFP16.02 Heavy Chain' 22455.230 3 ? ? ? ? 8 polymer man 'vFP16.02 Light Chain' 23752.521 3 ? ? ? ? 9 branched man 'beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose' 586.542 9 ? ? ? ? 10 branched man 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;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1072.964 3 ? ? ? ? 16 branched man ;alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-2)-alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-3)-[alpha-D-mannopyranose-(1-6)]alpha-D-mannopyranose-(1-6)]beta-D-mannopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ; 1559.386 3 ? ? ? ? 17 non-polymer man 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose 221.208 6 ? ? ? ? # loop_ _entity_poly.entity_id _entity_poly.type _entity_poly.nstd_linkage _entity_poly.nstd_monomer _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code _entity_poly.pdbx_seq_one_letter_code_can _entity_poly.pdbx_strand_id _entity_poly.pdbx_target_identifier 1 'polypeptide(L)' no no ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAIEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; ;AVGIGAVFLGFLGAAGSTMGAASMTLTVQARNLLSGIVQQQSNLLRAIEAQQHLLKLTVWGIKQLQARVLAVERYLRDQQ LLGIWGCSGKLICCTNVPWNSSWSNRNLSEIWDNMTWLQWDKEISNYTQIIYGLLEESQNQQEKNEQDLLALD ; c,A,D ? 2 'polypeptide(L)' no no ;AENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIIS LWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKE YRLINCNTSACTQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEV MIRSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQAFYATGDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRK HFGNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQ CMYAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRV ; ;AENLWVTVYYGVPVWKDAETTLFCASDAKAYETEKHNVWATHACVPTDPNPQEIHLENVTEEFNMWKNNMVEQMHTDIIS LWDQSLKPCVKLTPLCVTLQCTNVTNNITDDMRGELKNCSFNMTTELRDKKQKVYSLFYRLDVVQINENQGNRSNNSNKE YRLINCNTSACTQACPKVSFEPIPIHYCAPAGFAILKCKDKKFNGTGPCPSVSTVQCTHGIKPVVSTQLLLNGSLAEEEV MIRSENITNNAKNILVQFNTPVQINCTRPNNNTRKSIRIGPGQAFYATGDIIGDIRQAHCNVSKATWNETLGKVVKQLRK HFGNNTIIRFANSSGGDLEVTTHSFNCGGEFFYCNTSGLFNSTWISNTSVQGSNSTGSNDSITLPCRIKQIINMWQRIGQ CMYAPPIQGVIRCVSNITGLILTRDGGSTNSTTETFRPGGGDMRDNWRSELYKYKVVKIEPLGVAPTRCKRRV ; d,2,C ? 3 'polypeptide(L)' no no ;APTFVSVAPGQTARITCGEESLGSRSVIWYQQRPGQAPSLIIYNNNDRPSGIPDRFSGSPGSTFGTTATLTITSVEAGDE ADYYCHIWDSRRPTNWVFGEGTTLIVL ; ;APTFVSVAPGQTARITCGEESLGSRSVIWYQQRPGQAPSLIIYNNNDRPSGIPDRFSGSPGSTFGTTATLTITSVEAGDE ADYYCHIWDSRRPTNWVFGEGTTLIVL ; n,6,N ? 4 'polypeptide(L)' no no ;QVHLQESGPGLVKPSETLSLTCNVSGTLVRDNYWSWIRQPLGKQPEWIGYVHDSGDTNYNPSLKSRVHLSLDKSKNLVSL RLTGVTAADSAIYYCATTKHGRRIYGVVAFKEWFTYFYMDVWGKGTSVTVSS ; ;QVHLQESGPGLVKPSETLSLTCNVSGTLVRDNYWSWIRQPLGKQPEWIGYVHDSGDTNYNPSLKSRVHLSLDKSKNLVSL RLTGVTAADSAIYYCATTKHGRRIYGVVAFKEWFTYFYMDVWGKGTSVTVSS ; m,5,M ? 5 'polypeptide(L)' no no ;EIVLTQSPGILSLSPGETATLFCKASQGGNAMTWYQKRRGQVPRLLIYDTSRRASGVPDRFVGSGSGTDFFLTINKLDRE DFAVYYCQQFEFFGLGSELEVH ; ;EIVLTQSPGILSLSPGETATLFCKASQGGNAMTWYQKRRGQVPRLLIYDTSRRASGVPDRFVGSGSGTDFFLTINKLDRE DFAVYYCQQFEFFGLGSELEVH ; r,7,R ? 6 'polypeptide(L)' no no ;QVQLVQSGAVIKTPGSSVKISCRASGYNFRDYSIHWVRLIPDKGFEWIGWIKPLWGAVSYARQLQGRVSMTRQLSQDPDD PDWGVAYMEFSGLTPADTAEYFCVRRGSCDYCGDFPWQYWGQGTVVVVSSASTKGPSVFPLAPSSGGTAALGCLVKDYFP EPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPK ; ;QVQLVQSGAVIKTPGSSVKISCRASGYNFRDYSIHWVRLIPDKGFEWIGWIKPLWGAVSYARQLQGRVSMTRQLSQDPDD PDWGVAYMEFSGLTPADTAEYFCVRRGSCDYCGDFPWQYWGQGTVVVVSSASTKGPSVFPLAPSSGGTAALGCLVKDYFP EPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPK ; q,8,Q ? 7 'polypeptide(L)' no no ;QVQLLQSGAELVRPGASVTLSCKASGYAFSDYEIHWVKQTPVRGLDWIGAFDPKSGASASNQKVKGRAILTADKSSSTAY MELRSLTSEDSAVYYCTRLRYFGYFDVWGTGTTVTVSPASTKGPSVFPLAPGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSG VHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKAEP ; ;QVQLLQSGAELVRPGASVTLSCKASGYAFSDYEIHWVKQTPVRGLDWIGAFDPKSGASASNQKVKGRAILTADKSSSTAY MELRSLTSEDSAVYYCTRLRYFGYFDVWGTGTTVTVSPASTKGPSVFPLAPGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSG VHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKAEP ; h,3,H ? 8 'polypeptide(L)' no no ;DVLMTQTPLSLPVSLGGQASISCRSSQSVVYSDGDTYLEWYLQKPGQSPKLLIYKVSRRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKI SRVETEDLGVYYCFQGSHVPYTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQ SGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNR ; ;DVLMTQTPLSLPVSLGGQASISCRSSQSVVYSDGDTYLEWYLQKPGQSPKLLIYKVSRRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKI SRVETEDLGVYYCFQGSHVPYTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQ SGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNR ; l,4,L ? # loop_ _entity_poly_seq.entity_id _entity_poly_seq.num _entity_poly_seq.mon_id _entity_poly_seq.hetero 1 1 ALA n 1 2 VAL n 1 3 GLY n 1 4 ILE n 1 5 GLY n 1 6 ALA n 1 7 VAL n 1 8 PHE n 1 9 LEU n 1 10 GLY n 1 11 PHE n 1 12 LEU n 1 13 GLY n 1 14 ALA n 1 15 ALA n 1 16 GLY n 1 17 SER n 1 18 THR n 1 19 MET n 1 20 GLY n 1 21 ALA n 1 22 ALA n 1 23 SER n 1 24 MET n 1 25 THR n 1 26 LEU n 1 27 THR n 1 28 VAL n 1 29 GLN n 1 30 ALA n 1 31 ARG n 1 32 ASN n 1 33 LEU n 1 34 LEU n 1 35 SER n 1 36 GLY n 1 37 ILE n 1 38 VAL n 1 39 GLN n 1 40 GLN n 1 41 GLN n 1 42 SER n 1 43 ASN n 1 44 LEU n 1 45 LEU n 1 46 ARG n 1 47 ALA n 1 48 ILE n 1 49 GLU n 1 50 ALA n 1 51 GLN n 1 52 GLN n 1 53 HIS n 1 54 LEU n 1 55 LEU n 1 56 LYS n 1 57 LEU n 1 58 THR n 1 59 VAL n 1 60 TRP n 1 61 GLY n 1 62 ILE n 1 63 LYS n 1 64 GLN n 1 65 LEU n 1 66 GLN n 1 67 ALA n 1 68 ARG n 1 69 VAL n 1 70 LEU n 1 71 ALA n 1 72 VAL n 1 73 GLU n 1 74 ARG n 1 75 TYR n 1 76 LEU n 1 77 ARG n 1 78 ASP n 1 79 GLN n 1 80 GLN n 1 81 LEU n 1 82 LEU n 1 83 GLY n 1 84 ILE n 1 85 TRP n 1 86 GLY n 1 87 CYS n 1 88 SER n 1 89 GLY n 1 90 LYS n 1 91 LEU n 1 92 ILE n 1 93 CYS n 1 94 CYS n 1 95 THR n 1 96 ASN n 1 97 VAL n 1 98 PRO n 1 99 TRP n 1 100 ASN n 1 101 SER n 1 102 SER n 1 103 TRP n 1 104 SER n 1 105 ASN n 1 106 ARG n 1 107 ASN n 1 108 LEU n 1 109 SER n 1 110 GLU n 1 111 ILE n 1 112 TRP n 1 113 ASP n 1 114 ASN n 1 115 MET n 1 116 THR n 1 117 TRP n 1 118 LEU n 1 119 GLN n 1 120 TRP n 1 121 ASP n 1 122 LYS n 1 123 GLU n 1 124 ILE n 1 125 SER n 1 126 ASN n 1 127 TYR n 1 128 THR n 1 129 GLN n 1 130 ILE n 1 131 ILE n 1 132 TYR n 1 133 GLY n 1 134 LEU n 1 135 LEU n 1 136 GLU n 1 137 GLU n 1 138 SER n 1 139 GLN n 1 140 ASN n 1 141 GLN n 1 142 GLN n 1 143 GLU n 1 144 LYS n 1 145 ASN n 1 146 GLU n 1 147 GLN n 1 148 ASP n 1 149 LEU n 1 150 LEU n 1 151 ALA n 1 152 LEU n 1 153 ASP n 2 1 ALA n 2 2 GLU n 2 3 ASN n 2 4 LEU n 2 5 TRP n 2 6 VAL n 2 7 THR n 2 8 VAL n 2 9 TYR n 2 10 TYR n 2 11 GLY n 2 12 VAL n 2 13 PRO n 2 14 VAL n 2 15 TRP n 2 16 LYS n 2 17 ASP n 2 18 ALA n 2 19 GLU n 2 20 THR n 2 21 THR n 2 22 LEU n 2 23 PHE n 2 24 CYS n 2 25 ALA n 2 26 SER n 2 27 ASP n 2 28 ALA n 2 29 LYS n 2 30 ALA n 2 31 TYR n 2 32 GLU n 2 33 THR n 2 34 GLU n 2 35 LYS n 2 36 HIS n 2 37 ASN n 2 38 VAL n 2 39 TRP n 2 40 ALA n 2 41 THR n 2 42 HIS n 2 43 ALA n 2 44 CYS n 2 45 VAL n 2 46 PRO n 2 47 THR n 2 48 ASP n 2 49 PRO n 2 50 ASN n 2 51 PRO 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Q2N0S7 509 ? 661 ? 512 664 19 3 6CDI L 1 ? 216 ? 6CDI 1 ? 211 ? 1 211 20 4 6CDI H 1 ? 211 ? 6CDI 1 ? 206 ? 1 206 21 5 6CDI R 1 ? 102 ? 6CDI 1 ? 102 ? 1 102 22 6 6CDI Q 1 ? 227 ? 6CDI 1 ? 210 ? 1 210 23 7 6CDI N 1 ? 107 ? 6CDI 6 ? 107 ? 6 107 24 8 6CDI M 1 ? 132 ? 6CDI 1 ? 111 ? 1 111 # loop_ _struct_ref_seq_dif.align_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_id_code _struct_ref_seq_dif.mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_strand_id _struct_ref_seq_dif.seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_pdb_ins_code _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_name _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_accession_code _struct_ref_seq_dif.db_mon_id _struct_ref_seq_dif.pdbx_seq_db_seq_num _struct_ref_seq_dif.details _struct_ref_seq_dif.pdbx_auth_seq_num _struct_ref_seq_dif.pdbx_ordinal 1 6CDI CYS d 171 ? UNP Q2N0S5 ILE 200 conflict 201 1 1 6CDI ASN d 301 ? UNP Q2N0S5 THR 330 conflict 332 2 1 6CDI CYS d 401 ? UNP Q2N0S5 ALA 430 conflict 433 3 1 6CDI CYS d 469 ? UNP Q2N0S5 ALA 498 conflict 501 4 2 6CDI CYS c 94 ? UNP Q2N0S7 THR 602 conflict 605 5 9 6CDI CYS 2 171 ? UNP Q2N0S5 ILE 200 conflict 201 6 9 6CDI ASN 2 301 ? UNP Q2N0S5 THR 330 conflict 332 7 9 6CDI CYS 2 401 ? UNP Q2N0S5 ALA 430 conflict 433 8 9 6CDI CYS 2 469 ? UNP Q2N0S5 ALA 498 conflict 501 9 10 6CDI CYS A 94 ? UNP Q2N0S7 THR 602 conflict 605 10 17 6CDI CYS C 171 ? UNP Q2N0S5 ILE 200 conflict 201 11 17 6CDI ASN C 301 ? UNP Q2N0S5 THR 330 conflict 332 12 17 6CDI CYS C 401 ? UNP Q2N0S5 ALA 430 conflict 433 13 17 6CDI CYS C 469 ? UNP Q2N0S5 ALA 498 conflict 501 14 18 6CDI CYS D 94 ? UNP Q2N0S7 THR 602 conflict 605 15 # loop_ _chem_comp.id _chem_comp.type _chem_comp.mon_nstd_flag _chem_comp.name _chem_comp.pdbx_synonyms _chem_comp.formula _chem_comp.formula_weight ALA 'L-peptide linking' y ALANINE ? 'C3 H7 N O2' 89.093 ARG 'L-peptide linking' y ARGININE ? 'C6 H15 N4 O2 1' 175.209 ASN 'L-peptide linking' y ASPARAGINE ? 'C4 H8 N2 O3' 132.118 ASP 'L-peptide linking' y 'ASPARTIC ACID' ? 'C4 H7 N O4' 133.103 BMA 'D-saccharide, beta linking' . beta-D-mannopyranose ? 'C6 H12 O6' 180.156 CYS 'L-peptide linking' y CYSTEINE ? 'C3 H7 N O2 S' 121.158 GLN 'L-peptide linking' y GLUTAMINE ? 'C5 H10 N2 O3' 146.144 GLU 'L-peptide linking' y 'GLUTAMIC ACID' ? 'C5 H9 N O4' 147.129 GLY 'peptide linking' y GLYCINE ? 'C2 H5 N O2' 75.067 HIS 'L-peptide linking' y HISTIDINE ? 'C6 H10 N3 O2 1' 156.162 ILE 'L-peptide linking' y ISOLEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LEU 'L-peptide linking' y LEUCINE ? 'C6 H13 N O2' 131.173 LYS 'L-peptide linking' y LYSINE ? 'C6 H15 N2 O2 1' 147.195 MAN 'D-saccharide, alpha linking' . alpha-D-mannopyranose ? 'C6 H12 O6' 180.156 MET 'L-peptide linking' y METHIONINE ? 'C5 H11 N O2 S' 149.211 NAG 'D-saccharide, beta linking' . 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose ? 'C8 H15 N O6' 221.208 PHE 'L-peptide linking' y PHENYLALANINE ? 'C9 H11 N O2' 165.189 PRO 'L-peptide linking' y PROLINE ? 'C5 H9 N O2' 115.130 SER 'L-peptide linking' y SERINE ? 'C3 H7 N O3' 105.093 THR 'L-peptide linking' y THREONINE ? 'C4 H9 N O3' 119.119 TRP 'L-peptide linking' y TRYPTOPHAN ? 'C11 H12 N2 O2' 204.225 TYR 'L-peptide linking' y TYROSINE ? 'C9 H11 N O3' 181.189 VAL 'L-peptide linking' y VALINE ? 'C5 H11 N O2' 117.146 # _exptl.absorpt_coefficient_mu ? _exptl.absorpt_correction_T_max ? _exptl.absorpt_correction_T_min ? _exptl.absorpt_correction_type ? _exptl.absorpt_process_details ? _exptl.entry_id 6CDI _exptl.crystals_number ? _exptl.details ? _exptl.method 'ELECTRON MICROSCOPY' _exptl.method_details ? # _struct.entry_id 6CDI _struct.title ;Cryo-EM structure at 3.6 A resolution of vaccine-elicited antibody vFP16.02 in complex with HIV-1 Env BG505 DS-SOSIP, and antibodies VRC03 and PGT122 ; _struct.pdbx_descriptor ;VRC03 Heavy Chain, VRC03 light chain, PGT122 Heavy Chain, PGT122 Light Chain, Glycoprotein 120, Glycoprotein gp41, vFP16.02 Heavy Chain, vFP16.02 Light Chain ; _struct.pdbx_model_details ? _struct.pdbx_formula_weight ? _struct.pdbx_formula_weight_method ? _struct.pdbx_model_type_details ? _struct.pdbx_CASP_flag N # _struct_keywords.entry_id 6CDI _struct_keywords.text 'HIV-1 Env, BG505 SOSIP, fusion peptide, VRC03, PGT122, vFP16.02, VIRAL PROTEIN' _struct_keywords.pdbx_keywords 'VIRAL PROTEIN' # loop_ _struct_asym.id _struct_asym.pdbx_blank_PDB_chainid_flag _struct_asym.pdbx_modified _struct_asym.entity_id _struct_asym.details A N N 1 ? B N N 2 ? C N N 3 ? D N N 4 ? E N N 5 ? F N N 6 ? G N N 7 ? H N N 8 ? I N N 1 ? J N N 2 ? K N N 3 ? L N N 4 ? M N N 5 ? N N N 6 ? O N N 7 ? P N N 8 ? Q N N 1 ? R N N 2 ? S N N 3 ? T N N 4 ? U N N 5 ? V N N 6 ? W N N 7 ? X N N 8 ? Y N N 9 ? Z N N 10 ? AA N N 11 ? BA N N 10 ? CA N N 12 ? DA N N 13 ? EA N N 14 ? FA N N 9 ? GA N N 15 ? HA N N 11 ? IA N N 11 ? JA N N 9 ? KA N N 12 ? LA N N 11 ? MA N N 16 ? NA N N 11 ? OA N N 10 ? PA N N 9 ? QA N N 10 ? RA N N 11 ? SA N N 10 ? TA N N 12 ? UA N N 13 ? VA N N 14 ? WA N N 9 ? XA N N 15 ? YA N N 11 ? ZA N N 11 ? AB N N 9 ? BB N N 12 ? CB N N 11 ? DB N N 16 ? EB N N 11 ? FB N N 10 ? GB N N 9 ? HB N N 10 ? IB N N 11 ? JB N N 10 ? KB N N 12 ? LB N N 13 ? MB N N 14 ? NB N N 9 ? OB N N 15 ? PB N N 11 ? QB N N 11 ? RB N N 9 ? SB N N 12 ? TB N N 11 ? UB N N 16 ? VB N N 11 ? WB N N 10 ? XB N N 17 ? YB N N 17 ? ZB N N 17 ? AC N N 17 ? BC N N 17 ? CC N N 17 ? # loop_ _struct_conf.conf_type_id _struct_conf.id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_id _struct_conf.beg_label_comp_id _struct_conf.beg_label_asym_id _struct_conf.beg_label_seq_id _struct_conf.pdbx_beg_PDB_ins_code _struct_conf.end_label_comp_id _struct_conf.end_label_asym_id _struct_conf.end_label_seq_id _struct_conf.pdbx_end_PDB_ins_code _struct_conf.beg_auth_comp_id _struct_conf.beg_auth_asym_id _struct_conf.beg_auth_seq_id _struct_conf.end_auth_comp_id _struct_conf.end_auth_asym_id _struct_conf.end_auth_seq_id _struct_conf.pdbx_PDB_helix_class _struct_conf.details _struct_conf.pdbx_PDB_helix_length HELX_P HELX_P1 AA1 GLY A 3 ? LEU A 9 ? GLY c 514 LEU c 520 1 ? 7 HELX_P HELX_P2 AA2 THR A 18 ? SER A 23 ? THR c 529 SER c 534 1 ? 6 HELX_P HELX_P3 AA3 LEU A 26 ? ASN A 32 ? LEU c 537 ASN c 543 1 ? 7 HELX_P HELX_P4 AA4 VAL A 59 ? ILE A 84 ? VAL c 570 ILE c 595 1 ? 26 HELX_P HELX_P5 AA5 ASN A 107 ? TRP A 112 ? ASN c 618 TRP c 623 1 ? 6 HELX_P HELX_P6 AA6 THR A 116 ? SER A 125 ? THR c 627 SER c 636 1 ? 10 HELX_P HELX_P7 AA7 GLN A 129 ? ASP A 153 ? GLN c 640 ASP c 664 1 ? 25 HELX_P HELX_P8 AA8 ASP B 27 ? THR B 33 ? ASP d 57 THR d 63 1 ? 7 HELX_P HELX_P9 AA9 VAL B 71 ? SER B 85 ? VAL d 101 SER d 115 1 ? 15 HELX_P HELX_P10 AB1 LEU B 92 ? CYS B 96 ? LEU d 122 CYS d 126 5 ? 5 HELX_P HELX_P11 AB2 ASN B 165 ? THR B 168 ? ASN d 195 THR d 198 5 ? 4 HELX_P HELX_P12 AB3 LYS B 304 ? ARG B 319 ? LYS d 335 ARG d 350 1 ? 16 HELX_P HELX_P13 AB4 ASP B 337 ? THR B 342 ? ASP d 368 THR d 373 1 ? 6 HELX_P HELX_P14 AB5 MET B 443 ? SER B 449 ? MET d 475 SER d 481 1 ? 7 HELX_P HELX_P15 AB6 THR D 86 ? SER D 90 ? THR m 83 SER m 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P16 AB7 ASP E 78 ? PHE E 82 ? ASP r 78 PHE r 82 5 ? 5 HELX_P HELX_P17 AB8 ARG F 62 ? GLN F 65 ? ARG q 61 GLN q 64 5 ? 4 HELX_P HELX_P18 AB9 THR F 94 ? THR F 98 ? THR q 83 THR q 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P19 AC1 GLY I 3 ? LEU I 9 ? GLY A 514 LEU A 520 1 ? 7 HELX_P HELX_P20 AC2 THR I 18 ? SER I 23 ? THR A 529 SER A 534 1 ? 6 HELX_P HELX_P21 AC3 LEU I 26 ? ASN I 32 ? LEU A 537 ASN A 543 1 ? 7 HELX_P HELX_P22 AC4 VAL I 59 ? ILE I 84 ? VAL A 570 ILE A 595 1 ? 26 HELX_P HELX_P23 AC5 ASN I 107 ? TRP I 112 ? ASN A 618 TRP A 623 1 ? 6 HELX_P HELX_P24 AC6 THR I 116 ? SER I 125 ? THR A 627 SER A 636 1 ? 10 HELX_P HELX_P25 AC7 GLN I 129 ? ASP I 153 ? GLN A 640 ASP A 664 1 ? 25 HELX_P HELX_P26 AC8 ASP J 27 ? THR J 33 ? ASP 2 57 THR 2 63 1 ? 7 HELX_P HELX_P27 AC9 VAL J 71 ? SER J 85 ? VAL 2 101 SER 2 115 1 ? 15 HELX_P HELX_P28 AD1 LEU J 92 ? CYS J 96 ? LEU 2 122 CYS 2 126 5 ? 5 HELX_P HELX_P29 AD2 ASN J 165 ? THR J 168 ? ASN 2 195 THR 2 198 5 ? 4 HELX_P HELX_P30 AD3 LYS J 304 ? ARG J 319 ? LYS 2 335 ARG 2 350 1 ? 16 HELX_P HELX_P31 AD4 ASP J 337 ? THR J 342 ? ASP 2 368 THR 2 373 1 ? 6 HELX_P HELX_P32 AD5 MET J 443 ? SER J 449 ? MET 2 475 SER 2 481 1 ? 7 HELX_P HELX_P33 AD6 THR L 86 ? SER L 90 ? THR 5 83 SER 5 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P34 AD7 ASP M 78 ? PHE M 82 ? ASP 7 78 PHE 7 82 5 ? 5 HELX_P HELX_P35 AD8 ARG N 62 ? GLN N 65 ? ARG 8 61 GLN 8 64 5 ? 4 HELX_P HELX_P36 AD9 THR N 94 ? THR N 98 ? THR 8 83 THR 8 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P37 AE1 GLY Q 3 ? LEU Q 9 ? GLY D 514 LEU D 520 1 ? 7 HELX_P HELX_P38 AE2 THR Q 18 ? SER Q 23 ? THR D 529 SER D 534 1 ? 6 HELX_P HELX_P39 AE3 LEU Q 26 ? ASN Q 32 ? LEU D 537 ASN D 543 1 ? 7 HELX_P HELX_P40 AE4 VAL Q 59 ? ILE Q 84 ? VAL D 570 ILE D 595 1 ? 26 HELX_P HELX_P41 AE5 ASN Q 107 ? TRP Q 112 ? ASN D 618 TRP D 623 1 ? 6 HELX_P HELX_P42 AE6 THR Q 116 ? SER Q 125 ? THR D 627 SER D 636 1 ? 10 HELX_P HELX_P43 AE7 GLN Q 129 ? ASP Q 153 ? GLN D 640 ASP D 664 1 ? 25 HELX_P HELX_P44 AE8 ASP R 27 ? THR R 33 ? ASP C 57 THR C 63 1 ? 7 HELX_P HELX_P45 AE9 VAL R 71 ? SER R 85 ? VAL C 101 SER C 115 1 ? 15 HELX_P HELX_P46 AF1 LEU R 92 ? CYS R 96 ? LEU C 122 CYS C 126 5 ? 5 HELX_P HELX_P47 AF2 ASN R 165 ? THR R 168 ? ASN C 195 THR C 198 5 ? 4 HELX_P HELX_P48 AF3 LYS R 304 ? ARG R 319 ? LYS C 335 ARG C 350 1 ? 16 HELX_P HELX_P49 AF4 ASP R 337 ? THR R 342 ? ASP C 368 THR C 373 1 ? 6 HELX_P HELX_P50 AF5 MET R 443 ? SER R 449 ? MET C 475 SER C 481 1 ? 7 HELX_P HELX_P51 AF6 THR T 86 ? SER T 90 ? THR M 83 SER M 87 5 ? 5 HELX_P HELX_P52 AF7 ASP U 78 ? PHE U 82 ? ASP R 78 PHE R 82 5 ? 5 HELX_P HELX_P53 AF8 ARG V 62 ? GLN V 65 ? ARG Q 61 GLN Q 64 5 ? 4 HELX_P HELX_P54 AF9 THR V 94 ? THR V 98 ? THR Q 83 THR Q 87 5 ? 5 # _struct_conf_type.id HELX_P _struct_conf_type.criteria ? _struct_conf_type.reference ? # loop_ _struct_conn.id _struct_conn.conn_type_id _struct_conn.pdbx_leaving_atom_flag _struct_conn.pdbx_PDB_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_comp_id _struct_conn.ptnr1_label_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr1_PDB_ins_code _struct_conn.pdbx_ptnr1_standard_comp_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_comp_id _struct_conn.ptnr2_label_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr2_PDB_ins_code _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_comp_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_comp_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_atom_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_seq_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_comp_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_asym_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_label_alt_id _struct_conn.pdbx_ptnr3_PDB_ins_code _struct_conn.details _struct_conn.pdbx_dist_value _struct_conn.pdbx_value_order _struct_conn.pdbx_role disulf1 disulf ? ? A CYS 87 SG ? ? ? 1_555 A CYS 93 SG ? ? c CYS 598 c CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf2 disulf ? ? B CYS 24 SG ? ? ? 1_555 B CYS 44 SG ? ? d CYS 54 d CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf3 disulf ? ? B CYS 89 SG ? ? ? 1_555 B CYS 175 SG ? ? d CYS 119 d CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf4 disulf ? ? B CYS 96 SG ? ? ? 1_555 B CYS 166 SG ? ? d CYS 126 d CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf5 disulf ? ? B CYS 101 SG ? ? ? 1_555 B CYS 119 SG ? ? d CYS 131 d CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf6 disulf ? ? B CYS 171 SG ? ? ? 1_555 B CYS 401 SG ? ? d CYS 201 d CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.037 ? ? disulf7 disulf ? ? B CYS 188 SG ? ? ? 1_555 B CYS 217 SG ? ? d CYS 218 d CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf8 disulf ? ? B CYS 198 SG ? ? ? 1_555 B CYS 209 SG ? ? d CYS 228 d CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf9 disulf ? ? B CYS 266 SG ? ? ? 1_555 B CYS 300 SG ? ? d CYS 296 d CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf10 disulf ? ? B CYS 347 SG ? ? ? 1_555 B CYS 413 SG ? ? d CYS 378 d CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf11 disulf ? ? B CYS 354 SG ? ? ? 1_555 B CYS 386 SG ? ? d CYS 385 d CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf12 disulf ? ? C CYS 17 SG ? ? ? 1_555 C CYS 85 SG ? ? n CYS 23 n CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf13 disulf ? ? D CYS 22 SG ? ? ? 1_555 D CYS 95 SG ? ? m CYS 22 m CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf14 disulf ? ? F CYS 22 SG ? ? ? 1_555 F CYS 103 SG ? ? q CYS 22 q CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf15 disulf ? ? F CYS 109 SG ? ? ? 1_555 F CYS 112 SG ? A q CYS 98 q CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf16 disulf ? ? G CYS 22 SG ? ? ? 1_555 G CYS 96 SG ? ? h CYS 22 h CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf17 disulf ? ? H CYS 23 SG ? ? ? 1_555 H CYS 93 SG ? ? l CYS 23 l CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf18 disulf ? ? I CYS 87 SG ? ? ? 1_555 I CYS 93 SG ? ? A CYS 598 A CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf19 disulf ? ? J CYS 24 SG ? ? ? 1_555 J CYS 44 SG ? ? 2 CYS 54 2 CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.034 ? ? disulf20 disulf ? ? J CYS 89 SG ? ? ? 1_555 J CYS 175 SG ? ? 2 CYS 119 2 CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf21 disulf ? ? J CYS 96 SG ? ? ? 1_555 J CYS 166 SG ? ? 2 CYS 126 2 CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf22 disulf ? ? J CYS 101 SG ? ? ? 1_555 J CYS 119 SG ? ? 2 CYS 131 2 CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf23 disulf ? ? J CYS 171 SG ? ? ? 1_555 J CYS 401 SG ? ? 2 CYS 201 2 CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf24 disulf ? ? J CYS 188 SG ? ? ? 1_555 J CYS 217 SG ? ? 2 CYS 218 2 CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf25 disulf ? ? J CYS 198 SG ? ? ? 1_555 J CYS 209 SG ? ? 2 CYS 228 2 CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf26 disulf ? ? J CYS 266 SG ? ? ? 1_555 J CYS 300 SG ? ? 2 CYS 296 2 CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf27 disulf ? ? J CYS 347 SG ? ? ? 1_555 J CYS 413 SG ? ? 2 CYS 378 2 CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf28 disulf ? ? J CYS 354 SG ? ? ? 1_555 J CYS 386 SG ? ? 2 CYS 385 2 CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf29 disulf ? ? K CYS 17 SG ? ? ? 1_555 K CYS 85 SG ? ? 6 CYS 23 6 CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf30 disulf ? ? L CYS 22 SG ? ? ? 1_555 L CYS 95 SG ? ? 5 CYS 22 5 CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf31 disulf ? ? N CYS 22 SG ? ? ? 1_555 N CYS 103 SG ? ? 8 CYS 22 8 CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf32 disulf ? ? N CYS 109 SG ? ? ? 1_555 N CYS 112 SG ? A 8 CYS 98 8 CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf33 disulf ? ? O CYS 22 SG ? ? ? 1_555 O CYS 96 SG ? ? 3 CYS 22 3 CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf34 disulf ? ? P CYS 23 SG ? ? ? 1_555 P CYS 93 SG ? ? 4 CYS 23 4 CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf35 disulf ? ? Q CYS 87 SG ? ? ? 1_555 Q CYS 93 SG ? ? D CYS 598 D CYS 604 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.020 ? ? disulf36 disulf ? ? R CYS 24 SG ? ? ? 1_555 R CYS 44 SG ? ? C CYS 54 C CYS 74 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.033 ? ? disulf37 disulf ? ? R CYS 89 SG ? ? ? 1_555 R CYS 175 SG ? ? C CYS 119 C CYS 205 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf38 disulf ? ? R CYS 96 SG ? ? ? 1_555 R CYS 166 SG ? ? C CYS 126 C CYS 196 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.022 ? ? disulf39 disulf ? ? R CYS 101 SG ? ? ? 1_555 R CYS 119 SG ? ? C CYS 131 C CYS 157 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.024 ? ? disulf40 disulf ? ? R CYS 171 SG ? ? ? 1_555 R CYS 401 SG ? ? C CYS 201 C CYS 433 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.036 ? ? disulf41 disulf ? ? R CYS 188 SG ? ? ? 1_555 R CYS 217 SG ? ? C CYS 218 C CYS 247 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf42 disulf ? ? R CYS 198 SG ? ? ? 1_555 R CYS 209 SG ? ? C CYS 228 C CYS 239 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf43 disulf ? ? R CYS 266 SG ? ? ? 1_555 R CYS 300 SG ? ? C CYS 296 C CYS 331 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.023 ? ? disulf44 disulf ? ? R CYS 347 SG ? ? ? 1_555 R CYS 413 SG ? ? C CYS 378 C CYS 445 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.026 ? ? disulf45 disulf ? ? R CYS 354 SG ? ? ? 1_555 R CYS 386 SG ? ? C CYS 385 C CYS 418 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? disulf46 disulf ? ? S CYS 17 SG ? ? ? 1_555 S CYS 85 SG ? ? N CYS 23 N CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.030 ? ? disulf47 disulf ? ? T CYS 22 SG ? ? ? 1_555 T CYS 95 SG ? ? M CYS 22 M CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.032 ? ? disulf48 disulf ? ? V CYS 22 SG ? ? ? 1_555 V CYS 103 SG ? ? Q CYS 22 Q CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf49 disulf ? ? V CYS 109 SG ? ? ? 1_555 V CYS 112 SG ? A Q CYS 98 Q CYS 100 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.027 ? ? disulf50 disulf ? ? W CYS 22 SG ? ? ? 1_555 W CYS 96 SG ? ? H CYS 22 H CYS 92 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.031 ? ? disulf51 disulf ? ? X CYS 23 SG ? ? ? 1_555 X CYS 93 SG ? ? L CYS 23 L CYS 88 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 2.028 ? ? covale1 covale one ? A ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? c ASN 611 B NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? N-Glycosylation covale2 covale one ? A ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 XB NAG . C1 ? ? c ASN 637 c NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale3 covale one ? B ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? d ASN 88 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale4 covale none ? B ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 Z NAG . O5 ? ? d ASN 88 E NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? ? covale5 covale one ? B ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? d ASN 133 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale6 covale none ? B ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 AA NAG . O5 ? ? d ASN 133 F NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? ? covale7 covale one ? B ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? d ASN 156 I NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.401 ? N-Glycosylation covale8 covale one ? B ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? d ASN 160 J NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? N-Glycosylation covale9 covale one ? B ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? d ASN 197 K NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? N-Glycosylation covale10 covale one ? B ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? d ASN 234 O NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale11 covale one ? B ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? d ASN 262 P NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.427 ? N-Glycosylation covale12 covale one ? B ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? d ASN 276 Z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? N-Glycosylation covale13 covale one ? B ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? d ASN 295 S NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.392 ? N-Glycosylation covale14 covale one ? B ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? d ASN 301 T NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? N-Glycosylation covale15 covale one ? B ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? d ASN 332 X NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.222 ? N-Glycosylation covale16 covale one ? B ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 YB NAG . C1 ? ? d ASN 355 d NAG 644 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale17 covale one ? B ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? d ASN 363 U NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? N-Glycosylation covale18 covale one ? B ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? d ASN 386 V NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale19 covale one ? B ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? d ASN 392 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.395 ? N-Glycosylation covale20 covale none ? B ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 LA NAG . O5 ? ? d ASN 392 W NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale21 covale one ? I ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? A ASN 611 a NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale22 covale one ? I ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 ZB NAG . C1 ? ? A ASN 637 A NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale23 covale one ? J ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? 2 ASN 88 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale24 covale none ? J ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 QA NAG . O5 ? ? 2 ASN 88 b NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? ? covale25 covale one ? J ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? 2 ASN 133 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.430 ? N-Glycosylation covale26 covale none ? J ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 RA NAG . O5 ? ? 2 ASN 133 e NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.397 ? ? covale27 covale one ? J ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? 2 ASN 156 g NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? N-Glycosylation covale28 covale one ? J ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? 2 ASN 160 i NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.465 ? N-Glycosylation covale29 covale one ? J ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? 2 ASN 197 j NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? N-Glycosylation covale30 covale one ? J ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? 2 ASN 234 k NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? N-Glycosylation covale31 covale one ? J ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? 2 ASN 262 o NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale32 covale one ? J ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? 2 ASN 276 y NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? N-Glycosylation covale33 covale one ? J ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? 2 ASN 295 p NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.392 ? N-Glycosylation covale34 covale one ? J ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? 2 ASN 301 s NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.418 ? N-Glycosylation covale35 covale one ? J ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? 2 ASN 332 w NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.223 ? N-Glycosylation covale36 covale one ? J ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 AC NAG . C1 ? ? 2 ASN 355 2 NAG 644 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale37 covale one ? J ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? 2 ASN 363 t NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? N-Glycosylation covale38 covale one ? J ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? 2 ASN 386 u NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale39 covale one ? J ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? 2 ASN 392 v NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.395 ? N-Glycosylation covale40 covale none ? J ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 CB NAG . O5 ? ? 2 ASN 392 v NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale41 covale one ? Q ASN 100 ND2 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? D ASN 611 z NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? N-Glycosylation covale42 covale one ? Q ASN 126 ND2 ? ? ? 1_555 BC NAG . C1 ? ? D ASN 637 D NAG 702 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.434 ? N-Glycosylation covale43 covale one ? R ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? C ASN 88 0 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? N-Glycosylation covale44 covale none ? R ASN 58 ND2 ? ? ? 1_555 HB NAG . O5 ? ? C ASN 88 0 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.394 ? ? covale45 covale one ? R ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? C ASN 133 1 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.431 ? N-Glycosylation covale46 covale none ? R ASN 103 ND2 ? ? ? 1_555 IB NAG . O5 ? ? C ASN 133 1 NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.396 ? ? covale47 covale one ? R ASN 118 ND2 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? C ASN 156 AA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.402 ? N-Glycosylation covale48 covale one ? R ASN 122 ND2 ? ? ? 1_555 LB NAG . C1 ? ? C ASN 160 BA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.466 ? N-Glycosylation covale49 covale one ? R ASN 167 ND2 ? ? ? 1_555 MB NAG . C1 ? ? C ASN 197 CA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.331 ? N-Glycosylation covale50 covale one ? R ASN 204 ND2 ? ? ? 1_555 NB NAG . C1 ? ? C ASN 234 DA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? N-Glycosylation covale51 covale one ? R ASN 232 ND2 ? ? ? 1_555 OB NAG . C1 ? ? C ASN 262 EA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.428 ? N-Glycosylation covale52 covale one ? R ASN 246 ND2 ? ? ? 1_555 WB NAG . C1 ? ? C ASN 276 MA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.460 ? N-Glycosylation covale53 covale one ? R ASN 265 ND2 ? ? ? 1_555 PB NAG . C1 ? ? C ASN 295 FA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.392 ? N-Glycosylation covale54 covale one ? R ASN 271 ND2 ? ? ? 1_555 QB NAG . C1 ? ? C ASN 301 GA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.417 ? N-Glycosylation covale55 covale one ? R ASN 301 ND2 ? ? ? 1_555 UB NAG . C1 ? ? C ASN 332 KA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.222 ? N-Glycosylation covale56 covale one ? R ASN 324 ND2 ? ? ? 1_555 CC NAG . C1 ? ? C ASN 355 C NAG 644 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.432 ? N-Glycosylation covale57 covale one ? R ASN 332 ND2 ? ? ? 1_555 RB NAG . C1 ? ? C ASN 363 HA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.408 ? N-Glycosylation covale58 covale one ? R ASN 355 ND2 ? ? ? 1_555 SB NAG . C1 ? ? C ASN 386 IA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.433 ? N-Glycosylation covale59 covale one ? R ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 TB NAG . C1 ? ? C ASN 392 JA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.395 ? N-Glycosylation covale60 covale none ? R ASN 361 ND2 ? ? ? 1_555 TB NAG . O5 ? ? C ASN 392 JA NAG 1 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale61 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y NAG . C1 ? ? B NAG 1 B NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale62 covale both ? Y NAG . O4 ? ? ? 1_555 Y BMA . C1 ? ? B NAG 2 B BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale63 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z NAG . C1 ? ? E NAG 1 E NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale64 covale both ? Z NAG . O4 ? ? ? 1_555 Z BMA . C1 ? ? E NAG 2 E BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale65 covale both ? Z BMA . O3 ? ? ? 1_555 Z MAN . C1 ? ? E BMA 3 E MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale66 covale both ? AA NAG . O4 ? ? ? 1_555 AA NAG . C1 ? ? F NAG 1 F NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale67 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA NAG . C1 ? ? G NAG 1 G NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale68 covale both ? BA NAG . O4 ? ? ? 1_555 BA BMA . C1 ? ? G NAG 2 G BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale69 covale both ? BA BMA . O3 ? ? ? 1_555 BA MAN . C1 ? ? G BMA 3 G MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale70 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA NAG . C1 ? ? I NAG 1 I NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale71 covale both ? CA NAG . O4 ? ? ? 1_555 CA BMA . C1 ? ? I NAG 2 I BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale72 covale both ? CA BMA . O3 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? I BMA 3 I MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale73 covale both ? CA BMA . O6 ? ? ? 1_555 CA MAN . C1 ? ? I BMA 3 I MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale74 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA NAG . C1 ? ? J NAG 1 J NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale75 covale both ? DA NAG . O4 ? ? ? 1_555 DA BMA . C1 ? ? J NAG 2 J BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale76 covale both ? DA BMA . O3 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? J BMA 3 J MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale77 covale both ? DA BMA . O6 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? J BMA 3 J MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale78 covale both ? DA MAN . O2 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? J MAN 4 J MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale79 covale both ? DA MAN . O2 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? J MAN 5 J MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale80 covale both ? DA MAN . O3 ? ? ? 1_555 DA MAN . C1 ? ? J MAN 7 J MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale81 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA NAG . C1 ? ? K NAG 1 K NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale82 covale both ? EA NAG . O4 ? ? ? 1_555 EA BMA . C1 ? ? K NAG 2 K BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale83 covale both ? EA BMA . O6 ? ? ? 1_555 EA MAN . C1 ? ? K BMA 3 K MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale84 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA NAG . C1 ? ? O NAG 1 O NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale85 covale both ? FA NAG . O4 ? ? ? 1_555 FA BMA . C1 ? ? O NAG 2 O BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale86 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA NAG . C1 ? ? P NAG 1 P NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale87 covale both ? GA NAG . O4 ? ? ? 1_555 GA BMA . C1 ? ? P NAG 2 P BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale88 covale both ? GA BMA . O3 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? P BMA 3 P MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale89 covale both ? GA BMA . O6 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? P BMA 3 P MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale90 covale both ? GA MAN . O2 ? ? ? 1_555 GA MAN . C1 ? ? P MAN 4 P MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale91 covale both ? HA NAG . O4 ? ? ? 1_555 HA NAG . C1 ? ? S NAG 1 S NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale92 covale both ? IA NAG . O4 ? ? ? 1_555 IA NAG . C1 ? ? T NAG 1 T NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale93 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA NAG . C1 ? ? U NAG 1 U NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale94 covale both ? JA NAG . O4 ? ? ? 1_555 JA BMA . C1 ? ? U NAG 2 U BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale95 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA NAG . C1 ? ? V NAG 1 V NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale96 covale both ? KA NAG . O4 ? ? ? 1_555 KA BMA . C1 ? ? V NAG 2 V BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale97 covale both ? KA BMA . O3 ? ? ? 1_555 KA MAN . C1 ? ? V BMA 3 V MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale98 covale both ? KA BMA . O6 ? ? ? 1_555 KA MAN . C1 ? ? V BMA 3 V MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale99 covale both ? LA NAG . O4 ? ? ? 1_555 LA NAG . C1 ? ? W NAG 1 W NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale100 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA NAG . C1 ? ? X NAG 1 X NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale101 covale both ? MA NAG . O4 ? ? ? 1_555 MA BMA . C1 ? ? X NAG 2 X BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale102 covale both ? MA BMA . O3 ? ? ? 1_555 MA MAN . C1 ? ? X BMA 3 X MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale103 covale both ? MA BMA . O6 ? ? ? 1_555 MA MAN . C1 ? ? X BMA 3 X MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale104 covale both ? MA MAN . O2 ? ? ? 1_555 MA MAN . C1 ? ? X MAN 4 X MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale105 covale both ? MA MAN . O2 ? ? ? 1_555 MA MAN . C1 ? ? X MAN 5 X MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale106 covale both ? MA MAN . O3 ? ? ? 1_555 MA MAN . C1 ? ? X MAN 7 X MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale107 covale both ? MA MAN . O6 ? ? ? 1_555 MA MAN . C1 ? ? X MAN 7 X MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale108 covale both ? NA NAG . O4 ? ? ? 1_555 NA NAG . C1 ? ? Y NAG 1 Y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale109 covale both ? OA NAG . O4 ? ? ? 1_555 OA NAG . C1 ? ? Z NAG 1 Z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale110 covale both ? OA NAG . O4 ? ? ? 1_555 OA BMA . C1 ? ? Z NAG 2 Z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale111 covale both ? OA BMA . O3 ? ? ? 1_555 OA MAN . C1 ? ? Z BMA 3 Z MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale112 covale both ? PA NAG . O4 ? ? ? 1_555 PA NAG . C1 ? ? a NAG 1 a NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale113 covale both ? PA NAG . O4 ? ? ? 1_555 PA BMA . C1 ? ? a NAG 2 a BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale114 covale both ? QA NAG . O4 ? ? ? 1_555 QA NAG . C1 ? ? b NAG 1 b NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale115 covale both ? QA NAG . O4 ? ? ? 1_555 QA BMA . C1 ? ? b NAG 2 b BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale116 covale both ? QA BMA . O3 ? ? ? 1_555 QA MAN . C1 ? ? b BMA 3 b MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale117 covale both ? RA NAG . O4 ? ? ? 1_555 RA NAG . C1 ? ? e NAG 1 e NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale118 covale both ? SA NAG . O4 ? ? ? 1_555 SA NAG . C1 ? ? f NAG 1 f NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale119 covale both ? SA NAG . O4 ? ? ? 1_555 SA BMA . C1 ? ? f NAG 2 f BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale120 covale both ? SA BMA . O3 ? ? ? 1_555 SA MAN . C1 ? ? f BMA 3 f MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale121 covale both ? TA NAG . O4 ? ? ? 1_555 TA NAG . C1 ? ? g NAG 1 g NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale122 covale both ? TA NAG . O4 ? ? ? 1_555 TA BMA . C1 ? ? g NAG 2 g BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale123 covale both ? TA BMA . O3 ? ? ? 1_555 TA MAN . C1 ? ? g BMA 3 g MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale124 covale both ? TA BMA . O6 ? ? ? 1_555 TA MAN . C1 ? ? g BMA 3 g MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale125 covale both ? UA NAG . O4 ? ? ? 1_555 UA NAG . C1 ? ? i NAG 1 i NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale126 covale both ? UA NAG . O4 ? ? ? 1_555 UA BMA . C1 ? ? i NAG 2 i BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale127 covale both ? UA BMA . O3 ? ? ? 1_555 UA MAN . C1 ? ? i BMA 3 i MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.459 ? ? covale128 covale both ? UA BMA . O6 ? ? ? 1_555 UA MAN . C1 ? ? i BMA 3 i MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale129 covale both ? UA MAN . O2 ? ? ? 1_555 UA MAN . C1 ? ? i MAN 4 i MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale130 covale both ? UA MAN . O2 ? ? ? 1_555 UA MAN . C1 ? ? i MAN 5 i MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale131 covale both ? UA MAN . O3 ? ? ? 1_555 UA MAN . C1 ? ? i MAN 7 i MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale132 covale both ? VA NAG . O4 ? ? ? 1_555 VA NAG . C1 ? ? j NAG 1 j NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale133 covale both ? VA NAG . O4 ? ? ? 1_555 VA BMA . C1 ? ? j NAG 2 j BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale134 covale both ? VA BMA . O6 ? ? ? 1_555 VA MAN . C1 ? ? j BMA 3 j MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale135 covale both ? WA NAG . O4 ? ? ? 1_555 WA NAG . C1 ? ? k NAG 1 k NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale136 covale both ? WA NAG . O4 ? ? ? 1_555 WA BMA . C1 ? ? k NAG 2 k BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale137 covale both ? XA NAG . O4 ? ? ? 1_555 XA NAG . C1 ? ? o NAG 1 o NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale138 covale both ? XA NAG . O4 ? ? ? 1_555 XA BMA . C1 ? ? o NAG 2 o BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale139 covale both ? XA BMA . O3 ? ? ? 1_555 XA MAN . C1 ? ? o BMA 3 o MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale140 covale both ? XA BMA . O6 ? ? ? 1_555 XA MAN . C1 ? ? o BMA 3 o MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale141 covale both ? XA MAN . O2 ? ? ? 1_555 XA MAN . C1 ? ? o MAN 4 o MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale142 covale both ? YA NAG . O4 ? ? ? 1_555 YA NAG . C1 ? ? p NAG 1 p NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale143 covale both ? ZA NAG . O4 ? ? ? 1_555 ZA NAG . C1 ? ? s NAG 1 s NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale144 covale both ? AB NAG . O4 ? ? ? 1_555 AB NAG . C1 ? ? t NAG 1 t NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale145 covale both ? AB NAG . O4 ? ? ? 1_555 AB BMA . C1 ? ? t NAG 2 t BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.468 ? ? covale146 covale both ? BB NAG . O4 ? ? ? 1_555 BB NAG . C1 ? ? u NAG 1 u NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale147 covale both ? BB NAG . O4 ? ? ? 1_555 BB BMA . C1 ? ? u NAG 2 u BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale148 covale both ? BB BMA . O3 ? ? ? 1_555 BB MAN . C1 ? ? u BMA 3 u MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale149 covale both ? BB BMA . O6 ? ? ? 1_555 BB MAN . C1 ? ? u BMA 3 u MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale150 covale both ? CB NAG . O4 ? ? ? 1_555 CB NAG . C1 ? ? v NAG 1 v NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale151 covale both ? DB NAG . O4 ? ? ? 1_555 DB NAG . C1 ? ? w NAG 1 w NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale152 covale both ? DB NAG . O4 ? ? ? 1_555 DB BMA . C1 ? ? w NAG 2 w BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale153 covale both ? DB BMA . O3 ? ? ? 1_555 DB MAN . C1 ? ? w BMA 3 w MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale154 covale both ? DB BMA . O6 ? ? ? 1_555 DB MAN . C1 ? ? w BMA 3 w MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale155 covale both ? DB MAN . O2 ? ? ? 1_555 DB MAN . C1 ? ? w MAN 4 w MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale156 covale both ? DB MAN . O2 ? ? ? 1_555 DB MAN . C1 ? ? w MAN 5 w MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale157 covale both ? DB MAN . O3 ? ? ? 1_555 DB MAN . C1 ? ? w MAN 7 w MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale158 covale both ? DB MAN . O6 ? ? ? 1_555 DB MAN . C1 ? ? w MAN 7 w MAN 9 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale159 covale both ? EB NAG . O4 ? ? ? 1_555 EB NAG . C1 ? ? x NAG 1 x NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale160 covale both ? FB NAG . O4 ? ? ? 1_555 FB NAG . C1 ? ? y NAG 1 y NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale161 covale both ? FB NAG . O4 ? ? ? 1_555 FB BMA . C1 ? ? y NAG 2 y BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale162 covale both ? FB BMA . O3 ? ? ? 1_555 FB MAN . C1 ? ? y BMA 3 y MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale163 covale both ? GB NAG . O4 ? ? ? 1_555 GB NAG . C1 ? ? z NAG 1 z NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale164 covale both ? GB NAG . O4 ? ? ? 1_555 GB BMA . C1 ? ? z NAG 2 z BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale165 covale both ? HB NAG . O4 ? ? ? 1_555 HB NAG . C1 ? ? 0 NAG 1 0 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale166 covale both ? HB NAG . O4 ? ? ? 1_555 HB BMA . C1 ? ? 0 NAG 2 0 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale167 covale both ? HB BMA . O3 ? ? ? 1_555 HB MAN . C1 ? ? 0 BMA 3 0 MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale168 covale both ? IB NAG . O4 ? ? ? 1_555 IB NAG . C1 ? ? 1 NAG 1 1 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.453 ? ? covale169 covale both ? JB NAG . O4 ? ? ? 1_555 JB NAG . C1 ? ? 9 NAG 1 9 NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale170 covale both ? JB NAG . O4 ? ? ? 1_555 JB BMA . C1 ? ? 9 NAG 2 9 BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.441 ? ? covale171 covale both ? JB BMA . O3 ? ? ? 1_555 JB MAN . C1 ? ? 9 BMA 3 9 MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale172 covale both ? KB NAG . O4 ? ? ? 1_555 KB NAG . C1 ? ? AA NAG 1 AA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.448 ? ? covale173 covale both ? KB NAG . O4 ? ? ? 1_555 KB BMA . C1 ? ? AA NAG 2 AA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale174 covale both ? KB BMA . O3 ? ? ? 1_555 KB MAN . C1 ? ? AA BMA 3 AA MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale175 covale both ? KB BMA . O6 ? ? ? 1_555 KB MAN . C1 ? ? AA BMA 3 AA MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale176 covale both ? LB NAG . O4 ? ? ? 1_555 LB NAG . C1 ? ? BA NAG 1 BA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale177 covale both ? LB NAG . O4 ? ? ? 1_555 LB BMA . C1 ? ? BA NAG 2 BA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.452 ? ? covale178 covale both ? LB BMA . O3 ? ? ? 1_555 LB MAN . C1 ? ? BA BMA 3 BA MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.458 ? ? covale179 covale both ? LB BMA . O6 ? ? ? 1_555 LB MAN . C1 ? ? BA BMA 3 BA MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale180 covale both ? LB MAN . O2 ? ? ? 1_555 LB MAN . C1 ? ? BA MAN 4 BA MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale181 covale both ? LB MAN . O2 ? ? ? 1_555 LB MAN . C1 ? ? BA MAN 5 BA MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale182 covale both ? LB MAN . O3 ? ? ? 1_555 LB MAN . C1 ? ? BA MAN 7 BA MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale183 covale both ? MB NAG . O4 ? ? ? 1_555 MB NAG . C1 ? ? CA NAG 1 CA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale184 covale both ? MB NAG . O4 ? ? ? 1_555 MB BMA . C1 ? ? CA NAG 2 CA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.451 ? ? covale185 covale both ? MB BMA . O6 ? ? ? 1_555 MB MAN . C1 ? ? CA BMA 3 CA MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.445 ? ? covale186 covale both ? NB NAG . O4 ? ? ? 1_555 NB NAG . C1 ? ? DA NAG 1 DA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale187 covale both ? NB NAG . O4 ? ? ? 1_555 NB BMA . C1 ? ? DA NAG 2 DA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale188 covale both ? OB NAG . O4 ? ? ? 1_555 OB NAG . C1 ? ? EA NAG 1 EA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale189 covale both ? OB NAG . O4 ? ? ? 1_555 OB BMA . C1 ? ? EA NAG 2 EA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.443 ? ? covale190 covale both ? OB BMA . O3 ? ? ? 1_555 OB MAN . C1 ? ? EA BMA 3 EA MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale191 covale both ? OB BMA . O6 ? ? ? 1_555 OB MAN . C1 ? ? EA BMA 3 EA MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.450 ? ? covale192 covale both ? OB MAN . O2 ? ? ? 1_555 OB MAN . C1 ? ? EA MAN 4 EA MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale193 covale both ? PB NAG . O4 ? ? ? 1_555 PB NAG . C1 ? ? FA NAG 1 FA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? covale194 covale both ? QB NAG . O4 ? ? ? 1_555 QB NAG . C1 ? ? GA NAG 1 GA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale195 covale both ? RB NAG . O4 ? ? ? 1_555 RB NAG . C1 ? ? HA NAG 1 HA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.438 ? ? covale196 covale both ? RB NAG . O4 ? ? ? 1_555 RB BMA . C1 ? ? HA NAG 2 HA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.469 ? ? covale197 covale both ? SB NAG . O4 ? ? ? 1_555 SB NAG . C1 ? ? IA NAG 1 IA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale198 covale both ? SB NAG . O4 ? ? ? 1_555 SB BMA . C1 ? ? IA NAG 2 IA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.444 ? ? covale199 covale both ? SB BMA . O3 ? ? ? 1_555 SB MAN . C1 ? ? IA BMA 3 IA MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.436 ? ? covale200 covale both ? SB BMA . O6 ? ? ? 1_555 SB MAN . C1 ? ? IA BMA 3 IA MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale201 covale both ? TB NAG . O4 ? ? ? 1_555 TB NAG . C1 ? ? JA NAG 1 JA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.449 ? ? covale202 covale both ? UB NAG . O4 ? ? ? 1_555 UB NAG . C1 ? ? KA NAG 1 KA NAG 2 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.440 ? ? covale203 covale both ? UB NAG . O4 ? ? ? 1_555 UB BMA . C1 ? ? KA NAG 2 KA BMA 3 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale204 covale both ? UB BMA . O3 ? ? ? 1_555 UB MAN . C1 ? ? KA BMA 3 KA MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.446 ? ? covale205 covale both ? UB BMA . O6 ? ? ? 1_555 UB MAN . C1 ? ? KA BMA 3 KA MAN 7 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.442 ? ? covale206 covale both ? UB MAN . O2 ? ? ? 1_555 UB MAN . C1 ? ? KA MAN 4 KA MAN 5 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale207 covale both ? UB MAN . O2 ? ? ? 1_555 UB MAN . C1 ? ? KA MAN 5 KA MAN 6 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.435 ? ? covale208 covale both ? UB MAN . O3 ? ? ? 1_555 UB MAN . C1 ? ? KA MAN 7 KA MAN 8 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.437 ? ? covale209 covale both ? UB MAN . 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MA BMA 3 MA MAN 4 1_555 ? ? ? ? ? ? ? 1.447 ? ? # loop_ _struct_conn_type.id _struct_conn_type.criteria _struct_conn_type.reference disulf ? ? covale ? ? # loop_ _struct_mon_prot_cis.pdbx_id _struct_mon_prot_cis.label_comp_id _struct_mon_prot_cis.label_seq_id _struct_mon_prot_cis.label_asym_id _struct_mon_prot_cis.label_alt_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code _struct_mon_prot_cis.auth_comp_id _struct_mon_prot_cis.auth_seq_id _struct_mon_prot_cis.auth_asym_id _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_label_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_ins_code_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_comp_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_seq_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_auth_asym_id_2 _struct_mon_prot_cis.pdbx_PDB_model_num _struct_mon_prot_cis.pdbx_omega_angle 1 THR 7 H . ? THR 7 l PRO 8 H ? PRO 8 l 1 -6.09 2 VAL 99 H . ? VAL 94 l PRO 100 H ? PRO 95 l 1 0.78 3 THR 7 P . ? THR 7 4 PRO 8 P ? PRO 8 4 1 -6.10 4 VAL 99 P . ? 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parallel AG1 2 3 ? anti-parallel AG1 3 4 ? anti-parallel AG2 1 2 ? anti-parallel AG2 2 3 ? anti-parallel AG2 3 4 ? anti-parallel AG3 1 2 ? anti-parallel AG3 2 3 ? anti-parallel AG3 3 4 ? anti-parallel AG4 1 2 ? parallel AG4 2 3 ? anti-parallel AG4 3 4 ? anti-parallel AG4 4 5 ? anti-parallel AG4 5 6 ? anti-parallel AG5 1 2 ? parallel AG5 2 3 ? anti-parallel AG5 3 4 ? anti-parallel AG6 1 2 ? parallel AG6 2 3 ? anti-parallel AG6 3 4 ? anti-parallel AG6 4 5 ? anti-parallel AG6 5 6 ? anti-parallel AG7 1 2 ? anti-parallel AG8 1 2 ? anti-parallel AG8 2 3 ? anti-parallel AG9 1 2 ? anti-parallel AG9 2 3 ? anti-parallel AG9 3 4 ? anti-parallel AH1 1 2 ? parallel AH1 2 3 ? anti-parallel AH2 1 2 ? anti-parallel AH3 1 2 ? anti-parallel AH4 1 2 ? anti-parallel AH4 2 3 ? anti-parallel AH5 1 2 ? anti-parallel AH5 2 3 ? anti-parallel AH5 3 4 ? anti-parallel AH5 4 5 ? anti-parallel AH6 1 2 ? parallel AH7 1 2 ? anti-parallel AH8 1 2 ? anti-parallel AH8 2 3 ? anti-parallel AH9 1 2 ? anti-parallel AI1 1 2 ? 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X ARG 216 # _em_ctf_correction.id 1 _em_ctf_correction.em_image_processing_id 1 _em_ctf_correction.type 'PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION' _em_ctf_correction.details ? # loop_ _em_entity_assembly_naturalsource.id _em_entity_assembly_naturalsource.entity_assembly_id _em_entity_assembly_naturalsource.cell _em_entity_assembly_naturalsource.cellular_location _em_entity_assembly_naturalsource.ncbi_tax_id _em_entity_assembly_naturalsource.organ _em_entity_assembly_naturalsource.organelle _em_entity_assembly_naturalsource.organism _em_entity_assembly_naturalsource.strain _em_entity_assembly_naturalsource.tissue 2 2 ? ? 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? 3 3 ? ? 9606 ? ? 'Homo sapiens' ? ? 4 4 ? ? 11676 ? ? 'Human immunodeficiency virus 1' ? ? 5 5 ? ? 9606 ? ? 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3 d BMA 650 n KA 12 MAN 4 V MAN 4 d MAN 651 n KA 12 MAN 5 V MAN 5 d MAN 652 n LA 11 NAG 1 W NAG 1 d NAG 653 n LA 11 NAG 2 W NAG 2 d NAG 654 n MA 16 NAG 1 X NAG 1 d NAG 656 n MA 16 NAG 2 X NAG 2 d NAG 657 n MA 16 BMA 3 X BMA 3 d BMA 658 n MA 16 MAN 4 X MAN 4 d MAN 659 n MA 16 MAN 5 X MAN 5 d MAN 661 n MA 16 MAN 6 X MAN 6 d MAN 664 n MA 16 MAN 7 X MAN 7 d MAN 660 n MA 16 MAN 8 X MAN 8 d MAN 662 n MA 16 MAN 9 X MAN 9 d MAN 663 n NA 11 NAG 1 Y NAG 1 d NAG 665 n NA 11 NAG 2 Y NAG 2 d NAG 666 n OA 10 NAG 1 Z NAG 1 d NAG 1201 n OA 10 NAG 2 Z NAG 2 d NAG 1202 n OA 10 BMA 3 Z BMA 3 d BMA 1203 n OA 10 MAN 4 Z MAN 4 d MAN 1204 n PA 9 NAG 1 a NAG 1 A NAG 703 n PA 9 NAG 2 a NAG 2 A NAG 704 n PA 9 BMA 3 a BMA 3 A BMA 705 n QA 10 NAG 1 b NAG 1 2 NAG 601 n QA 10 NAG 2 b NAG 2 2 NAG 602 n QA 10 BMA 3 b BMA 3 2 BMA 603 n QA 10 MAN 4 b MAN 4 2 MAN 604 n RA 11 NAG 1 e NAG 1 2 NAG 605 n RA 11 NAG 2 e NAG 2 2 NAG 606 n SA 10 NAG 1 f NAG 1 2 NAG 607 n SA 10 NAG 2 f NAG 2 2 NAG 608 n SA 10 BMA 3 f BMA 3 2 BMA 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OB 15 MAN 5 EA MAN 5 C MAN 636 n OB 15 MAN 6 EA MAN 6 C MAN 635 n PB 11 NAG 1 FA NAG 1 C NAG 639 n PB 11 NAG 2 FA NAG 2 C NAG 640 n QB 11 NAG 1 GA NAG 1 C NAG 641 n QB 11 NAG 2 GA NAG 2 C NAG 642 n RB 9 NAG 1 HA NAG 1 C NAG 645 n RB 9 NAG 2 HA NAG 2 C NAG 646 n RB 9 BMA 3 HA BMA 3 C BMA 647 n SB 12 NAG 1 IA NAG 1 C NAG 648 n SB 12 NAG 2 IA NAG 2 C NAG 649 n SB 12 BMA 3 IA BMA 3 C BMA 650 n SB 12 MAN 4 IA MAN 4 C MAN 651 n SB 12 MAN 5 IA MAN 5 C MAN 652 n TB 11 NAG 1 JA NAG 1 C NAG 653 n TB 11 NAG 2 JA NAG 2 C NAG 654 n UB 16 NAG 1 KA NAG 1 C NAG 656 n UB 16 NAG 2 KA NAG 2 C NAG 657 n UB 16 BMA 3 KA BMA 3 C BMA 658 n UB 16 MAN 4 KA MAN 4 C MAN 659 n UB 16 MAN 5 KA MAN 5 C MAN 661 n UB 16 MAN 6 KA MAN 6 C MAN 664 n UB 16 MAN 7 KA MAN 7 C MAN 660 n UB 16 MAN 8 KA MAN 8 C MAN 662 n UB 16 MAN 9 KA MAN 9 C MAN 663 n VB 11 NAG 1 LA NAG 1 C NAG 665 n VB 11 NAG 2 LA NAG 2 C NAG 666 n WB 10 NAG 1 MA NAG 1 C NAG 1201 n WB 10 NAG 2 MA NAG 2 C NAG 1202 n WB 10 BMA 3 MA BMA 3 C BMA 1203 n WB 10 MAN 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DManpa1-6DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1- 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 17 14 'WURCS=2.0/3,4,3/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3/a4-b1_b4-c1_c6-d1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 18 14 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 19 15 'DManpa1-2DManpa1-3[DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 20 15 'WURCS=2.0/3,6,5/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-f1_d2-e1' WURCS PDB2Glycan 1.1.0 21 15 '[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}}' LINUCS PDB-CARE ? 22 16 'DManpa1-2DManpa1-2DManpa1-3[DManpa1-3[DManpa1-6]DManpa1-6]DManpb1-4DGlcpNAcb1-4DGlcpNAcb1-' 'Glycam Condensed Sequence' GMML 1.0 23 16 ;WURCS=2.0/3,9,8/[a2122h-1b_1-5_2*NCC/3=O][a1122h-1b_1-5][a1122h-1a_1-5]/1-1-2-3-3-3-3-3-3/a4-b1_b4-c1_c3-d1_c6-g1_d2-e1_e2-f1_g3-h1_g6-i1 ; WURCS PDB2Glycan 1.1.0 24 16 ;[]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-GlcpNAc]{[(4+1)][b-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{[(2+1)][a-D-Manp]{}}}[(6+1)][a-D-Manp]{[(3+1)][a-D-Manp]{}[(6+1)][a-D-Manp]{}}}}}} ; LINUCS PDB-CARE ? # loop_ _pdbx_entity_branch_link.link_id _pdbx_entity_branch_link.entity_id _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_1 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_1 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_1 _pdbx_entity_branch_link.entity_branch_list_num_2 _pdbx_entity_branch_link.comp_id_2 _pdbx_entity_branch_link.atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.leaving_atom_id_2 _pdbx_entity_branch_link.value_order _pdbx_entity_branch_link.details 1 9 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 2 9 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 3 10 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 4 10 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 5 10 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 6 11 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 7 12 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 8 12 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 9 12 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 10 12 5 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 11 13 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 12 13 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 13 13 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 14 13 5 MAN C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? 15 13 6 MAN C1 O1 5 MAN O2 HO2 sing ? 16 13 7 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 17 13 8 MAN C1 O1 7 MAN O3 HO3 sing ? 18 14 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 19 14 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 20 14 4 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 21 15 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 22 15 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 23 15 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 24 15 5 MAN C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? 25 15 6 MAN C1 O1 3 BMA O6 HO6 sing ? 26 16 2 NAG C1 O1 1 NAG O4 HO4 sing ? 27 16 3 BMA C1 O1 2 NAG O4 HO4 sing ? 28 16 4 MAN C1 O1 3 BMA O3 HO3 sing ? 29 16 5 MAN C1 O1 4 MAN O2 HO2 sing ? 30 16 6 MAN C1 O1 5 MAN O2 HO2 sing ? 31 16 7 MAN C1 O1 3 BMA 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